应用噬菌体展示随机12肽库筛选诺如病毒抗原模拟表位

目的:利用Ph.D.-12噬菌体展示肽库筛选诺如病毒(NoV)的抗原模拟表位。方法:包被与GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.17型NoV具有高特异性及中和能力较强的单链可变片段抗体(scFv),用Ph.D.-12噬菌体展示肽库进行3轮生物淘选。ELISA鉴定淘选所得噬菌体与scFv的结合活性及其与NoV P蛋白的竞争作用;阳性克隆测序后进行生物信息学分析,合成多肽鉴定其抗原性。结果:发现1段与GⅡ.6 VP1区同源性较高的氨基酸序列“MG-D-W”,综合分析提示其可能为GⅡ.6 NoV的抗原模拟表位,且合成的包含“MG-D-W”的多肽可竞争抑制P蛋白与人类组织血型抗原(HBGAs)受体的结合。结论:“MG-DW”是与NoV单链抗体高亲和力的肽段,可能模拟了GⅡ.6 NoV与scFv结合的抗原表位。

用噬菌体随机12肽库筛选单纯疱疹病毒2型gD基因模拟抗原表位的研究

目的用针对HSV-2gD的单克隆抗体(McAb)从噬菌体展示随机12肽库中筛选HSV-2gD基因的抗原模拟表位,寻找更有效的小片段短肽作为HSV新型基因工程疫苗的候选抗原。方法利用HSVgDMcAb淘筛噬菌体随机12肽库,经"吸附-洗脱-扩增"的4轮筛选,随机挑取噬菌体克隆经酶联免疫吸附实验(ELISA)进行鉴定,并对阳性克隆所携带的外源DNA片段进行序列测定和计算机辅助分析。结果经4轮生物淘筛后特异性噬菌体克隆得到了富集,对阳性克隆的分析结果表明P-PLW和PYH--H氨基酸序列是模拟gD基因抗原表位的骨架结构,携有此短肽的噬菌体可以与McAb特异结合。结论从噬菌体随机12肽库中筛选到的外源序列可以模拟HSV-2gDMcAb针对的抗原表位,可能是HSV-2gD一个抗原表位的替代抗原,为进一步研究HSV-2基因疫苗奠定了基础。

应用噬菌体随机12肽库筛选TβR Ⅱ特异性序列

目的从噬菌体随机12肽库中筛选TGF-β1Ⅱ型受体(TGF-beta receptorⅡ,TβRⅡ)的特异性序列,评估其对瘢痕疙瘩成纤维细胞的作用。方法以人TGF-β1单克隆抗体为靶,在噬菌体随机12肽库中进行4轮生物筛选;应用ELISA法挑选结合活性较好的单克隆噬菌体,进行DNA序列分析;MTT法评估TGF-β1单克隆噬菌体对瘢痕疙瘩成纤维细胞的生物学效应。结果测序共获得5种类似于TβRⅡ的特异性序列。MTT结果显示其中有3种噬菌体模拟肽能够抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞增殖。结论具有TβRⅡ特异性序列的噬菌体模拟肽能够抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞增殖。

抗TNF-α单克隆抗体对噬菌体随机12肽库的筛选

目的试从噬菌体随机多肽库中筛选出能与肿瘤坏死因子 α(TNF α)特异性结合的短肽分子。方法采用抗TNF α单克隆抗体作为配基 ,免疫亲和筛选以融合蛋白形式在丝状噬菌体M13 外壳蛋白Ⅲ表达的随机 12肽文库 ,按“吸附 -洗脱 -扩增”的淘洗过程 ,经过 3轮免疫筛选后 ,随机挑取阳性噬菌体克隆用ELISA及斑点ELISA检测其特异性。结果经过 3轮免疫筛选 ,特异性结合的阳性噬菌体克隆富集增加近10 0倍 ,第 3轮筛选后随机挑选 7个阳性噬菌体克隆经ELISA和斑点ELISA检测 ,有 5个克隆能与抗TNF α特异性结合。结论噬菌体随机肽库技术可以应用于分析、鉴定抗TNF α的表位 ,继而为获得亚单位表位水平的诊断试剂和抗TNF

