实验用大林姬鼠种群微卫星标记开发及遗传特性分析

目的 开发大林姬鼠多态性微卫星标记,丰富大林姬鼠遗传数据,为大林姬鼠遗传质量控制及基因定位等工作奠定基础。方法 基于大林姬鼠基因组序列筛选微卫星位点,挖掘微卫星引物,通过多重PCR技术分析群体的遗传多样性。结果 成功开发出30个微卫星标记,利用60份大林姬鼠基因组DNA对30个微卫星位点进行评价,共检测出152个等位基因,平均每个位点有5.067个等位基因;平均观察杂合度为0.592;平均香农指数为1.265;平均多态信息含量为0.598。结论 基于本研究所开发的微卫星位点具有较好的多态性,能有效分析大林姬鼠群体的遗传多样性,适合为建立大林姬鼠遗传质量标准和遗传质量检测方法奠定基础。

黑线姬鼠实验动物化研究进展

自新冠肺炎疫情以来,全球以动物为媒介的传染病不断发生,人们需要更多种类的实验动物作为研究样本。黑线姬鼠(Apodemus agrarius)是一种我国常见的农田害鼠,繁殖期短、适应能力强,在我国分布广泛,是影响我国农业生产的主要害鼠之一。另外,黑线姬鼠也是汉坦病毒(Hantavirus)、莱姆病伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi)和刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)的天然携带者,是流行病学研究的重要调查样本,同时在构建疾病模型和探究病原体致病机制方面也更具优势,其实验动物化的研究情况应该受到重视。本文总结了黑线姬鼠分类及其分布、繁殖学研究、生理学研究、分子生物学研究、携带病原体概况,并对黑线姬鼠的繁殖研究、多组学应用、病原探究和发展前景进行展望,以期为黑线姬鼠后续实验动物资源开发提供帮助。

黑线姬鼠睾丸实时荧光定量PCR内参基因的筛选及验证

为筛选出不同季节黑线姬鼠睾丸的最适内参基因,基于黑线姬鼠睾丸转录组数据,初步筛选出12个候选内参基因,即ALDOA、GLUL、RABAC1、TEGT、EID3、SYF2、MRPL20、GAPDH、HPRT、18s、B2M、NWD1。以不同季节(春季、夏季、秋季)成年黑线姬鼠的睾丸作为试验材料,进行RNA的提取并反转录成cDNA,再通过实时荧光定量PCR技术(Real-time Quantitative PCR,RT-qPCR)检测上述候选内参基因的表达水平。将所得到的循环阈值(Cyclethreshold,Ct)通过GeNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder等分析软件进行基因稳定性的综合分析。结果表明,不同季节黑线姬鼠睾丸中12个候选内参基因表达稳定性由高到低排序为STF2>B2M>GAPDH>MRPL20>18s>HPRT>ALDOA>EID3>RABAC1>TEGT>NWD1>GLUL,其中SYF2是最稳定的内参基因,GLUL是最不稳定的基因。综上,本研究确定了不同季节下黑线姬鼠睾丸的内参基因,为黑线姬鼠功能基因的开发及基因表达的研究提供基础,并为后续黑线姬鼠基因组学的研究提供参考。

性别与生境因素对黑线姬鼠肠道菌群多样性的影响

为探究黑线姬鼠(Apodemus agrarius)肠道菌群的组成以及多样性,讨论性别差异和生境差异对黑线姬鼠肠道菌群的影响,采用高通量测序技术对黑线姬鼠肠道菌群的16S rRNA V3-V4区进行PCR扩增并进行分析。结果显示:农田黑线姬鼠雌雄2组样品间在门、目、属水平上排名前3的优势菌群种类大致相同,但各菌群所占比例不同;灌丛黑线姬鼠雌雄2组样品间在门、目、属水平上的前3种优势菌群不同。Alpha多样性分析表明:农田组黑线姬鼠雌雄间肠道菌群差异不显著;灌丛组黑线姬鼠雌雄间肠道菌群多样性差异显著,丰富度差异不显著;不同生境黑线姬鼠肠道菌群无显著差异。ANOSIM分析表明:农田黑线姬鼠雌雄2组样品间肠道菌群差异不显著;灌丛黑线姬鼠雌雄2组样品间肠道菌群差异极显著;2种生境黑线姬鼠组间肠道菌群差异不显著。综上所述,性别和生境对黑线姬鼠的肠道菌群的组成及多样性有影响。

