微卫星标记分析勒通绵羊的遗传多样性

为了对勒通绵羊这一资源群体的遗传多样性进行评价,本试验选择位于绵羊染色体上的30个微卫星标记,采用毛细管凝胶电泳的方法进行等位基因的分型。结果表明,30个微卫星标记共有262个等位基因,每个标记的等位基因数在3~18个之间,平均为8.73个;有效等位基因数为1.5636~9.5163个,平均为4.2384个;观察杂合度为0.3276~0.9138,平均为0.6563;期望杂合度为0.3636~0.9027,平均为0.7170;多态信息含量为0.330~0.886,平均为0.6764,属于高度多态性。揭示勒通绵羊具有丰富的多样性,有进一步挖掘利用的价值。

基于九个微卫星标记的核桃举肢蛾地理种群的遗传多样性分析

【目的】核桃举肢蛾Atrijuglans hetaohei是核桃Juglans regia上的一种重要蛀果性害虫,在我国北京、山东、山西、陕西、四川等核桃种植产业区普遍发生,严重影响核桃的产量和商品价值,造成严重的经济损失。本研究旨在明确核桃举肢蛾地理种群遗传分化和地理分布特点,阐明其不同地理种群间的遗传结构,了解其种群扩散规律,为核桃举肢蛾的防控提供理论指导。【方法】基于核桃举肢蛾转录组测序结果,使用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳分型方法,利用筛选的多态性微卫星位点对我国8个省/市(北京、河北、河南、山东、山西、陕西、甘肃和四川)的16个地理种群共319头核桃举肢蛾样本进行种群遗传多样性分析,使用STRUCTURE和BAPS软件分析其种群遗传结构,并对影响其地理分布的因素进行探讨。【结果】核桃举肢蛾9个SSR位点具有较高的多态性,且多数位点未偏离哈迪-温伯格平衡。核桃举肢蛾各地理种群遗传多样性中等偏低(有效等位基因数Ne为1.334~1.824,期望杂合度He为0.203~0.342),种群间遗传分化较小(遗传分化系数F_(ST)<0.142),种群间基因流差异较大(Nm为1.518~23.800)。核桃举肢蛾地理种群间遗传分化程度与地理距离间有显著相关性(R^(2)=0.226)。16个核桃举肢蛾地理种群可分为两支,即东部和西部种群。AMOVA分析表明,核桃举肢蛾种群间遗传变异较小,且种群变异主要来源于种群内;种群内的遗传分化系数FCT值在0.03941~0.06449之间,表明地理阻隔和气候差异不是影响核桃举肢种群遗传结构和地理分布格局的主要因素。【结论】核桃举肢蛾地理种群遗传多样性中等偏低,不同地理种群间存在较低水平的遗传分化和差异较大的基因流。鉴于核桃举肢蛾特殊的生活史和独特的生物学特性,结合种群遗传结构分析结果,我们推测河流对核桃举肢蛾地理种群基因流的阻碍作用强于山川,而作为主要经济果树害虫,人类活动可能是干扰核桃举肢蛾种群地理分布的最主要因素。

东北春播区糜子核心种质的荧光微卫星标记鉴定

优异种质资源是糜子新品种选育和产业发展的基础。本研究以190份东北春播区糜子核心种质为材料,利用前期构建的SSR标记在5'端标注荧光,进行PCR扩增和毛细管电泳。根据毛细管电泳检测的片段有无采用“0/1”表示,利用ID Analysis4.0进行区分,使用PopGene、PowerMarker、MEGA、Structure、NTSYS进行遗传多样性分析。试验结果表明,3个荧光SSR标记组合(RYW3+RYW6+RYW28)可区分190份材料,共检测出等位变异73个,平均为24.3333;有效等位基因数(Ne)为5.4728(RYW3)~15.8922(RYW6),平均为9.6496;检出Shannon多样性指数(I)为2.0851(RYW3)~2.9457(RYW6),平均为2.4896;观测杂合度(Ho)为0.7529(RYW6)~0.9574(RYW28),平均为0.8876;期望观测杂合度(He)为0.8194(RYW3)~0.9398(RYW6),平均为0.8765;Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.8173(RYW3)~0.9371(RYW6),平均为0.8741;多态性信息含量(PIC)为0.8656(RYW3)~0.9722(RYW6),平均为0.9198。基于UPGMA将190份资源划分为3个群组。基于Structure的遗传结构分析(K=3)将糜子核心种质分为3个类群,来源于东北地区的4个基因库(黑龙江、吉林、辽宁和内蒙古的一部分)。基于主成分分析将材料分为4个类群,与地理来源一致。利用在线二维码技术(https://cli.im/)构建了190份东北糜子核心种质的DNA分子身份证。

