我国栽培平菇近缘种的多相分类

采用拮抗试验、同工酶酶谱分析和子实体形态观察三种方法 ,对我国广泛栽培的平菇近缘种定名为紫孢侧耳 (Pleurotussapidus)、糙皮侧耳 (P .ostreatus)、佛罗里达侧耳 (P .floridanus)、凤尾菇 (P .sajor -ca ju)、肺形侧耳 (P .pulmonarius)和黄白侧耳 (P .cornu copiae)等 6个种 18个菌株进行了分类学研究。结果表明 ,被定名为紫孢侧耳 (P .sapidus)的ACCC5 0 15 1与定名为糙皮侧耳 (P .ostreatus)的ACCC5 0 2 76、定名为凤尾菇(P .sajor -caju)的ACCC5 0 16 8与定名为肺形侧耳 (P .pulmonarius)的ACCC5 0 713菌株之间无拮抗反应 ,酯酶同工酶谱和过氧化物酶同工酶谱相同 ,子实体形态相似 ,确认ACCC5 0 15 1与ACCC5 0 2 76为同种—糙皮侧耳 (P .ostreatus) ;ACCC5 0 16 8与ACCC5 0 713为同种—肺形侧耳(P .pulmonarlus)。糙皮侧耳 (P .ostreatus)、肺形侧耳(P .pulmonartus)、佛罗里达侧耳 (P .florida)、黄白侧耳 (P .cornucopiae)之间有明显的拮抗线 ,酯酶同工酶酶谱和过氧化物酶同工酶酶谱及子实体形态均表现出了各自的特异性。

根瘤菌多样性和系统发育研究的多相分类体系及其进展

近年来对新的根瘤菌资源的不断发掘及现代分子生物学技术的发展和应用使根瘤菌分类研究有了突破性进展。多相分类通过综合获取信息,多种方法相互印证、互为补充,推进了根瘤菌的表型、遗传型和系统发育三方面的发展,从而较全面地反映根瘤菌的生物多样性特征,是根瘤菌多样性研究工作中常常采用的技术手段。文中主要阐述了根瘤菌多相分类体系中的主要方法及现代根瘤菌系统发育地位的研究和进展。

不同金针菇菌株多相分类研究

利用菌丝拮抗反应、酯酶同工酶以及ISSR分子标记对35个金针菇菌株进行多相分类研究,建立了遗传相似性聚类分析图。结果表明:拮抗反应与ISSR分析结果较为一致,而酯酶同工酶与拮抗反应、ISSR分析结果差异较大,ISSR聚类分析结果更为精确。根据ISSR聚类分析,当相似系数为0.86时,可将供试菌株分为7组,其中黄色金针菇的遗传多样性要高于白色金针菇。

胡枝子属根瘤菌的多相分类研究

采用了数值分类、全细胞可溶性蛋白电泳分析、ＤＮＡＧ＋Ｃｍｏｌ％和ＤＮＡ相关性的测定以及１６ＳｒＤＮＡＰＣＲＲＦＬＰ分析等多相分类技术对来源于不同地区的１６种寄主的胡枝子根瘤菌进行了系统的分类研究。数值分类的结果表明，在６７％的相似性水平上，全部供试菌可以分为快生型根瘤菌和慢性型根瘤菌两大群，在８０％的相似性水平上又可分为四个亚群。在此基础上，对各亚群的胡枝子根瘤菌进行了ＤＮＡ相关性的测定，以进一步证实和确定它们的分类地位，并通过１６ＳｒＤＮＡＰＣＲＲＦＬＰ分析对各亚群的系统发育关系进行了初步研究。

西藏卡拉山土样中放线菌的多相分类研究

从西藏念青唐古拉山卡拉山支脉的土样中分离到40株放线菌,对其中的13株菌进行了多相分类。形态、培养特征和系统发育结果表明,所有菌株均属于链霉菌属。从系统发育结果看,840018、850003和Z851023各处于一个独立的分支,分别与Streptomyces rishiriensis、Streptomyces cyanoalbus和Streptomyces albus subsp.albus的相似性达到99%。菌株Z851010、Z851004、850011和850070聚成一个小群,它们之间的相似性达到95%,与Streptomyces sp.YIM26的相似性达到98%;Z851013和Z851024聚成小群,它们之间的相似性达到100%,它们有可能是同一种菌株;850008和Z851020聚成小群,它们的相似性达到95%;Z850007和850040聚成小群,与已知菌种的相似性只有96%,有可能是新的分类单元。

Actinobacteria分离株的多相分类学研究

A ctinobacteria class nov.一般包括具有超过50%G+C的DNA碱基组成的微生物,其中一些菌种在生物技术和医药方面具有重要的意义。为了分离能够产生有用化合物的微生物菌种,我们将分离对象从已进行过深入研究的S trep tomy ces及其以外的放线菌扩大到所有的A ctinobacteria,其中包括那些具有普通细菌形态的高G+C含量革兰阳性细菌。为了对A ctinobacteria这一较新的研究领域有详细的了解,我们又对两株有弱生物活性的IM B 02B-165和IM B 02B-172进行了多相分类学研究。化学分类和系统分类的结果表明IM B 02B-165、IM B 02B-172菌株均属于A rthrobacter属中A rthrobacter g lobif orm is/A rthrobacter citreus组。

