中卫山羊早期体型及羊毛性状的遗传参数估计

本研究通过对国家级保护品种中卫山羊15个初生时期和35日龄的体型和羊毛性状的遗传力、遗传相关和表型相关进行估计,分析了性别和出生年份固定效应对这些性状的影响,旨在为中卫山羊的保种工作提供参考。运用DMU软件的DMUAI模块,用单性状动物模型估计遗传力,用多性状动物模型估计遗传相关与表型相关。结果发现,除了35日龄的肩部和臀部毛弯曲数的遗传力小于0.1外其他各性状遗传力的范围为0.10~0.62,均属于中等或偏高遗传力,各性状遗传相关的范围为-0.799~0.991,表型相关的范围为-0.407~0.904。出生年份对除35日龄管围外的其余性状均有极显著影响,性别效应对所有体型性状均有显著影响,但对于初生时期2个毛长性状和35日龄的2个羊毛弯曲数性状影响不显著。中卫山羊早期体型和羊毛性状具有选育提高潜力,可将初生体长和毛股长作为中卫山羊早期选择性状。

鄂尔多斯细毛羊KAP15-1和KAP27-1基因多态性及其与羊毛性状的关联分析

本研究旨在鉴定细毛羊主要经济性状相关的分子标记,以462只1岁鄂尔多斯细毛羊母羊为实验动物,联合DNA混池测序和Snapshot技术,检测KAP15-1基因和KAP27-1基因多态性。采用SAS 9.2对非同义突变位点和鄂尔多斯细毛羊羊毛性状进行相关性分析,利用DNASTAR软件预测蛋白质二级结构。结果显示:KAP15-1基因的SNP1突变位点对羊毛纤维直径标准差和纤维直径变异系数有显著影响;SNP1突变位点对蛋白质二级结构的影响集中在60~80号氨基酸之间。KAP27-1基因的SNP3突变位点对羊毛平均纤维直径有显著影响,对纤维直径标准差和剪毛前体重影响极显著;SNP3突变导致的蛋白质二级结构变化分布在整个氨基酸序列上,但是集中在Beta、Turn、Coil Regions和Antigenic Index部分。综上,KAP15-1基因的SNP1突变和KAP27-1基因的SNP3突变影响鄂尔多斯细毛羊羊毛纤维直径,在实际育种中可作为该性状的潜在分子标记。

基于皮肤组织转录组学和蛋白质组学测序揭示影响羊毛性状的关键基因

目的羊毛是高档纺织原料,羊毛的物理性质直接关系到羊毛品质。本研究旨在挖掘影响羊毛性状的基因,探索影响羊毛性状的复杂分子机制。方法本研究选取萨福克羊和小尾寒羊各3只作为试验样本,取背部皮肤组织,采用转录组学(RNA-seq)和蛋白质组学测序分析造成羊毛性状差异的基因、蛋白质及相关信号通路。结果转录组测序表明:测序完成后,共得到230406674个原始数据和222049370个干净数据,其中Q20碱基百分比为99.9%以上,Q30碱基百分比为98%以上。以差异倍数FC≥1.4或FC≤0.714且P<0.05作为标准,由此筛选出1213个差异表达基因(DEGs),其中萨福克羊与小尾寒羊相比,上调基因有644个,下调基因有569个。GO富集发现中间丝、钙离子结合、角蛋白丝显著富集,表明其可能与羊毛性状相关。KEGG富集发现,影响羊毛性状的信号通路可能是ECM-受体相互作用。蛋白质组测序表明:以差异倍数FC≥1.4或FC≤0.714且P<0.05作为标准,由此筛选出99个差异表达蛋白(DEPs),其中萨福克羊与小尾寒羊相比,上调蛋白有47个,下调蛋白有52个。GO富集发现中间丝等显著富集,表明其可能与羊毛性状相关。KEGG富集发现,影响羊毛性状的信号通路可能是过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路和ECM-受体相互作用。转录组与蛋白质组联合分析发现:转录组和蛋白质组均检测到的显著差异基因共有15个,其中13个为正相关,2个为负相关。中间丝显著富集,其中涉及的KRT35、KRT13、KAP13-1-like基因可能是影响羊毛性状的关键候选基因,PPAR信号通路显著富集,可能是影响羊毛性状的关键候选通路,FABP4基因可能是影响羊毛性状的关键候选基因。结论KRT35可能影响羊毛直径和弯曲;KRT13可能影响羊毛分化;KAP13-1-like可能影响羊毛硬度和韧性;FABP4可能影响羊毛直径。这些结果将扩展对影响绵羊羊毛性状的复杂分子机制的理解,并为后续的研究提供基础。

