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几种动物胆汁的组分对比及树脂法精制CDCA初探 被引量:6
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作者 杨春梅 王洪钟 +1 位作者 胡瑞兰 冯作山 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2006年第6期467-471,共5页
采用薄层层析法对蟾蜍、兔、鸡、猪及牛胆汁的组分进行了初步分析,结果表明,蟾蜍胆汁中主要是胆酸(CA)和几种不明物质;兔胆汁中主要是去氧胆酸(DCA)和少量的胆酸(CA);鸡胆汁中以鹅去氧胆酸(CDCA)和胆酸(CA)为主;猪胆汁中主要是鹅去氧胆... 采用薄层层析法对蟾蜍、兔、鸡、猪及牛胆汁的组分进行了初步分析,结果表明,蟾蜍胆汁中主要是胆酸(CA)和几种不明物质;兔胆汁中主要是去氧胆酸(DCA)和少量的胆酸(CA);鸡胆汁中以鹅去氧胆酸(CDCA)和胆酸(CA)为主;猪胆汁中主要是鹅去氧胆酸(CDCA)、猪去氧胆酸(HDCA)和石胆酸(LCA)为主;牛胆汁中主要是胆酸(CA)、去氧胆酸(DCA)以及少量的鹅去氧胆酸(CDCA)。采用紫外扫描皂化胆汁,确定了皂化胆汁的最大吸收波长,并以此为紫外检测波长首次对离子交换树脂法提取CDCA进行了初步研究并得到了高纯度的CDCA精品。 展开更多
关键词 动物胆汁 胆汁酸成分分析 cdca 离子交换树脂 薄层层析
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三叶青乙酸乙酯提取物通过miR-515-5p/CDCA5调控结直肠癌细胞HCT116增殖、迁移及侵袭 被引量:4
2
作者 李志发 罗超元(指导) +1 位作者 吴小兵 陈戎 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第24期2970-2971,2985,共3页
结直肠癌是临床常见的一种消化系统恶性肿瘤,中药提取物具有抗氧化、抗肿瘤等作用,并可抑制结直肠癌等肿瘤细胞的增殖等生物学行为[1-3]。三叶青属于葡萄科崖爬藤属多年生藤本植物,可抑制肝癌细胞增殖并可促进细胞凋亡[4]。miR-515-5p... 结直肠癌是临床常见的一种消化系统恶性肿瘤,中药提取物具有抗氧化、抗肿瘤等作用,并可抑制结直肠癌等肿瘤细胞的增殖等生物学行为[1-3]。三叶青属于葡萄科崖爬藤属多年生藤本植物,可抑制肝癌细胞增殖并可促进细胞凋亡[4]。miR-515-5p在肿瘤细胞中表达下调,上调其表达可抑制肿瘤细胞迁移[5]。starbase预测显示CDCA5可能是miR-515-5p的靶基因,CDCA5在结直肠癌细胞中表达水平升高,并可通过激活ERK信号通路从而促进结直肠癌发展进程[6]。因此,本研究主要探究三叶青乙酸乙酯提取物对结直肠癌细胞增殖、迁移及侵袭的影响,探讨其对miR-515-5p/CDCA5分子轴的调控作用。 展开更多
关键词 结直肠癌细胞 消化系统恶性肿瘤 三叶青 HCT116 cdca 肝癌细胞增殖 中药提取物 葡萄科
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人类胚胎干细胞分化前后CDCA8基因启动子区甲基化状态的实验研究 被引量:2
3
作者 戴灿 潘艺 +2 位作者 苗聪秀 周菂 卢光琇 《激光生物学报》 CAS CSCD 2010年第2期259-262,共4页
目的:分析在人类胚胎干细胞分化过程中,CDCA8基因启动子区甲基化的状态。方法:生物信息学预测人类CDCA8基因上游2 kb区域的CpG岛。抽提未分化和自然分化的人类胚胎干细胞gDNA,应用重亚硫酸盐修饰和DNA序列分析方法检测CDCA8基因启动子区... 目的:分析在人类胚胎干细胞分化过程中,CDCA8基因启动子区甲基化的状态。方法:生物信息学预测人类CDCA8基因上游2 kb区域的CpG岛。抽提未分化和自然分化的人类胚胎干细胞gDNA,应用重亚硫酸盐修饰和DNA序列分析方法检测CDCA8基因启动子区CpG岛甲基化情况。结果:未分化和自然分化的人类胚胎干细胞中,被检测的CDCA8基因启动子区CpG岛均未发现明显的甲基化修饰。结论:在人类胚胎干细胞分化前后,CDCA8基因启动子关键区域的甲基化状态未发生明显改变。 展开更多
关键词 胚胎干细胞 cdca8 甲基化 重亚硫酸盐修饰
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口服UDCA和CDCA溶石治疗胆石症 被引量:2
4
作者 王凯 傅淑花 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 1997年第1期18-19,共2页