奉贤区害鼠优势种黑线姬鼠的发生规律及防控技术

通过介绍上海市奉贤区害鼠优势种黑线姬鼠的发生规律,包括其形态特征、生活习性、年龄组成与消长、种群繁殖等,提出了黑线姬鼠的具体防控目标、防控指标、防控范围、防控适期以及防控方法等,以期为奉贤区农作物的安全生产以及农田鼠害的有效防控提供理论依据和可操作措施。

中国姬鼠属的研究及与日本种类关系的讨论

姬鼠属(Apodemus)分布在欧亚大陆及其邻近的岛屿上,种类及数量均较多。一般认为有2个亚属:田姬鼠亚属(Apodemus)和林姬鼠亚属(Sylvaemus)。Ellerman和Morrison-Scott(1951)虽对它作了较系统的研究,但对中国所产的姬鼠仍有许多不同的意见,随着中国研究工作的深入,有许多看法与他们不同。Corbet(1978)虽作了一些改正,但仍不能令人满意。仅就现有材料提出个人的意见,抛砖引玉,提供进一步研究的一块踏板。

张广才岭东部地区黑线姬鼠夏秋季植物性食物分析研究

黑线姬鼠(Apodemus agrarius)是农林业典型害鼠,为探究黑线姬鼠对食物资源利用的变化特征,选取张广才岭东部地区三道关针阔叶混交林为研究地点,分别于夏季(2020年6—8月)和秋季(2020年9—11月),采用铗日法和样线法采集黑线姬鼠样本,利用DNA宏条形码技术进行黑线姬鼠食性分析。结果表明:黑线姬鼠的夏季食物主要为草本植物,胃容物包含14科19属21种,其中以稗(Echinochloa crus-galli,87.0%)和堪察加费菜(Phedimus kamtschaticus,7.0%)为主;秋季食物主要为乔木植物果实,胃容物包含15科40属44种,其中以蒙古栎(Quercus mongolica,48.3%)、湿地风毛菊(Saussurea umbrosa,17.0%)、樟子松(Pinus sylvestris var.mongolica,7.9%)和葎草(Humulus scandens,6.2%)为主;夏秋两季均摄食的有14种,以湿地风毛菊为主。通过Shannon-Wiener指数(夏季,H'=0.50;秋季,H'=0.83)、Simpson指数(夏季,D=0.77;秋季,D=0.62)和Chao1指数(夏季,Chao1=12.29;秋季,Chao1=13.50)等多样性指数分析,发现黑线姬鼠的秋季食物组成较夏季更丰富,食物物种多样性更高。研究结果探明了张广才岭三道关林区黑线姬鼠夏秋两季的食物资源利用特征,为科学开展鼠害防治提供基础资料。

性别与生境因素对大林姬鼠肠道菌群多样性的影响

【目的】探明不同因素对大林姬鼠肠道菌群结构与多样性的影响,为进一步研究大林姬鼠环境适应性机制奠定理论基础。【方法】采用Illumina高通量测序技术对大林姬鼠盲肠样品16S rRNA V3~V4区进行高通量测序,分析大林姬鼠肠道菌群结构和多样性及性别、生境等因素对大林姬鼠肠道菌群多样性的影响。【结果】大林姬鼠肠道菌群在门水平下,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes,雌66.266%、雄61.866%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,雌15.478%、雄12.019%);在属水平下,优势菌属为unclassified Lachnospiraceae(雌24.665%、雄24.714%)、Lachnospiraccac NK4A136 Group(雌19.313%、雄11.612%)和unclassified Muribaculaceae(雌12.962%、雄9.040%)。雌性大林姬鼠样品间肠道菌群结构相似性高,而雄性的差异较大。阔叶林生境的大林姬鼠样品间肠道菌群结构相似性高,针阔混交林的差异较大。【结论】不同性别、生境因素对大林姬鼠肠道菌群结构影响较大。

