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柯萨奇病毒A组6型中国株的分子进化和时空传播分析
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作者 贾永涛 唐佳婕 +1 位作者 王惠 董长征 《宁波大学学报(理工版)》 2024年第1期84-92,共9页
柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)是手足口病的主要病原体,可引起非典型手足口病和中枢神经系统疾病,对儿童造成严重的疾病负担,尚无上市的疫苗和抗病毒药物.基于3288条CV-A6中国株VP1序列,利用Nextstrain平台的augur病原体... 柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)是手足口病的主要病原体,可引起非典型手足口病和中枢神经系统疾病,对儿童造成严重的疾病负担,尚无上市的疫苗和抗病毒药物.基于3288条CV-A6中国株VP1序列,利用Nextstrain平台的augur病原体生物信息分析包,构建了CV-A6的时间尺度分子进化树,确定了进化分支和分支突变,分析了分支突变与抗原表位之间的联系.进一步分析了CV-A6中国株各分支在中国七大地理区域的时空分布和优势分支,绘制了主要分支的时空传播路线.结果发现,CV-A6中国株主要分为B、C和D三个进化分支以及D2、D3a和D3b三个子分支,抗原表位处的突变形成了新的进化分支,促进了病毒的流行.华南和华东是CV-A6中国株的主要起源地,华南和华东相互输出、华东输出全国是中国株的主要传播模式.对CV-A6中国株的分子进化和时空传播分析,为CV-A6引起的手足口病等疫情的监测、预警和防控提供了重要支持. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 肠道病毒 分子进化 时空传播分析 生物信息学
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柯萨奇病毒A组6型与肠道病毒71型感染所致的手足口病临床特点比较 被引量:18
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作者 颜湘 刘泉波 《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2015年第3期206-209,共4页
目的探讨柯萨奇病毒A组6型(CA6)和肠道病毒71型(EV71)感染所致手足口病(HFMD)的临床特点。方法回顾性分析2013年9月至2014年8月在重庆医科大学附属儿童医院住院的HFMD患儿的临床资料,纳入病原学确诊为EV71和CA6感染的病例,分为EV7... 目的探讨柯萨奇病毒A组6型(CA6)和肠道病毒71型(EV71)感染所致手足口病(HFMD)的临床特点。方法回顾性分析2013年9月至2014年8月在重庆医科大学附属儿童医院住院的HFMD患儿的临床资料,纳入病原学确诊为EV71和CA6感染的病例,分为EV71组和CA6组,分析两组的临床特点、流行特征和预后。结果共确诊HFMD住院患儿887例,其中EV71组438例(49.4%),CA6组43例(4.8%)。1EV71组和CA6组平均年龄分别为(17.6±8.7)和(27.2±18.2)月龄,差异有统计学意义(P〈0.001)。2两组流行时间不同,CA6组以1~3月所占比例最大,EV71组主要集中于4~7月。3发热、神经系统受累症状(呕吐、惊跳及肢体抖动)在CA6组发生率明显低于EV71组(P均〈0.05),且意识障碍仅见于EV71组。4CA6和EV71组主要表现为手足疱疹、口腔疱疹和臀部皮疹,CA6组还更表现为躯干、四肢和口周皮疹。CA6组疱疹比例(23/43,53.5%)明显高于EV71组(49/438,11.2%)(P〈0.001)。5CA6组均痊愈,并完成随访;EV71组428例(97.7%)痊愈,1例(0.2%)死亡,347/437例(79.4%)完成随访。CA6组后期脱甲和脱屑的发生率均较EV71组明显增高(P均〈0.001)。CA6组均无后遗症;EV71组肢体瘫痪8/437例(1.8%),癫1/437例(0.2%)。结论EV71和CA6感染所致的HFMD好发于不同季节,与EV71感染相比,CA6感染患儿年龄偏小,皮疹广泛,形态多样,脱甲及脱屑发生率高,神经系统受累较轻,预后较好。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a组6型 肠道病毒71 脱甲 脱屑
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2011-2016年上海地区手足口病病原谱及柯萨奇病毒A组6型不同基因型感染细胞的差异研究 被引量:9
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作者 张晓玲 俞慧菊 +3 位作者 刘祎 代发辉 宋志刚 王蔚 《微生物与感染》 2018年第2期84-89,共6页