胆石症患者口服药物UDCA和CDCA溶石疗法作为一种非创伤性治疗方法已广泛地应用于临床,但其疗效受多种因素的影响,本文就其临床应用及影响疗效的因素作一综述。 一、应用范围 1.适应症 口服药物溶石疗法并不能溶解所有胆石,只对胆固醇结... 胆石症患者口服药物UDCA和CDCA溶石疗法作为一种非创伤性治疗方法已广泛地应用于临床,但其疗效受多种因素的影响,本文就其临床应用及影响疗效的因素作一综述。 一、应用范围 1.适应症 口服药物溶石疗法并不能溶解所有胆石,只对胆固醇结石有效,有严格的适应症。其适应症包括:(1)X线可透过的胆固醇结石;(2)胆囊造影提示胆囊机能良好;(3) 展开更多
关键词 胆结石 药物疗法 UDCA cdca 溶石疗法
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基于TCGA数据集分析CDCA5在肺腺癌中的临床意义与分子机制 被引量:5
5
作者 王萍 黄奔 +6 位作者 范维 柳家翠 程庆元 段怡萍 陈梁玥 马甜甜 喻明霞 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第12期1616-1620,共5页
目的研究细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)在肺腺癌中的表达、临床意义和分子作用机制。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载肺腺癌RNA测序数据和患者的临床资料,使用R 3.6.1软件提取并分析CDCA5在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达量,探... 目的研究细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)在肺腺癌中的表达、临床意义和分子作用机制。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载肺腺癌RNA测序数据和患者的临床资料,使用R 3.6.1软件提取并分析CDCA5在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达量,探究CDCA5表达与患者临床病理特征的联系。结合患者的生存资料,利用cox回归分析CDCA5在肺腺癌患者中的预后作用。使用基因集富集分析(GSEA)探索CDCA5在肺腺癌中的分子作用机制。结果在TCGA肺腺癌数据集(TCGA-LUAD)中,CDCA5在肺腺癌组织中的表达水平显著高于正常肺组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。高表达的CDCA5与肺腺癌患者的TNM分期(P=0.003)和淋巴结浸润(P=0.016)显著相关。多因素cox回归分析显示,CDCA5可以作为肺腺癌的独立预后指标(HR=1.28,95%CI:1.06~1.54,P=0.010)。GSEA分析结果表明,高表达的CDCA5主要参与细胞周期、DNA复制、错配修复、同源重组、RNA降解以及P53信号通路等。结论 CDCA5在肺腺癌组织中表达明显上调,并且与肺腺癌患者的恶性进展特征相关,CDCA5可作为预测肺腺癌预后的新型分子标志物。 展开更多
关键词 cdca5 TCGA 肺腺癌 预后因子 GSEA
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细胞周期相关因子CDCA3基因shRNA表达载体的构建及鉴定 被引量:1
6
作者 李娟 唐刘君 +5 位作者 王晓辉 查欣 胡中倩 邢小翠 杨晓明 汪思应 《安徽医学》 2012年第2期136-140,共5页
目的设计能转录短发夹状RNA(short hairpin RNAs,shRNA)的DNA序列,构建能有效下调CDCA3蛋白表达的shRNA真核表达载体,研究其对CDCA3表达的影响,以便进一步研究CDCA3的功能。方法根据文献获得CDCA3的siRNA靶序列,依据RNA干扰机制和shRNA... 目的设计能转录短发夹状RNA(short hairpin RNAs,shRNA)的DNA序列,构建能有效下调CDCA3蛋白表达的shRNA真核表达载体,研究其对CDCA3表达的影响,以便进一步研究CDCA3的功能。方法根据文献获得CDCA3的siRNA靶序列,依据RNA干扰机制和shRNA靶序列的设计原则,以CDCA3基因为靶基因,合成一对编码shRNA的两条DNA序列,经退火后合成DNA双链,再克隆至shRNA表达载体pSIREN-DNRDsRed质粒中,连接产物转化E.coilJM109感受态细胞,然后挑取克隆提质粒,进行酶切鉴定和DNA序列测定。将构建成功的载体通过脂质体介导转染导入人胚肾HEK293细胞,采用Western blot法和Realtime RT-PCR,检测特异性shRNA对CDCA3蛋白在mRNA及蛋白表达水平的抑制效果。结果成功构建靶向CDCA3蛋白的特异shRNA的真核表达载体;转染HEK293细胞后,可显著下调CDCA3在细胞内的mRNA水平及蛋白表达水平。结论 CDCA3蛋白的特异shRNA的真核表达载体能显著下调HEK293细胞内的CDCA3蛋白表达。成功构建CDCA3 shRNA表达载体,为进一步研究CDCA3基因的功能提供了实验基础。 展开更多
