沉默信息调节因子家族在细胞焦亡中的作用

背景:不同于非炎症性细胞凋亡,细胞焦亡是炎症性细胞死亡的一种形式,它伴随着膜完整性的破坏和促炎性细胞内物质的释放,因而与多种疾病有关。沉默信息调节因子家族是依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸的组蛋白去乙酰化酶家族。除了去乙酰化外,还具有其他酶活性,如脱琥珀酸化、脱丙酰化和腺苷二磷酸-核糖基化等,在参与细胞焦亡调控中发挥重要的作用。目的:综述沉默信息调节因子家族在细胞焦亡中的作用及影响。方法:第一作者通过检索PubMed、Web of Science、中国知网、万方数据库,检索时限为各数据库建库至2024年3月,中文检索词为“沉默信息调节因子,沉默信息调节因子1,沉默信息调节因子2,沉默信息调节因子3,沉默信息调节因子4,沉默信息调节因子5,沉默信息调节因子6,沉默信息调节因子7,细胞焦亡”,英文检索词为“Sirtuins,Sirtuin1,Sirtuin2,Sirtuin3,Sirtuin4,Sirtuin5,Sirtuin6,Sirtuin7,pyroptosis”,最后纳入71篇文献进行综述。结果与结论:①沉默信息调节因子家族均参与了对细胞焦亡的调控;②过表达沉默信息调节因子1、沉默信息调节因子4可通过多种通路抑制细胞焦亡,从而缓解细胞焦亡对机体的损害;③沉默信息调节因子3除了影响细胞焦亡经典通路外,还能通过增强线粒体活性氧的清除能力、有丝分裂来抑制细胞焦亡;④沉默信息调节因子5参与细胞内代谢和能量平衡的调节,包括能量的摄入、储存和消耗;⑤沉默信息调节因子6既能通过多种通路影响细胞焦亡,还能影响巨噬细胞M1极化、活性氧的生成以及细胞焦亡相关因子消皮素D的裂解以抑制细胞焦亡;⑥过表达沉默信息调节因子7可抑制细胞焦亡;⑦沉默信息调节因子2与其他家族成员不同,其被敲降后才可抑制细胞焦亡,但报道较少,需要更为深入与全面的研究。

N6-甲基腺苷相关调节因子与骨关节炎:生物信息学和实验验证分析

背景:越来越多证据表明N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)调节因子与骨关节炎密切相关,被认为是防治骨关节炎新方向,但具体作用机制不明。目的:通过对骨关节炎基因芯片数据集进行生物信息学分析,探讨m6A对骨关节炎的作用,解析骨关节炎发病机制。方法:首先利用R软件提取GEO数据库中GSE1919数据集中骨关节炎相关m6A调节因子及其表达量,进而对提取结果行基因差异分析及GO、KEGG富集分析;接着对PPI网络拓扑学分析结果和机器学习结果取交集得到m6A关键调节因子,并通过体外细胞实验验证。结果与结论:①提取得到16个骨关节炎相关m6A调节因子表达量,通过差异分析获得ZC3H13、YTHDC1、YTHDF3、HNRNPC等11个m6A差异调节因子;②GO富集分析显示,骨关节炎相关m6A差异调节因子在生物过程中主要于mRNA转运、RNA分解代谢、胰岛素样生长因子受体信号通路调控等发挥作用;③KEGG富集分析显示,差异调节因子主要参与p53、白细胞介素17和AMPK信号通路;④综合PPI网络拓扑学分析和机器学习结果获得m6A关键调节因子——YTHDC1;⑤体外细胞实验结果表明,m6A关键调节因子——YTHDC1在对照组与骨关节炎组中表达存在显著差异(P<0.05);⑥结果显示,YTHDC1与骨关节炎发生发展密切相关,有望成为m6A治疗骨关节炎的分子靶点。

