循环肿瘤DNA检测在乳腺癌早期诊治中的应用进展

乳腺癌作为全球女性第二大癌症致死原因,其高发病率与致死率给全球女性的健康带来了极大威胁。循环肿瘤DNA(ctDNA)是肿瘤细胞所释放的DNA片段,可以反映肿瘤负荷及肿瘤基因组的突变情况。ctDNA是肿瘤复发的灵敏且特异的生物标志物。ctDNA检测作为一种新兴的液体活检技术,在检测分子残留病灶和治疗反应监测方面具有实用性,可帮助临床医生优化治疗和监测策略。ctDNA检测在临床应用中面临一些挑战,包括检测灵敏度的限制、ctDNA水平的波动及其他因素的干扰。该文综述了近年来ctDNA检测技术在乳腺癌早期筛查、肿瘤反应监测、微小残留病灶检测及治疗耐药性评估方面的最新发展动态,并剖析其在临床实践中面临的挑战与未来潜力。

循环肿瘤DNA在膀胱癌中的研究进展及临床价值

随着生物技术的发展,液体活检技术在肿瘤方面的研究逐渐深入,循环肿瘤DNA(ctDNA)作为液体活检的主要方式之一,以其非侵入性、可重复性及可早期发现病变等特点备受关注。目前有研究表明ctDNA在膀胱癌(BCa)的早期诊断和分级、靶向治疗的选择和疗效分析、肿瘤的复发及进展等方面有一定的潜能,本文结合ctDNA的特点及其近年来在BCa中的研究进展和临床价值进行综述。ctDNA检测技术近年不断发展,人们在测序、突变测定技术发展及在增强其作为癌症检测生物标志物能力方面做出多项进展与尝试。对血浆样本中ctDNA的检测有助于在早期BCa的诊断中实现准确分类,但由于ctDNA含量低,需要更先进检测技术的支持;基于靶向测序的ctDNA分析是预测非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)患者疾病复发和侵袭性的一种有希望的方法。在晚期BCa患者中,可以应用ctDNA收集特有突变类型的特点,有针对性地指导用药、调整治疗及监测预后。尽管ctDNA在BCa的应用仍存在挑战,但已表现出广泛的应用前景。

尿液循环肿瘤DNA在膀胱癌早期诊断及预后预测中的价值

目的探讨尿液循环肿瘤DNA(ctDNA)在膀胱癌早期诊断及预后预测中的价值。方法选取68例膀胱癌患者作为观察组,77例健康体检者作为对照组。比较两组患者的尿液ctDNA浓度,采用多因素Logistic回归模型分析膀胱癌患者预后的影响因素。绘制受试者工作特征(ROC)曲线,分析ctDNA对早期膀胱癌的诊断价值及对预后的预测价值。结果观察组患者尿液ctDNA浓度明显高于对照组,差异有统计学意义(P﹤0.01)。尿液ctDNA诊断早期膀胱癌的灵敏度为0.868,特异度为0.985,ROC曲线的曲线下面积为0.975(95%CI:0.953~0.996)。多因素Logistic回归分析结果显示,ctDNA浓度是早期膀胱癌患者预后的影响因素(P﹤0.05)。尿液ctDNA预测早期膀胱癌患者预后的灵敏度为0.833,特异度为0.860,曲线下面积为0.864(95%CI:0.759~0.970)。结论检测尿液中ctDNA的浓度有助于诊断膀胱癌,且操作简单方便、无创伤性。尿液中ctDNA浓度对膀胱癌预后具有一定的预测价值,且特异度和灵敏度较高。

循环肿瘤DNA的检测技术及在癌症诊疗中的应用价值

循环肿瘤DNA(ctDNA)来源于肿瘤,能很好地反映肿瘤的基因信息,并且会随着肿瘤的进展发生相应的改变。近年来,ctDNA独特的能力备受人们关注并被广泛研究,本文在总结ctDNA的来源、性质和样品处理的基础上,对ctDNA的检测技术及在癌症诊疗中的应用进行综述,阐述了ctDNA标准物质在二代测序中的作用及重要性,并指出ctDNA样品的收集、存储、定量检测以及数据分析等各个流程中建立统一标准及规范的迫切性。