凯里市黑线姬鼠种群数量动态分析

为黑线姬鼠预测预报、防控及自然生态环境治理提供依据,探讨其种群数量、种群组成的年度、月份、季节变化规律。在稻田、旱地耕作区采用夹夜法,对贵州省凯里市1984—2022年稻田、旱地耕作区黑线姬鼠捕获率进行年度、月份、季节种群动态进行分析。结果表明:黑线姬鼠在该地区主要分布于稻田区和旱地耕作区,占总鼠数的62.36%,各年度间种群组成比例在50.69%~94.44%,为当地绝对优势鼠种,是主要的监测和防控对象。不同年度黑线姬鼠种群数量存在显著差异,各年度间平均捕获率为0.70%~6.38%,相互间存在9.11倍差异,平均捕获率为3.92%;1984—1992年捕获率较高,平均为4.86%,处于种群密度较高的波动较大状态;2011—2022年捕获率较低,平均为1.20%,处于种群密度较低的稳定状态。不同月份及季节间种群数量存在显著差异,不同月份以7月最高,2月最低,捕获率分别为3.52%、0.95%;不同季节以夏季最高,冬季最低,捕获率分别为3.05%、1.29%。该分析得出黑线姬鼠是凯里市鼠类绝对优势种,近10 a来处于种群密度较低的稳定状态,7月和夏季种群数量最高;该研究为黑线姬鼠列为凯里市主要鼠类监测、防控对象,为准确做出预测预报,制定合理的综合防控措施及自然生态环境治理提供了重要依据。

唐家河自然保护区高山姬鼠和中华姬鼠夏季生境选择的比较

为揭示影响高山姬鼠和中华姬鼠夏季空间分布的生态因素,采用样线法和样方取样法,于2009年6—8月在四川省唐家河国家级自然保护区内对两种姬鼠的生境选择进行了比较研究。结果表明:两种姬鼠主要利用坡度平缓,郁闭度、落叶层盖度、乔木胸径和高度较小,灌木、竹子和草本密度适中而草本盖度较大的生境;高山姬鼠频繁出现在海拔较低(1400 m左右)、草本植物较大(平均高度为16—30 cm)的生境中,而中华姬鼠频繁出现在海拔较高(1900 m左右)、草本植物较小(平均高度<15 cm)的生境中。此外,高山姬鼠频繁出现在竹林较矮(平均高度<1 m)、水源距离较近(<50 m)、植被演替阶段较低(小树林)的常绿-落叶阔叶混交林中,而中华姬鼠对这4种生态因子无明显的选择性。两种姬鼠在对生境的利用上虽具一定重叠性,但对诸多生境变量选择上的差异表明各自具有不同的生境利用模式。海拔、植被演替阶段、郁闭度和草本高度4个生境变量判别函数系数的绝对值明显大于其他变量,表明高山姬鼠和中华姬鼠在生境上的分割可能主要与这4个变量有关。生境利用模式的不同有助于两种姬鼠同域共存。

EP-1对雄性中华姬鼠和黑线姬鼠繁殖力的影响

为了检测左炔诺孕酮-炔雌醚(EP-1)对雄性中华姬鼠和黑线姬鼠的不育效果,将32只雄性中华姬鼠和30只雄性黑线姬鼠分为30 mg/kg单剂量组、30 mg/kg多剂量组和对照组,15 d和45 d后剖检,比较睾丸、附睾、储精囊、精子密度、睾酮含量及睾丸组织形态的变化。结果发现:给药后第15 d,两种试鼠的睾丸、附睾、储精囊的重量较对照组明显降低;精子密度、睾酮含量显著下降;曲细精管结构破坏明显。给药后第45 d,处理组各生理指标继续下降,但与第15 d相比差别不显著;单剂量组和多剂量组在两个时间点的差别并不显著。结果表明,EP-1对雄性中华姬鼠和黑线姬鼠的繁殖器官有显著抑制效果,单次给药与多次给药的不育效果差别不大。

