陕北白绒山羊FGF5基因多态性分析

陕北白绒山羊是以辽宁白绒山羊为父本,本地黑山羊为母本,历经25年培育而成的绒肉兼用山羊新品种。具有产绒量高、羊绒纤维细长、绒色纯白和光泽好等优点。绒毛纤维的细度是分析绒毛品质和使用价值的重要指标,可决定山羊绒的纺织性能和经济价值。

GRB7基因在5个猪群体内的多态性分析

采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析GRB7基因在杜洛克猪、长白猪、大白猪、梅山猪和申农猪群体内的多态性。结果表明:猪GRB7基因片段长度为626 bp,检测发现该片段的163 bp和243 bp处存在突变位点。163位点突变在杜洛克猪群体内CC基因型较多,在长白猪、大白猪和申农猪群体内CT基因型较多,在梅山猪群体内TT基因型较多。243位点突变在杜洛克猪、长白猪和大白猪群体内CT基因型较多,在申农猪和梅山猪群体内TT基因型较多。GRB7基因TTTT合并基因型在申农猪和梅山猪群体内为优势基因型,在杜洛克猪和长白猪群体内CCTC合并基因型频率较高,在大白猪群体内CTCT合并基因型频率较高。

长春地区人群HPA 1-6,15系统基因多态性分析

人类血小板抗原系统HPA(Human Platelet Antigen)是由单核苷酸多态性(SNPs)导致单一氨基酸取代而导致的免疫原性结构,是血小板膜糖蛋白(GPIIb/IIIa、GPIa、GPIbα、GPIbβ和CD109)的构成部分,并且具有遗传多态性,可以介导产生同种免疫性抗体,并进一步导致血小板同种异体免疫反应的发生。

小梅山、中梅山及大约克猪的SLA-DQB基因外显子2 PCR-RFLP多态性分析

采用限制性内切核酸酶RsaⅠ对中国地方猪种小梅山、中梅山及国外猪种大约克SLA DQB基因外显子 2的2 73bp扩增产物进行多态性分析。小梅山猪酶切后出现两种基因型 :2 4 6bp 2 7bp(AA)、132bp 84bp 30bp 2 7bp(BB) ;中梅山猪中出现 4种基因型 :2 4 6bp 2 7bp(AA)、132bp 84bp 30bp 2 7bp(BB)、132bp 114bp 2 7bp(CC)、2 4 6bp 132bp 84bp 30bp 2 7bp(AB) ;大约克猪中出现 5种基因型 :2 4 6bp 2 7bp(AA)、132bp 84bp 30bp 2 7bp(BB)、132bp 114bp 2 7bp(CC)、2 4 6bp 132bp 84bp 30bp 2 7bp(AB)、2 73bp 2 4 6bp 2 7bp(AD)。分析发现 ,SLA DQB基因外显子 2的 11、94和 12 4位碱基表现出多态性并在 3个猪种中检测到A、B、C和D 4个等位基因 ;χ2 适合性检验结果表明 ,小梅山、中梅山及大约克SLA DQB基因外显子 2在RsaⅠ酶切位点已经达到了Hardy

原鸡线粒体DNA部分序列多态性分析

测定了分布于中国的红原鸡两个亚种(Gallusgallusspadiceus亚种、Gallusgallusjabouillei亚种)5个个体的线粒体细胞色素B(cytb)部分序列(289bp)和控制区(D 环)的部分序列(539bp),并结合GENBANK中已有的原鸡的相应片段进行分析,结果显示分布在中国的两个红原鸡亚种与在泰国等地分布的红原鸡亚种可归为一类,而与爪哇岛上分布的红原鸡亚种差异较大。我们的结果支持红原鸡可以分为陆地型和海岛型亚种,家鸡可能来源于陆地型红原鸡,并经受了多次独立驯化。

枯萎病尖孢镰刀菌的RAPD-PCR多态性分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD PCR),对采自我省不同地区、不同寄主和同一寄主不同植株的瓜类枯萎病原菌尖孢镰刀菌进行遗传多样性分析,筛选到6个多态性随机引物,共产生了72条RAPD带,其中86.11%具有多态性;通过聚类分析,将供试菌株分为4个RAPD组,确定了菌株间的亲缘关系,为瓜类枯萎病原菌尖孢镰刀菌的分类提供有利的分子证据.

