辣椒EIL基因家族的鉴定及其在盐碱胁迫下的表达分析

EIL(Ethylene-insensitive 3-like)基因在参与植物乙烯信号通路的转导和生长发育过程中发挥着重要作用。为了解辣椒EIL基因家族成员信息,利用生物信息学手段对辣椒EIL基因家族成员的理化性质、蛋白质结构、系统进化、基因结构、保守域、启动子顺式作用元件及CaEILs基因在不同组织部位和不同非生物胁迫条件下的表达模式进行分析。同时使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对辣椒叶片中CaEILs在盐碱胁迫下的表达模式进行研究。结果表明,辣椒9个CaEILs分布在6条染色体上,氨基酸数目、蛋白质理论分子质量和脂肪系数分别介于209~677、23.77~76.07 ku和63.10~87.75,且主要为酸性、亲水的不稳定性核蛋白。系统进化分析显示,CaEILs被分成了4个亚家组,9个CaEILs在根、茎、叶、花蕾、花中具有不同程度的表达,而低温、高温、高盐、干旱胁迫下均能诱导CaEILs的表达,其对以上非生物胁迫均具有不同程度的响应。此外,利用qRT-PCR对盐碱胁迫下辣椒叶片中CaEILs进行了检测,结果发现,随着处理时间的延长,CaEIL1、CaEIL2、CaEIL4、CaEIL5、CaEIL8的表达量整体呈上升趋势,而CaEIL3、CaEIL6、CaEIL7、CaEIL9的表达量整体呈下降趋势。

EIN3/EIL基因家族的系统进化

为了研究37个物种中EIN3/EIL基因家族的系统进化,利用生物信息学手段从系统发育、基因结构、表达分析和共线性等方面对EIN3/EIL基因家族分析。在37个物种的基因组中共鉴定出203个EIN3/EIL家族基因。分析亚家族中选取的6个结构稳定且支持度高的,有51个EIN3/EIL基因在这6个亚家族中,其中约86%的基因无内含子,98%的EIN3/EIL等电点小于7,其蛋白氨基酸数在306~650之间,全部属于亲水性蛋白。植物的EIN3/EIL基因有广泛的共线性,且共线性区域含有多个基因。在水稻的茎、花、根和叶中都出现了EIN3/EIL基因,由表达量我们能清楚地看出Os24128240、Os24126076和Os24109079基因比其他基因的高。对花的形成及根和幼苗的发育,Sb1953535基因在高粱中有着重要的调控作用。本研究初步解析了EIN3/EIL基因家族的系统进化,有助于进一步研究基因家族成员EIN3/EIL的功能。

油菜EIN3/EIL基因家族的鉴定及结构分析

Ethylene-insensitive3(EIN3)和EIN3-like(EIL)蛋白是乙烯信号转导途径中重要的核转录因子。EIN3/EIL基因家族在高等植物中分布广泛,在植物的生长、发育等多个过程中有重要的作用。为了揭示油菜EIN3/EIL基因家族的生物学信息,利用生物信息学的方法鉴定了油菜EIN3/EIL基因家族的成员,并从理化性质、亚细胞定位、跨膜结构、二级结构等几个方面对油菜EIN3/EIL基因家族成员进行了预测和分析。这些研究结果有助于进一步研究油菜EIN3/EIL基因家族成员的功能,同时在生产实践中也具有一定的应用价值。