急性颅脑外伤患者肠道菌群多样性差异对继发性全身炎症反应综合征的临床预测价值

目的探讨急性颅脑外伤患者肠道菌群多样性差异对继发性全身炎症反应综合征(SIRS)的临床预测价值。方法回顾性分析2022年1月—2023年12月固原市人民医院急诊重症监护病房和神经外科重症监护病房收治的急性颅脑外伤患者60例。按SIRS诊断标准分为单纯急性颅脑外伤组(非SIRS组)与急性颅脑外伤后继发性SIRS组(SIRS组);收集患者一般资料并进行临床指标检测,通过16S rRNA基因测序比较两组肠道菌群多样性与菌属相对丰度,采用Pearson相关性分析肠道菌群与临床指标的关系,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析肠道菌群对SIRS的预测价值。结果两组患者性别构成、年龄、红细胞计数、血小板计数比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。SIRS组体温较非SIRS组高、心率较非SIRS组快、白细胞计数较非SIRS组多、C反应蛋白水平较非SIRS组高(P<0.05)。两组患者Chao1和Shannon指数比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。两组患者拟杆菌属、瘤胃球菌属、阿克曼菌属、粪肠球菌属相对丰度比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。SIRS组普雷沃菌属相对丰度低于非SIRS组(P<0.05),埃希菌-志贺菌属、棒状杆菌属相对丰度均高于非SIRS组(P<0.05)。Pearson相关性分析结果表明,体温、心率、白细胞计数及C反应蛋白与普雷沃菌属相对丰度均呈负相关(r=-0.574、-0.539、-0.554和-0.572,均P<0.05);体温、心率、白细胞计数及C反应蛋白与埃希菌-志贺菌属相对丰度呈正相关(r=0.751、0.743、0.657和0.770,均P<0.05),与棒状杆菌属相对丰度均呈正相关(r=0.782、0.762、0.707和0.799,均P<0.05)。ROC曲线分析结果表明,联合诊断的预测效能最高,曲线下面积为0.946(95%CI:0.871,1.000),敏感性为96.7%(95%CI:0.902,0.100),特异性为93.3%(95%CI:0.844,0.100)。结论肠道菌群组成的变化与颅脑损伤后SIRS的发展密切相关,特定菌属的丰度变化可作为SIRS发展的早期生物预警信号。

基于高通量测序的营养不良儿童肠道菌群多样性研究

目的 使用高通量测序模式和方法 ,对比分析营养不良儿童和正常儿童中肠道菌群物种存在的多样性和实际组成特点存在的差异。方法 选取20例营养不良患儿作为A组,选择20例身体正常的儿童作为B组,采集分析粪便样本,提取细菌中的核糖体DNA(RDNA),通过两组聚合酶链式反应(PCR)模式和方法 ,增加V4~V5区域实现高通量的测序设计,并进行生物信息学的分析研究;构建相应的稀释曲线,使用MOTHUR软件实现APLHA的多样化的计算分析,通过R语言实现热图(HEAT MAP)分析研究,实现典型关联分析(CCA),之后分别在样本的门和属两个列表中实现数据的整合和归纳,进行统计分析。结果 两组年龄、性别、分娩方式等一般资料比较,差异无统计学意义(P>0.05)。两组生物多样性比较差异无统计学意义(P>0.05)。两组生物多样性比较差异无统计学意义(P>0.05)。两组样本中共发现微生物154种。A组肠道菌群的操作性分类单元(OTU)为320, B组大肠产甲烷菌群的OTU为348,以及其共同OTU为290,两组肠细菌群门的细菌中共检出14个。为更好地展现检测结果 ,本研究依托柱状图优势,将各个样品进行分类学层面的比较和研究。A组硬壁菌门及未分级菌(乳酸菌)的OTU少于B组,拟杆菌(多形状杆菌、罗斯菌)的OTU多于B组,差异有统计学意义(P<0.05)。除A组含有的菌群外, B组还独有厌氧弧菌属、厌氧螺菌属等19种,远超A组体内的菌群种类和丰度。两组体内多形杆状菌、隐秘杆菌属等5种菌群丰度相同,差异无统计学意义(P>0.05),其他菌群丰度比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论 营养不良儿童肠道菌群中硬壁菌的数量较少,其中多形杆状菌和罗斯菌的浓度较高,为保持菌群的稳定性与均衡,必须利用不同菌属的实际特性做好菌落的调节,确保儿童有良好的消化吸收与身体生长发育。