分子生物学技术在环境微生物多相分类中的应用

概述了分子生物学技术包括DNA(G+C)mol%的测定、核酸杂交、分子标记技术、蛋白质技术等在环境微生物多相分类中的应用,分析了各项技术的优缺点,介绍了最新进展和发展的方向。

1株湿地稀有放线菌的多相分类鉴定

从鸭绿江滨海湿地样品中分离得到1株稀有海洋放线菌S402003,通过形态观察、培养特征、生理生化特征、化学组分鉴定以及16S rRNA基因序列分析对其进行多相分类鉴定。结果表明:该菌株具有脂酶活性,能还原硝酸盐,属于轻度耐盐、嗜碱菌。该菌株属于Brevibacterium linens,相似性为98.834%。

一株螯合球菌HB-4的分离及多相分类鉴定

自华北油田地层水中分离得到的细菌HB-4,对其进行形态学、生理生化特征鉴定、化学成分分析以及遗传特征测定,并结合16S rRNA基因序列分子生物学鉴定及系统发育学分析。结果表明,该菌株归属于螯合球菌属(Chelatococcussp.),并且可鉴定为大邱螯合球菌(Chelatococcus daeguensis)。其最适生长温度为37℃,主要极性脂为DPG、PE、PG及PC,醌为Q-10,主要脂肪酸组成分别为C18:1ω7c(47.01%)和C19:0cycloω8c(21.83%),HB-4具有氧化酶、接触酶、酯酶(C4)、类脂酯酶(C8)、白氨酸芳胺酶、缬氨酸芳胺酶、胱氨酸芳胺酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、酸性磷酸酶及萘酚-AS-BI-磷酸水解酶等酶活性。

口腔微生物的多相分类

随着分子生物学技术的迅速发展,口腔微生物的分类亦从传统的表型分类进入到各种分子水平分类。多相分类综合了表型和遗传型以及系统发育特征,更加客观地反映了生物间系统进化的关系。本文就蛋白质电泳图谱、G+C摩尔分数、分子杂交、16S rRNA序列分析和代谢组学等口腔微生物多相分类方法作一综述。

一株华北油田地层水细菌HB-1的分离及多相分类鉴定

自华北油田地层水中分离得到的细菌HB-1,对其进行形态学、生理生化特征鉴定、化学成分分析以及遗传特征测定,并结合16S rRNA基因序列分子生物学鉴定及系统发育学分析。结果表明,该菌株归属于螯合球菌属(Chelatococcussp.),并且可鉴定为大邱螯合球菌(Chelatococcus daeguensis)。其最适生长温度为37℃,主要极性脂为DPG、PE、PG及PC,醌为Q-10,主要脂肪酸组成分别为C18:1ω7c(39.49%)和C19:0cycloω8c(30.39%),HB-1具有氧化酶、接触酶、酯酶(C4)、类脂酯酶(C8)、白氨酸芳胺酶、缬氨酸芳胺酶、胱氨酸芳胺酶、胰蛋白酶、酸性磷酸酶及萘酚-AS-BI-磷酸水解酶等酶活性。该菌株是首次从油田地层水中分离并鉴定得到的螯合球菌。

将云南原小单孢菌转入纤维化纤维菌的多相分类研究

对中国普通微生物菌种保藏中心(CGMCC)保藏的云南原小单孢菌(Promicromonospora yunnanensis)AS4.1333进行的多相分类研究表明,菌株AS4.1333与纤维化纤维菌(Cellulosimicrobium cellulans)DSM43879T关系密切,它们的16S rRNA基因序列相似性为99.6%,DNA同源性为89.3%。胞壁组分、枝菌酸、甲基萘醌、磷酸类脂和DNAG+Cmol%测定等化学分类结果支持了上述结论。在形态和生理生化特性上,菌株AS4.1333与CellulosimicrobiumcellulansDSM43879T之间也表现出非常相似的性状。根据系统发育分析、化学分类、形态和生理生化特性、DNA同源性测定等研究结果,对菌株AS4.1333的分类地位做了修正,将其从原小单孢菌属中排除,认为菌株AS4.1333与Cellulosimicrobium cellulansDSM43879T是同一个种,建议将菌株AS4.1333由云南原小单孢菌(Promicromonosporayunnanensis)转入纤维化纤维菌(Cellulosimicrobium cellulans)。

