PCV3吉林野毒株全基因组序列分析及其Cap蛋白的亚细胞定位

为了研究吉林省猪圆环病毒3型(PCV3)野毒株遗传变异情况及其衣壳蛋白(Cap)的亚细胞定位特征,本试验对收集到的10株PCV3吉林野毒株进行全基因组序列测定和分析,并构建真核表达载体pcDNA3.1V5/HisA-Cap转染猪肺巨噬细胞(PAM);继而用本实验室已构建的兔源PCV3-Cap多克隆抗体,通过激光共聚焦检测Cap蛋白在PAM中的定位。序列分析结果显示,10株PCV3吉林野毒株与国内外参考株之间的全基因组核苷酸序列同源性为95.8%~99.5%,处于PCV3a和PCV3b两个亚群;基因重组分析结果显示,仅中国参考株MF589102(2016年)、MH445396(2019年)和分离株JL-2在80~303 nt、840~1196 nt和1885~2001 nt处发生3处重组。激光共聚焦检测结果显示,Cap蛋白大部分定位于细胞核,少部分定位于细胞质。结果表明,目前吉林省PCV3比较保守,没有出现较大变异,Cap蛋白在PAM的细胞核和细胞质中均有分布。

猪瘟病毒强弱毒株和野毒株E2全基因序列测定及比较分析

为了比较猪瘟病毒 (HCV)野毒株、疫苗株及标准株之间E2基因抗原区域的差异 ,采用RT PCR扩增了HCV石门株、兔化弱毒疫苗株、野毒 0 3及 0 7株的囊膜糖蛋白E2 (gp55)全基因的cDNA片段 ,分别克隆于pGEM T载体中并对其进行了核苷酸序列测定及氨基酸序列的推导 ,同时进行了同源性比较及E2结构与功能的分析。所测 4株HCVE2基因的长度均为1 2 73bp,所编码的氨基酸序列均包括部分信号肽序列和完整的跨膜区序列 ,共由 381个氨基酸组成 ;4个毒株E2蛋白N末端的 683位至 690位信号肽序列 (WLLLVTGA)和C末端 1 0 30～1 0 63位跨膜区均为保守序列 ,而且具疏水性 ;N末端抗原功能区中 ,4个E2蛋白与其它所比较序列在位于第 753位至 759位氨基酸处 ,均有一段保守序列RYLASLH ,无一氨基酸发生变异 ,为亲水性 ,在整个E2蛋白抗原谱中抗原性峰值为最高 ,推测对抗原性产生起重要作用 ;4个E2蛋白的氨基酸序列中均含有 1 5个半胱氨酸 (Cys)残基 ,其数量及位置与国外五株HCV(Brescia ,C ,Alfort.ALD和GPE)完全一致。表明该 4株HCVE2抗原具有相同的构型 ,尤其是N末端的 6个Cys残基对E2蛋白结构的正确折叠及特异抗原决定簇的形成至关重要。同时对主要抗原区域氨基酸位点变异进行分析 ,发现疫苗株与野毒株之间抗原决定簇未发生明显变?

检测猪瘟病毒野毒株胶体金免疫层析方法的建立

为建立快速、简便检测猪瘟病毒(CSFV)野毒的胶体金免疫层析方法(GICA),本研究采用柠檬酸三钠还原法制备胶体金颗粒,标记纯化的抗CSFVE2蛋白的单克隆抗体(MAb)6E10作为捕捉抗体,将纯化的抗CSFVE2蛋白的MAbHQ06和兔抗鼠IgG抗体包被在硝酸纤维素膜上,分别作为检测线和质控线,优化反应条件,组装成胶体金免疫层析试纸条。结果表明,所制备的试纸条用于检测CSFV野毒感染的PK-15细胞培养物,在检测线和质控线处均呈现红色条带,健康PK-15细胞培养物对照仅在质控线呈现红色条带;试纸条检出病毒培养物的最低限为103.5 TCID50;用不同批次的试纸条重复检测,结果无差异;该试纸条不与猪瘟兔化弱毒(HCLV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪轮状病毒(PRV)、伪狂犬病病毒(PrV)、猪细小病毒(PPV)和猪圆环病毒2型(PCV2)反应。所制备的试纸条具有良好的特异性、敏感性和重复性,初步达到了区分检测CSFV野毒株和弱毒株的目的。

