结构基因座和微卫星标记应用于绵(山)羊群体遗传分化的比较研究

对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的随机样本分别进行14个结构基因座和7个微卫星标记的遗传检测,比较由两种遗传标记获得的群体基因平均杂合度(H)、多态信息含量(PIC)及群体有效等位基因数(Ne);分别根据两种类型的基因频率资料,计算3个群体间的标准遗传距离并加以比较。结果表明:由微卫星等位基因频率获得的群体基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数显著大于结构基因座获得的,但在三群体中变化趋势是一致的;由结构基因座资料计算的3个群体间标准遗传距离为0 0268～0 2487,微卫星标记资料计算的3个群体间标准遗传距离为:0 2321～1 2313,绵山羊间显著大于绵羊群体之间。提示:结构基因座和微卫星标记一致揭示3群体内的遗传变异;同羊>湖羊>长江三角洲白山羊;微卫星标记较结构基因座标记更能表达近缘种间进化趋异水平,可将FCB11、MAF33、AE101、FCB128及FCB304位点作为研究绵山羊近缘种间遗传分化的标志性位点。

利用结构基因座分析小尾寒羊、滩羊群体遗传分化水平

采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测60只小尾寒羊、73只滩羊编码血液蛋白17个结构基因座上的变异,引用国内外14个绵羊群体相同资料进行比较分析,探讨其遗传分化水平。研究表明:(1)小尾寒羊、滩羊结构基因座平均杂合度分别为0.2360和0.2587;平均多态信息含量分别为0.1974、0.2102;平均有效等位基因数分别为1.5723和1.5751。(2)4个组合(分别为4个、6个、13个及16个绵羊群体)的基因分化系数分别为0.049323、0.059987、0.1728和0.201256,说明湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊4个绵羊群体结构基因座的基因分化程度低;这4种绵羊与蒙古国绵羊的基因分化程度次之;蒙古羊系绵羊和南亚羊及欧洲羊之间基因传分化程度较高。(3)前人关于小尾寒羊、滩羊由蒙古羊分化而来的考证得到遗传学实验的进一步证明,湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊受蒙古羊血统的影响递减。群体间亲缘关系远近与其所处地理位置远近并未表现出紧密相关。

湖羊结构基因座遗传共适应性分析

根据多座位电泳法检测的结构基因座上等位基因频率分析湖羊群体的遗传共适应性。结果发现,在显隐性-显隐性模式中未发现座位间的遗传共适应现象,显隐性-共显性模式中X-p-Cat组合座位以及共显性-共显性模式中Po-CA、Po-Cat组合座位均存在遗传共适应,表明在湖羊群体中性结构基因座间存在遗传共适应,而且起主要的作用,维持着座位间的遗传平衡或者使座位间处于遗传不平衡状态。

非乳用山羊乳蛋白结构基因座遗传多态性研究

为了解非乳用山羊不同群体编码乳蛋白结构基因座的遗传多态性,揭示不同群体间的遗传关系。采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术,分析中国9个非乳用山羊群体共316只个体编码乳蛋白(酶)7个结构基因座的遗传多态性,并基于5个结构基因座等位基因频率计算Nei氏遗传距离,以UPMGA法作聚类分析。研究结果表明,9个山羊群体中,编码乳蛋白(酶)的-κCN,-βCN,sα1-CN,αs2-CN,-βLg,SA和LDH7个结构基因座在PAGE上均呈现出不同程度的遗传多态性;9个山羊群体中在-κCN,-βCN,αs2-CN,-βLg和SA5个结构基因座上的平均基因一致度、平均基因杂合度和平均有效等位基因数分别为0.335 0,0.655 2和1.819 9。基于-κCN,-βCN,αs2-CN,-βLg和SA5个结构基因座的等位基因频率计算Nei氏遗传距离,以UPMGA法可将中国9个非乳用山羊群体划分为2大类。非乳用山羊群体中,乳蛋白结构基因座是1个遗传多样性相对丰富的系统;乳蛋白结构基因座在非乳用山羊群体划分中具有较强的代表性。