本文旨在分析2011—2016年上海地区手足口病病原谱的构成和主要病原体流行规律,为手足口病的疫情防控和重症预警提供参考。采集2011—2016年哨点医院临床诊断为手足口病的患儿标本,首先进行肠道病毒通用型核酸和分型检测,其次对2012—2... 本文旨在分析2011—2016年上海地区手足口病病原谱的构成和主要病原体流行规律,为手足口病的疫情防控和重症预警提供参考。采集2011—2016年哨点医院临床诊断为手足口病的患儿标本,首先进行肠道病毒通用型核酸和分型检测,其次对2012—2016年核酸检测为柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CA6)阳性样本进行基因型重组检测,分离重组型和非重组型CA6株,比较两者生物学特性。结果显示,2011—2012年秋季上海地区手足口病主要致病原为肠道病毒71型(enterovirus type 71,EV71)和CA16;2012年秋季起CA6成为主要病原体;2013—2014年重组型CA6(recombinant CA6,R CA6)占一定比例;2015—2016年非重组型CA6(non-recombinant CA6,NR CA6)成为优势流行株。R CA6和NR CA6代表株在RD细胞中增殖良好,在KB、MRC-5和HEp-2细胞中未见明显增殖。比较R CA6与NR CA6代表株接种于RD细胞后细胞活性下降的动态变化,未见显著差异。本研究证实,CA6为近年来上海地区手足口病的主要病原体,R CA6和NR CA6的构成比逐年变化,提示持续监测手足口病主要病原体并了解其生物学特性,对上海地区手足口病的防控预警及疫苗研发具有重要意义。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71 柯萨奇病毒a组6型
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柯萨奇病毒A组6型TaqMan一步法实时荧光定量PCR方法的建立 被引量:5
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作者 刘红波 丛山日 +4 位作者 许丹菡 黄小琴 孙浩 杨昭庆 马绍辉 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第11期1314-1317,共4页
目的建立一种灵敏、特异的一步法实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR),用于快速、准确地检测柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)。方法利用MEGA7.0软件比对GenBank数据库中15条CV-A6 VP1序列,选择高保守区域设计特异性引物和探针;以体外转录获得的... 目的建立一种灵敏、特异的一步法实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR),用于快速、准确地检测柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)。方法利用MEGA7.0软件比对GenBank数据库中15条CV-A6 VP1序列,选择高保守区域设计特异性引物和探针;以体外转录获得的RNA为标准品,绘制标准曲线,建立检测CV-A6病毒的RT-qPCR方法;对该方法的灵敏度、特异度、重复性进行评估;并利用该方法对CV-A6病毒感染后的乳鼠组织进行病毒载量的检测。结果该方法在102~1011 copy/μL模板范围内出现良好的扩增曲线,检测极限约为102 copy/μL,标准曲线中R2系数为0.999,扩增效率为109.6%;且该方法对肠道病毒71型(EV-A71)、柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)和柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)均无交叉反应;另外,该方法在组间重复试验中,变异系数(CV)值小于2.0%。结论本实验建立的方法具有较强的灵敏度、特异度和重复性,可用于CV-A6病毒的日常检测、实验室诊断和定量分析。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 TAQMAN探针 荧光定量聚合酶链反应
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2018-2019年吉安市柯萨奇病毒A组6型和10型的病原学检测和流行特征分析 被引量:1
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作者 孙爱猛 吴珺 +3 位作者 罗青 罗蕴娇 周信云 罗智娟 《实验与检验医学》 CAS 2021年第6期1636-1638,共3页
目的通过吉安市近年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)标本中通用型肠道病毒核酸(EV-RNA)阳性中的非柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)和非肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)肠道病毒标本做柯萨奇病毒A组6型(Coxsa... 目的通过吉安市近年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)标本中通用型肠道病毒核酸(EV-RNA)阳性中的非柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)和非肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)肠道病毒标本做柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CA6)和10型(Coxsackievirus A10,CA10)病原学检测,回顾性分析CA6、CA10的流行规律,探讨吉安地区手足口病例的病毒谱的变化情况,为制定、调整吉安市HFMDR防控策略提供科学依据。方法使用RT-PCR法对2018-2019年吉安市收集的1433份手足口病病例标本进行EV、CA16和EV71核酸检测,对其中EV阳性的非CA16和非EV71型标本做CA6、CA10核酸检测并做流行病学特征分析。结果437份非CA16和非EV71肠道病毒标本中CA6型266份(60.87%),CA10型23份(5.26%),其他未分出型别148份(33.87%)。病原流行高峰期主要集中在7~10月份,检出226份(51.72%)。男女比例1.93:1;病例主要集中在3岁及以下幼儿(97.48%)。各县(市、区)病例分布有统计学意义。标本类型以肛拭子(268份,61.33%)和粪便(118份,27.00%)为主;疱疹液中检出阳性率最高(25/25,100.00%)。结论近年来吉安市手足口病病原体由EV71型、CA16型为主转变为其他肠道病毒型别为主,其中以CA6型等为主要病原,提示应加强对CA6、CA10等其他肠道病毒的监测和分型,并制定切实可行的防控措施。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a组6型 柯萨奇病毒a10 病原学检测 流行特征分析