云南三种稻蝗基因组DNA的RAPD多态性分析

应用RAPD技术对采自云南龙陵两交水和腾冲曲石马鹿冲的24头稻蝗进行了基因组DNA多态性分析,10条随机引物共产生129条清晰、稳定的谱带。基于Jaccard相似系数,用BetweengroupsLinkage法得出的聚类图与基于Nei’s遗传距离分别用UPGMA和NJ法构建的分子系统树基本一致:供试的所有稻蝗个体分为3个聚类簇:龙陵两交水的3、7～8号个体与腾冲曲石马鹿冲(海拔1450m)的8个个体聚为一支,龙陵两交水的1、2、4～6号个体聚为另一支,两支相聚后与腾冲曲石马鹿冲(海拔1550m)的8个个体聚为一起。形态学鉴定表明:龙陵两交水的3、7～8号个体为日本稻蝗,1、2、4～6号个体为小稻蝗,腾冲曲石马鹿冲(海拔1450m)的8个个体均为日本稻蝗,腾冲曲石马鹿冲(海拔1550m)的个体为有待进一步鉴定的未知种。形态学鉴定结果与聚类结果完全吻合,充分展示了RAPD技术在区分近缘物种方面的独到优势。比较不同采集地的日本稻蝗、小稻蝗的RAPD分析结果,发现云南的这两种稻蝗在同物种不同种群中的遗传多样性最为丰富,从一个侧面显示出我国云南昆虫的物种多样性及物种内部丰富的遗传多样性。

关中驴线粒体DNA D-loop多态性分析

本文对 6头关中驴线粒体DNAD loop区 399bp的核苷酸序列进行了分析。结果发现 ,关中驴的D loop区核苷酸变异只有转换 1种形式。 6头关中驴D loop区的核苷酸序列组成 3种单倍型 ,单倍型比例为 5 0 .0 0 % ,说明关中驴mtDNA遗传多样性正逐步丧失 ,需要加强驴种质资源保护。以欧洲驴D loop序列为对照 ,关中驴 3种单倍型的核苷酸变异率分别为 4 .2 1%、4 .5 1%和 0 .2 5 %。在获得的 399bpD loop碱基序列中 ,共检测出核苷酸多态位点18个 ,多态位点比例为 4 .5 1%。从D loop区核苷酸序列的 3种单倍型分析 ,发现关中驴可能有

毛细管电泳-单链构象多态性分析检测K-ras基因突变

K ras癌基因的点突变在结直肠癌的发生起重要作用。以异丙醇为聚合反应链转移剂,水相法合成 特性粘度为0.70×10-3m3/kg,分子量为6.5×104的低粘度短链线性聚丙烯酰胺。以6%线性聚丙烯酰胺为 筛分介质,分离温度27℃,分离电压9kV为电泳条件,建立了检测K ras基因突变的毛细管电泳 单链构象多 态性方法。利用该方法检测36例结直肠癌患者肿瘤组织,发现12例K ras基因突变。结果表明:该方法具有 快速、高灵敏的优点,为大规模进行结直肠肿瘤的早期诊断提供了可靠方法。

民猪群体氟烷基因频率检测及序列多态性分析

重新确定现有民猪(原称东北民猪)群体中氟烷基因(Haln)的基因型,采用PCR—RFLP方法对48头民猪进行了氟烷(Haln)基因检测,并测定了其中5头民猪的Haln基因序列。结果表明,48头民猪中HalNHalN(NN)型占70.83%,HalNHal(nNn)型占25%,HalnHal(nnn)型占4.17%;N基因频率为83.33%,n基因频率为16.67%。民猪Haln基因测序结果与GenBank登录号为Z49778.1的野猪Haln基因的同源性为99%,与其他10个品种(系)的Haln基因序列相比,发现他们具有相同的结构域构成,在所测民猪Haln基因中发现13个突变位点。

