hsp65 and rpoB PCR-RFLP用于龟/脓肿分枝杆菌复合群种的快速鉴定(英文)

目的探讨和评价hsp65and rpoB PCR-RFLP用于龟/脓肿分枝杆菌复合群种的快速鉴定。方法收集经PNB/TCH鉴别培养基表型鉴定和16s rRNA基因测序鉴定为龟/脓肿分枝杆菌复合群的临床分离菌株,用hsp65and rpoBPCR-RFLP进行种/亚种鉴定。结果经表型鉴定为非结核分枝杆菌的27株临床菌株,16s rRNA基因测序分析与龟/脓肿分枝杆菌的同源性达到99.7%。经hsp65PCR-RFLP and rpoBPCR-RFLP鉴定18株为脓肿分枝杆菌(M.abscessus),4株为溃疡分枝杆菌(M.absecces),另5株表现为独特的指纹特征,可能是一个新的亚种。结论能够快速进行龟/脓肿分枝杆菌复合群种/亚种的鉴定。

脓肿分枝杆菌复合群药敏试验及耐药机制研究进展

脓肿分枝杆菌复合群是非结核分枝杆菌病中最常见的快速生长型分枝杆菌之一,对大多数抗结核药物耐药,临床治疗难度大。脓肿分枝杆菌复合群的3个亚种对多种抗生素的敏感性存在较大差异,临床实验室对其3个亚种的准确分型鉴定对于治疗药物的选择有重要价值。中华医学会结核病学分会制定了非结核分枝杆菌病诊断与治疗指南(2020版),按照美国临床和实验室标准协会(CLSI)分枝杆菌药敏试验标准(2018版)进行脓肿分枝杆菌药敏试验,建议根据药敏试验结果选用多药联合治疗方案。现就脓肿分枝杆菌复合群药敏试验及对主要治疗药物的耐药机制的研究进展进行综述。

多靶位基因测序快速鉴定脓肿分枝杆菌复合群

目的 探讨和评价多靶位基因测序联合分析的方法用于脓肿分枝杆菌复合群的快速菌种鉴定.方法 收集经PNB/TCH鉴别培养基表型鉴定和16S rRNA基因测序鉴定为脓肿分枝杆菌复合群的临床分离株,再应用hsp65和rpoB基因测序的联合分析进行种/亚种的鉴定.结果 经表型鉴定为非结核分枝杆菌的52株临床分离菌株,16S rRNA基因测序比对分析与脓肿分枝杆菌的同源性高达100%.最后经hsp65和rpoB测序及16S rRNA基因序列的联合分析鉴定40株菌株为脓肿分枝杆菌脓肿亚种,10株为脓肿分枝杆菌马赛亚种以及2株脓肿分枝杆菌bolletii亚种.结论 16S rRNA、hsp65和rpoB三个靶位基因测序联合分析的方法能够快速将脓肿分枝杆菌复合群分离株鉴定至亚种的水平.

脓肿分枝杆菌复合群病研究进展

脓肿分枝杆菌复合群(Mycobacterium abscessus complex,MABC)是一种备受关注的快速生长型非结核分枝杆菌,在全球范围内其分离率持续攀升。由于脓肿分枝杆菌肺病与肺结核的症状相似,且MABC不但具有高水平天然、适应性和获得性的抗菌药物耐药性,而且不同亚种治疗方法不同,加大了治疗难度,患者往往难以获得良好的治疗效果。本文就MABC的基本特性、常见的抗菌药物耐药机制,以及诊断和治疗等研究进展进行阐述,为将来的研究和治疗提供有效的参考和启示,以便更好地预防和治疗MABC病,保障人们的健康。

广东地区脓肿分枝杆菌复合群对克拉霉素的耐药机制研究

目的探讨脓肿分枝杆菌复合群(MABC)对克拉霉素的耐药机制,为MABC肺病诊治提供依据。方法对广州市胸科医院冻存的191株龟-脓肿分枝杆菌复合群进行hsp65、rpoB、ITS多靶位基因菌种鉴定,确定为MABC的菌株进行克拉霉素最低抑菌浓度(MIC)药敏,延长培养时间至14 d,记录3、7、10、14 d的MIC值,观察MABC对克拉霉素诱导耐药情况,并对耐药相关基因rrl和erm(41)进行测序,研究克拉霉素耐药表型和基因型的关系。结果 191株龟-脓肿分枝杆菌复合群经多靶位基因法鉴定出2株龟分枝杆菌,189株MABC,其中111株脓肿分枝杆菌,78株马赛分枝杆菌。111株脓肿分枝杆菌中,克拉霉素获得性耐药1株,获得性耐药率0.9%;克拉霉素诱导耐药78株,诱导耐药率70.3%;总耐药株79株,总耐药率71.2%;78株马赛分枝杆菌无诱导耐药,克拉霉素获得性耐药5株,获得性耐药率6.4%;总耐药株5株,总耐药率为6.4%;脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌总耐药率和获得性耐药率差异均有统计学意义(P<0.05)。6株克拉霉素获得性耐药菌株中,rrl突变的菌株5株,突变率为83.3%;所有的脓肿分枝杆菌erm(41)序列完整,所有的马赛分枝杆菌erm(41)序列有短缺;111株脓肿分枝杆菌,T28序列型菌株84株、C28序列型菌株27株。78株马赛分枝杆菌皆为T28序列型。结论 MABC为我国较为常见的非结核分枝杆菌,耐药率高,可用药物有限,治疗困难,主要菌种为脓肿分枝杆菌,根本的原因在于克拉霉素诱导耐药,准确的菌种鉴定、可靠的药敏试验对指导MABC肺病的临床治疗有重要意义。

