PCR-ASO技术分析东北地区1型糖尿病HLA-DQ位点基因

目的 :了解东北地区 1型糖尿病与HLA DQ等位基因的关系。方法 :PCR ASO技术检测 1型糖尿病HLA DQA1和DQB1位点等位基因。结果 :1型糖尿病病人编码HLA DQα链 5 2位精氨酸的DQA1 0 30 1和编码HLA DQβ链 5 7位非门冬氨酸的DQB1 0 5 0 1等位基因频率均显著增高 ,而编码DQβ链 5 7位门冬氨酸的DQB1 0 6 0 2基因频率明显降低。结论 :HLA DQα链 5 2位精氨酸和DQβ链 5 7位非门冬氨酸联合构成了 1型糖尿病的易感因素 ,而DQβ链 5 7位门冬氨酸具有保护作用。

模拟高住低练对大鼠红细胞相关指标和EPO基因表达的影响

目的 :研究模拟高住低练对大鼠红细胞相关指标和肾脏EPO基因表达的影响。方法 :4 8只雄性Wistar大鼠随机分为 4组 :低住低练组 (LoLo) ,模拟高住低练组 (HiLo) ,高住对照组 (Hi) ,对照组 (Con) ,每组 12只。模拟高住低练组和低住低练组进行相同的训练 ,但模拟高住低练组和高住对照组每晚在相当于 2 5 0 0米海拔高度的低压舱内居留 12～ 13小时 ,对照组和低住低练组仅在正常条件下居住 ,4周后测定大鼠红细胞计数、血红蛋白浓度、红细胞压积和肾脏EPO基因表达。结果 :模拟高住低练组大鼠红细胞计数、血红蛋白浓度和红细胞比容明显高于低住低练组、高住组和对照组 (P <0 .0 5 ) ,高住组红细胞计数、血红蛋白浓度和红细胞比容与对照组相比无明显差异。模拟高住低练组肾脏EPO基因表达明显高于低住低练组、高住组和对照组 (P <0 .0 5 ) ,高住组、低住低练组与对照组之间无显著差异。结论 :模拟高住低练可提高大鼠血红蛋白浓度 ,促进肾脏EPO基因表达 ,EPO基因表达的增加可能是长期低氧和运动应激累积效应的结果。

HLA-DQB1 PCR-SSP基因分型技术

HLA-Ⅱ(DR,DQ,DP)配型对提高异基因骨髓移植存活率减少GVHD有重要意义。既往HLA-DQ采用血清学技术检定表型,近年国外转向基因分型,不少实验室已将其列为常规。国内近年来有人报告聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针杂交(PCR-SSOP)。

HLA-DQ/DP等位基因与粤籍汉族斑秃及中医证型的相关性研究

目的探讨HLA-DQ/DP等位基因与粤籍汉族斑秃及中医证型的相关性。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)分型技术,对51例粤籍汉族斑秃患者的HLA-DQ/DP等位基因进行检测,并与110名粤籍汉族健康人群进行对照。结果 HLA-DQA1*0201、DQA1*0601、DQB1*0501、DQB1*0602、DPA1*0103基因频率斑秃组显著高于对照组,有极显著性差异(P<0.05或P<0.01);DQB1*0301、DPA1*0201基因频率斑秃组显著低于对照组(P<0.05);DQA1*0301气血两虚证基因频率显著高于其他证型(P<0.05)。结论 HLA-DQA1*0201、DQA1*0601、DQB1*0501、DQB1*0602、DPA1*0103可能是斑秃的易感基因,DQB1*0301、DPA1*0201可能是斑秃的保护基因,DQB1*0301主要与重型组有关,DQB1*0501、DPA1*0103则与轻型组相关,DQA1*0301可能是气血两虚证的易感基础。