PCR方法检测我国脊髓灰质炎病毒Ⅰ型野毒株的研究

用聚合酶链反应试验（ＰＣＲ）检测我国脊髓灰质炎病毒Ⅰ型（ＰＶＩ）野毒株，仅需５μｌＰＶＩ细胞培养液，方法简便、快速、敏感、特异，用本法对我国１４个省市７９份ＰＶＩ分离株的检测结果，能与检定ｓａｂｉｎⅠ相关株的ＳＩ／ＰＣＲ法的检测结果相印证，与其中３１份核苷酸测序判断为野毒株的结果相一致。其检测阳性率为８４．４％，基本能检测我国流行过的５个ＰＶＩ基因型野毒株。另外，从检测结果看，除北京市未发现野毒株外，其它１３个省区都有野毒株流行，表明当前我国消灭脊灰的任务还很重。

猪瘟病毒野毒株RT-LAMP可视化检测方法的建立

本研究旨在建立一种可视化检测猪瘟病毒(CSFV)野毒株的反转录-环介导等温扩增方法(RT-LAMP)。根据CSFV的NS5B基因序列设计一套RT-LAMP引物,以样品的cDNA为模板,利用BstDNA聚合酶,在62℃恒温条件下进行扩增,扩增产物中加入SYBR GreenⅠ染料直接或在紫外光下观察判定扩增结果。该方法可检测出不同基因型的CSFV野毒株,其检出极限为2.5TCID50的CSFV,与实时荧光定量RT-PCR方法的敏感性相当;特异性试验表明,该方法对猪瘟兔化弱毒疫苗株(HCLV)、牛病毒性腹泻病毒以及其它常见猪源病毒均无扩增反应;通过对126份不同样品进行检测比较,该方法与实时荧光定量RT-PCR检测方法的符合率达100%,与引物-探针能量转移PCR方法的符合率为98.4%。该方法无需特殊仪器,是一种适用于基层的快速、简便的CSFV野毒鉴别检测方法。

猪瘟兔化弱毒抗体对不同野毒株体内外中和保护试验的相关性研究

将猪瘟兔化弱毒疫苗阳性血清与猪瘟野毒株HeBZJK1.95、GZGD1.95、HeBHH2.95、BJXC1.95、HeNBY1.96、BJCY1.96、BJSY2.96、BGTX3.96、HeNXH2.98、FJFQ1.99、JL1.94和标准石门株在PK-15单层细胞上进行中和试验,测定了猪瘟病毒抗体在体外对野毒株的中和作用能力.结果表明,阳性血清对HeBZJK1.95、GZGD1.95、B.JSY2.96、JL1.94和石门株的中和效价为1:256,对BGTX3.96株为1:128,对HeBHH2.95、BJCY1.96、HeNXH2.98株为1:64,对BJXC1.95株为1:16,对FJFQ1.99株为1:8,对HeNBY1.96株为1:4.由此表明,对不同毒株血清中和效价不同.另外测定了猪体内免疫抗体与免疫保护力的关系.采用1头份猪瘟兔化弱毒疫苗主动免疫没有母源抗体的猪,免疫后14 d和192 d抗体滴度<1:16,攻击野毒HeNXH2.98株,仔猪能够完全保护.采食初乳的2组仔猪,母源抗体滴度为<1:16～1:64,分别免疫2头份和4头份猪瘟兔化弱毒疫苗,免疫后抗体滴度均下降1～2个滴度(1头母源抗体滴度低的仔猪,免疫4头份后由<1:16达到1:16).攻击野毒HeNXH2.98株后,免疫2头份的仔猪,不管免疫后抗体水平多高(<1:16～1:64),均不完全保护;免疫4头份的仔猪,免疫后抗体滴度较低(1:8)时,不完全保护;抗体滴度≥1:16时,能够完全保护.动物免疫保护试验表明,1头份疫苗免疫抗体水平能起到良好攻毒保护作用,但母源抗体会影响疫苗免疫抗体水平和攻毒保护效果.

闽西地区猪伪狂犬野毒株感染的血清学调查

美国IDEXX公司生产的PRV-gE（gE-ELISA）酶联免疫试剂盒,能对已免疫PR缺失gE的基因工程疫苗或未免疫的猪群,区分疫苗株和野毒株感染。2005～2007上半年,对闽西地区使用gE-基因缺失疫苗的规模化猪场母猪、仔猪和生长猪,不分健康状况,进行PR野毒株感染的血清学调查,结果显示2005年至2006年上半年,该地区母猪PR野毒感染阳性率较高,达41.5%和43.8%,2006年下半年至2007上半年,该地区母猪PR野毒感染阳性率有较大幅度的降低,且阴性猪场很多,阳性率分别是21.3%和13.3%。同时3年来对54个规模化猪场监测结果分析,各猪场阳性率差异很大,3年来猪场阳性率也呈大幅度下降,2007年上半年猪场阳性率仅为33.3%。对仔猪和生长猪的监测结果显示,阳性率比母猪大大降低,并且也呈下降的趋势。

