增强子及相关调控组在肠型胃癌中的重塑特征及其预后预测模型

目的研究组蛋白H3K27ac修饰在肠型胃癌的全基因组分布情况,探讨其增强子及相关调控组重塑特征,建立临床预后评估模型。方法收集于2022年1-12月在我院消化内科就诊患者的15例肠型胃癌组织与18例正常胃黏膜组织进行靶向H3K27ac修饰的染色质靶向捕获(cleavage under targets and tagmentation,CUT&Tag)测序,采用生物信息学分析,比较两种组织H3K27ac修饰在基因组的分布差异;基于H3K27ac修饰分布特征,鉴定增强子元件,探讨增强子及相关调控组的重塑特征;采用单因素Cox和多因素Cox等回归分析方法,构建增强子相关靶基因的预后预测模型。结果两种组织的H3K27ac修饰的基因组分布特征无明显差异,主要位于增强子区域;与正常胃黏膜相比,肠型胃癌增强子H3K27ac修饰的整体水平更高;共鉴定出8847个在肠型胃癌中活性增加的增强子(获得性增强子),占所有增强子的8.3%,其可能促进胃癌细胞增殖、黏附等恶性行为;联合6个获得性增强子相关靶基因(BHLHE41、CEP97、CHI3L2、NR6A1、SUPT3H和TOMM20)构建的预测模型,能够较好地推测患者总体生存期。结论增强子重塑是肠型胃癌显著的表观遗传学特征之一,增强子可能通过上调MYC、E2F3等基因表达促进癌细胞恶性增殖与黏附行为,并基于增强子靶基因构建预后模型。

肠型胃癌基因表达的cDNA微阵列分析

目的:研究肠型胃癌发生发展的基因表达变化. 方法:利用肠型胃癌和相应非癌组织的mRNA通过逆转录方法,将Cy3和Cy5两种荧光分别标记到两种cDNA上制成探针,然后与表达谱芯片(含4 096条基因)进行杂交后扫描,通过计算机辅助判别基因的差异表达. 结果:肠型胃癌和相应非癌组织组织中差异表达的基因有666条,上调表达333条,下调表达333条.参与细胞增生、凋亡、分化和转移调控的多种基因的表达水平发生了明显改变. 结论:高通量、高灵敏度的cDNA微阵列芯片技术提供了全面了解肠型胃癌基因表达谱的新思路,一些与肿瘤发生相关的差异表达基因有可能发展成为生物标记物或肿瘤早期诊断和治疗的靶点.

肠型胃癌中LDH-A与HDAC1表达的相关性研究

目的探讨乳酸脱氢酶A(LDH-A)与组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)在肠型胃癌中表达的相关性及其与预后的关系。方法应用Western blotting法检测HDAC1蛋白在慢病毒介导的LDH-A siRNA转染肠型胃癌细胞株SGC7901中表达的变化;应用免疫组织化学方法检测661例肠型胃癌组织及癌旁正常组织中LDH-A与HDAC1蛋白的表达情况并分析其表达与预后的关系。结果 Western blotting检测结果显示,LDH-A蛋白在SGC7901细胞株中的表达明显上调,且LDH-A的沉默可显著下调HDAC1的表达。肠型胃癌组织中LDH-A蛋白的高表达率为54.8%(362/661),明显高于癌旁正常组织的12.9%(85/661),两者差异有统计学意义(P<0.01);肠型胃癌组织中HDAC1的高表达率为51.3%(339/661),明显高于癌旁正常组织的15.4%(102/661),两者差异有统计学意义(P<0.01)。LDH-A与HDAC1蛋白在肠型胃癌组织中的表达呈正相关(r=0.324,P<0.001)。单因素生存分析结果显示,LDH-A与HDAC1均低表达患者的生存曲线明显优于其他组合(P<0.001);多因素生存分析结果显示LDH-A与HDAC1表达均为肠型胃癌独立的预后因素。结论在肠型胃癌中,LDH-A与HDAC1的表达呈正相关,采用LDH-A和HDAC1双靶点抑制治疗可能具有潜在的生存获益。