IGFBP-3基因多态性及其与中国美利奴羊部分羊毛性状的关联性分析

采用PCR-SSCP方法对中国美利奴羊和哈萨克羊中IGFBP-3基因的多态性进行了检测,并对不同基因型与中国美利奴羊部分羊毛性状间的关联性进行了分析。结果在位于内含子1区的一段178bp的扩增产物经SSCP分析后出现了3种基因型,基因型AA、AB和BB及等位基因A、B在中国美利奴羊中的频率分别为0.70、0.24、0.06和0.82、0.18;在哈萨克羊中的频率分别为0.87、0.13、0.00和0.93、0.07。序列分析发现:在该序列的122位碱基表现多态性(g.122G>T)。所研究的两个群体在该位点上均处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.01)。不同基因型对部分羊毛性状有一定的影响:不同基因型个体在剪毛后体重和净毛率上没有明显差异。AA、AB及BB基因型个体的羊毛伸直长度逐渐变短,其中AA与AB基因型之间差异极显著(P<0.01)。AA型个体的剪毛量和羊毛密度要明显低于AB型(P<0.01)和BB型个体(P<0.05);羊毛纤维直径则明显高于AB型(P<0.01)和BB型(P<0.05)个体。

BMPR1B基因在细毛羊皮肤毛囊中的表达及与羊毛性状关系的研究

本研究旨在探讨BMPR1B基因在皮肤毛囊的表达及与羊毛性状的关系,为解析其对羊毛相关性状的调控机理奠定理论基础。以敖汉细毛羊为研究材料,分别采集肩部(多毛区)和腹股沟部(少毛区)皮肤组织样。通过基因芯片技术,分析BMPR1B基因在皮肤不同部位表达量的差异;应用实时荧光定量PCR技术,检测BMPR1B基因在细毛羊肩部的表达量,并与羊毛性状和毛囊密度进行关联性分析;应用免疫组化方法,定位BMPR1B基因在细毛羊毛囊中表达的位置。结果表明:BMPR1B基因在肩部和腹股沟部均有表达,且在肩部表达量较高,差异倍数在2倍以上(P<0.05);关联分析显示,BMPR1B基因的m RNA表达量与羊毛细度呈显著正相关,相关系数为0.382(P<0.05);免疫组化结果显示,BMPR1B基因在细毛羊皮肤中,主要表达于表皮上皮细胞和内根鞘细胞中。综上,可推测在内根鞘中表达的BMPR1B基因,可能对羊毛细度具有调控作用,这可对细毛羊的育种实践提供理论参考。

凉山半细毛羊微卫星标记与羊毛性状的相关分析

利用微卫星技术对凉山半细毛羊核心育种群206个个体第1、2、3、9号染色体上的18个微卫星位点进行研究,检测其基因型,利用SAS程序下的GLM对18个微卫星位点与羊毛性状的关系进行方差分析和多重比较,结果发现7个微卫星位点对部分羊毛性状存在显著或极显著影响,同时,在这些位点上找到对羊毛性状有利的基因型。