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柯萨奇病毒A组6型研究进展 被引量:5
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作者 吴书惠 于莉莉 《新乡医学院学报》 CAS 2020年第8期787-791,共5页
手足口病是我国目前发病率最高、死亡病例数最多的丙类传染病,已经严重影响我国儿童的健康。手足口病可由多种肠道病毒(EV)引起,其中EV71型和柯萨奇病毒A组16型是引起手足口病的优势病原体。近年来,柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)已逐渐成为... 手足口病是我国目前发病率最高、死亡病例数最多的丙类传染病,已经严重影响我国儿童的健康。手足口病可由多种肠道病毒(EV)引起,其中EV71型和柯萨奇病毒A组16型是引起手足口病的优势病原体。近年来,柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)已逐渐成为全球多个国家和地区引起手足口病的主要病原体。而目前关于CV-A6的基因结构和分型以及感染的发病机制等方面的研究资料均较少,影响了对CV-A6所致手足口病的防控。基于此,本文对CV-A6的病原学、流行病学、临床症状、实验室诊断及疫苗相关的研究进展加以综述,以期为手足口病的防控提供新线索。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 手足口病 流行病学
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柯萨奇病毒A组6型分子进化与其相关手足口病流行的研究
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作者 韦欢欢(综述) 朱俊萍(审校) 《微生物学免疫学进展》 CAS 2024年第1期72-78,共7页
手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)是一种可由多种肠道病毒引起的以儿童急性感染为主的全球性传染病。近期,柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)引起的典型及非典型HFMD在多个国家及地区发病率明显上升且临床表现多... 手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)是一种可由多种肠道病毒引起的以儿童急性感染为主的全球性传染病。近期,柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)引起的典型及非典型HFMD在多个国家及地区发病率明显上升且临床表现多样。而CVA6的分子进化、人群群体免疫屏障的建立等均可影响HFMD的暴发流行及病原谱的变迁。现就CVA6的流行、分子进化与重组、氨基酸变异、结构解析及血清流行病学研究作一概述,旨在为HFMD的防控提供思路。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a组6型 临床症状 分子进化 基因重 结构解析 氨基酸变异 血清流行病学
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2013-2022年江苏省柯萨奇病毒A6型全基因组序列特征分析
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作者 樊欢 鲍倡俊 +2 位作者 朱立国 胡建利 嵇红 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2023年第12期1165-1173,共9页
目的 研究江苏省2013-2022年分离到的柯萨奇病毒A6型(CV-A6)全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析,以期从分子流行病学特征的角度解释CV-A6取代肠道病毒A71和柯萨奇病毒A16成为江苏省引起手足口病(HFMD)主要病原的原... 目的 研究江苏省2013-2022年分离到的柯萨奇病毒A6型(CV-A6)全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析,以期从分子流行病学特征的角度解释CV-A6取代肠道病毒A71和柯萨奇病毒A16成为江苏省引起手足口病(HFMD)主要病原的原因。方法 选取2013-2022年间江苏省地区流行的35株CV-A6毒株进行全基因组测序,采用DNASTAR、MEGA7.0和Similarity plots3.5.1等软件对获取的全基因组序列进行比对、相似性分析、系统进化分析和基因重组分析,对P1编码区和3D区主要氨基酸变异位点进行分析。