猪瘟病毒野毒株与疫苗株双重SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立

为建立猪瘟病毒(CSFV)兔化弱毒疫苗(C株)与野毒株的快速鉴别检测方法,本研究根据GenBank登录的CSFV C株与野毒株的E2基因序列差异,设计2对特异性引物,建立了同时检测C株与野毒株的双重SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法。应用该方法对CSFV野毒和疫苗株的最低检出量为10拷贝;检测牛病毒性腹泻病毒Ⅰ型、猪繁殖与呼吸综合征病毒、伪狂犬病病毒和猪圆环病毒2型4种病毒均呈阴性;批内、批间重复试验的变异系数均低于3%。应用该方法检测从黑龙江省各地区猪场采集的600份样品,结果表明野毒株的阳性率为30.5%。该方法可应用于CSFV野毒株和C株的鉴别检测。

新城疫野毒株与F_(48)E_9强毒株对不同抗体水平雏鸡的感染试验

应用新城疫野毒株与F48E9标准强毒株对母源抗体效价分别为 8.5 0、6.0 0和 4.0 0log2的雏鸡进行了攻毒试验。结果 ,新城疫野毒株的感染致死率依次为 2 0 %、10 0 %和 10 0 % ;F48E9标准强毒株的感染致死率依次为 0、10 %和10 0 %。提示 ,在目前新城疫流行日益复杂的情况下 。

重庆地区猪伪狂犬野毒株感染的流行病学调查

为了研究重庆地区猪伪狂犬病毒(PRV)野毒株感染情况,笔者从2009年8月份至2011年6月份采集了31个猪场共1 402份血清样品,采用PRV-gE ELISA试剂盒进行检测。结果表明:总阳性率为7.42%;母猪阳性率最低,为4.24%;仔猪阳性率最高,为9.64%;生长猪阳性率为6.65%。

GPV野毒株的分离及PCR检测方法的应用

在本实验中 ,用根据CPVHl标准毒核苷酸VP1_VP3和VP3两个区段基因序列设计的 2对特异性引物GRPl/GRP2和GFl/GF2 ,用该 2对引物对从鹅细小病毒野毒感染的病鹅分离的GPV野毒株进行PCR检测 ,结果 2对引物GRPl/GRP2和GFl/GR2 ,均能特异性地扩增出与预期片段大小相符的 0 .6bp和 1.6bp两个片段。回归试验的结果表明 ,该GFV野毒株的感染潜伏期为 8d ,病程为 1～ 3d ,致死率达 10 0 %。

流行性乙型脑炎减毒活疫苗对国内外不同野毒株的免疫性

目的 研究乙型脑炎减毒活疫苗对国内外不同野毒株的免疫原性。方法 用小鼠保护力试验和空斑减少中和试验检测该疫苗对国内外不同野毒株攻击的保护作用及其免疫血清的中和能力。结果 小鼠免疫 1针后均能抵抗国内 11株和国外 11株乙脑病毒的攻击 ,保护率均可达 90 %以上 ;人体免疫血清对台湾 1株和国外 9株病毒均有明显的中和作用。结论 SA14 142株乙脑活疫苗具有广谱的免疫原性。

新城疫病毒野毒株的分离及其致病新特点

1998年 4月份 ,本厂收检 2 0日龄患病肉仔鸡 8只。发病群临症主要表现为扭颈、后退、长病程 (2周以上 )、高死亡率 (90 %～ 10 0 % )及内脏无眼观病变。迫杀取病料以SPF鸡胚分离出新城疫病毒 (NDV)。经致病性检验证明分离物为NDV野外强毒株 (该强毒株可被常规抗NDV血清中和 )。说明目前已经出现了仅表现单一神经症状而内脏又无眼观病变、长病程且高死亡率的“新型ND”。

