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地盘松转录组密码子偏好性分析和直系同源基因鉴定
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作者 杨耀 赵杨 +2 位作者 王秀荣 肖枫 刘富华 《种子》 北大核心 2024年第9期16-22,共7页
地盘松是云南松的一个灌木状变种,其生长习性与常见的松属植物有着显著的区别。本研究旨在探究地盘松的遗传联系和遗传规律,通过对地盘松转录组进行密码子偏好性分析、直系同源基因鉴定和选择压力分析,深入了解地盘松的演化和适应策略... 地盘松是云南松的一个灌木状变种,其生长习性与常见的松属植物有着显著的区别。本研究旨在探究地盘松的遗传联系和遗传规律,通过对地盘松转录组进行密码子偏好性分析、直系同源基因鉴定和选择压力分析,深入了解地盘松的演化和适应策略。密码子偏好性分析揭示了地盘松基因信息翻译过程中的重要规律,而直系同源基因鉴定为研究地盘松的遗传特征和进化历程提供了重要信息。结果表明,地盘松、马尾松和油松在CDS密码子第二位和第三位偏好A/T碱基,且在第三位碱基使用上具有偏向性,其中T和G的使用频率较高。不同松树种类在密码子的使用上存在一定差异,但整体展现出类似的趋势。通过直系同源基因鉴定发现,地盘松蛋白质组中存在多拷贝基因,并且部分基因可能受到正选择压力的影响,如生长素合成、响应和转运等基因。 展开更多
关键词 地盘松 密码子偏好性 直系同源基因 选择压力分析
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血清mutL同源基因1在晚期胃癌患者XELOX新辅助化疗中的监测意义 被引量:1
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作者 方玲 夏永欣 田春阳 《罕少疾病杂志》 2023年第5期75-76,共2页
目的探讨与分析血清mutL同源基因1(MLH1)在晚期胃癌患者XELOX新辅助化疗中的监测意义。方法2018年12月到2020年10月选择在本院进行诊治的晚期胃癌患者80例作为胃癌组,所有患者都给予XELOX新辅助化疗,治疗观察4个周期。检测所有患者治疗... 目的探讨与分析血清mutL同源基因1(MLH1)在晚期胃癌患者XELOX新辅助化疗中的监测意义。方法2018年12月到2020年10月选择在本院进行诊治的晚期胃癌患者80例作为胃癌组,所有患者都给予XELOX新辅助化疗,治疗观察4个周期。检测所有患者治疗前后的血清MLH1相对水平,调查患者的病理特征,随访患者的预后并进行影响因素分析。结果治疗后晚期胃癌患者的血清MLH1相对表达水平明显高于治疗前P<0.05)。在晚期胃癌患者中,不同临床分期、淋巴结转移患者的血清MLH1相对表达水平对比有明显差异(P<0.05)。80例患者治疗后CR 40例,PR 25例,SD 10例,SD 5例,总有效率为81.3%。在化疗期间发生不良反应18例,发生率为22.5%,其中8例胃肠反应,神经系统受损6例,肝肾损害2例,过敏反应1例,血液系统受损1例。所有患者随访1年,80年患者生存67例,死亡13例,死亡率为16.3%。以预后1年死亡率作为因变量,以调查的内容作为自变量,多元Logistic回归分析显示临床分期、淋巴结转移、血清MLH1相对表达水平都是影响胃癌患者预后1年死亡率的重要因素(P<0.05)。结论晚期胃癌患者多伴随有血清MLH1的高表达,而XELOX新辅助化疗的应用能促进降低血清MLH1表达水平,血清MLH1表达水平与患者的病理特征存在相关性,也是影响胃癌患者预后1年死亡率的重要因素。 展开更多
关键词 mutL同源基因1 晚期胃癌 XELOX新辅助化疗 相关性 影响因素
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番茄红素调节RAS同源基因家族成员A/Rho相关激酶信号通路对氧化低密度脂蛋白诱导脑血管内皮细胞凋亡的影响 被引量:1
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作者 张君臣 徐武华 钟丽 《实用临床医药杂志》 2023年第22期44-49,共6页