微卫星座位与超细型细毛羊羊毛性状的关联性分析

本研究选取了绵羊基因组1号和3号染色体上的8个微卫星座位,对超细型细毛羊的232个个体的遗传多样性进行了检测。计算了各微卫星座位的等位基因频率(p)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(N)。同时检测了研究样本的羊毛纤维直径(WFD),毛纤维直径离散度(FD-D),单纤维绝对强力(WAS),单纤维相对强力(WRS),强力离散(WSD),单纤维自然长度(WNL),单纤维伸直长度(WEL)和单纤维弯曲度(FW)等羊毛性状的8个表型数据。微卫星座位与羊毛性状表型数据的关联性分析结果表明,微卫星BL-4和KRT2-13两个座位与WEL之间极显著相关(P<0.01)。微卫星Oarcp43座位与WSD之间、微卫星座位Bms1248与羊毛单纤维直径之间极显著相关(P<0.01)。座位Fcb5和OarDB6分别与FW和WAS表现出显著性关系(P<0.05)。

角蛋白关联蛋白基因与羊毛性状关系的研究进展

综述了与羊毛性状有关的角蛋白关联蛋白基因的定位、生物学功能及其与羊毛性状之间的关系,旨在为绒毛用羊品种改良和分子标记辅助选择育种提供理论基础。

绵羊角蛋白中间丝I型基因多态性及其与羊毛性状的关系

采用PCR-RFLP分子标记技术,检测了湖羊、哈萨克羊及中国美利奴多胎羊、"A"型羊和细型、超细型羊5个群体,共314只个体,角蛋白中间丝I型基因第1外显子的遗传多态性,并进行与绵羊羊毛性状相关性分析。结果表明:480 bp PCR产物经M spⅠ消化分析后在5个绵羊群体中均有2个等位基因突变(M占0.910 8,N占0.089 2)和3种基因型(MM占0.839 2,MN占0.141 5,NN占0.019 3),优势等位基因M基因频率比欧洲绵羊和印度绵羊品种高。序列比对发现,第1个M spⅠ酶切位点发生1个碱基C→T突变(g.160 C>T)。中国美利奴羊在该位点处于Hardy-W e inberg不平衡状态(P<0.05),其中中国美利奴细型、超细型群体在该位点处于Hardy-W e inberg极不平衡状态(P<0.01)。该位点与羊毛纤维直径不相关。

利用mRNA差异显示技术筛选绵羊毛性状相关基因

利用mRNA差异显示技术(DD-PCR),比较绵羊肩、腹、腿三部位皮肤中mRNA的差异表达,共获得差异表达的cDNA片段16条,其中肩部、腹部与腿部之间的差异较大;对所有16条差异片段进行测序并在GENBANK中进行检索,未发现有同源序列。提示16条cDNA片段可能为未发现的基因片段,也可能存在假阳性片段。

新吉细毛羊KAP24.1基因多态性及羊毛性状的相关性分析

为了解角蛋白关联蛋白(KAP)24.1基因在新吉细毛羊群体中的多态性与其毛用性状的关联性,试验采用DNA测序法对新吉细毛羊基因组编码区进行测序,找出基因突变位点,然后采用PCRSSCP技术对497只新吉细毛羊KAP24.1基因编码区序列进行多态性分析,并利用最小二乘模型对其多态性与产毛量、纤维直径、拉伸长度进行关联性分析。结果表明:在编码区有两处突变点,一处在348 bp处发生C→T的突变,脯氨酸突变为亮氨酸;另一处在414 bp处发生T→C的突变,丝氨酸突变为脯氨酸,均属于错义突变,KAP24.1基因的AA、AB、BB和CC基因型与纤维直径不相关(P>0.05),BB基因型的产毛量和拉伸长度显著大于AB基因型、CC基因型(P<0.05)。说明KAP24.1基因可以作为新吉细毛羊产毛量和拉伸长度主要候选基因之一,BB基因型可以作为分子标记用于预测绵羊产毛量和拉伸长度。

