河北省两类奶牛场大肠杆菌耐药性检测及多位点序列分型分析

为研究抗菌药物减量使用对细菌耐药性的影响,本试验从抗菌药物减量使用达标奶牛场和非达标奶牛场采集肛拭子样品,进行常规细菌分离鉴定,对分离株进行耐药表型、基因型检测和多位点序列分型(Multi-locus sequencetyping,MLST)。比较两类奶牛场大肠杆菌的耐药表型和基因型的差异性。结果显示,从174个肛拭子样品中分离到了173株大肠杆菌,达标场84株,非达标场89株,总体分离率为99.4%。耐药性检测发现,达标场和非达标场大肠杆菌耐药率无显著性差异(P>0.05)。分离株中共有23株大肠杆菌具有多重耐药性,多数五重及以上耐药菌株来自于非达标场。除QnrB基因达标场检出率高于非达标场外(P<0.05),两类奶牛场其他耐药基因检出率差异不显著(P>0.05)。MLST分型发现25种ST类型,其中20种为已知ST型,5种新ST型。达标场大肠杆菌的优势型为ST109型,非达标场大肠杆菌的优势型为ST10和ST1307型。奶牛场大肠杆菌的耐药表型、基因型与ST型之间无相关性。

航空食品生产环境中肠杆菌科细菌的分离鉴定及多位点序列分型研究

目的对航空食品生产环境中肠杆菌科细菌进行分离鉴定和多位点序列分型研究,了解生产环境中肠杆菌科细菌的污染状况和来源。方法采集航空食品生产车间的操作台、推车和地面等32份环境涂抹样品,从中分离肠杆菌科细菌,采用生化实验和16S rDNA测序方法鉴定细菌种类,并进行多位点序列分型。结果从32份环境涂抹样品中分离出7株肠杆菌科细菌,包括3株产酸克雷伯菌、2株肺炎克雷伯菌、1株阴沟肠杆菌、1株河生肠杆菌。3株产酸克雷伯菌多位点序列分型的型别为ST126、ST160和ST277。结论本研究未从航空食品生产环境中分离到致病菌,但分离到肺炎克雷伯菌和产酸克雷伯菌、阴沟肠杆菌、河生肠杆菌等条件致病菌,这些条件致病菌对食品的污染风险也应引起重视。

β-内酰胺耐药粪肠球菌的低亲和力青霉素结合蛋白检测与多位点序列分型

目的检测临床分离粪肠球菌的耐药性、低亲和力青霉素结合蛋白pbp4基因和多位点序列分型(MLST)情况。方法收集临床分离的粪肠球菌78株,使用自动化仪器检测其耐药性;采用PCR扩增及基因测序的方法检测TEM基因和pbp4基因突变的突变情况;应用MLST对分离菌株进行进行多位点序列(MLST)分型。结果78株粪肠球菌对环丙沙星、左氧氟沙星、利福平、红霉素、四环素以及高浓度庆大霉素的耐药率较高,对青霉素和氨苄青霉素的耐药率为10.3%,未发现对呋喃妥因、万古霉素、替考拉宁和利奈唑胺耐药的菌株;78株粪肠球菌中有8株扩增出TEM基因,全部对青霉素和氨苄青霉素耐药,阳性率为10.3%;78株粪肠球菌共分为16个序列型,其中ST179型和ST16型最多,分别有21株和20株,占26.9%和25.6%,其余依次为ST6型8株(10.3%),ST4型7株(9.0%),ST585型6株(7.7%),ST480型4株(5.1%),ST28型3株(3.8%),其余各ST型只检出1株;分析ST型别与耐药性的关系显示相同ST型别的粪肠球菌具有类似的耐药谱。结论粪肠球菌对β-内酰胺类抗菌药物的耐药机制主要是由于产生由TEM基因介导的β-内酰胺酶所致,与pbp4基因的突变没有必然联系;粪肠球菌分离菌株主要以CC16(包含ST16和ST179)克隆株为主且耐药情况严重,需要针对其特点指导临床用药并加强院内感染监控。

碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌耐药性及多位点序列分型研究

目的探讨碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌(CRAB)的耐药性及多位点序列分型,为医院内感染控制及临床合理用药提供理论依据。方法对北京市昌平区医院2017—2019年临床分离的47株CRAB进行药物敏感性试验,分子流行病学研究应用多位点序列分型(MLST)技术,MLST结果的分析使用eBURST软件。结果47株CRAB主要来源于痰标本(80.9%),主要分布在内科重症监护病房(66.0%)、呼吸科(10.6%)、重症监护病房(8.5%)等;除阿米卡星(81.4%)、复方磺胺甲噁唑(41.9%)、替加环素(40.0%)外,对其余检测药物的敏感率均低于5.0%。经扩增得到4种序列型(ST),以ST208(25株,53.2%)、ST195(19株,40.4%)为主,其次为ST369(2株,4.3%)和ST523(1株,2.1%);eBURST分析显示,4种ST都属于克隆复合体92(CC92)。结论大多数抗菌药物对CRAB的耐药率很高,CC92在医院流行播散,临床要重视CRAB感染的预防和管理。

产酸克雷伯菌核心基因组多位点序列分型方案

目的对产酸克雷伯菌进行核心基因组多位点序列分型(cgMLST)并探索产酸克雷伯菌克隆群(clonal groups,CGs)在国家或地区层面上的遗传多样性。方法chewBBACA被用作GbG(gene-by-gene)分析的生物信息学管道,从整个物种的基因组序列中进行集群识别,以构建和验证产酸克雷伯菌的cgMLST方案。公开获得的21个完整的产酸克雷伯菌基因组序列用于cgMLST方案的创建,386个不完整的产酸克雷伯菌基因组序列用于cgMLST方案的验证。结果建立了一个针对3356个核心基因的cgMLST(简称3356-cgMLST)方案。提出的3356-cgMLST方案实现了针对98%以上(400/407)的产酸克雷伯菌分离株基因组序列的分型。根据提出的3356-cgMLST方案,最终纳入分型的400株产酸克雷伯菌基因组序列中共确定了130个CGs。基于3356-cgMLST方案获得的CGs分布情况可以看出产酸克雷伯菌呈现出明显的多国家多地区传播现象。结论本研究为产酸克雷伯菌提供一个公开的3356-cgMLST方案,并揭示产酸克雷伯菌基因组序列呈现高度的遗传多样性,CG26为优势克隆群。

妊娠35~37周女性定植B族链球菌的血清和多位点序列分型及其相互关系

目的 探讨北京某妇产医院妊娠35~37周女性生殖道和消化道定植的B族链球菌(group B streptococcus,GBS)的血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)及其之间的关系,为临床防治GBS感染以及疫苗的研制提供参考依据。方法 妊娠35~37周女性常规进行阴道、直肠拭子联合采样,通过细菌培养、鉴定,分离GBS菌株,利用多重聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术及第一代测序分别进行荚膜多糖血清分型和MLST分型,并通过统计学方法分析两种分型之间的关联性。结果 147名妊娠妇女定植GBS菌,其中共发现7种血清型,前三位分别是Ⅲ型占38.7%(57/147)、Ia型占35.3%(52/147)、Ib型占19.0%(28/147),另有2株未分型(non-typeable,NT)占1.4%(2/147);MLST分型共发现22种基因型,其中最主要的基因型是ST19占30.6%(45/147)、ST10占17.0%(25/147)、ST12占12.2%(18/147)、ST1占10.2%(15/147),另有3株菌为新发现的基因型占2.0%(3/147);GBS菌株主要血清型(Ia、Ib、Ⅲ)和MLST的主要分型(ST1、ST10、ST12、ST19)之间关联性存在统计学意义(χ^(2)=75.29,P<0.05),进一步计算了Pearson列联系数C=0.6。结论 本研究中,最常见3种血清型(Ⅲ型、Ⅰa型、Ⅰb型)覆盖了93.2%妊娠妇女定植的GBS(137/147),GBS荚膜多糖三价结合疫苗包含上述三种血清型,提示该疫苗应用可能减少本地区围生期妇女GBS定植。ST19/Ⅲ、ST10/Ia和ST12/Ia型是妊娠妇女定植的主要序列型/血清型,为研制有针对性的GBS疫苗提供参考依据。另外,多位点序列分型中新序列型的发现补充了B族链球菌MLST数据库。