成人隐匿性自身免疫性糖尿病与HLA-DQ、DR基因的关联性

探讨成人隐匿性自身免疫性糖尿病(LADA)与HLA-DQ、DR基因的关联性。方法用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR-SSP)检测60例正常人、41例1型糖尿病人(TlDM)和39例LADA患者的HLA-DR、DQ基因频率。结果HLA-DR3、DR4、HLA-DQA10301、HLA-DQB10201与TlDM的易感性相关;HLA-DR15、HLA-DQB10601与TlDM的保护性相关。HLA-DR4、HLA-DQA10301、HLA-DQB10201与LADA的易感性相关,HLA-DQB10601的基因频率在LADA组中显著高于TlDM组(P<0.05)。结论不同的遗传背景可能是影响LADA和TlDM起病方式及病情进展的重要因素之一。

HLA-DQ基因与成人IDDM和成人缓慢进展型IDDM的相关性研究

目的研究HLA-DQ基因与成人发病的IDDM和成人缓慢进展型IDDM的相关性。方法利用PCR／SSP技术检测了30倒成人发病的IDDM患者、52例成人缓慢进展型IDDM患者和50例正常人的HLA-DQ基因频率。结果①HLA-DQA1*0301、0501及DQB1*0201等位基因与IDDM和缓慢IDDM呈显著正相关；DQB1*0301与缓慢IDDM呈显著正相关，而DQB1*0302与IDDM呈显著正相关。②DQA1*0104、0201及DQB1*0601等位基因与缓慢IDDM呈显著负相关。③HLA-DQα链52-Arg（＋）纯合子基因型和DQβ链57-Asp（-）纯合子基因型与IDDM和缓慢IDDM均呈显著正相关，而HLA-DQα链52-Arg（-）纯合子基因型和DQβ链57-Asp（＋）纯合子基因型与IDDM和缓慢IDDM均呈显著负相关。结论提示IDDM和缓慢IDDM虽然均为自身免疫性糖尿病，但其HLA表型并不完全相同，不同的HLA表型可能是决定患者起病方式及病情发展的不同因素。

山西汉族人群HLA-DQ基因多态性分析

目的分析山西汉族人群HLA-DQA1、HLA-DQB1基因多态性。方法应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)法对100例山西汉族健康人进行HLA-DQA1、HLA-DQB1基因分型,并与国内部分地区汉族人群进行比较。结果①共检出9种HLA-DQA1等位基因型别,分别是:HLA-DQA1*0301/2(24.5%)、*0102(14.0%)、*0103(12.5%)、*0201(12.0%)、*0501(12.0%)、*0104(8.5%)、*0401(8.0%)、*0601(4.5%)、*0101(4.0%)。②在100个健康人中共检出13种HLA-DQB1等位基因型别,分别是:HLA-DQB1*0301/4(21.0%)、*0201(18.5%)、*0303(14.5%)、*0302(12%)、*0603/8(9.0%)、*0501(5.5%)、*0401(4.5%)、*0602(4.5%)、*0604(3.5%)、*0503(2.5%)、*0601(2.0%)、*0502(1.5%)、*0402(1.0%)。③山西汉族HLA-DQ等位基因分布与北方汉族接近,又有其自身特征。结论山西汉族人群HLA-DQ基因具有丰富的多态性,其分布特征与北方汉族人群接近,但又有其独特性。

中国河南汉族HLA-DQB1基因多态性的群体调查

HLA即人类白细胞抗原（Human leucocyte antigen,HLA）,是具有高度多态性的同种异体抗原,存在于人体的各种有核细胞表面,能识别＂自己＂和＂非己＂,并通过免疫反应排除＂非己＂,从而保持个体完整性。HLA分为Ⅰ类和Ⅱ类两大类抗原。HLA-DQ基因位于第六号染色体短臂的p21.3区域中,属于HLAⅡ类抗原,由α和β肽链组成,

绿色住居“地域基因"理论研究概论

在人类可持续发展的大背景下,把住居看做大自然中的有机生命体,创造性地将生物基因理论引入地区绿色住居的研究中。运用其科学原理。把住居生成与发展的内在规律视为住居的调控机制,把人们对各个环境因素的应对称为住居的“地域基因”,试图从深层次把握绿色住居的生成与发展机理,为可持续的人居环境建设提供科学的方法和依据。

