腹泻患儿扎如病毒感染研究

目的了解广州地区婴幼儿扎如病毒性腹泻感染现状。方法在2008年8月—2009年7月,每周二、周五采集10份腹泻标本,运用real-time RT-PCR进行检测,阳性标本再行RT-PCR扩增、纯化、克隆、测序。结果扎如病毒检出率为1.0%(10/985),包括GI与GIV型,其中GI型占90%(9/10)。结论扎如病毒是该地区婴幼儿急性腹泻中检出率较低的病原体,GI-1是主要的感染型,GIV型感染在华南地区有增多趋势。

基于同源加尾系统的4种腹泻病毒的多重RT-PCR检测方法

目的针对轮状病毒、诺如病毒、星状病毒和扎如病毒四种常见腹泻病毒,建立基于同源加尾(Homo-Tag AssistedNon-Dimer,HAND)系统的一步法四重RT-PCR检测方法。方法根据4种病毒基因组保守序列设计引物并在5'端加上同源尾巴序列。通过优化通用尾巴引物和特异性加尾引物的浓度等PCR参数构建四重RT-PCR反应体系,并系统评价其稳定性、特异性和灵敏度。结果成功建立基于HAND系统的4种腹泻病毒一步法多重RT-PCR检测方法。特异性分析显示四种病毒间无交叉反应,灵敏度分析显示轮状病毒、诺如病毒、星状病毒和扎如病毒的检测下限分别达到48、9.6、1.92和48 pg。结论所建立的基于HAND系统的4种腹泻病毒多重RT-PCR检测方法简便快速、灵敏特异稳定、成本低廉,非常适用于基层医学实验室。

深圳地区婴幼儿人类杯状病毒感染状况及基因型分析

目的了解深圳地区婴幼儿人类杯状病毒（HuCV）感染状况和对HuCV阳性病毒株进行基因型分析。方法采集连续二个秋冬季腹泻流行期间来深圳儿童医院就诊的临床检验已排除寄生虫、细菌性腹泻和轮状病毒检测结果为阴性的3岁以下腹泻患儿粪便标本226份，应用分型引物RT—PCR法检测HuCV的诺如病毒（norovirus，NoV）GⅠ和GⅡ群和扎如病毒（sappovirus，SaV），扩增产物通过1．5g／d1琼脂糖凝胶电泳鉴定。部分阳性标本测序，结合GenBank参考株相应核苷酸序列进行进化和型别流行特点分析。结果HuCV阳性率11．06％（25／226），其中NoV阳性率10．62％（24／226），saV阳性率0．44％（1／226），检测出NoV阳性株GⅡ／4群18株，GⅡ／3群5株，1株尚不能确定所属群（占4．17％，]／24）。1株Sav为SGⅡ／1群。7月～24月龄为NoV高发年龄段。结论HuCV是深圳地区婴幼儿冬季腹泻的重要病原体之一，流行株为NoV的GⅡ／4群，同时，还发现SaV的SGⅡ／1群存在。

苏州市2013年-2017年5岁以下住院儿童病毒性腹泻的病原学分析

目的分析苏州市5岁以下病毒性腹泻的常见病原及流行病学特点,以助于小儿病毒性腹泻的防治。方法收集2013年1月-2017年12月在苏州大学附属儿童医院消化科住院的5岁以下病毒性腹泻患儿粪便标本1735例,采用ELISA法检测A组轮状病毒(RV),阳性标本采用RT-PCR法进行毒株分型鉴定;诺如病毒(NoV)、扎如病毒(SaV)、肠道腺病毒(EAdV)、星状病毒(AstV)采用RT-PCR或PCR法进行检测。结果共收集1735例标本,五种病毒检出率分别为A组RV 31.6%、NoV 16.9%、SaV 2.3%、EAdV 2.6%、AstV 1.9%,其中混合感染例数占9.0%。(1)A组RV的G血清学以G9为主83.6%,P基因分型以P[8]为主(94.5%),G血清型和P基因型组合以G9P[8]为主,549例A组RV阳性标本中,以12~23月龄组检出率最高,检出率最高季节在10月到次年2月。(2)293例NoV阳性标本中,以12~23月龄组和36~60月龄组检出率最高,检出率最高季节在10月。(3)40例SaV阳性标本中12~60月龄组检出率高;45例EAdV阳性标本中<2岁占73.3%;33例AstV阳性标本中<2岁占81.8%。结论A组RV是苏州市5岁以下住院儿童病毒性腹泻的最主要病原,其次是NoV,A组RV的流行菌株为G9P[8],不同种类的病毒的流行病学特点不同。

上海市浦东新区2011年病毒性腹泻检测情况分析

目的了解上海市浦东新区病毒性腹泻的感染情况。方法采用实时荧光定量-聚合酶链式反应对2011年7—12月间上海市浦东新区12家监测医院的1327例腹泻患者的粪便标本同时进行诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、扎如病毒和肠道腺病毒核酸检测。结果 1327份粪便样本中,179份样本检出至少1种病毒核酸,核酸阳性检出率为13.49%。诺如病毒、轮状病毒、扎如病毒、星状病毒以及肠道腺病毒的检出率分别为8.29%、2.79%、1.36%、1.21%和0.53%。各年龄组均有病毒检出,其中年龄最小的为2岁,最大为87岁,分别感染轮状病毒和诺如病毒。不同年龄组的病毒性腹泻感染没有差异。10月份开始是病毒性腹泻的高发期,各病毒的检出率均有明显升高。不同区域间腹泻病毒的感染没有差异。结论诺如病毒和轮状病毒是浦东地区病毒性腹泻的主要病原。应该加强对病毒性腹泻的监测,尤其是诺如病毒和轮状病毒。

