利用AFLP技术研究玉米及其野生近缘种的遗传关系

用AFLP分子标记技术对 5 0个有代表性的玉米及其野生近缘种大刍草、摩擦禾、薏苡材料进行了遗传关系分析。利用 2 1个PstⅠ MseⅠ引物组合检出可辨认带共 6 4 1条 ,其中多态性带 5 86条 ,平均每对引物得到 30 5 2条多态性带 ,多态性 91 4 %。聚类分析结果表明 ,可以将 5 0个材料分为 3大类 ,与已有的玉米族分类一致 ,但与玉蜀黍属内的种间和种内分类存在差异 ,说明大刍草各种内存在较大的遗传多样性。本实验发现玉蜀黍属与摩擦禾关系比与薏苡的关系更近 ,但并没有发现玉米与小颖玉米亚种比与其他大刍草的遗传关系更近。

棉花AFLP技术体系的摸索与建立

对影响棉花AFLP技术体系的多种因素作了探讨 ,得到了一种适于棉花AFLP银染技术的优化体系。该体系中各优化因素为 :①模板DNA浓度为 15 0ng·μL-1;②酶切体系中 ,MseI和EcoRI各加入 3units ,使用NEBbuffer2 ,反应时间为 2h ;③连接最适反应时间为 10h ;④连接产物最适稀释倍数为 10倍 ;⑤预扩增产物最适稀释倍数为10倍。

应用AFLP技术检测莲藕遗传多样性的初步研究

利用AFLP技术对12个莲藕品种进行了DNA多态性分析。从10对引物中筛选出2对引物应用于扩增基因组DNA,共获得72条带,其中64条为多态性标记,每个引物平均提供36个标记信息。由UPMGA方法进行聚类分析结果显示了12个品种间的亲缘关系,聚类结果与它们的系谱关系非常吻合。

AFLP技术运用于小麦种子超干燥保存遗传完整性的初探

小麦种子被干燥和超干燥至 9.0 % ,8.0 % ,7.0 % ,6 .0 % ,5 .0 % ,4 .0 %后 ,密封包装于江西南昌常温保存。保存五年后 ,发芽结果表明 ,小麦种子于亚热带地区常温保存 ,必须先经过干燥密封包装。种子最适含水量介于 7.0 %～ 9.0 %之间 ,不同品种间有差异。种子经发芽生长至三叶一心期 ,取幼苗 (茎与叶 ) ,用AFLP分子技术对其单株及 2 0株的混合样品进行遗传稳定性鉴定 ,结果表明 ,每对引物的AFLP图谱谱带丰富 ,不同引物的清晰带有 2 6至 5 2条 ,不同品种间差异带在 3至 6条。同一品种不同的含水量之间AFLP图谱谱带整齐划一 ,未见明显差异。同一含水量不同混合样品或单株样品间也未见差异 ,表明小麦种子经干燥、超干燥后于亚热带地区 (江西南昌 )常温保存五年后 ,在AFLP分子水平上未见遗传变异。同时本研究也为贮藏种子的遗传完整性研究提供了一个新的思路。

利用AFLP技术分析中国明对虾的韩国南海种群和养殖群体的遗传差异

利用AFLP技术对新发现的中国明对虾的一个地理种群--韩国南海种群(SP)和中国明对虾的养殖群体(CP)进行了遗传分析.每个群体随机取样30个,5对AFLP引物获得326个位点.其中SP多态位点比例(P0.99)46.93%,Shannon多样性指数(I)0.1884,Nei(1978)基因多样性指数(h)0.1197,群体差异性位点9个,占检测位点总数的2.7%.CP多态位点比例(P0.99)51.84%,Shannon多样性指数(I)0.1954,Nei(1978)基因多样性指数(h)0.1229,群体差异性位点19个,占检测位点总数的5.8%.SP种群各项遗传参数都低于CP种群.两个群体的非偏差遗传相似度和遗传距离分别为0.9899和0.0102.利用中国明对虾的韩国南海种群和养殖群体杂交可以获得新的种质资源,这将为获得最大变异数量性状表型和基因多样性的产生提供可能.

