目的探究在紫外线暴露下环指蛋白20(ring finger protein 20,RNF20)低表达对胃癌细胞DNA损伤修复的影响及其相关作用机制。方法实验采用慢病毒载体构建稳定低表达胃癌细胞系,分为对照组和RNF20敲低组,用CCK-8法检测两组细胞的增殖情况,...目的探究在紫外线暴露下环指蛋白20(ring finger protein 20,RNF20)低表达对胃癌细胞DNA损伤修复的影响及其相关作用机制。方法实验采用慢病毒载体构建稳定低表达胃癌细胞系,分为对照组和RNF20敲低组,用CCK-8法检测两组细胞的增殖情况,用总共照射剂量为20 J/m^(2)紫外线照射胃癌MGC803细胞,采用Western blotting及免疫荧光技术检测两组细胞γ-H2AX、RAD51和p21的情况。结果荧光显微镜观察两组细胞均有绿色荧光蛋白表达;CCK-8显示RNF20表达降低会促进胃癌细胞增殖;敲低组细胞中RNF20蛋白较对照组表达降低。与对照组相比,经20 J/m^(2)紫外线照射细胞后,敲低组γ-H2AX消失更加迟缓,RAD51蛋白表达降低,p21蛋白表达下降趋势更慢。结论RNF20敲低会抑制紫外线诱导的胃癌细胞DNA损伤修复过程。展开更多
文摘目的 利用生物信息学方法挖掘并筛选与神经母细胞瘤(neuroblastoma, NB)生存预后相关的DNA损伤修复相关基因,构建NB生存的多基因预后模型。方法 从GSEA(gene set enrichment analysis)数据库中下载DNA损伤修复相关基因。TARGET(therapeutically applicable research to generate effective treatments)数据集作为训练集,结合基因表达谱数据和临床信息,运用最小绝对值收敛和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)回归分析和多因素Cox回归分析构建NB的DNA损伤修复相关的多基因预后模型。GEO(gene expression omnibus)数据集作为验证集,评估预后模型的准确性。使用受试者工作特征曲线(receiver operating cure, ROC)计算预后模型曲线下面积(area under the curve, AUC)。使用Kaplan-Meier生存曲线进行生存分析。通过单因素Cox回归和多因素Cox回归分析评估预后模型的预测性能。利用公共数据库数据进行Kaplan-Meier生存曲线分析,验证COA8对NB预后的影响。CCK8实验和集落形成实验验证COA8表达量对NB细胞增殖的影响。结果 构建了包含10个DNA损伤修复相关基因的NB预后模型(IL4、HBE1、WRNIP1、RSF1、MDM4、COA8、PDCD10、HIST3H2A、PRODH和ATR)。模型风险评分可将患儿分为低风险组和高风险组,且低风险组比高风险组患儿预后好(P<0.0001)。生存分析证明COA8高表达导致NB预后不良。同时CCK8实验和集落形成实验证明降低COA8表达量,可抑制NB细胞增殖。结论 构建了具有良好预测功能的DNA损伤修复相关的NB多基因预后模型。验证了COA8是NB不良预后的潜在生物标志物。