抗肿瘤坏死因子-α单克隆抗体对噬菌体随机12肽库的免疫筛选

目的从噬菌体随机多肽库中筛选出能与肿瘤坏死因子-α特异性结合的短肽分子。方法采用肿瘤坏死因子-α作为配基,免疫亲和筛选以融合蛋白形式在丝状噬菌体M13外壳蛋白Ⅲ表达的随机12肽文库,按“吸附-洗脱-扩增”的淘洗过程,经过3轮免疫筛选后,随机挑取噬菌体克隆用双抗体夹心ELISA及斑点ELISA测其特异性,并用混合的阳性噬菌体克隆分别与SLE患者和正常人血清反应,以斑点ELISA法分析其诊断系统性红斑狼疮的价值。结果经过3轮免疫筛选,特异性结合的阳性噬菌体克隆富集增加近100倍,第3轮筛选后随机挑选7个阳性噬菌体克隆,经双抗体夹心ELISA和斑点ELISA检测,有5个克隆能与肿瘤坏死因子α特异性相结合,其中A值最高的5个克隆混合后与SLE患者血清结合率明显高于正常人,差异有显著性。结论噬菌体随机肽库技术可以应用于分析、鉴定肿瘤坏死因子α的表位,继而为获得亚单位表位水平的诊断试剂和抗肿瘤坏死因子α的短肽疫苗提供依据。

噬菌体肽库筛选抗人B7-H4中和抗体的模拟抗原表位及其免疫原性鉴定

目的:用噬菌体呈现随机12肽库筛选能与抗人B7-H4(h B7-H4)中和抗体特异性结合的模拟抗原表位肽,并用其免疫小鼠检测其免疫原性。方法:以抗h B7-H4中和抗体为靶分子,用体外生物淘洗法从噬菌体呈现随机12肽库中筛选与之结合的噬菌体克隆,用竞争性细胞ELISA鉴定阳性噬菌体克隆;化学合成候选多肽,并与钥孔血蓝蛋白或破伤风毒素偶联鉴定多肽的特异性;进一步用融合蛋白免疫小鼠检测其免疫原性和抗血清的补体依赖的细胞杀伤活性(CDC)。结果:经过3轮体外筛选后随机挑取50个阳性噬菌体克隆,其中20个克隆与抗h B7-H4抗体有较强的结合能力,DNA测序得到6组结构相似的肽序列;竞争性ELISA结果显示1号肽噬菌体能与细胞表面的h B7-H4竞争性地结合抗h B7-H4单抗;点杂交结果显示1号肽能特异性结合抗h B7-H4单抗;小鼠免疫实验结果显示1号肽融合蛋白能诱导高滴度的抗h B7-H4抗血清,并且抗血清具有补体依赖的细胞杀伤活性。结论:筛选得到能与抗h B7-H4中和抗体特异性结合的12肽模拟抗原表位序列并且具有免疫原性,为进一步开发h B7-H4相关的多肽疫苗提供了实验依据。

能与SLE患者血清总IgG抗体识别的噬菌体抗原表位模拟肽的研究

目的:从噬菌体随机肽库中,筛选能与SLE患者血清总IgG抗体特异结合的SLE相关抗原表位的噬菌体模拟肽,并寻找对SLE敏感性和特异性均高的模拟肽。方法:制备SLE患者血清总IgG抗体,以此作为筛选配基,按“吸附-洗脱-扩增”的淘洗过程,对噬菌体随机12肽库进行3轮免疫筛选,随机挑取噬菌体克隆并进行初步鉴定,最后取混合阳性克隆检测SLE患者和正常人血清,分析其与SLE反应的敏感性和特异性。结果:经3轮免疫淘洗后,特异结合的噬菌体富集增加近100倍。随机挑取的11个噬菌体克隆,经鉴定均能与总IgG抗体产生特异性反应,阳性率100%。混合的阳性克隆与SLE反应的敏感性和特异性分别为80%和67%。结论:利用SLE患者血清总IgG抗体筛选噬菌体随机肽库,能获得多种SLE相关抗原表位的噬菌体模拟肽,因其对SLE的敏感性和特异性均高,故有潜在的诊断价值,有望利用该技术开发SLE特异性IgG抗体检测试剂盒。

