近交系大鼠DNA指纹分析研究

目的 建立DNA指纹技术对近交系大鼠遗传监测的方法。方法 采用DNA指纹图法对国内已知的7个品系 9个近交系大鼠群体进行了分析 ,并对相同DNA进行了多次DNA指纹图重复实验。结果 (1)不同品系之间DNA指纹图差异较大 ,其平均图带数为 16 .36 0± 2 .178,共有带率为 0 .0 6 1± 0 .0 0 8,相似系数为 0 .0 6 2± 0 .0 0 8,相同DNA指纹图概率为 3.6 91× 10 - 2 3 。 (2 )同一群体不同个体之间DNA指纹图带的相似系数和共有带率 (除SHR(哈 )和WKY(哈 )小于 0 .7外 ) ,其他均在大于 0 .9。 (3)不同地区同一SHR和同一WKY品系间DNA指纹图也存在不同 ,其相似系数和共有带率均小于 0 .6。 (4 )相同DNA不同次制作的DNA指纹图谱基本一致 (P >0 .0 5 )。

50份无花果种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

为探究国内外无花果遗传多样性并对种质资源进行鉴定,利用15对SSR分子标记引物对50份无花果种质资源从DNA水平上进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。结果表明,15对SSR引物在50份无花果种质资源中共扩增出67个等位基因,等位基因数范围为2~8个,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均值分别为0.5947和0.5703,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为1.0452,多态性信息含量指数(PIC)变化范围为0.2411~0.7353,平均为0.5101,表明无花果种质资源具有丰富的遗传多样性。50份无花果种质资源之间的遗传距离为0~0.68,平均为0.39,与其他种质资源遗传距离最大的为哈代。基于SSR分子标记结果,利用UPGMA方法对50份无花果种质资源进行聚类分析,根据遗传距离可将50份无花果种质资源分为四大类,第Ⅰ类为哈代,第Ⅱ类为斯特拉,第Ⅲ类为梦幻甜蜜,其余无花果种质资源划归为第Ⅳ类。构建了26份无花果种质资源的SSR指纹图谱,可用于品种鉴定,以期为无花果分子辅助育种提供科学依据。

52份枇杷种质资源遗传多样性分析与DNA指纹图谱构建

【目的】丰富枇杷种质资源鉴定方法,为枇杷种质资源发掘和利用提供理论依据。【方法】利用277对EST⁃SSR标记和1对果肉颜色相关InDel标记,对52份国内外枇杷种质资源和国家西南特色园艺作物种质资源圃(成都)枇杷育种与栽培创新团队创制的杂交后代进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。【结果】筛选出扩增带型清晰、稳定性和重复性好的9对引物,每对引物扩增条带为2~5条,平均85条;多态性条带比率为40.00%~100.00%,平均71.55%;多态性信息含量(PIC)为0.250~0.999,平均0.685。遗传多样性分析显示,52份枇杷种质资源和创制的杂交后代的平均相似系数为0.791;果肉颜色一致或地理分布相近的枇杷种质资源被聚类到相近的分类单元,并且可以准确地将西班牙、日本枇杷种质资源与其他种质资源进行区分。此外,本研究还构建了52份枇杷种质资源的DNA指纹图谱和色块矩阵。【结论】丰富了枇杷种质资源鉴定的分子标记,为今后发掘分子标记紧密连锁的功能基因或片段提供了理论依据。

基于核心KASP标记的江苏粳稻品种DNA指纹图谱构建

为了建立江苏粳稻品种DNA指纹图谱数据库,本研究利用水稻10K液相芯片对314份来源广泛的水稻种质资源进行SNP基因分型,筛选出一系列高多态性的SNP位点并开发出122个KASP标记。利用122个KASP标记对38份江苏粳稻品种进行检测,以多态性信息量(PIC)>0.3,最小等位基因频率(MAF)>0.2,检出率>0.9为筛选标准,筛选出56个具有高效鉴别效率的核心KASP标记。遗传距离相关性分析结果表明,基于56个核心KASP标记的江苏粳稻品种的遗传距离与基于122个高多态性KASP标记的的江苏粳稻品种的遗传距离相关系数为89.1%,呈极显著正相关(P<0.01),表明56个核心标记可以有效代替122个高多态性标记进行品种鉴定。进一步利用56个核心KASP标记对102份江苏粳稻品种的遗传多样性进行分析,并构建了102份品种的DNA指纹图谱和分子身份证二维码,本研究结果为江苏地区粳稻品种鉴定、选育和种质资源高效利用提供了参考。