以价值为导向的住院康复服务价值调节因子构建研究

目的:本研究旨在建立实现康复治疗效果可比的价值调节因子,为将康复服务价值作为医保支付依据、基于现行医保制度建立按价值付费机制提供可行思路。方法:课题组于2022年1月1日—2023年3月31日收集样本医院脑损伤住院患者功能相关信息,并与样本地区医保结算清单数据库关联。采用神经网络模型拟合康复结果与康复效果影响因素之间的函数关系,根据康复结果实际值与预测值差值的分布区间判断康复服务价值。结果:共计878例脑损伤患者的住院康复病案与医保结算清单资料纳入分析;根据预测精度评价指标及其标准,选取了最优模型,并根据其预测结果对康复治疗效果进行了评价,确定了包含四个档次的价值调节因子。结论:本研究构建的价值调节因子,不仅为评价住院康复服务治疗效果、实现康复效果可比提供了重要工具,也为进一步推动医保对住院康复服务实施按价值付费提供了可行方向。

红细胞免疫黏附调节因子对焦虑症诊断及疗效的预测价值

目的 探讨焦虑症患者红细胞免疫黏附调节因子表达及其对临床疗效的预测价值。方法选取180例焦虑症患者设为观察组,180名健康志愿者设为对照组。两组受试者均进行红细胞免疫黏附调节因子检测,比较两组检测结果。同时比较不同疗效患者红细胞免疫黏附调节因子水平。绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析红细胞免疫黏附调节因子对焦虑症诊断价值及对临床疗效的预测价值。结果 观察组受试者红细胞免疫抑制因子、免疫黏附促因子、循环免疫复合物、β-内啡肽水平及红细胞-免疫复合植物花环率均高于对照组,酵母花环率低于对照组(P<0.01)。ROC曲线分析显示,6种红细胞免疫黏附调节因子诊断焦虑症的曲线下面积(AUC)分别为0.770、0.747、0.698、0.729、0.722、0.863,6项指标联合诊断焦虑症的AUC为0.991,高于单项诊断效能(Z=4.266、4.760、5.742、4.106、4.022、4.464,P<0.05或0.01)。180例患者中,疗效良好144例,疗效较差36例;疗效良好患者5种红细胞免疫黏附调节因子水平均低于疗效较差患者,酵母花环率高于疗效较差患者,差异有统计学意义(P<0.01)。6种红细胞免疫黏附调节因子预测焦虑症治疗无效的AUC分别为0.786、0.845、0.777、0.866、0.745、0.902,6项指标联合预测焦虑症治疗无效的AUC为0.990,高于单项预测效能(Z=2.880、2.286、3.049、2.662、3.049、2.182,P<0.01)。结论 焦虑症患者红细胞免疫黏附调节因子表达异常,且与预后关系密切,检测该指标能为焦虑症诊断和临床疗效评估提供科学依据。

紫花苜蓿生长调节因子的全基因组鉴定及干旱胁迫下特征分析

为揭示紫花苜蓿(Medicago sativa)生长调节因子(GRF)响应干旱胁迫中的生理功能及响应机制,以劲能5020为试验材料,基于全基因组分析,对紫花苜蓿GRF家族成员进行鉴定和生物信息学分析,并采用RT-qPCR方法分析相关基因在干旱胁迫下的表达模式。结果表明,在紫花苜蓿中共鉴定出8个GRF编码基因的非冗余成员,可定位于7条染色体上。系统发育分析表明,紫花苜蓿GRF(MsGRF)可分为4个亚家族,同一亚家族的MsGRF都包含共同的高度保守基序、基因结构及多种顺式作用元件,表明MsGRF具有潜在的功能多样性。RNA-seq、qPCR表达模式表明,MsGRF在幼嫩组织和根系中具有较高的表达活性。RT-qPCR进一步表明,8个MsGRF成员中,6个基因(MsGRF1、MsGRF3、MsGRF5、MsGRF6、MsGRF7、MsGRF8)在干旱胁迫下上调表达,其中MsGRF1相对表达水平45.8~83.1,表达活性最高、契合度最佳。综上,MsGRF在紫花苜蓿抗干旱过程中具有重要作用,推测MsGRF1是紫花苜蓿耐旱的关键基因。