基于抗原表位预测的MUC1模拟肽表位筛选

目的:预测粘蛋白1(Mucin1,MUC1)抗原的B细胞表位,从噬菌体随机多肽文库筛选及鉴定MUC1抗原的模拟表位。方法:对MUC1的二级结构及免疫原性进行分析,预测MUC1的抗原表位。利用纯化获得的Ma695抗体筛选噬菌体随机12肽库,夹心ELISA分析噬菌体克隆,测定阳性克隆DNA序列,竞争性抑制实验鉴定阳性噬菌体克隆。结果:MUC1存在有17个潜在的抗原表位区域。经3轮筛选,获得了14个阳性克隆,DNA序列分析并推导出其氨基酸序列:KHYDPFHHRMPQ,QADTARSVALAG,VPSKPDLHVRSI及MTPIHYWNHNRV;4个噬菌体展示肽克隆抑制率均在50%以上。结论:预测MUC1抗原B细胞表位,为进一步研究MUC1结构和功能奠定了基础。所得序列KHYDPFHHRMPQ,QADTARSVALAG,VPSKPDLHVRSI及MTPIHYWNHNRV能模拟MUC1抗原表位。

P-糖蛋白结合肽的筛选及合成肽鉴定

目的筛选人膀胱癌P-糖蛋白特异性结合肽并合成鉴定。方法利用表达获得的P-糖蛋白胞外段融合蛋白为靶蛋白,采用酶联板法筛选噬菌体随机12肽库,化学合成该特异性肽序列,免疫细胞化学方法进行鉴定。结果从噬菌体随机肽库中筛选获得了与P-糖蛋白特异性结合的噬菌体阳性克隆,测序获得特异性结合肽序列。免疫细胞化学结果显示特异性合成肽可与耐药细胞BIU-87/ADM结合,而与敏感细胞BIU-87不结合。结论筛选获得的结合肽具有一定的亲和力,可与特定的肿瘤细胞结合,表现出一定的肿瘤特异性;P-糖蛋白结合肽的筛选,为人膀胱癌多药耐药的靶向治疗结论提供实验依据。

应用噬菌体随机十二肽库筛选TGF-β1相关模拟肽的实验研究

目的应用噬菌体随机12肽库生物筛选获得转化生长因子-β1(TGF-β1)噬菌体模拟肽。方法以人TGF-β1单克隆抗体为靶,进行4轮生物淘选,随机挑取单克隆噬菌体,ELISA法检测单克隆噬菌体的结合力。对结合力较好的单克隆噬菌体提取噬菌体DNA,进行测序,行序列分析。结果经过4轮生物淘选,特异性噬菌体模拟肽获得了富集,ELISA检测结果显示,获得的一些噬菌体模拟肽具有较好的结合力,测序获得10个与促进成纤维细胞增殖或抑制细胞增殖有关的碱基序列。结论从噬菌体随机十二肽库中可淘选到与TGF-β1相关的噬菌体模拟肽。

日本血吸虫细胞免疫原模拟表位的筛选及初步鉴定

目的从噬菌体随机12肽库中筛选日本血吸虫(Schistosoma japonicum,S.j)具有保护性的细胞免疫原模拟表位,为进一步阐明其免疫保护性分子机制提供依据。方法用具有保护性的S.j12d童虫培养细胞(S.jC-12)免疫鼠血清中的IgG对随机12肽库作亲和筛选,随机挑取20个噬菌体克隆用ELISA检测其特异性;对阳性克隆进行测序,采用ELISA和Western blot检测阳性克隆免疫鼠血清中的特异性抗体及其识别天然抗原的特性。结果经过4轮免疫淘洗,洗脱的噬菌体得到了有效富集(16 250倍)。20个噬菌体克隆经检测有15个能被S.jC-12免疫鼠血清识别,有12个序列不同的噬菌体克隆;ELISA检测显示有11个阳性噬菌体克隆诱导小鼠产生IgG应答,其中含精氨酸的阳性噬菌体克隆免疫血清中IgG水平与不含精氨酸克隆免疫鼠比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论利用噬菌体展示技术可筛选出S.jC-12免疫原的部分模拟表位且能在小鼠模型中诱导免疫应答。

