长链非编码RNA CASC15低表达在伴NPM1基因突变的急性髓系白血病中的临床意义

目的:确定急性髓系白血病(AML)患者骨髓样本中长链非编码RNA CASC15的表达水平及甲基化水平,并进一步探讨其在AML中的临床意义。方法:纳入82例初治AML患者和18例健康对照者,同时分析了来自GEO和TCGA等7个公共数据集中的CASC15表达和甲基化数据。应用ROC曲线分析确定CASC15表达对AML患者的鉴别意义;使用X-tile方法将患者分为CASC15高表达组和CASC15低表达组,并采用Kaplan-Meier法及单因素和多因素Cox回归分析确定CASC15的预后价值。结果:与健康对照者相比,CASC15在AML患者骨髓细胞中表达显著降低(P<0.001)。ROC曲线分析结果表明,CASC15表达可能是鉴别AML的潜在生物标志物。CASC15在造血过程的早期阶段表达水平较高,在多能祖细胞分化阶段达到峰值,然后迅速下降至低值波动。在FAB亚型中,CASC15在M0中的表达水平显著高于M1-M7。CASC15低表达患者更有可能发生NPM1突变(P=0.048),而高表达患者更易发生IDH1(P=0.021)和RUNX1(P=0.014)突变。在伴NPM1突变的AML患者中,CASC15低表达患者的总体生存时间更短,多因素分析也证实CASC15表达是伴NPM1突变的AML患者总体生存时间的独立影响因素。此外,CASC15在AML患者骨髓样本中的甲基化水平较健康对照者显著降低,高甲基化患者总体生存时间和无病生存时间更短。结论:CASC15在AML中表达降低,并且CASC15低表达提示伴NPM1基因突变的AML预后不良。CASC15在AML中甲基化水平显著降低,高甲基化可能预示患者预后不良。

终末期肾脏病血液透析患者血清LncRNA CASC15 LncRNA MALAT1表达及临床意义

目的:探讨终末期肾脏病血液透析患者血清LncRNA CASC15、LncRNA MALAT1表达及临床意义。方法:选择本院2019年1月至2020年12月开始规律透析治疗终末期肾脏病患者为研究组,按照1∶1比例随机选择本院首次需要行透析治疗的CKDⅢ~Ⅳ期患者62例为对照组。对血液标本中血肌酐(SCr)、尿酸(UA)、eGFR、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、尿素(BUN)、血红蛋白、C反应蛋白(CRP)、血钙和血磷含量进行检测以实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)基于SYBR Green法扩增目的序列。随访研究组患者开始透析1年内临床终点时间发生情况。结果:研究组血清LncRNA CASC15、LncRNA MALAT1表达显著高于对照组(P>0.05);LncRNA CASC15高表达组SCr、BUN高于LncRNA CASC15低表达组,eGFR、血红蛋白低于LncRNA CASC15低表达组(P<0.05);LncRNA MALAT1高表达SCr、UA、BUN高于LncRNA MALAT1低表达组,eGFR、血红蛋白低于低表达组,差异具有统计学意义(P<0.05);不同LncRNA CASC15表达水平尿毒症患者发生心血管事件、全因死亡率差异具有统计学意义(P<0.05),不同LncRNA CASC15、LncRNA MALAT1表达水平放弃治疗(全因死亡)比较差异具有统计学意义(P<0.05),不同LncRNA CASC15、LncRNA MALAT1表达水平分组脑血管意外、严重感染和消化道出血发生率比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:LncRNA CASC15、LncRNA MALAT1在终末期肾脏病血液透析患者血清中显著上调,与患者临床参数和透析临床终点时间密切相关,有望成为治疗靶点进行深入研究。