外周血循环肿瘤DNA预测晚期非小细胞肺癌免疫治疗疗效及预后价值

目的探讨外周血循环肿瘤DNA预测晚期非小细胞肺癌(NSCLC)免疫治疗疗效及预后的价值。方法对2021年1-12月收治于河北北方学院附属第一医院呼吸与危重症医学科住院的78例晚期驱动基因阴性使用替雷利珠单抗治疗的NSCLC患者进行前瞻性研究,免疫治疗2周期后按照实体瘤疗效评价标准(RECIST1.1)评价疗效,包括完全缓解(CR)、部分缓解(PR)、疾病稳定及疾病进展,将CR和PR患者定义为观察组(n=48),其他患者被定义为对照组(n=30),测定两组患者治疗前后外周血中ctDNA水平,采用ROC曲线分析外周血ctDNA水平对于免疫治疗后达客观缓解的预测价值。对所有患者进行随访,统计其无进展生存期,采用单因素及多因素回归分析免疫治疗后患者预后的影响因素,采用Spearman相关系数对ctDNA水平与PFS进行相关性分析,采用Kalplan-Meier生存曲线进行生存分析。结果观察组治疗前后外周血ctDNA水平分别为(4.47±1.21)、(2.65±1.14)ng/μL(t=7.559,P<0.001),对照组治疗前后外周血ctDNA水平为(4.54±1.15)、(4.29±1.57)ng/μL(t=0.699,P=0.487),两组患者在治疗前外周血ctDNA水平差异无统计学意义(t=-0.25,P=0.801),观察组治疗后外周血ctDNA水平较对照组下降(t=-5.35,P<0.001)。ROC曲线分析外周血ctDNA水平预测免疫治疗后达客观缓解的曲线下面积为0.819,预测的敏感性度81.3%,特异度为80%,外周血ctDNA水平与患者无进展生存期(PFS)呈负相关(r=-0.784,P<0.001),采用单因素Cox回归对入组患者的临床病理特征及ctDNA水平进行分析,结果显示肿瘤最大径>5 cm(HR=0.501,95%CI:0.282~0.890)、肿瘤Ⅳ期(HR=0.392,95%CI:0.227~0.677)、治疗方式(HR=15.473,95%CI:6.731~35.567)及ctDNA水平(HR=4.567,95%CI:3.182~6.555)均为晚期NSCLC患者免疫治疗后PFS的影响因素,再将有统计学差异的上述指标进行多因素分析,结果显示:治疗方式(HR=2.981,95%CI:1.019~8.722)及外周血ctDNA水平(HR=3.918,95%CI:2.619~5.861)是晚期NSCLC患者PFS的独立影响因素,采用Kalplan-Meier生存曲线进行分析,结果显示观察组的中位PFS为8.4个月,对照组的中位PFS为5.4个月,差异有统计学意义(χ^(2)=46.828,P=0.000)。结论免疫联合化疗可增强杀伤肿瘤细胞的能力,外周血ctDNA水平可评估免疫治疗的疗效及预后,可用于指导晚期NSCLC患者的免疫治疗。