江苏汉族人HLA-DQ位点基因多态性分析

用聚合酶链反应结合顺序持异的寡核苷酸t（PCR／SSO）探针杂交方法分析了86例江苏籍汉族正常人HLA－DQ位点等位基因分布情况，发现大多数DQA1和DQB1等位基因阳性，并与白种人的不同。证实了HLA分布的种族差异，研究结果对于探索人类的起源和人数的迁移与进化有重要意义。

淮河中下游地区汉族人类风湿关节炎与HLA-DQβ1等位基因相关性

目的观察HLA-DQβ1等位基因与淮河中下游地区汉族人类风湿关节炎(RA)的易感性,并分析其与临床表现、实验室检查及双手X线检查结果的相关性。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应技术(PCR-SSP)对103例RA和102例健康对照的HLA-DQβ1的9种基因亚型(0501、0503、0601、0602、0201、0301、0303、0401、0402)进行检测;酶联免疫吸附试验(ELISA)检测患者血清抗环瓜氨酸肽抗体(抗CCP)水平,并分析患者临床表现、实验室指标、双手X线检查与基因亚型之间的关系。结果 HLA-DQβ1*0401、*0501亚型在RA患者出现的频率分别为12.5%和7.5%,而健康对照组为3.5%和1.5%,差异有显著统计学意义,P<0.05;RA患者组及对照组均以HLA-DQβ1*0301、*0303阳性率为高,但组间比较差异无显著统计学意义;携带HLA-DQβ1*0401亚型、*0501亚型的患者与不携带HLA-DQβ1*0401亚型、*0501亚型的RA患者,其临床表现、实验室检查包括抗CCP及手X线检查,差异均无显著统计学意义。结论 HLA-DQβ1*0401、*0501基因亚型可能与淮河中下游地区汉族人RA的易感性有关,而与RA的临床、实验室指标及关节受累的严重程度无相关性。

PCR法对HLA-DQ_α基因的分型及其在性犯罪鉴定中的应用

本文应用 PCR 法及 ASO 探针斑点杂交技术,对100例无关个体血液 DNA 及10例性犯罪案件混合斑中精子 DNA 进行了 HLA-DQα基因的扩增及其 DNA 分型。结果正常人0.1～0.3μgDNA 就能满足 DQα基因扩增的需要。在100例个体中可以观察到由4种等位基因组成的10种 DQα基因型。10例不同条件的混合斑中精子 DNA 经30～60次扩增后与 ASO 探针杂交均能准确地判定 DQα基因型。HLA-DQα是个体识别能力较强的遗传标志。本文为性犯罪中精子来源的个体识别提供了一个新方法,具有一定的实用价值。

从甘南地区传统住居的地域基因浅析地域建筑文化的延续和发展

对建筑地域性的理解及其文化脉络的探究,是推进人类居住环境可持续发展的重要环节.以甘南地区民居、聚落为例,着重分析了传统住居的地域基因和文化内涵,为甘南地区可持续的人居环境建设提供科学的依据.

中国汉族人群HLA-DR和HLA-DQ基因频率及连锁单倍型特点研究

本研究旨在探讨中国汉族人群中人类白细胞抗原(HLA)DR和DQ基因连锁不平衡的分布规律,提高HLA配型的准确性。采用PCR-SSP基因分型方法,对1799例汉族受检者的DR和DQ基因进行了分型,对其基因的连锁不平衡进行了研究。结果发现,在1799例受检者中有29种不同于西方人种的新连锁组合,其中DR13-DQ5出现频数最高,达11次;DR11-DQ9出现8次,DR8-DQ8出现7次;DR9-DQ8和DR12-DQ6及DR14-DQ4各出现6次。所有29种新单倍型的连锁不平衡参数均为负,其连锁单倍型的发生频率低于理论频率,显示新发现的连锁不平衡单倍型都比较罕见,在人群中的分布频率较低。结论:本研究丰富了经典HLA-DR/DQ连锁组合,指出了该种组合分布的民族相关性,对提高HLA配型实验的准确性和工作效率具有重要意义。