柠檬酸杆菌基因组多位点序列分型(in silico MLST )研究

对4株柠檬酸杆菌分离株进行全基因测序分析,并基于基因组序列进行16s rRNA、多位点序列分型(in silico MLST)及其遗传进化关系研究。对分离的4株柠檬酸杆菌进行全基因组测序,经拼接得到全基因组序列,然后进行16S rRNA物种鉴定、in silico MLST分析,并基于MLST分型构建遗传进化树,分析分离株的遗传进化关系。全基因组测序分析结果表明,柠檬酸杆菌的基因组大小介于4.771~5.477 Mb之间,平均为5.03 Mb;基因数量在4591~5334之间,平均为4871个。16s rRNA分析结果表明,4株柠檬酸杆菌分离菌中有3株为布雷氏柠檬酸杆菌,1株为沃克曼氏柠檬酸杆菌。MLST分析结果表明,4株柠檬酸杆菌均是新的ST型。该研究分析了4株柠檬酸杆菌的基因组,基因组MLST分型分析表明4株分离菌均为新ST型,丰富了柠檬酸杆菌的菌种资源和遗传信息,为柠檬酸杆菌的防控、溯源奠定了基础。

1株鹅源柠檬酸杆菌的分离鉴定及多位点序列分型研究

为查明引起广西南宁市某鹅场鹅患病死亡的病原,并了解其病原学特征,试验首先采集病死鹅的肝脏、肺脏等组织病料并对其进行易感病毒检测和细菌分离鉴定,然后对分离菌株进行16S rRNA基因PCR扩增、致病性试验、毒力基因检测、药敏试验、多位点序列分型,最后基于多位点序列分型结果构建系统发育树分析分离菌株的遗传进化特征。结果表明:在病死鹅的组织样品中未检测到小鹅瘟病毒、鸭病毒性肝炎病毒、鸭坦布苏病毒、鸭呼肠孤病毒、鸭圆环病毒、禽流感病毒、新城疫病毒,经细菌分离和16S rRNA基因PCR扩增鉴定出1株柠檬酸杆菌,小鼠腹腔注射0.5 mL的分离菌株菌液(浓度为4×108cfu/mL)48 h后全部死亡,剖检后可见肺脏出血、肝脏淤血、脾脏肿大出血等病变,感染小鼠肺泡间隔增宽、肝窦充满红细胞、脾窦扩张。分离菌株含有毒力基因ompX、ureF和cfa;对青霉素、头孢氨苄、阿莫西林、链霉素、卡那霉素、庆大霉素、四环素、氟苯尼考、磺胺甲口恶唑、万古霉素、多黏菌素、强力霉素耐药,对头孢呋辛、亚胺培南中介,对头孢他啶、头孢噻肟、阿米卡星、诺氟沙星、环丙沙星、美罗培南敏感。分离菌株的5个管家基因aspC、clpX、fadD、arcA和lysP与PubMLST数据库中已有的等位基因完全匹配,其他2个管家基因dnaG和mdh无匹配。分离菌株与分离自欧洲的人囊肿伤口中的柠檬酸杆菌菌株CB00003亲缘关系最为密切。说明引起广西南宁市某鹅场鹅死亡的病原为柠檬酸杆菌,该分离菌株毒力较强,属于新的序列类型。

