2024年5月17日,上海交通大学医学院附属新华医院临床遗传中心余永国团队在Genet in Medicine杂志发表研究论文“Genome-wide epigenetic signatures facilitated the variant classification of the PURA gene and uncovered the pathom...2024年5月17日,上海交通大学医学院附属新华医院临床遗传中心余永国团队在Genet in Medicine杂志发表研究论文“Genome-wide epigenetic signatures facilitated the variant classification of the PURA gene and uncovered the pathomechanism of PURA-related neurodevelopmental disorders”。该研究对23例携带PURA基因变异的神经发育障碍(PURA-NDD)患者进行了基因型-表型分析,同时应用全基因组甲基化芯片对其中17例患者外周血DNA进行了检测和分析,发现了一些之前未被报道的新表型。同时,全基因组DNA甲基化分析揭示了PURA-NDD独特的甲基化谱,发现携带PURA单倍剂量不足变异和错义变异的患者具有相似的DNA甲基化特征,通过机器学习建立的分类模型帮助3例携带PURA意义不明错义变异重新分类为致病变异。进一步体外实验结果显示,PURA错义变异与截短变异的细胞均显示Pur-α表达下调,表明存在共同的单倍剂量不足机制。该研究首次建立了PURA-NDD的甲基化谱,可以帮助识别和诊断不典型PURA-NDD患者,体现了其在遗传疾病诊断中的价值。展开更多
近年来,全基因组关联研究（genome-wide association studies,GWAS）取得了举世瞩目的成就,识别了成千上万个复杂疾病（complex disease）遗传易感位点[1]。然而,疾病的发生还与遗传以外的诸多因素有关,包括表观遗传（epigenetics）的改...近年来,全基因组关联研究（genome-wide association studies,GWAS）取得了举世瞩目的成就,识别了成千上万个复杂疾病（complex disease）遗传易感位点[1]。然而,疾病的发生还与遗传以外的诸多因素有关,包括表观遗传（epigenetics）的改变[2]。这类问题的阐述需要通过与全基因组关联研究类似的大规模、展开更多
文摘2024年5月17日,上海交通大学医学院附属新华医院临床遗传中心余永国团队在Genet in Medicine杂志发表研究论文“Genome-wide epigenetic signatures facilitated the variant classification of the PURA gene and uncovered the pathomechanism of PURA-related neurodevelopmental disorders”。该研究对23例携带PURA基因变异的神经发育障碍(PURA-NDD)患者进行了基因型-表型分析,同时应用全基因组甲基化芯片对其中17例患者外周血DNA进行了检测和分析,发现了一些之前未被报道的新表型。同时,全基因组DNA甲基化分析揭示了PURA-NDD独特的甲基化谱,发现携带PURA单倍剂量不足变异和错义变异的患者具有相似的DNA甲基化特征,通过机器学习建立的分类模型帮助3例携带PURA意义不明错义变异重新分类为致病变异。进一步体外实验结果显示,PURA错义变异与截短变异的细胞均显示Pur-α表达下调,表明存在共同的单倍剂量不足机制。该研究首次建立了PURA-NDD的甲基化谱,可以帮助识别和诊断不典型PURA-NDD患者,体现了其在遗传疾病诊断中的价值。
文摘近年来,全基因组关联研究（genome-wide association studies,GWAS）取得了举世瞩目的成就,识别了成千上万个复杂疾病（complex disease）遗传易感位点[1]。然而,疾病的发生还与遗传以外的诸多因素有关,包括表观遗传（epigenetics）的改变[2]。这类问题的阐述需要通过与全基因组关联研究类似的大规模、
