从核糖体DNA ITS区序列研究甘蔗属及其近缘属种的系统发育关系

测定了甘蔗属及其近缘属的 13个种共 4 3个个体和 1个橡草 (Pennisetum schumach)外群的核糖体 DNA中的内转录间隔区 (ITS)及 5 .8S r DNA基因的序列。结果表明 :甘蔗属及其近缘属种的 ITS区 (含 ITS1,5 .8S r DNA和ITS2 )序列的长度范围为 5 89～ 5 91bp,变异位点为 14 0个 ,信息位点为 6 0个 ;其中 ,ITS1和 ITS2的长度范围分别为 2 0 5～ 2 0 8bp和 2 16～ 2 2 0 bp,变异位点分别为 6 4和 6 8个 ,信息位点分别为 33和 2 4个 ;5 .8S r DNA长度范围为 16 4 bp,变异位点为 8个 ,信息位点为 3个。以狼尾草属的橡草 (P.schumach)作为外群 ,运用 PAUP4 .0 b软件构建的系统发育 NJ树表明 :浙江果蔗 (R4 5 )应属于热带种 (S. officinarum ) ;河王八属与蔗茅属的亲缘关系较近 ,各自的金猫尾种与蔗茅种、河王八种与滇蔗茅种分别交叉聚在 2个不同的小分支中 ;斑茅 (S.arundinaceum或 E.arundinaceum)具有其他属不同的特异位点 ,是距甘蔗属较远的一个独立分支 ,从分子水平上提出了斑茅并不属于甘蔗属的观点 ,但其是否属于蔗茅属 ,还是应当立为单种属则需进一步的研究论证。

用SSR标记研究柑橘属及其近缘属植物的亲缘关系(英文)

用SSR标记分析了 2 9份柑橘属及近缘属植物的亲缘关系。 7对SSR引物在 2 9个样品中扩增得到 114个等位基因 ,平均每个位点有 16 3个等位基因。计算匹配系数后用邻接法进行聚类 ,结果表明 ,澳洲指橘与柑橘属的亲缘关系很近 ;SSR位点的高纯合频率支持富民枳种的地位 ;枳与柑橘属的关系较远 ,枳不大可能是从柑橘属衍生而来 ;Swingle的亚属的划分以及田中的原生柑橘类和后生柑橘类的划分界线都不清晰 ;现代栽培柑橘的起源与大翼橙关系密切 ;柑橘属的枸橼、柚和宽皮橘都能很好地分离 ,支持其为现代栽培柑橘的 3个基本种的观点。

利用普通小麦与近缘属间的复合杂交创造小麦新种质

利用永 36 8(普通小麦 )与春品 11(白壳、六倍体小黑麦 )、人工合成小麦双二倍体、柱穗山羊草进行复合杂交 ,采用系谱法 ,按照宁夏小麦品种选育目标 ,经过连续十年的选择 ,培育出 10个稳定优良品系 ,分别为春节 1、2、3、4、5、6号和春山1、2、3、4号。它们与宁夏目前生产上的主栽品种宁春 4号所属的遗传类群不同 ,品质也有明显改进。染色体组原位杂交和醇溶蛋白电泳鉴定结果表明 ,新创造的 7个选系是黑麦染色体 1B/ 1R易位系 ,另外一个品系是涉及黑麦其他染色体的易位系。

甘蔗属及其近缘属种的rbcL基因序列变异和系统发育初步研究(英文)

甘蔗属及其近缘属种在分类关系上非常复杂 ,存在不少混乱。目前关于它们的分类学研究主要是基于形态学和同工酶水平 ,而基因水平上的报道很少。我们对甘蔗属及其近缘属种的部分rbcL基因片段 (1137bp)进行了测序比较 ,以期探讨rbcL基因能否用于研究甘蔗属及其近缘种之间的亲缘关系。序列比较显示rbcL基因在甘蔗属和近缘属种间的变异极低 ,一些来自不同属的个体序列完全一致 ,而某些同属内不同种个体却略有差异。这些结果表明rbcL基因在甘蔗属及其近缘属种之间的进化速率缓慢而不稳定 ,难以用于系统发育研究。不过 ,不同聚类方法都将斑茅与其它属种分开 ,放在玉米与甘蔗属和其它近缘属种分枝的外部 ,提示斑茅不应列入甘蔗属或蔗茅属 ,而应独立为一属。

