分块PCA提取细胞周期调控基因的研究

用主成分分析(PCA)方法处理基因表达微阵列数据能够实现基因选择、基因表达模式提取、基因分类等,有其独特的优点。然而,PCA方法却存在容易丢失重要信息的弱点。为了克服这一方法的弱点,提出分块PCA,并以此为基础形成一种提取细胞周期调控基因的新方法。通过理论分析和对酵母微阵列数据的仿真实验研究,表明这种方法可行、有效,能够全面地提取出隐含在方差较小变量中的细胞周期调控基因,并能够给予实验结果较好的生物意义解释,在微阵列数据处理中具有应用前景。

细胞周期调控基因与人类肿瘤

肿瘤的恶性增生从生物学角度看主要表现在两个方面:一方面是肿瘤细胞的'不死性',即凋亡障碍;另一方面就是细胞分裂的失控,细胞有丝分裂的速度、程序发生紊乱。这两者都是目前肿瘤研究的热点,而且在近几年都取得了较大进展。越来越多的证据表明,细胞分裂的精确性及定时性是正常细胞生长和分化所必需的,包含于这一过程中的蛋白质及其基因的改变与肿瘤发生及其恶性表型密切相关。其中,最引人瞩目的就是CyclinD1(细胞周期蛋白D1型)—CDKs(细胞周期蛋白依赖性激酶,cyclins dependent kinases)这一以CDKs为中心的细胞周期网络调控系统。

细胞周期调控基因在精子发生中的作用

精子发生是一个特殊的雄性生殖细胞的分化过程,也是一个特殊的细胞周期运行过程。其 中,细胞周期相关基因的缺失或过度表达主要影响生殖细胞使其不能发育为成熟精子。本文从细胞周 期正、负调控基因和细胞周期的调控途径这三个方面综述了细胞周期调控基因在精子发生过程中的表 达和蛋白定位,为深入了解生精过程的分子机制奠定基础。

骨髓增生异常综合征细胞周期调控基因表达谱的研究

目的研究骨髓增生异常综合征(MDS)细胞周期调控基因的异常表达。方法通过半定量RTPCR分析29名正常对照、27例MDS和19例原发性急性髓系白血病(AML)患者骨髓细胞周期素(cyclins)家族(cyclinD2,cyclinD3,cyclinA1和cyclinE)、细胞周期素依赖性激酶(CDKs)家族(CDK2,CDK4和CDK6)、CDKs抑制剂家族(p21,p27和p57)以及RbE2Fs通路中Rb和E2F1基因的表达率和表达量。结果MDS组cyclinD3和cyclinA1基因表达量(分别为0.65±0.17,0.48±0.04)均明显高于正常对照(0.49±0.04,0.32±0.06),且低于原发性AML组(0.84±0.15,0.65±0.09)(P值均<0.05)。MDS组cyclinD2和cyclinE基因表达率(表达量)分别为40.7%(0.78±0.21)和51.9%(0.52±0.10),均明显高于正常对照[13.8%(0.49±0.09);17.2%(0.33±0.13)]和原发性AML组[10.5%(0.38±0.08);21.1%(0.33±0.03)]。MDS组CDK2基因表达量(0.66±0.19)明显高于正常对照(0.42±0.04)(P<0.001),而且CDK6基因表达率(25.9%)明显高于正常对照(3.4%)(P<0.05)。MDS组、原发性AML组及正常对照组CDK4基因表达率和表达量差异无统计学意义。MDS组p21基因(77.8%;1.18±0.21)和p27基因(48.1%;1.14±0.40)有较高的表达率和表达量,明显高于正常对照和原发性AML组。MDS组p57基因表达量(0.69±0.06)明显高?

5种细胞周期调控基因在小鼠生殖细胞发育过程中的表达研究

以成熟 (10周龄以上 )的昆明种正常小鼠的精巢和卵巢为材料 ,利用地高辛标记的基因探针进行组织切片上的DNA -mRNA分子原位杂交 ,研究了PCNA ,cdc2 ,cyclinD1,p2 1和 p16 5种细胞周期调控基因在生殖细胞发育过程中的表达 .结果表明 :PCNA基因在睾丸组织的精原细胞和精母细胞中有强杂交信号 ,而在雌性生殖细胞及滤泡细胞的发育过程都没有杂交信号 ;cyclinD1,cdc2 ,p2 1,p16基因在生殖细胞的发育过程中都没有 ,表明这些基因并没有参与小鼠生殖细胞的生长和分化调控 .这些事实表明在生殖细胞发育过程中 ,控制细胞增殖和增殖抑制的基因与培养细胞有不同的机制 ,它们可能采用了不同的调控系统 .