结果 35株CV-A6江苏毒株的全基因组核苷酸和氨基酸序列相似性分别为87.5%~99.6%和97.0%~99.8%,与CV-A6原型株Gdula/USA/1949的全基因组核苷酸序列相似性仅为80.3%~81.0%,氨基酸序列相似性为94.7%~95.3%。基于VP1序列的系统进化树结果显示,2013-2022年江苏省有34株CV-A6分离毒株分属于D3a基因亚型,1株分属于D2基因亚型;基于3D区进化树划分不同重组模式,2013-2022年江苏省流行的CV-A6出现过4个重组进化分支:RF-A、RF-L、RF-K和RF-C型。重组分析结果显示:江苏省流行的CV-A6毒株与CV-A6原型株Gdula/USA/1949在结构蛋白序列上具有较高的相似性。而在非结构蛋白和非编码区则与其他EV-A原型株序列相似性更高。而氨基酸突变位点分析结果显示,与原型株Gdula/USA/1949相比,P1区和3D区多个氨基酸位点变异频繁,可能会使得衣壳蛋白的结构、潜在的受体结合位点产生变化。结论 通过对2013-2022年江苏省CV-A6的全基因组序列分析,有助于了解江苏省CV-A6基因重组及遗传进化关系,解释了近年来CV-A6成为手足口病的主要病原体的可能原因,对CV-A6的防控工作提供了基础资料。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a组6型 基因重 遗传特征
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2013-2021年在沈阳地区持续传播的柯萨奇病毒A组6型的分子进化研究
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作者 王德成 栗凡 +2 位作者 丛如意 杨婷婷 王冰 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1253-1260,共8页
手足口病(Hand foot and mouth disease,HFMD)是一种儿童常见的传染性疾病。持续的研究表明,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已经成为其主要病原。本研究为分析辽宁省沈阳地区CVA6的VP1区病原学特点及其分子进化特征,收集了20... 手足口病(Hand foot and mouth disease,HFMD)是一种儿童常见的传染性疾病。持续的研究表明,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已经成为其主要病原。本研究为分析辽宁省沈阳地区CVA6的VP1区病原学特点及其分子进化特征,收集了2013-2021年沈阳地区手足口病患者标本,应用荧光定量PCR方法进行CVA6等肠道病毒核酸的检测,对CVA6核酸阳性标本应用RT-PCR方法针对VP1区全长进行扩增、核苷酸序列测定,使用MEGA软件进行遗传进化和氨基酸突变位点分析。结果表明2013-2021年间沈阳地区CVA6占肠道病毒阳性构成比的36.08%(1269/3517),2015年和2018年成为绝对优势流行株,分别为68.38%(240/351)和58.30%(316/542)。进化分析表明,2013-2021年间沈阳地区的CVA6均属于D3a基因型,其中2013-2014年CVA6位于D3a.1和D3a.2分支上,而2015-2021年毒株均位于D3a.2分支上。与参考株相比,沈阳地区CVA6的VP1蛋白上存在24个氨基酸突变位点。因此,CVA6为近年来沈阳地区手足口病的主要病原体之一,基于VP1区进化分析,可看出2013-2021年间沈阳地区CVA6均属于D3a基因型,且已由D3a.1分支进化到D3a.2分支,并持续流行至今。加强CVA6的持续性监测与病原特征分析,对HFMD的科学防控具有重要意义。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a组6型 VP1区 分子进化
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柯萨奇病毒A组6型的研究进展 被引量:4
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作者 郝晓甜 李克坚 +1 位作者 周诚 毛群颖 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1271-1275,1280,共6页
手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)是一种严重影响婴幼儿健康的传染病,为全球范围内特别是亚太地区的重大公共卫生问题之一。HFMD可由多种肠道病毒引起,其中以肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievir... 手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)是一种严重影响婴幼儿健康的传染病,为全球范围内特别是亚太地区的重大公共卫生问题之一。HFMD可由多种肠道病毒引起,其中以肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CVA16)最为常见。近年,随着柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)感染引发HFMD比例大幅上升,CVA6逐渐成为造成全球多个国家和地区HFMD暴发的主要病原体。CVA6不仅易造成儿童感染,也易侵袭免疫功能正常的成年人,严重威胁人类健康。本文就CVA6的病原学、流行病学、临床症状、实验室诊断及其疫苗相关研究进展作一综述。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 手足口病 流行病学 实验室诊断 疫苗