芽胞杆菌属及其近缘属种名目录

本文所涉及的芽胞杆菌(Bacillus-like)是指来自芽胞杆菌属及其近缘属的能形成具有极强抗逆性的内生孢子即芽胞的一大类厚壁菌门细菌。它们广泛分布于多样化的环境中,而且已经在食品、农林业、工业、生物技术、医学、冶金、环保、军事等领域得到广泛应用,因此,芽胞杆菌的分类研究一直是非常重要的基础性工作。随着实验技术和研究方法的改进,越来越多的芽胞杆菌种类被发现,然而,有大量的新种和新属还没有中文译名;同时,有许多种类的分类地位发生了变动或被合并。这些情况常给我国相关领域的科技人员应用和处理这些物种的名称带来混乱和困惑。本文根据LPSN网站中"具有命名地位的原核生物名称的名录"截至2014年12月底为止的更新版本和《伯杰氏系统细菌学手册》第二版第3卷厚壁菌门的相关信息,结合充分的文献研究,共整理出芽胞杆菌相关的5科71属753种,并在文中列出芽胞杆菌属及其近缘属的分类地位的变动情况以及相关科、属、种的拉丁文学名和中文译名。

ISSR分子标记在甘蔗及其近缘属分类上的应用

对11个甘蔗及其近缘属供试材料,以锚定简单重复序列为引物,通过PCR扩增和凝胶电泳,从100个引物(来自UBC#9)中得到32个引物的清晰特异图谱.出现清晰条带的二核苷酸重复序列引物19个,三核苷酸重复序列引物3个,四、五核苷酸重复序列引物分别为2、3个,5′简并基序引物4个.引物(AC)n产生的多态性条带最多,其次是5′简并基序引物和(GT)n.所有(AG)n引物和6个(TC)n引物中的5个产生多态性条带,说明甘蔗基因组中含有丰富的AG/TC重复序列.总的来看,不同属间平均出现11.6条多态性条带,属内9.5条,种内有6.6条.对32个引物的特征图谱进行聚类分析,树状图与Irvine的分类结果非常相似.由此可见ISSR分子标记在甘蔗分类、基因多态性分析和品种特征图谱的建立中有一定潜力.

基于柑橘及其近缘属植物DNA条形码的叶绿体编码序列筛选

【目的】通过对柑橘及其近缘属植物叶绿体4种编码序列的测定分析,获得能进行DNA条形编码的特征序列,为进一步研究叶绿体非编码区序列奠定基础。【方法】对柑橘及其近缘属植物59份样品进行matK、rpoB、rpoC1、rbcL测序,序列比对与人工校正,计算属间、种间、种内的遗传距离,比较序列间的差异,建立系统发育树。【结果】4种序列中,matK序列在属间、种间差异最大,与其它序列相比具有显著性差异,rbcL序列次之,而rpoB、rpoC1序列两者间没有显著性差异。【结论】matK序列是柑橘及其近缘属植物DNA条形码的未来研究中一个重要的候选片段。

小麦近缘属种纹枯病的抗性鉴定

用土壤接种法对２６份小麦近缘材料、栽培品种及其杂交后代的抗纹枯病性能进行了鉴定。结果表明，小麦近缘植物中存在着丰富的抗纹枯病资源，其中有５份材料表现免疫，他们是节节麦３４、峨观草、野燕麦、八倍体小黑麦、六倍体小黑麦；有１２份材料表现高抗，他们是斯卑尔脱小麦、峨观草（河南）、圆锥小麦、密穗小麦、二棱大麦、阿比西尼亚小麦、节节麦３４×Ｂ１８６、波兰小麦、六棱大麦、硬粒小麦、四棱小麦、茹可夫斯基小麦；有５份材料表现中抗，他们是波斯小麦、东方小麦、节节麦２８×冀麦５４１８、印度圆粒小麦、节节麦２８；只有节节麦３４×豫麦９号为高度感病。

应用RAPD技术研究甘蔗属及其近缘属种间亲缘关系

利用DNA随机扩增多态性(randomamplifiedpolymorphicDNA,RAPD)技术,研究了甘蔗属及其近缘属种间的亲缘关系。选择20个引物扩增,在得到的193个片段中,有3个片段是10个材料共有的,多态性达98%。聚类分析结果表明:甘蔗属可划分为两个组群,即热带种组群(包括热带种、印度种、大径野生种、中国种)和割手密种组群。该结论与Irvine的分类结果非常相似。