生长分化因子15联合沉默信息调节因子1在老年急性心肌梗死患者介入治疗的预后预测价值分析

目的:探讨生长分化因子15(growth differentiation factor-15,GDF15)联合沉默信息调节因子1(silent information regulator 1,SIRT1)在老年急性心肌梗死(acute myocardial infarctio,AMI)患者PCI治疗后预后预测中的价值。方法:选取本院2019年1月至2021年8月收治的209例AMI行PCI老年患者纳入AMI组,另选同期健康体检人群90例纳入对照组,检测AMI患者术前、术后7d以及对照组血清GDF15、SIRT1表达水平,观察AMI术后3个月内AMI组主要不良心血管事件(major adverse cardiovascular events,MACE)发生情况,对比MACE发生与未发生患者血清GDF15、SIRT1表达差异,通过受试者工作曲线(ROC)评估其对患者MACE发生的预测价值。结果:AMI患者术前与术后血清GDF-15水平明显高于对照组,SIRT1水平明显低于对照组(P <0.05);血清GDF-15、SIRT1水平联合检测诊断AMI的发生ROC曲线下面积(AUC)显著高于两项指标单独评估的AUC(P <0.05);209例患者术后3个月内发生MACE者44例(21.1%),发生MACE患者术前及术后血清GDF-15水平高于未发生者,SIRT1水平低于未发生者(P <0.05);术前血清GDF-15、SIRT1水平联合检测评估老年PCI治疗AMI患者MACE的发生ROC曲线下面积为0.816,显著高于两项指标单独评估曲线下面积0.726、0.725(P <0.05);术后血清GDF-15、SIRT1水平联合检测评估老年PCI治疗AMI患者MACE的发生ROC曲线下面积为0.894,显著高于两项指标单独评估曲线下面积0.815、0.811(P <0.05);术后7d血清GDF-15、SIRT1水平检测评估老年PCI治疗AMI患者MACE的发生ROC曲线下AUC高于术前(P <0.05)。结论:AMI患者血清GDF-15呈高表达,SIRT1呈低表达,且其表达水平可在一定程度上预测患者PCI术后MACE的发生,反映患者预后状态。

染色质调节因子对乳腺癌预后的预测价值

目的探讨染色质调节因子(CRs)在乳腺癌中的差异表达及其对预后的预测价值。方法利用癌症基因组图谱数据库筛选乳腺癌和正常乳腺组织中差异表达的CRs,并通过最小绝对值收敛和选择算子算法-Cox回归分析构建预后风险模型,根据风险分数(Risk score)将乳腺癌患者分为高风险组和低风险组;同时分析风险模型与乳腺癌患者临床特征的相关性,并对每个基因进行单独验证。结果本研究识别了127个在乳腺癌中差异表达的CRs,并基于16个关键CRs构建了预后风险模型;低风险组患者中年龄≤65岁、StageⅠ~Ⅱ期、Ⅲ~Ⅳ期、T_(0)~T_(1)、T_(2)~T_(3)、N_(0)~N_(1)、N_(2)~N_(3)者总生存期均高于高风险组(均P<0.05)。结论CRs能预测乳腺癌患者的预后。

沉默信息调节因子1激活剂SRT1720减轻大鼠急性颅脑损伤的机制

背景:有研究显示在急性颅脑损伤小鼠模型中,以药物激活沉默信息调节因子1的转录和翻译水平后能明显升高脑组织中沉默信息调节因子1的表达,降低脑组织炎症应激和氧化应激水平,改善神经功能。目的:探讨腹腔注射沉默信息调节因子1激活剂SRT1720减轻大鼠急性颅脑损伤的机制。方法:取90只SD大鼠,采用随机数字表法分为3组,每组30只:假手术组不造模;模型组、激活剂组建立急性颅脑损伤模型,6 h后假手术组、模型组、激活剂组分别腹腔注射二甲亚砜溶液、二甲亚砜溶液、SRT1720,1次/d,连续注射28 d。设定取材时间点,检测大鼠神经功能、脑组织含水量、脑组织氧化应激与炎症反应、脑组织形态、细胞凋亡与血管新生以及脑组织中沉默信息调节因子1蛋白表达。结果与结论:①注射7,14,28 d时,与假手术组比较,模型组大鼠改良神经功能缺损评分、脑组织含水量及细胞凋亡率均升高(P<0.05);与模型组比较,激活剂组大鼠改良神经功能缺损评分、脑组织含水量及细胞凋亡率均降低(P<0.05);②注射7,14,28 d时,与假手术组比较,模型组大鼠脑组织中活性氧自由基、髓过氧化物酶水平升高(P<0.05),血清中丙二醛、肿瘤坏死因子α和白细胞介素6水平升高(P<0.05),血清中超氧化物歧化酶水平降低(P<0.05);与模型组比较,激活剂组大鼠大鼠脑组织中活性氧自由基、髓过氧化物酶水平降低(P<0.05),血清中丙二醛、肿瘤坏死因子α和白细胞介素6水平降低(P<0.05),血清中超氧化物歧化酶水平升高(P<0.05);③注射7,14,28 d的免疫组化染色显示,模型组大鼠脑组织中新生血管数量多于假手术组(P<0.05),激活剂组大鼠脑组织中新生血管数量多于模型组(P<0.05);注射7,14,28 d的Western blot检测显示,模型组大鼠脑组织中沉默信息调节因子1蛋白表达低于假手术组(P<0.05),激活剂组大鼠脑组织中沉默信息调节因子1蛋白表达高于模型组(P<0.05);注射7,14,28 d的苏木精-伊红染色显示,激活剂组大鼠脑组织损伤程度轻于模型组;④结果表明,腹腔注射SRT1720通过下调急性颅脑损伤大鼠脑组织氧化和炎性应激水平、抑制神经细胞凋亡、促进血管新生来减轻脑组织损伤。

