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题名不同地区穇子ITS序列比较及穇属物种聚类分析
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作者
李基光
汤睿
欧立军
王艳兰
王利群
陈光辉
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机构
湖南农业大学农学院
湖南省作物研究所
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第24期8081-8091,共11页
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基金
国家农作物种质资源平台(NIGGR-2019-80)
旱粮与油料作物资源保护(111721301354052033)
湖南省农作物种质资源创新平台(2018xk2005)共同资助。
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文摘
穇子作为药食兼用的特色作物,对粮食安全和改善人们健康起着重要作用。为探究快速鉴定穇属物种的方法及确定穇子的亲缘关系,本研究对65个不同产地穇子居群的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列进行测序及比对,并构建穇属物种系统发育树。结果发现,穇子EC25、EC53和EC59等3个居群的ITS序列存在单碱基的突变体,其他居群无任何差异;穇属物种间ITS存在3~43个碱基的差异;系统聚类表明,穇属物种分为2大类4个亚组,其中穇子与凯芝济穇亲缘关系最近。研究表明,穇子的ITS序列具有高保守性而穇属种间差异性较大,ITS序列不能作为穇子居群的鉴定标记,可作为穇属物种鉴定的参考序列。本研究为穇子的亲缘关系鉴定及杂交育种提供了分子依据。
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关键词
穇子(eleusine
coracana)
ITS
分子鉴定
聚类分析
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Keywords
eleusine coracana
ITS
Molecular identification
Cluster analysis
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分类号
S515
[农业科学—作物学]
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