甘蔗属起源及其与近缘属进化关系研究进展

阐述了甘蔗起源、进化、分子遗传学在甘蔗与其近缘属的进化关系研究上的应用,回答了甘蔗的起源中心、甘蔗属及其近缘属之间的进化关系,以及当前如何利用细胞学手段和分子标记技术,从微观分子的角度来研究和分析其遗传多样性、生活史进化等生态和进化问题,最后对其发展前景进行了简要的探讨。

楠木种属及其近缘属叶绿体matK基因序列的鉴定

为给楠木及其近缘属植物的 DNA 分子鉴定提供依据，对30种楠木及其近缘属植物进行基因组 DNA 提取，叶绿体 matK 序列扩增与测定，并进行序列比对与人工校正，计算属间及种间的遗传距离，比较序列间的差异，构建系统发育树。结果表明：matK 各基因序列的组成中 G＋C 含量平均为36．6％。30个楠木及近缘属植物共发现72个碱基变异位点，碱基变异率为9．38％。其 matK 基因序列种间遗传距离为0～0．098，平均遗传距离为0．010。聚类分析，新樟属为1个分支，楠属和润楠属聚为1个分支，其余樟属、木姜子属、新木姜子属、山胡椒属、檫木属、月桂属与黄肉楠属聚为1个分支。故 matK 序列基本可以对楠木及其近缘属植物进行属间鉴定，但在种间水平上并不可行。

虫草及其近缘属两个新记录

2007年4月初，在安徽芜湖繁昌马仁奇峰风景区进行虫生真菌资源调查时采集到十余个长在像植物种子上的虫草标本，经鉴定为草剃虫草Cordyceps kusanagiensis Kobayasi＆Shimizu（1983），为中国新记录种。同年7月下旬，在安徽省滁州市琅琊山林场采到一个长在近球形植物种子上的标本，经鉴定为虫草近缘属Shimizuomyces真菌奇异清水菌Shimizuomyces paradoxus Kobayasi（1981），也为中国新记录属种。

四川莴苣属及近缘属 1 0种植物的核型研究

报道了四川莴苣属及近缘属 10种植物核型研究结果 ,其中 6个种染色体数目和核型为首次报道。核型结果为 :莴苣 (Lactucasativa) 8m +8sm (2sat) +2st(sat) ;高大翅果菊 (Pterocypselaelata) 2m +8sm +8st(2sc) ;翅果菊 (Ptero cypselaindica) 6m +10sm +2st(sat) ;多裂翅果菊 (Pterocypselalaciniata) 2m +10sm (4sat) +6st (2sc) ;细梗紫菊 (Noto serisgracilipes) 10m +8sm ;全叶紫菊 (Notoserisguizhouensis) 14m +4sm ;南川紫菊 (Notoserisporphyrolepis) 16m (4sc) +2sm ;三花紫菊 (Notoseristriflora) 10m (2sc) +8sm ;大理细莴苣 (Stenoseristaliensis) 12sm +4st;假福王草 (Paraprenanthessororia) 14m +2sm +2st。属间核型相似 ,为 2A或 3A类型。

七种犁头尖属(Typhonium Schott)植物和两个近缘属等位酶的研究

用凝胶电泳法分析了七种犁头尖属植物和两个近缘属三个种的6种酶系统,检测了7个等位酶位点,利用软件BIOSIS-2进行遗传相似性的聚类分析,绘出树状分支图,将七种犁头尖属植物分为三个组,同时澄清了犁头尖属、斑龙芋属和半夏属之间的近缘性,即犁头尖属与斑龙芋属比与半夏属有较近的亲缘关系。

盐胁迫对近缘属小麦种子发芽的影响

采用培养皿发芽法研究了NaCl胁迫处理对小麦近缘属种子萌发的影响。结果表明:低浓度NaCl胁迫对近缘属小麦种子萌发的影响较小,只有在高浓度NaCl胁迫下,才对种子萌发起抑制作用。不同浓度的NaCl胁迫对近缘属小麦发芽的影响有显著差异。3个小麦近缘属种中,黑麦耐盐性相对最好,小黑麦次之,硬粒小麦耐盐性相对较差。