微卫星标记技术在绵羊育种中的应用

丰富的绵羊品种是我国宝贵的遗传资源,保护与管理不到位是造成品种资源数量下降以及绵羊生产性能降低的主要原因,为充分保护和利用绵羊资源、提高生产性能,利用分子技术开展绵羊遗传育种研究已成为主流。微卫星标记技术是一种普遍应用的分子标记辅助育种手段,虽在自动化水平方面具有一定的局限性,但其具有信息量大、分布广、多态性高、成本低等优势,在畜禽遗传育种研究领域发挥着不可替代的作用,不断发展的高通量测序技术对微卫星标记技术带来了极大的推动作用。本文主要介绍了微卫星标记的作用机制、特征、基于高通量测序技术的筛选及检测分析方法等,重点综述了微卫星标记技术在绵羊遗传多样性评估、群体遗传结构分析、遗传图谱构建、亲权鉴定、杂种优势推测等方面的应用进展,以期为更好地应用微卫星标记技术开展绵羊遗传育种研究工作提供参考。

基于D-loop序列和微卫星标记的4个黄颡鱼群体的遗传变异分析

为探究广东珠江、广西漓江、四川金沙江和云南西江4个水系黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)群体的遗传变异情况,本研究分别基于上述水系共108尾黄颡鱼的线粒体D-loop序列和12个微卫星标记对4个黄颡鱼群体进行群体内遗传多样性、群体间遗传距离和变异及群体结构分析。结果表明:共得到105个D-loop序列,其核苷酸组成中A+T含量占比为56.22%,G+C含量占比为43.78%。在105个有效序列中,多态位点数为746个(含缺和无效多态位点),单倍型数为51个。Hap2、Hap25、Hap15分别是广东珠江、广西漓江、四川金沙江群体的优势单倍型。4个黄颡鱼群体的单倍型多样性(H_(d))介于0.842~0.940,核苷酸多样性(π)介于0.002~0.083;四川金沙江群体Hd的最低,π也处于较低水平;而云南西江群体的Hd和π均最高;4个群体的Tajima′s D值均小于0。等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)均为广西漓江群体最高,广东珠江群体次之,云南西江群体较低,四川金沙江群体最低。4个黄颡鱼群体的K2P遗传距离介于0.008~0.115之间,其中广西漓江与云南西江群体间的K2P遗传距离最近;广东珠江群体与其他3个群体的K2P遗传距离较远,与四川金沙江群体的K2P遗传距离最远。4个黄颡鱼群体间均存在极显著的遗传分化(P<0.01),群体间遗传分化指数(F_(st))介于0.114~0.959之间。4个黄颡鱼群体间Nei’s遗传距离和遗传一致性分别介于0.117~1.114之间和0.328~0.890之间,其中,广西漓江群体与云南西江群体的Nei’s遗传距离最近、遗传一致性最高,广东珠江与四川金沙江群体的Nei’s遗传距离最远、遗传一致性最低。在UPGMA系统聚类树中,4个黄颡鱼群体主要分为两支,其中广西漓江群体、云南西江群体最先聚为一支,然后与四川金沙江群体聚为一支,最后与广东珠江群体聚类。在NJ聚类树中,4个群体黄颡鱼的明显分为4个分支,广西漓江群体与云南西江群体呈镶嵌式分布。4个黄颡鱼群体中共享单倍型较少,但特有单倍型较多,其中云南西江和广西漓江群体相邻较近且共有单倍型较多。在基于Nei’s遗传距离进行的主坐标分析中,广西漓江群体和云南西江群体的个体之间遗传差异较小,广东珠江和四川金沙江群体的个体之间遗传差异较大。说明四川金沙江群体遗传多样性水平较低,云南西江群体遗传多样性水平较高,广西漓江群体与云南西江群体存在一定的基因交流。