血液循环肿瘤DNA测序技术在卵巢癌诊断中的可行性分析

目的探究卵巢癌(OC)患者肿瘤组织与血液循环肿瘤DNA(ctDNA)驱动基因突变频谱改变的一致性,评估血液ctDNA测序技术在OC诊断中的可行性。方法选取2019年6月至2021年6月于呼和浩特市第一医院明确诊断的30例OC患者作为研究对象,采集所有患者术前外周血及肿瘤组织样本,检测ctDNA基因突变序列,分析肿瘤组织与血浆中ctDNA突变基因检测结果及肿瘤组织与血浆ctDNA驱动基因突变频率一致性。结果30例OC患者,肿瘤组织ctDNA驱动基因突变频率较高的前5位分别为MAP3K1框内缺失突变、DCP1B框内插入突变、AHNAK错义突变、TP53错义突变、ZNF331错义突变;血液ctDNA驱动基因突变频率较高的前5位分别为DCP1B框内插入突变、MAP3K1框内缺失突变、AHNAK错义突变、ZFHX3多重突变、PLEC错义突变。肿瘤组织及血液样本共涉及驱动基因173个,突变频率较高的基因共52个;肿瘤组织与血液样本中DCP1B、MAP3K1、CLTCL1、GRIN3A、ERBB2、MEGF6、MN1、ZFHX3、PLEC等多个基因突变频率高度一致,TP53、RANBP17、PDGFB、FES、TRIP11、TET2等基因在肿瘤组织样本中突变频率较高,而SLC34A2、NFATC2、TFEB、NCOA3等基因在血浆样本中突变频率较高。结论血浆和肿瘤组织样本均可检出ctDNA基因突变,二者可相互补充,且基因突变频谱具有较高一致性,可全面监控OC基因频谱在致病过程中的变化,有助于指导临床及时调整治疗方案。

循环肿瘤DNA在消化道肿瘤早期筛查中的研究进展

消化道肿瘤发病率高,起病隐匿,且预后较差。传统的筛查方法存在创伤性、滞后性、敏感度及特异度低等不足,导致其在消化道肿瘤早期筛查中的推广应用受到限制。循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是由肿瘤细胞坏死或凋亡后释放到体液中的游离DNA片段,携带有突变、重排和甲基化等肿瘤特异性改变的遗传信息,与传统组织活检相比,ctDNA检测具有敏感度和特异度高、无创、易获得以及可重复性好的优势,在消化道肿瘤早期筛查中有很大潜力。本文通过对ctDNA在消化道肿瘤早期筛查中的研究现状作一综述,旨在评估ctDNA在消化道肿瘤诊断中的潜在价值,为探索消化道肿瘤的早期诊断手段提供理论依据。

循环肿瘤DNA与胃肠道恶性肿瘤相关研究的文献计量分析

目的利用文献计量学分析工具分析循环肿瘤DNA与胃肠道恶性肿瘤的相关研究,探讨该领域的研究现状、热点分布和未来趋势。方法检索建库至2023年11月17日的Web of Science核心合集数据库,使用CiteSpace 6.2.R6、Scimago Graphica、VOSviewer 1.6.19和R软件(Bibliometrix包)用于数据分析和可视化。结果纳入语种为英文的论著和综述共1326篇,1997—2014年为研究成果缓慢增长期,2014年以后发文量快速增长。国家(地区)和机构合作分析表明美国和西欧是该领域的全球研究中心,美国德克萨斯大学是发文量最多的机构。发文量最多的学者是Bardelli Alberto,被引频次最多的学者是Chetan Bettegowda。《Cancers》是载文量最高的期刊,该领域呈现出突变分析向临床应用发展的趋势,突变分析相关的热点包括微卫星不稳定、启动子甲基化、KRAS基因突变、拷贝数畸变、表皮生长因子受体、肿瘤内异质性,临床应用方面备受关注的热点涉及诊断、疗效监测、获得性耐药、复发风险、微小残留疾病监测。结论该领域的研究方兴未艾,整体上呈现出从全基因组测序到精准靶向测序、将突变分析与临床实践相结合的趋势。

脑脊液循环肿瘤DNA在非小细胞肺癌柔脑膜转移中的临床应用进展

柔脑膜转移(leptomeningeal metastasis,LM)是恶性肿瘤的一种致死性并发症,其在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者中的发生率为3%-5%。LM诊断难、预后差、治疗手段有限且无统一的疗效评价标准,是NSCLC诊疗的难点。循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)由肿瘤细胞脱落,携带与癌症相关的信息,在肿瘤精准治疗中有重要应用价值。脑脊液(cerebrospinal fluid,CSF)存在于大脑蛛网膜下腔、脊髓和中央管,与脑膜组织直接接触,是最能反映LM遗传特征的液体介质。近年来,解析CSF ctDNA多组学特征对深入探索中枢神经系统(central nervous system,CNS)转移瘤的辅助诊断、疗效判断、预后预测及耐药机制分析等具有重大意义。本文将对CSF ctDNA检测技术及其在NSCLC-LM患者中的临床应用进行简要综述。