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柯萨奇病毒A组6型对利巴韦林耐药性的初步研究 被引量:1
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作者 王蕊 王聪聪 +8 位作者 李晓亮 宋洋 刘莹 李冀琛 肖金波 路环环 刘志军 孙强 张勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期384-392,共9页
柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已成为近年来国内导致手足口病的主要病原体。本研究挑选16株中国流行的不同基因亚型的CVA6,通过在RD细胞上的细胞活性实验和观察致细胞病变效应来检测利巴韦林对不同CVA6毒株的抑制率。结果... 柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已成为近年来国内导致手足口病的主要病原体。本研究挑选16株中国流行的不同基因亚型的CVA6,通过在RD细胞上的细胞活性实验和观察致细胞病变效应来检测利巴韦林对不同CVA6毒株的抑制率。结果表明药物浓度在0.8mmol/L和0.4mmol/L作用下对部分CVA6有明显的抑制作用(P<0.0001),在0.8mmol/L药物浓度下根据抑制率的高低,将抑制率大于80%的CVA6株(5株,占31.25%)以及低于10%的CVA6株(5株,占31.25%)分别定义为对利巴韦林敏感组和耐药组。为了探究CVA6耐药性与病毒致病力之间的关系,在利巴韦林敏感组与利巴韦林耐药组分别随机挑选两株CVA6进行ICR乳鼠感染实验。通过观察乳鼠生存率、临床评分和体重变化,结果显示利巴韦林耐药组CVA6致病力均比利巴韦林敏感组弱,表明利巴韦林耐药与致病力之间存在一定联系。最后使用MEGA软件对利巴韦林敏感组和耐药组CVA6进行3D区氨基酸序列比对分析,发现两组CVA6在3D区75位、308位、342位、346位氨基酸完全不同,提示利巴韦林耐药与3D区的基因多态性存在一定联系。本研究提示对利巴韦林耐药的CVA6广泛存在,属于目前优势流行D3a基因亚型,不仅为手足口病患者个体化治疗提供了重要依据,而且对CVA6感染相关疾病的防控具有重要意义。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 利巴韦林 差异位点分析 耐药性
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全球柯萨奇病毒A组6型VP1区进化与正向选择位点分析 被引量:1
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作者 肖金波 路环环 +3 位作者 宋洋 王东艳 严冬梅 张勇 《国际病毒学杂志》 2023年第2期105-109,共5页
目的基于柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus group A type 6,CV-A6)VP1编码区寻找与其流行强度增加有关的关键氨基酸位点。方法对GenBank数据库中全部CV-A6 VP1编码区核苷酸序列进行筛选,获得其中的1533条序列进行比对。使用RAxML软件构... 目的基于柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus group A type 6,CV-A6)VP1编码区寻找与其流行强度增加有关的关键氨基酸位点。方法对GenBank数据库中全部CV-A6 VP1编码区核苷酸序列进行筛选,获得其中的1533条序列进行比对。使用RAxML软件构建最大似然树。使用Shannon Entropy在线分析工具计算序列的氨基酸置换熵值,并用Datamonkey在线分析平台通过MEME,SLAC和FUBAR三种方法来分析正向选择位点。结果目前全球流行的CV-A6以D3基因亚型为主。在VP1编码区存在三个高度可变的氨基酸位点,分别是VP1-5、VP1-30、VP1-137。三种方法均发现VP1-5、VP1-90、VP1-137三个位点在流行中受到过正向选择的作用。结论应继续加强对D3基因亚型CV-A6的监测,D3基因亚型的CV-A6在位于DE环中的VP1-137高度可变且受到了正向选择的作用,需要加以重视,并通过进一步研究来确定它与D3亚型广泛流行的关系。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 D3基因亚 系统发育分析 氨基酸置换熵值 正向选择位点
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2013~2015年宁夏地区手足口病柯萨奇病毒A组6型基因特征分析 被引量:11
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作者 袁芳 陈慧 +2 位作者 马江涛 马学旻 詹军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期702-706,共5页