基于微卫星标记的雪豹种群结构及遗传多样性

掌握雪豹(Panthera uncia)的遗传多样性信息对其保护和管理有重要意义。对104只雪豹个体的组织样品提取DNA,结合文献中提供的70个雪豹基因分型数据,利用9个微卫星多态性位点进行遗传多样性研究。结果显示:当样本量从70个增加到174个时,雪豹种群有分化为2个种群的趋势,即西北部群和中部群;共检测到45个等位基因(Na),中部、西北部2个种群平均每个位点Na分别为4.556和4.667,平均期望杂合度(He)分别为0.574和0.591,平均观测杂合度(Ho)分别为0.517和0.498。雪豹群体的平均近交系数(FIS)为0.137,平均遗传分化系数(FST)为0.067,平均多态信息含量(PIC)为0.602,种群间遗传变异为15.24%,种群内遗传变异为84.76%。9个微卫星位点具有中高程度多态性,与其他雪豹研究相比,2个雪豹种群遗传多样性处于中等水平,种群间遗传分化水平处于中等程度,遗传变异大部分来源于群体内部。研究结果对全球雪豹的种群结构和遗传多样性研究具有重要意义,也为雪豹未来的科学保护提供可靠的遗传背景。

利用微卫星标记分析贺兰山东麓不同子产区酿酒酵母遗传多样性

本研究采用7个微卫星分子标记(SCAAT1、YPL009C、C4、C5、C11、SCAAT3、SCY0R267c),对宁夏贺兰山东麓5个子产区的‘霞多丽’‘赤霞珠’和‘美乐’葡萄酒发酵中分离的59株本土酿酒酵母和10株商业酿酒酵母进行了遗传多样性分析。7个位点共检测出153个等位基因,每个位点等位基因数为15~28个;平均多态信息含量0.7990,均为高多态位点;SCAAT1表现出最高的观测杂合度0.9278,C5表现出最高的期望杂合度0.8699。在聚类分析中,各株酵母可以得到有效区分,各子产区本土酿酒酵母表现出较明显的地域分化,来源于青铜峡产区的菌株大都聚类在一起,来源于永宁、石嘴山和红寺堡产区的菌株表现出较近的亲缘关系;年份因素对特定产区(如青铜峡)的菌株聚类有显著影响,尤其是在2020年和2019年的样本中表现出较高的遗传相似性;品种因素对菌株聚类的影响较为复杂,‘赤霞珠’在不同产区和年份中表现出较稳定的基因特征,而‘霞多丽’和‘美乐’则表现出较强的地域性。商业酿酒酵母与本土酿酒酵母保持了一定的遗传距离,表现出比本土酿酒酵母更低的遗传相似性。69株酿酒酵母菌株表现出较高水平的遗传多样性,本土酿酒酵母在不同子产区间存在一定的遗传距离,商业酿酒酵母与本土酿酒酵母表现出较远的亲缘关系。

利用10个微卫星标记对珠三角地区猪个体识别和肉类溯源

基于微卫星标记和毛细管电泳技术建立猪个体识别和肉类溯源系统,打击市场上来源不明的猪肉混合售卖的现象。采用10个微卫星标记进行PCR扩增和毛细管电泳分析,对珠三角地区采集的102个猪DNA样品进行个体识别和肉类溯源研究。结果表明:10个微卫星标记具有良好的猪个体识别和肉类溯源能力,多态性信息含量(PIC)在0.33和0.78之间,平均值为0.61;随机匹配概率(PM)和非父排除率(PE)的组合值分别为0.999999963514977和0.99592159278654;在实际应用中检出1例猪肉来源不明事件。该方法灵敏度高和准确性好,可应用于农场到市场各阶段的猪个体识别和肉类溯源,为监管部门提供技术支持。

