家鸡对丝带凤蝶性二型体色的反应

旨在明确丝带凤蝶成虫Sericinus montelus Gray在全光谱范围内存在性二型体色,评估鸟类对丝带凤蝶性二型体色的识别度,推测性二型体色是否对雌雄丝带凤蝶个体的生存概率产生影响。先用光谱检测仪测量丝带凤蝶雌雄成虫的反射光谱,分析反射光谱特征;再通过家鸡Gallus gallus domesticus视觉模型估算丝带凤蝶雌雄体色与预设背景的颜色差异。最后以小鸡为捕食者设计行为学试验,观测小鸡捕食雌雄丝带凤蝶成虫的行为反应。反射光谱测量结果显示雌雄丝带凤蝶在可见光和紫外波段都具有体色差异,雄性在前后翅白斑测量点上的亮度明显高于雌性。鸟类视觉模型结果表明,雄性丝带凤蝶所有测量点在明暗视觉(远距离)和颜色视觉(近距离)中的识别度值都高于识别阈值3,捕食者容易识别;但是雌性丝带凤蝶前翅和后翅黄白斑识别度值在明暗视觉和颜色视觉中都介于1与3之间,捕食者不易区分。捕食行为试验数据分析发现,捕食者发现猎物的潜伏时间及攻击潜伏时间没有显著差异,但小鸡啄食雄性猎物的次数及处理时间都显著高于雌性猎物。由此可见,与雌性丝带凤蝶相比,雄性在全光谱范围内的确具有更加亮丽的体色,但这种亮丽的视觉信号更易吸引鸟类捕食者的注意,带来了更高的捕食风险。

组学技术及组学联合分析在家鸡中的应用现状

家鸡是重要的经济动物,为人们提供肉、蛋等农副产品。借助组学技术对家鸡生长发育、肉蛋品质改良、疾病发生等方面进行研究具有重要意义,文章概述了常见组学技术分析原理、多组学联合分析的方法和优势,综述了多组学联合分析在家鸡生产生长发育、肉蛋品质、疾病及应激反应等领域的研究进展,并总结了组学联合分析面临的挑战,以期为家鸡生产过程中品种选育、肉蛋品品质改良、疾病发生机制研究和治疗等提供参考。

家鸡免疫性状调控基因研究进展

鸡的免疫性状是一种由多个微效基因调控的经济性状。随着规模化和集约化养鸡业的发展,家鸡免疫功能受环境中的病原体影响加重,传统的疾病治疗方案受限。应用分子生物学技术手段,探究家鸡的免疫相关基因的调控机制,有助于从根本上提高家鸡的免疫力。对家鸡免疫系统进行了概述,从免疫防治和疾病方向综述了TLRs、MHC、MX、IFN、NRAMP和IL等影响家鸡免疫性状的关键调控基因,旨在为家鸡抗病育种提供理论依据。

家鸡羽毛结构色的定量检测方法探究

家鸡的羽毛的结构色具有观赏价值与经济价值。该研究旨在建立出一套系统客观的家鸡羽毛结构色定量检测方法,对735只荆门黑羽绿壳蛋鸡母鸡的羽毛结构色进行图片采集方法和定量指标的探究,同时利用单元内混合家系相关法进行遗传力的估计。结果显示,Lab色彩模型中的a值与b值可以作为对结构色进行定量的光学指标;相对于鞍羽、肩羽来说,翼羽中的次级大覆羽结构色光学指标与鸡只整体的结构色关联更强;次级大覆羽的a值为中等遗传力,b值为高遗传力且其个体内测定变异程度较小。可见,次级大覆羽的b值可能更适合作为遗传育种的选育指标,能够对家鸡羽毛结构色进行定量,并用于育种实践中实现对结构色的特色化选育。

家鸡GBE1基因克隆与生物信息学分析

目的:克隆1,4-α-葡聚糖分支酶1(GBE1)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学以及差异表达分析。方法:根据家鸡转录组数据,利用PCR扩增GBE1的全长cDNA并进行生物信息学分析。使用qRT-PCR法检测基因在家鸡6个组织中的表达差异。结果:克隆得到全长为2145 bp GBE1基因,开放阅读框(ORF)为2130 bp,编码709个氨基酸。GBE1蛋白相对分子质量为81.993,理论等电点6.25,稳定指数为35.40,平均亲水性值为-0.484,属于稳定酸性亲水蛋白;GBE1蛋白含有67个磷酸化位点,不存在跨膜区域与信号肽序列,主要定位在细胞质、细胞核、线粒体、胞液中;二级结构主要包括α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲和延伸链,三级结构表明为单体蛋白;同源性分析表明,家鸡中GBE1蛋白氨基酸序列与珠鸡亲缘关系最近。qRT-PCR结果表明,GBE1基因在家鸡心、肝、脾、肺、肾、鸡内金6个组织内均有表达,但在肝脏和鸡内金中的表达量显著高于其他脏器。结论:该结果为进一步探讨家鸡GBE1基因的功能及其对葡聚糖分支酶的调控机制积累了必要的研究基础。