中国对虾微卫星DNA多态性分析

根据建立的中国对虾部分基因组文库,对筛选的含微卫星序列的克隆设计了引物,并选择了8对多态性引物对中国对虾进行了分析。实验材料为中国对虾黄渤海群体(HB)、朝鲜半岛西海岸群体(KX)和朝鲜半岛南海岸群体(KN)3个野生群共计60个个体。结果表明:经8对引物对60尾中国对虾进行PCR扩增后,共获得了61个等位基因。对3个野生群体的8个基因位点共计24个群体位点进行了杂合度观测值(HD)和杂和度期望值(He)计算,通过Hardy-Weinberg平衡偏离指数(D)检验,发现有5个群体位点处于杂合子缺失状态,其中HB群体有3个群体位点杂合子缺失。KC和KN群体各有1个群体位点杂合子缺失。其次,对中国对虾3个野生群体遗传分化指数F_(st)值进行了计算,两两群体之间的F_(st)值均小于0.05,说明中国对虾3个野生群体的遗传分化较弱。P检验也说明了这个结果,即3个群体的中国对虾遗传分化不显著,有99.27％的遗传变异是来自个体之间,只有0.73％的遗传变异是来自群体之间。最后,经过聚类分析,发现HB群体和KX群体的亲缘关系较近,而KN群体与前两者亲缘关系较远。实验还对8对微卫星引物的多态性信息含量(PIC)进行了评估,PIC值介于0.5984～0.9178之间,揭示了这8个微卫星位点在中国对虾中具有较高的信息含量。

中国5个牛种leptin基因外显子3的多态性分析

利用改进的DNA提取方法和PCR-RFLP技术,对南阳牛、秦川牛、西镇牛、鲁西牛(地方黄牛品种)和荷斯坦奶牛等5个牛品种的263头个体lep tin基因外显子3多态性进行了分析。结果表明,牛lep tin基因外显子3长度为330 bp,存在H aeⅢ和Ap aⅠ限制性内切酶的酶切位点,但在这2个酶切位点上无多态性,2种酶酶切片段长度均为70 bp和260 bp。说明牛lep tin基因外显子3在H aeⅢ和Ap aⅠ2个酶切位点上具有保守性。

广东茄科青枯菌致病力分化及其DNA多态性分析

分别采自广州、增城、东莞、花都、三水、清远、电白、高要 8个菜区的番茄、茄子和辣椒上的 31个青枯病菌株 ,经人工接种于 10个鉴别寄主植物上 ,结果表明 ,它们的致病力存在明显的差异。聚类分析这 31个菌株 ,可以聚为 3个组 :第I组菌株主要来自种植番茄和茄子历史较长的广州、东莞、增城老菜区 ,其致病力较强 ;第II组菌株主要分离自茄子和辣椒上 ,其致病力中等 ;第III组菌株主要来自近年来新发展的三水市各番茄产区 ,它们的致病力较弱。从 2 0 0个随机引物中筛选出 17个引物用于上述 31个菌株DNA的RAPD分析 ,共扩增出 5 2 3条带 ,其中 4 6 8条为多态性带 ,占 89.5 %。聚类分析这 31个菌株 ,又可聚为 4个簇群 :第I簇群主要分离自已推广种植多年的丰顺、金丰等抗病番茄品种上 ;第II簇群分离自抗病的番茄新品种新星、年丰和石碣紫红茄上 ;第IV簇群主要分离自辣椒和茄子 ;而第III簇群来源包括番茄、茄子和辣椒这 3种寄主植物。上述试验结果说明 ,广东茄科青枯菌的致病力存在明显的分化现象 。

莱芜黑猪FSHβ亚基基因的多态性分析

PCR扩增分析中国华北型优良地方猪种莱芜黑猪和产仔数与其差异较大的大约克夏 ,以及它们的杂交后代大莱猪在卵泡刺激素 (FSH) β亚基基因结构区的多态性。通过测序发现莱芜黑猪在该区存在插入突变 ,插入片段长度为 2 75bp ,位于已发表的猪FSHβ亚基基因全序列的 +80 9与 +810碱基之间 ,插入片段中存在一个RNA聚合酶Ⅲ启动子及AluI内切酶识别位点 ,末端有 17个腺苷酸的poly(A) ,所以该片段可能为Alu成分。对FSHβ亚基基因插入片段进行BamHI多态性分析 ,发现本研究所检测样品中不存在BamHI多态性。把FSHβ亚基基因作为控制猪产仔数主效基因的候选基因与产仔数进行连锁分析 ,证明FSHβ基因座位在莱芜猪种中与控制猪产仔数的主效基因紧密连锁 ,优势基因AA纯合子比BB纯合子母猪平均每胎多产仔 1.2头。因莱芜猪与太湖猪插入序列的主要差异是末端的poly(A)长短不同 ,故推测该插入片段末端的poly(A)结构亦可能影响猪的产仔数。

廊坊市汉族女性MTHFR与MTRR基因多态性分析

5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶（5,10-methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR）和甲硫氨酸合成酶还原酶（5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase,MTRR）是参与体内叶酸代谢的关键酶,其基因多态性会影响体内叶酸及同型半胱氨酸水平,与神经管畸形、复发性流产、妊娠期高血压疾病的发生密切相关,严重影响母婴健康.