慢性苯中毒易感细胞周期调控基因多态性研究进展

近年来研究发现,细胞周期调控基因多态性与慢性苯中毒易感性有关。本文就慢性苯中毒易感细胞周期调控基因及其多态位点对慢性苯中毒发病风险的影响进行概述。

补肾、健脾、益气、活血法对衰老细胞增的调控作用

目的 :比较补肾、健脾、益气、活血法对衰老细胞增殖的调控作用。方法 :采用含药血清对衰老的人胚肺二倍体成纤维细胞 2BS细胞株进行处理 ,观察四种中药对细胞寿命、细胞生长曲线、代谢活力 (MTT法 )以及衰老细胞生物学标志衰老相关半乳糖苷酶活力的影响。结果 :补肾和益气方药能够明显延长衰老细胞的传代次数 ,促进细胞增殖 ,使细胞MTT的还原量明显升高 ,抑制细胞衰老相关半乳糖苷酶 (SA β Gal)活力。而健脾、活血方药对细胞增殖的促进作用不明显。 结论 :细胞衰老时增殖变慢 ,活力降低 ,衰老相关半乳糖苷酶活力增高。补肾、益气中药能改善上述衰老变化 ,健脾、活血药作用不明显。

肺神经内分泌肿瘤发生发展过程中相关基因、微小RNA、信号通路的调控作用研究进展

肺神经内分泌肿瘤是具有共同神经内分泌分化的肺肿瘤的一个亚型,包括典型和非典型类癌、小细胞肺癌和大细胞神经内分泌癌。肺神经内分泌肿瘤的发生发展与许多因素有关,包括细胞周期调控基因、染色质重构基因、Yes相关蛋白1(YAP1)基因、MYC家族基因、BCL2家族基因、p130基因等相关基因,miR375、miR205-5p、miR-29等相关miRNAs,m TOR信号通路、NOTCH信号通路等相关信号通路。

甲基汞通过miRNA对人胚胎神经干细胞细胞周期相关基因表达的调控

[目的]通过研究甲基汞对人胚胎神经干细胞mi RNA表达的影响,探讨低剂量甲基汞对神经干细胞细胞周期调控基因的调节作用。[方法]以0、10、50 nmol/L甲基汞染毒人胚胎神经干细胞24 h后,用MTT法测定甲基汞对细胞活力影响,应用逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)检测甲基汞对细胞周期调控基因(p16、p21)的m RNA的表达水平影响,利用实时荧光定量多聚酶链反应技术检测调控p16、p21的mi RNA(mi R-24、mi R-106a)的表达情况。[结果]50 nmol/L甲基汞染毒组细胞活力降低为对照组的53.5%,差异有统计学意义(P<0.05);p16与p21基因的m RNA表达水平随着甲基汞染毒浓度的升高而升高,差异均有统计学意义(P<0.05),但10 nmol/L与50 nmol/L组的p16基因表达差异无统计学意义。mi R-24、mi R-106a的表达水平随着甲基汞染毒浓度的升高而降低,差异有统计学意义(P<0.05)。[结论]50 nmol/L的甲基汞可以引起人胚胎神经干细胞增殖抑制,并可能通过mi RNA调节细胞周期调控基因的表达。

氧化应激对肺泡Ⅱ型上皮细胞中促凋亡基因细胞周期和凋亡调控蛋白1表达的影响

目的探讨氧化应激对肺泡Ⅱ型上皮细胞中促凋亡基因细胞周期和凋亡调控蛋白1(CCAR1)表达的影响。方法常规培养人肺泡Ⅱ型上皮细胞系A549细胞。分为正常对照组(无过氧化氢处理的A549细胞)、0.1mmol/L过氧化氢处理的A549细胞组、0.5mmol/L过氧化氢处理的A549细胞组和1.0mmol/L过氧化氢处理的A549细胞组。利用DNA梯状电泳检测细胞凋亡。免疫荧光细胞化学检测CCAR1蛋白在A549细胞中的表达和分布。Western blot检测过氧化氢对A549细胞中CCAR1蛋白表达的影响。比色法测定半胱氨酸蛋白水解酶(Caspase-3)的活性。结果DNA梯状电泳检测显示,1.0mmol/L过氧化氢处理A549细胞24h,电泳出现反映细胞凋亡的梯形条带。免疫荧光细胞化学检测显示CCAR1主要定位在细胞核,但胞质中也有分布。Western blot结果显示过氧化氢呈剂量依赖性地诱导A549细胞中CCAR1蛋白表达上调(Pa<0.05)。CCAR1蛋白的表达与促凋亡的Caspase-3的活性呈显著正相关(r=0.7212P<0.05)。结论氧化应激诱导肺泡Ⅱ型上皮细胞中促凋亡基因CCAR1蛋白表达上调。CCAR1可能参与了氧化应激诱导肺泡Ⅱ型上皮细胞凋亡的调控,其机制可能涉及到Caspase-3活性改变。