东亚山羊结构基因座突变率的估计

检测我国17个地方山羊群体编码血液酶和其它蛋白质的33个结构基因座上的基因频率分布,收集东亚另外7个群体的同类资料;根据这些群体的23 075.1千总规模、181.8千调查范围和1713只样本规模,以校正的Nei无限位点模型,估计了东亚山羊结构基因座的突变率。其值为:每代每座位（1.176±0.783）×10-6。这个结果与关于其它高等哺乳动物的估计结果非常接近;说明在高等哺乳动物范围内,结构基因座上的中性突变率可能与种别无关。这个数值可以作为由DNA编码区控制的密码子突变率的最低估计值。

闽南牛结构基因座多型性的研究

以中心产区典型群简单随机抽样原则在福建省漳州市抽取闽南牛64头,采集血样,按常规方法分离血浆和血细胞,冷冻后带回实验室-20℃保存备用。用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术(SGE)检测21个编码血液蛋白(酶)的结构基因座。同时引用其他学者用相同方法获得的国内外12个牛群体7个相同座位的研究资料,进行聚类分析。结果表明:在所检测的21个基因座中,有10个存在多型,多态位点百分比为47.62%,群体内遗传变异水平相对较高,平均杂合度为0.1593;证实了闽南牛与东南亚牛种亲缘关系较近,闽南牛是南方黄牛和瘤牛的混血种,但不应含有巴厘牛或斑腾牛的血统。

渤海黑牛结构基因座多型性的研究

以中心产区典型群简单随机抽样在山东省滨州市渤海黑牛原种场随机抽取渤海黑牛45头,应用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术检测了16个编码血液蛋白(酶)的结构基因座,实验结果表明:在所检测的16个座位中有9个存在多型现象,多态位点百分比为56.25%,群体内遗传变异水平相对较高,平均杂合度为0.2319。证实了渤海黑牛是由北方牛和南方牛的混血种。

长江三角洲白山羊群体遗传结构研究

应用结构基因座和微卫星DNA两种遗传标记探讨长江三角洲白山羊群体遗传结构。结果表明,检测的9个结构基因座位上7个存在多态性,座位的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.1767、0.1457和1.2837;7个微卫星位点上共检测到110个等位基因,位点的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.8867、0.8774和11.2907。群体内的遗传变异程度相对较高,反映出丰富的遗传多样性,而且微卫星DNA标记揭示的遗传变异高于结构基因座。

湖羊遗传检测与形态学特征的研究

以中心产区典型群简单随机抽样方法在浙江省湖州市湖羊主要分布区抽取 63只具有独立血统的个体 ,用水平板淀粉凝胶多座位电泳方法检测编码血液酶和其他蛋白质 (以及控制非蛋白遗传变异 )的结构基因座上的频率分布 ,观测 9项相对形态学特征标记的表型频率 ,并测量体尺 ,分析总体频率样本估计值的可靠性与精确度。结果表明 :在 1 4个结构基因座中 ,除 Al座位已由 Al C基因固定外 ,其他 1 3个座位皆存在多型 ,群体平均杂合度为 0 .3 3 2 1 ;9项形态学特征标记中 7项存在多型 ;

鲁西黄牛遗传多样性及其系统地位的研究

以中心产区简单随机抽样在山东省鄄城县和梁山县共抽取鲁西黄牛87头,用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白(酶)的结构基因座的基因频率,同时引用国内外13个群体7个相同座位的研究资料,进行聚类分析。结果表明,在所检测的21个基因座中,有9个存在多型,多态位点百分比为42.86%,群体内遗传变异水平相对较高,平均杂合度为0.1416;鲁西牛与东南亚牛种亲缘关系较近,证实了鲁西牛是由北方蒙古利亚牛系和南方瘤牛的混血种,但不可能含有巴厘牛的血统。目前应扩大保种群的数量,以维持群体内的遗传多样性。