青海高原放牧季节对羊毛性状的生态作用

依据牧草开始生长发育的温度指标，结合降水量、湿度，以及产草量和牧草养分变化、放牧羊只的增重动态、羊群放牧活动的季节性变迁，将高寒草原地区划分为暖、冷两个畜牧季节。按照所划分的季节，分别采集青海半细毛羊的体侧部毛样，通过测量羊毛的主要性状值，用量化指标来反映暖、冷季节的生态作用。暖季５个月，生长了毛丛长度的７０％以上，而冷季长达７个月，只生长毛丛长度的３０％左右。毛纤维直径暖季比冷季粗６μｍ，品质支数相差３～４个档级，由此造成了羊毛单纤维的季节性细度。羊毛含脂率、强度、伸度、氨基酸含量及总含硫量、鳞片特征等性状指标都不同程度地存在季节间差异。

影响绵羊羊毛性状的主效基因和QTL

在绵羊中已经发现了许多影响重要经济性状的主效基因,其中包括影响色素沉着、羊毛质量和角蛋白等的主效基因,而角蛋白对羊毛纤维的形态特征有着重要影响。在羊毛质量和产量性状上,基因图谱研究已经发现了与其变异相联系的染色体区域。现在面临的主要挑战就是建立一种有价值的分子技术方法来提供绵羊的遗传进展。

BMP7基因在细毛羊皮肤毛囊中的表达及与羊毛性状的关系

本研究旨在探讨BMP7基因皮肤毛囊的表达及与羊毛性状的关系,为解析其对羊毛相关性状的调控机理奠定理论基础。实验以敖汉细毛羊为研究材料,分别采集肩部(多毛区)和腹股沟部(少毛区)皮肤组织样。通过基因芯片技术,分析BMP7基因在皮肤不同部位表达量的差异;应用实时荧光定量PCR技术,检测BMP7基因在细毛羊肩部的表达量,并与羊毛性状进行关联分析;应用免疫组化方法,定位BMP7基因在细毛羊毛囊中表达的位置。结果表明:BMP7基因在肩部和腹股沟部均有表达,且腹股沟部表达量较高,差异倍数在2倍以上(P<0.05);关联分析显示,BMP7基因的m RNA表达量与羊毛长度呈显著负相关,相关系数为-0.373(P<0.05);免疫组化结果显示,BMP7基因在细毛羊皮肤中,主要表达于表皮上皮、皮脂腺和外根鞘细胞中,在毛干细胞中有少量表达。综上,推测在毛干中表达的BMP7基因,可能对羊毛长度的增长具有一定的抑制作用。

鄂尔多斯细毛羊LMNB1基因和TXNIP基因多态性与羊毛性状关联分析

该研究旨在寻找细毛羊主要经济性状的分子标记。以462只周岁鄂尔多斯细毛羊母羊为试验动物,联合DNA混池和Snapshot技术,检测LMNB1基因和TXNIP基因多态性,采用SAS9.2对LMNB1基因和TXNIP基因突变位点与羊毛性状进行关联分析。结果表明:鄂尔多斯细毛羊的LMNB1基因有1个Indel(Indel1)、4个SNP同义突变(SNP1、SNP2、SNP3、SNP4);TXNIP基因在3'UTR区有1个突变(SNP5)。LMNB1基因Indel1-SNP1突变位点ATCT基因型和TTTT基因型群体纤维直径变异系数显著高于AACC基因型(P<0.05),ATCT基因型和TTTT基因型之间差异不显著(P>0.05);TXNIP基因SNP5突变位点TT基因型平均纤维直径显著高于CT基因型(P<0.05),极显著高于CC基因型(P<0.01);CC基因型和CT基因型之间平均纤维直径差异不显著(P>0.05)。结果提示,TXNIP基因SNP5可作为影响鄂尔多斯细毛羊绒毛纤维直径的分子标记,为鄂尔多斯细毛羊超细型群体的选育提供试验依据。

