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p62^(dok)蛋白氨基酸和cDNA序列测定和分析 被引量:2
1
作者 汪长华 董峰 +2 位作者 董传仁 郑汉巧 杨海鹭 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期407-410,共4页
目的 :分析p6 2 dok氨基酸和cDNA序列 ,探讨p6 2 dok酪氨酸磷酸化及其与p2 1ras鸟苷三磷酸酶激活蛋白(p2 1rasGAP)的关系。方法 :从过渡表达人类胰岛素受体的中国仓鼠卵巢细胞 (CHO/IR细胞 )中提取、纯化p6 2 dok,进行微肽序列分析 ,设... 目的 :分析p6 2 dok氨基酸和cDNA序列 ,探讨p6 2 dok酪氨酸磷酸化及其与p2 1ras鸟苷三磷酸酶激活蛋白(p2 1rasGAP)的关系。方法 :从过渡表达人类胰岛素受体的中国仓鼠卵巢细胞 (CHO/IR细胞 )中提取、纯化p6 2 dok,进行微肽序列分析 ,设计相应引物PCR、克隆cDNA并测序。利用免疫沉淀和蛋白免疫印迹检测p6 2 dok是否存在酪氨酸磷酸化及与p2 1rasGAP的关系。结果 :p6 2 dokcDNA由 186 3bp组成 ,编码 481个氨基酸 ,含 15个酪氨酸残基 ,富PXXP基序 ,并有一个pleckstrin同源区。当p6 2 dok酪氨酸磷酸化后 ,可与p2 1rasGAP相结合。结论 :p6 2 dok可能是一种新的信息分子 ,并通过p2 1rasGAP参与胰岛素信号转导系统中RAS/MAPK径路的调节。 展开更多
关键词 脱氧核糖核酸类 氨基酸类 序列排列 CTP磷酸水解酶 信号传递 胰岛素抵抗 CDNA p62^dok蛋白
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幽门螺杆菌HSPB基因的克隆与序列分析 被引量:1
2
作者 尹焱 张建中 孙兆军 《世界华人消化杂志》 CAS 2001年第3期348-350,共3页
幽门螺杆菌(Hp)的研究已普遍受到关注[1-10].毒力因子中,目前研究的一个热点是热休克蛋白(heat shock protein,HSP).已知所有的Hp菌株都产生HSP,它作为分子伴侣对于Hp的生存及其致病具有重要作用[11-13].HSP位于细菌表面,具有较强的免... 幽门螺杆菌(Hp)的研究已普遍受到关注[1-10].毒力因子中,目前研究的一个热点是热休克蛋白(heat shock protein,HSP).已知所有的Hp菌株都产生HSP,它作为分子伴侣对于Hp的生存及其致病具有重要作用[11-13].HSP位于细菌表面,具有较强的免疫原性,抗HSP免疫反应可使机体产生保护性免疫[14],因而存在着发展为疫苗成分的可能性.目前在我国对于Hp的HSP研究较少.因此,克隆中国菌株的HSPB基因,阐明其基因结构特征,对于研究它的生物学功能及探索其基因产物作为疫苗成分的价值有重要意义. 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 遗传载体 热休克蛋白质类 基因表达 序列排列
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求最短子排列序及长度的一个图论方法
3
作者 刘伦华 《贵州大学学报(自然科学版)》 1990年第3期158-160,共3页
本文推广了DeBruijn图,用图论方法讨论了最短子排列序列,其结果可应用于编码、通迅、计算机存储等领域。
关键词 排列序列 欧拉图 长度
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陕西株庚型肝炎病毒(GBV-C/HGV)RNA NS_3区cDNA(4248nt~4465nt)的扩增、克隆和序列分析
4
作者 李如琳 徐德忠 +1 位作者 闫永平 张景霞 《第四军医大学学报》 2000年第6期685-688,共4页