基于G蛋白信号调节因子2敲低探讨血管紧张素Ⅱ诱导的主动脉夹层形成的机制

目的探讨G蛋白信号调节因子2(RGS2)在调节血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)诱导的主动脉夹层形成中的作用。方法将C57BL/6小鼠分为3组:Control组(n=10)、AngⅡ组(n=20)、AngⅡ+sh-RGS2组(n=20)。AngⅡ组和AngⅡ+sh-RGS2组小鼠建立了主动脉夹层模型。在体内评估主动脉夹层的发生率,在体外和体内评估血管平滑肌细胞(VSMC)表型转化。结果RGS2的敲低逆转了AngⅡ导致的αSMA、ACTA2和MYH11的表达下调,并抑制了AngⅡ诱导的SPP1和Vimentin蛋白表达。AngⅡ组和AngⅡ+sh-RGS2组的主动脉夹层发生率分别为45%(9/20)和10%(2/20)。与AngⅡ组小鼠比较,AngⅡ+sh-RGS2组小鼠中观察到更少的弹性层增厚、主动脉破裂和主动脉壁胶原纤维含量。此外,与AngⅡ组比较,AngⅡ+sh-RGS2组主动脉的最大直径减小(P<0.05),ACTA2、MYH11蛋白增加(P<0.01),RGS2、SPP1、Vimentin蛋白降低(P<0.01)。结论RGS2敲低抑制AngⅡ诱导的VSMC从可收缩表型转变为合成表型,降低了主动脉夹层形成的发生率。

西黄胶囊联合XP方案治疗晚期胃癌的近期疗效及对外周血肿瘤标志物、细胞免疫功能和血管生成调节因子的影响

目的:探讨西黄胶囊联合卡培他滨+顺铂(XP方案)治疗晚期胃癌的近期疗效及其对患者外周血肿瘤标志物、细胞免疫功能和血管生成调节因子水平的影响。方法:选择2019年1月至2022年3月北京航天总医院收治的晚期胃癌患者152例,以随机数字表法分为观察组和对照组,每组76例。对照组患者给予XP方案治疗,观察组患者在对照组的基础上联合西黄胶囊治疗,21 d为1个疗程。连续治疗4个疗程后进行近期疗效评价,治疗过程中记录两组患者的不良反应情况。治疗前后检测两组患者血清肿瘤标志物[糖类抗原(CA)19-9、CA72-4和癌胚抗原(CEA)]、细胞免疫功能[外周血CD3^(+)、CD4^(+)、CD8^(+)T细胞百分比和CD4^(+)/CD8^(+)比值]及血清血管生成调节因子[血管内皮生长因子(VEGF)、碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)和转化生长因子-β1(TGF-β1)]水平,并随访记录两组患者的远期生存情况。结果:观察组患者的客观缓解率、疾病控制率分别为51.32%(39/76)、93.42%(71/76),显著高于对照组的30.26%(23/76)、82.89%(63/76),差异均有统计学意义(P<0.05)。观察组患者白细胞减少、血小板减少和胃肠道反应的发生率显著低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗后,两组患者CA19-9、CA72-4和CEA,VEGF、bFGF和TGF-β1水平均较治疗前显著降低,观察组患者较对照组降低更为显著,差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗后,观察组患者外周血CD3^(+)、CD4^(+)水平及CD4^(+)/CD8^(+)比值均较治疗前显著升高,且显著高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。观察组患者中位无进展生存期、中位总生存期分别为6.1、12.9个月,均较对照组(4.7、9.8个月)显著延长,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:西黄胶囊联合XP方案治疗晚期胃癌患者,能有效抑制血清肿瘤标志物水平,调控血管生成调节因子的表达,改善机体细胞免疫功能,提高近期疗效及远期生存获益,且表现出一定的减毒作用。

