CRISP3在宫颈癌分泌物与组织中的表达及临床意义

目的:筛选宫颈癌诊断标志物,检测其在宫颈癌组织中的表达及临床意义。方法:从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载宫颈癌相关数据集,利用R语言对差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行筛选,酶联免疫法检测其在宫颈癌血清中表达水平,PCR法检测其在宫颈癌分泌物中的表达情况,组织芯片上检测其在宫颈癌组织和正常组织中的表达情况,统计学分析其与临床特征的关系。结果:GEO数据库分析筛选出差异基因富含半胱氨酸分泌蛋白3(cystein-rich secretory protein 3,CRISP3),血清中CRISP3的表达,宫颈癌组与对照组相比无显著差异(P>0.05),宫颈分泌物中CRISP3表达在宫颈癌组显著降低(P<0.01),组织芯片中CRISP3在宫颈癌组中呈低表达(P<0.01),宫颈癌不同分期之间比较,Ⅰ期和Ⅱ-Ⅲ期差异有统计学意义(P<0.05)。结论:宫颈分泌物中CRISP3有可能作为宫颈癌诊断的潜在生物标志物之一。

柯乐猪CRISP 3基因SNP鉴定及其对繁殖性状的影响

为分析富半胱氨酸的分泌蛋白3(cysteine rich secretory protein 3,CRISP3)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点对柯乐猪繁殖性状的影响,采用Sanger测序法检测250头健康经产柯乐猪母猪CRISP 3基因的SNP突变位点,利用SPSS 22.0软件分析SNP位点与柯乐猪产活仔猪数、初生窝重、初生均重、断奶窝重、断奶仔猪数和断奶均重6个指标的关联性。结果显示,在柯乐猪CRISP 3基因第4内含子共发现3个SNP突变位点,即g.43796318T>C、g.43796424T>A和g.43796425G>T,均存在3种基因型。g.43796318T>C和g.43796424T>A位点的优势基因型为TT,优势等位基因为T;g.43796425G>T位点的优势基因型为GG,优势等位基因为G。χ^(2)检验显示,g.43796318T>C位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);g.43796424T>A和g.43796425G>T位点基因型分布均极显著(P<0.01)偏离Hardy-Weinberg平衡状态。3个SNP位点的多态信息含量(PIC)为0.25~0.50,表现为中度多态。连锁不平衡分析显示,g.43796424T>A与g.43796425G>T之间存在强连锁不平衡。关联分析显示,g.43796318T>C位点TT和CC基因型个体的初生窝重和初生均重均显著(P<0.05)高于TC基因型;g.43796424T>A位点TA基因型个体的产活仔猪数、初生窝重和断奶仔猪数均显著(P<0.05)高于TT和AA基因型;g.43796425G>T位点GT基因型个体的产活仔猪数、初生窝重和断奶仔猪数均显著(P<0.05)高于GG和TT基因型。双倍型关联分析显示,双倍型H2H4(CCTAGT)个体的产活仔猪数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重显著(P<0.05)高于H1H2(TCTAGT)个体和H2H2(CCAATT)个体;双倍型H2H2(CCAATT)个体的初生均重显著(P<0.05)高于除H4H4(CCTTGG)个体外的其他个体,且其断奶均重显著(P<0.05)高于其他双倍型个体。CRISP 3基因第4内含子上的3个突变位点与柯乐猪的6个繁殖性状均存在显著关联,可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记。