肠型胃癌细胞中酪蛋白激酶2相互作用蛋白1与转化生长因子β_1表达的相关性

目的探讨酪蛋白激酶2相互作用蛋白1(CKIP-1)与转化生长因子β1(TGF-β1)在肠型胃癌细胞中表达的相关性。方法 Western blotting方法检测不同分化肠型胃癌细胞(高分化MKN28细胞、中分化SGC7901细胞和低分化BGC823、MKN45及AGS细胞)中CKIP-1与TGF-β1表达,Spearman相关性分析CKIP-1与TGF-β1表达相关性;分别构建过表达及干扰表达CKIP-1的人肠型腺癌MKN28细胞模型,Westernblotting方法检测各组细胞TGF-β1表达。结果与高分化胃癌MKN28细胞相比,中分化SGC7901细胞与低分化BGC823、MKN45及AGS细胞CKIP-1表达均降低、TGF-β1表达均升高(P <0.01);与中分化SGC7901细胞相比,低分化BGC823、MKN45及AGS细胞CKIP-1表达降低、TGF-β1表达升高(P <0.01);Spearman相关性分析显示不同分化肠型胃癌细胞中CKIP-1与TGF-β1表达负相关(r=-0.689 2,P <0.01)。与空白对照组相比,CKIP-1过表达组MKN28细胞TGF-β1表达下降(P <0.01),CKIP-1干扰表达组MKN28细胞TGF-β1表达增加(P <0.01)。结论肠型胃癌细胞中CKIP-1与TGF-β1蛋白表达负相关,CKIP-1蛋白可能通过负性上调TGF-β1表达后促进了肠型胃癌的恶性转化、发展及浸润转移。

应用基因芯片技术筛查肠型胃癌发生发展中差异基因表达的研究

目的应用寡核苷酸芯片研究胃正常组织、慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生、慢性萎缩性胃炎伴非典型性增生和肠型胃癌黏膜的基因表达谱,筛选肠型胃癌发生相关基因。方法利用激光切割显微捕获联合基因芯片研究胃正常黏膜组织与慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生、慢性萎缩性胃炎伴非典型性增生和肠型胃癌黏膜组织研究肠型胃癌发展中的差异基因表达谱。结果在慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生、慢性萎缩性胃炎伴非典型性增生和肠型胃癌黏膜组织中,筛选出共同差异基因109个,其中有61个基因持续上调表达,48个基因持续下调表达,包括细胞信号传导、细胞周期相关基因、代谢酶类相关基因、细胞信号和传递蛋白、细胞外基质基因、原癌基因、抑癌基因、细胞黏附分子、生长因子、免疫相关基因、细胞骨架和运动相关蛋白、凋亡相关基因和肿瘤相关抗原等。将各组筛选出的基因进行聚类并结合各组临床病理资料统计分析后发现一些表达上具有特征意义的基因。其中ALDOB下调、CDX2和MUC2上调与Hp感染和肠化之间存在关联;Bim-1、hTERT、PTTG和COX2上调,TFF3下调与肠上皮化生和不典型增生具有相关性;Bim-1、PGA5、HAP1、STS和LIPF表达改变与胃癌Borrmann分型、Hp感染阳性率和淋巴结转移数目等存在关联;在慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生、慢性萎缩性胃炎伴非典型性增生和肠型胃癌黏膜共同差异基因中聚类分析并结合临床资料分析发现,ALDOB和TFF3表达下调与肠上皮化生具有负相关性,hTERT、COX-2和hMSH2上调和上皮非典型增生具有正相关。结论基因表达谱芯片能够快速筛选出肠型胃癌发生癌相关基因,有多种基因共同参与肠型胃癌发生的整个过程。

Nanog、Sox2、TFF3在肠型胃癌中的表达及其与肠型胃癌预后关系的研究

目的探讨Nanog、Sox2、TFF3在肠型胃癌中的表达及其与肠型胃癌预后的关系。方法回顾性分析60例肠型胃癌患者的临床资料,应用免疫组化法检测Nanog、Sox2、TFF3在肠型胃癌患者中的表达情况,分析其表达情况与患者临床病理特征及预后的关系。结果 60例肠型胃癌患者中,Nanog高表达者38例(63.3%)、TFF3高表达者33例(55.0%),Sox2低表达者35例(58.3%)。单因素分析结果显示,Nanog、TFF3、Sox2的表达情况与肠型胃癌患者的肿瘤浸润深度、淋巴结转移情况及TNM分期有关(P﹤0.05),与肠型胃癌患者的年龄、性别、肿瘤部位无关(P﹥0.05)。多因素分析结果显示,Nanog、Sox2、TFF3的表达情况与肠型胃癌患者的无病生存期和总生存期有关,同时具有Nanog高表达、TFF3高表达、Sox2低表达的肠型胃癌患者预后最差。结论Nanog、Sox2、TFF3可成为评价肠型胃癌患者预后的生物标志物,联合检测更利于判断肠型胃癌患者的预后。