索马鲁肽治疗阿尔茨海默病的潜在靶点:沉默信息调节因子1

背景:研究发现胰高血糖素样肽1及其类似物具有显著的神经保护作用,并且已有部分药物应用到阿尔茨海默病临床三期研究阶段,然而其发挥神经保护作用的具体机制尚不明确,有待进一步探讨阐明。目的:拟通过生物信息学和网络药理学分析方法筛选出阿尔茨海默病发病机制的相关基因,以及索马鲁肽(一种胰高血糖素样肽1受体激动剂)治疗阿尔茨海默病的相关靶点,对两者进行综合分析挑选出潜在靶点基因,并在细胞水平加以验证。方法:利用DisGeNET数据库筛选出阿尔茨海默病患者与健康人群的差异基因,利用PubChem在线数据库得到索马鲁肽的化学结构式和2D结构图,利用DAVID在线数据库进行GO/KEGG富集分析,利用STRING数据库进行蛋白互作网络的构建,利用HPA数据库判断目的蛋白在人体各组织中的分布特点,最后使用蛋白印迹技术和免疫荧光技术检测索马鲁肽干预HT22细胞之后的蛋白表达情况。结果与结论:①利用DisGeNET数据库内数据得到3374个阿尔茨海默病患者与健康人群的差异基因,同时获得索马鲁肽潜在药物的101个靶基因,取两者交集得到23个相关基因;结合蛋白互作网络从中筛选出10个关键基因,分别是沉默信息调节因子1(SIRT1)、CASP9、CCND1、CASP1、KEAP1、DLG4、CASP4、GRB2、GRIA1、EDNRA;②GO基因功能分析显示关键基因主要富集在:半胱氨酸型内肽酶的正向调节活动,蛋白溶解的正向调节,半胱氨酸型内肽酶的正向调节,涉及凋亡活动过程的细胞质部分,AMPA谷氨酸受体复合物,炎症复合物,CARD结构域结合,半胱氨酸型内肽酶活性,半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡过程;KEGG信号通路分析结果主要为:结直肠癌,非小细胞癌,子宫内膜癌,上述均与免疫浸润、炎症、自噬凋亡相关;此外,根据关键基因的关联度排名及在HPA在线数据库不同组织中的分布情况,挑选出最显著的差异基因为SIRT1;③细胞实验显示,SIRT1蛋白表达在β-淀粉样蛋白1-42干预后的HT22细胞中显著下调,而经过索马鲁肽处理后明显上升;④结果显示,SIRT1可能是索马鲁肽治疗阿尔茨海默病的靶点基因。

干扰素调节因子敲减细胞系的构建及其对猪伪狂犬病病毒增殖的影响

旨在揭示干扰素调节因子(interferon regulatory factor,IRFs)对猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)增殖的影响,本研究通过shRNA技术构建敲减IRF 1-9的PK15细胞系,并检测其敲减效率。采用流式细胞术以及滴度测定检测敲减IRF 1-9后PRV的增殖情况;利用RT-qPCR技术检测PRV感染细胞后PRV-gB、IFN-β、ISG-15和IL-6的mRNA表达水平;Western blot技术检测PRV感染细胞后gB蛋白的表达水平。敲减效率测定结果显示,PK15细胞中的IRF 1-9 mRNA表达水平均有显著降低;流式细胞术及滴度测定结果表明,敲减IRF 1-9基因后有助于PRV的增殖;RT-qPCR及Western blot结果证明,敲减IRF 1-9基因后,PRV-gB mRNA及蛋白表达水平均有显著提高;细胞炎性因子的mRNA表达水平检测结果发现,敲减IRF 1-9抑制PRV诱导的IFN-β、ISG-15以及IL-6 mRNA表达。综上所述,IRF 1-9是PRV在PK-15细胞内复制的宿主限制因子。