上海市浦东新区2012-2013年病毒性腹泻检测情况分析

目的了解上海市浦东新区2012-2013年间常见病毒性腹泻的病原学特征,为腹泻病的防控提供依据。方法收集2012-2013年上海市浦东新区14家监测医院腹泻患者的粪便标本,采用实时荧光定量-聚合酶链式反应(real-time PCR)检测轮状病毒、诺如病毒GI型、诺如病毒GII型、星状病毒、扎如病毒和肠腺病毒。结果共检测粪便样本4 214份。1 255份样本检出至少1种病毒核酸,核酸阳性检出率为29.78%。轮状病毒、诺如病毒GI型、诺如病毒GII型、扎如病毒、星状病毒以及肠腺病毒的检出率分别为7.6%、1.4%、18.6%、1.6%、1.5%和1.1%。各年龄组均有病毒检出,其中年龄最小的为1岁,最大为92岁,分别为感染轮状病毒和诺如病毒。病毒性腹泻感染不存在男女差异,但不同年龄组的病毒性腹泻感染有差异。不同病毒病原的感染存在不同的高峰期,但主要集中在秋冬季。结论诺如病毒和轮状病毒是浦东地区病毒性腹泻的主要病原。应该加强对病毒性腹泻的监测,尤其是诺如病毒和轮状病毒。

一起病毒性腹泻聚集性事件的调查分析

目的确定1起引起学校聚集性腹泻事件的病原。方法采集接报当日12例腹泻病例的肛拭标本,采用实时荧光定量方法检测诺如病毒、扎如病毒、轮状病毒、星状病毒以及肠道腺病毒,确定病原。对继发病例、生活老师及工作人员的肛拭标本进行确认检测。结果在当日的12份标本中,有2份检出诺如病毒阳性,在继发的38例患者肛拭标本中,又有12例为诺如病毒阳性。结论本次聚集性腹泻事件是由诺如病毒引起的。

2012-2013年上海市浦东新区成人病毒性腹泻感染情况调查

目的了解上海市浦东新区2012—2013年间成人病毒性腹泻感染情况。方法通过实时荧光PCR方法检测该区14家监测医院成人腹泻患者粪便标本中的轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、扎如病毒和肠腺病毒。结果共检测腹泻患者粪便样本3 403份。在1 060份样本中检出至少1种病毒核酸,核酸阳性检出率为31.15%。诺如病毒、轮状病毒、扎如病毒、星状病毒以及肠腺病毒的检出率分别为21.28%、7.70%、1.85%、1.55%和0.59%。患者的性别分布不存在差异,性别比为0.95∶1。诺如病毒在各年龄组均有检出。不同病毒病原的感染存在不同的高峰期,但主要集中在秋冬季。结论诺如病毒是浦东地区成人病毒性腹泻的主要病原。应该加强对病毒性腹泻的监测,预防由诺如病毒引起的腹泻暴发。

分型引物RT-PCR法在杯状病毒分子流行病学研究中的应用

目的:应用分型引物RT-PCR法确定五个地区病毒性腹泻粪便标本中杯状病毒流行型别及感染情况。方法:对五个地区收集的<5岁病毒性腹泻粪便标本应用针对病毒壳体区域设计的四对引物(GI-SKF/GI-SKR、COG2F/G2-SKR、SLV5317/SLV5749、PreCAP1/82b)进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增诺如病毒GI和GII组、扎如、星状病毒(Astrovirus),扩增产物通过1·5%琼脂糖凝胶电泳鉴定。选取部分阳性标本测序研究型别流行特点。结果:本实验从663例标本中共检出单独感染诺如病毒、扎如病毒和星状病毒阳性标本数分别为84、4、11株,同时还发现3株混合感染标本。选取24株诺如病毒阳性标本测序分析发现19株为GII/4型,2株为GII/3型,1株为GII/1型,1株为GII/13型,1株为GII/15型,4株扎如病毒中2株为SGI/1型,1株为SGII/3型,1株为SGII/1型。结论:研究表明杯状病毒是我国婴幼儿腹泻重要病原体,诺如病毒流行株为GII/4型毒株,同时存在其它型别的散在流行;福建、兰州检测到不同型别扎如病毒证明我国存在多种型别的扎如病毒感染。

新冠肺炎疫情常态化下房山区腹泻病例肠道病原体感染情况分析

目的了解新冠肺炎疫情常态化防控背景下,北京市房山区腹泻病例肠道病原体的感染情况,为肠道传染病的防治工作提供依据。方法2021年1月1日至2021年12月31日,收集北京市房山区某2家二级医院未使用抗生素治疗的腹泻病例的粪便标本,进行志贺菌、沙门菌、副溶血性弧菌、大肠埃希菌、弯曲菌、轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、扎如病毒和腺病毒的分离培养鉴定。结果392例腹泻病例,男性219例,女性173例,以青年为主。至少一项病原体阳性的腹泻病例84例,检出肠道病原菌89株,检出率为22.70%,弯曲菌35株,诺如病毒18株,致泻性大肠埃希菌14株,沙门菌10株,副溶血性弧菌4株,轮状病毒4株,扎如病毒2株,肠道腺病毒2株。病原体检出高峰为4~10月。其可疑暴露食品主要为熟食冷荤31例,水果蔬菜9例和凉拌菜8例;食用方式主要为直接食用43例;食用地点主要为居家53例。结论2021年新冠肺炎疫情常态化防控背景下,北京市房山区腹泻病例病原体检出率有所下降,种类多样,以弯曲菌为主,应继续监测并开展多形式的宣传教育,以提升当地居民的食品安全意识。