中国地方稻种资源初级核心种质取样策略研究

以国家品种资源库编目入库的中国地方稻种资源 5 0 5 2 6份的 2 6个数量和质量性状为基本数据 ,研究了中国地方稻种资源的初级核心种质取样策略 ,包括分组原则、组内取样比例和组内取样方法。分组原则为按丁颖分类体系、按中国稻作生态区划、按中国稻作生态区内分籼粳两亚种、按中国行政省或自治区、按中国行政省或自治区内分籼粳两亚种、按单一性状等分组和不分组的大随机 ;组内取样量按组内个体数量的简单比例、平方根比例、对数比例和多样性指数比例确定 ;组内取样采用随机方法。应用遗传多样性指数、表型方差、表型频率方差、变异系数和表型保留比例等 5个参数来检验各取样策略所得的核心种质。结果表明 ,以丁颖分类体系分组、按平方根或对数比例在组内随机取样的策略为中国地方稻种核心种质初级样品的可行策略。在初级核心种质取样量上 ,以计算机提取 6 % ,加上人工定向取样增加优异种质和极值材料约 2 % ,使初级核心种质总数达 4 0 0 0份 ,约占总资源的 8%。

割手密初级核心种质取样策略研究

以国家甘蔗种质资源圃中596份割手密为研究对象,根据21个质量性状和6个数量性状,从分组原则、组内取样比例、组内取样方法3个层次探讨构建割手密初级核心种质的最佳取样策略,共形成50种取样策略;同时设10个总体取样量梯度,确定最佳的总体取样量。分组原则以采集地、海拔、茎径、纬度、生态区域、总体聚类进行分组及不分组的大随机;组内取样比例按组内个体数量的简单比例、平方根比例、对数比例和多样性比例确定;组内取样方法采用聚类和随机2种方法;10个总体取样量梯度为5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%和50%,应用变异系数、遗传多样性指数、表型保留比例、表型频率方差、表型方差等5个参数的主成分综合得分来检验各取样策略的优劣。结果表明,聚类取样优于随机取样;采集地分组和茎径分组都优于其他分组,组内取样比例以多样性比例最好;根据取样策略及总体取样量的分析结果最终确认,按15%总体取样量、以茎径分组、按多样性比例在组内聚类取样为构建割手密初级核心种质的最佳策略组合。在此初级核心种质的基础上,加入取样极易丢失表型性状的材料共计92份,组成最终初级核心种质,占总资源的15.44%。建立的初级核心种质库的遗传多样性、变异系数、表型频率方差、表型方差均明显优于总资源库,表型保留比例达100%,能较好代表总资源库。

基于形态性状的甘薯核心种质取样策略研究

选取15%的总体取样比例,采用2种分组方法、3种组内取样量比例和2种组内个体选择方法,分析了476份广西甘薯种质资源的18个农艺性状数据,构建出13个甘薯初级核心种质样本。为确定这些样本的代表性,分别与总体进行了5个指标的比较,包括表型保留比例、表型频率方差、遗传多样性指数、变异系数、极差符合率。结果表明,按资源类型分组优于按来源地分组;组内取样量以对数法代表性最好,简单比例法的代表性其次,平方根法最差;在个体选择中,最小距离逐步取样法优于随机法。因此,按资源类型分组,再按对数比例法确定组内取样量,通过最小距离逐步取样法选择个体是甘薯核心种质构建的最佳取样策略。

甘蔗杂交品种初级核心种质取样策略

以国家甘蔗种质资源圃中1202份甘蔗杂交品种为材料,根据23个数量和质量性状,从分组原则、组内取样比例、组内取样方法3个层次探讨构建甘蔗杂交品种初级核心种质的最佳取样策略,共形成26种取样策略;同时设10个总体取样量梯度,确定最佳的总体取样量。分组原则以原产地、种植区域、总体聚类进行分组及不分组的大随机;组内取样比例按组内个体数量的简单比例(P)、平方根比例(S)、对数比例(L)和多样性比例(G)确定;组内取样方法采用聚类(C)和随机(R)2种方法;10个总体取样量梯度为5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%和50%。应用变异系数、遗传多样性指数、表型保留比例、表型频率方差、表型方差等5个参数来检验各取样策略的优劣。结果表明,聚类取样优于随机取样;总体聚类分组优于其他分组;在聚类取样中,平方根比例最好,在随机取样中,多样性比例最好;根据取样策略及总体取样量的分析结果最终确认按10%总体取样量,以总体聚类分组、按对数比例在组内聚类取样为构建甘蔗杂交品种初级核心种质的最佳策略组合,其遗传多样性明显高于总资源库。在此初级核心种质的基础上,加入极值材料和取样极易丢失表型性状的材料共计136份组成最终初级核心种质,占总资源的11.31%。