后囊膜混浊的基因治疗

基因治疗作为一种全新的治疗方法已经在医学领域开展研究,本文从自杀基因、细胞周 期调控基因、凋亡基因等方面就近年来对后囊膜混浊在基因治疗研究的进展进行综述。

利用基因芯片技术研究一氧化碳对小鼠脑基因表达的影响

目的 研究 2 5mmol·L- 1一氧化碳小鼠吸入染毒 72h后 ,对小鼠大脑和小脑基因表达的影响。方法 6 0只成年雄性昆明种小鼠随机分为对照组和染毒组 ,30只 /组。采用上海博星基因芯片有限公司提供的MGEC 4 0S表达谱芯片检测差异表达基因。结果 与对照组比 ,染毒组表达差异在 2倍以上的基因大脑和小脑共 12 7个 ,大脑为 4 8条 ,小脑为 79条。其中 ,大脑差异表达下调的有 13条 ,表达上调的有 35条 ,分别占 2 7%和 73% ;小脑差异表达下调的有 4 3条 ,表达上调的有 36条 ,分别占 5 4%和4 6 %。大脑和小脑共同表达的基因有 31条 ,其中 ,1条为表达下调 ,30条为表达上调 ,分别占到了 3%和97%。结论 一氧化碳可以影响到小鼠脑中多种基因的表达 ,主要影响的基因类别包括蛋白质翻译合成基因、细胞周期调控基因、细胞生长基因。

细胞蛋白依赖性激酶10与病理性瘢痕

1970年，PaulNurse等以裂殖酵母为实验材料，发现了许多细胞周期调控基因，如：裂殖酵母cdc2等。CDC2与细胞周期蛋白结合才具有激酶的活性，称为细胞周期蛋白依赖性激酶（cyclin—dependent kinase，CDK），因此CDC2又被称为CDKl，激活的CDKl可将靶蛋白磷酸化而产生相应的生理效应。

细胞周期调节蛋白依赖性激酶2-关联蛋白-1小干扰RNA表达载体构建及鉴定

细胞周期调节蛋白依赖性激酶2-关联蛋白-1（CDK2AP1）是一种细胞周期调控基因[1].我们构建小干扰RNA（siRNA）序列的载体,并转染乳腺癌细胞株MCF-7,筛选出干扰CDK2AP1表达的最佳的siRNA. 一、材料与方法 1．材料：乳腺癌细胞株MCF-7；大肠杆菌感受态细胞DH50α；载体质粒pGCSIL—GFP。

p27-CyclinD1/CDK4-Rb蛋白在不同类型甲状腺肿瘤组织中的表达及临床意义

目的:探讨细胞周期调控基因蛋白p27、CyclinD1、CDK4、Rb在不同类型甲状腺肿瘤组织中的变化,为甲状腺肿瘤的发生学以及临床诊断提供参考。方法:应用流式细胞术和免疫荧光技术对甲状腺乳头状癌(40例)、甲状腺腺瘤(16例)、结节性甲状腺肿(21例)、正常甲状腺组织(10例)的CyclinD1、CDK4、p27、Rb基因蛋白的表达进行定量检测。结果:CyclinD1和CDK4基因蛋白在甲状腺乳头状癌组织中的表达量显著高于其它三组(P<0.01),而后三组间差异无显著性(P>0.05);p27基因蛋白在结节性甲状腺肿、甲状腺腺瘤和甲状腺乳头状癌表达量依次减少,均低于正常甲状腺组织(P<0.05);Rb基因蛋白的表达量在正常甲状腺组织、甲状腺腺瘤、结节性甲状腺肿、甲状腺乳头状癌中依次减少,但各组间无显著性差异(P>0.05)。结论:CyclinD1/CDK4高表达、p27低表达在甲状腺乳头状癌的发生中起着重要的作用,而Rb基因在甲状腺乳头状癌的发生中可能不起主要作用。