研究2013-2015年宁夏地区普通手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)分离株基因特征。将2013-2015年收集的普通HFMD病例标本中所有非肠道病毒A71型(enterovirus,71)和非柯... 研究2013-2015年宁夏地区普通手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)分离株基因特征。将2013-2015年收集的普通HFMD病例标本中所有非肠道病毒A71型(enterovirus,71)和非柯萨奇病毒16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)的其它肠道病毒(Enterovirus,EV)核酸阳性标本,使用RD细胞进行病毒分离,获得的毒株使用兼并引物进行VP1区基因扩增和测序,测序结果编辑后通过BLAST比对进行型别鉴定,选择CV-A6毒株进行基因进化分析。2013-2015年共收集非EV71和非CV-A16的EV阳性标本998份,共分离到227株毒株,其中61株鉴定为CV-A6,同源性分析表明宁夏61株CVA6间核苷酸和氨基酸序列同源性分别是96.1%-99.8%和98%-100%,与Gudla原型株同源性为82%-83.5%和93.8%-95.7%,遗传距离较远。CV-A6成为宁夏地区2013年和2015年其它肠道病毒中导致HFMD的主要病原体与国内流行的CV-A6具有较高的同源性,流行趋势一致,并且在宁夏地区存在多个传播链。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 病原 柯萨奇病毒a组6型(CV-A6) 进化分析
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湖北省十堰市59例柯萨奇病毒A组6型手足口病流行病学特征与临床特点分析 被引量:17
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作者 梅玉发 王喜云 +2 位作者 崔龙 郑向梅 刘海波 《疾病监测》 CAS 2013年第12期981-983,共3页
目的探讨柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,Cox A6)手足口病的流行病学特征与临床特点,为该病的诊治与防控提供参考。方法 2012年10月至2013年9月,收集十堰市570例手足口病临床诊断病例标本,以实时荧光定量聚合酶链反应(real time RT... 目的探讨柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,Cox A6)手足口病的流行病学特征与临床特点,为该病的诊治与防控提供参考。方法 2012年10月至2013年9月,收集十堰市570例手足口病临床诊断病例标本,以实时荧光定量聚合酶链反应(real time RT-PCR)法进行手足口病病毒核酸检测并分型,对判定为Cox A6的手足口病确诊病例,采用描述流行病学方法进行流行病学特征与临床特点分析。结果 Cox A6在手足口病确诊病例的病原构成中居第3位(占13.41%,59/440);5岁以下儿童占100.00%,3岁以下占86.44%,散居、幼托儿童构成比为83.05%和16.95%,全市各县(市、区)全年均有发病,高峰期出现在10—11月,有1起聚集性疫情发生;所有病例在手、足、口或臀部出现皮疹,34.53%的病例出现发热,87.72%的病例出现口腔炎,26.32%的病例出现呼吸系统症状,3例白细胞计数偏高。结论 Cox A6肠道病毒可引起典型的手足口病及聚集性疫情,是手足口病的重要病原体之一,应加强监测与研究。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a组6型 流行病学 临床医学
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2015~2018年柯萨奇病毒A组6型在黑龙江省的持续流行 被引量:11
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作者 张曼 陈淑红 +10 位作者 张勇 宋洋 许军 孙巍 杨明 韩振志 肖金波 路环环 许文波 刘志军 杨倩 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期201-206,共6页
手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一类常见的儿童传染病,自2009年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)已经成为引起HFMD流行持续循环的重要病原之一,是其他肠道病毒(Enterovirus,EV)中的优势病原,而黑龙江省CV... 手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一类常见的儿童传染病,自2009年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)已经成为引起HFMD流行持续循环的重要病原之一,是其他肠道病毒(Enterovirus,EV)中的优势病原,而黑龙江省CV-A6相关研究报道尚欠缺。本研究为了解2015~2018年黑龙江省HFMD流行概况和病原学组成,并分析该地区CV-A6的基因特征,收集2015~2018年黑龙江省HFMD疫情资料进行流行病学分析,并采集HFMD病例临床标本进行EV核酸检测。对分离出的EV毒株进行CV-A6的特异性荧光定量PCR法检测,对所有CV-A6阳性毒株进行全长VP1区扩增和核苷酸序列测定,并与GenBank上下载的CV-A6分型代表株构建系统进化树,以了解CV-A6的基因特征。流行病学结果显示,2015~2018年黑龙江省HFMD疫情平稳且2017年有所下降,无死亡病例。黑龙江省每年7月~8月为HFMD流行高峰,患病人群平均年龄为(4.39±3.74)岁,男女患病比例为1.44∶1。全省13个地市均收集到标本,哈尔滨市标本数最多,占36.77%。2015~2018年在黑龙江省共分离到69株CV-A6,与CV-A6原型株的核苷酸相似性为81.8%~83.9%,氨基酸相似性为94.0%~96.3%,均属D3基因亚型的D3a进化分支。尽管肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和CV-A16为主要病原,但D3基因亚型的CV-A6也已成为引起黑龙江省HFMD流行的稳定型别之一,且有加强的趋势,因此应加强CV-A6疫情的监控和分析,为该地区HFMD防控及疫苗研制提供基础数据。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型(CV-A6) D3基因亚 手足口病(HFMD)