抹茶菌群多样性分析

为了解抹茶菌群多样性,以不同企业不同等级的抹茶为试验材料,采用CTAB法提取样品总DNA,分别测定样品中微生物的16SrDNA基因V3、V4区序列。测序数据经质量控制、嵌合体过滤、高质量数据统计后,利用QIIME2软件获得扩增子序列变体ASVs特征表和特征序列,进行ASVs分布、α多样性、β多样性、物种和物种关系分析。结果表明,45个抹茶样本中有9个样本的菌群丰度极低,集中在高等级产品中。Z企业和Y企业的抹茶菌群ASVs数目、Chao1和Observed-species指数均与抹茶等级呈负相关性,而J企业抹茶的上述指标与抹茶等级不成相关性。Shannon指数表明影响各抹茶中菌群多样性的因素基本一致。抹茶组内样本间群落结构相近,企业内部样本间群落结构相近,同一企业不同批次但等级相同的样本菌群结构相近,产品微生态稳定性较好。36个抹茶样中共检测到物种29门、71纲、176目、345科、902属、1577种,其中变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)为各组样本的绝对优势菌门,二者在ZA、ZB、ZC、YA、YB、JA、JB和JC中的丰度之和分别为96.34%、95.85%、96.06%、95.53%、95.31%、95.91%、96.06%和95.27%。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、甲基杆菌属(Methylobacterium)和假单胞杆菌属(Pseudomonas)为各组的共有优势菌属(丰度≥2.00%),优势菌属在上述各组中的丰度之和分别为64.71%、65.61%、60.04%、70.65%、69.20%、72.98%、75.92%和76.57%。各组的共有优势菌属均属于变形菌门(Proteobacteria),ZB的第一优势菌属链球菌属(Streptococcus)属于厚壁菌门(Firmicutes)。本试验结果为阐明抹茶菌群多样性提供理论参考。

基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析丹阳黄酒酒曲中微生物菌群多样性

该研究以江苏丹阳某黄酒酒曲为原料,利用Illumina Miseq高通量测序技术对其微生物菌群多样性进行研究。结果表明,该酒曲中真菌菌群的多样性高于细菌,而丰富度低于细菌。从样品中共注释到7个细菌门,10个细菌属;6个真菌门,14个真菌属。优势细菌属(相对丰度≥1%)为乳杆菌属(Lactobacillus)、魏斯氏菌属(Weissella)、肠杆菌属(Enterobacter)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、不动杆菌属(Acinetobacter)、泛菌属(Pantoea);优势真菌属(相对丰度≥1%)为曲霉属(Aspergillus)、短梗霉属(Aureobasidium)、芽枝霉属(Cladosporium)、威克汉姆酵母属(Wickerhamomyces)、青霉属(Penicillium)、木拉克酵母属(Mrakia)、根霉属(Rhizopus)、镰刀菌属(Fusarium)、帚枝霉属(Sarocladium)、篮状菌属(Talaromyces)。其中,短梗霉属(Aureobasidium)、篮状菌属(Talaromyces)均为酒曲微生物中报道较少的属,其特性和功能尚不清晰,有待进一步深入的研究。该研究结果为丹阳黄酒的发酵工艺改进和品质提升提供了理论依据。