极端嗜盐古菌TRM51^T的多相分类研究

从新疆硝尔库勒盐湖分离纯化到一株极端嗜盐古菌TRM 51T,其菌落颜色为白色/粉红,细胞为杆状,能运动,革兰氏染色为阴性,生长温度范围是28～50℃(最适温度37℃),NaCl浓度生长范围是2.1～4.3 M(最适浓度为3.1 M),Mg2+生长范围是0.03～1.0 M(最适0.3 M),pH生长范围5.5～9.0(最适pH8.0)。细胞可在蒸馏水中裂解,避免细胞裂解的最低NaCl浓度为8%(w/v)。TRM 51T主要的极性脂是PG(磷脂酰甘油)、PGP-Me(磷脂酰甘油磷酸甲基酯)、TGD-2(葡糖苷甘露糖苷葡糖二醚),基于16S rDNA基因的系统发育分析显示,菌株TRM 51T与相近属Halopiger的成员相似性仅为94.2%～95.3%,与Haloterrigena类群的相似性为92.4%～94.6%,菌株TRM 51T基因组DNA的G+C mol%为63.2mol%。多相分类结果表明,菌株TRM 51T不能归入嗜盐古菌科的已描述属,建议成立新属级的新分类单元。

利用多相分类法鉴定瓜类枯萎病拮抗菌株HVG60

对分离自东北蔬菜保护地土壤的一株拮抗菌株HVG60进行了形态学特征、培养特性、生理生化特征分析以及分子生物学鉴定。结果表明,链霉菌HVG60菌落圆形,气丝稀疏不发达,顶端直线型、大环状或松散敞环螺旋状,基丝发达,多分支;聚类分析表明,菌株HVG60与教酒链霉菌、拒霉素链霉菌、美浓链霉菌、纳塔尔链霉菌和橄榄产色链霉菌的同源性均较高,达98%,但又有所差别,最终将菌株HVG60确定为链霉菌属的一个新种,命名为瓜类链霉菌。

一株对多种植物具有生理活性的放线菌的多相分类学鉴定

分离到一株对多种植物具有生理活性的放线菌,为确定其准确的分类地位进行了多相分类学研究。形态特征表明孢子丝螺旋状,孢子球形(单颗)或椭圆形,培养特征和生理生化特性均与丁香暗黄链霉菌相似,16SrRNA基因序列分析表明该放线菌为丁香暗黄链霉菌(Streptomyces lilacinofulvus)。可以预见该放线菌产生的生理活性物质在农作物的栽培上具有广阔的应用前景。

硫酸盐还原菌多相分类系统的研究进展

自硫酸盐还原菌由Beijerinck发现并命名至今,其分类地位一直处于不断的变化之中。近年来,随着一些新种的发现和新的分析方法应用,硫酸盐还原菌分类手段已由传统的形态学分类方法向现代的多相分类法过渡。本文阐述了经典分类法、化学分类法、分子分类法在硫酸盐还原菌分类中的应用,并对它们的优缺点作了简要的评价。

分枝杆菌的多相分类鉴定

20世纪80年代以来，细菌分类学取得了两个方面的巨大发展：其一是分子生物学技术的应用推动了细菌系统发育的研究，其二是多相分类（Polyphasic Taxonomy）的应用预示着分类单元一致性的到来，它们是现代细菌分类发展过程中重要的里程碑。多相分类的概念最初是由Colwell提出。

根瘤菌多相分类的研究进展

根瘤菌可以入侵豆科植物形成根瘤或茎瘤,并可固定空气中的氮为其宿主植物提供必需的氮素营养。根瘤菌的分类系统可分为早期根瘤菌的分类系统和现代根瘤菌的分类系统两个阶段。根瘤菌的多相分类技术包括表型的分群方法和遗传型的分群方法两大类。

放线菌的多相分类

随着科学技术的发展，人们对放线菌的认识已由早期的描述分类发展到现代的化学分类（Ｃｈｅｍｏｔａｘｏ－ｎｏｍｙ）和分子分类（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒｔａｘｏｎｏｍｙ），以至于现在的多相分类（Ｐｏｌｙｐｈａｓｉｃｔａｘｏｎｏｍｙ）。分子分类的规则来源于细胞中的核...

一株抗真菌海洋放线菌的筛选、分离和多相分类鉴定

为开发利用宁波近海潮间带药用微生物资源,本研究自宁波慈溪海塘采集7份海泥样品,从中筛选、分离抗真菌放线菌,并对目标菌株进行多相分类鉴定,包括16S rRNA、gyrB基因序列分析、形态观察、生理生化鉴定及细胞化学组成分析。通过筛选培养获得了25个菌株,其中2P-4对白色念珠菌、黑曲霉表现出抑制生长的作用。细胞化学组成鉴定分析了2P-4全细胞糖、氨基酸、极性脂质、甲基萘醌和脂肪酸组成,结果表明,2P-4属于链霉菌属。2P-4的16S rRNA、gyrB基因序列分析也表明2P-4属于链霉菌属,并且与毒三链霉菌的关系最密切,其16S rRNA基因序列与Streptomyces toxytricini NBRC 13194~T的相似度为99.56%,gyrB基因序列与Streptomyces toxytricini NRRL B-5426~T的相似度为99.04%,但16S rRNA、gyrB基因序列在系统进化树上均形成独立分枝,支持2P-4与毒三链霉菌分属不同的种;此外,2P-4与其近缘种Streptomyces toxytricini NBRC 13194~T相比,两者在形态和生理生化特征方面存在明显差异。基于以上分析,初步鉴定2P-4为链霉菌属的一个新种。本研究为进一步探究2P-4抗真菌代谢产物提供了理论依据。