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2018年浙江省宁海县柯萨奇病毒A组6型手足口病临床特征及分子流行病学 被引量:11
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作者 孔志芳 倪红霞 +8 位作者 杨斌 谢蕾 张丹 王晓英 章海斌 胡莉莉 葛宝湘 陈伟 王帆 《疾病监测》 CAS 2019年第11期1005-1009,共5页
目的了解浙江省宁海县柯萨奇病毒A组6型(Cox A6)手足口病的临床特征,探讨其防控策略和措施。方法从国家疾病监测信息系统获取2018年宁海县手足口病资料,采集宁海县第一医院手足口病门诊、住院患者粪便和(或)咽拭子标本,用实时荧光定量... 目的了解浙江省宁海县柯萨奇病毒A组6型(Cox A6)手足口病的临床特征,探讨其防控策略和措施。方法从国家疾病监测信息系统获取2018年宁海县手足口病资料,采集宁海县第一医院手足口病门诊、住院患者粪便和(或)咽拭子标本,用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测肠道病毒通用型及核酸分型,对Cox A6阳性标本进一步用RT-PCR方法进行VP1全长基因扩增、测序和系统进化分析。结果肠道病毒核酸阳性635例,阳性率为75.42%,其中Cox A6、非Cox A6阳性分别为412例(64.88%)和223(35.12%);对Cox A6与非Cox A6病例组的临床表现进行比较,年龄、发热及热程、皮疹分布范围、出现疱疹及大疱疹比例、皮肤疼痛和痒感、脱皮及色素沉着、随访16周脱甲率等因素差异有统计学意义。序列分析显示,2018年宁海县流行的Cox A6均为D3基因亚群,D3.2分枝。结论 2018年宁海县Cox A6 D3基因亚群病毒广泛流行,临床上表现为皮肤黏膜剧烈反应,皮疹分布较非Cox A6广泛,脱甲为Cox A6病毒对指(趾)甲的直接侵害。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 手足口病 临床特征 分子流行病学
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江苏省2012-2013年柯萨奇病毒A组6型分子流行特征分析 被引量:10
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作者 卞莲莲 姚昕 +3 位作者 毛群颖 叶强 朱凤才 梁争论 《中国病毒病杂志》 CAS 2015年第5期361-367,共7页
目的分析江苏省2012-2013年流行的柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区序列特征。方法采集江苏省2012-2013年10例CV-A6感染引发的手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿的咽拭子或肛拭子样本,通过RT-PCR扩增... 目的分析江苏省2012-2013年流行的柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区序列特征。方法采集江苏省2012-2013年10例CV-A6感染引发的手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿的咽拭子或肛拭子样本,通过RT-PCR扩增完整VP1区。应用DNAStar软件包的MegAlign对CV-A6毒株的VP1区进行核苷酸和氨基酸序列比对分析,构建系统进化树。结果同源性和系统进化分析结果显示,10株流行株与2008年芬兰流行株同属于分支F,核苷酸同源性为95.1%~96.5%,而与原型株Gdula核苷酸同源性较低,为82.4%~84.0%。01-PZ/JS/2012、02-PZ/JS/2012、03-PZ/JS/2012、04-BY/JS/2012和08-PZ/JS/2013属于分支F2,05-PZ/JS/2013、06-PZ/JS/2013、07-PZ/JS/2013、09-PZ/JS/2013和10-BY/JS/2013属于F3,不同亚分支毒株之间核苷酸同源性为95.8%~97.2%。结论江苏省2012-2103年流行的10株毒株分别属于F2和F3分支,属于F2的5株毒株的VP1第30位氨基酸位点为V,而属于F3的5株毒株该位点为A。开展CV-A6流行株分子流行病学研究,了解毒株进化变异的趋势,对防控CV-A6引发的HFMD具有重要意义。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒a组6型(CV-A6) 基因
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北京地区柯萨奇病毒A组6型、肠道病毒EV71型和柯萨奇病毒A组16型手足口病流行特征及临床特点比较 被引量:25
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作者 刘潇潇 初艳慧 +3 位作者 任剑 秦迪 孔庆征 王永全 《公共卫生与预防医学》 2016年第5期8-11,共4页