基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物;利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出238个位点信息,其中多态性位点227个,平均多态性位点百分比为95.38%;采用NTSYS-pc 2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588~0.920之间,遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号,二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异,说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制,在相似系数0.735处,可将其划分为7个类群,说明61份黄瓜种质材料背景存在差异,但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT12和SCoT83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源,该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。

四川省玉米品种DNA指纹检测及遗传多样性分析

为探究四川省玉米品种的遗传多样性,用40对SSR引物检测2021年四川省玉米联合体试验中234个参试品种的DNA指纹,构建参试品种SSR-DNA指纹库,并基于DNA指纹进行遗传多样性分析和DNA指纹分析。结果表明,234个参试玉米品种多态信息整体高于早年吉林省和全国审定玉米品种;鲜食玉米组与其他玉米组遗传距离最远;234个参试玉米品种互为不同品种。2021年四川省参试玉米品种与早年吉林省和全国审定玉米品种相比遗传多样性更丰富,DNA指纹检测通过比例较2014-2019年国家玉米区域试验参试组合有所提高。

基于SRAP标记的三十三份白及种质资源聚类分析及DNA指纹图谱的构建

以白及(BletillastriataRchb.f.)为试材,基于UPGMA法通过13对SRAP引物组合对6个野生居群的33份白及种质资源进行聚类分析并构建DNA指纹图谱,以期为白及品种鉴定和资源收集提供参考依据。结果表明:13对SRAP引物组合共扩增出182条条带(其中有152条为多态性条带),多态性比率为83.52%,平均Shannon’s信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.4846和0.3243。6个野生居群根据UPGMA聚类,可分为2个支系。我国华南地区广东茂名、广西百色和华中地区湖南张家界3个白及居群聚为一支;西南地区贵州安龙、云南蒙自和四川峨眉山另外3个白及居群聚为另一支。Manteltest检测表明,物种遗传距离和地理距离间存在显著正相关性(r=0.6246;P<0.001)。4对SRAP核心引物组合构建了33份白及品种的DNA指纹图谱。

50种石斛种质资源的遗传多样性及DNA指纹图谱构建

【目的】分析国内外引种石斛种质资源遗传多样性,揭示不同种质间的亲缘关系,为促进石斛种质的有效利用及保护提供参考。【方法】利用ISSR分子标记技术对杯鞘石斛、金钗石斛、檀香石斛等50种石斛进行遗传多样性和亲缘关系研究分析,并构建DNA指纹图谱。【结果】9条多态性高、重复性好的引物共扩增出112个等位基因,其中,多态性位点102个,多态性比率为93.09%。检测的位点数为9~14,平均为12.44;50种石斛属植物的遗传相似系数为0.15~0.95。聚类分析显示,在遗传相关系数0.70处,可将石斛材料分为12个大组。PCR扩增显示,引物UBC808可将50种石斛完全区分开,基于其扩增的14个清晰的多态性条带构建50种石斛的DNA指纹图谱。【结论】50种石斛种间具有丰富的遗传多样性。

用非放射性标记MYO探针进行DNA指纹分析

用非放射性标记ＭＹＯ探针进行人的ＤＮＡ指纹分析，获得了清晰易读的ＤＮＡ指纹图，并用该方法调查了云南省的７８名无关个体，经统计学分析，计算出无关个体的相关几率是３．４×１０－１０，高于３２Ｐ标记的Ｍｙｏ探针。研究结果表明该方法是一种简便、快速、灵敏、可靠、经济的ＤＮＡ指纹图检测技术，可在法医鉴定及其它领域里得到更广泛的应用。

分子标记在品种鉴定及DNA指纹库构建中的应用

分子标记历经了第一代、第二代、第三代分子标记,目前在品种鉴定及指纹库构建中应用的较多的是SSR标记、SNP标记及MNP标记,推行全链条流程监管及净化我国种业市场等方面发挥重要作用。本文综述了分子标记在种子质量检测上的应用、技术标准化方面的情况及政策法规、DNA指纹库构建的情况等,以便对读者今后的研究工作提供参考。

DNA指纹数据库法律问题初探——美国的纷争和启示

分子生物学科技发展起来后 ,美国开始建立DNA指纹数据库 ,以提高辨别罪犯的效率和准确率。然而 ,这一做法却引起了广泛争议 ,主要围绕着强制采集DNA样本是否构成“不合理的搜查和扣押” ,利用DNA样本进行科学研究是否违反了“知情同意”的人体实验伦理原则 ,以及保存DNA样本是否会侵犯个人隐私这三个方面展开。这些纷争对我们的启示是 :既要合理地利用科学技术 ,又要加强法制 ,保护公民的合法权利 ,防止科学技术的负面影响。