运用AFLP技术估计毛白杨及其杂种毛新杨的遗传杂合水平

首次报道以毛新杨 (Populustomentosa×P .bolleana)无性系TB0 1×毛白杨 (P .tomentosa)无性系LM5 0的回交子代 12 0株随机个体为材料 ,利用扩增性片断长度多态性 (AFLPs)标记技术研究毛白杨及其杂种毛新杨的遗传平均杂合水平。研究结果表明 :30对不同的AFLP引物组合能够检测到毛白杨的遗传平均杂合水平范围为 9 10 %～ 30 19% ,平均为 18 71% ;而毛新杨的遗传平均杂合范围为 1 39%～ 2 0 31% ,平均杂和水平约为 8 4 7%。因此 ,对于分离群体亲本杂合度来说 ,毛白杨平均杂合度为毛新杨的 2 2 1倍。

AFLP技术在微生物分类鉴定、基因标定及遗传多样性方面的应用

简述了AFLP技术的原理 ,比较了AFLP方法与其他分子标记的不同及其优缺点。着重论述了该技术在微生物分类、鉴定、基因标定及遗传多样性方面的应用。

用AFLP技术构建棉花雄性不育三系及其杂种F_1的DNA指纹图谱

实验应用 AFL P同位素标记法 ,获得了棉花细胞质雄性不育系、保持系、恢复系及其杂种F1的 DNA指纹图谱。较为详尽地介绍了有关AFLP的技术核心及注意点 ,并探讨了其适用于棉花研究的方法。结果表明 ,AFL P是一种十分有效的 DNA指纹技术 ,它具有多态性丰富、稳定性高。

利用cDNA-AFLP技术分析旱作促进水稻种子根伸长过程中的基因表达(英文)

短期旱作促进水稻种子根的伸长。利用cDNA AFLP技术分析种子根根尖在旱作条件下差异表达的基因 ,同时比较这些基因在种子根尖、侧根和不定根原基区的表达差异。在 1 6 4 0个片段中 ,70个在种子根根尖中受旱作诱导 ,其中 2 4个被克隆并测序。 2个基因分别编码丙酮酸脱氢酶激酶(PDK)和腺嘌呤转磷酸核糖基酶 (APRT) ,并用电子拼接技术获得水稻的APRT全长cDNA ;另一个经cDNA末端快速扩增法延长后仍无同源序列。Northern杂交验证了这 3个基因的cDNA AFLP表达谱。这是首次报告使用cDNA AFLP技术研究水稻根组织的差异表达基因。

扁桃基因组DNA的制备和AFLP技术体系的建立

AFLP技术对DNA模板的质量要求较高。桃属果树扁桃的叶片含有较高的糖分、多酚类等物质,基因组DNA的纯化比较繁琐。笔者采用3×CTAB缓冲液提取基因组DNA,并加以纯化,使DNA质量达到AFLP技术的要求。在AFLP分析中,筛选出合适的引物组合:采用E+3/M+3选择性引物组合时,扩增条带少;改用E+2/M+3引物组合后,扩增产物主要分布在600～100bp内,且扩增条带数目适中,多态性适宜,电泳图谱清晰。

应用cDNA-AFLP技术分离应答BABA诱导的番茄抗病相关基因

应用cDNA-AFLP技术研究番茄根部组织应答BABA(β-Aminobutyric Acid,β-氨基丁酸)诱导后基因转录谱,得到与植物获得性抗性相关的差异表达片段29条,克隆测序后获得10个上调基因片断.经过生物信息学分析和功能预测,其同源基因都是植物体在抗病、抗逆反应中的表达序列标签.根据功能可将其分为5类:第1类是防御反应基因,为病程相关蛋白基因P69家族成员,具有蛋白水解酶功能;第2类是转运蛋白基因,负责细胞内外离子、水和小分子物质的跨膜运输;第3类是信号传导蛋白,是Ca2+信号传导途径上重要的功能蛋白;第4类是分子伴侣蛋白BIF1,协助蛋白质的复性;第5类属功能未知基因.研究表明:BABA诱导植物根部抗病机制涉及植物多方面生理生化反应,由多个功能不同基因共同参与控制.差异表达片段的获得将有助于下一步全长抗病基因的克隆和BABA诱导植物抗性机制的研究.