甘草属与其近缘属植物的同工酶研究

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法,对甘草属( Glycyrrhiza) 植物短荚果系的3 个种和念珠状荚果系6 个种与其近缘属4 个种的子叶和下胚轴进行了超氧化物歧化酶、细胞色素氧化酶和过氧化物同工酶的分析。结果显示:属间、种间具有酶谱差异,每个属有其特征酶谱带。根据同工酶酶谱性状:下胚轴36 个同工酶谱性状和子叶38 个同工酶谱性状,分别对13 个种进行了聚类分析,结果表明,13 个种可划分为2 类;甘草属( Glycyrrhiza) 植物的9 个种很好的聚在一组,盐豆木( H.holodendron) 也在此组,表明两属间关系较近;苦豆子( S.alopecuroides) 、骆驼刺( A.pseudalhagi) 和小花棘豆( O.glabra) 在另一组,它们关系较近。

用微卫星荧光标记分析小麦及其近缘属种的遗传多样性

应用微卫星(SSR)荧光标记技术,对小麦及其10个近缘属种57份材料进行分析。43对引物共检测出7 580个等位变异,每个引物每个模板平均检测出3.09个等位变异。聚类分析表明57份材料被聚成11类,还发现栽培二粒小麦、普通小麦亲缘关系较近,与其他材料亲缘关系较远。聚类结果与现有的植物学分类结果一致。

3个菊属与近缘属属间杂种自交特性研究

对菊属菊花脑(Chrysanthemum nankingense)×菊蒿属菊蒿(Tanacetum vulgare)(JJ),菊属大岛野路菊(Chrysanthemum crassum)×亚菊属多花亚菊(Ajania myriantha)(DD),菊属大岛野路菊(C.crassum)×芙蓉菊属芙蓉菊(Crossostephium chinense)(DF)3个属间杂种的自交特性进行了研究。结果表明:JJ自交不结实,未获得种子。DD自交获得种子8粒,出苗3株,成苗1株,结实率、出苗率和成活率分别为0.11、37.50%和33.33%;自交一代未能获得后代。DF自交获得种子52粒,出苗16株,成活10株,结实率、出苗率和成活率分别为0.48、30.77%和62.50%;DF自交一代株系2自交,获得75粒种子,出苗46株,成活38株,结实率、出苗率和成活率分别为0.94、61.33%和82.60%。DD自交后代的染色体数目为54,DF 3个自交后代的染色体数目均大于54,为非整倍体。DD和DF 2个属间杂种的自交后代部分性状出现不同程度的衰退现象,尤其是花序直径、花心直径、管状花数;叶长/叶宽在各自交后代中差异不显著,表现稳定自交遗传。DD F1自交后代花色及管状花类型均未出现分离;DF F1自交一代中仅1株花色出现了非白色,而自交二代花色出现较大分离。

^(15)N自然丰度法分析甘蔗及近缘属野生种固氮效率

利用^(15)N同位素自然丰度法,在连续两年不施氮肥条件下,对甘蔗及近缘属野生种(材料)的固氮效率进行对比分析,同时筛选出适宜本试验研究的参比植物。试验结果表明,河八王及其后代材料表现出明显的高固氮能力,最高固氮率达到36.13%,最低的为甘蔗栽培种ROC22,固氮率仅为5.72%。银胶菊、胜红蓟和狗尾草与河八王1-1号的δ^(15)N值之差为3.13~3.50,是分析甘蔗及近缘属野生种固氮效率较理想的参比植物。

甘蔗近缘属种23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列分析

【目的】探讨叶绿体23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列在甘蔗近缘属种系统进化中的应用,为深入研究甘蔗近缘属种系统进化提供参考。【方法】以14个甘蔗近缘属种材料为研究对象,测序分析其23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列,并应用BLAST分析其在禾本科中的变异情况。【结果】23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列在14个甘蔗近缘属种材料间的同源性为100%,属于高度保守区域,但在禾本科各亚科间表现出一定的变异,且在各亚科中都存在其特异的变异位点。【结论】23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列在甘蔗近缘属种间属于高度保守的区域,不适合用于甘蔗近缘属种间系统进化的分析,但可为禾本科亚科系统进化的分析提供有用的信息。