自然发酵酸面团发酵过程中微生物菌群多样性分析及细菌功能预测

该研究通过高通量测序技术研究不同发酵时期自然发酵酸面团的微生物菌群多样性,并利用PICRUSt对细菌群落进行基因功能预测分析。结果表明,对于细菌,共检测到5个细菌门,不同发酵时期绝对优势菌门不同,发酵前期(D1)为蓝藻细菌门(Cyanobacteria),中期(D2~D3)为厚壁菌门(Firmicutes),后期(D4)为变形菌门(Proteobacteria);共检测到34个细菌属,发酵前期绝对优势菌属为未分类的蓝藻门(norank_c__Cyanobacteria),中期为乳球菌属(Lactococcus),后期为未分类的γ-变形菌纲(unclassified_c_Gammaproteobacteria)。对于真菌,共检测到13个真菌门,发酵过程中子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门;共检测到12个真菌属,未分类的酵母目(Saccharomycetales_unclassified)为绝对优势菌属,后期汉逊酵母属(Hanseniaspora)也被大量检出。通过PICRUSt进行分析预测,细菌群落在整个发酵过程中的基因功能主要有能量产生和转化、转录、无机离子转运和代谢等,该研究结果可为筛选酸面团内优良发酵功能菌种提供数据参考。

基于高通量测序的黄羽肉鸡屠宰过程中菌群多样性分析

利用传统培养和高通量测序技术分析黄羽肉鸡打毛、净膛、预冷和包装屠宰过程中鸡胴体表面和预冷水的微生物污染情况。结果表明:经打毛、净膛和预冷后的鸡胴体菌落总数分别为4.82、5.03、4.68(lg(CFU/g)),说明该屠宰工艺未起到较好的减菌效果,宰后胴体微生物污染严重;高通量测序技术分析发现,肉鸡屠宰加工过程中的胴体表面和预冷水的优势腐败菌在属水平上为莫拉氏菌属、假单胞菌属、葡萄球菌属、乳杆菌属、巨大球菌属、嗜冷杆菌属和不动杆菌属等。主成分分析表明,一阶、二阶预冷水、预冷后鸡胴体及包装后鸡胴体相距较近,差异性不大,但与打毛鸡胴体和净膛后鸡胴体2组样品有较大差异,说明预冷水中的污染菌组成决定了宰后胴体的污染菌种类。本研究说明不同屠宰流程后的黄羽肉鸡胴体污染菌的组成与丰度存在差异,需针对不同屠宰流程特性采取对应的控制手段保障黄羽肉鸡制品的质量与安全。

芦台春酱香型白酒酿造过程中真菌菌群多样性及代谢分析

该研究采用高通量测序技术对天津芦台春酱香型白酒发酵过程中不同轮次出窖酒醅的真菌群落结构进行研究,并对其与理化因子、挥发性风味成分相关性分别进行典范对应分析(CCA)及偏最小二乘判别分析(PLS-DA)。结果表明,随着轮次的增加,真菌菌群的多样性升高,而丰度先升高后降低;酵母菌是白酒发酵过程中的主要真菌,但相对丰度逐步降低,在属水平上以伊萨酵母属(Issatchenkia)为主,其相对丰度由第一轮次的97.48%逐渐下降至第七轮次的3.53%。相关性分析结果表明,总酸、还原糖和酒精度是窖池发酵微生物演替的重要理化因子;伊萨酵母属(Issatchenkia)与乙酸乙酯、乙酸异戊酯、异戊醇等相关性较大;哈萨克斯坦酵母属(Kazachstania)、丝衣霉属(Byssochlamys)、罗萨氏菌属(Rasamsonia)、复膜孢酵母属(Saccharomycopsis)等与正己酸乙酯、庚酸乙酯、3-羟基丁酸乙酯、丁二酸二乙酯、苯乙酸乙酯、油酸乙酯、乙醇等相关性较大;而Leiothecium、未分类的酵母目(unclassified_o__Saccharomycetales)、Apiotrichum、Cutaneotrichosporon等则对壬酸乙酯、乙酸苯乙酯、正己醇、2,3-丁二醇、糠醇、糠醛等的形成起到重要作用。