构建我国燕麦核心种质的取样策略研究

采用2种分层方法、3种确定组内取样量方法和2种个体选择方法,分析了3255份燕麦种质资源的12个农艺性状的数据,构建出13个初级核心种质样本。为确定这些样本代表性,分别与总体进行了7个指标的比较,包括数量性状的极差、符合度、平均数、表型方差、遗传多样性指数方差、变异系数及质量性状的频率分布。结果表明,2种分层方法产生的样本在代表性上差异不明显;3种确定组内取样量方法以比例法的代表性最好,对数法的代表性其次,平方根法的代表性最差;在个体选择中,聚类法明显好于随机法。因此,在燕麦核心种质的构建中,先按省份分组,再按比例法确定组内取样量,通过聚类结果选择个体为最佳取样策略。

近缘物种的遗传多样性及其亲缘关系的取样策略研究

取样策略的问题目前大多停留于对单一物种的种质资源研究.然而,对野生近缘植物取样策略的研究,不仅有利于准确快捷地阐明物种间的系统发育关系,而且对于了解遗传多样性分布状况,制定野外考察、材料收集取样及保护策略均有重要的理论指导意义.以巴山松及其近缘种为例,利用cpSSR(叶绿体微卫星)和AFLP2种分子标记对其取样策略和统计方法进行分析,揭示居群取样个体数和基因位点数与遗传多样性的关系以及基因(引物)和系统树构建方法对亲缘关系确定的影响.研究表明:(1)居群取样个体数和基因位点数差异对遗传多样性影响并不显著,但当居群取样个体数为30个左右,单引物基因位点数为60个以上,总位点数为480个以上时,所得遗传多样性及亲缘关系较为准确可靠.(2)较多数目的基因(引物)对于得到较为准确可靠的亲缘关系分析是十分必要的.(3)系统树构建方法对近缘种亲缘关系的确定有一定的影响.

取样策略对SSR标记鉴别紫云英品种能力的影响

紫云英属于异花授粉植物,品种内个体基因型杂合,品种鉴定难度大。本研究以紫云英闽紫系列3个审定品种为材料,采用SSR标记进行取样策略对3个品种鉴别能力影响的研究。结果表明：（1）固定4对引物组合,从5~50进行梯度取样时,品种内的扩增位点总数、观测等位基因数趋于增多,但有效等位基因数、Shanon信息指数、遗传多样性指数增大到最大值后趋于下降,其中取样量为30时总体样品出现最大值;随着样品量的增加,品种间Nei氏遗传距离以及分子方差分析的品种间期望变异系数比例值（Phi PT）均呈减少趋势,但Phi PT值的置信度在增大;（2）固定品种的样品容量为30和50,再加入2对能扩增出在品种间形成频率差异的标记位点的SSR引物对,基于这6对SSR引物可以将参试的3个紫云英品种有效的区分,品种间期望变异系数比例值（Phi PT）提高且差异的置信度为极显著。主成分分析进一步表明：3个参试品种30个样品与50个样品的散布状况基本一致。对紫云英取样策略的研究表明：为提高对参试品种的鉴别能力,样品取样量以30株为宜,即达到较佳鉴别效果又降低分析成本。