噬菌体随机肽库技术筛选抗CCR5单克隆抗体的识别表位

目的利用噬菌体随机肽库技术筛选趋化因子受体5(CCchemokine receptor 5,CCR5)单克隆抗体的识别表位。方法用抗CCR5单克隆抗体筛选噬菌体随机12肽库,采用双抗体夹心ELISA法鉴定噬菌体阳性克隆,挑取阳性克隆测定DNA序列,推导其氨基酸序列并进行同源性分析。结果从噬菌体随机12肽库中筛选出30株可与抗CCR5单抗特异结合的噬菌体克隆,其中多数克隆呈现核心序列HY-TC-SS-XX-P/FYS-X,该序列与CCR5的一级序列ECL2具有一定的同源性。结论 HY-TC-SS-XX-P/FYS-X序列是抗CCR5单抗的识别表位。

人泌尿系上皮肿瘤疫苗的初步研究

目的通过筛选噬菌体随机12肽库获得MUC1糖链抗原模拟表位。方法利用纯化获得的M a695抗体筛选噬菌体随机12肽库,通过夹心ELISA分析噬菌体克隆,测定阳性克隆DNA序列并进行同源性及氨基酸分析,竞争性抑制实验鉴定噬菌体克隆。结果经3轮筛选,获得了14个阳性克隆,DNA序列分析并推导出氨基酸序列:KHYDPFHHRMPQ,QADTARSVALAG,VPSKPDLHVRSI,MTPIHYWNHNRV。鉴定结果表明4个噬菌体展示肽克隆抑制率均在50%以上。结论所得序列KHYDPFH-HRMPQ,QADTARSVALAG,VPSKPDLHVRSI,及MTPIHYWNHNRV模拟了MUC1抗原表位。

转化生长因子β1的关键序列筛选及鉴定

目的应用噬菌体随机12肽库,筛选转化生长因子β1(Transforming growth factor-beta1,TGF-β1)的关键序列,进行TGF-β1活性短肽的合成,并检测其与成纤维细胞的亲和力。方法以TGF-β1单克隆抗体为靶,筛选噬菌体随机12肽库,获得TGF-β1的特异性序列。进行序列比对分析,选择TGF-β1的关键序列。进行TGF-β1活性短肽的合成、纯化、修饰及免疫荧光标记。应用免疫荧光法检测TGF-β1活性短肽的成纤维细胞亲和力。结果筛选噬菌体随机12肽库,获得10个与TGF-β1相似的特异性序列。分析获得7个TGF-β1的关键序列。合成获得7个TGF-β1活性短肽,并纯化至98%,短肽的C端进行氨基化封闭,N端进行罗丹明激光染料标记。免疫荧光检测结果显示,1个TGF-β1活性短肽能够与成纤维细胞相结合。结论从噬菌体随机12肽库中筛选到TGF-β1的关键序列,1个TGF-β1活性短肽能够与成纤维细胞相结合,有望应用于促进创面愈合的相关研究。