中国家鸡和红色原鸡mtDNA控制区遗传多态性及系统进化分析

通过线粒体DNA控制区的结构和多态性来研究中国家鸡和红色原鸡的遗传多态性与系统进化。测定14个中国地方鸡种和红色原鸡2个亚种的256个个体线粒体DNA控制区部分序列约560bp，结果表明，A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为25．∞％、37．40％、4．40％和33．20％。共发现44个变异位点，约占分析位点总数的7．86％，没有观测到插入／缺失，颠换和转换之比为0．13；共具有32种单倍型，9种为共享单倍型；16个群体内单倍型多样度从0到0．964，单倍型变异度总体为0．909±0．014，整体的平均核苷酸差异数为7．276，核苷酸多样度为1．851％。群体间核苷酸分歧度（Dxy）在0．747％～3．125％之间变化，核苷酸净遗传距离（Da）为0．015％～2．633％。16个群体表现出较高水平的遗传多态性，群体间表现出显著的遗传分化。群体遗传多态性和亲缘关系分析表明，一些中国家鸡的群体（如固始鸡和仙居鸡）起源于泰国红色原鸡Gallus gallu sgallus亚种，一些中国家鸡的群体（如茶花鸡和藏鸡等）起源于中国红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种，在一些中国地方鸡种还同时具有这2种红色原鸡的遗传贡献；认为中国家鸡起源于泰国或单纯起源于中国的观点都是不全面的。

三个品种家鸡催乳素基因cDNA的克隆及序列分析

从粤黄鸡、丝毛乌骨鸡及伊莎蛋鸡的垂体中快速抽提总ＲＮＡ，根据国外已发表的肉用仔鸡催乳素基因ｃＤＮＡ的序列，设计并合成了能与特定载体末端互补的１对引物，经反转录－聚合酶链式反应（ＲＴ－ＰＣＲ）方法扩增获得了特异性片段。将扩增片段与线性化质粒 ｐＢＳＳＫ连接，克隆后进行序列分析，与已报道的肉用仔鸡、矮脚鸡和火鸡催乳素基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行了比较。结果表明，不同品种间核苷酸同源性介于９３．９７％～９９．８７％之间，其中丝毛乌骨鸡与矮脚鸡间的同源性最高，为９９．８７％。推导的相应氨基酸序列的同源性在９８．２５％～１００％之间，也是丝毛乌骨鸡与矮脚鸡间的同源性最高，为１００％。在粤黄鸡、丝毛乌骨鸡和伊莎蛋鸡中，发现前两者的催乳素前体的ｃＤＮＡ片段推导的氨基酸序列中信号肽裂解位点跟肉用仔鸡、矮脚鸡及火鸡的一样，为 Ｌｅｕ－Ｐｒｏ－Ｉｌｅ－Ｃｙｓ，而伊莎蛋鸡的信号肽裂解位点则不一样，为Ｐｒｏ－Ｐｒｏ－Ｉｌｅ－Ｃｙｓ。此位点的差异可能导致催乳素前体翻译加工的不同，使伊莎蛋鸡无就巢性。这３个家鸡品种与国外的肉用仔鸡、矮脚鸡催乳素氨基酸序列还在以下位置出现差异：７１、１４１、１５０、１７５。在肉用仔鸡、丝毛乌骨鸡?

中国家鸡的起源探讨

测定了６个家鸡品种３０个个体的线粒体Ｄ－环区５３９ｂｐ的碱基序列，并与ＧｅｎＢａｎｋ中的红原鸡、灰原鸡、绿原鸡、黑尾原鸡及鹌鹑的相应序列作比较分析，构建了分子系统树。结果表明，原鸡属４个种间差异较大，其中家鸡与泰国及邻近地区红原鸡关系最近，与印尼红原鸡、黑尾原鸡、灰原鸡、绿原鸡及鹌鹑的关系依次变远。提示中国家鸡可能起源于泰国及邻近地区的红原鸡。结果还显示，该地区红原鸡的两个亚种（Ｇ．ｇ．ｇａｌｌｕｓ和Ｇ．ｇ．ｓｐａｄｉｃｅｕｓ）间的遗传分化程度显著低于家鸡亚种内的分化程度，这两个亚种似乎可以归为同一亚种。