目的探讨番茄红素(LYC)调节RAS同源基因家族成员A(RhoA)/Rho相关激酶(ROCK)信号通路对氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导的脑血管内皮细胞(EC)凋亡的影响。方法未做任何处理的人脑微血管内皮细胞(HBMECs)设为NC组;采用ox-LDL处理的HBMECs分... 目的探讨番茄红素(LYC)调节RAS同源基因家族成员A(RhoA)/Rho相关激酶(ROCK)信号通路对氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导的脑血管内皮细胞(EC)凋亡的影响。方法未做任何处理的人脑微血管内皮细胞(HBMECs)设为NC组;采用ox-LDL处理的HBMECs分为ox-LDL组、LYC组(0.5μmol/L的LYC处理HBMECs)、溶血磷脂酸(LPA)组(5μmol/L RhoA/ROCK信号通路激活剂LPA处理HBMECs)、LYC+LPA组(0.5μmol/L的LYC以及5μmol/L LPA共同处理HBMECs);处理24 h后用于后续实验。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测HBMECs细胞因子水平;CCK-8法检测HBMECs增殖;流式细胞术检测HBMECs凋亡率;Western blot检测细胞血小板内皮细胞黏附分子-1(CD31)、平滑肌(SM)22α、BCL-2相关X蛋白(Bax)、B细胞淋巴瘤/白血病-2蛋白(Bcl-2)、裂解的半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(cleaved-Caspase-3)、RhoA/ROCK通路相关蛋白表达。结果与NC组相比,ox-LDL组单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)、白细胞介素(IL)-6、血管内皮细胞黏附分子1(VCAM-1)、HBMECs凋亡率、Bax、cleaved-Caspase-3、SM22α、RhoA、ROCK1蛋白水平升高,OD值、Bcl-2、CD31蛋白水平下降,差异有统计学意义(P<0.05);与ox-LDL组相比,LYC组MCP-1、IL-6、VCAM-1、HBMECs凋亡率、Bax、cleaved-Caspase-3、SM22α、RhoA、ROCK1蛋白水平降低,OD值、Bcl-2、CD31蛋白水平升高,差异有统计学意义(P<0.05),而LPA组趋势相反;LPA减弱了LYC对ox-LDL诱导的HBMECs凋亡的改善作用。结论LYC可能通过抑制RhoA/ROCK信号通路来减轻HBMECs凋亡。 展开更多
关键词 脑血管内皮细胞 RAS同源基因家族成员A/Rho相关激酶信号通路 番茄红素 氧化低密度脂蛋白 凋亡
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微阵列芯片法和多同源基因序列测序在非结核分枝杆菌菌种鉴定中的差异
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作者 郭明日 李玉明 +1 位作者 李妍 孙海柏 《检验医学》 CAS 2023年第10期909-914,共6页
目的比较微阵列芯片法和多同源基因序列测序在非结核分枝杆菌(NTM)菌种鉴定中的差异,为NTM感染提供精准诊断依据。方法采用罗氏固体培养法复苏天津市海河医院2016—2019年保存的170株NTM菌株,分别采用微阵列芯片法和同源基因序列[16S r... 目的比较微阵列芯片法和多同源基因序列测序在非结核分枝杆菌(NTM)菌种鉴定中的差异,为NTM感染提供精准诊断依据。方法采用罗氏固体培养法复苏天津市海河医院2016—2019年保存的170株NTM菌株,分别采用微阵列芯片法和同源基因序列[16S rRNA、RNA聚合酶亚基B(rpoB)、热休克蛋白65(hsp65)]测序进行鉴定。以多同源序列测序分析结果为参考,分析微阵列芯片法菌种鉴定的准确性。比较2种方法样本周转时间(TAT)的差异。结果微阵列芯片法鉴定出8个NTM菌种,同源序列测序鉴定出14个。微阵列芯片法无法鉴定出缓慢生长群的猿分枝杆菌、慢生黄分枝杆菌、副瘰疬分枝杆菌和快速生长群的龟分枝杆菌、马德里分枝杆菌、母牛分枝杆菌等10个菌种,多同源序列测序可鉴定出全部的菌种。以多同源序列测序分析结果为参考,微阵列芯片法鉴定错误7株,鉴定到复合群的正确率为90.0%(153/170);16S rRNA、rpoB、hsp65单独和3个同源序列联合分析鉴定到复合群的正确率分别为93.5%、98.8%、99.4%和100.0%。对于微阵列芯片法无法区分的53株龟/脓肿分枝杆菌复合群(MABC),3个同源序列联合测序鉴定出6株龟分枝杆菌、25株MABC脓肿亚种、20株MABC马赛亚种和2株MABC bolletii亚种。微阵列芯片法单个样本鉴定TAT为8 h,170株NTM菌株全部鉴定需要2 d;多同源序列测序单个样本鉴定TAT为3 d,170株NTM菌株全部鉴定约需要5 d。结论微阵列芯片技术可快速鉴定临床常见分枝杆菌。多同源基因序列测序不仅可鉴定临床常见分枝杆菌,还可鉴定微阵列芯片法无法鉴定出的菌种和可能鉴定错误的菌种及其亚种,但所需时间较微阵列芯片法长。 展开更多
关键词 微阵列芯片法 同源基因序列 非结核分枝杆菌 脓肿分枝杆菌复合群 样本周转时间