长链非编码RNA CASC15在成釉细胞瘤中的差异表达及生物信息学分析

目的:探讨CASC15在成釉细胞瘤(ameloblastoma, AM)组织中的表达及其在AM发生、发展过程中的作用机制。方法:分析8对AM及其正常瘤旁组织二代高通量全转录测序数据筛选出的目的 lncRNA CASC15,采用DEseq2算法筛选与CASC15具有显著差异表达的mRNA;通过与GO数据库以及KEGG数据库中的基因注释进行比对,以及基因本体论(Gene Ontology,GO)分析和信号通路分析。通过计算Pearson和K-core,分析差异表达mRNA相对于CASC15的核心度,构建CASC15与差异mRNA的共表达网络。采用qRT-PCR检测CASC15在AM组织中的表达,采用GraphPad Prism 8软件包对数据进行统计学分析。结果:在CASC15相关mRNA中筛选出172个具有差异表达的mRNA。GO分析显示,与CASC15差异共表达的mRNA主要参与细胞增殖、信号转导、迁移和血管生成等生物学行为。信号通路分析显示,与CASC15共表达的mRNA主要参与癌症相关信号通路、Hedgehog、p53等信号通路,破骨细胞分化、细胞周期等途径。共表达网络分析筛选出5个与CASC15有密切联系的高核心度mRNA—FGF18、EPCAM、PTCH1、SHH和GLI1,可用于后续AM复发、侵袭机制的研究。qRT-PCR结果显示,CASC15在AM中高表达,相对于瘤旁正常组织的差异表达倍数为11.41倍(P<0.0001),相对于牙囊组织中的差异表达倍数为11.72 (P<0.0001)。结论:CASC15在AM中高表达,可能通过调控细胞增殖、迁移、细胞周期等参与AM的发生、发展。

长非编码RNA CASC15影响肝细胞SREBP1a表达及定位

长非编码RNA CASC15(long non-coding RNA CASC15,CASC15)被认为是一种与肿瘤相关的lncRNA,参与调控多种肿瘤的侵袭、增殖和迁移等生物学过程。然而CASC15在细胞内脂质代谢中的作用仍不明确。胆固醇调节元件结合蛋白1(SREBP1)是细胞内调控脂质代谢的关键转录因子,其成员SREBP1a主要调控脂肪合成中关键酶基因的表达。本文通过分子生物学实验及细胞功能学实验,研究CASC15对人肝细胞中脂质调控因子SREBP1a表达及定位的影响。研究结果显示,在肝细胞中,过表达CASC15(P<0.001)后细胞内的SREBP1a的mRNA和总蛋白质水平不变,前体蛋白质水平增加(P<0.05)且定位发生改变,即入核增加;SREBP1a调控脂肪酸合成相关产物游离脂肪酸(P<0.001)和甘油三酯(P<0.001)呈下调趋势。本文揭示了CASC15调控肝细胞脂代谢的一种可能机制,希望为脂代谢紊乱相关疾病的治疗和研究提供新思路。

长链非编码RNA CASC15与肿瘤的研究进展

长非编码RNA(lncRNA)负责各种细胞功能,如转录和转化调节以及基因表达的变异。lncRNA CASC15是染色体6p22.3中一个长的异源性非编码RNA(lncRNA)位点。先前的研究表明,lncRNA CASC15与神经母细胞瘤和黑色素瘤等几种癌症的生物行为有关。本综述结合近期文献,总结lncRNA CASC15参与肿瘤的发生发展作用与分子机制,以期为肿瘤的诊断和治疗提供新的理论依据。

长链非编码RNA CASC15在胶质瘤细胞自噬过程中的调控作用

目的探讨长链非编码RNA CASC15在胶质瘤细胞自噬过程中的调控作用.方法应用TCGA和GTEx数据库分析CASC15在胶质瘤组织与正常组织中的表达情况,构建过表达细胞系;应用PCR法检测CASC15在不同细胞系中的表达及转染后的表达情况,CCK8检测CASC15对细胞的生长能力的影响,Western blot检测自噬相关蛋白LC3和P62的表达.结果CASC15在胶质瘤组织及胶质瘤细胞系中高表达,并可促进U251和U87胶质瘤细胞的生长;CASC15能够增加胶质瘤细胞LC3Ⅱ/LC3Ⅰ的比率,并降低P62的表达;CASC15还能促进ATG3的表达,但ATG5和ATG7无变化.结论CASC15可促进胶质瘤细胞生长,并激活胶质瘤细胞自噬.