HLA-DQ、HLA-DR基因多态性与广西南宁居民肠易激综合征的相关性研究

目的:探讨HLA-DQ、HLA-DR基因多态性与广西南宁市社区居民肠易激综合征(IBS)的相关性。方法:分别收集广西南宁市社区居民IBS患者、健康志愿者外周血标本102例、108例,常规提取DNA,采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)进行HLA-DQ、HLA-DR基因多态性鉴定,采用统计学方法分析IBS患者组与健康对照组HLA-DQ、HLA-DR的基因型和基因分布频率,并对两组间基因分布频率进行比较。结果:(1)IBS患者组HLA-DQ6基因表达频率高于健康对照组(44.1%vs29.6%,OR=1.875),而HLA-DQ2基因表达频率低于健康对照组(14.7%vs 28.7%),差异有统计学意义(P<0.05);(2)IBS患者组HLA-DR13基因表达频率高于健康对照组(17.6%vs 7.4%,OR=2.679),而HLA-DR17基因表达频率低于健康对照组(8.8%vs19.4%),差异有统计学意义(P<0.05)。其余等位基因在两组间的基因频率经比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:广西南宁居民IBS的遗传易感性可能与HLA-DQ、HLA-DR基因多态性相关,HLA-DQ6、HLA-DR13基因可能是广西南宁居民IBS的易感基因,而HLA-DQ2、HLA-DR17基因可能具有保护作用。

基于不同靶基因的3种住肉孢子虫PCR检测方法比较

为筛选敏感、特异的住肉孢子虫(Sarcocystis spp.)PCR检测方法,对以住肉孢子虫18S rRNA、28S rRNA和线粒体细胞色素C氧化酶I基因(cox 1)的部分片段为靶基因设计的3套引物建立的PCR方法进行敏感性和特异性试验,并对田间采集的100份牛源和猪源肌肉样品进行检测。结果显示,以18S rRNA和28S rRNA为靶基因的PCR检测方法的敏感性相似,DNA最小检出量均为1×10-2 ng/μL;而以cox 1为靶基因的PCR检测方法敏感性相对较低,DNA的最低检出量为1 ng/μL。对7种不同寄生虫DNA进行特异性试验,结果以cox 1基因为靶基因的PCR方法特异性较好,仅能够扩增出枯氏住肉孢子虫(Sarcocystis cruzi)DNA;以18S rRNA为靶基因的PCR法,除枯氏住肉孢子虫外,刚地弓形虫和微小隐孢子虫也有相似扩增条带;以28S rRNA为靶基因的PCR法,除枯氏住肉孢子虫外,刚地弓形虫、微小隐孢子虫和欧猥迭宫绦虫DNA也能扩增出杂带,但大小不符。利用3种方法对100份牦牛和猪肉样品进行扩增,发现以18S rRNA、28S rRNA和cox 1为靶基因的PCR法的阳性率分别为36.00%(36/100)、43.00%(43/100)和38.00%(38/100)。结果表明,以cox 1为靶基因的PCR法有良好的特异性,适合用于田间动物肌肉样品中住肉孢子虫的检测,为开展动物住肉孢子虫病分子流行病学及防控研究提供了依据。

青海巨型住肉孢子虫线粒体cox1基因的克隆及进化分析

为了研究青海省巨型住肉孢子虫线粒体细胞色素C氧化酶第一亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况,并用pcox1序列构建巨型住肉孢子虫与其他住肉孢子虫的种群遗传关系。利用PCR技术扩增巨型住肉孢子虫的pcox1,将测序所获序列进行比对,并进行同源性分析和系统发育树的构建。结果显示,所获得的pcox1序列长度均为968 bp,与GenBank已公布的巨型住肉孢子虫相似度为99.1%~99.8%。系统发育树表明,所有分离株与已知巨型住肉孢子虫位于同一分支。巨型住肉孢子虫pcox1序列种内相对保守(0.2%~0.7%),种间差异较大(6.8%~20.8%),可用作种间遗传变异研究的标记。