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三种同源基因的辨析
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作者 王力先 王永飞 《生命的化学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期369-371,共3页
同源基因分为直向同源基因、横向同源基因和异源同源基因。该文对这三种同源基因进行辨析,并对直向同源基因和横向同源基因的进一步分类进行了简单介绍。
关键词 同源基因 直向同源基因 横向同源基因 异源同源基因
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不同禾本科作物中ZmWRKY79同源基因的鉴定与分析 被引量:1
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作者 卢源达 陈玲 +10 位作者 杜云龙 刘学思 柯学 赵建屛 吴洪钦 刘鑫 李玉琢 朱文强 邢世军 程在全 钟巧芳 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期522-531,共10页
【目的】玉米ZmWRKY79基因在合成植保素和干旱胁迫响应中发挥重要作用。文章旨在通过生物信息学技术从不同禾本科作物中挖掘更多的ZmWRKY79同源基因,为玉米及其它禾本科作物提供抗逆境胁迫的候选基因。【方法】从NCBI数据库中获取玉米Zm... 【目的】玉米ZmWRKY79基因在合成植保素和干旱胁迫响应中发挥重要作用。文章旨在通过生物信息学技术从不同禾本科作物中挖掘更多的ZmWRKY79同源基因,为玉米及其它禾本科作物提供抗逆境胁迫的候选基因。【方法】从NCBI数据库中获取玉米ZmWRKY79同源基因的基本信息,并对其进行染色体定位、基因结构可视化、功能结构域预测、进化关系分析、亚细胞定位预测、启动子顺式作用元件预测及非生物胁迫表达预测。【结果】在玉米、谷子、高粱、青稞、野生二粒小麦、普通小麦、水稻作物中共鉴定到9个ZmWRKY79同源基因,这些基因结构相似性较高,分布于不同的染色体上,且均属于第III类WRKY转录因子。系统进化分析结果显示ZmWRKY79蛋白同源序列可被分为I和II类,不同成员间进化受纯化选择,其中ZmWRKY79蛋白与高粱SbWRKY54蛋白同源性较高,达到81.58%。亚细胞定位预测显示所有ZmWRKY79同源蛋白均在细胞核,说明ZmWRKY79同源基因均在细胞核中发挥功能。启动子顺式作用元件预测显示ZmWRKY79同源基因的启动中主要包含组织特异性元件、应激响应元件和激素响应元件。非生物胁迫表达预测表明,ZmWRKY53和ZmWRKY74 2个ZmWRKY79的同源基因被确定为受逆境胁迫诱导。【结论】在7种禾本科作物中鉴定到9个ZmWRKY79同源基因,这些同源基因可能具有抗逆功能,为禾本科作物抗逆研究提供了更多的基因选择。 展开更多
关键词 玉米 ZmWRKY79 同源基因 生物信息学
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磷酸酶和张力蛋白同源基因诱导激酶1与糖尿病难愈创面修复的研究进展
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作者 杨嘉琪 张培华 黄海丽 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2023年第15期1909-1915,共7页
慢性难愈创面已成为糖尿病严重的并发症之一,且缺乏有效的治疗方法。大量研究证实糖尿病创面修复过程中炎性反应、血管形成及基质重塑等事件均与线粒体功能密切相关。磷酸酶和张力蛋白同源基因诱导激酶1(PINK1)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白... 慢性难愈创面已成为糖尿病严重的并发症之一,且缺乏有效的治疗方法。大量研究证实糖尿病创面修复过程中炎性反应、血管形成及基质重塑等事件均与线粒体功能密切相关。磷酸酶和张力蛋白同源基因诱导激酶1(PINK1)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,主要定位在线粒体。PINK1参与调控线粒体自噬,保护细胞免受氧化应激损害;另外,其在调控炎性反应、促进脂质代谢等事件中发挥重要作用。PINK1基因突变与帕金森综合征发病密切相关。最近的研究显示PINK1可参与调控2型糖尿病的发生和发展进程。本文综述了PINK1参与糖尿病创面修复机制的最新研究进展,希望通过阐明PINK1调控创面修复的作用机制,发现目前该方面研究尚存的问题。现有研究未能揭示创面修复的不同阶段PINK1参与的分子机制与信号转导过程的时序性和交互作用,且目前仍缺乏PINK1调控糖尿病难愈创面修复的体内研究,期待后期进一步的临床研究为糖尿病难愈创面治疗提供更多思路。 展开更多