循环肿瘤DNA在胃癌和结直肠癌早期诊断中的应用进展

癌症威胁着人类健康,全球范围内胃癌和结直肠癌仍是癌症相关死亡的主要原因之一。早期诊断对提高胃癌和结直肠癌的生存率尤为重要,但目前的临床筛查手段都具有一定的局限性。近来液体活检(fluid biopsy)得到了研究者的广泛关注,其中循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是体液内肿瘤来源的游离DNA片段,携带肿瘤相关遗传信息,目前已有相关研究表明ctDNA检测在胃癌和结直肠癌的早期诊断中具有特异性。该文主要就ctDNA及其在胃癌和结直肠癌早期诊断中的应用进展予以综述。

循环肿瘤DNA液态活检检测微小残留病在实体肿瘤诊疗中的研究进展

基于液态活检的微小残留病(minimal residual disease,MRD)检测在各肿瘤疾病的应用中具有巨大的潜力,随着基因测序技术和生物信息学的发展,二代测序(next-generation sequencing,NGS)作为一种新兴的MRD检测技术,可以对循环肿瘤DNA(circulation tumor DNA,ctDNA)进行定量和定性分析,目前在多种实体瘤中的应用均具有高灵敏度和高特异度。多项研究已证实基于ctDNA的MRD检测结果与患者复发预测、预后判断、疗效评估及个体化分层治疗均有临床相关性,且相较于传统临床手段优势明显。但目前ctDNA MRD的检测技术应用于常规临床实践仍需要大量临床数据的支持,检测方法的统一标准仍未建立。

循环肿瘤DNA检测在乳腺癌中的临床应用

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,考虑到其在临床和生物学上的异质性,乳腺癌具有不同的分子分型,临床中需为不同的患者定制个性化的诊疗方案。用于确诊乳腺癌的传统检测方法仍然不够完善,而且不能完整地获取乳腺癌的全基因组信息。近年来,随着液体活组织检查技术的出现,为肿瘤的早期筛查及明确诊断提供了很大的支持,也将极大地促进乳腺癌的早期诊断和预后提升。液体活检是一种利用人体体液为样本来源,以获取与肿瘤相关信息的一种检测方法,它通过非侵入性方式获得体液进行组织活检,提供了一种便捷、无创的检测技术,能够更全面显示出肿瘤的遗传特征。在此背景下,循环肿瘤DNA(ctDNA)正迅速成为标准肿瘤活检的重要辅助手段,它在乳腺癌的诊断和治疗中展现出巨大的应用前景,通过ctDNA检测可为乳腺癌患者提供更为精准的医学治疗方案。本文就ctDNA在乳腺癌领域中的应用及未来发展趋势作一综述,希望能为液体活检在临床实践中的应用提供一定的帮助。

循环肿瘤DNA在结直肠癌精准诊疗中的应用

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是世界上最常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率居高不下,严重危害着人们的身体健康。传统的诊断模式已不能满足现如今人们对于肿瘤进行实时监测的需求。对比传统的检测手段,ctDNA检测不仅无创,而且能够实时检测肿瘤全面的基因组信息。随着检测技术的进步,逐渐凸显出其在CRC临床治疗中的潜在价值。本文就ctDNA在CRC患者中早期筛查、微小残留病变检测、指导个体化治疗的临床应用进展进行综述。

循环肿瘤DNA在弥漫大B细胞淋巴瘤诊治及预后评估中的应用研究进展

弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是常见的非霍奇金淋巴瘤亚型,其异质性高,目前主要依靠病理学检查进行诊断,通过影像学检查及临床特征判定疗效及预后,尚不能满足临床需求。循环肿瘤DNA(ctDNA)是患者循环中的肿瘤DNA游离片段,作为新兴的特异性生物标志物,在疾病辅助诊断、疗效评价、预后评估、治疗指导等方面展现出易全程获取、携带全面信息、可动态实时监测等诸多优势,尤其在与机器学习方法结合后,可实现更为经济高效的动态监测,从而改善DLBCL的全程管理。通过监测疾病全程中的ctDNA水平可指导临床调整治疗方案,实现DLBCL患者个体化精准治疗管理。ctDNA有望在未来成为一种可靠且广泛适用的生物标志物。