DNA指纹技术在可疑精子标本等鉴定中的应用

目的 :应用DNA指纹技术对精子库供精者中来源可疑的精子标本进行鉴定 ,并对供精者的后代进行亲子鉴定。方法 :分别对本研究室所涉及的 6名供精者的精子标本及其对应可疑精子标本各一份 ,同时志愿者精子和其儿子外周血各一份提取DNA ,应用PCR扩增 ,PAGE胶电泳检测DNA指纹图。结果 :通过DNA指纹图分析 ,5个可疑精子标本被确定为对应同一供精者精子标本 ,余 1例被确认为非同一供精者精子标本来源 ;志愿者和其儿子被确定为亲子关系。结论 :应用DNA指纹图技术对精子库供精者的可疑精子标本和供精者精子及对应供精者精子和后代外周血进行分析 。

拉萨地区小云雀（Alaudagulaglainopinata）遗传多样性的DNA指纹图分析

ＤＮＡ指纹探针ＬＺＦ－Ｉ用于拉萨地区小云雀（Ａｌａｕｄａｇｕｌａｇｌａｉｎｏｐｉｎａｔａ）遗传多样性的ＤＮＡ指纹图研究，结果表明：（１）同一个体的肝、肾、心、肌肉和十二指肠的ＤＮＡ指纹图谱完全相同，无组织特异性，表明鸟类的任何器官组织都能作为ＤＮＡ指纹的分析材料．（２）检测随机个体ＤＮＡ指纹图的平均杂交谱带数为２１．８条，相似系数为０．０９３，平均杂合率为８６．３％．（３）在随机个体检测中，ＬＺＦ－Ｉ探针的鉴别机率为２．１３×１０－２３，ＤＮＡ指纹图具有高度的个体特异性，群体基因组表现出高度的多态性．

中国玉米新品种DNA指纹库建立系列研究 Ⅱ.适于玉米自交系和杂交种指纹图谱绘制的SSR核心引物的确定

本项研究利用60个玉米自交系对初选出的158个SSR引物对进行进一步筛选,综合考虑PIC值大小、扩增带型统计的难易及引物的重复性高低,确定bnlg439、bnlg125、phi053、bnlg197、phi072、bnlg238、phi126、bnlg161、bnlg240、bnlg619共10个引物对作为构建玉米自交系和杂交种指纹库的核心引物;同时提出适用于计算玉米SSR指纹图谱概率的公式:P=1/N,对自交系N=n;对杂交种,N=Cn1+Cn2。n为所用引物的等位基因数。

建立小麦品种DNA指纹的方法研究

建立小麦DNA指纹对遗传资源评价、品种权益保护、种子质量鉴定具有重要的意义。本研究采用15个SSR标记和20个AFLP-SCAR标记,分析了来自我国不同麦区的455个小麦品种,证明用两种分子标记建立小麦DNA指纹可以更加全面地反应品种的遗传多样性。从而,在提出采用SSR标记与AFLP-SCAR标记构建小麦品种DNA指纹的技术路线的基础上,建立了构建DNA指纹的方法模式。按此方法获得的品种指纹代码可以经条形码软件转换为条形码,使为每个品种建立身份证的设想成为可能。

玉米杂交种DNA指纹图谱及其在亲子鉴定中的应用

采用79对SSR引物分析了86个玉米杂交种的72份亲本自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的50对引物用于构建86个杂交种的DNA指纹图谱数据库,进而确定10对核心引物和判别标准用于亲子鉴定研究。结合玉米SSR分子标记检测技术和单籽粒DNA快速提取方法,DNA指纹数据库和判别标准可有效地用于玉米杂交种的亲子鉴定。

DNA指纹技术在亲子鉴定中的应用

用非放射性标记α－珠蛋白－３＇ＨＶＲ探针在低强度洗涤条件下，对人的ＤＮＡ指纹进行了分析，获得了清晰易读的ＤＮＡ指纹图。并用该方法调查了云南省的７８名无关个体，经统计学分析，计算出无关个体的相关机率是２．４×１０－４。用该方法进行亲子鉴定，获得了满意的结果，用ＨｉｎｆⅠ和ＨｅａⅢ两种内切酶酶切，解决了子代陌生带问题，用该方法对二十余起亲权纠纷案进行了鉴定，证明该方法稳定、结果可靠，父权肯定机率均在９９．９％以上。

SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用

以16个杂交水稻不育系、恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法。与常规凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更高。常规凝胶电泳检测方法验证表明,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测方法进行水稻品种DNA指纹鉴定,方法可行、结果可靠。