利用SSR标记分析一年生黑麦草遗传多样性的取样策略

一年生黑麦草(Lolium multiflorum)为异花授粉植物,其DNA多态性研究的取样策略与遗传多样性分析的可靠性和效率直接相关。从一年生黑麦草国家审定品种"长江2号"和"特高"中,分别提取50个单株DNA,同时提取5、10、15、20、25和30个单株叶片混合样本的DNA,利用SSR标记进行遗传多态性分析。研究结果表明,取样梯度间多态性信息含量指数(PIC)差异不显著(P>0.05),但当混合单株样本为20株时,PIC达到最高值;SSR平均等位基因数和单个SSR座位上等位基因种类随样品内单株混合数目增加而增加,当取样量在20株及以上时,等位基因数和等位基因种类趋于稳定,电泳图谱表现基本一致;不考虑稀有等位基因(基因频率≤10%)的漏检,采用20株混合样本能够最大限度保持检出较高频率(>10%)等位基因,且重演性较好。鉴于此,利用SSR标记分析一年生黑麦草遗传多样性时采用20个单株混合样提取的DNA样本能够有效反映群体间差异。

东南地区土壤养分的空间变异性与取样策略I.土壤属性与大量元素

在我国东南6省(市)选择代表性区域(自然村),采用ASI和地统计学等方法对耕作土壤的pH值、有机质、有效氮、磷和钾的空间变异性与合理取样数量进行了研究。结果表明,①pH值和有机质是相对稳定的土壤属性,在整个研究区域其变异较小,近似于正态分布;施肥元素的变异则较大,表现出明显的负偏峰分布特征。②尽管某些土壤属性或大量元素的总体变异性相似,但在各研究区域,其实际半方差结构并不相同。③对于明显偏峰分布的土壤养分来说,建议采用最适分配法确定合理取样数量。纯随机合理取样数量可在一定程度作为参考。

不同尺度下森林土壤特性空间变异与取样策略

采用网格法采样，对天然更新的次生阔叶林群落林分尺度（40m×40m）和植物个体尺度（2m×2m）的0～20cm土壤分别取样80个和64个，测定pH、有机质、全N、水解N、有效P、速效K等6个指标．结合传统统计与地统计方法，分析在2种尺度下不同土壤性质空间变异特征与样本容量．研究结果表明，各土壤性质的变异系数、极差和半变异函数的基台值均随尺度的放大而增加；不同土壤性质变异性从大到小顺序依次为：有效P〉速效K〉有机质〉全N〉水解N〉pH，说明在相同的精度要求和置信水平下，土壤性质的变异越大，其合理的取样数应相应增加；半变异函数结构说明，除有效P和pH外，多数土壤空间变异主要受随机性因素影响，且无明显基台效应．最后，在对比分析2种尺度下土壤的空间变异特征和样本容量的基础上，探讨优化森林土壤的取样策略．

普通野生稻居群异位保护取样策略研究

野生稻居群异位保护首要解决的关键问题是如何取样才能使采集的样本遗传多样性能够代表居群总遗传多样性。为了确定普通野生稻居群异位保护最佳取样数量,笔者应用SSR分子标记技术,以海南文昌东路普通野生稻居群为试验材料,研究普通野生稻异位保护最佳取样数量。结果表明:以采集的样本遗传多样性占居群总遗传多样性的90%为临界值,则最佳取样数量为26株;若采集的样本遗传多样性达到居群总遗传多样性的95%,最佳取样数量应增加至31株。

生活史性状和取样策略对植物微卫星遗传多样性参数估算的影响

对150种野生种子植物基于微卫星分子标记的遗传参数进行统计,旨在分析植物的生活史性状和取样策略对各遗传参数的影响.结果表明,微卫星标记数与种群遗传分化系数(FST和RST)呈显著正相关,与多样性指数(HO和HE)呈显著负相关;取样距离加大显著提高种群间分化指数FST和RST;种群间分化指数与多样性指数呈显著负相关;异交繁殖、长寿多年生的植物总体上保持着更高的种群内遗传多样性,而自交繁殖的一年生植物具有更高的种群间遗传分化水平;在种群水平上,裸子植物的遗传多样性比被子植物高.