激素敏感性前列腺癌患者中PSMA PET/CT衍生参数与循环肿瘤DNA特征之间的相关性分析

背景与目的:前列腺特异性膜抗原(prostate-specific membrane antigen,PSMA)正电子发射计算机体层显像(positron emission tomography/computed tomography,PET/CT)和循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)的检测结果都是激素敏感性前列腺癌(hormone-sensitive prostate cancer,HSPC)治疗决策的参考依据。本研究旨在分析HSPC患者中PSMA PET/CT衍生参数与ctDNA特征之间的相关性。方法:回顾性纳入于复旦大学附属肿瘤医院就诊且接受PSMA PET/CT和ctDNA测序的间隔≤2周、有完整病历记录的HSPC患者。排除存在除前列腺癌外的活动性恶性肿瘤,以及组织学特征支持纯神经内分泌癌或小细胞癌诊断的患者。本研究经复旦大学附属肿瘤医院伦理委员会批注(伦理编号:1909207-12)。采用Spearman相关系数评价PSMA PET/CT衍生参数最大标准摄取值(maximum standardized uptake value,SUVmax)、总肿瘤体积(total tumor volume,TTV)、病灶摄取总量(total lesion uptake,TLU)与ctDNA分数(ctDNA%)之间的相关性。结果:共纳入60例HSPC患者,TP53(3.3%)、BRCA2(3.3%)和ATM(3.3%)是最常见的突变基因。在相关性分析中,ctDNA%与SUVmax有显著相关性(Spearman’s rho=0.272,P=0.036);ctDNA%与TLU(Spearman’s rho=0.160,P=0.222)和TTV(Spearman’s rho=0.162,P=0.215)无显著相关性。结论:SUVmax与ctDNA%之间有显著相关性,提示与无PSMA阳性病灶和低PSMA摄取病灶的患者相比,存在高PSMA摄取病灶的患者接受联合靶向治疗的概率增加,本研究结果有望作为制订个体化治疗方案的参考。

循环肿瘤DNA在早期乳腺癌分子检测中的研究进展

通过常规检查方法(钼靶摄片、CT、超声)早期发现乳腺癌(BRCA)存在一定程度的局限,而液体活检技术在BRCA患者中的早期诊断优势日益显著。循环肿瘤DNA(ctDNA)是存在于体液中的部分游离于细胞外的DNA。ctDNA是以液体活检技术为基础的筛选新型肿瘤标志物的新思路,并有助于早期乳腺癌的临床决策。本研究就ctDNA的生物学特性、检测方法在早期BRCA诊治中的应用进行探讨,并展望ctDNA的未来研究方向。

循环肿瘤DNA在膀胱癌诊治中的研究进展

膀胱癌是常见的泌尿系肿瘤,其诊断、预后评估和术后随访主要依靠膀胱镜检查和组织病理活检。循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是一种新型无创和实时的肿瘤特异性生物标志物,与传统组织活检相比,ctDNA检测的优势在于风险小,可以进行连续检测,在协助膀胱癌的早期诊断、疗效监测、个体化治疗、预后评估及预测复发等方面均能发挥重要作用。该文对ctDNA在膀胱癌中的最新研究进展进行综述。

一种突变型循环肿瘤DNA荧光检测方法的构建

首先合成二氧化硅包覆Fe_(3)O_(4)磁性纳米粒子(Fe_(3)O_(4)-SiO_(2)),然后连接目标物T790M的识别核酸链(DNA1),制备T790M的捕获探针(Fe_(3)O_(4)-SiO_(2)-DNA1)。进一步加入荧光素FAM标记的DNA2探针。当T790M存在时,DNA2,Fe_(3)O_(4)-SiO_(2)-DNA1与T790M发生DNA杂交。磁性分离后,上清液中DNA2上连接的FAM的荧光强度显著下降,且荧光强度与T790M浓度之间具有良好的线性相关性,线性回归方程为F=-142.56lgC+739.24(R^(2)=0.994),检测限为0.02 nmol/L。本方法为恶性肿瘤的精确诊断提供了一种有效的技术。