关键词 cdca3蛋白 RNA干扰 SHRNA 载体构建
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CDCA2在肿瘤中的研究进展 被引量:1
7
作者 曹金玉 陈敏洋 +1 位作者 柯小林 刘繁荣 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1102-1105,共4页
细胞分裂周期相关(cell devision cycle associated,CDCA)基因家族是与细胞周期有关的一种蛋白,其家族共有CDCA1~8八个成员。现有研究表明,CDCA可参与肿瘤细胞周期、凋亡以及增殖等多种生物学行为。目前已证实CDCA2在多种肿瘤中均表达失... 细胞分裂周期相关(cell devision cycle associated,CDCA)基因家族是与细胞周期有关的一种蛋白,其家族共有CDCA1~8八个成员。现有研究表明,CDCA可参与肿瘤细胞周期、凋亡以及增殖等多种生物学行为。目前已证实CDCA2在多种肿瘤中均表达失调,其可能作为重要的分子标志物参与肿瘤的发生、发展。探讨CDCA2在肿瘤中的作用机制可能对疾病的早期诊疗和预后有重大的研究和临床意义,该文就CDCA2及其在多种肿瘤中的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 肿瘤 cdca2 细胞周期蛋白 文献综述
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CDCA3在肿瘤领域的研究进展 被引量:7
8
作者 王芹 孙正魁 《实用癌症杂志》 2018年第6期1043-1044,共2页
细胞周期调控异常将导致细胞过度增殖以及恶性肿瘤的发生。因此,细胞周期调控相关因子的研究对于揭示肿瘤的发生发展具有重要意义。在细胞周期的不同阶段,细胞分裂调控基因的表达都是必需的。许多研究报道了致癌作用与细胞周期相关基因... 细胞周期调控异常将导致细胞过度增殖以及恶性肿瘤的发生。因此,细胞周期调控相关因子的研究对于揭示肿瘤的发生发展具有重要意义。在细胞周期的不同阶段,细胞分裂调控基因的表达都是必需的。许多研究报道了致癌作用与细胞周期相关基因的关系。 展开更多
关键词 cdca3 肿瘤
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CDCA3在下咽鳞癌中的表达及临床意义
9
作者 吴俊福 代立媛 +3 位作者 崔萌 杜伟 刘善廷 娄卫华 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2020年第18期919-924,共6页
目的:探索与下咽鳞癌生长、转移及预后相关的分子标记物,为开发下咽鳞癌新的疗法提供理论依据。方法:分析Oncomine肿瘤芯片数据库中细胞分裂周期相关蛋白3(cell division cycle associated protein 3,CDCA3)在头颈部鳞癌及癌旁组织中的... 目的:探索与下咽鳞癌生长、转移及预后相关的分子标记物,为开发下咽鳞癌新的疗法提供理论依据。方法:分析Oncomine肿瘤芯片数据库中细胞分裂周期相关蛋白3(cell division cycle associated protein 3,CDCA3)在头颈部鳞癌及癌旁组织中的表达差异,检测下咽鳞癌及癌旁组织中CDCA3的表达,分析其表达水平与下咽鳞癌患者临床病理特征及预后的关系。结果:通过分析Oncomine肿瘤芯片数据库中CDCA3的DNA拷贝数,发现在肿瘤基因图谱(TCGA)数据集中,相比全血及正常头颈部组织,CDCA3的DNA拷贝数在头颈鳞癌组织中显著上调(P<0.05)。下咽鳞癌组织中CDCA3的mRNA相对表达水平较癌旁正常黏膜表达水平升高(P<0.05)。CDCA3的蛋白表达水平与肿瘤大小、淋巴结转移及TNM分期等临床病理特征相关(P<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线分析显示CDCA3阳性表达组患者的总生存期显著低于CDCA3阴性表达组(P<0.05)。结论:CDCA3在下咽鳞癌组织中高表达,与下咽鳞癌患者原发肿瘤大小、TNM分期以及淋巴结转移情况密切相关,是影响患者预后的独立危险因素。 展开更多
关键词 下咽鳞癌cdca3 预后
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NTERA-2细胞中人类CDCA8基因的转录因子谱的芯片分析(英文)
10
作者 戴灿 苗聪秀 +1 位作者 刘刚 卢光琇 《激光生物学报》 CAS CSCD 2010年第3期291-296,共6页
