为了了解永州地区犬球虫的感染情况,确定优势虫种,并探究不同球虫虫种之间的种系发育关系,试验利用饱和重铬酸钾溶液漂浮法对采自永州地区的362份犬粪便进行虫卵检测,通过宏基因组测序技术鉴定虫种,PCR扩增球虫的18S r RNA、ITS-1基因,...为了了解永州地区犬球虫的感染情况,确定优势虫种,并探究不同球虫虫种之间的种系发育关系,试验利用饱和重铬酸钾溶液漂浮法对采自永州地区的362份犬粪便进行虫卵检测,通过宏基因组测序技术鉴定虫种,PCR扩增球虫的18S r RNA、ITS-1基因,经测序、比对确定永州地区流行的优势虫种,并对其种系发育关系进行分析。结果表明:有124份犬粪便为阳性,总体感染率为34.25%,其中宠物犬的感染率为24.31%,流浪犬的感染率为44.20%;在永州地区有犬等孢球虫与俄亥俄等孢球虫流行,其中犬等孢球虫33株(占比26.61%),俄亥俄等孢球虫91株(占比73.39%);犬等孢球虫18S r RNA、ITS-1基因序列的长度分别为738 bp与1000 bp,俄亥俄等孢球虫18S r RNA、ITS-1基因序列的长度分别为1051 bp和398 bp。两种犬球虫18S r RNA、ITS-1基因序列的相似性分别为98.53%~98.76%和99.58%~99.72%。此外,在基于18S r RNA、ITS-1基因序列所组建的2个种系发育树中,犬等孢球虫与俄亥俄等孢球虫均处于每个种系发育树的同一分支上。说明在永州地区犬球虫的感染率较高,俄亥俄等孢球虫为该地区的优势虫种,且犬等孢球虫与俄亥俄等孢球虫之间存在较近的亲缘关系。展开更多
文摘为了了解永州地区犬球虫的感染情况,确定优势虫种,并探究不同球虫虫种之间的种系发育关系,试验利用饱和重铬酸钾溶液漂浮法对采自永州地区的362份犬粪便进行虫卵检测,通过宏基因组测序技术鉴定虫种,PCR扩增球虫的18S r RNA、ITS-1基因,经测序、比对确定永州地区流行的优势虫种,并对其种系发育关系进行分析。结果表明:有124份犬粪便为阳性,总体感染率为34.25%,其中宠物犬的感染率为24.31%,流浪犬的感染率为44.20%;在永州地区有犬等孢球虫与俄亥俄等孢球虫流行,其中犬等孢球虫33株(占比26.61%),俄亥俄等孢球虫91株(占比73.39%);犬等孢球虫18S r RNA、ITS-1基因序列的长度分别为738 bp与1000 bp,俄亥俄等孢球虫18S r RNA、ITS-1基因序列的长度分别为1051 bp和398 bp。两种犬球虫18S r RNA、ITS-1基因序列的相似性分别为98.53%~98.76%和99.58%~99.72%。此外,在基于18S r RNA、ITS-1基因序列所组建的2个种系发育树中,犬等孢球虫与俄亥俄等孢球虫均处于每个种系发育树的同一分支上。说明在永州地区犬球虫的感染率较高,俄亥俄等孢球虫为该地区的优势虫种,且犬等孢球虫与俄亥俄等孢球虫之间存在较近的亲缘关系。