小尾寒羊遗传共适应的初步研究

以中心产区小尾寒羊编码碱性磷酸酶(Alp)、酯酶(Ary-Es)、亮氨酸氨肽酶(Lap)、血红蛋白β链(Hb-β)、苹果酸脱氢酶(ME)、过氧化氢酶(Cat)6个多态结构基因座上的频率分布为研究对象,进行遗传共适应分析,结果表明:(1)显隐性-显隐性和显隐性-共显性组合座位均处于遗传平衡状态,共显性-共显性组合座位中ME/Cat处于遗传不平衡状态;(2)Hb-β/ME座位间遗传共适应起着与连锁不平衡相反的作用;ME/Cat座位间遗传共适应的独立作用造成其遗传不平衡;(3)遗传不平衡系数、连锁不平衡系数和配子间遗传共适应概率与x2适合性检验结果相一致。

中国及中亚以东南部分绵羊群体的遗传多样性

以中心产区典型群简单随机抽样的方法,抽样检测65只同羊、63只湖羊的5项体尺、5项形态特征、6项生态特征及10个血液蛋白质结构基因座基因频率,引用国内外相关研究资料。(1)对国内的6个绵羊群体的17项指标进行主成分分析,并根据各群体主成分值进行聚类,结果表明,国内6个绵羊群体被明显分为牧区、农牧交错区的蒙古羊、滩羊和农区的大尾寒羊、小尾寒羊、湖羊、同羊两大类。(2)在10个结构基因座基因频率基础上,计算中亚以东南12个绵羊群体平均座位纯合度和杂合度,比较其遗传多样性,依杂合度的高低分为3类。结果表明:绵羊的4项生态指标、2项形态特征及4项体尺对绵羊品种间差异起决定作用;湖羊、同羊及蒙古羊系统的另两个群体Kh和Ub具丰富的遗传多样性。

我国农区及农牧交错区绵羊与蒙古羊遗传分化研究

采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测小尾寒羊、滩羊编码血液蛋白16个结构基因座上的变异,与蒙古国蒙古羊、我国湖羊和同羊的相同资料进行比较分析,探讨其遗传分化关系。除Alp和X p,结构基因座的基因遗传分化程度均低于7 341 7%,群体间遗传差异占5 370 5%。标准遗传距离、模糊聚类分析表明,湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊与蒙古羊亲缘关系逐渐疏远。遗传贴近度是否适合用于受研究群体和已知其始祖的现代群体之间的比较有待进一步验证。从结构基因座方面进一步证实小尾寒羊、滩羊的蒙古羊属性,揭示了5 个绵羊群体之间的部分遗传差异。

长江三角洲白山羊群体遗传多样性分析

以结构基因座和微卫星标记检测长江三角洲白山羊群体的遗传多样性。结果表明,9个结构基因座上的平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.176 7、0.145 7和1.283 7;7个微卫星座位的平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.886 7、0.877 4和11.290 7。微卫星标记揭示的群体遗传多样性高于结构基因座。

应用两类遗传标记方法分析湖羊和同羊的遗传多样性

随机抽取湖羊 6 3只、同羊 6 5只分别进行 14个结构基因座和 7个微卫星标记的遗传检测 ,比较由两种遗传标记获得的群体基因平均杂合度 (H)、多态信息含量 (PIC)及群体有效等位基因数 (Ne)。结果表明 :由微卫星等位基因频率获得的群体基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数显著大于由结构基因座获得的 ,且在两群体中变化趋势一致。提示 :结构基因座和微卫星标记是绵羊群体遗传多样性研究的可靠遗传标记 ,而微卫星标记揭示更为丰富的遗传变异 ;两绵羊群体在结构基因座和微卫星DNA两个层次上具相当的遗传多样性 ;微卫星标记可有效用于近缘群体间的遗传分析。