为了研究细胞周期相关基因8(CDCA8)的转录调控机制,首先克隆了人类CDCA8基因5’端上游的1071 bp转录调控区。生物信息学预测发现,此区域存在一系列已知转录因子的可能结合位点。联合运用DNApull-down和转录因子芯片技术分析发现共有114... 为了研究细胞周期相关基因8(CDCA8)的转录调控机制,首先克隆了人类CDCA8基因5’端上游的1071 bp转录调控区。生物信息学预测发现,此区域存在一系列已知转录因子的可能结合位点。联合运用DNApull-down和转录因子芯片技术分析发现共有114种转录因子在人恶性多发性畸胎瘤细胞(NTERA-2)中与该区域结合,其中某些转录因子有预测的结合位点,其他没有预测结合位点的转录因子可能是以复合物的形式结合到CDCA8基因的转录调控区。 展开更多
关键词 cdca8基因 NTERA-2细胞 蛋白质/DNA芯片 转录调控
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CDCA7基因在食管鳞癌细胞系中的表达及其对细胞增殖凋亡的影响 被引量:7
11
作者 李泓漪 胡晓玲 +5 位作者 徐恩伟 程彩霞 孔鹏洲 阎婷 崔鹤洋 张玲 《中国药物与临床》 CAS 2017年第4期461-464,I0001,共5页
目的明确CDCA7基因在食管鳞癌各种细胞系中的表达量及其对细胞表型的影响。方法 (1)实时聚合酶链反应(real-time PCR)和蛋白质印迹法检测食管鳞癌细胞系及永生化食管上皮细胞系中的CDCA7基因的表达水平;(2)构建CDCA7基因的敲除载体pLKO.... 目的明确CDCA7基因在食管鳞癌各种细胞系中的表达量及其对细胞表型的影响。方法 (1)实时聚合酶链反应(real-time PCR)和蛋白质印迹法检测食管鳞癌细胞系及永生化食管上皮细胞系中的CDCA7基因的表达水平;(2)构建CDCA7基因的敲除载体pLKO.1-purosh RNA-CDCA7;(3)将pLKO.1-puro-sh RNA-CDCA7和对照空载体pLKO.1-puro转染到内源性高表达CDCA7基因的食管鳞癌细胞系ECA109中;(4)用real-time PCR和蛋白质印迹法验证筛选出的单克隆细胞;(5)四甲基偶氮唑盐(MTT)试验、克隆形成试验、细胞凋亡试验验证CDCA7基因敲除后对细胞表型的影响。结果 (1)在食管鳞癌的各种细胞系中,ECA109是内源性高表达CDCA7基因的细胞系之一;(2)成功构建了pLKO.1-puro-sh RNA-CDCA7的敲除质粒,并筛选出稳定敲除CDCA7基因的单克隆细胞株;(3)MTT、克隆形成试验结果显示,敲除CDCA7基因可以降低食管鳞癌细胞的增殖能力和克隆形成能力;(4)细胞凋亡试验结果显示,敲除CDCA7基因能够加速食管鳞癌细胞的凋亡。结论 CDCA7基因的敲除能够对食管鳞癌细胞系的细胞表型产生影响,会抑制癌细胞的增殖能力和克隆形成能力,加速癌细胞的凋亡。 展开更多
关键词 食管肿瘤 cdca7 细胞凋亡
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白桦酸通过miR-508-5p/CDCA5通路调控结直肠癌细胞增殖、迁移、侵袭的机制研究 被引量:4
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作者 关亚超 席作武 +2 位作者 高宗跃 王凯 马丙旭 《中药材》 CAS 北大核心 2019年第12期2936-2941,共6页
目的:研究白桦酸对结直肠癌HT29细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其潜在的分子机制。方法:用白桦酸5、10、20 mg/L分别处理结直肠癌细胞HT-29,qRT-PCR检测细胞中miR-508-5p及CDCA5 mRNA的表达,Western blot检测CDCA5、增殖相关蛋白CyclinD1... 目的:研究白桦酸对结直肠癌HT29细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其潜在的分子机制。方法:用白桦酸5、10、20 mg/L分别处理结直肠癌细胞HT-29,qRT-PCR检测细胞中miR-508-5p及CDCA5 mRNA的表达,Western blot检测CDCA5、增殖相关蛋白CyclinD1和p21、迁移侵袭相关蛋白MMP-2和MMP-9蛋白表达水平,MTT法测定HT29细胞增殖活性,Transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力,双荧光素酶报告系统验证miR-508-5p与CDCA5的调控关系。结果:白桦酸可促进结直肠癌细胞HT29中miR-508-5p表达,抑制CDCA5表达,抑制HT29的侵袭、迁移和增殖,且其作用呈现显著的浓度依赖性;过表达miR-508-5p和抑制CDCA5表达均可抑制HT29细胞增殖、迁移和侵袭;双荧光素酶报告系统结果显示,miR-508-5p靶向负调控CDCA5的表达,抑制miR-508-5p逆转了白桦酸对HT29细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用。结论:白桦酸通过miR-508-5p靶向CDCA5基因抑制HT29细胞的增殖、迁移和侵袭。白桦酸对结直肠癌具有潜在治疗作用。 展开更多