关键词 糖尿病 糖尿病难愈创面 磷酸酶和张力蛋白同源基因诱导激酶1 创面修复 综述
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植物LEAFY同源基因的研究进展 被引量:27
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作者 马月萍 陈凡 戴思兰 《植物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期605-613,共9页
本文就近10年来LEAFY(简写为LFY)同源基因的研究进展做了综合分析。通过对19种植物中已分离到的LFY同源基因的序列比较分析发现:LFY同源基因编码区核苷酸和氨基酸序列同源性都较高;在双子叶植物基因组中,拷贝数却有所不同。该基因的表... 本文就近10年来LEAFY(简写为LFY)同源基因的研究进展做了综合分析。通过对19种植物中已分离到的LFY同源基因的序列比较分析发现:LFY同源基因编码区核苷酸和氨基酸序列同源性都较高;在双子叶植物基因组中,拷贝数却有所不同。该基因的表达特性显示其在不同植物中表达的时间和空间有所差异。根据已知序列推导的氨基酸序列构建的系统进化树表明,单子叶植物与裸子植物的亲缘关系近于双子叶与裸子植物的亲缘关系。上述研究资料为植物成花机理研究提供了重要参考,且在研究植物系统进化方面也具有重要的意义。 展开更多
关键词 高等植物 花发育 LFY同源基因 LEAFY同源基因 植物基因 单子叶植物 序列同源 氨基酸序列 系统进化 亲缘关系
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人类p53和c-myc同源基因在玉米颖果发育过程中的表达(英文)
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作者 亓翠英 宁顺斌 +2 位作者 王宁 李立家 宋运淳 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第9期797-803,共7页
肿瘤抑制基因p5 3和原癌基因c myc已被证明在动物中高度保守并参与许多PCD过程。这两个基因编码的同源蛋白及其RNA在玉米中的存在已有报道 ,并且其DNA同源序列已利用荧光原位杂交定位在玉米相应的染色体上。利用免疫组织化学方法探测了... 肿瘤抑制基因p5 3和原癌基因c myc已被证明在动物中高度保守并参与许多PCD过程。这两个基因编码的同源蛋白及其RNA在玉米中的存在已有报道 ,并且其DNA同源序列已利用荧光原位杂交定位在玉米相应的染色体上。利用免疫组织化学方法探测了与人类p5 3和c myc基因同源的玉米基因在玉米颖果发育过程中的时空表达模式。结果发现 ,在授粉后的一定阶段 ,在反足细胞、珠被、未成熟的胚乳、子房壁、导管组织和糊粉层中 ,p5 3同源基因表达强烈 ,c myc同源基因的表达相反 ,在授粉后的这些组织中基本不表达 ,而在授粉前的中央细胞的极核中表达水平较高。TUNEL检测显示 ,在p5 3同源基因呈现高水平表达的地方 ,DNA断裂信号强烈。在动物细胞中 ,p5 3和c myc起相反的调节作用 ,这与其同源基因在玉米中的作用模式相似。由此说明p5 3和c myc同源基因可能在玉米颖果发育PCD过程中起重要作用 ,并进一步推论高等植物PCD和动物细胞凋亡存在一定的保守性机制。 展开更多
关键词 玉米 p53同源基因 c—myc同源基因 程序性细胞死亡
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樱桃番茄Ph-3基因调控元件与同源基因系统进化分析
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作者 刘子记 刘维侠 +1 位作者 牛玉 杨衍 《北方园艺》 CAS 北大核心 2020年第6期31-37,共7页
以樱桃番茄品种"京番黄星"为试材,采用PlantCARE在线分析和Gcorn系统进化分析方法,研究了Ph-3基因的表达调控元件及同源基因系统进化特征,以期为进一步解析Ph-3表达调控机制奠定基础。结果表明:Ph-3启动子除了含有核心元件外... 以樱桃番茄品种"京番黄星"为试材,采用PlantCARE在线分析和Gcorn系统进化分析方法,研究了Ph-3基因的表达调控元件及同源基因系统进化特征,以期为进一步解析Ph-3表达调控机制奠定基础。结果表明:Ph-3启动子除了含有核心元件外,还含有光响应元件、赤霉素响应元件、茉莉酸甲酯响应元件、厌氧诱导元件、昼夜节律调控响应元件等。Ph-3同源基因系统进化分析结果表明,当同源指数为0.70时,番茄、马铃薯、辣椒含有Ph-3的同源基因,且同源基因属于直系同源基因。另外,由同源指数分析结果发现,番茄与马铃薯的亲缘关系最近,其次为辣椒。 展开更多