家鸡和原鸡的线粒体DNA多态性比较

本文运用１１种限制性内切酶分析了家鸡（茶花鸡、尼西鸡、大理漾濞黄鸡）和原鸡共１０只个体的线粒体ＤＮＡ限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ），平均每个个体检测到的片段为４０条左右。但仅发现３种变异的限制性格局，即ＳｔｕＩ－Ｂ，ＥｃａＵ－Ｂ和ＥｃｏＲＩ－Ｂ。其中ＳｔｕＩ─Ｂ和ＳｃａＩ─Ｂ为首次报道，而且均为原鸡所特有，ＥｃｏＲＩ─Ｂ则为大理漾濞黄鸡所特有。茶花鸡和尼西鸡拥有完全相同的限制性格局。经过计算，原鸡与茶花─尼西鸡的遗传距离为０．３２％，与漾濞黄鸡的遗传距离为０．４８％。上述结果提示，受试原鸡所代责的云南孟连亚群体可能是一个较为特殊的群体，应受到保护和注意。

红原鸡与家鸡的亲缘关系研究

对中国红原鸡滇南亚种和海南亚种与我国茶花鸡、泰和鸡和寿光鸡等地方鸡种以及芦花鸡、洛岛红等外国鸡种进行了血型（３个位点、１３个等位基因）、蛋白质（酶）多态（５个位点，１１个等位基因）和ＤＮＡ指纹分析，结果表明，红原鸡与茶花鸡（原始型品种）的亲缘关系较近；与泰和鸡、寿光鸡、芦花鸡、洛岛红（进化型品种）的亲缘关系较远，呈红原鸡－茶花鸡－泰和鸡、寿光鸡或芦花鸡、洛岛红这样一个进化阶梯。以上结果与国外资料（红原鸡不同群体和其它３种原鸡）比较显示，家鸡与红原鸡的亲缘关系最近，与绿原鸡的亲缘关系最远；而且我国的４个鸡种系统聚类为一个类群，而国外的不同原鸡聚类为另３个类群，提示中国地方鸡种可能有独立的血缘来源。

华南家鸡MHC-B区域复合微卫星位点LEI0258的遗传多样性与进化研究

旨在应用MHC-B区域复合微卫星位点LEI0258研究华南家鸡的遗传多样性与进化历史。以华南地区和邻省家鸡及商品鸡为试验材料,对微卫星位点LEI0258进行基因分型和测序,分析其遗传多样性和构建中介网络图。结果表明,580份样品共检测到LEI0258的62个等位基因,长度范围为182~501bp,其中37个为首次发现。华南家鸡LEI0258保持着较高的遗传多样性水平,观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为0.813、0.960和0.957。中山沙栏鸡、文昌鸡和五华三黄鸡的遗传多样性水平明显高于广西三黄鸡。LEI0258的28个等位基因与27种已知MHC血清型相对应。基于LEI0258侧翼区变异信息的中介网络图将62个等位基因分为8条进化枝,其中3条进化枝同样存在于红原鸡中,提示华南家鸡主要起源于红原鸡。部分等位基因存在于特定鸡品种中,可作为品种鉴定的参考依据。结果提示,微卫星位点LEI0258适用于地方鸡群体遗传多样性、血清型鉴定、品种鉴定和进化研究。

家鸡腺苷琥珀酸裂解酶基因多态性与肌苷酸含量的关联及其与红原鸡的亲缘关系

根据腺苷琥珀酸裂解酶(adenylosuccinate lyase,ADSL)基因外显子2的序列设计引物,用PCR-SSCP的方法对隐性白羽鸡、丝羽乌骨鸡、白耳鸡、藏鸡以及红色原鸡两个亚种进行了单核苷酸多态性分析,并检测到了多态性,表现为3种基因型,对两种纯合子进行直接测序,结果发现3484位碱基处发生C→T突变。对3种基因型的肌肉肌苷酸含量的最小二乘分析结果显示TT型(突变型)个体的肌肉肌苷酸含量极显著地高于CT型、显著地高于CC型个体,CT型个体也稍高于CC型,但差异不显著,初步推测该位点可能与肌肉肌苷酸含量有关。根据该多态位点的基因频率,基于Nei氏的遗传距离运用NJ聚类法构建系统发生树,进行家鸡与原鸡的亲缘关系分析,结果发现,丝羽乌骨鸡与白耳鸡的亲缘关系最近,藏鸡和中国红原鸡亚种的亲缘关系也较近,中国地方家鸡品种与中国红原鸡亚种的亲缘关系较近,而与泰国红色原鸡的亲缘关系较远,隐性白羽鸡与原鸡亲缘关系最远,初步得出中国家鸡有自己独自的血缘来源的结论。