木豆种质资源遗传多样性研究中的AFLP技术优化及引物筛选

以来自国际半干旱热带作物研究所 (ICRISAT)的 2份栽培木豆 (Cajanuscajan)和 1份野生木豆 (Cajanusscarabaeoides)资源为试材 ,将AFLP技术体系在木豆资源研究上进行优化 ,并筛选出 2 0对多态性高的AFLP引物组合 ,推荐用于将来的木豆种质遗传多样性分析。

用cDNA-AFLP技术构建基因组转录图谱

以分离群体mRNA反转录的cDNA为模板进行AFLP分析 ,在保留AFLP多态性丰富、稳定性高、无需了解序列信息等优点的同时 ,集中显示基因组表达序列的多态性差异 ,已逐渐发展成为基因差异表达显示、表达基因遗传连锁作图和基因克隆的常用方法。本文介绍了作图群体组配、总RNA提取与mRNA分离、cDNA合成、AFLP分析、转录图谱多态性分析作图等cDNA AFLP分析的主要技术。

AFLP技术在蔬菜作物遗传育种研究上的应用

综述了AFLP技术在蔬菜作物遗传图谱构建、遗传多样性和物种亲缘关系分析、重要基因的定位、基因的表达调控研究、蔬菜作物品种 (系 )的指纹图谱构建和杂种纯度鉴定、分子标记辅助选择等研究领域上的应用。并对该技术在蔬菜作物遗传育种研究上的应用前景进行了探讨。

利用AFLP技术研究海湾扇贝不同养殖群体的遗传结构及其分化

采用AFLP分子标记技术对我国海湾扇贝的4个不同地理群体共80个个体利用7对引物组合进行了遗传多样性分析.4群体的多态位点比例分别为:加拿大养殖群体48.8235%,墨西哥湾养殖群体49.2914%,秦皇岛养殖群体38.2353%,浙江养殖群体41.1765%.平均杂和度分别为0.1878,0.1886,0.1265和0.1618.遗传距离介于0.1188～0.0941之间.4个群体的Fst为0.1883.根据遗传距离绘制了UPGMA聚类图.4个群体间的遗传关系如下:加拿大群体和浙江群体聚为一支,墨西哥湾群体和秦皇岛群体聚成一支,最后这两支聚在一起.试验结果表明,经过长时间累代养殖的浙江、加拿大、墨西哥湾群体仍保持较高的杂合度,与引种时间最短的(2年)、最为接近美国自然群体的秦皇岛群体比较,以上3个群体没有出现多态位点比例和杂合度显著下降的现象.

AFLP技术在食品微生物研究中的应用

随着现代分子生物学技术的发展 ,对微生物学的研究也进入到分子、基因水平。扩增片段长度多态性(AFLP)是一种基于PCR的高分辨率DNA指纹技术 ,它能检测整个微生物基因组的多态性 ,并且结果可重复、分辨率高。近些年来 ,AFLP在细菌等微生物的遗传相关性鉴定、流行病学分型等上的应用得到迅速发展。文中介绍了AFLP技术的基本原理、反应流程 。

AFLP技术及其在植物基因组研究中的应用

ＤＮＡ指纹技术是１９８５年在人体遗传研究中发展起来的一种先进的遗传标记方法，它很快地在动物、植物、微生物上得到广泛的应用。随着ＤＮＡ指纹技术的广泛采用，许多新的ＤＮＡ指纹技术不断涌现。然而，这些技术基本上是在两个不同的基础上发展起来的，其一是基于经典...

利用太空诱变、AFLP技术及日光温室加代选育航椒3号辣椒一代杂种

选择天水羊角椒、甘农线椒2个辣椒品种原种干种子,搭载在"神州3号"飞船上进行太空诱变处理。收回种子后,采用田间观察和AFLP技术相结合的方法,检测太空诱变处理的效果。利用日光温室进行加代选育,每年选育两代。选择优良变异,通过自交,选育优良自交系;同时,配制杂交组合,选育优良一代杂种。结果表明:太空诱变处理后,2个辣椒品种在太空诱变处理后的第一代就产生了明显变异,自交4代后选育出了高纯度自交系。对太空诱变、AFLP技术、日光温室加代选育等技术集成创新,显著地提高了育种效率,仅三年时间选育出了极早熟、优质、高产、抗逆、广适的辣椒一代杂种"航椒3号"。