目的了解柯萨奇病毒A组6型、肠道病毒71型和柯萨奇A组16型手足口病流行特征、临床特点,为指导临床诊断,调整手足口病防控策略提供科学依据。方法采用前瞻性调查的方法,采集2013年8月至2015年9月在北京市儿童医院诊断的手足口病临床确诊... 目的了解柯萨奇病毒A组6型、肠道病毒71型和柯萨奇A组16型手足口病流行特征、临床特点,为指导临床诊断,调整手足口病防控策略提供科学依据。方法采用前瞻性调查的方法,采集2013年8月至2015年9月在北京市儿童医院诊断的手足口病临床确诊病例的咽拭子,将手足口病原核酸检测阳性的病例分为CA6、EV71、CA16 3组,分析比较3组的临床特点、流行特征、预后及影响因素。结果共采集HFMD临床诊断病例574例患儿咽拭子,CA6入组122例,EV71入组107例,CA16入组124例。13组年龄、性别分布一致,差异无统计学意义。2不同年份流行主要毒株不同,但3种病原体引起的手足口病高峰均在夏季。3CA6组发热比例高达78.69%,明显高于EV71组(35.51%)和CA16组(37.90%)(P<0.001),平均体温约为38.78℃。CA6组表现大疱疹(9.01%)、结痂(8.20%)、皮疹部位疼痛(29.51%)、恢复期脱皮(38.52%)、脱甲(35.25%)、色素沉着(11.47%)比例高于EV71组、CA16(P<0.001)。43组在卫生学指标方面差异无统计学意义。结论CA6、EV71和CA16感染所致的HFMD发病高峰季节一致;与EV71、CA16感染相比,CA6感染引起的高热比例较高,部分病例可表现为大疱疹,疼痛、脱皮、脱甲、色素沉着、结痂发生率高,预后较好。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a组6型 肠道病毒EV71 柯萨奇病毒a16 大疱疹 脱甲
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柯萨奇病毒A组6型报告基因假病毒可视化感染模型的建立 被引量:3
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作者 吴星 苏瑶 +8 位作者 董方玉 陈盼 李克雷 高帆 卞莲莲 孙世洋 胡亚林 毛群颖 梁争论 《中国病毒病杂志》 CAS 2018年第6期515-520,共6页
目的以含报告基因的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)假病毒(pCV-A6-Luc),建立CV-A6可视化感染模型,用于疫苗的有效性评价.方法比较BALB/c、C57BL/6、ICR、NIH、KM小鼠对pCV-A6-Luc的敏感性,确定模型动物;进行小鼠周龄选择、检测时间摸索以及假... 目的以含报告基因的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)假病毒(pCV-A6-Luc),建立CV-A6可视化感染模型,用于疫苗的有效性评价.方法比较BALB/c、C57BL/6、ICR、NIH、KM小鼠对pCV-A6-Luc的敏感性,确定模型动物;进行小鼠周龄选择、检测时间摸索以及假病毒感染剂量优化等研究,确定模型体系;通过给小鼠接种灭活CV-A6病毒或被动免疫抗血清观察保护效果.结果通过不同品系小鼠对假病毒的敏感性比对,确定将BALB/c小鼠作为模型动物,并确定了使用4周龄小鼠作为假病毒攻毒时间,攻毒后16h为检测时间.半数动物感染剂量(AID50)研究结果表明,活体成像发光值与pCV-A6-Luc攻毒剂量呈现良好的剂量效应关系(r^2=0.996),Reed-Muench法计算pCV-A6-Luc感染BALB/c小鼠的AID50攻毒剂量为2.86×10^8拷贝.主动免疫和被动免疫研究结果表明,抗体及灭活疫苗均可抑制pCV-A6-Luc对小鼠的感染.主动免疫实验组小鼠活体成像发光强度和中和抗体检测结果均明显低于对照组.结论本研究建立了安全、敏感、可视化的CV-A6报告基因假病毒可视化感染模型,该模型可应用于CV-A6疫苗评价及药物筛选研究. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 可视化 动物模 报告基因 病毒
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某高中一起柯萨奇病毒A组6型手足口病暴发疫情的流行病学调查 被引量:5
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作者 刘潇潇 初艳慧 +2 位作者 秦迪 孙小宇 王永全 《国际病毒学杂志》 2016年第3期160-163,167,共5页
目的了解某高中一起手足口病暴发疫情的流行病学特征,寻找导致该暴发发生的危险因素,同时了解柯萨奇病毒A组6型(CVA6)手足口病的临床表现。方法按照病例定义开展病例搜索。采用统一设计的调查表调查患者一般情况和临床表现,采用病... 目的了解某高中一起手足口病暴发疫情的流行病学特征,寻找导致该暴发发生的危险因素,同时了解柯萨奇病毒A组6型(CVA6)手足口病的临床表现。方法按照病例定义开展病例搜索。采用统一设计的调查表调查患者一般情况和临床表现,采用病例对照研究分析暴发危险因素。结果该学校从8月17日-9月10Et出现28名病例(24例学生,4例家长),其中23例临床诊断病例,5例实验室确诊病例(检出病原体CVA6)。患者中82.1%(23/28)的病例出现发热症状,64.3%(18/28)的病例体温≥38.5℃;21,4%(6/28)的病例出现皮疹部位疼痛症状;46.4%(13/28)的病例恢复期出现脱皮症状;17.9%(5/28)的病例出现脱甲症状。发病前1周与手足口病患者接触、饭前不洗手是手足口病发病的危险因素。结论患者未及时隔离、与患者密切接触和饭前不洗手是造成疾病蔓延的主要原因。CVA6导致的手足口病患者常出现高热、脱甲、脱皮等非典型手足口病临床症状。 展开更多
关键词 手足口病 暴发 柯萨奇病毒a组6型 流行病学
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