野生大麻居群遗传多样性ISSR分析的取样策略

【目的】分析野生大麻居群的合理取样样本量,为全面了解我国大麻资源的遗传多样性及制定野生大麻保护策略提供参考依据。【方法】随机抽取96个辽宁科尔沁沙地野生大麻自然居群个体,采用计算机模拟方法从中随机抽取不同样本量(分别为5、10、15、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90和96个个体)的抽样群体各20次,利用ISSR分子标记对其遗传多样性进行分析,确定合理的取样样本量。【结果】利用从60条ISSR引物中筛选出的9条引物对随机抽取的96个野生大麻个体进行PCR扩增,共获得76个位点,其中多态位点48个,多态率达63.16%,观测等位基因数(Na)为1.632,有效等位基因数(Ne)为1.250,Nei’s基因多样性指数(H)为0.156,Shannon’s信息指数(I)为0.245。由各遗传参数拟合曲线变化趋势分析结果可知,初始的4种抽样群体(分别为5、10、15和20个个体)遗传多样性水平呈急速增加趋势,之后随着样本量的加大,遗传多样性水平增加趋势明显变缓。当抽样群体样本量超过25个个体时,Na、Ne、H和I均包含了野生大麻居群90%以上的遗传变异。【结论】采用ISSR分子标记评估野生大麻群体遗传多样性时,群体取样样本量不宜小于25个个体才能较好地反映该居群总体的遗传多样性水平。

东南地区土壤养分的空间变异性与取样策略Ⅱ.中微量元素

在我国东南5省选择6个代表性区域(自然村),采用ASI和地统计学等方法对耕作土壤的有效Ca、Mg、S和Zn的空间变异性与合理取样数量进行了研究。结果表明,①中微量元素的一般变异性大小顺序为:S>Zn>Mg>Ca,有效Ca和Mg的变异主要受土壤母质和微地形等区域性因素的影响,有效Zn的变异主要与作物布局和施肥水平等随机性因素有关,有效S的变异则同时受水分条件、作物布局和施肥水平的制约;②尽管某些中微量元素的总体变异性相似,但在各研究区域,其实际半方差结构并不相同;③对于明显偏斜的土壤养分来说,建议采用最适分配法确定合理取样数量,纯随机合理取样数量仍可作为重要参考。

基于SRAP和IRAP标记的野生君迁子居群取样策略分析

君迁子（Diospyros lotus L.）是中国栽培柿（D.kaki Thunb.）的主要砧木,其适应性和繁殖能力强,表型变异丰富,存在多个变种和近缘种,在国内广泛分布。目前,有关君迁子居群的取样策略尚不完全清楚。试验以1个野生君迁子自然居群（40个单株）和8个外类群种质为试材,利用SRAP和IRAP标记技术分析其居群取样策略。结果表明,20对SRAP引物扩增出188条谱带,多态性比例为94.68%;9条IRAP引物共扩增出102条谱带,多态性比率为95.10%。UPGMA聚类分析表明,君迁子居群分别与柿和浙江柿（D.glaucifolia L.）独立成组。供试君迁子居群遗传多样性信息参数随取样梯度的增加（5~35个单株）而增加。Nei’s基因多样性指数（H）在取样梯度为20个单株时达到总体的95%以上,Shannon信息指数（I）和多态性位点百分率（PPL）在取样梯度为25个单株时分别达到总体的95%以上,随着取样梯度的进一步增加,Nei’s基因多样性指数、Shannon信息指数和多态性位点百分率数值趋稳。综上所述,基于遗传多样性信息参数（H、I、PPL）的居群取样单株数量建议为20~25个单株。

汉字特征分析与实验字取样策略

以汉字分析为基础，建议选取６ ～１３ 画为笔画数取样范围，把１ ．０ ～４９ ．９ 次／ 百万、５０ ．０ ～４９９ ．９次／ 百万字次作为低、高字频实验汉字的字频取样范围，认为成字部件在上、下、左、右４ 个位置上的出现频率是整字部件识别研究中选择检测部件时的匹配因素之一。２°视角６４ ×６４ 点阵大小黑、宋体汉字图象的大部分频谱能量分布在０ ～８ ．０ 周／ 度的空间频率范围内，应在此范围内进行模式识别研究，并将图像灰度矩阵间的欧氏距离作为汉字图像相似性度量指标。