尾侧同源盒转录因子2在胃粘膜肠上皮化生及肠型胃癌中的表达研究

目的探讨尾侧同源盒转录因子2(CDX2)在胃粘膜肠上皮化生(IM)及肠型胃癌(GC)中的表达。方法免疫组织化学染色方法检测CDX2在胃粘膜、IM、上皮异型增生和肠型GC中的表达;Spearman相关性分析CDX2表达与IM分型分级、异型增生分级以及肠型GC分化的相关性。结果与胃粘膜组相比,IM组CDX2高表达病例百分率显著增高(P<0.01);与IM组和异型增生组相比,肠型GC组CDX2高表达病例百分率降低(P<0.01,P<0.05);异型增生组CDX2高表达病例百分率稍低于IM组,但差异无统计学意义(P>0.05)。CDX2表达与肠型GC癌细胞分化相关(Rho=0.3491,P<0.01),癌细胞的分化越低,CDX2表达也越低,CDX2表达与IM分型及分级、异型增生分级不相关。结论CDX2蛋白可能参与了肠型GC的恶性转化,可能在肠型GC发生发展中发挥抑制作用。

肠化生和肠型胃癌内镜及病理特点分析

目的通过对肠化生及肠型胃癌病例的回顾性分析,探讨肠化生和肠型胃癌的关系以及影响肠化生的因素。方法收集1998～2003年间行胃镜检查的病例共14766人次进行统计分析。结果中、重度肠化生和肠型胃癌检出年龄呈递增趋势,各组间有显著性差异(P<0.01);肠型胃癌的检出年龄以胃角最小,与其他部位相比有显著的差异(P<0.01),胃窦、胃体、胃底和贲门癌之间年龄无显著性差异;肠型胃癌男女检出率分别为3.44%和1.18%,性别差异有显著性(P<0.01),中重度肠化生检出率分别为5.46%和5.17%,性别之间无显著差异(P>0.05);发生中度和重度肠化生的胃窦粘膜HP阳性检出率分别为37.44%和35.80%,较无肠化生和轻度肠化生病例高(30.19%);肠化生程度和粘膜萎缩程度相关。结论肠化生在年龄上早于肠型胃癌出现,肠化生与肠型胃癌性别上的分布不一致;中重度肠化生和HP感染有关;肠化生程度和萎缩程度相关。

肠上皮下肌成纤维细胞与肠型胃癌相关性的回顾性分析

目的检测肠上皮下肌成纤维细胞(ISEMF)在肠型胃癌中的表达及分布,初步探讨其与肠型胃癌之间的关系。方法应用免疫组织化学方法,采用α-肌动蛋白(α-SMA)单克隆抗体检测ISEMF在30例正常对照组胃黏膜及45例肠型胃癌中的分布与表达。结果肠上皮下肌成纤维细胞在正常胃黏膜中表达阳性率低且均为弱阳性,散在分布于腺体中间;在肠型胃癌中肠上皮下肌成纤维细胞表达阳性率高,在肿瘤组织间呈无规律的小片状分布。慢性胃炎对照组每高倍视野α-SMA阳性ISEMF为43.4±6.5,在早期肠型胃癌组每高倍视野α-SMA阳性ISEMF为72.3±8.2,两组间具有统计学差异(P<0.05)。结论α-SMA阳性ISEMF在早期肠型胃癌与正常胃黏膜间质中分布及表达均存在明显差异,在肠型胃癌黏膜间质中有增多的趋势,提示ISEMF参与了肠型胃癌的发生、发展过程。