尼罗罗非鱼生长性状相关微卫星标记的筛选与验证

为筛选尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)生长相关微卫星分子标记用于指导其选育工作,选用29个微卫星标记对尼罗罗非鱼高要F_(0)群体、高要F_(1)群体、番禺群体和海南群体的生长性状(体质量、全长、体长、头长、体高和体宽)进行了关联性分析和基因型间比较。结果表明:在高要F_(0)群体中29个微卫星位点共检测到242个等位基因,平均等位基因数(N_(a))为8.345,平均观测杂合度(Ho)为0.621,平均多态性信息含量(PIC)为0.842,各位点PIC值均大于0.5,具高度遗传多样性;29个微卫星标记中有6个标记(GM114、GM213、GM423、GM642、UNH130和UNH985)在高要F_(0)群体中与至少一种生长性状显著相关(P<0.05);GM213、GM642、UNH130和UNH9854个标记的不同基因型个体对应的生长性状在高要F_(1)群体中存在显著性差异(P<0.05),说明其在不同世代中遗传稳定;初筛生长相关微卫星标记在外群中的验证结果显示,GM213、GM642、UNH130和UNH9854个标记的不同基因型对应的生长性状在番禺群体中存在显著性差异(P<0.05),GM642、UNH130和UNH9853个标记的不同基因型对应的生长性状在海南群体中存在显著性差异(P<0.05)。研究表明,GM642、UNH130和UNH9853个微卫星位点在尼罗罗非鱼不同世代和不同群体中均与生长性状显著相关,GM642的DD和HH基因型,UNH130的AD、BC和FF基因型,以及UNH985的GH和CF基因型具有明显生长优势,可作为尼罗罗非鱼潜在的生长相关分子标记。

基于微卫星标记的克氏原螯虾种群遗传多样性和遗传结构分析

为了解当前我国不同地区克氏原螯虾种群的遗传背景情况,以期为人工养殖、新品种选育和资源保护提供参考依据。选取江苏洪泽湖(HZH)、湖北洪湖(HH)、湖南洞庭湖(DTH)、山东微山湖(WSH)、安徽巢湖(CH)、江西鄱阳湖(PYH)6个典型区域的克氏原螯虾群体作为研究对象,采用14对微卫星引物对来自6个地区的168份样品进行遗传多样性检测。结果可知,各群体不同标记位点的等位基因数在3~14之间,平均期望杂合度为0.81,平均多态信息含量分布在0.42~0.59之间,各群体均处于中高度遗传多样性水平。6个群体均发生一定程度Hardy-Weinberg平衡偏离,仅有少数位点在单一群体满足Hardy-Weinberg平衡,同时连锁不平衡检测发现9个连锁座位对处于不平衡状态。遗传距离结果显示,6个克氏原螯虾群体的遗传一致度(I)处于0.1278~0.6439之间,各群体间遗传距离(D)处于0.4402~2.0573之间。群体间遗传分化指数(Fst)接近0.5,反映出群体间的基因交流水平较弱,存在高度的遗传分化。AMOVA分析发现,39.65%的遗传变异来源于群体间,97.99%的遗传变异来源于个体间。遗传结构数据显示,K=5时,6个群体间存在显著的结构差异。上叙结果可知,6个地区的克氏原螯虾群体具有丰富的遗传多样性,群体间出现了显著分化,可通过隔离保种、杂交、选择育种等方式保护利用克氏原螯虾的种质资源,为我国克氏原螯虾产业的持续健康发展提供良种支持。

基于线粒体控制区和微卫星标记探讨秦岭细鳞鲑物种有效性

文章基于线粒体控制区基因序列和微卫星标记比较秦岭细鳞鲑(Brachymystax tsinlingensis Li)、黑龙江流域的尖吻细鳞鲑(Brachymystax lenok Pallas)和钝吻细鳞鲑(Brachymystax tumensis Mori)的分子遗传差异,为澄清其分类地位争议提供分子证据。结果表明:(1)扩增217个样本的mtDNA D-loop区序列,共获得45个单倍型,类群间无共享单倍型;基于单倍型构建的系统进化树显示三个细鳞鲑类群呈独立的支系;(2)基于14个呈多态性位点的遗传分化结果表明,秦岭细鳞鲑与尖吻或钝吻细鳞鲑之间的遗传距离均大于尖吻细鳞鲑和钝吻细鳞鲑之间的遗传距离;(3)基于线粒体D-loop和多态性微卫星位点计算出的遗传分化系数(FST)都远高于0.25表明三个类群间的遗传分化程度极高。这些结果表明,秦岭细鳞鲑与黑龙江流域细鳞鲑之间遗传分化程度高,结合前期发现秦岭细鳞鲑与黑龙江细鳞鲑类群有明显形态分化的研究结果及它们之间地理隔离已久的现状,研究初步判定秦岭细鳞鲑为独立物种,并建议以Brachymystax tsinlingensis Li为拉丁名。同时,建议将秦岭细鳞鲑作为独立单元进行保护,避免人为引种或杂交等因素造成种质资源破坏。