目的 了解陕西株庚型肝炎病毒 (HGV,RNA/ GBV-C)的核苷酸序列特点 .方法 从陕西省西安市两位非甲、乙、丙、丁、戊型肝炎患者的血清中 ,应用反转录及套式 PCR技术 ,从血清中提取 RNA,经特异性的反转录引物 P4反转录成c DNA,以此为模... 目的 了解陕西株庚型肝炎病毒 (HGV,RNA/ GBV-C)的核苷酸序列特点 .方法 从陕西省西安市两位非甲、乙、丙、丁、戊型肝炎患者的血清中 ,应用反转录及套式 PCR技术 ,从血清中提取 RNA,经特异性的反转录引物 P4反转录成c DNA,以此为模板分别用 P3,P4及 P1 ,P2 两对引物进行PCR扩增 ,扩增到 2 18bp的 HGV RNA NS3区部分基因 ,将其克隆入 Pin Point TMXal- T载体 ,挑选阳性克隆并进行了序列分析 .结果  SG2 与 HGV的核苷酸同源性分别为 85 .6 4%与84.48% ;与 GBV- C的核苷酸同源性为 86 .2 1%与 84.48% ,其二者之间同源性为 97.13% ;二者与 HGV的氨基酸同源性分别为 98.2 8%和 93.10 % ,与 GBV- C的氨基酸同源性也为98.2 8% ,93.10 % ,二者之间的氨基酸同源性达 94.83% .结论 庚型肝炎病毒 NS3区核苷酸同源性较高 ,同义突变率也较高 ,可能是一个对其生存环境较为适应的病毒 . 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 聚合酶键反应 克隆 序列排列
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果蝇DNA和基因间序列的两个信息参数沿染色体分布
5
作者 解廷月 《山西大同大学学报(自然科学版)》 2007年第6期18-21,共4页
以果蝇染色体的全序列和基因间序列作为研究对象.分别用描述序列构成的两个信息参数X和F分析两类序列沿着染色体分布特征,并着重讨论染色体着丝粒及其周围区域的分布规律,用线性拟合和多项式拟合分析染色体各类序列沿染色体的统计分布特... 以果蝇染色体的全序列和基因间序列作为研究对象.分别用描述序列构成的两个信息参数X和F分析两类序列沿着染色体分布特征,并着重讨论染色体着丝粒及其周围区域的分布规律,用线性拟合和多项式拟合分析染色体各类序列沿染色体的统计分布特征(学生t检验),分析各个参数的平均值在染色体不同区域的分布. 展开更多
关键词 果蝇染色体 信息参数 序列沿染色体排列
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线虫DNA序列沿染色体进化的非均匀性
6
作者 杜德成 解廷月 李宏 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期516-523,共8页
选择了四个信息参量来刻画核酸序列的进化水平,研究线虫染色体全序列、基因序列和基因间序列的进化水平沿染色体的非均匀分布规律.结果显示各类序列的进化水平沿常染色体呈现明显的非均匀性和规律性.进化水平高的序列分布在染色体的两端... 选择了四个信息参量来刻画核酸序列的进化水平,研究线虫染色体全序列、基因序列和基因间序列的进化水平沿染色体的非均匀分布规律.结果显示各类序列的进化水平沿常染色体呈现明显的非均匀性和规律性.进化水平高的序列分布在染色体的两端,是进化活跃区,进化水平低的序列,分布在染色体的中部,是进化保守区;基因序列和基因间序列是协同进化的,在染色体上具有相同的分布规律;Ⅳ号染色体显示出了染色体形成的拼接模式,由此推断常染色体的形成与进化过程是先以一个进化保守序列为核序列,在其两端拼接其它的序列,通过序列间的协调和融合使之逐渐走向成熟;整个X染色体具有稳定的进化水平,进化模式与常染色体不同. 展开更多
关键词 线虫 染色体 信息参量 序列沿染色体排列 进化非均匀性
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CK7、CK14、CK19和CK20在胃肠癌转移诊断中价值的新发掘 被引量:7
7
作者 于观贞 陈颖 +2 位作者 顾小强 倪灿荣 王杰军 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1015-1019,共5页