关键词 结直肠癌 白桦酸 miR-508-5p cdca5 增殖 迁移 侵袭
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CDCA8基因表达与膀胱癌患者临床病理和预后的相关性 被引量:5
13
作者 毕娅琼 陈松 +2 位作者 蒋佳志 石宏杰 李胜 《武警医学》 CAS 2018年第8期750-754,共5页
目的探讨膀胱癌患者CDCA8基因的表达情况和CDCA8基因与膀胱癌的临床病理相关性及预后相关性,预测CDCA8是如何推动膀胱癌发生、发展及其机制。方法从NCBI(National Center for Biotechnology Information)的GEO数据库中下载膀胱癌基因表... 目的探讨膀胱癌患者CDCA8基因的表达情况和CDCA8基因与膀胱癌的临床病理相关性及预后相关性,预测CDCA8是如何推动膀胱癌发生、发展及其机制。方法从NCBI(National Center for Biotechnology Information)的GEO数据库中下载膀胱癌基因表达数据GSE13507,采用非配对t检验分析CDCA8在膀胱癌中的表达情况,χ2检验分析CDCA8表达与膀胱癌患者临床病理指标的相关性,Log-rank检验用于预后生存分析;利用基因富集分析(GSEA)方法,分析CDCA8高表达样本的富集基因及受CDCA8调控的相关基因。结果膀胱癌中CDCA8表达水平明显高于正常膀胱组(8.87±0.08 vs 7.47±0.07,P<0.0001);CDCA8的表达与膀胱癌患者的年龄(P=0.027)、性别(P=0.04)及膀胱癌的疾病进展(P=0.001)、T分期(P<0.0001)、N分期(P=0.013)、不同分级(P<0.0001)密切相关;CDCA8高表达组膀胱癌患者的肿瘤特异性生存期明显短于CDCA8低表达组(P<0.0001,HR=0.5177,95%CI:13.40~18.10),且CDCA8高表达组膀胱癌患者的总生存期亦短于CDCA8低表达组(P<0.0001,HR=0.09906,95%CI:5.971~16.38);CDCA8可能调控与精子形成、G2M检查点、E2F信号通路、未折叠蛋白反应、MYC信号通路、MTORC1信号通路、有丝分裂纺锤体形成、PI3K/AKT/m TOR通路、胆固醇平衡、糖酵解相关的基因集。结论 CDCA8在膀胱癌组织中显著高表达,且与膀胱癌的恶性程度和发生进展相关,高表达CDCA8的膀胱癌患者临床预后更差,可能作为潜在的判断膀胱癌患者疾病进展的标志物和治疗膀胱癌的靶标。 展开更多
关键词 膀胱癌 cdca8 临床意义
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敲低CDCA8基因表达对膀胱癌5637细胞吡柔比星敏感性的影响 被引量:5
14
作者 高鑫 陈美 +2 位作者 王新彤 刘明月 张淑芳 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第6期592-597,共6页
目的膀胱癌具有较高的耐药和复发率,研究其分子机制有助于解决临床耐药问题。文中旨在探索CDCA8在膀胱癌5637细胞中的表达与吡柔比星(THP)敏感性的相关性。方法收集2018年1月至2020年12月中南大学湘雅医学院附属海口医院膀胱癌组织患者... 目的膀胱癌具有较高的耐药和复发率,研究其分子机制有助于解决临床耐药问题。文中旨在探索CDCA8在膀胱癌5637细胞中的表达与吡柔比星(THP)敏感性的相关性。方法收集2018年1月至2020年12月中南大学湘雅医学院附属海口医院膀胱癌组织患者的临床信息。从TCGA数据库中获取CDCA8的mRNA表达数据及患者化疗信息,同时进行免疫组化实验,分析CDCA8的表达与患者化疗敏感性的关系。针对CDCA8基因构建RNA干扰慢病毒,将膀胱癌5637细胞分为空白组(未作处理)、阴性对照组(转染不含CDCA8靶序列的慢病毒)和实验组(转染含CDCA8靶序列的慢病毒,敲低CDCA8),检测CDCA8基因及蛋白的表达;检测敲低CDCA8对膀胱癌细胞THP敏感性的影响;Celigo检测5637细胞吡柔比星IC50。结果膀胱癌化疗者CDCA8表达(10.369±1.131)较非化疗者(9.250±0.892)显著高表达(P=0.012)。qRT-PCT实验结果显示实验组CDCA8的mRNA表达量(0.069±0.004)较空白组(1.087±0.075)、阴性对照组(1.001±0.054)显著降低(P<0.001)。免疫印迹实验结果所示,实验组CDCA8蛋白表达量较空白组、阴性对照组明显降低(P=0.003)。实验组的IC50明显低于空白组、阴性对照组(P<0.05),细胞抑制率显著高于其他两组(P<0.05)。结论敲低CDCA8表达后增强了膀胱癌5637细胞对THP的敏感性,为后续研究膀胱癌THP耐药机制奠定了研究基础。 展开更多