脓肿分枝杆菌复合群致人工关节置换术后假体周围感染的文献分析

目的分析脓肿分枝杆菌复合群(MABC)引起人工关节置换术后假体周围感染(PJI)的文献,探讨MABC致PJI的治疗现状及药学监护。方法检索中国知网、万方、中国生物医学文献服务系统、PubMed、ScienceDirect、Springer Link、Wiley Online Library等数据库,自建库以来至2020年9月30日期间符合纳入标准的病例资料。统计MABC致PJI的患者基线信息、外科治疗、抗感染药物治疗等情况,分析MABC致PJI的治疗方案及药学监护。结果各大数据库中共检索出14篇关于MABC致PJI的个案报道,有效病例15例;外科治疗方法主要包括关节穿刺术、开放清创术、二期翻修术;抗感染治疗强调根据药物敏感性结果长期联合用药,常见药品不良反应为阿米卡星的耳、肾毒性及替加环素的胃肠道反应。结论MABC是PJI罕见且难治的病原菌,需要外科手术联合抗感染药物治疗。患者在接受长期治疗的过程中易发生不良反应,临床药师应积极开展药学监护工作。

微阵列芯片法和多同源基因序列测序在非结核分枝杆菌菌种鉴定中的差异

目的比较微阵列芯片法和多同源基因序列测序在非结核分枝杆菌(NTM)菌种鉴定中的差异,为NTM感染提供精准诊断依据。方法采用罗氏固体培养法复苏天津市海河医院2016—2019年保存的170株NTM菌株,分别采用微阵列芯片法和同源基因序列[16S rRNA、RNA聚合酶亚基B(rpoB)、热休克蛋白65(hsp65)]测序进行鉴定。以多同源序列测序分析结果为参考,分析微阵列芯片法菌种鉴定的准确性。比较2种方法样本周转时间(TAT)的差异。结果微阵列芯片法鉴定出8个NTM菌种,同源序列测序鉴定出14个。微阵列芯片法无法鉴定出缓慢生长群的猿分枝杆菌、慢生黄分枝杆菌、副瘰疬分枝杆菌和快速生长群的龟分枝杆菌、马德里分枝杆菌、母牛分枝杆菌等10个菌种,多同源序列测序可鉴定出全部的菌种。以多同源序列测序分析结果为参考,微阵列芯片法鉴定错误7株,鉴定到复合群的正确率为90.0%(153/170);16S rRNA、rpoB、hsp65单独和3个同源序列联合分析鉴定到复合群的正确率分别为93.5%、98.8%、99.4%和100.0%。对于微阵列芯片法无法区分的53株龟/脓肿分枝杆菌复合群(MABC),3个同源序列联合测序鉴定出6株龟分枝杆菌、25株MABC脓肿亚种、20株MABC马赛亚种和2株MABC bolletii亚种。微阵列芯片法单个样本鉴定TAT为8 h,170株NTM菌株全部鉴定需要2 d;多同源序列测序单个样本鉴定TAT为3 d,170株NTM菌株全部鉴定约需要5 d。结论微阵列芯片技术可快速鉴定临床常见分枝杆菌。多同源基因序列测序不仅可鉴定临床常见分枝杆菌,还可鉴定微阵列芯片法无法鉴定出的菌种和可能鉴定错误的菌种及其亚种,但所需时间较微阵列芯片法长。