哮喘患儿呼气冷凝物菌群多样性及其与病情的相关性

目的探讨哮喘患儿呼气冷凝物菌群的多样性,分析其多样性与病情的相关性。方法前瞻性选取2020年12月至2024年1月来我院接受治疗的98例哮喘患儿作为研究对象纳入研究组,选取同期于我院接受健康检查的50例健康儿童作为观察对象,纳入对照组。采用微生物评估方法对比研究组患儿和对照组儿童呼吸道中的呼气冷凝物的物种多样性,同时根据研究组患儿的临床表现将其分为轻中度组、重度组,采用Spearman分析其呼气冷凝物菌群多样性与病情的相关性。结果研究组的呼吸道菌群主要为变形菌门、厚壁菌门以及拟杆菌门,其中以变形菌门占比最高;研究组的丰富度指数Chao1、ACE以及多样性指数Evenness均低于对照组,多样性指数Shannon、Simpson均高于对照组(P<0.05);根据研究组患儿的临床表现进行亚分组后发现,重度组的丰富度指数Chao1、ACE以及多样性指数Evenness均低于轻中度组,多样性指数Shannon、Simpson均高于轻中度组(P<0.05);Spearman分析显示,哮喘的病情与ACE(r_( s)=-0.734,P<0.05)、Chao(r_( s)=-0.618,P<0.05)以及Evenness指数(r_( s)=-0.384,P<0.05)呈负相关,与Shannon(r_( s)=0.724,P<0.05)、simpson指数(r_( s)=0.642,P<0.05)呈正相关。结论在哮喘患儿的呼气冷凝物菌群中存在较高的菌群多样性,同时菌群多样性越高,患者的病情越严重。

丙型肝炎患者肠道菌群多样性变化及其致肝损伤作用机制研究进展

肠道菌群在维持肠上皮通透性、调节代谢、诱导先天免疫等方面发挥重要作用,正常情况下肠道菌群维持着动态平衡。丙型肝炎患者的肠道菌群出现失调,主要表现为肠道菌群的α和β多样性发生改变。丙型肝炎病毒不仅能够通过调节胆汁酸代谢影响肠道菌群,还能破坏肠道的免疫防线,使得参与形成肠道黏膜免疫屏障的抗菌肽、IgA和免疫细胞、短链脂肪酸减少,引起肠道通透性增加,导致细菌易位。肠道菌群的这种失调启动炎症和代谢紊乱的循环,直接和间接通过肠—肝轴促进丙型肝炎患者肝脏的损伤。

固齿散对慢性牙周炎患者的效果及对龈沟液菌群多样性的影响

目的探讨固齿散对慢性牙周炎患者的效果及对龈沟液菌群多样性的影响。方法选择邯郸市口腔医院2022年1月至2023年8月收治的112例慢性牙周炎患者为研究对象。按照随机数字表法将其分成观察组和对照组,各56例。对照组予以常规治疗,观察组在对照组基础上予以固齿散(0.5 g/次,2次/d)治疗,两组共治疗3个月。对比两组临床疗效,中医证候积分,牙周探诊相关指标情况[龈沟出血指数(sulcus bleeding index,SBI)、菌斑指数(plague index,PLI)及牙龈指数(gingival index,GI)],龈沟炎症因子[白细胞介素(interleukin,IL)-6、IL-1β],龈沟液菌群α多样性(Shannon指数、Simpson指数、Chao1指数、ACE指数)及β多样性。结果治疗后,观察组(92.86%)临床总有效率高于对照组(78.57%)(P<0.05);与对照组相比,观察组中医证候积分、SBI、PLI、GI、IL-6、IL-1β、Shannon指数降低(P<0.05,P<0.01),Simpson指数升高(P<0.05)。PC1对于样本差异的贡献值为70.90%,PC2对于样本差异的贡献值为24.10%。治疗后观察组与对照组整体距离存在一定分离趋势(P<0.05)。结论固齿散可调节慢性牙周炎患者龈沟液菌群多样性,改善牙周状况,减轻龈沟液炎症水平,效果显著。