关键词 膀胱癌 吡柔比星 cdca8 耐药 生物信息学
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CDCA8对肝细胞癌患者预后的影响 被引量:1
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作者 曾茂林 徐婷 +2 位作者 何锦悦 刘胜伟 苏凤娟 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期190-194,共5页
目的:肝细胞癌预后相关的分子标志物对提高患者生存质量和改善疗效至关重要,本研究旨在探究细胞分裂周期相关基因8(cell division cycle associated 8,CDCA8)对肝细胞癌预后的影响及潜在分子机制。方法:432例肝细胞癌样本的转录组数据... 目的:肝细胞癌预后相关的分子标志物对提高患者生存质量和改善疗效至关重要,本研究旨在探究细胞分裂周期相关基因8(cell division cycle associated 8,CDCA8)对肝细胞癌预后的影响及潜在分子机制。方法:432例肝细胞癌样本的转录组数据及对应患者的临床信息下载自肿瘤基因表达图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库。分析肿瘤组织和正常组织中CDCA8 mRNA差异;根据CDCA8 mRNA中位数将肝细胞癌患者分为高表达组和低表达组,绘制生存曲线。采用Kruskal检验分析CDCA8与肿瘤分期、分级和T分期的相关性。采用单因素和多因素Cox回归分析探究CDCA8能否作为肝细胞癌患者的独立预后因子。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探究CDCA8在肝细胞癌中的潜在作用机制。结果:CDCA8在肿瘤组织中的mRNA水平明显高于正常对照组织(P<0.001),CDCA8高表达患者的生存率明显低于低表达组(P<0.001)。随着肿瘤分期(P<0.001)、分级(P<0.001)和T分期(P<0.001)增加,肝细胞癌恶性程度增加,同时伴随CDCA8 mRNA水平增加。GSEA富集分析发现CDCA8高表达明显富集的通路包括细胞周期和有丝分裂。结论:CDCA8可作为肝细胞癌患者的预后分子标志物,深入研究后有望成为治疗的新靶点。 展开更多
关键词 cdca8 肝细胞癌 TCGA GSEA
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CDCA3在食管癌中的表达及其对食管癌细胞增殖与凋亡的影响 被引量:4
16
作者 方兰 卢一艳 刘金楠 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第5期583-587,591,共6页
目的研究细胞周期相关因子(CDCA3)在食管癌组织和细胞中的表达及其对食管癌细胞增殖与凋亡的影响。方法实时荧光定量PCR(qPCR)检测50例食管癌组织及其配对的癌旁组织中CDCA3 mRNA的表达水平,同时检测CDCA3 mRNA在不同食管癌细胞系(Eca10... 目的研究细胞周期相关因子(CDCA3)在食管癌组织和细胞中的表达及其对食管癌细胞增殖与凋亡的影响。方法实时荧光定量PCR(qPCR)检测50例食管癌组织及其配对的癌旁组织中CDCA3 mRNA的表达水平,同时检测CDCA3 mRNA在不同食管癌细胞系(Eca109、Kyse-170、TE1)和人食管鳞状上皮细胞系Het-1A中的表达水平;采用si-CDCA3-1、si-CDCA3-2转染Eca109和TE1细胞,另转染si-NC作为阴性对照,MTS法检测细胞增殖能力,流式细胞仪检测细胞周期和凋亡变化;Western blot检测CDCA3、CyclinD1和cleaved caspase-3蛋白的表达变化。结果食管癌组织中CDCA3 mRNA的表达高于癌旁组织(P<0.05),Eca109、Kyse-170和TE1细胞中CDCA3 mRNA表达高于人食管鳞状上皮细胞(P<0.05)。沉默CDCA3表达后,Eca109细胞和TE1细胞的增殖率降低,G0/G1期细胞比例增加(P<0.05)。沉默CDCA3表达后,Eca109细胞和TE1细胞的凋亡率增加(P<0.05)。沉默CDCA3表达可降低CyclinD1蛋白表达和增加cleaved caspase-3蛋白表达(P<0.05)。结论CDCA3 mRNA在食管癌组织和细胞系中均高表达,干扰CDCA3的表达可能通过降低CyclinD1蛋白表达抑制细胞增殖,增加cleaved caspase-3蛋白表达促进细胞凋亡,提示CDCA3可能为食管癌的潜在治疗靶标。 展开更多