关键词 樱桃番茄 晚疫病 顺式调控元件 同源基因 直系同源基因
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苹果LEAFY同源基因的cDNA克隆与表达分析 被引量:27
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作者 曹秋芬 和田雅人 +3 位作者 孟玉平 黄静 孙毅 王果萍 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期267-271,共5页
从苹果的果台枝顶芽中克隆了两个长约 1 4kb的cDNA片段 ,分别定名为AFL1和AFL2。它们的碱基序列在编码区有 90 %的同源性 ,但在 3 末端非编码区仅有约 6 0 %的同源性。它们表达的肽链氨基酸序列与小叶杨、大豆、矮牵牛等有 70 %以上的... 从苹果的果台枝顶芽中克隆了两个长约 1 4kb的cDNA片段 ,分别定名为AFL1和AFL2。它们的碱基序列在编码区有 90 %的同源性 ,但在 3 末端非编码区仅有约 6 0 %的同源性。它们表达的肽链氨基酸序列与小叶杨、大豆、矮牵牛等有 70 %以上的同源性 ,与番茄、金鱼草、拟南芥有近 70 %的同源性 ,证明它们是LFY的同源基因。RT -PCR的结果表明 ,生长期AFL2在萼片、子房、根、茎、叶以及果台枝顶芽中都有表达 ,而AFL1只在果台枝顶芽中表达 ;在不同发育时期的果台枝顶芽中 ,AFL1在顶芽停止营养生长转向生殖生长以后才清晰表达 ,而AFL2在生长期 6~ 10月都有表达。因此认为苹果中的这两个LFY同源基因虽有共同的起源 ,但是在功能上存在差异 ,在花和营养组织的发育中起不同的作用。DNA印迹分析表明 ,在苹果属及近缘的梨属植物中LFY同源基因是多拷贝的。 展开更多
关键词 苹果 LEAFY 同源基因 CDNA克隆 基因表达 氨基酸序列
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银杏LEAFY同源基因的分离与克隆 被引量:20
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作者 张建业 陈力耕 +1 位作者 胡西琴 何新华 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第4期167-170,共4页
The flower meristem identity gene LEAFY is a developmental switch,sufficient for flower initiation in diverse plants. Ginkgo biloba is a kind of gymnosperm,and a dioecious tree species.The nucleotide DNA sequence was ... The flower meristem identity gene LEAFY is a developmental switch,sufficient for flower initiation in diverse plants. Ginkgo biloba is a kind of gymnosperm,and a dioecious tree species.The nucleotide DNA sequence was cloned from the genomic DNA of the tender leaves collected from a male tree in Ginkgo biloba L.cv.Dafushou.The analysis of DNA sequence structure indicated that the gene was composed of 3450 bp,and inferred the sequence to LEAFY gene of the male Ginkgo .Comparing the gene with LEAFY gene of the female Ginkgo reported in the relative references,the rate of homology was 99%,only lacking 3 nucleotides.The research work laid a sound foundation for studing the regulation and controlling flowering mechanism in Ginkgo biloba L.at the molecuar level in the future. 展开更多