5个绵羊群体的BMPR-IB基因多态性分析

选择骨形态发生蛋白受体IB基因(BMPR-IB)作为一种侯选基因。采用PCR-RFLP方法检测其在杜泊绵羊、湖羊、小尾寒羊及杜湖、杜寒杂交F1代群体中的多态性分布规律。结果显示:在杜泊绵羊中只存在1种基因型,即野生型(++);在湖羊和小尾寒羊中检测到两种基因型,纯合突变型(BB)和杂合突变型(B+);湖羊中BB、B+基因型频率分别为0.909和0.091,小尾寒羊中BB、B+基因型频率分别为0.563和0.437;在杜湖和杜寒杂交绵羊中发现两种基因型(B+和++),杜湖羊B+和++基因型频率分别为0.875和0.125;杜寒羊B+和++基因型频率分别为0.786和0.214。BMPR-IB分子标记可作为一种新颖的辅助技术用于评估杜泊绵羊与湖羊或小尾寒羊杂交后代的繁殖力。

猪生长激素基因ApaⅠ酶切位点多态性分析

利用 PCR- RFL P技术 ,分析了大约克猪和长白猪 GH基因的 Apa 酶切位点多态性。结果表明 ,在p GH基因序列中共检测到 5种基因型和 4种等位基因 ;基因型频率和等位基因频率在 2个猪种间分布差异不显著。

用PCR-限制性片段长度多态性分析法检测游泳池肉芽肿中海分枝杆菌

目的:探讨用PCR-限制性片段长度多态性(RFLP)分析法快速检测游泳池肉芽肿组织中海分枝杆菌。方法:对疑诊为游泳池肉芽肿患者5份皮损组织DNA进行PCR扩增,扩增产物分别用BstEⅡ和HaeⅢ两种限制性内切酶进行酶切,再用琼脂糖凝胶电泳进行RFLP分析,并与培养结果进行比较。结果:5份标本中均检测出海分枝杆菌,与培养结果一致。经过3～7个月治疗,4例患者治愈,1例患者好转。结论:用PCR-RFLP可以快速鉴定海分枝杆菌,有利于该类疾病的早期诊断和及时治疗。

猪肥胖基因(ob)部分序列的克隆与多态性分析

猪肥胖基因（ｏｂ）部分序列的克隆与多态性分析戴茹娟１李宁２吴常信１（１．中国农业大学动物科技学院，北京１０００９４）；（２．中国农业大学农业生物技术重点实验室，北京１０００９４）ＰａｒｔｉａｌＣｌｏｎｉｎｇｏｆＰｏｒｃｉｎｅＯｂｅｓｉｔｙＧｅｎｅａｎ...

黑番鸭VIPR-1基因的克隆与多态性分析

VIPR-1基因是研究家禽就巢性状的重要候选基因,VIPR-1基因的克隆和测序能为进一步研究黑番鸭就巢性状的单核苷酸多态性奠定理论基础,为鸭分子遗传育种提供基因素材。本研究以黑番鸭基因组为模板进行PCR扩增,获取黑番鸭VIPR-1基因序列[1 864bp(序列1)和1 673bp(序列2)的基因片段],并进行目的基因片段克隆和测序。结果分析表明,序列1包含第5外显子(101bp)、第5内含子(1 630bp)及第6外显子(133bp)的完整序列;序列2包含第12外显子(42bp)、第12内含子(1 455bp)的完整序列和第13外显子(176bp)的部分序列。根据基因序列特征,对获取的2段黑番鸭VIPR-1基因序列分别设计4对引物,进行扩增序列测序比对。结果发现:在序列1第318处、454处存在C/T突变,第547处存在A/G突变,第923处存在A/T突变;序列2第89处、944处存在C/T突变,第662处存在G/A突变,第1 031处存在A/G突变,第1 334处存在A/C突变。黑番鸭VIPR-1基因序列的克隆与单核苷酸多态性SNP突变位点的发现为进一步开展VIPR-1基因的多态性与黑番鸭就巢性状相关研究奠定了基础。