目的:重新评估CK7、CK14、CK19和CK20在胃肠癌淋巴结微转移中的诊断价值和意义。方法:采用组织芯片和免疫组化方法检测CK7、CK14、CK19和CK20在正常黏膜(n=112)、原发癌(n=112)、淋巴结转移癌(n=106)和肝脏转移癌(n=37)中的表达,比较... 目的:重新评估CK7、CK14、CK19和CK20在胃肠癌淋巴结微转移中的诊断价值和意义。方法:采用组织芯片和免疫组化方法检测CK7、CK14、CK19和CK20在正常黏膜(n=112)、原发癌(n=112)、淋巴结转移癌(n=106)和肝脏转移癌(n=37)中的表达,比较它们在转移灶与原发灶间表达差异以及与临床病理参数之间的关系。结果:CK19在各种组织中的表达均为100%,原发癌和转移癌间呈一致性表达;而CK20和CK7的表达随肿瘤的发生和进展逐步下降,淋巴结转移灶中的表达水平显著低于原发癌中的表达水平(P<0.05),CK20和CK7的下降表达与肿瘤的浸润深度有关(P<0.05);CK7的下降表达与肿瘤的远处转移有关(P<0.01),胃癌中CK7的表达率高于肠癌中的表达(P=0.003),CK20正好相反(P<0.001)。CK14在各种组织中的表达率较低,在胃肠癌的诊断中的价值不大。结论:CK19是检测胃肠癌转移的一个理想指标,而CK20和CK7在检测微转移中价值有待评估,其表达下调可能在胃肠癌发展至转移中起重要作用。 展开更多
关键词 胃肿瘤 肠肿瘤 肿瘤转移 寡核苷类排列序列分析
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凋亡相关基因在喉鳞癌中的表达概况 被引量:6
8
作者 韩瑞珠 李晓丹 +2 位作者 王鑫 徐秀玉 周梁 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期331-334,共4页
目的了解凋亡相关基因在喉鳞状细胞癌中的表达概况,探寻其在喉鳞癌及正常喉组织中的表达差异及意义。方法提取喉鳞癌及癌旁正常喉组织的总RNA,采用Ampolablaleing-LRP方法,分别将上述提取的RNA合成生物素标记的cDNA探针。将合成的探针... 目的了解凋亡相关基因在喉鳞状细胞癌中的表达概况,探寻其在喉鳞癌及正常喉组织中的表达差异及意义。方法提取喉鳞癌及癌旁正常喉组织的总RNA,采用Ampolablaleing-LRP方法,分别将上述提取的RNA合成生物素标记的cDNA探针。将合成的探针与细胞凋亡GEArrayQ芯片膜(96个凋亡相关基因)进行杂交。采用化学发光方法.并用X感光片记录喉鳞癌标本和对照标本的基因信号表达强弱。将X光片感光点转化成TIFF图形文件,使用ScanAlyze和GEArrayAnalyzer软件进行资料分析。结果利用基因芯片杂交筛选的方法,在所分析的与凋亡相关的96个基因中,survivin、bcl-2、TNF-β/Lta、TNF-α等23个基因在喉鳞癌组织中表达上调;bak、bax、bik、p53等22个基因表达下调。结论通过细胞凋亡GEArrayQ芯片膜杂交筛查的方法发现,在喉鳞癌中抑制凋亡的基因表达上调,促进凋亡的基因表达下调,这些基因改变组成了喉鳞癌特异的与凋亡相关的基因表达谱,为全面系统地研究喉鳞癌中与凋亡相关基因表达情况,及探讨喉鳞癌的发病机制提供了有益的线索。 展开更多
关键词 喉肿瘤 鳞状细胞 基因表达 细胞凋亡 寡核苷类排列序列分析
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针刺对大鼠脑组织神经生物学基因表达的研究 被引量:10
9
作者 陈泽斌 王华 《中国针灸》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期573-576,共4页
目的采用基因芯片技术,分析探讨针刺预处理抗脑缺血再灌注损伤作用的分子机制。方法取雄性Wistar大鼠6只,3只为正常对照组,另3只为针刺预处理组。针刺组先行“肾俞”“百会”针刺预处理,出针后0.5h断头取脑。基因芯片技术进行基因表达... 目的采用基因芯片技术,分析探讨针刺预处理抗脑缺血再灌注损伤作用的分子机制。方法取雄性Wistar大鼠6只,3只为正常对照组,另3只为针刺预处理组。针刺组先行“肾俞”“百会”针刺预处理,出针后0.5h断头取脑。基因芯片技术进行基因表达差异分析。结果针刺预处理后0.5h,大鼠脑组织表达变化大于2倍的基因共265个,20个基因表达差异具有显著性意义(P<0.05)。其中8个基因表达上调,12个基因表达下调;涉及神经元信号传递类(离子通道、递质、受体、第二信使)基因11个,涉及转录调控类基因5个,涉及代谢酶类基因2个,涉及热休克反应类基因1个,涉及细胞骨架类基因1个。结论一些针刺诱导的基因表达产物在针刺预处理抗脑缺血再灌注损伤过程中发挥了重要作用;针刺预处理后神经细胞功能状态的改变可能是其随后发挥抗脑缺血再灌注损伤作用的重要基础。 展开更多