阴道菌群多样性和代谢产物分析及与HPV感染的相关性

目的探讨人乳头瘤病毒(HPV)感染患者阴道菌群多样性和代谢产物并分析其相关性。方法选取2022年1月至2023年1月体检科或妇产科就诊的女性100例,采集患者宫颈分泌物检测其HPV感染情况,根据患者有无感染HPV,取阴道分泌物检测其阴道菌群及其代谢产物,明确其相关性。多因素Logistic回归分析影响HPV感染发生的因素。结果100例患者HPV检测显示,HPV阳性46例。HPV感染组细菌、菌群感染阳性占比、唾液酸苷酶、菌群多样性Ⅰ级占比及H_(2)O_(2)阳性占比均明显高于无HPV感染组(P<0.05),乳酸杆菌阳性占比、菌群多样性、密集性Ⅱ~Ⅲ级占比明显低于无HPV感染组(P<0.05),2组间霉菌、支原体、滴虫、混合菌阳性占比、菌群多样性、密集性Ⅳ级占比、白细胞脂酶、乙酰氨基葡萄糖苷酶阳性占比比较差异无统计学意义(P>0.05);多因素Logistic回归分析显示,菌群多样性、菌群密集性及H_(2)O_(2)为影响HPV感染的因素(P<0.05)。结论阴道菌群多样性、密集性、H_(2)O_(2)与HPV感染有关,可增加HPV感染风险。

利福平耐药与敏感肺结核患者痰液样本微生物菌群多样性对比分析

通过精准测序技术,对利福平耐药与敏感肺结核患者痰液样本微生物菌群多样性进行分析。方法 选取我院2023.1-2024.12我院征集到的500份确诊为肺结核患者的痰液样本进行检测,对痰液微生物16SV4区域进行高通量测序分析。结果 RFP-R组和RFP-S组的痰液菌群α多样性指数(如Chao1、Observed、Shannon、Simpson和Evenness)差异均不具有统计学意义(P值均大于0.05)。讨论 这项研究的结果有助于我们更好地理解结核病及其耐药形式对患者微生物群落的影响,以及这些变化如何影响疾病的进展和治疗效果。

基于高通量测序技术分析天津高温大曲微生物菌群多样性

以贵州高温大曲为对照,基于高通量测序技术对天津高温大曲微生物多样性进行分析。结果表明,与贵州高温大曲相比,天津高温大曲的细菌群落物种丰富度较大且多样性更高,而真菌群落相反。两个高温大曲样品的共有优势细菌属为海洋芽孢杆菌属(Oceanobacillus)、克罗彭斯特菌属(Kroppenstedtia)、枝芽孢杆菌属(Virgibacillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、糖多孢菌属(Saccharopolyspora),共有优势真菌属为热子囊菌属(Thermoascus)、嗜热真菌属(Thermomyces)、红曲霉属(Monascus)、曲霉属(Aspergillus)、丝衣霉属(Byssochlamys)。而天津高温大曲还含有葡萄球菌属(Staphylococcus)、链霉菌属(Streptomyces)两个特有优势细菌属,以及毕赤酵母属(Pichia)和根霉属(Rhizopus)两个特有优势真菌属。本研究结果初步揭示了天津高温大曲的微生物菌群结构,为后续天津高温大曲研究奠定基础。

基于高通量测序技术观察哮喘患儿上呼吸道菌群多样性的变化

目的:分析哮喘患儿上呼吸道菌群定植种类和数量与健康儿童之间的差异。方法:选择2020年10月至2021年10月我院收治的8例学龄前哮喘患儿入哮喘组,另纳入18例同期在我院体检的健康儿童为对照组,分析两组之间呼吸道菌群种类及数量的差异。结果:16S rDNA测序结果显示,哮喘患儿上呼吸道菌群物种丰富度及多样性增加,菌群结构发生显著变化。哮喘组和对照组共有扩增子序列变异(amplicon sequence variants,ASVs)375个,特有ASVs分别为889个和1037个,哮喘组菌群ASVs相较于对照组发生显著变化。在门水平,与对照组比较,哮喘组中厚壁菌门的相对丰度明显下降(P<0.01),放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、弯曲杆菌门(Campilobacterota)的相对丰度明显增加(P<0.05)。在属水平,与对照组比较,哮喘组链球菌属、鞘氨醇单胞菌属相对丰度减少,奈瑟菌属(Neisseria)相对丰度明显增加,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论:哮喘患儿上呼吸道菌群在种类和数量上与健康儿童之间存在显著差异,且哮喘患儿存在呼吸道菌群紊乱状态。