黄淮山羊与长江三角洲白山羊遗传多样性研究

采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测53只黄淮山羊、30只长江三角洲白山羊编码血液蛋白17个结构基因座上的变异,分析其遗传多样性。结果表明:黄淮山羊、长江三角洲白山羊结构基因座平均杂合度分别为0.0826和0.0899;平均多态信息含量分别为0.0699和0.0899;平均有效等位基因数分别为1.0000和1.1533。黄淮山羊与长江三角洲白山羊群体对于“东亚集团”的基因贴近度分别为0.8445、0.8981,对于“南亚集团”的基因贴近度分别为0.7440、0.8201,说明黄淮山羊群体与长江三角洲白山羊群体应属于“东亚山羊集团”。该研究结果符合山羊播迁的路线并与其地理分布相吻合。

小尾寒羊群体遗传检测的研究

以中心产区典型随机抽样法在小尾寒羊的中心产区随机抽取60只具有独立血统的小尾寒羊。用水平板淀粉凝胶电泳法检测编码血液酶和其他蛋白质(以及控制非蛋白遗传变异)的14个结构基因座上的频率分布,并记录其9项形态学特征标记以及9项体尺指标,分析总体频率样本估计值的可靠性与精确性,结果表明:在所检测的14个结构基因座上,小尾寒羊在座位上是单态性的,而其他10个座位皆存在多型现象,且群体的平均杂合度为0.3114;在所检测的9项形态学特征标记上存在5项指标的多型现象。

同羊群体遗传共适应特性研究

在电泳检测中性结构基因座的基础上采用共显性-共显性模型探讨同羊群体遗传共适应特性。结果表明,在Hb-β-Cat、Tf-ME和CA-ME基因座组合中均存在遗传共适应现象,而且遗传共适应起关键作用,维持着座位间的遗传平衡或者使座位间处于遗传不平衡状态。

绵羊和山羊基于两种标记的遗传分化初步研究

对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的随机样本分别进行14个结构基因座和7个微卫星标记的遗传检测,比较由2种遗传标记获得的群体基因平均杂合度、多态信息含量及群体有效等位基因数,分别根椐2种类型的基因频率资料,计算3个群体问的标准遗传距离并加以比较。结果表明:由微卫星等位基因频率获得的群体基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数显著大于由结构基因座获得的,由结构基因座资料计算的3个群体间标准遗传距离为0.026 8-0.248 7,微卫星标记资料计算的3个群体间标准遗传距离为0.232 1-1.231 3,绵山羊群体间显著大于绵羊间。结构基因座和微卫星标记一致揭示了3群体内的遗传变异程度由大到小依次为同羊、湖羊、长江三角洲白山羊;微卫星标记较结构基因座标记更能表达近缘种间进化趋异水平;可将FCB11、MAF33、AE101、FCB128及FCB304位点作为研究绵山羊近缘种间遗传分化的标志性位点。

小尾寒羊与湖羊遗传检测的比较

以我国特有的两大优良绵羊品种小尾寒羊和湖羊为检测对象,采用中心产区典型群随机抽样法,从小尾寒羊中心产区山东省梁山县和湖羊中心产区浙江省湖州市分别抽取小尾寒羊60只和湖羊63只,用水平板淀粉凝胶电泳检测11个结构基因座的频率,观测9项相对形态学特征标记的表型频率,测定其体尺,记录当地生态环境特征,从结构基因座、形态学特征和生态特征3个方面对两者间的遗传差异进行定量分析。结果表明:小尾寒羊在A l、E s-D、Ly座位上是单态性的,而湖羊仅在A l、E s-D上是单态性的;小尾寒羊的基因平均纯合度高于湖羊;两者除在角的有无和色斑上存在差异外,其他表型特征基本相似;在生态特征方面,湖羊产区与小尾寒羊产区相比,海拔低、年平均气温高、降水量充沛。