关键词 基因表达 寡核苷类排列序列分析 再灌注损伤/针灸疗法 再灌注损伤/代谢 针刺疗法/方法
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恶性肿瘤转移相关基因改变的起源 被引量:3
10
作者 林国领 叶青海 汤钊猷 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期78-80,共3页
经典的肿瘤转移理论认为,转移是肿瘤细胞克隆选择的结果,在肿瘤内部仅有少数肿瘤细胞具有转移潜能,且转移发生在肿瘤进展的晚期。然而随着基因芯片技术的应用,通过对不同转移潜能的乳腺癌细胞亚群进行基因表达谱分析发现,不同转移潜能... 经典的肿瘤转移理论认为,转移是肿瘤细胞克隆选择的结果,在肿瘤内部仅有少数肿瘤细胞具有转移潜能,且转移发生在肿瘤进展的晚期。然而随着基因芯片技术的应用,通过对不同转移潜能的乳腺癌细胞亚群进行基因表达谱分析发现,不同转移潜能的细胞亚群表达出不同临床预后的基因表达标志。高转移潜能乳腺癌细胞亚群的“差预后(poor prognosis sig-nature)”基因表达标志可预测乳腺癌患者的高转移潜能和低生存率;而“好预后(good prognosis signature)”的基因表达标志则预测相反的结果。肿瘤细胞的这种转移潜能在肿瘤形成的早期已经存在,且原发肿瘤中的大部分细胞均具有相应的转移能力。在乳腺癌患者,通过对临床标本的研究表明好预后和差预后的基因表达标志能较准确地预测预后。在不同类型肿瘤的原发病灶和转移瘤之间的基因表达谱基本相同,而伴有和不伴有转移的相同类型原发瘤之间的基因表达谱有明显差异,这也说明肿瘤转移相关基因改变发生在肿瘤形成的早期。当然,和所有新理论的出现一样,这一理论尚需通过相关的实验进一步验证。 展开更多
关键词 肿瘤转移 基因转变 寡核苷类排列序列分析
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cDNA芯片检测STAT5诱骗核苷酸对K562细胞凋亡相关基因的影响 被引量:1
11
作者 曾建明 冯文莉 +3 位作者 王小中 史梅 涂植光 黄宗干 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期738-742,共5页
目的:转录因子STAT5在慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)中组成性激活,并与CML细胞恶性表型密切相关,本研究用cDNA芯片检测方法探讨诱骗核苷酸(decoy ODNs)抑制STAT5对白血病K562细胞株凋亡相关基因的影响。方法:分别提... 目的:转录因子STAT5在慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)中组成性激活,并与CML细胞恶性表型密切相关,本研究用cDNA芯片检测方法探讨诱骗核苷酸(decoy ODNs)抑制STAT5对白血病K562细胞株凋亡相关基因的影响。方法:分别提取decoy ODNs处理前后的K562细胞总RNA,逆转录合成Cy3、Cy5标记的cDNA探针,与人14K基因表达谱cDNA芯片(V2.0)杂交,扫描获得数据后,用Genespring软件分析对照组和实验组的差异表达基因,半定量RT- PCR验证cDNA芯片结果。结果:2张cDNA芯片检测重复性良好(R=0.9799)。在13824个标记的基因中,检出413个上调基因,其中包括:TIAF1、GAB1、GYPA、DAPK3、TNFRSF1B、IRF1和PML等在内的18个凋亡相关基因;在检出的332个下调基因中,发现PIM1、CCND2、CCND1、MYC和BCL2L1等在内的11个凋亡相关基因;部分基因经半定量RT-PCR证实与cDNA芯片结果一致。结论:Decoy ODNs抑制STAT5信号通路后可引起K562细胞多种凋亡相关基因的变化,本实验为进一步研究STAT5信号通路所调控的凋亡相关基因提供了依据。 展开更多
