目的建立一种基于CRISPR/Cas12a的侧流层析技术检测人乳头瘤病毒(HPV)的方法,以实现对HPV的简单、准确、快速筛查。方法通过将CRISPR/Cas12a结合PCR技术与侧流层析技术对常见的10种高危型HPV质粒亚型进行检测验证其可行性;着重对HPV16、...目的建立一种基于CRISPR/Cas12a的侧流层析技术检测人乳头瘤病毒(HPV)的方法,以实现对HPV的简单、准确、快速筛查。方法通过将CRISPR/Cas12a结合PCR技术与侧流层析技术对常见的10种高危型HPV质粒亚型进行检测验证其可行性;着重对HPV16、HPV52、HPV58、HPV59四种亚型进行灵敏性及特异性验证;并对31例HPV临床样本进行检测,验证基于CRISPR/Cas12a的侧流层析技术(Lateral Flaw Assay based CRISPR,LFAC)的临床检测效能。结果通过应用LFAC检测,结果表明10种高危型HPV质粒均能产生明显的检测条带,表明该检测系统具有稳定性;对HPV16、HPV52、HPV58、HPV59四种高危型HPV质粒检测结果表明,该方法具有高特异性与高灵敏度,灵敏度检测下限为1.04×10^(4)copies/μL;31例临床样本检测结果总符合率为96.77%,根据LFAC检测结果绘制ROC曲线,灵敏度为0.920,特异度为0.626。结论通过将PCR技术、CRISPR/Cas12a和侧流层析法结合建立一种基于CRISPR/Cas12a的侧流层析技术,实现对HPV的可视化检测,为HPV的快速筛查与诊断提供了技术思路。展开更多
Bovine viral diarrhea virus(BVDV)is a positive-sense single-stranded RNA virus,belonging to the genus Pestivirus in the Flaviviridae family(Riitho et al.2020).Currently,BVDV is divided into 3 main genotypes,BVDV-1,BVD...Bovine viral diarrhea virus(BVDV)is a positive-sense single-stranded RNA virus,belonging to the genus Pestivirus in the Flaviviridae family(Riitho et al.2020).Currently,BVDV is divided into 3 main genotypes,BVDV-1,BVDV-2,and BVDV-3,based on the genetic differences in the 5′untranslated region(5′UTR)(Muasya et al.2022).展开更多
文摘目的建立一种基于CRISPR/Cas12a的侧流层析技术检测人乳头瘤病毒(HPV)的方法,以实现对HPV的简单、准确、快速筛查。方法通过将CRISPR/Cas12a结合PCR技术与侧流层析技术对常见的10种高危型HPV质粒亚型进行检测验证其可行性;着重对HPV16、HPV52、HPV58、HPV59四种亚型进行灵敏性及特异性验证;并对31例HPV临床样本进行检测,验证基于CRISPR/Cas12a的侧流层析技术(Lateral Flaw Assay based CRISPR,LFAC)的临床检测效能。结果通过应用LFAC检测,结果表明10种高危型HPV质粒均能产生明显的检测条带,表明该检测系统具有稳定性;对HPV16、HPV52、HPV58、HPV59四种高危型HPV质粒检测结果表明,该方法具有高特异性与高灵敏度,灵敏度检测下限为1.04×10^(4)copies/μL;31例临床样本检测结果总符合率为96.77%,根据LFAC检测结果绘制ROC曲线,灵敏度为0.920,特异度为0.626。结论通过将PCR技术、CRISPR/Cas12a和侧流层析法结合建立一种基于CRISPR/Cas12a的侧流层析技术,实现对HPV的可视化检测,为HPV的快速筛查与诊断提供了技术思路。
基金the Inner Mongolia Autonomous Region Major Science and Technology Project,China(2020ZD0006 and 2021ZD0013)the Natural Science Foundation of Heilongjiang Province,China(JQ2021C005)+1 种基金the National Key Research and Development Plan of China(2022YFE0140700)the National Natural Science Foundation of China(32172940)。
文摘Bovine viral diarrhea virus(BVDV)is a positive-sense single-stranded RNA virus,belonging to the genus Pestivirus in the Flaviviridae family(Riitho et al.2020).Currently,BVDV is divided into 3 main genotypes,BVDV-1,BVDV-2,and BVDV-3,based on the genetic differences in the 5′untranslated region(5′UTR)(Muasya et al.2022).