基于最适取样策略的老芒麦种质指纹图谱构建及遗传多样性分析

利用EST-SSR分子标记,基于最适取样策略构建了15份老芒麦种质的DNA指纹图谱,并对其遗传多样性进行了评价。结果显示,16对引物扩增出的条带多态信息含量变化范围为0.0457(Ps569)~0.4667(Elw1468s087),表明15份老芒麦材料具有较丰富的遗传多样性。其中,甘南老芒麦种群遗传多样性最丰富(H=0.2165,I=0.3285),其次是F 2种群(H=0.1662,I=0.2439)、育成品种(H=0.1583,I=0.2311)和俄罗斯种质(H=0.1078,I=0.1573)。利用引物Elw5627s404和Ltc0157构建的DNA指纹图谱,可将所有15份材料进行区分。从地理类群分析,4个地区老芒麦种质的遗传相似度变化范围为0.7536~0.8728,遗传距离变化范围为0.1361~0.2829。遗传结构聚类分析将15份材料分为三大类:类群Ⅰ为甘南的6份材料,类群Ⅱ为混合种群,类群Ⅲ为3份F 2种质。

信息提示方式对图形识别取样策略的影响

目的研究误导信息和纠错信息提示对被试图形识别取样策略的影响。方法文章以三维立体几何图形为为实验材料,要求被试进行对图形进行相同-不同判断,在被试首次识别图形识别后显示真正的纠错提示信息和误导提示信息,并用眼动仪记录被试的行为数据和眼动数据,探讨被试在信息提示后进行二次判断时取样策略的变化。结果发现对于难度较大的图形,被试在二次判断时会采取补充型和调整型策略。而对于较简单的图形,被试二次判断时则会选择确认型策略。结论(1)图形识别过程是高度自动化的;(2)被试对自己的评判结果有自己内在的评判力,并不完全受提示信息的影响;(3)二次判断图形识别策略归纳为三种:调整型策略、确认型策略和补充型策略。

基于分子标记的野生大豆居群遗传多样性估算与取样策略

遗传多样性是生物多样性的基础和最重要组成部分,正确评价物种及其居群的遗传多样性是有效保护和利用生物种质资源的必要条件．以一个野生大豆自然居群(面积约为10000m^2)为研究材料,从中随机选取了100棵植株,分别用3种分子标记AFLP,ISSR和SSR对其遗传多样性进行分析,并采用计算机模拟方法,从这100棵植株中随机抽取不同大小(5～90个个体)的样本(抽样群体)各50次,对其主要遗传多样性参数进行了计算,旨在探讨利用不同分子标记检测该野生大豆居群的主要遗传多样性参数,即位点的预期杂合度(H_e)、Shannon多样性指数(l)和多态位点百分率(P)的差异和变化趋势以及随抽样群体样本量的不断增加这些参数的变化规律．结果表明,不同分子标记检测到同一野生大豆居群的各种遗传多样性参数值不同；同一居群中的不同样本量对遗传多样性参数的估算值有较大影响；用不同分子标记进行遗传多样性参数的估算时,多态位点百分率相对具有可比性；选用不同的遗传多样性参数来反映居群90%以上的总体遗传变异时需要不同的样本量,当选用多态位点百分率(P)时,30-45个植株才能代表总体90%以上的遗传变异．本研究为评价植物居群遗传多样性和采用合理的保护取样策略提供了科学依据．

中国樟树初级核心种质取样方法与策略研究

为了优化樟树种质资源保存策略,提高利用效率,利用872份中国樟树种质资源的苗高、地径、种子大小和千粒质量4个表型数据为材料,从分组方法、组内抽样比例方法、聚类方法、抽样策略、总体取样比例等方面进行中国樟树初级核心种质取样策略研究。结果表明:不同聚类方法和取样策略下采用4种系统取样法构建的核心种质的效果是不同的,在确定最长距离法和优先取样策略的前提下,组内采用对数比例法所构建的樟树核心种质效果较好。应用最长距离法进行聚类筛选出的核心种质的极差符合率和变异系数变化率相对高于其他6种方法,是构建樟树核心种质的最佳聚类方法;优先取样法构建的核心种质的遗传多样性指数、表型频率方差、表型方差和变异系数变化率的值都是最佳的。在25%的取样比例下,遗传多样性指数、表型保留比例和表型方差的值最高,表型频率方差最小,是构建樟树初级核心种质的最佳取样比例。综合6个参数的分析结果,最终确定种源-对数比例-最长距离法聚类-优先取样法为构建中国樟树核心种质的优选取样策略。