用体重和体长鉴定黑线姬鼠年龄方法的商榷

在黑线姬鼠种群数量变动的研究中,年龄鉴定是一项重要的工作。分析种群的年龄组成,有助于了解种群的繁殖、生长、死亡和数量发展的趋势。计算不同年龄组所占的比例,更有助于判断某些自然疫源性疾病的流行动态。因此,探讨黑线姬鼠年龄鉴定的方法,有重要的理论与实践意义。 关于黑线姬鼠年龄鉴定的方法,曾有两种不同的意见。一种意见认为:黑线姬鼠的寿命较短,而且终生能不停地生长,可用体重来分析种群的年龄组成(诸葛阳等,1959)。

中华姬鼠与大林姬鼠的同工酶差异(英文)

中华姬鼠（Ａｐｏｄｅｍｕｓｄｒａｃｏ）和大林姬鼠（Ａｐｏｄｅｍｕｓｐｅｎｉｎｓｕｌａｅ）是形态学上十分相似的两种鼠类。为了对两种姬鼠的分类提供生物化学方面的依据，采用聚丙烯酰胺凝胶等电聚焦电泳方法比较和分析了两种姬鼠的ＬＤＨ同工酶、ＥＳＴ同工酶和ＳＯＤ同工酶的差异。结果表明，两种姬鼠的ＬＤＨ同工酶酶谱基本相似，而ＥＳＴ同工酶和ＳＯＤ同工酶酶谱则存在明显的种间差异。根据ＥＳＴ同工酶Ａ２带的有无和ＳＯＤ同工酶主带等电点的差别，能将两种姬鼠很容易区分开来。

大林姬鼠中汉坦病毒的分离及其S片段的序列分析

目的分析吉林省大林姬鼠携带的汉坦病毒(HV)在进化过程中的系统发生关系。方法采用病毒分离技术、逆转录聚合酶链反应(RT PCR)、克隆以及测序技术对中国大林姬鼠携带的HV进行研究。结果从4只大林姬鼠HV抗原阳性的肺组织标本中分离到2株HV(CJI89和CJI93),对其中CJI93病毒株的S片段进行克隆、测序以及分析,基因分型结果为汉滩型(HTN)汉坦病毒。根据S片段的核苷酸序列同源性分析,CJI93与Aa2499核苷酸序列的同源性最高(94.3%),而与Ap61、Ap63的同源性最小(83.3%,82.9%)。由全S片段构建的HTN型汉坦病毒的系统发生树表明CJI93与Aa2499等俄罗斯黑线姬鼠携带的HV的亲缘关系最近,其次为中国的HTN型病毒,然后才是Ap61、Ap63等俄罗斯大林姬鼠携带的HV。结论从我国吉林省大林姬鼠分离到的CJI93株是HTN型汉坦病毒的新亚型。

凯里市黑线姬鼠种群繁殖特征动态分析

【目的】为摸清黑线姬鼠种群繁殖特征动态变化规律,给其种群数量预测预报及防控提供科学依据。【方法】以贵州省凯里市2011—2023年稻田区、旱地耕作区的黑线姬鼠为研究对象,采用夹夜法调查分析其性别比率、怀孕率、睾丸下降率、胎仔数以及繁殖指数时间变化规律。【结果】凯里市黑线姬鼠总体种群性比(♀/♂)为1.08,种群总性比符合1:1的关系,年度间和月份间性比存在一定差异。总体平均怀孕率为23.70%,年度间怀孕率在8.33%~55.56%,一年中种群主要怀孕期在4—5月和8—9月,怀孕率分别为64.00%~70.59%和39.13%~41.67%,呈现典型的双峰型曲线。总体平均胎仔数为5.38只,以5只最多,占总孕鼠数的34.00%。总体平均睾丸下降率为64.62%,年度间睾丸下降率在35.71%~100.00%,3—10月睾丸下降率维持在较高水平,睾丸下降率为68.75%~100.00%,月份间怀孕率与睾丸下降率呈同步变化趋势。总体平均繁殖指数为0.66,年度间繁殖指数在0.24~1.54,月份间繁殖指数在0.15~2.61,在4—5月和8—9月出现2个繁殖高峰,呈现典型的双峰型曲线。【结论】黑线姬鼠应列为凯里市主要监测防控对象,黑线姬鼠种群繁殖特征具有明显的月份变化规律,其防控最佳时期应选择每年4月和8月。