补喂鞣花酸对哺乳中后期纯血马马驹粪便菌群多样性的影响

【目的】试验旨在研究补喂不同水平的鞣花酸对马驹粪便细菌多样性的影响,通过探究粪便菌群的变化,以期为哺乳马驹胃肠道菌群多样性和肠道健康等提供参考依据。【方法】选择出生日期相近、体重为(143.33±16.10)kg的3月龄纯血马马驹15匹,随机分为3组,每组5匹,分别为对照组、试验Ⅰ组、试验Ⅱ组。在相同的饲养条件下,对照组马驹不做任何处理,试验Ⅰ和Ⅱ组马驹每天分别补喂15和30 mg/kg BW鞣花酸,进行为期60 d的饲养试验。试验第60天晨饲前于直肠采集马驹粪便样品,测定粪便菌群多样性。【结果】OTUs结果显示,试验各组共有OTUs 789个,试验Ⅰ组特有的OTUs为182个;各试验组与对照组之间Alpha多样性差异不显著(P>0.05),但试验Ⅰ组Shannon、Chao1及ACE指数有提高的趋势;菌群丰度结果表明,各试验组与对照组前十的优势菌种类相同,以厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和疣微菌门为主,且丰度占总数92.94%以上,各组之间门、科和属水平菌群丰度差异均不显著(P>0.05);LefSe分析结果表明,试验Ⅰ组有差异菌9种,试验Ⅱ组有2种;预测前十的功能有全局与概述图谱,碳水化合物代谢和氨基酸代谢等,但差异不显著(P>0.05)。【结论】哺乳期纯血马马驹粪便中优势菌群为厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和疣微菌门,补喂15 mg/kg BW鞣花酸能够提高粪便菌群多样性,增加粪便菌群的种类。

七氟烷全麻在牙科恐惧症儿童口腔治疗中的应用及其对口腔菌群多样性的影响

目的探讨七氟烷全麻在牙科恐惧症儿童口腔治疗中的应用及其对口腔菌群多样性的影响。方法选取2021年5月至2022年9月江西省儿童医院收治的60例牙科恐惧症患儿作为研究对象。按照随机数字表法分为对照组(30例)和试验组(30例),对照组应用咪达唑仑麻醉方法,试验组应用七氟烷全麻方法。比较两组牙科恐惧症患儿的麻醉效果、不良反应发生率、唾液样本变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)电泳图谱条带数以及麻醉前后的心率水平、呼吸频率、平均动脉压、血氧饱和度。结果试验组的意识反应消失时间、睫毛反射消失时间、疼痛反应消失时间、意识恢复清醒时间短于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);试验组的不良反应发生率低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);试验组的唾液样本DGGE电泳图谱条带数高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。两组患儿麻醉前的心率水平、呼吸频率、平均动脉压、血氧饱和度比较,差异无统计学意义(P>0.05);麻醉后,试验组的心率水平、呼吸频率、平均动脉压低于对照组,血氧饱和度高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论七氟烷全麻可显著改善牙科恐惧症患儿的麻醉效果和丰富口腔菌群多样性。

不同工艺绍兴酒麦曲微生物菌群多样性分析

为研究不同培养环境、制曲工序、地理方位对绍兴酒麦曲微生物群落结构和多样性的影响,采用高通量测序技术对6种不同工艺绍兴酒麦曲样品的微生物菌群多样性进行分析。结果表明,从6种绍兴酒麦曲样品中共注释到30个细菌属和43个真菌属,其中共有的优势细菌属为糖多孢菌属(Saccharopolyspora)(69.16%)和芽孢杆菌属(Bacillus)(10.90%);共有的优势真菌属为根毛霉属(Rhizomucor)(50.37%)、曲霉属(Aspergillus)(28.32%)、横梗霉属(Lichtheimia)(12.66%)、镰刀菌属(Fusarium)(3.64%)。高温放线菌属(Thermoactinomyces)(4.81%)和伊萨琴基亚(Issatchenkia)(1.43%)仅在西路箱式麦曲样品中为优势菌属。综合无度量多维标定法(NMDS)和线性判别分析效应大小(LEfSe)分析发现,西路箱式麦曲样品与其他绍兴酒麦曲样品间细菌群落结构差异主要由优势菌群相对丰度的差别所致,真菌菌群结构差异主要由差异菌群复膜孢酵母科(Saccharomycopsidaceae)微生物所致。研究表明,培养环境对绍兴酒麦曲的微生物多样性影响较大,而制曲工序与市域内的地理方位对绍兴酒麦曲的微生物多样性影响较小。