关键词 白血病 髓样 慢性 信号转导和转录活化因子 诱骗脱氧寡核苷酸 细胞凋亡 寡核苷类排列序列分析 K562细胞
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新基因pp3774抑制NIH/3T3细胞生长机制初探 被引量:1
12
作者 张锋锐 李锦军 +3 位作者 王春艳 朱丽 徐文 顾健人 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期550-554,共5页
目的探讨新基因pp3774在NIH/3T3细胞生长调节中的可能机制。方法用pp3774-HA融合表达质粒通过脂质体法转染NIH/3T3细胞,G418筛选,建立稳定细胞系,并用RT-PCR检测pp3774在NIH/3T3细胞中mRNA的表达状况;利用Atlas cDNA array分析pp377... 目的探讨新基因pp3774在NIH/3T3细胞生长调节中的可能机制。方法用pp3774-HA融合表达质粒通过脂质体法转染NIH/3T3细胞,G418筛选,建立稳定细胞系,并用RT-PCR检测pp3774在NIH/3T3细胞中mRNA的表达状况;利用Atlas cDNA array分析pp3774的异位表达对NIH/3T3细胞基因表达谱的影响;用RT-PCR方法验证Atlas cDNA array杂交结果。结果 pp3774超表达可以明显下调cyclin D1、cyclin E、转录因子Dpl等基因的表达,同时可上调P13K p85α、FGF7、MMP-2等基因的表达。上述基因表达的改变可能通过调控细胞周期实现pp3774对NIH/3T3细胞的生长抑制。结论新基因pp3774抑制NIH/3T3细胞生长可能与pp3774基因下调cyclin D1、cyclin E、转录因子Dpl的表达有关。 展开更多
关键词 基因 pp3774 基因表达调控 肿瘤 寡核苷酸排列序列分析 逆转录酶聚合酶链反应 NIH/3T3细胞
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乙型肝炎病毒X蛋白羧基端30个氨基酸缺失突变体转染Huh7细胞的基因表达谱和蛋白质组差异分析
13
作者 刘晓红 王力 +2 位作者 赵海华 陈颖 朱明华 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期893-899,共7页
目的:本课题组既往研究显示乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)羧基端30个氨基酸的缺失突变雄(△HBx)具有明显不同于野生型HBx(wtHBx)的细胞生物学效应,因此,本研究进一步探讨△HBx和wtHBx导致Huh7细胞差异生物学效应的分子基础。方法:采用cDNA芯... 目的:本课题组既往研究显示乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)羧基端30个氨基酸的缺失突变雄(△HBx)具有明显不同于野生型HBx(wtHBx)的细胞生物学效应,因此,本研究进一步探讨△HBx和wtHBx导致Huh7细胞差异生物学效应的分子基础。方法:采用cDNA芯片和双向凝胶电泳方法,从基因和蛋白质组水平,对分别转染了△HBx和wtHBx的Huh7细胞进行检测。结果:cDNA芯片检测结果显示,对比wtHBx组,△HBx组存在193个基因(0.95%)的显著性改变,154和39个基因分别显示表达上调和下调。双向凝胶电泳结果显示,对比wtHBx组,△HBx组存在147个蛋白差异点。基因表达谱和质谱分析结果显示,△HBx组差异表达的基因和蛋白主要涉及宿主细胞的基因转录、细胞连接、信号转导和代谢、免疫应答等过程及癌基因和抑癌基因。结论:HBx缺失突变体对细胞基因和蛋白质的影响是广泛的,涉及肝组织特异性的代谢基因的变化。这些差异表达的基因和蛋白质在HBx突变致癌过程中是否发挥了重要的作用,需要进一步的研究证实。 展开更多
关键词 肝肿瘤 肝炎病毒 乙型 寡核苷类排列序列分析 电泳 凝胶 双向 HUH7细胞
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人卵巢癌顺铂耐药细胞中核糖体蛋白基因的表达谱分析
14