急性起病糖尿病患者HLA-DQ易感基因型与胰岛功能的相关性研究

目的探讨南京地区急性起病糖尿病患者HLA—DQ易感基因型-9胰岛功能及胰岛自身抗体的相关性。方法收集2006—2008年期间南京鼓楼医院内分泌科收诊的急性起病糖尿病患者150例。DNA测序法确定HLA—DQAl和DQBl基因型，检测不同易感基因型下急性起病糖尿病患者的胰岛功能和胰岛自身抗体。结果急性起病糖尿病患者中，①高危基因型组IA～2Ab、GADA阳性率显著均高于中危基因型组（均P〈0．05）；IA-2Ab阳性率亦显著高于低危基因型组（P〈0．05）。②IA-2Ab单一阳性患者的高危基因型分布频率显著高于低危基因型和中危基因型（均P〈0．05），GAD—Ab单一阳性患者的高危基因型分布频率显著高于中危基因型（P〈0．05）。③同时携带DQAl（高危）和DQBl（低危）基因型患者的C肽水平显著低于同时携带DQAl（低危）和DQBl（低危）基因型的患者（均P〈0．05）。结论与携带低危基因型的急性起病糖尿病患者比较，携带HIJA—DQ高危基因型的患者体内胰岛自身免疫反应更重，C肽水平更低。因此，对急性起病糖尿病患者进行HLA—DQ易感基因型的筛查将有助于患者的病情评估。

1型糖尿病种HLA-DQA1-DQB1连锁基因的特征研究

目的:探讨HLA-DQA1-DQB1连锁基因单倍体与成人缓慢进展型1型糖尿病(SPIDDM)和速发型1型糖尿病(FPIDDM)的相关性。方法:采用PCR/SSP技术检测本组1型糖尿病中102例SPIDDM患者和130例FPIDDM患者频率。结果:①HLA-DQA1*0301-DQB1*0201和DQA1*0501-DQB1*0201连锁基因单倍体与SPIDDM(Pc<0.001)和FPIDDM(Pc<0.001)均呈显著正相关。②HLA-DQA1*0301-DQB1*0301和DQA1*0301-DQB1*0602连锁基因单倍体与SPIDDM呈显著正相关(Pc<0.001)。③HLA-DQA1*0301-DQB1*0302、DQA1*0301-DQB1*0303及DRB1*0301-DQA1*0301-DQB1*0201连锁基因单倍体与FPIDDM呈显著正相关(均Pc<0.05);DQA1*0102等位基因中SPIDDM组16例(15.69%);FPIDDM组10例(7.69%)(P<0.05);DQA1*03基因SPIDDM组47例(46.08%),FPIDDM组79例(60.77%)(P<0.05);DQB1*0601基因SPIDDM组10例(9.8%),FPIDDM组4例(3.08%)(P<0.01)。结论:SPIDDM和FPIDDM虽然均为自身免疫性糖尿病,但其HLA表型并不完全相同,不同的HLA表型可能是决定患者起病方式及病情发展不同的因素之一。

HLA-DQ等位基因多态性与反复种植失败的关系

目的探讨反复种植失败与夫妇双方HLA-DQ等位基因多态性之间的关系。方法选取44例反复种植失败(RIF组)的患者和16例(对照组)同期接受体外受精-胚胎移植且在第1周期成功妊娠的患者,采用序列特异性引物PCR和基因测序分型的方法分别检测夫妇双方HLA-DQA1和HLA-DQB1的基因位点,采用χ2检验和Fisher’s精确检验比较2组等位基因频率和相容性的差异。结果等位基因HLA-DQB1*03:01、HLA-DQB1*03:02、HLA-DQB1*03:03在RIF组中的出现频率高于对照组,但差异均无统计学意义(P>0.05);将以上3个位点合并为HLA-DQB1*03后,在女方RIF组中出现频率显著高于对照组(52.28%vs31.26%,P<0.05);而HLA-DQB1*05:02等位基因频率在RIF组中低于对照组(女:9.09%vs 12.50%,男:6.82%vs 21.88%),且在男方中差异有统计学意义(P<0.05)。HLA-DQA1等位基因位点频率分布在RIF组和对照组之间无统计学意义(P>0.05);HLA-DQ单元型、夫妇双方HLA-DQ的相容性与对照组相比差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 HLA-DQ等位基因的多态性在反复种植失败中可能扮演重要的作用,HLA-DQB1*03可能是一个导致种植失败的易感基因,而HLA-DQB1*05:02可能是一个保护性基因。