两种不同噬菌体筛选方法所获的卫氏并殖吸虫抗原模拟表位抗原性比较

目的比较从兔抗蚯蚓血清免疫球蛋白(E-Ig)结合后的噬菌体12肽库中和从噬菌体肽库中筛选出的两种卫氏并殖吸虫抗原模拟表位的抗原性。方法以肺吸虫病患者血清免疫球蛋白(Pw-Ig)作为靶分子,分别对噬菌体12肽库(PwA)和经过 E-Ig 筛选一轮后的肽库(PwB)进行3轮吸附-洗脱-扩增的淘筛,随机挑取 PwA 和 PwB 蓝色噬菌斑各24个扩增,用 ELISA 方法检测并比较两者的抗原性。结果24个 PwA 克隆中有12个可以与肺吸虫病患者血清发生免疫反应,其中 A_(491)nm 值较高的2个克隆具有较好的特异性和敏感性;24个 PwB 克隆中有10个可以被卫氏并殖吸虫病患者血清所识别,其中 A_(491)nm 值较高的2个克隆具有较好的抗原性。结论从 PwA 和 PwB 中均筛选到了对肺吸虫具有潜在诊断价值的抗原模拟表位,提示以异源性抗体结合后的肽库作为源肽库来筛选寄生虫抗原模拟表位是可行的,为研制新型诊断试剂提供了一条新的着眼点。

幽门螺杆菌基因克隆表达及其抗原表位分析

目的克隆表达幽门螺杆菌基因hp0410,构建12肽噬菌体展示库,对hp0410的抗原表位进行筛选和分析,为构建多表位嵌合疫苗提供理论依据。方法从幽门螺杆菌NCTC11639基因组DNA中扩增出hp0410,并克隆入pGEX-4T-1中表达。利用纯化重组蛋白筛选出特异性单抗E018,利用该单抗和M13噬菌体12肽随机肽库,构建HP0410抗原表位的抗原展示库。竞争-抑制实验验证获得的阳性噬菌体并测序,生物信息学分析HP0410的抗原表位。结果成功构建可高水平分泌型表达HP0410的原核表达系统。对13株阳性噬菌体测序后获得8个表位,其中候选表位1个。HP0410可有效抑制展示该表位的噬菌体与单抗E018结合。分析表明,获得的8个表位与HP0410同源性不高,但处于生物信息学预测的区域。结论获得8个HP0410高抗原性区域的模拟表位,其中1个为模拟单抗E018特异性结合的抗原决定基的候选表位。

生殖支原体黏附蛋白MgPa特异结合多肽的筛选与鉴定

目的：利用噬菌体展示随机12肽库筛选生殖支原体黏附蛋白（ MgPa）的特异结合多肽，以了解MgPa的生物学功能及其可能的致病机制。方法以纯化的重组生殖支原体黏附蛋白（ rMgPa）为靶分子，对噬菌体展示随机12肽库进行3轮生物淘选，收集淘选后的噬菌体进行扩增培养，利用碘化钠法提取其单链DNA进行测序分析。用ELISA、竞争性结合试验和斑点免疫印迹试验检测阳性噬菌体与rMgPa结合的特异性。结果进行3轮生物淘选后，噬菌体克隆有明显富集。随机挑取的38个噬菌体克隆中，共出现11种不同的外源性多肽序列（ P1~P11）。根据11条多肽序列中氨基酸出现的重复次数，推导出两条核心序列，即：V-H-W-D-F-R-Q-W-W-Q-P-S和D-W-S-S-W-V-H/Y-R-D-P-Q-T/S。 ELISA、竞争性结合试验和斑点免疫印迹试验的结果表明：11个代表性克隆中，有10个（P1~P10）能与rMgPa发生特异结合。结论成功筛选到了能与rMgPa发生特异结合的2条多肽，为了解MgPa的生物学功能，从而进一步了解Mg可能的致病机制提供前期实验基础。