家鸡血浆淀粉酶的多态现象

本研究采用水平平板聚丙烯酰胺凝胶电泳法,测定了杏花鸡、石歧杂鸡、粤黄鸡、郑州红鸡、长沙黄鸡和白来航鸡的血浆淀粉酶。发现各鸡种的Amy-1位点均存在多态现象,还发现在杏花鸡中存在着控制血浆淀粉酶的另一位点(Amy-2),Amy-2位点上有一对显隐性基因(Amy-2~I,Amy-2~i)。经交配试验,发现Amy-2位点与Amy-1位点是紧密连锁的,重组率为0.0303。

家鸡冠型与生产性能及冠型基因遗传规律的研究进展

冠型为家禽的品种特征之一,不同品种的鸡其冠形也有各自的特点和形状。家鸡冠型主要有单冠、豆冠、玫瑰冠、胡桃冠等4种类型,它们由2对基因控制,即玫瑰冠基因R和豆冠基因P,这2个基因位于不同的染色体上。现对冠型基因和生产性能关系,冠型基因的遗传规律及基因定位的研究作一概述。

中国古代家鸡起源的再研究

本文认真探讨中国古代家鸡起源于近万年以前的中国河北地区这个观点的不足之处,详细阐述了动物考古学研究人员对中国新石器时代早期遗址中出土雉的骨骼的研究结果,特别重申家鸡可能最先在红原鸡的传统栖息地亚洲东南部被驯化,之后逐渐通过文化交流的方式北上,至少在距今3300年前,已经到达河南东部地区。专门强调形态学研究是动物考古学的研究方法中最为重要的工作,如果在古代动物遗存的D NA研究中没有动物考古学研究人员的参与,忽视动物考古学研究的思考,甚至单纯地从D NA的研究结果中提出推翻动物考古学研究成果的结论,这种认识的科学性是要受到全面质疑的。

家鸡(Gallus domesticus)和鹌鹑(Coturnix coturnix)染色体核型及G带比较分析

采用外周血淋巴细胞培养法和胰酶处理法,对家鸡和鹌鹑染色体的核型和G带进行了研究。结果表明,家鸡和鹌鹑染色体数目均为2n=78,但染色体的形态存在明显差异,主要表现在NO.1、NO.4、NO.6、NO.8和Z染色体上。NO.1染色体,家鸡为m型,而鹌鹑为sm型;NO.4、NO.6、NO.8和Z染色体,家鸡分别为sm、sm、m、m型,而鹌鹑全为t型。G带分析结果显示,家鸡和鹌鹑的G带差异主要反映在NO.1、NO.2染色体上,这可能是由于臂间倒位所致。

不同家鸡品种淀粉酶Amy-1分布不平衡现象的调查分析

调查不同品种成年鸡及其死胚的Amy-1表型分布,发现粤黄鸡、杏花鸡、清远麻鸡、胡须鸡和郑州红鸡及AA鸡成年鸡群Amy-1表型分布不符合Hardy-Weinberg氏平衡,其中粤黄鸡、杏花鸡和清远麻鸡的不平衡可能由各基因型生活力差异引起,胡须鸡、郑州红鸡和AA鸡不平衡的原因有待弄清,其中AA鸡的不平衡有其独特之处。结果表明,家鸡血液淀粉酶Amy-1分布不平衡具有品种特异性。

鸡mtDNA D-loop区单倍型簇频率与中国家鸡多母系起源研究

本研究旨在通过分析家鸡和原鸡D-loop区单倍型簇的区域性分布和频率揭示中国家鸡多母系起源的区域和传播途径。通过对1 347条鸡D-loop序列进行完全对比排序,共发现198种单倍型,聚成12个单倍型簇。分析结果显示,海岛型红色原鸡与家鸡和大陆型红色原鸡有明显差异;苏门答腊大陆型红色原鸡作为独立分支,也体现出与东南亚大陆型红色原鸡的区别。单倍型簇频率分析显示,Clade C代表的母系可能更早在东南亚及云南等地驯化并对我国南方家鸡形成产生影响,但并非直接由云南引入我国,应该另有途径;Clade D代表的母系可能更早在山东及河南一带驯化繁衍,后引入四川,并在四川开始大规模繁育饲养,此后向周边区域传播扩散,成为中国家鸡重要母系来源。本研究结果进一步支持了我国家鸡多母系起源的论断,并指出东南亚是我国南方家鸡重要的母系来源;同时,河南和山东一带也可能是我国家鸡起源的区域之一。

家鸡性早熟相关基因的研究进展

性早熟是优质鸡特有的重要经济性状。性早熟在很大程度上与遗传密切相关,是一个由多基因决定的复杂性状。本文主要介绍了GnRH-1基因、NPY基因、FSHβ基因、FSHR基因、PRL基因、PRLR基因、VIP基因、VIPR-1基因、DRD1基因、DRD2基因、IGF-1基因与STAT5B基因与家鸡性早熟的关系。