滩羊二毛期羊毛性状分析及其相关性研究

本试验旨在探究滩羊二毛期羊毛性状及其相关性,采集出生当天(初生期)及30～40日龄(二毛期)的滩羊样本各511个,其中公羊260只,母羊251只,分别测定初生期和二毛期羊毛的侧部毛长和侧部弯曲数;并分析了二毛期两型毛和绒毛的平均纤维直径(MFD)、平均纤维曲率(MFC)、毛纤维直径变异系数(CVFD)和毛纤维直径标准差(FDSD),对羊毛性状进行描述性统计及相关性分析。结果显示:初生期滩羊羊毛侧部弯曲数和初生期侧部毛长呈极显著中等正相关(r=0.410,P<0.001);初生期侧部弯曲数和二毛期侧部弯曲数间存在极显著中等正相关(r=0.618,P<0.001);两型毛FDSD与CVFD间呈极显著强正相关(r=0.796,P<0.001),绒毛FDSD与CVFD间极显著强正相关(r=0.942,P<0.001);两型毛MFD与FDSD呈极显著中等正相关(r=0.511,P<0.001),绒毛MFD与FDSD呈极显著中等正相关(r=0.660,P<0.001);绒毛MFD与CVFD呈极显著中等正相关(r=0.410,P<0.001),两型毛MFD与CVFD呈显著弱负相关(r=―0.106,P<0.05);绒毛MFD和MFC间呈极显著中等负相关(r=―0.497,P<0.001),两型毛MFD和MFC间呈弱正相关,相关性不显著(r=0.011,P>0.05)。本试验首次大规模检测了滩羊二毛期羊毛的性状指标,确定了各指标间的相关关系,为滩羊裘皮性状的选育提供数据支撑。

DSG4基因的SNPs筛查及其与裘用绵羊羊毛性状关系的研究

应用PCR-SSCP方法检测118只滩羊和82只小尾寒羊与滩羊杂交羊DSG4基因的多态性,用最小二乘法分析该基因多态性与毛股长度和弯曲数的关系。结果发现16个SNPs和1个TTG插入/缺失,其中在5′调控区和3′调控区各有1个SNP;11个SNPs位于外显子区域,其中4个为错义突变,TTG插入/缺失使丝氨酸替换为异亮氨酸并引起甘氨酸的插入/缺失;其余3个SNPs位于内含子区域。DSG4基因编码区的6处碱基变异与3′调控区的1个SNP处于完全连锁不平衡,组合基因型命名为PPRR、PQRS和QQSS。杂交羊QQSS基因型的初生肩部毛股长度、初生肩部毛股弯曲数以及二毛(1月龄左右)肩部毛股弯曲数的最小二乘均值极显著大于PPRR和PQRS基因型所对应的值(P<0.01);QQSS基因型的二毛股部毛股弯曲数的最小二乘均值显著大于PPRR基因型(P<0.05),但与PQRS基因型差异不显著(P>0.05)。滩羊QQSS基因型上述性状的最小二乘均值也大于PPRR和PQRS基因型,但差异不显著(P>0.05)。本研究初步表明,QQSS基因型可能是裘用型绵羊毛股长度和弯曲数的有利基因型,本研究的结果为阐明DSG4基因对绵羊羊毛性状的影响提供了较丰富的分子素材。

青海细毛羊周岁前体重和羊毛性状遗传参数估计

估测了青海细毛羊六个主要数量性状的表型参数和遗传参数,结果表明:青海细毛羊初生重,断奶毛长和周岁体重的遗传力分别为0.380,0.650和0.353,表型选择可收到良好的效果;周岁体重与周岁毛量间的遗传相关为0.847,断奶重与周岁重,用岁毛量间的遗传相关分别为0.480和0.327,因此,断奶重可作为早期选择性状来考虑。