关键词 食管癌 cdca3 增殖 凋亡
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CDCA5在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其与预后相关性的生物信息学分析 被引量:5
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作者 韩未 沈国良 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2021年第7期1234-1240,共7页
目的:探讨CDCA5在皮肤恶性黑色素瘤(cutaneous malignant melanoma,CMM)中的表达、相关信号通路及其与患者预后之间的关系。方法:应用Oncomine和GEPIA数据库研究CDCA5基因在不同肿瘤组织中的表达情况以及与患者预后关系。此外,还收集了... 目的:探讨CDCA5在皮肤恶性黑色素瘤(cutaneous malignant melanoma,CMM)中的表达、相关信号通路及其与患者预后之间的关系。方法:应用Oncomine和GEPIA数据库研究CDCA5基因在不同肿瘤组织中的表达情况以及与患者预后关系。此外,还收集了我院41例黑色素瘤患者及41例正常皮肤病例进行免疫组化分析。cBioPortal数据库用于研究CDCA5基因突变情况。应用STRING数据库构建CDCA5相关蛋白-蛋白相互作用网络,并进行功能富集和通路分析。应用TISIDB数据库探究CDCA5与免疫浸润的关系。结果:CDCA5基因在大多数肿瘤组织包括CMM中的表达水平上调,高表达与患者的预后不良有关。免疫组化结果显示,CDCA5在CMM中表达也是明显高于正常皮肤组织。TCGA数据库中有8%的CDCA5基因在CMM组织中发生了突变。CDCA5相关蛋白-蛋白相互作用网络中,相互作用蛋白网络富集明显(P<1.0E-16)。CDCA5编 码蛋白的分子功能主要为蛋白质结合、染色体结合、ATP结合以及蛋白激酶活性等。而生物学过程主要集中于姐妹染色单体凝聚力、有丝分裂核分裂、细胞分裂等。KEGG信号通路主要为细胞周期、卵母细胞减数分裂和孕激素介导的卵母细胞成熟。GSEA结果显示CDCA5相关显著变化的通路主要为炎症反应、TNFα-NF-κB通路、干扰素alpha通路、干扰素gamma通路、IL2-STAT5通路、IL6-JAK-STAT3通路、p53通路以及KRAS通路。此外,CDCA5基因与活化CD4^(+)T细胞成正相关,与不成熟B细胞、肥大细胞、1型辅助T细胞以及效应记忆CD8^(+)T细胞成负相关。结论:CDCA5在CMM患者肿瘤组织中表达较高,高表达与患者的预后不良有关。 展开更多
关键词 黑色素瘤 cdca5 生物信息学 预后
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CDCA2在原发性肝细胞癌中的表达及其临床意义 被引量:2
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作者 罗金武 肖亿 +3 位作者 孙兴 覃鑫 苏泽 张智 《贵州医药》 CAS 2020年第6期850-852,I0001,共4页
目的探讨细胞分裂周期相关蛋白(CDCA2)基因在原发性肝细胞癌中的表达情况及其临床意义。方法通过下载癌症基因组(TCGA)数据库相关数据,分析CDCA2基因与原发性肝细胞癌患者临床病理特征以及生存预后的关系。结果总体363例原发性肝细胞癌... 目的探讨细胞分裂周期相关蛋白(CDCA2)基因在原发性肝细胞癌中的表达情况及其临床意义。方法通过下载癌症基因组(TCGA)数据库相关数据,分析CDCA2基因与原发性肝细胞癌患者临床病理特征以及生存预后的关系。结果总体363例原发性肝细胞癌样本的癌和癌旁组织中的CDCA2的表达水平分别为(5.3106±1.6239)和(2.2912±1.224),差异有统计学意义(t=75.04,P<0.000)。50例配对的原发性肝细胞癌和癌旁组织中的CDCA2表达水平分别为(5.0955±1.5494)和(2.2912±1.224),差异有统计学意义(t=12.921,P<0.001)。ROC曲线分析提示CDCA2基因可作为一个灵敏度和特异度较高的原发性肝细胞癌诊断指标(敏感性84.0,特异性90.0,AUC 0.929)。CDCA2基因表达与原发性肝细胞癌患者的年龄、AFP值、病理分级、T分期、M分期、临床分期均有关(P<0.05),但与患者性别、肝功能分级、N分期无关(P>0.05)。生存分析发现总体363例样本中CDCA2低表达者和高表达的总体生存时间(OS)分别为(938.98±777.51)和(721.15±679.54)d,差异具有统计学意义(Log-rank=32.58,P<0.001)。无复发生存期(RFS)分别为(698.25±658.37)和(522.55±570.88)d,差异有统计学意义(Log-rank=32.58,P<0.001)。结论CDCA2在原发性肝细胞癌中高表达,且临床特征密切相关,其高表达对判断原发性肝细胞癌的生存预后及其诊断具有参考价值。 展开更多