Wnt信号通路与自身免疫调节因子共同参与胚胎干细胞向胸腺上皮祖细胞的分化

背景:自身免疫调节因子(autoimmune regulator gene,Aire)及Wnt信号通路在小鼠胚胎干细胞多能性的维持及分化中都发挥着重要作用,但Wnt信号与Aire是否参与了小鼠胚胎干细胞向胸腺上皮祖细胞的分化尚未可知。目的:探讨Wnt信号通路和自身免疫调节因子与胚胎干细胞分化的关系。方法:采用两步分化方法定向诱导小鼠胚胎干细胞分化为内胚层再分化为胸腺上皮祖细胞,然后用Aire shRNA慢病毒感染小鼠胚胎干细胞,嘌呤霉素筛选单克隆稳定株,再采用两步分化方法进行诱导分化,分别于定向诱导分化第0,3,10天,采用细胞免疫荧光、流式细胞术、Western blot、Real-Time qPCR检测相关基因及蛋白的表达变化。结果与结论:①定向诱导分化第0天,免疫荧光染色显示SSEA1、OCT4表达呈阳性;②定向诱导分化第3天,免疫荧光染色显示SOX17、FOXA2表达呈双阳性;③定向诱导分化第10天,流式细胞术结果显示EPCAM1、K5、K8表达呈阳性;④与未分化的小鼠胚胎干细胞相比,诱导分化的胸腺上皮祖细胞中Wnt7a、β-catenin、Gsk-3β蛋白表达升高,Aire蛋白表达降低;⑤与未分化的小鼠胚胎干细胞相比,诱导分化的胸腺上皮祖细胞中Wnt7a、β-catenin、Gsk-3β及Aire mRNA表达升高;⑥与正常培养的小鼠胚胎干细胞及其最终分化的胸腺上皮祖细胞相比,敲低Aire基因的小鼠胚胎干细胞及其最终分化的胸腺上皮祖细胞中Wnt7a、β-catenin、Gsk-3β蛋白表达水平降低。综上所述,Wnt信号通路和Aire共同参与了小鼠胚胎干细胞定向诱导分化为小鼠胸腺上皮祖细胞的过程。

肌肉生长抑制素8和沉默信息调节因子4与老年慢性心力衰竭心肌重构和心功能损伤的相关性

目的 探讨血清肌肉生长抑制素8(growth differentiation factor-8,GDF-8)和沉默信息调节因子4(silent information regulator 4,Sir4)在老年慢性心力衰竭(chronic heart failure, CHF)中的表达及其与左心室重构和心功能之间的关系。方法 选取2021年1月至2023年12月在郑州大学第二附属医院就诊的CHF患者300例为观察组,纳入同期在郑州大学第二附属医院体检的健康人群100例为对照组;观察组患者根据纽约心脏病协会(New York Heart Association, NYHA)心功能分级分为Ⅰ级组60例、Ⅱ级组72例、Ⅲ级组102例、Ⅳ级组66例。收集临床资料,检测血清GDF-8和Sir4,采用超声心动图检查确定左心室重构情况,采用NYHA心功能分级评估心功能损伤程度。采用Pearson相关性分析和Spearman相关性分析对GDF-8、Sir4与左心室重构、心肌损伤之间的相关性进行分析。结果 观察组左心房内径、左心室舒张末期内径、左心室后壁厚度、室间隔厚度、左心室质量指数、Sir4、GDF-8水平显著高于对照组[(42.46±4.75)mm vs(36.39±5.33)mm,(54.63±7.96)mm vs(47.42±8.08)mm,(9.44±1.21)mm vs(8.49±0.88)mm,(9.27±1.58)mm vs(8.66±1.71)mm,(141.49±5.32)g/m^(2)vs(106.52±7.33)g/m^(2),(3.69±1.06)g/L vs(1.48±0.42)g/L,(33.75±10.64)g/L vs(19.08±5.13)g/L,P<0.01],左心室射血分数、左心室重构指数显著低于对照组[(40.02±10.14)%vs(63.64±6.13)%,(1.05±0.24)g/ml vs(1.32±0.33)g/ml,P<0.01]。Ⅰ级组、Ⅱ级组、Ⅲ级组、Ⅳ级组Sir4和GDF-8水平及左心室质量指数逐渐升高,左心室重构指数逐渐下降,4组间比较差异有统计学意义(P<0.01)。Pearson相关性分析和Spearman相关性分析显示,Sir4、GDF-8与左心房内径、左心室舒张末期内径、左心室后壁厚度、室间隔厚度、左心室质量指数、NHYA心功能分级呈正相关(P<0.01),与左心室射血分数、左心室重构指数呈负相关(P<0.01)。结论 Sir4、GDF-8在老年CHF患者中异常升高,其表达水平与左心室重构严重程度和心功能损伤程度均呈正相关。