鸡DEC-205结合肽的筛选及体外鉴定

为筛选鸡DEC-205的优势结合肽,以小鼠CD8α信号肽、鸡DEC-205具有结合作用的3个C型凝集素样结构域(CTLD-4、CTLD-5和CTLD-6)、人IgG1 Fc和His标签作为目的基因,设计构建重组表达质粒pcDNA3.1-DEC-205-Fc-his和pcDNA3.1-Fc-his(用于对照);转染293t细胞,Western blot鉴定蛋白表达;镍亲和层析法纯化蛋白,用于噬菌体线性12肽库筛选结合肽,protein G/A交替进行了3轮液相淘选,对第3轮噬斑提取DNA测序并统计肽重复率。对重复率较高的短肽进行合成,ELISA及荧光显微镜观察鉴定肽与重组蛋白的结合效果。Western blot结果显示,转染重组质粒的293t细胞裂解液和细胞上清均可表达目的蛋白,DEC-205-Fc-his蛋白约90 kDa, Fc-his蛋白约35 kDa,与预期大小符合,纯化的蛋白作为靶标进行3轮淘选后,15条序列出现重复,其中DLPVNSVIFPFR(DL)重复率最高(达到6.41%)。ELISA及荧光检测结果显示,合成的DL短肽可结合表达DEC-205-Fc-his的细胞,与表达Fc-his的细胞亲和性较低。筛选获得的DL短肽经体外鉴定,结果显示是鸡DEC-205的潜在配体,相关结果将为研发鸡DEC-205新型靶向策略奠定基础。

两种方法纯化的抗体筛选华支睾吸虫模拟抗原表位的比较

目的比较用不同方法纯化的IgG从噬菌体随机12肽库中筛选出的华支睾吸虫模拟抗原表位。方法用饱和硫酸铵沉淀法和饱和硫酸铵沉淀法加层析法(两步法)纯化提纯的华支睾吸虫病患者血清IgG筛选华支睾吸虫模拟抗原表位,扩增随机挑取噬菌斑并进行序列分析和免疫学鉴定。结果硫酸铵沉淀法纯化IgG筛选的20个噬菌体克隆,6个有不同的DNA插入序列,Western blot显示6个克隆均可与华支睾吸虫患者血清反应,斑点免疫金银染色法有3个克隆可被华支睾吸虫患者血清识别。两步法纯化IgG筛选的20个噬菌体克隆,9个有DNA插入序列,其中有2个序列相同;Western blot和斑点免疫金银染色法显示9个克隆均可与华支睾吸虫患者血清反应。结论两种方法纯化的IgG均筛选到了可与华支睾吸虫患者血清结合的模拟抗原表位,用两步法纯化IgG筛选的模拟抗原表位更具有潜在的诊断价值。

犬种布鲁氏菌ZG株单克隆抗体4H3抗原模拟表位的筛选及分析

【背景】目前犬布鲁氏菌病诊断存在一定的困难。【目的】筛选并研究犬种布鲁氏菌单克隆抗体4H3株的特异性抗原表位。【方法】利用噬菌体肽库展示技术,以犬种布鲁氏菌单克隆抗体4H3株作为靶分子,包被酶标板,用12肽随机肽库经过3轮生物淘洗程序进行筛选。经过3轮筛选后,噬菌体产出率从5.00×10^(−7)增加到9.84×10^(−6),假阳性率逐轮降低。从第3轮筛选的阳性克隆中随机挑取14个进行增殖,提取基因组DNA,进行测序分析;并通过iELISA和cELISA检测阳性克隆的亲和性和特异性。【结果】14株阳性单克隆噬菌体共出现3种不同的短肽序列,分别是KMSIRHPIRLPI、ILRRRRKRIIQI和QRIHMRLTTQS;iELISA结果表明3种短肽序列与单克隆抗体的亲和性依次为KMSIRHPIRLPI>ILRRRRKRIIQI>QRIHMRLTTQS;cELISA结果显示短肽KMSIRHPIRLPI和ILRRRRKRIIQI特异性较强。对亲和性较强、特异性较高的2条短肽KMSIRHPIRLPI和ILRRRRKRIIQI展开具体分析,比对分析表明KMSIRHPIRLPI与犬种布鲁氏菌RM6/66菌株的肽酶C26家族蛋白(PuuD)有比较高的相似性,氨基酸符合率为75%,而且存在4位连续相似氨基酸;ILRRRRKRIIQI与布鲁氏菌6/66菌株中3-氧酰基-[酰基载体蛋白]还原酶(OAR)相似性较高,氨基酸符合率为75%,存在2位连续相似氨基酸。【结论】利用噬菌体肽库展示技术筛选出与犬种布鲁氏菌ZG分离株单克隆抗体特异性结合的短肽序列。