基于线粒体细胞色素b基因对大耳姬鼠和龙姬鼠分类关系的探讨

大耳姬鼠Apodemus latronum的分类地位,尤其它和龙姬鼠A.draco的关系,还存在着争议。用PCR扩增了采集自5个不同地点的大耳姬鼠的线粒体细胞色素b(cytb)基因,并和GenBank已有的3条大耳姬鼠cytb序列一起分析其碱基组成和变异情况。采用邻接法(Neighbor-joining,NJ)、最大简约法(Maximum parsimony,MP)、最大似然法(Maximum likelihood,ML)和贝叶斯法(Bayesian inference,BI)构建了大耳姬鼠和龙姬鼠的系统发育树。4种方法构建的系统发育树拓扑结构一致,大耳姬鼠和龙姬鼠均各自形成单系,龙姬鼠先与台湾森鼠A.semotus聚在一起,再与大耳姬鼠形成姐妹群。此外,大耳姬鼠和龙姬鼠两者间的K2P平均遗传距离达到0.14。因此,认为大耳姬鼠是一个独立的种,而不是龙姬鼠的一个亚种。

张广才岭东部两种姬鼠两性异形比较研究

为了解朝鲜姬鼠(Apodemus peninsulae)和黑线姬鼠(Apodemus agrarius)的两性异形特征,在黑龙江省张广才岭东部农林交错区,采用铗日法采集同域分布的两个优势物种朝鲜姬鼠和黑线姬鼠,分别测量其外部形态和内脏特征等形态指标,并对其两性异形比较研究。结果表明,两种姬鼠的外部形态和内脏特征的两性异形差异不显著,均属于雌雄同形,表现出雄性的主要形态特征略大于雌性的,朝鲜姬鼠雄性前足长、心脏重、脾脏重均大于雌性的;黑线姬鼠雄性体长、后足长、体重、心脏重、肝脏重均大于雌性的。朝鲜姬鼠和黑线姬鼠的雄雌体长比值分别为1.021和1.043,体长两性异形程度指数分别为0.021和0.041;雄雌体重比值分别为1.065和1.161,两性异形程度指数分别为0.061和0.139。两种姬鼠两性的部分局部形态特征均与其体长以及体重呈显著正相关。

大林姬鼠与黑线姬鼠消化系统的比较研究

为了解大林姬鼠(Apodemusspeciosus)和黑线姬鼠(Apodemusagraius)消化系统的差异,选取成体大林姬鼠和黑线姬鼠进行解剖对其消化系统进行观察,消化道形态相仿,但各消化道器官又有自己的特点。

大林姬鼠和黑线姬鼠肠道菌群的比较与分析

为了探究大林姬鼠和黑线姬鼠肠道微生物的组成及是否有显著差异,采用高通量测序技术对10只大林姬鼠和10只黑线姬鼠的肠道菌群的组成进行了初步分析,并比较两组之间肠道菌群的差异。结果表明,两种鼠的肠道菌群在门水平上以厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门为主。在属水平上,大林姬鼠的优势菌属为unidentified-Muribaculace、unidentified-Lachnospiraceae、螺杆菌属,黑线姬鼠的优势菌属为unidentified-Lachnospiraceae、unidentified-Muribaculace、乳杆菌属。Anosim分析结果表明,大林姬鼠与黑线姬鼠肠道菌群的组间差异大于组内差异,且两组间肠道菌群差异极显著(P<0.01)。本研究结果为防治农林有害微生物和有效评估鼠类疾病传播风险提供基础微生物数据。

大林姬鼠和黑线姬鼠消化系统中酶的分布与活性分析

为森林害鼠防治及实验动物化等研究提供基础生化数据,采用PAGE对大林姬鼠(Apodemus peninsulae)和黑线姬鼠(Apodemus agrarius)消化系统中AMY、PRO、EST 3种主要消化酶和SOD的分布与活性进行比较分析。结果表明,大林姬鼠和黑线姬鼠消化系统中AMY、PRO、EST和SOD均有表达,但在两种鼠之间及鼠的组织内和组织间酶的活性和分布存在明显差异。