全球副溶血弧菌环境菌株的基于碱基序列和肽链序列的多位点序列分型

为了了解来自全球的副溶血弧菌环境菌株的群组结构和克隆复合体构成,利用PubMLST公共数据的数据,筛选其中具有完整序列分型（sequence type,ST）及肽序列型（peptide sequence type,pST）的来自全球的副溶血弧菌环境菌株数据,进行亚群分析和克隆复合体分析,并分别构建了基于ST型和pST型的最小生成树。结果表明,从数据库中共筛选到具有ST型及pST型的来自全球的副溶血弧菌环境菌株数据886条,共含有663个ST型,以ST3型为最多,但也仅含27条菌株信息。其中,有436条菌株数据来自中国（包括大陆、香港和台湾）,覆盖了410个ST型,每个ST型含1~4条菌株数据,这436条菌株数据又可分为128个pST型,其中pST1型为最多,达116条菌株数据。利用eBURST软件对数据进行分析,共发现了73个组,483个单体。STRUCTURE软件分析显示来自全球的副溶血弧菌环境菌株的适宜亚群数为4,各亚群内的样品平均距离为0.981 7。综上结果表明,来自全球的副溶血弧菌环境菌株具有高度多态性,可更细分为4个亚群,MLST分型时以ST3型为多,AA-MLST分型时以pST1型为主。

171株儿童侵袭性肺炎链球菌血清分型和多位点序列分型研究

目的了解侵袭性肺炎链球菌在中国儿童中的多位点序列分型(MLST)状况。方法对2006—2008年中国11家儿童医院分离的171株侵袭性肺炎链球菌,采用简易棋盘式肺炎链球菌分型试剂盒进行血清型分型,用聚合酶链反应(PCR)扩增7个看家基因并测序,根据7个基因型的组合确定序列分型(ST)。结果 171株侵袭性肺炎链球菌常见的血清型为19F(19.9%),14(19.3%),19A(18.1%),6B(9.4%)和23F(6.4%),其中有5株(2.0%)用丹麦抗血清无法确定血清型。共检出65种ST,12个克隆群,有1株因未扩增出aroe位点的等位基因无法分型。其中ST320最常见,占17.5%,其次为ST271(13.5%)、ST876(10.5%)。常见的ST同源复合群是CC320(33.9%)和CC876(13.3%)。发现20种新的ST型,已被MLST数据库录入,并有3个新的等位基因序列。结论分离自中国儿童的侵袭性肺炎链球菌主要为ST320、ST271和ST876等3种,流行的克隆群为CC271、CC876。

非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究

目的对国内部分地区非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株进行分子分型分析,了解菌株间的遗传进化关系。方法根据mlst.ucc.ie数据库提供的大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)方案,对来自我国河南、黑龙江2省的29株非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的7个管家基因进行PCR扩增并测序,通过序列比对确定其等位基因谱及菌株序列型(Sequence type,ST),使用MEGA、eBURST生物信息软件分析不同ST序列群及菌株间的进化关系。结果 29株非O157产志贺毒素大肠杆菌呈现较大的遗传多态性,可分为13个ST型别,其中ST155为优势型别(34.48%)。同时研究发现2个新等位基因型(fumC376、recA214)和3个新序列型(ST2460、ST2467、ST2468)。结论 29株非O157产志贺毒素大肠杆菌菌株之间具有分子多态性,与国际流行菌株具有一定的亲缘关系。加强我国对这一类菌株的检测和监测具有重要的公共卫生意义。

多位点序列分型技术在鲍曼不动杆菌同源性分析中的应用

目的了解我院ICU病房鲍曼不动杆菌的分子流行特征,分析其基因同源性,为医院感染控制提供实验室依据。方法收集暨南大学附属第一医院ICU病房分离的107株鲍曼不动杆菌,采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术,PCR扩增gltA、gyrB、gdhB、recA、cpn60、gpi和rpoD 7个管家基因片段,测序结果与PubMLST数据库比对分析,利用eBURST软件绘制不同基因型之间的进化关系图。结果 107株鲍曼不动杆菌被分为4个基因型,分别是ST-136(31株)、ST-195(7株)、ST-208(58株)和一个新的基因型(11株),其中ST136、ST195和ST208基因型具有同源相关性。结论我院ICU病房的鲍曼不动杆菌具有水平传播特征,多位点序列分型技术可用于临床鲍曼不动杆菌的基因分型。