肠化生皮下肌成纤维细胞标志物在肠型胃癌中的表达及其与Ki-67表达的相关性分析

目的探讨肠型胃癌与癌前病变患者病变处胃黏膜肌成纤维细胞内转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)、α-平滑肌肌动蛋白(α-smooth muscle actin,α-SMA)与Ki-67表达的相关性。方法选取2016年9月至2017年2月于本院行电子胃镜和病理组织检查的102例患者,收集并保存其资料,将其中67例确诊为肠型胃癌患者纳入观察组,35例癌前病变患者纳入对照组。采用免疫组织化学法检测肠化生皮下肌成纤维细胞内TGF-β、α-SMA及Ki-67的表达水平,并分析其相关性。结果观察组患者肌成纤维细胞内TGF-β、α-SMA、Ki-67阳性表达例数均显著多于对照组(P_均<0.05)。观察组中瘤体大小≥5 cm、未侵及浆膜层、淋巴结未转移及TNM分期Ⅰ~Ⅱ期患者的肌成纤维细胞中TGF-β、α-SMA及Ki-67阳性表达例数均显著增高(P_均<0.05)。TGF-β、α-SMA阳性表达在不同分化程度的肌成纤维细胞之间无显著差异(P均>0.05),低分化癌变细胞中Ki-67阳性表达显著增加(P<0.05)。Ki-67与TGF-β、α-SMA的相关性值分别为0.626、0.754(P_均<0.05),TGF-β、α-SMA表达与Ki-67表达均呈正相关。结论在胃黏膜细胞由良性发展为恶性癌细胞过程中,肠化生引起皮下肌成纤维细胞分泌的TGF-β、α-SMA与Ki-67表达均呈正相关,对临床进行肠型胃癌的早期预防具有一定参考价值。

cyclin E在肠型胃癌中的表达及意义

目的：探讨ｃｙｃｌｉｎＥ蛋白表达与肠型胃癌的临床病理特征及预后的关系。方法：以免疫组化法分析５９例肠型胃癌的ｃｙｃｌｉｎＥ蛋白表达情况。结果：正常胃粘膜上皮细胞呈阴性反应，而３０例（３０／５９）肠型胃癌组织被免疫染色。ｃｙｃｌｉｎＥ的异常表达与肿瘤的浸润深度显著相关，强阳性者５年生存率低。结论：ｃｙｃｌｉｎＥ的异常表达与肠型胃癌的发展有关。

HLA-Ⅱ类区6个基因位点在肠型胃癌中的突变情况

目的 :探讨HLA—Ⅱ类区的 (DQAl、DR2、DR3、DR4、DR7、DR9) 6个基因位点在中国人群肠型胃癌中的突变发生情况 ,进而探讨其是否与胃癌的发生易感性有关。方法 :采用PCR系列技术 (SSP -PCR和PCR/SS CP)。结果 :HLA -Ⅱ类基因区 6个基因位点基因型在个体中存在着明显多态性 ,PCR -SSCP结果显示DR4基因位点突变频率为 45 % ,明显高于其它几个基因位点。结论 :HLA—Ⅱ类基因区DR4基因的突变在国人肠型胃癌组织中较多见 。

双源CT能谱参数对Lauren弥漫型与肠型胃癌的鉴别诊断价值

目的:探讨双源CT能谱定量参数对Lauren弥漫型与肠型胃癌的鉴别诊断价值。方法:前瞻性搜集胃镜提示胃癌、术前行双源CT能谱增强扫描、术后病理确诊为Lauren弥漫型或肠型胃癌的患者61例,另搜集胃镜及能谱CT增强扫描均正常的25例患者为对照组。测量动、静脉期标准化碘浓度(ANIC、VNIC)及动、静脉期能谱曲线40~70 keV区间的斜率(λa、λv),采用单因素方差分析比较ANIC、VNIC、λa、λv在弥漫型胃癌组、肠型胃癌组及对照组间的差异,并绘制以上参数鉴别诊断弥漫型与肠型胃癌的受试者工作特征(ROC)曲线。结果:弥漫型胃癌组、肠型胃癌组、对照组的ANIC值分别为(21.4±2.22)%、(20.22±1.64)%、(18.96±1.76)%,VNIC值分别为(58.31±3.49)%、(55.40±3.70)%、(52.71±3.73)%,λa分别为-3.15±0.23、-3.01±0.22、-2.65±0.20,λv分别为-3.62±0.23、-3.37±0.22、-2.85±0.20,以上参数三组间差异均有统计学意义(P<0.05);能谱参数ANIC、VNIC、λa、λv鉴别诊断弥漫型与肠型胃癌的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.677、0.722、0.674、0.765;联合VNIC和λv鉴别诊断弥漫型与肠型胃癌的AUC为0.821,敏感度为0.750,特异度为0.758。结论:双源CT能谱参数在鉴别诊断Lauren弥漫型与肠型胃癌方面有一定价值。

