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普通小麦5DL染色体分选及染色体BIBAC文库构建技术体系优化 被引量:3
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作者 佘茂云 郭东伟 +4 位作者 李连城 徐兆师 陈明 曲延英 马有志 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期354-361,共8页
【目的】优化小麦染色体流式分选及特定染色体BAC文库构建技术体系,为加速小麦基因组学研究提供技术支撑。【方法】采用双阻断法对中国春5DL端体根尖分生组织进行细胞周期同步化处理,结合机械匀浆法制备染色体悬浮液进行流式核型分析,... 【目的】优化小麦染色体流式分选及特定染色体BAC文库构建技术体系,为加速小麦基因组学研究提供技术支撑。【方法】采用双阻断法对中国春5DL端体根尖分生组织进行细胞周期同步化处理,结合机械匀浆法制备染色体悬浮液进行流式核型分析,分选染色体5DL及PCR检测,对小麦染色体分选技术体系进行优化。对复合峰分选产物BamHI酶切制备高分子量(high molecular weight,HMW)DNA,按10﹕1质量比与双元细菌人工染色体(binary-bacterial artificial chromosome,BIBAC)连接,电激转化感受态细胞DH10B,随机挑取100个重组子,经NotI完全酶切后脉冲电泳检测插入片段大小,优化小麦染色体BAC文库构建的技术体系。【结果】经1.25mmol·L-1羟基脲(hydroxyurea,HU)18h,恢复6h和1μmol·L-1氟乐灵(trifluralin)2.5h的顺序处理的小麦根尖分生组织,细胞有丝分裂指数可超过60%。流式核型分析表明,5DL端体的流式核型图由清晰的三个复合峰和两个单峰组成。PCR鉴定表明,其中一单峰确由5DL染色体组成。部分酶切复合峰染色体3~10min,可以获得50~300kb的HMWDNA。连接产物检测显示平均插入片段可达100kb左右,根据荧光通道值,估算5DL端体的大小约为482Mb,构建库容为19000个克隆的5DL端体特异文库即可达到约4倍的覆盖率。【结论】上述两项优化技术适用于小麦染色体的分选及染色体特异文库的构建。 展开更多
关键词 普通小麦 端体 细胞周期同步化 流式细胞术 染色体分选
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染色体分选技术在植物学研究中的应用 被引量:3
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作者 钱旺 王秋松 +2 位作者 杨善 徐良年 邓祖湖 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期221-228,共8页
介绍了染色体分选技术的基本原理和样品处理的基本流程,对根尖分生区采用同步化处理,制备染色体悬浮液,最后通过流式细胞仪的分析与收集获得纯度高、数量多的目标染色体。综述了染色体分选技术在植物学研究中的主要应用,包括物理图谱的... 介绍了染色体分选技术的基本原理和样品处理的基本流程,对根尖分生区采用同步化处理,制备染色体悬浮液,最后通过流式细胞仪的分析与收集获得纯度高、数量多的目标染色体。综述了染色体分选技术在植物学研究中的主要应用,包括物理图谱的构建、DNA分子标记的开发、以及复杂多倍体植物的基因组测序等。通过染色体分选技术的不断完善与发展,应用于染色体分选的探针标记不断开发,以及分选后的染色体DNA纯化和扩增技术的优化,将为多倍体植物如甘蔗等基因组学研究提供更有效的帮助。 展开更多
关键词 染色体分选 流式细胞术 基因组 多倍体植物
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以小麦根尖分生组织细胞核及染色体制备高分子量DNA 被引量:3
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作者 郭东伟 佘茂云 +4 位作者 李连城 陈耀峰 陈明 徐兆师 马有志 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1920-1923,共4页
为了克服以叶片为材提取HMW DNA的局限性,优化了一套简便、实用的提取方法。该法以细胞周期同步化处理的根尖分生组织为材料,利用机械匀浆释放细胞核或中期染色体制备悬浮液,再以蔗糖密度梯度离心和流式分选技术分别分离细胞核和染色体... 为了克服以叶片为材提取HMW DNA的局限性,优化了一套简便、实用的提取方法。该法以细胞周期同步化处理的根尖分生组织为材料,利用机械匀浆释放细胞核或中期染色体制备悬浮液,再以蔗糖密度梯度离心和流式分选技术分别分离细胞核和染色体,经去蛋白、酶切、透析,获得HMW DNA。经检测,来自200条根尖(10个胶块)的HMW DNA的浓度约为4~20ng/μL,而连接、转化后的BAC克隆平均插入片段超过100kb。证明该法适用于提取HMW DNA以构建BAC文库。 展开更多
关键词 高分子量DNA 蔗糖密度梯度离心 细胞周期同步化 染色体流式分选 BAC
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植物流式细胞遗传学及其应用研究进展 被引量:2
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作者 李国庆 萧凤回 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2008年第3期396-401,共6页
流式细胞遗传学是利用流式细胞术对植物有丝分裂细胞的染色体进行分离、纯化和分选等操作的细胞遗传学分支学科,已在许多领域广泛的应用,如与DNA分子标记结合进行物理作图,利用FISH和PRINS进行细胞遗传作图,重组DNA文库的构建,标记片段... 流式细胞遗传学是利用流式细胞术对植物有丝分裂细胞的染色体进行分离、纯化和分选等操作的细胞遗传学分支学科,已在许多领域广泛的应用,如与DNA分子标记结合进行物理作图,利用FISH和PRINS进行细胞遗传作图,重组DNA文库的构建,标记片段的定向分离以及蛋白质分析。利用流式细胞技术已对数十种植物物种进行了染色体分析,应用最多的是豆类作物和禾谷类作物。流式细胞术有许多潜在的利用价值,主要包括植物染色体和染色体臂特异BAC文库的构建,低拷贝序列的目标分离,ESTs和杂交DNA序列的高产量作图以及对染色体蛋白的整体分析等。本文综述了植物流式细胞遗传学的研究方法及其在植物研究中的应用,并对其在植物基因组分析的潜在利用价值作了展望。 展开更多
关键词 细胞遗传学 流式细胞术 染色体分选 物理作图
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Characterization of Two Human Lung Adenocarcinoma Cell Lines by Reciprocal Chromosome Painting 被引量:4
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作者 彭昆靖 王金焕 +3 位作者 苏伟婷 王熙才 杨凤堂 佴文惠 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期113-121,共9页
Lung cancer is a leading cause of cancer death worldwide. Some lung cancer patients correlate with a gas of radon besides smoking. To search for common chromosomal aberrations in lung cancer cell lines established fro... Lung cancer is a leading cause of cancer death worldwide. Some lung cancer patients correlate with a gas of radon besides smoking. To search for common chromosomal aberrations in lung cancer cell lines established from patients induced by different factors, a combined approach of chromosome sorting, forward and reverse chromosome painting was used to characterize karyotypes of two lung adenocarcinoma cell lines: A549 and GLC-82 with the latter line derived from a patient who has suffered long-term exposure to environmental radon gas pollution. The chromosome painting results revealed that complex chromosomal rearrangements occurred in these two lung adenocarcinoma cell lines. Thirteen and twenty-four abnormal chromosomes were identified An A549 and GLC-82 cell lines, respectively. Almost half of abnormal chromosomes in these two cell lines were formed by non-reciprocal translocations, the others were derived from deletions and duplication/or amplification in some chromosomal regions. Furthermore, two apparently common breakpoints, HSA8q24 and 12q14 were found in these two lung cancer cell lines. 展开更多
关键词 Lung adenocarcinoma cell lines Chromosome sorting Chromosome painting Cytogenetic characterization
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