作者 曹漫明 张积仁 +2 位作者 周媛 孙海 李工 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期555-558,共4页
目的研究核糖体蛋白基因在人卵巢癌顺铂耐药细胞中的表达。方法以顺铂为诱导剂,采用中等剂量、间歇作用法建立人卵巢癌顺铂耐药细胞系COC_1/DDP,然后以其亲本细胞COC_1为对照,应用cDNA微阵列检测COC_1/DDP细胞的核糖体蛋白基因表达。... 目的研究核糖体蛋白基因在人卵巢癌顺铂耐药细胞中的表达。方法以顺铂为诱导剂,采用中等剂量、间歇作用法建立人卵巢癌顺铂耐药细胞系COC_1/DDP,然后以其亲本细胞COC_1为对照,应用cDNA微阵列检测COC_1/DDP细胞的核糖体蛋白基因表达。结果与COC_1细胞相比,COC_1/DDP细胞对顺铂有6.2倍耐药性,细胞倍增时间延长了8.9h,S期细胞减少了(27.4±2.13)%,而G_1和G_2期细胞分别增加了(19.6±3.71)%和(8.3±1.95)%。在143个表达水平发生改变的基因中,有12个核糖体蛋白基因表达下调,多个凋亡抑制基因表达上调,凋亡诱导基因CASP2表达下调。结论 COC_1/DDP细胞对顺铂具有耐药性,耐药性的产生可能与部分核糖体蛋白基因的表达下调有关。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 顺铂抗药性 核糖体蛋白质类 寡核苷酸类排列序列分析 基因表达 肿瘤细胞 培养的
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WT1基因异构体WTA对NB4细胞基因表达谱影响的研究
15
作者 沈慧玲 陈子兴 +3 位作者 王玮 岑建农 胡绍燕 赵晔 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期512-518,共7页
目的:探讨WT1基因异构体比例的改变对急性早幼粒细胞性白血病细胞株NB4基因表达谱的影响。方法:用电穿孔法将携带WT1基因异构体WTA(-17AA/-KTS)全长cDNA的重组真核表达载体及其对照质粒pCB6+转染入白血病细胞株NB4,建立WT1基因异构体表... 目的:探讨WT1基因异构体比例的改变对急性早幼粒细胞性白血病细胞株NB4基因表达谱的影响。方法:用电穿孔法将携带WT1基因异构体WTA(-17AA/-KTS)全长cDNA的重组真核表达载体及其对照质粒pCB6+转染入白血病细胞株NB4,建立WT1基因异构体表达比例改变的单克隆细胞株NB4/WTA。运用cDNA微阵列技术检测WT1基因异构体表达比例的转变对NB4细胞基因表达谱的影响。并用RTPCR方法验证cyclinA1及CDK7基因表达的改变。结果:转染WT1基因异构体WTA后,外源基因在mRNA及蛋白水平上稳定表达,NB4细胞中共89个细胞周期相关基因、细胞凋亡相关基因、癌基因以及细胞信号和传递蛋白等基因出现2倍以上表达水平的改变。RTPCR证实与细胞周期相关的cyclinA1基因表达上调,CDK7基因表达下调。结论:WT1基因异构体WTA表达比例增加能引起NB4细胞基因表达谱的改变,这些基因的改变可能对白血病细胞增殖、分化和凋亡等生物学行为产生影响。 展开更多
关键词 白血病 早幼粒细胞 急性 基因 肾母细胞瘤 蛋白质异构体 寡核苷类排列序列分析 NB4 细胞
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基因芯片在中医药研究中的应用
16
作者 李劲平 王培训 《中医杂志》 CSCD 北大核心 2001年第12期750-751,共2页
1995年,斯坦福大学的Schena M和Brown PO等在Science 杂志上发表第一篇基因表达谱芯片以来,在世界上兴起了一股基因芯片的大浪潮,基因芯片技术的开发和利用为AIDS病研究、癌症研究、疾病诊断、基因治疗、中西新药开发、新食品开发以及... 1995年,斯坦福大学的Schena M和Brown PO等在Science 杂志上发表第一篇基因表达谱芯片以来,在世界上兴起了一股基因芯片的大浪潮,基因芯片技术的开发和利用为AIDS病研究、癌症研究、疾病诊断、基因治疗、中西新药开发、新食品开发以及生命科学研究提供了一种全新的手段.世界上许多科学家纷纷对基因芯片的出现进行评价,并对基因芯片的应用前景作了一些大胆的预测.1999年Nature Genetics杂志出版增刊,邀请专家学者对基因芯片的发展方向进行探讨.