沉默信息调节因子6是骨组织再生修复的潜在作用靶点

创伤、感染、肿瘤或全身性疾病等因素引起的节段性骨缺损和骨折不愈合具有成骨范围局限、骨骼愈合周期长等特点。骨组织再生代谢调节因子可加速骨组织修复和高效重建骨缺损区。沉默信息调节因子6(SIRT6)作为一种去乙酰化酶和核苷酸转移酶,广泛参与成骨细胞和破骨细胞等骨细胞的分化、凋亡、代谢和炎症反应的调节,是骨代谢调节的重要因子。SIRT6通过与B淋巴细胞诱导成熟蛋白1形成复合体,并下调核因子κB通路表达,促进雌激素受体α-Fas配体轴信号表达,以抑制破骨细胞生成和成熟分化,从而阻碍骨吸收,导致骨组织骨量增加。另外,SIRT6能通过激活Akt-mTOR途径调节骨髓间充质干细胞自噬水平和成骨能力,并抑制成骨细胞内糖酵解和活性氧生成,通过CREB/CCN1/COX2途径和骨形态发生蛋白信号通路促进成骨细胞分化增加骨的形成,加速骨组织骨再生修复。本文综述了SIRT6参与骨再生病理生理机制的研究进展,揭示其可能作为骨组织修复潜在治疗靶点的意义。

沉默信息调节因子2在胆管癌中的表达及其对可切除胆管癌患者预后的预测价值

目的:探究沉默信息调节因子2(SIRT2)在胆管癌组织中的表达、潜在作用机制及临床意义,并构建可切除胆管癌患者生存预测模型。方法:首先,通过癌症基因图谱和基因表达综合数据库分析SIRT2在胆管癌组织与正常组织中的表达差异,并通过基因集富集分析(GSEA)探讨SIRT2在胆管癌中的潜在机制;其次,免疫组织化学染色检测研究者队列胆管癌组织中SIRT2的表达,并分析SIRT2表达与胆管癌患者临床病理特征和预后的关系。最后,基于COX回归分析结果构建胆管癌术后患者预后列线图预测模型,使用校准曲线及时间依赖性的受试者工作特征曲线(ROC)对列线图模型进行评价,并与美国癌症联合委员会(AJCC)第八版TNM分期预测效果进行比较。结果:公共数据库中SIRT2 mRNA在胆管癌组织中显著过表达,免疫组织化学染色发现SIRT2蛋白在胆管癌组织中表达高于癌旁组织(均P<0.05)。GSEA结果显示,SIRT2高表达可能影响了多种代谢相关信号通路,如脂肪酸代谢、氧化磷酸化、氨基酸代谢等。SIRT2表达与血清三酰甘油水平、肿瘤大小、淋巴结是否转移相关(均P<0.05)。生存分析结果显示,SIRT2高表达患者较低表达患者总生存期显著缩短(P<0.05)。单因素回归分析结果显示,肿瘤分化程度、TNM分期、是否接受后续治疗、SIRT2表达与胆管癌患者预后相关(均P<0.05);多因素回归分析结果进一步证实,TNM分期和SIRT2表达是胆管癌患者总生存期的独立预测因素(均P<0.05)。基于SIRT2构建的胆管癌术后患者列线图生存预测模型C指数为0.675,第1、2、3年的时间依赖性ROC曲线下面积分别为0.879、0.778、0.953,与AJCC第八版TNM分期系统相比具有更好的预后预测价值。结论:可切除胆管癌患者肿瘤组织中SIRT2高表达并与患者不良预后相关,基于SIRT2构建的胆管癌术后患者的预后列线图模型可能比TNM分期系统具有更好的预测作用。