基于微卫星标记的中华绒螯蟹遗传多样性分析

为了解中华绒螯蟹不同群体的遗传结构,利用微卫星分子标记,分析中华绒螯蟹单年系F5代选育群体、“长江2号”和长江野生群体的遗传多样性。结果表明,6个微卫星位点的等位基因数为7~11,有效等位基因数为4.5394~9.5294,观测杂合度为0.6389~0.8611,期望杂合度为0.7907~0.9077,多态信息含量为0.7797~0.8951,6个微卫星位点均具有高度多态性。3个河蟹群体的期望杂合度为0.8176~0.8478,多态信息含量为0.7841~0.8125,表明所有群体均具有高度遗传多样性。遗传分化指数值为0.05269~0.08482,表明所有群体间均有不同程度的遗传分化。AMOVA分析显示,群体间变异占总变异的5.34%,群体内个体间的变异占总变异的94.66%。基于Nei氏遗传距离构建的UPGMA系统进化树显示,单年系F5代选育群体先与“长江2号”群体聚为一类,再与长江野生群体聚为一类。

基于线粒体D-loop区和微卫星标记分析惠阳胡须鸡的遗传多样性

惠阳胡须鸡是广东省内的优质地方鸡种。为了准确评估惠阳胡须鸡的遗传多样性和保种效果,以线粒体DNA(mtDNA)D-loop区和10个微卫星标记联合分析惠阳胡须鸡的遗传多样性。mtDNA的结果表明:在检测的片段中,共发现23个变异位点、13种单倍型,群体的单倍型多态性和核苷酸多态性分别为0.8150、0.0094。微卫星标记结果表明:共检测到60个等位基因,平均每个标记位点具有6个等位基因,群体的期望杂合度、观察杂合度和多态信息含量分别为0.5234、0.5730、0.5120。结合群体构建的系统进化树和遗传结构分析,惠阳胡须鸡群体中可能有4个母系来源。上述结果揭示,惠阳胡须鸡具有较高水平的遗传多样性,具有较大的开发和选育潜力。

大菱鲆饲料转化率相关微卫星标记的筛选

饲料转化率(FCR)是大菱鲆重要的经济性状,通过选择育种提高饲料转化率,能够有效地降低大菱鲆的养殖成本,进而推动产业的发展。微卫星标记是鱼类分子标记辅助选育中常用的分子标记,为了筛选出与大菱鲆饲料转化率相关的微卫星标记,提高育种效率,实验以300尾大菱鲆幼鱼为研究对象,通过特制的网箱养殖系统,测定个体饲料转化率,分别选取饲料转化率最高和最低的30个样本作为高饲料转化率组(H组)和低饲料转化率组(L组)。利用40对大菱鲆微卫星引物,对H组和L组的DNA混池进行PCR扩增,统计两组个体PCR产物的基因型,筛选两池之间出现差异等位基因片段的位点,通过进一步的群体验证和家系验证,分析微卫星位点与大菱鲆饲料转化率的相关性。结果显示,微卫星位点YSKr148在238 bp的等位基因片段与大菱鲆饲料转化率存在极显著正相关,相关系数达到0.359,家系验证中该位点的阳性组的饲料转化率显著高于阴性组。研究表明,大菱鲆微卫星位点YSKr148与饲料转化率性状显著相关,可以用于该性状的分子标记辅助选育。本研究首次获得了与大菱鲆饲料转化率性状显著相关的分子标记,为研究该性状的遗传基础以及相关分子机制提供了依据,为该性状的分子标记辅助选育奠定基础。

基于微卫星标记的云南桑粉虱遗传多样性分析

应用2对微卫星引物对云南17个桑粉虱种群377个雌性个体的核基因组进行扩增,分析其遗传多样性与遗传分化状况。PopGene1.32和NTSYSpc2.10e软件分析结果表明:云南桑粉虱整体水平的Nei’s基因多样性指数为0.262 1±0.224 6,Shannon’s信息指数为0.389 1±0.301 2,表现出较高的遗传多样性。17个桑粉虱种群中红河LQ种群、保山WGJ种群具有较高的遗传多样性,而曲靖DP种群、昭通ZX种群、楚雄SB种群的遗传多样性最低。UPGMA聚类分析显示,当遗传一致度为0.964时,17个桑粉虱种群聚为9个支系。其中,红河CB种群、保山种群与普洱JD种群聚为一支;曲靖LL、PJ种群与普洱ZY种群聚为一支;曲靖DP种群与楚雄SB种群聚为一支;昭通QJ种群与楚雄DY种群聚为一支;红河LQ种群、德宏ZN种群、大理HQ种群、昭通ZX种群、楚雄YR种群分别为独立支系。种群间基因分化指数Gst为0.575 0,说明17个桑粉虱种群间遗传分化程度很高。Arlequin3.1软件Mantel test分析表明,云南桑粉虱种群遗传距离与地理距离无相关性。