多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用

目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。

牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究

目的对牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)进行多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)分析,了解菌株的遗传进化关系及致病潜力。方法根据E.coli MLST数据库(http://mlst.ucc.ie/mlst/dbs/Ecoli)提供的MLST方案,对青海玉树牦牛中分离的54株STEC分离株的7个管家基因进行PCR扩增并测序,通过序列比对确定其等位基因及菌株序列型(Sequence type,ST),并使用BioNumerics软件构建最小生成树(Minimum spanning tree,MST),分析牦牛ST型与HUSEC及人源主要流行血清群STEC菌株ST型间的进化关系。结果 54株牦牛STEC菌株呈现高度遗传多态性,可分为31个ST型别,其中包括7个新的等位基因型和17个新的ST型,并存在与HUSEC及主要流行血清群STEC亲缘关系相同或相近的ST型别。结论青藏高原牦牛携带的STEC具有遗传多样性及一定的特异性,部分菌株具有对人致病的潜力。

临床分离的肺炎链球菌耐药性分析及多位点序列分型

目的了解泉州地区临床分离的肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,SP)的耐药性特征及多位点序列分型(multilocus sequence type,MLST)。方法针对45株临床分离的SP用E-test法和纸片扩散法检测菌株对14种常用抗菌素的敏感性,以PCR方法检测耐药基因erm B、mef E、mef A及转座子家族int Tn916/Tn1545转座酶基因,采用多位点序列分型(MLST)技术分析菌株序列型(ST)。结果 SP对红霉素、克林霉素、复方磺胺甲噁唑、四环素、青霉素、头孢噻肟、头孢吡肟、美罗培南、阿莫西林、氯霉素、左氧氟沙星的耐药率分别97.8%、93.3%、73.3%、82.2%、26.7%、44.4%、42.1%、26.7%、24.4%、11.1%和4.4%,未见对替考拉宁、利奈唑胺和万古霉素的耐药性;耐药基因erm B、mef E、mef A及转座子家族int Tn916/Tn1545转座酶检出率分别为97.78%、51.11%、44.44%和91.11%;MLST共分出21个ST型,存在一个优势型别ST271,占44.4%(20/45);ST271在mef耐药基因检出率要高于其它散在STs,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论本地区分离的SP耐药较为严重,且更多的表现为多重耐药;耐药机制主要表现为erm B编码的23S r RNA甲基化酶致靶位改变以及int Tn916/Tn1545接合性转座子介导的耐药传播;ST271是本地区分离SP的主要ST型,并且以多重耐药为主。

浙江省副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株多位点序列分型研究

目的掌握浙江省不同来源的副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株的分子分型特征,为副溶血性弧菌食源性疾病的预防控制提供技术支持。方法选择副溶血性弧菌的7个管家基因dnaE、gyrB、recA、dtdS、pntA、pyrC及tnaA,对62株不同来源的副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株样本进行PCR扩增、测序,Chromas软件和DNA Star软件分析,核酸序列上传至MLST数据库进行比对,获得每株菌的序列型,绘制多位点序列分型遗传进化树并进行亲缘性分析。结果 62株副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株中,59株菌为ST-3型(3,4,19,4,29,4,22),1株菌为ST-121型(3,2,82,52,4,78,66),1株菌为新的ST型(5,10,34,27,77,49,23),1株菌仅gyrB基因第562位点由C突变为T,其余基因序列与ST4型(3,5,22,12,20,22,25)一致。结论浙江省副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株的主要MLST型别为ST-3型。

碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌多位点序列分型和不同ST分型感染患者的临床特点

目的对临床分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CR-KPN)进行多位点序列分型(MLST),同时研究不同ST分型感染患者的临床特点。方法收集2013年1月-2015年6月辽宁省为主5所医院临床分离的61株CR-KPN,采用微量肉汤稀释法测定受试菌株对14种抗菌药物的敏感性。应用PCR基因扩增技术及DNA测序方法对受试菌株进行碳青霉烯酶基因检测。通过对受试菌株进行MLST,探讨其克隆相关性和分子流行病学特征。同时分析不同ST分型下CR-KPN的耐药特点、耐药机制及菌株感染的临床特点。结果 MLST分型显示61株CR-KPN共有18种ST分型,ST11为优势型别(53.3%),研究同时发现这部分ST11型菌株更容易对碳青霉烯类抗生素耐药且MIC值较高,大部分产KPC-2型碳青霉烯酶。单因素分析提示ST11组患者在ICU接受治疗所占的比例及机械通气的使用率高于非ST11组,差异具有统计学意义。其他ST型中ST2033、ST2135、ST2193、ST2194、ST2195、ST2196为世界范围内首次注册,其中ST2193、ST2194、ST2195与ST11有密切的亲缘性。临床资料提示同一所医院同一时期以相同克隆流行为主。结论 MLST显示CR-KPN共有18种ST型别,ST11为优势型别,结合临床资料发现同一所医院同一时期以相同克隆流行为主,提示CR-KPN有局部播散的风险。鉴于临床资料分析提示接受过ICU治疗和机械通气的患者容易发生CR-KPN菌株(特别是ST11型)感染的风险,此类患者应引起临床的广泛重视。