本文就基因芯片在中医药研究中的应用作一介绍,希望能为中医药现代化提供一点有益的思考. 1 基因芯片简介 基因芯片(Gene chip)又叫DNA微阵列技术(DNA microarray),也称为DNA芯片.是20世纪90年代兴起的一项前沿生物技术,它横跨生命信息、生物物理、生命科学、化学、电子技术、计算机科学、统计学等众多学科.基因芯片是从传统的Southern杂交和Northern杂交基础上发展起来的,指在尼龙膜、玻璃、硅片或瓷片上的一微小区域内(1cm2),将成千上万条DNA探针按一定的规律排列,然后与标记了的待检样品进行杂交(hybriding),通过芯片扫描仪对芯片进行扫描,检测每一点杂交信号的有无及强弱,由相应统计软件进行统计分析,就可以检测出待检样品基因表达的种类和基因的表达量. 展开更多
关键词 基因表达分型法 寡核苷类排列序列分析 基因芯片 中医药研究 应用 中医 中药
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宫颈癌细胞中HMAT1基因的功能预测及其干扰小RNA的筛选 被引量:1
17
作者 欧璇 赵旻 +3 位作者 左泽华 李辉 魏芸 伍欣星 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期113-117,共5页
目的 预测宫颈癌细胞中人类与鼠同源乳腺转化基因(HMATI)的功能及筛选出能有效沉默该基因的干扰小RNA。方法 采用细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片对原发性宫颈癌标本进行筛选,通过生物信息学分析HMAT1 基因,针对HMAT1基因设计了三条... 目的 预测宫颈癌细胞中人类与鼠同源乳腺转化基因(HMATI)的功能及筛选出能有效沉默该基因的干扰小RNA。方法 采用细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片对原发性宫颈癌标本进行筛选,通过生物信息学分析HMAT1 基因,针对HMAT1基因设计了三条特异性干扰小RNA,分别与pRNAU6.1 Hygro重组后,与含有该基因的重组体瞬时共转染B16F0细胞,用逆转录聚合酶链反应(RT PCR)技术检测对HMAT1基因的干扰效果。结果 细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片筛选出表达量明显上调的基因共四条。对其中上调明显的HMAT1基因,通过生物信息学预测其为一个调节细胞生长的看家基因,其编码的蛋白质为一个Ⅰ型跨膜蛋白,且其酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点可能与HMAT1 蛋白功能活化有关。半定量检测结果表明其中第一条特异性干扰小RNA有显著性抑制效果(P<0.05)。结论 初步预测HMAT1 基因很可能是与宫颈癌相关的癌基因,其编码的蛋白质可能参与细胞的信号转导,设计出针对该基因的干扰小RNA可以有效沉默HMAT1基因。 展开更多
关键词 宫颈肿瘤 寡核苷类排列序列分析 HMATI基因 RNA干扰
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大鼠乳腺肿瘤线粒体基因突变研究 被引量:4
18
作者 王平忠 蒙世杰 +1 位作者 刘佩 姚养正 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期297-301,共5页
目的 :了解大鼠乳腺癌组织、癌旁组织和正常组织的线粒体细胞色素b基因变异 ,探讨线粒体基因突变与肿瘤发生的关系。方法 :提取细胞总DNA ,用PCR法扩增细胞色素b基因 ,产物用DNA自动测序法进行序列分析。结果 :癌组织发生了nt14931C→G ... 目的 :了解大鼠乳腺癌组织、癌旁组织和正常组织的线粒体细胞色素b基因变异 ,探讨线粒体基因突变与肿瘤发生的关系。方法 :提取细胞总DNA ,用PCR法扩增细胞色素b基因 ,产物用DNA自动测序法进行序列分析。结果 :癌组织发生了nt14931C→G ,nt 15 0 0 4C→G和nt15 435T→C 3处点突变。癌旁组织发生了nt15 436A→C突变。正常组织没有突变。结论 :mtDNA突变可能是诱导核基因突变的内源性因素之一 ,对肿瘤的发生可能有促进作用。癌旁组织在DNA水平属非正常组织。 展开更多