叶绿体基因组微卫星标记(cpSSR)研究进展

随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开发,将会有越来越多的叶绿体基因组SSR分子标记应用于群体遗传学、生物地理学和杂交育种的研究。其在野生植物进化过程研究中所具备的潜力在不久的将来将被充分认识和利用。

利用微卫星标记鉴定水稻的稻瘟病抗性

应用水稻稻瘟病抗性基因 [Pi d(t) ]紧密连锁的微卫星标记RM 2 6 2对含有该抗病基因的品种地谷与感病品种江南香糯和 8987的杂交F2群体进行遗传分析和抗性鉴定 ,结果表明 ,RM2 6 2的PCR扩增物在抗、感品种之间的多态性较好 ;在 2个F2群体中 ,RM2 6 2和抗病基因间的重组率分别为 5 74%和 8 17% ,应用该标记的抗性纯合和杂合带型选择抗性植株 ,其准确率可达 98%以上。此外 。

中国主栽水稻品种微卫星标记数据库的初步构建

以前期筛选的微卫星标记为基础,并在4个染色体上增加新标记,进一步检测了63个主栽常规稻品种和杂交稻亲本,推荐了24个微卫星标记(每条染色体2个)作为水稻品种鉴别的标记;除了63个常规稻品种和杂交稻亲本外,这24个标记还应用于检测41个主栽杂交稻组合,并确定了各个标记在试验材料中检测到的等位基因类型。通过杂交稻组合与其亲本的标记匹配性检验,确认了杂交稻母本的高真实性,提高了恢复系数据的可靠性,剔除了1个假杂交稻,建立了103个水稻材料×24个标记的主栽水稻品种微卫星标记数据库,并分析了数据库中各个标记、各组材料的多态性表现。此外,还讨论了材料真实性和典型性对数据库构建的影响,提出了水稻品种间差异判别标准的建议及其应用风险和解决途径。

用微卫星标记鉴定中国小麦品种中Rht8矮秆基因的分布

利用微卫星Xgwm2 6 1标记对中国小麦主产区近 30年小麦主栽品种进行Rht8矮秆基因的鉴定 ,同时进行系谱分析加以验证 ,结果表明 :就全国范围而言 ,约 4 2 .3%的品种含有Rht8,但不同生态区的分布频率不同 ;结合赤霉酸(GA3)反应实验 ,约 2 0 .6 %的品种同时含有Rht8和对GA3不敏感矮秆基因。根据系谱分析 ,中国小麦品种Rht8的供体品种主要是来自意大利的阿夫 (Funo)、中农 2 8(VillaGlori)、郑引 1号 (St14 72 5 0 6 )、郑引 4号 (St2 4 2 2 4 6 4 )等和前苏联的无芒 1号 (Bezostaya 1)。洛类系统在中国作为抗源利用的同时 ,很可能也是Rht8的重要供体。

利用配合力和微卫星标记预测虹鳟品系间的杂交优势

用10对SSR引物对渤海、丹麦、道氏、挪威、加州5个虹鳟(Oncorhynchus mykiss)品系进行遗传距离分析,以这些品系为亲本,用完全双列杂交方法建立50个全同胞家系,对F1个体体质量、体长进行配合力分析,以期预测各品系间配组的杂交优势。结果表明,5个虹鳟品系均具有较高程度的遗传异质性,10个位点的平均杂合度为0.8163;在道氏品系与加州品系之间,遗传距离最大,达到0.7173;丹麦品系与渤海品系间最小,仅为0.2773。一般配合力以渤海品系为最高,依次为美国道氏品系、挪威品系、丹麦品系、加州品系。而各品系配组中丹麦品系×加州品系、渤海品系×挪威品系、丹麦品系×道氏品系、渤海品系×道氏品系等均是特殊配合力较高的高效组合,对其重复试验显示,有望培育出杂种优势率较高的优势组合。实验证实,结合配合力与SSR标记分析,能有效地指导优势杂交组合的选配。