循环肿瘤DNA在非小细胞肺癌中的应用进展

肺部恶性肿瘤在全球范围内属于发病率与致死率最高的癌症类型,非小细胞肺癌(NSCLC)占所有肺癌病例的大多数,大约85%。治疗NSCLC的主要策略包括手术切除、放射治疗、化学治疗、分子靶向药物治疗及免疫治疗等综合疗法。液态活检技术,因其具有非侵入性、能够实时监测肿瘤负荷,以及提供全面的肿瘤基因组信息等显著优势,在临床上应用日益广泛。特别是循环肿瘤DNA(ctDNA)作为一种理想的生物标志物,在NSCLC的诊断和治疗中扮演着关键角色。本文将深入探讨ctDNA在NSCLC中的研究进展,覆盖预后评估、复发监控及治疗反应预测等多个领域。

弥漫大B细胞淋巴瘤^(18)F-FDG PET/CT代谢参数和循环肿瘤DNA突变丰度:相关性和生存分析

目的:探讨弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者18-氟-脱氧葡萄糖正电子发射断层显像/计算机断层扫描代谢参数与外周血循环肿瘤DNA(ctDNA)的相关性,以及这两类参数在预测无进展生存期(PFS)中的预后价值。方法:回顾性分析同期行外周血ctDNA检测及相应PET/CT扫描的DLBCL患者的临床、PET/CT及ctDNA资料。ctDNA取样及PET扫描时,根据疾病不同治疗及病情发展情况,将患者分为基线组和复发/难治性(R/R)组。ctDNA突变丰度以变异等位基因频率(VAF)表示,包括最大VAF(maxVAF)和平均VAF(meanVAF)。以41%最大标准化摄取值方法获得总代谢肿瘤体积(TMTV)和糖酵解总量(TLG),并获得两最远病灶距离(Dmax),采用Spearman相关分析评估PET参数与ctDNA突变丰度的相关性。在基线及R/R组中分别采用受试者工作特征(ROC)曲线获得这些参数和预测PFS的最佳截断值。采用Kaplan-Meier法勾画生存曲线并行log-rank检验比较生存差异。结果:共纳入67例DLBCL患者,男性33例,女性34例,中位年龄为56.0(46.0,67.0)岁,基线组29例,R/R组38例。PET参数中,除最大标准化摄取值(SUVmax)外,基线TMTV、TLG、Dmax均与基线ctDNA突变丰度显著相关(maxVAFvsTMTV:r=0.711;maxVAFvsTLG:r=0.709;maxVAFvsDmax:r=0.672;meanVAFvsTMTV:r=0.682;meanVAFvsTLG:r=0.677;meanVAFvsDmax:r=0.646),而在全部患者中,以上相关性明显减弱。在R/R患者中,仅TMTV与meanVAF具有较弱的相关性(r=0.376)。对各参数进行ROC分析结果表明,TMTV、TLG和Dmax预测PFS的特异性优于突变丰度,而ctDNA突变丰度的敏感性更好。除R/R患者外,在基线患者和全体患者中可观察到在不同乳酸脱氢酶水平下,TMTV、TLG、Dmax、VAF均具有显著差异(均P<0.05)。生存曲线表明,基线患者中,高TMTV(> 109.5 cm3)、高TLG(> 2 141.3)、高Dmax(> 33.1 cm)及高VAF(maxVAF> 7.74%、meanVAF> 4.39%)均是不良PFS的危险因素,而在R/R患者中仅高VAF(maxVAF和meanVAF均> 0.61%)是影响PFS的危险因素。结论:PET衍生参数与ctDNA突变丰度相关性良好,尤其是在基线患者中。ctDNA的VAF预测PFS较PET代谢参数更敏感,而PET代谢肿瘤负荷具有更好的特异性。TMTV、TLG和VAF均对PFS有良好的预后价值。PET/CT联合ctDNA在预后评估和个性化治疗方面有进一步研究的潜力。