鸡传染性支气管炎疫苗株与广西流行野毒株鉴别方法的建立

根据鸡传染性支气管炎病毒(IBV)3′端非编码区和S1基因保守区域设计两对特异性引物,对H120、Ma5和4/91、M41等常用疫苗株以及26株广西田间分离株进行二重RT-PCR扩增,并进行该方法的特异性和敏感性试验,同时进行了初步应用。结果表明,经RT-PCR扩增后,M41毒株得到约160bp的目的片段,Mass型毒株得到约370bp的目的片段,4/91型IBV毒株得到约480bp和345bp 2条目的片段,其他24株广西分离株得到1条大小在260bp^345bp的目的片段。特异性试验表明此二重RT-PCR方法不能扩增NDV、AIV、MDV、IBDV、ALV等,敏感性试验表明最低检测量达到100pg。该方法的临床应用表明,攻毒鸡病料阳性率达90%。研究结果表明了所建立的二重RT-PCR方法可以鉴别IBV疫苗株与广西流行野毒株,且特异性强,敏感度高。

猪伪狂犬病毒野毒株SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR诊断试剂盒的研制

根据GenBank中猪伪狂犬病毒(PRV)gE基因序列设计特异性的引物,PCR扩增获得PRV gE基因片段,构建重组质粒pMD18-T-gE,作为阳性标准品。对SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR反应条件进行优化,建立猪PRV SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR诊断方法,研制诊断试剂盒。扩增产物的熔解曲线分析结果显示只出现单特异峰,无引物二聚体,对猪圆环病毒(PCV-2)、猪细小病毒(PPV)、PRV(gE基因缺失株)、猪源E.coli、猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)均无阳性信号扩增,且重复性好,灵敏度可达2.3×101拷贝/μL。结果表明,研制的PRV野毒株SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR试剂盒特异、灵敏、快速、重复性好,适于伪狂犬病毒临床样品的检测。

猪瘟流行野毒株E_2基因编码的gp55蛋白模拟分析

利用RT-PCR和PCR技术扩增出近期猪瘟流行野毒株的E2基因,将其克隆到载体上测定核苷酸序列,根据Alfort株和Brescia株、C-株确定起始氨基酸三联体的正确位置后推导出其氨基酸序列,结果表明近期流行的猪瘟毒株与疫苗毒株和强毒株之间存在一定差异;利用DNAstar软件分析E2基因编码的gp55蛋白的疏水性、抗原性和二级结构,并与猪瘟疫苗毒株(C-株)进行比较,结果表明,目前流行的猪瘟病毒与疫苗毒的gp55蛋白在抗原性、二级结构上存在一定的差异,而C末端疏水性差异不大。

4株猪瘟流行野毒株病毒结构蛋白E2基因的核苷酸序列分析

应用RT PCR和nPCR扩增由 4株甘肃省近期 ( 1997— 1998)猪瘟流行野毒株的E2基因 ,将其克隆到pGEM TEasy载体上 ,经转化、筛选、鉴定后 ,测出核苷核序列。 4株流行毒株的E2基因核苷酸序列同源性为 89.2 %— 99.7% ,相应的氨基酸序列同源性为 93 .8%— 99.0 %。这 4株流行毒株 ;与C 株 (疫苗种毒 )E2基因的核苷酸序列同源性为82 .2 %— 84.3 % ,相应的氨基酸序列同源性为 87.9%— 90 .2 % ,表明近期猪瘟流行毒株与C 株的 gp5 5蛋白之间存在一定的差异。

GPV野毒株鉴定及其致病力试验

在送检的小鹅瘟病料中分离到1株病毒,经NS1基因特异性引物扩增后确定是GPV。用该对引物对从鹅细小病毒野毒感染的病鹅分离的GPV野毒株进行PCR检测,结果该对引物能特异性地扩增出与预期片段大小相符的1.9kb片段。回归试验结果表明,该GPV野毒株的感染潜伏期为8天,病程为1～3天,致死率达100%;对雏鹅半数致死量LD50为3.4。

犬瘟热病毒野毒株与疫苗株联合RT-PCR鉴别方法的建立

为了建立快速、有效的鉴别犬瘟热病毒(CDV)野毒株与疫苗株的诊断方法,根据CDV野毒株与疫苗株N基因的保守区域以及H基因的多变区域设计特异性引物,建立了区分CDV野毒株与疫苗株的联合RT-PCR方法。结果表明,针对N基因的RT-PCR方法能同时检测CDV野毒株与疫苗株;而针对H基因的RT-PCR方法只能检测CDV野毒株,不能检测CDV疫苗株。根据2次RT-PCR反应结果,能够很好地区分CDV野毒株与疫苗株。同时,经过病毒电镜观察和H基因扩增片段的克隆测序结果的比对,进一步确认了该方法的特异性。表明,该方法具有快速、特异、实用等优点,可作为CDV鉴别诊断的有效手段。