广州地区2018-2021年非结核分枝杆菌临床分离株菌种鉴定结果分析

目的 分析广州地区非结核分枝杆菌(NTM)的菌种分布及NTM肺病(NTM-PD)状况变化,为NTM-PD的防治提供参考依据。方法 收集2018-2021年广州市胸科医院住院及门诊就诊患者的痰液、支气管冲洗液、脓液、尿液、浆膜腔积液、脑脊液和穿刺物等分枝杆菌培养阳性(BACTEC MGIT 960和改良罗氏法)的标本,对培养物阳性分枝杆菌菌株18 501株进行菌群鉴定,将所有鉴定为NTM的菌株用16S rRNA基因测序方法进行菌种鉴定,剔除重复后的菌株共检出NTM 6 558株。对NTM菌种来源、菌种分布、性别、年龄等不同特征进行分析。结果采用SPSS 23.0统计学软件进行统计分析。率的比较采用χ2检验,以P <0.05为差异有统计学意义。结果 2018-2021年各种标本培养分枝杆菌阳性的18 501株,采用基因芯片法进行菌种鉴定,NTM检出率为35.45%(6 558/18 501),其中痰与支气管冲洗液的总检出率为36.67%(6 426/17 522);6 558株NTM(按年度剔除重复病例计算)共来自于4 336例患者,各年间NTM分离率分别为28.01%、29.04%、29.63%、31.68%;四年间总的病例数3 624例,NTM感染患者分离率27.98%(3 624/12 950);前5位菌种分布为:MAC 1 305例(36.01%)、龟-脓肿分枝杆菌复合群1 240例(34.22%)、堪萨斯分枝杆菌286例(7.89%)、偶发分枝杆菌285例(7.86%)、戈登分枝杆菌137例(3.78%)。男女性别比为1∶139(1 694∶1 930),高峰年龄段均为51~70岁(占46.36%)。结论 广州地区近年来NTM检出率呈逐年上升趋势,菌种分布种类多样,流行的菌种以鸟-胞内分枝杆菌和龟-脓肿分枝杆菌为主的稳定状态,中老年患者易感,女性人群应重点关注、探讨更适用于临床常规使用的菌种鉴定技术是目前提高精确诊断的重要环节。

海南省某医院2014—2021年脓肿拟分枝杆菌分离鉴定及药物敏感性分析

目的 通过对海南医学院第二附属医院肺部感染患者脓肿拟分枝杆菌复合群(Mycobacteroides abscessus complex,MABC)进行菌种鉴定,探讨海南地区MABC肺部感染菌种类型、药物敏感性及人群分布情况。方法 收集2014—2021年期间就诊于海南医学院第二附属医院疑似肺结核患者的呼吸道标本并进行分枝杆菌分离培养,通过对硝基苯甲酸/噻吩-2-羧酸肼(PNB/TCH)培养基与DNA微阵列芯片法初步鉴定出非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)菌株,再采用hsp65及rpoB基因测序法鉴定MABC及其亚种,并采用微量肉汤稀释法进行体外药敏试验。结果 研究期间共收集3 025例疑似肺结核患者呼吸道标本,从123例患者呼吸道标本中分离培养鉴定出124株MABC菌株,包括脓肿拟分枝杆菌脓肿亚种(Mycobacteroides abscessus subsp.abscessus)74株,脓肿拟分枝杆菌马赛亚种(Mycobacteroides abscessus subsp.massiliense)38株,脓肿拟分枝杆菌博莱亚种(Mycobacteroides abscessus subsp.bolletii)12株,其中118例患者为单一MABC亚种感染,1例为2种MABC亚种混合感染,2例为MABC与其他NTM混合感染,2例为MABC与结核分枝杆菌混合感染。患者女多于男,比例为1∶0.64,50岁以上患者占76.42%(94/123,95%CI:67.93%~83.61%),不同性别患者年龄分布差异无统计学意义(Z=-0.944,P=0.347)。药敏结果显示,所有MABC菌株对替加环素(tigecycline,TGC)敏感,对阿米卡星(amikacin,AK)耐药率为0.81%(1/124),对头孢西丁(cefoxitin,FOX)、利奈唑胺(linezolid,LZD)和亚胺培南(imipenem,IPM)耐药率分别为为6.45%(8/124)、32.26%(40/124)、74.19%(92/124)。对于克拉霉素(clarithromycin,CLR),MABC存在诱导耐药,且3个亚种之间的CLR(14 d)耐药率差异有统计学意义(χ^(2)=66.335,P<0.001)。对妥布霉素(tobramycin,TOB)、多西环素(doxycycline,DOX)、莫西沙星(moxifoxacin,MFX)、环丙沙星(ciprofoxacin,CIP)、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑(trimethoprim/sulfamethoxazole,TMP-SMX)及阿莫西林/克拉维酸(amoxicillin/clavulanic acid,AMC)的耐药率较高,均>80%。结论 海南省MABC肺部感染主要以脓肿亚种为主,对CLR诱导耐药率较高,及时准确地将MABC鉴定到亚种并进行药敏试验,对临床决策具有重要意义。