LncRNA CASC15通过miR-153-3p/Nrf2反馈环调控胃癌细胞增殖、侵袭和上皮间质转化

目的:探讨LncRNA CASC15通过miR-153-3p/Nrf2反馈环对SGC-7901细胞增殖、侵袭和上皮间质转化(EMT)的影响。方法:采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法分析胃癌组织、癌旁正常组织、SGC-7901细胞、GES-1细胞中LncRNA CASC15、miR-153-3p和Nrf2的表达量。下调CASC15后,通过MTT、Transwell及Western blotting实验检测SGC-7901细胞的增殖、侵袭和EMT能力。用miRcode和双荧光素酶报告基因实验分析LncRNA CASC15的作用靶点、CASC15和miR-153-3p的相关性。检测下调miR-153-3p对SGC-7901细胞增殖、侵袭和EMT的影响以及上调LncRNA CASC15通过miR-153-3p对SGC-7901细胞增殖、侵袭和EMT的影响。TargetScan软件分析miR-153-3p的作用靶点,双荧光素酶报告基因实验检测miR-153-3p和Nrf2之间的关系。分析Nrf2 siRNA对SGC-7901细胞的增殖、侵袭和EMT的影响。结果:与癌旁正常组织相比,胃癌组织中LncRNA CASC15和Nrf2表达上调,miR-153-3p表达下调;与GES-1细胞相比,SGC-7901细胞中LncRNA CASC15和Nrf2表达上调,miR-153-3p表达下调。LncRNA CASC15 siRNA或Nrf2 siRNA抑制了细胞增殖、侵袭与EMT;LncRNA CASC15靶向miR-153-3p,miR-153-3p靶向Nrf2。miR-153-3p inhibitor促进SGC-7901细胞增殖、侵袭与EMT;上调LncRNA CASC15通过miR-153-3p促进Nrf2表达(均P<0.05)。结论:LncRNA CASC15在胃癌中表达上调且通过miR-153-3p/Nrf2轴促进SGC-7901细胞增殖、侵袭及其EMT。

真核基因组编码大量长链非编码RNA癌易感性候选基因15在肺癌细胞中表达上调且通过miR-153-3p激活Wnt/β-catenin通路调控A549细胞增殖、侵袭及化疗敏感性实验研究

目的:探讨真核基因组编码大量长链非编码RNA癌易感性候选基因15(lncRNA CASC15)调控肺癌A549细胞增殖、侵袭和化疗敏感性的作用机制。方法:实时荧光定量PCR实验分析lncRNA CASC15、miR-153-3p在65例肺癌组织、50例癌旁组织、肺癌A549细胞和正常肺上皮BEAS-2B细胞中的差异表达。选取A549细胞进行培养,并将siRNA CASC15转染A549细胞,分析下调CASC15对A549细胞增殖和侵袭的影响,用不同浓度顺铂(0、2、4、8、16μg/ml)处理A549细胞后,检测细胞活力和凋亡率。miRcode预测lncRNA CASC15的潜在结合靶点,双荧光素酶报告基因实验进一步分析与miR-153-3p之间的相关性。下调miR-153-3p或同时上调lncRNA CASC15和miR-153-3p表达,分析A549细胞增殖、侵袭和化疗敏感性情况。过表达或下调miR-153-3p,检测Wnt/β-catenin通路相关蛋白表达。XAV939作用细胞后进一步检测miR-153-3p对A549细胞的增殖、侵袭和化疗敏感性的影响。结果:与癌旁正常组织或BEAS-2B细胞相比,肺癌组织或A549细胞中lncRNA CASC15表达上调(均P<0.01),miR-153-3p表达下调(均P<0.01)。与siRNA NC组相比,CASC15 siRNA组A549细胞活力和侵袭能力明显降低,增强了细胞对顺铂的化疗敏感性;lncRNA CASC15靶向miR-153-3p;miR-153-3p inhibitor转染A549细胞对癌细胞增殖和侵袭能力具有显著促进作用,下调了细胞对顺铂的化疗敏感性;上调lncRNA CASC15与miR-153-3p表达,显著上调了A549细胞的活力和侵袭能力。下调miR-153-3p激活了A549细胞内Wnt/β-catenin通路,XAV939作用细胞后影响了A549细胞增殖、侵袭及其化疗敏感性。结论:lncRNA CASC15在肺癌A549细胞中表达上调且通过miR-153-3p激活Wnt/β-catenin通路调控A549细胞增殖、侵袭及化疗敏感性。