关键词 LEAFY同源基因 分离 克隆 银杏 雄株 童期 开花 分子调控机理
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LEAFY同源基因研究进展 被引量:14
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作者 吕玲玲 孙光明 +3 位作者 刘玉革 魏长宾 刘胜辉 段俊 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期197-203,共7页
LEAFY(LFY)同源基因存在于所有的陆生植物中,在植物花发育早期表达,并在花发育过程中抑制茎端分生组织的营养生长,调控花分生组织和花器官的形成,使转LFY基因植株提前开花,LFY同源基因与其上下游基因共同调控花发育过程.LFY同源基因的... LEAFY(LFY)同源基因存在于所有的陆生植物中,在植物花发育早期表达,并在花发育过程中抑制茎端分生组织的营养生长,调控花分生组织和花器官的形成,使转LFY基因植株提前开花,LFY同源基因与其上下游基因共同调控花发育过程.LFY同源基因的蛋白质结构在不同物种间保守性很高,但它们的表达部位差异很大.该文总结了近年来国内外已经克隆到的LFY同源基因的表达、功能及其在果树、花卉、粮食作物上的应用,以期为植物花发育的深入研究提供参考. 展开更多
关键词 LEAFY同源基因 表达 功能 应用
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银杏LEAFY同源基因的时空表达 被引量:11
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作者 郭长禄 陈力耕 +2 位作者 何新华 戴正 袁海英 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期241-244,共4页
以银杏雄株、雌株成年树和还未开过花的幼树的根、茎、叶,雌株幼果和不同时期的雄花芽、雌花芽为材料,利用同位素标记,制备Ginlfy 和GinNdly 两个特异探针,进行 Northern分子杂交,研究银杏 LFY 同源基因Ginlfy、GinNdly 在银杏不同器官... 以银杏雄株、雌株成年树和还未开过花的幼树的根、茎、叶,雌株幼果和不同时期的雄花芽、雌花芽为材料,利用同位素标记,制备Ginlfy 和GinNdly 两个特异探针,进行 Northern分子杂交,研究银杏 LFY 同源基因Ginlfy、GinNdly 在银杏不同器官,花芽不同生长发育时期的时空表达情况。结果显示,无论是幼树,还是成年的雌株、雄株,Ginlfy 基因在各个器官,如根、茎、叶、雌花芽、雄花芽、幼果以及雌花芽、雄花芽的不同发育时期都有表达,属组成型表达,而GinNdly 基因只在叶和不同时期的雄花芽、雌花芽中表达,其他器官都不表达,属特异性表达。银杏双拷贝 LFY 同源基因中的GinNdly 基因可能与开花关系更为密切。 展开更多
关键词 银杏 LEAFY同源基因 Ginlfy GinNdly 表达
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植物Ⅴ类几丁酶苦瓜同源基因(McChi5)的克隆及特征分析 被引量:9
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作者 肖月华 侯磊 +4 位作者 袁小红 杨星勇 裴颖 罗小英 裴炎 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第11期1028-1033,共6页
苦瓜是一种病害很少的蔬菜作物。用 3′RACE方法从苦瓜叶片RNA中扩增了一个与烟草Ⅴ类几丁酶序列相似的片段 ,进一步用Y RACE方法扩增了相应的 5′端序列。经序列拼接 ,获得了植物Ⅴ类几丁酶苦瓜同源基因(McChi5 )的全长cDNA基因。该基... 苦瓜是一种病害很少的蔬菜作物。用 3′RACE方法从苦瓜叶片RNA中扩增了一个与烟草Ⅴ类几丁酶序列相似的片段 ,进一步用Y RACE方法扩增了相应的 5′端序列。经序列拼接 ,获得了植物Ⅴ类几丁酶苦瓜同源基因(McChi5 )的全长cDNA基因。该基因全长 1348bp ,含有一个 10 4 4bp的ORF。推测的蛋白质由 347个氨基酸组成 ,计算所得的分子量为 38.3kD ,等电点为 5 .77。同源性分析表明 ,McChi5蛋白与烟草V类几丁酶、拟南芥的推测几丁酶和类几丁酶蛋白、以及哺乳动物和细菌的一些几丁酶有序列相似性 ,并具有第 18家族糖基水解酶的保守域。Southernblotting表明 ,在苦瓜基因组中存在 2个拷贝的McChi5基因 ,同时也存在少数同源基因。RNAdotblotting分析表明 ,McChi5基因有组成性表达的特性 ,伤害处理对其表达的影响不明显。对McChi5基因可能的生物功能和应用作了进一步的讨论。 展开更多