关键词 大鼠 乳腺肿瘤 DNA 线粒体 细胞色素B 基因突变 序列排列
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日本确定15万个SNP的位置
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作者 张可喜 《中国高校技术市场》 2001年第11期37-37,共1页
关键词 日本 SNP 单核苷酸多态性 碱基对 排列序列
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Screening of plane S waves by an array of rigid piles in poroelastic soil 被引量:10
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作者 Yuan-qiang CAI Guang-ya DING Chang-jie XU 《Journal of Zhejiang University-Science A(Applied Physics & Engineering)》 SCIE EI CAS CSCD 2008年第5期589-599,共11页
An array of rigid piles used as a screening barrier for plane shear (S) waves is investigated in a homogeneous unbounded space. The dynamic poroelastic theory of Biot is employed, under the assumption of an incompress... An array of rigid piles used as a screening barrier for plane shear (S) waves is investigated in a homogeneous unbounded space. The dynamic poroelastic theory of Biot is employed, under the assumption of an incompressible solid grain. Using Fourier-Bessel series, the problem of multiple scattering is solved by imposing continuity conditions and equilibrium conditions at the soil-pile interfaces with the translational addition theorem. A parametric analysis is conducted to investigate the influence of the permeability of poroelastic soil, separation between piles, number of piles and frequency of incident waves on screening effectiveness of the barrier, and the results are compared with those in an elastic soil medium. Computed results show that the intrinsic permeability of the soil medium displays an apparent effect on the screening of plane S waves. 展开更多
关键词 Array of rigid piles Poroelastic soil Theory of Biot Scattering Screening effectiveness
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