染色质调节因子相关的lncRNA肾透明细胞癌预后模型的构建和验证

目的构建染色质调节因子(CR)相关长链非编码RNA(lncRNA)的肾透明细胞癌(ccRCC)预后模型,提高ccRCC的预后管理。方法从TCGA数据库下载ccRCC的转录组数据和临床数据,并通过“caret”R包将ccRCC样本以7∶3的比例分为训练集(166例)和验证集(71例)。基于“DESeq2”R包筛选出差异表达的CR及相关的lncRNA。构建CR与lncRNA的共表达网络,并筛选出相关系数|rs|>0.3且P<0.05的差异lncRNA。利用单因素Cox、Lasso和多因素逐步Cox回归分析,构建CR相关的lncRNA预后模型。计算训练集和验证集样本的风险评分,根据风险评分的中位数将ccRCC患者分为高、低风险组。K-M曲线和受试者操作特征(ROC)曲线评价模型,单因素和多因素Cox回归分析评估风险评分的独立预测性能。“DynNom”和“shiny”R包开发在线预测工具。单样本基因集富集分析探索风险评分与免疫微环境及免疫检查点的关系。结果本研究最终纳入237个肿瘤样本和72个癌旁正常组织样本,鉴定了1025个CR相关的lncRNA,最终筛选得到7个CR相关lncRNA(DUXAP8、AC026462.3、LINC01460、AL592494.1、AL353804.2、AC012462.1、AC009518.1)构建预后模型,并将其开发成在线工具(https://xzlmodelshiny.shinyapps.io/DynNomapp/)。高危组患者的生存率低于低危组(P<0.05),ROC曲线表明模型预测效能较好,单因素分析和多因素分析中风险评分的HR值分别为4.058(95%CI:2.530~6.508,P<0.001)和3.096(95%CI:1.887~5.080,P<0.001)。高风险组MDSC和Tregs细胞等免疫抑制细胞的浸润比例高于低风险组,趋化因子、免疫检查点及副炎症等通路的富集水平高于低风险组(P<0.05)。此外,风险评分与免疫检查点TNFRSF25和TNFSF14呈正相关(r>0.3,P<0.05)。结论本研究构建的CR相关的lncRNA风险模型可独立有效地预测ccRCC患者的预后。

沉默信息调节因子1在心肌梗死中的研究进展

沉默信息调节因子1(SIRT1)是一种烟酰胺腺嘌呤二核苷酸依赖的组蛋白脱乙酰酶,其可通过抑制氧化应激、炎症、细胞凋亡和纤维化发挥保护作用。大量研究证实,SIRT1与心肌梗死的发生和发展密切相关,SIRT1基因多态性是心肌梗死的易感因素之一。现综述SIRT1基因多态性及表达与心肌梗死的关系,同时总结目前以SIRT1为治疗靶点的研究,旨在为以SIRT1作为靶点的心肌梗死防治策略提供理论依据。

沉默信息调节因子3通过调节线粒体功能障碍减轻特发性肺纤维化的研究进展

特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)是一种以进行性肺瘢痕形成为主要特征慢性进行性肺部疾病[1]。IPF属于典型且常见的纤维性间质性肺病,其病理进程不可逆转,往往会进展为呼吸衰竭和死亡[2],确诊后的平均预期寿命为3~5年[3]。抗纤维化药物pirfenidone和nintedanib可以改善IPF患者的肺功能,但其疗效不佳且副作用较大[4]。

基于TCGA构建染色质调节因子相关LncRNA的胃癌预后模型

目的通过TCGA数据库构建胃癌染色质调节因子相关LncRNA的预后模型,协助评估胃癌患者的预后。方法从TCGA数据库下载胃癌的转录组数据及临床数据,通过差异分析获得在胃癌中差异表达染色质调节因子后共表达筛选出染色质调节因子相关LncRNA,采用COX分析构建胃癌预后模型,并对其预测能力进行风险曲线分析、单因素和多因素独立预后分析、多指标采用受试者工作特征(ROC)曲线验证。结果通过差异分析得出148个在胃癌中差异表达的染色质调节因子,共表达分析及COX分析发现,12个染色质调节因子相关LncRNA具有预后作用并纳入构建预后模型。生存分析、风险曲线分析、单因素和多因素独立预后分析、多指标ROC曲线分析结果均显示该预后模型具有较好的预后预测效果。结论成功构建胃癌染色质调节因子相关LncRNA预后预测模型,能较好地预测患者预后,为胃癌治疗提供参考。