重庆东部地区鲊广椒乳酸菌分离鉴定及细菌菌群多样性分析

为明确重庆东部地区鲊广椒中乳酸菌多样性和细菌群落多样性,该研究以采集自重庆东部5个地区的鲊广椒为研究对象,采用微生物纯培养技术对其蕴含的乳酸菌菌株进行分离鉴定,并进一步采用Illumina MiSeq高通量测序技术对其细菌菌群多样性进行了解析。结果表明,采用纯培技术共从鲊广椒样品中分离得到122株乳酸菌,鉴定为同一个门5个属下的22个种,其中戊糖乳杆菌(Lactobacillus pentosus)、消化乳杆菌(Lactobacillus alimentarius)和植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)为鲊广椒中的优势细菌,分别占乳酸菌总分离株的26.23%、20.49%和18.85%。高通量测序结果表明重庆东部地区鲊广椒样品以厚壁菌门(Firmicute)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为主,且在属水平上平均相对丰度大于1.0%的细菌属有7个,包括乳酸杆菌属(Lactobacillus)、醋酸杆菌属(Acetobacter)、魏斯氏菌属(Weissella)、乳球菌属(Lactococcus)、棒状杆菌属(Corynebacterium)、葡萄球菌属(Staphylococcus)和肠杆菌属(Enterobacter),其中乳酸杆菌属平均相对丰度为63.96%。由此可见重庆东部地区鲊广椒中蕴含了丰富的乳酸菌资源,并且具有较高的多样性。

不同产地米槁根际菌群多样性及其影响因素

以贵州省黔西南、黔南州3个产地(BP、LD、XL)的米槁根际土壤为研究对象,采用纯培养手段对米槁根际真菌进行纯化培养,探讨米槁根际土壤可培养真菌多样性和分离潜力,为后期促生真菌的筛选和功能验证提供基础依据。结果表明,从不同产地米槁根际土壤中共分离到真菌367株,鉴定为3门5纲17目38科57属。木霉属Trichoderma是3产地共有的优势属,占总菌株的20.98%。BP、LD和XL的共有属有9种且木霉属是BP(22.6%)和LD(27.3%)的绝对优势属,XL的绝对优势属为青霉菌属(16.7%)。在属水平上,BP的菌群多样性和丰富度最高,LD的菌群多样性最低,但其均匀度最高。不同产地米槁根际菌群的组成不同,其中除BP与XL之间中等不相似,其余产地间极不相似。菌群多样性与土壤化学性质及酶活性存在显著相关性,全氮、速效氮、有效钾和蔗糖酶活性是影响米槁根际菌群多样性的关键因子。

竹笋发酵中挥发性物质及菌群多样性动态分析

采用顶空固相微萃取-气相色谱-质谱联用技术(HS-SPME-GC-MS)对不同发酵阶段酸笋样品中的特征风味物质进行分析,同时运用二代高通量测序技术测定自然发酵不同时期的微生物菌群结构。结果表明,发酵过程中共检测出88种挥发性化合物,对甲酚是酸笋中特殊味道的主体成分,同时,在研究过程中也发现,二甲胺等有害物质随着发酵过程的进行而消失。环辛醇、环庚醇、乙酸、乳酸、苯酚等物质在发酵中、后期形成;麻竹笋发酵的不同时期菌群结构多样性改变显著。发酵初期优势细菌菌群主要有乳球菌属、魏斯氏菌属和肠杆菌属;发酵中期优势细菌菌群主要有明串珠菌属和片球菌属;发酵末期优势细菌菌群主要是乳杆菌属。优势菌群-挥发性组分的Pearson相关性分析发现,乳杆菌属和乳球菌菌属与发酵过程中的挥发性物质大多呈正相关。研究结果阐明了麻竹笋自然发酵过程中挥发性物质形成与微生物菌群之间的关系,为酸笋中优势功能菌株的筛选和定向发酵提供了基础数据。