关键词 原发性肝细胞癌 cdca2 TCGA 生物信息学
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慢病毒介导CDCA5敲低的三阴乳腺癌细胞的构建及鉴定 被引量:1
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作者 吕璐冶 黄燕 +4 位作者 李万金 韩秋影 宋楠 张学敏 周涛 《生物技术通讯》 CAS 2018年第3期329-334,共6页
目的:利用RNA干扰技术与慢病毒感染体系构建稳定干涉细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)基因的三阴乳腺癌细胞系,研究CDCA5在三阴乳腺癌细胞增殖过程中发挥的功能。方法:首先通过分子克隆技术构建稳定干涉CDCA5基因的慢病毒短发夹RNA(shRNA)... 目的:利用RNA干扰技术与慢病毒感染体系构建稳定干涉细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)基因的三阴乳腺癌细胞系,研究CDCA5在三阴乳腺癌细胞增殖过程中发挥的功能。方法:首先通过分子克隆技术构建稳定干涉CDCA5基因的慢病毒短发夹RNA(shRNA)质粒,并用PCR、琼脂糖凝胶电泳和深度测序技术进行验证;在此基础上,利用慢病毒感染体系将干涉质粒进行病毒包装、感染三阴乳腺癌细胞系MDA-MB-231,通过SDS-PAGE、Western印迹检测MDA-MB-231细胞中CDCA5蛋白质的表达水平;通过细胞活力检测实验研究干涉CDCA5对三阴乳腺癌细胞系MDA-MB-231细胞增殖能力的影响。结果:琼脂糖凝胶电泳与DNA测序结果显示稳定干涉CDCA5载体构建成功;SDS-PAGE及Western印迹结果显示稳定干涉CDCA5质粒在MDA-MB-231中获得表达,并能够敲低CDCA5蛋白表达水平,稳定干涉CDCA5的三阴乳腺癌细胞系构建成功;细胞活力检测实验结果表明,与对照组相比,干涉CDCA5蛋白表达水平能有效抑制MDA-MB-231细胞的增殖能力。结论:运用RNA干扰技术与慢病毒感染体系能够构建稳定干涉CDCA5的三阴乳腺癌细胞系,该细胞系的建立为进一步研究CDCA5在三阴乳腺癌发生、发展及转移过程中的作用及分子机制提供了重要的实验材料。 展开更多
关键词 细胞分裂周期相关蛋白5(cdca5) 三阴乳腺癌 稳定干涉 慢病毒shRNA质粒
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基于Oncomine等数据库分析CDCA基因家族在胃癌中的表达 被引量:1
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作者 陈晓萍 吴美珠 +3 位作者 刘丽雅 沈阿灵 陈友琴(指导) 彭军(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期691-697,共7页
目的:分析细胞分裂周期CDCA基因家族成员在胃癌中的表达。方法:通过Oncomine等多个数据库分析CDCA基因家族在不同肿瘤组织中的表达,采用GEPIA平台进一步分析TCGA数据库中CDCA基因家族在胃癌组织中的表达。结果:在Oncomine数据库中共收集... 目的:分析细胞分裂周期CDCA基因家族成员在胃癌中的表达。方法:通过Oncomine等多个数据库分析CDCA基因家族在不同肿瘤组织中的表达,采用GEPIA平台进一步分析TCGA数据库中CDCA基因家族在胃癌组织中的表达。结果:在Oncomine数据库中共收集了2664个不同类型肿瘤的研究结果,CDCA基因家族成员表达差异有统计学意义的研究结果共有427个,其中,表达上调的392个,表达下调的35个;在胃癌中高表达的研究有38个,低表达的研究有0个。在GEPIA数据库中有正常胃组织211例,胃癌组织有408例,CDCA1、CDCA2、CDCA3、CDCA4、CDCA5、CDCA6、CDCA7和CDCA8基因在胃癌组织的表达水平均显著高于癌旁组织(P<0.05),其改变倍数分别为2.756、2.275、2.734、1.719、2.991、1.080、3.399、3.880倍。结论:CDCA基因家族在胃癌中高表达,可能与胃癌的发生发展密切相关,有望成为胃癌早期诊断的潜在标志物。 展开更多
关键词 cdca基因家族 胃癌 Oncomine TCGA
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