关键词 植物 V类几丁酶 苦瓜 同源基因 克隆 特征分析 抗病性
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毛叶枣APETALA1同源基因的克隆 被引量:7
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作者 胡桂兵 徐昌杰 +3 位作者 陈大成 郑启发 安新民 张上隆 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期43-46,共4页
分析在植物花分生组织及花器官形成过程中起重要作用的APETALA1(AP1)基因的保守区序列 ,设计 1对长度为 2 3bp的PCR引物 ,以毛叶枣基因组DNA为模板 ,采用PCR方法扩增出长为 648bp的DNA片段 ,克隆入pUCm T载体 ,测序和序列分析结果表明... 分析在植物花分生组织及花器官形成过程中起重要作用的APETALA1(AP1)基因的保守区序列 ,设计 1对长度为 2 3bp的PCR引物 ,以毛叶枣基因组DNA为模板 ,采用PCR方法扩增出长为 648bp的DNA片段 ,克隆入pUCm T载体 ,测序和序列分析结果表明获得了毛叶枣AP1同源基因中部的 1个片段 ,该片段有 2个内含子 ,长度分别为15 2bp和 386bp ,编码区共编码 36个氨基酸 ,其序列已在GenBank中登记 (登记号为AF35 65 41) .在GenBank中进行同源性检索 ,结果表明其氨基酸序列与其他植物AP1同源基因的氨基酸序列同源性高达 66 %~ 88% 。 展开更多
关键词 毛叶枣 AP1基因 分子克隆 APETALAI 同源基因
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草莓AP1同源基因的克隆、表达及启动子分析 被引量:10
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作者 邹冬梅 刘月学 +3 位作者 张志宏 李贺 马跃 代红艳 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1972-1981,共10页
【目的】从草莓(Fragaria×ananassa)中克隆APETALA1(AP1)同源基因,并分析其在不同组织、器官及不同花发育阶段的表达水平,探讨其在草莓植株成花进程中的作用。【方法】根据其它物种AP1同源基因的保守序列设计简并引物,以草莓幼叶... 【目的】从草莓(Fragaria×ananassa)中克隆APETALA1(AP1)同源基因,并分析其在不同组织、器官及不同花发育阶段的表达水平,探讨其在草莓植株成花进程中的作用。【方法】根据其它物种AP1同源基因的保守序列设计简并引物,以草莓幼叶和花芽为试材,克隆得到AP1的基因片段,在此基础上利用RACE的方法分离获得其cDNA全长。利用实时定量RT-PCR分析草莓不同组织、器官及不同花发育阶段中AP1同源基因的表达水平。利用染色体步移的方法分离启动子序列。【结果】从草莓品种‘花姬’中克隆出AP1同源基因的cDNA全长序列,命名为FaAP1;其CDS长度为735 bp,编码245个氨基酸,与玫瑰AP1-1的氨基酸序列同源性最高,达到92%,与拟南芥AtAP1的氨基酸序列同源性为64.00%。FaAP1编码的氨基酸全长序列符合MADS-box基因家族特征,包含MADS-box、I-间插域、K-box域和C-末端几个结构域,是MIKC类型的MADS-box基因家族的成员。实时定量RT-PCR结果表明,在不同组织、不同花器官及不同花发育阶段中FaAP1的表达量存在差异。其启动子除了具有TATA/CAAT-box外还包含一些特异作用元件。【结论】从草莓中分离出的FaAP1基因,在花分生组织形成和花器官发育中有一定的调控作用。 展开更多
关键词 草莓 AP1同源基因 分离 表达 启动子
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NYGGF4小鼠同源基因mRNA在遗传性ob/ob肥胖小鼠体内的表达 被引量:16
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作者 夏黎 钱玲梅 +6 位作者 孔祥清 倪毓辉 张春梅 童梅玲 池霞 吴伟玲 郭锡熔 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第19期1488-1490,共3页