血流感染和皮肤软组织感染金黄色葡萄球菌耐药特征及多位点序列分型

目的了解血流和皮肤软组织感染金黄色葡萄球菌(金葡菌)耐药特征及多位点序列分型(MLST)特征。方法采用BD Phoenix^(TM) 100进行金葡菌鉴定与药敏检测,采用WHONET 5.6软件及SPSS 19.0软件对细菌耐药率进行统计分析,采用MLST方法对金葡菌进行分子分型。结果共收集47株血流感染金葡菌和62株皮肤软组织感染金葡菌,血流和皮肤软组织感染金葡菌中MRSA检出率分别为21.3%(10株)和61.3%(38株),未发现对万古霉素、利奈唑胺、替考拉宁、夫西地酸和高水平莫匹罗星耐药菌株。血流感染MRSA株MLST分型以ST59为主(40.0%,4/10),MSSA株以ST7、ST188为主(各16.2%,6/37)。皮肤软组织感染MRSA株以ST338为主(47.4%,18/38),MSSA株以ST5、ST88为主(各12.5%,3/24)。结论血流感染MRSA检出率低于皮肤软组织感染(P<0.05),血流感染和皮肤软组织感染MRSA株优势ST分别为ST59和ST338,MSSA株ST呈多样化分布。

致病性钩端螺旋体的多位点序列分型研究

目的通过对致病性钩端螺旋体(简称钩体)多位点序列分型(MLST)分析,了解国内与全球致病性钩体种群结构及其分子进化。方法应用16S rRNA基因测序和MLST分析方法对不同来源、不同时期国内钩体分离菌株与国际参考菌株进行分析,并与国内7株疫苗株结果平行比较,同时收集已公开的来自不同国家和不同时期1238株致病性钩体的基因种与MLST数据进行种群结构分析。结果16S rRNA基因测序分析结果显示7株钩体国际参考菌株和47株国内菌株基因种主要为问号基因种,分别占比71.4%和59.6%。7株国际参考菌株呈现7种不同ST型。而在47株中国钩体分离株中,发现15种ST型及24种尚未报道的新ST型。MLST聚类分析发现问号、波氏和卫氏基因种菌株均各自形成单独分支。7株不同ST的疫苗株也位于问号基因种内不同亚分支中。系统发育进化树表明世界范围内近百年分离的1238株钩体菌株主要包括16个进化簇,分别为ST17、ST34、ST149、ST1和ST37等,而中国236株钩体菌株可分为4个主要进化簇,主要流行基因型为ST1、ST128、ST17和ST143;不同国家流行菌株的基因种和ST型不尽相同。致病性钩体可在不同宿主物种广泛地交叉感染,不同国家间相互传播。结论获得我国致病性钩体基因种和MLST基因多态性资料,并系统地了解国内和全球致病性钩体种群结构和遗传进化关系,为后续致病性钩体监测和溯源提供科学指导。

碳青霉稀类耐药肺炎克雷伯菌耐药机制和多位点序列分型研究

碳青霉烯类抗菌药物被认为是为数不多的可有效治疗高产AmpC酶和超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）多重耐药菌引起的严重感染的药物之一。然而，随着碳青霉烯类药物在临床中的大量、广泛应用，碳青酶烯类耐药的肠杆菌科细菌不断增加。其机制主要是细菌产生的碳青霉烯酶能够水解碳青霉稀类抗生素。