肠型胃癌与癌前病变中α-SMA和TGF-β的表达及其与Ki-67的相关性研究

目的探究肠型胃癌与癌前病变中α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、转化生长因子-β(TGF-β)的表达及其与Ki-67的相关性。方法回顾性分析2016年4月至2018年6月确诊为肠型胃癌患者78例(观察组)和癌前病变患者33例(对照组)。分别检测胃黏膜组织细胞内α-SMA、TGF-β及Ki-67的表达水平和阳性细胞表达情况并分析三个指标的相关性及其与各病理因素的关系。结果观察组患者胃黏膜组织细胞中α-SMA、TGF-β和Ki-67阳性表达均明显高于对照组(P <0. 01),观察组患者胃黏膜组织细胞中α-SMA、TGF-β和Ki-67阳性细胞分布最高比率分别为41. 03%、37. 18%和42. 31%;不同分化程度癌细胞中α-SMA、TGF-β阳性表达差异无显著性(P> 0. 05),但分化程度越高,癌细胞中Ki-67阳性表达越少(P <0. 05);淋巴结是否转移、浸润程度不同和TNM分期不同细胞中α-SMA、TGF-β和Ki-67阳性表达数均存在明显差异(P <0. 05);α-SMA、TGF-β和Ki-67阳性表达相关系数分别为4. 791和4. 657,均呈正相关。结论胃黏膜组织细胞中在癌前病变至癌症发生过程中,α-SMA、TGF-β和Ki-67表达均呈正相关,为其作为标志物表征在胃癌发展过程提供理论依据。

Cdx2和PTEN在胃粘膜肠上皮化生及肠型胃癌组织中的表达

目的 :观察Cdx2及PTEN在胃粘膜病变中的表达。方法 :以正常胃粘膜作为对照 ,用免疫组化的方法检测Cdx2和PTEN在胃粘膜肠上皮化生和肠型胃癌组织中的表达情况。结果 :Cdx2在正常胃粘膜中没有表达 ,在肠上皮化生和肠型胃癌组织中明显增高 ,在肠型胃癌组织中Cdx2和PTEN水平显著低于肠上皮化生 ,两者表达模式相似。在不同类型肠化生中 ,小肠型肠化生Cdx2水平明显高于结肠型肠化生 ,而PTEN没有显著差异。结论 :Cdx2为肠上皮化生的特异性标志物 ,并与PTEN在肠型胃癌的多步骤多阶段过程中可能起到重要作用 ,而PTEN可能对Cdx2的表达起到正相调节作用。

基于数据挖掘分析PTGER3在肠型胃癌中的表达及临床意义

目的:探讨PTGER3在肠型胃癌中的表达及临床意义。方法:从GEO数据库的GSE29272数据集中下载58对肠型胃癌组织和癌旁组织的基因表达谱数据,筛选出差异表达基因,并利用DAVID数据库进行基因的功能富集分析。采用WGCNA软件对差异表达基因进行权重基因共表达网络分析,以挖掘出肠型胃癌发生发展过程中的关键调控基因。分析关键调控基因表达水平与肠型胃癌预后的相关性,并在Kaplan-Meier Plotter数据库中验证其预后意义。结果:共获得393个差异表达基因,DAVID功能富集分析显示它们主要涉及ECM受体相互作用、p53信号通路、PI3K-Akt信号通路和癌症信号通路等。PTGER3是癌症信号通路上的一个重要成员,在肠型胃癌组织中的表达明显上调。差异基因的共表达网络分析发现PTGER3是模块枢纽基因,与胃癌的发生发展关系密切。GSE29272数据集和Kaplan-Meier Plotter数据库的生存分析均显示PTGER3高表达与预后不良显著相关(P=0.034;P<0.001)。结论:PTGER3表达上调可能参与了肠型胃癌的发生发展,而且其高表达提示患者预后不良。

胃幽门螺旋杆菌感染与肠型胃癌的相关性研究

目的:研究胃幽门螺旋杆菌感染与肠型胃癌的关系。方法:光镜观察50例肠型胃癌手术切除标本,从发生部位、分化程度等方面观察胃幽门螺旋杆菌(HP)感染情况。结果:肠型胃癌中HP感染率高达68.5％,其中早期胃癌组中胃窦部癌HP感染率(61.1％)显著高于胃体部癌(28.6％,P<0.05)、结论:证实HP感染与肠型胃癌的发生关系密切。认为HP的致癌作用是因其长期的致炎性使胃粘膜上皮细胞最终发生突变而导致癌形成。

肠型胃癌的发生率、组织类型以及预后的研究——211例手术切除胃癌标本的病理学分析

本研究对211例手术切除胃癌标本进行病理学研究,“肠型胃癌”在所有胃癌中占79.2％,为宁夏地区胃癌的主要类型,与本地区萎缩性胃炎的高发互相平行,提示二者在病因发病学上密切联系,为宁夏胃癌的病因、癌前病变及预防的研究指出了方向。研究采用组织化学和形态学们结合的方法。