目的观察NYGGF4小鼠同源基因在遗传性ob/ob肥胖小鼠(以下简称ob/ob小鼠)与正常C57/BL6J小鼠脂肪组织中的差异表达,分析NYGGF4小鼠同源基因在ob/ob小鼠体内的多组织表达特征,探讨NYGGF4小鼠同源基因与肥胖之间的关系。方法雄性10周龄ob/o... 目的观察NYGGF4小鼠同源基因在遗传性ob/ob肥胖小鼠(以下简称ob/ob小鼠)与正常C57/BL6J小鼠脂肪组织中的差异表达,分析NYGGF4小鼠同源基因在ob/ob小鼠体内的多组织表达特征,探讨NYGGF4小鼠同源基因与肥胖之间的关系。方法雄性10周龄ob/ob小鼠、正常小鼠(对照组)各12只,以乌拉坦(0.4g/kg)深度麻醉后取腹膜后脂肪、肝、脑、骨骼肌、心肌、结肠、肾、小肠、肺、胸腺、脾等组织,采用RT-PCR技术检测NYGGF4小鼠同源基因的mRNA表达水平,比较NYGGF4小鼠同源基因在ob/ob小鼠与正常对照小鼠腹膜后脂肪组织中的差异表达及在ob/ob小鼠各组织中的表达。结果1.ob/ob小鼠体质量[(38.94±1.97)g]显著高于对照组小鼠[(18.47±0.66)g](P<0.001);2.NYGGF4小鼠同源基因在ob/ob小鼠腹膜后脂肪组织中的表达水平[(89.18±8.31)%]显著高于对照组小鼠[(56.84±9.54)%](P<0.001);3.NYGGF4小鼠同源基因在肝脏、脑、腹膜后脂肪、骨骼肌、心肌、结肠、肾脏等组织中均有表达,从高至低依次为肝脏>脑>腹膜后脂肪>骨骼肌>心肌>结肠>肾脏,虽在小肠、肺、胸腺、脾等组织中未检测到阳性信号,但总体上呈现多组织表达特征。结论NYGGF4小鼠同源基因可能参与肥胖发生的病理生理机制,并在肝脏、脑、腹膜后脂肪、骨骼肌等胰岛素作用的靶组织中表达水平相对较高。 展开更多
关键词 NYGGF4小鼠同源基因 遗传性ob/ob小鼠 肥胖 组织 表达
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荔枝LEAFY同源基因克隆及表达分析 被引量:9
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作者 李宁 陈厚彬 +2 位作者 张昭其 胡志群 周碧燕 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期57-61,共5页
采用RT-PCR与RACE-PCR相结合的方法,从‘糯米糍’荔枝Litchi chinensis花芽中分离得到了‘糯米糍’荔枝LEAFY同源基因(LcLFY)的cDNA全长序列.基因全长1 397 bp,其中编码区1 171个碱基,推测编码390个氨基酸.采用半定量PCR技术研究了LFY... 采用RT-PCR与RACE-PCR相结合的方法,从‘糯米糍’荔枝Litchi chinensis花芽中分离得到了‘糯米糍’荔枝LEAFY同源基因(LcLFY)的cDNA全长序列.基因全长1 397 bp,其中编码区1 171个碱基,推测编码390个氨基酸.采用半定量PCR技术研究了LFY同源基因在荔枝花芽分化进程的表达情况.结果表明,在‘糯米糍’荔枝花芽分化开始时检测到LFY同源基因的表达,在花序原基出现前后表达增强,但在花分化的阶段表达水平明显减弱. 展开更多
关键词 荔枝 花芽分化 LFY同源基因
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柑橘LEAFY同源基因片段的克隆及分析 被引量:6
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作者 刘淑芳 陈力耕 +1 位作者 陈大明 徐昌杰 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期297-300,共4页
在提取大三岛脐橙 ( Citrus sinensis ( L) Osbeck)基因组 DNA的基础上 ,利用 Uneven PCR的方法克隆了脐橙中的 LEAFY( L FY)同源基因片段 .经对该基因片段的核苷酸序列分析表明 ,它和烟草中的 L FY同源基因 N FY基因在结构上高度保守 ... 在提取大三岛脐橙 ( Citrus sinensis ( L) Osbeck)基因组 DNA的基础上 ,利用 Uneven PCR的方法克隆了脐橙中的 LEAFY( L FY)同源基因片段 .经对该基因片段的核苷酸序列分析表明 ,它和烟草中的 L FY同源基因 N FY基因在结构上高度保守 ,同源性高达 90 展开更多
关键词 柑橘 LEAFY同源基因 克隆 UnevenPCR 核苷酸序列
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