芦花鸡IFITM3基因克隆及生物信息学分析

本研究旨在对芦花鸡的干扰素诱导的跨膜蛋白-3(interferon-induced transmembrane protein 3,IFITM3)基因进行克隆及生物信息学分析。根据GenBank中鸡IFITM3基因序列(登录号:NM_001350061.1)设计特异性引物,利用RT-PCR技术对芦花鸡IFITM3基因进行克隆、测序和生物信息学分析。结果表明,芦花鸡IFITM3基因片段大小为414bp,与GenBank中发表的鸡IFITM3基因序列(登录号:NM_001350061.1)同源性为99.9%;编码137个氨基酸。IFITM3基因理论分子质量为14.95ku,理论等电点(pI)为6.89,不稳定系数为33.98,脂肪系数为103.14,平均疏水指数为0.300,存在3个明显的疏水区,无信号肽,存在2个跨膜区,分别位于第46-68、101-123位氨基酸处;二级结构预测显示,IFITN3蛋白主要以无规则卷曲为主,存在多个α-螺旋和β-折叠区域。本研究成功克隆了芦花鸡IFITM3基因,为进一步研究IFITM3蛋白功能及阐明其抗病毒分子机制奠定了理论基础。

三黄鸡IFITM3基因的克隆及其真核表达载体的构建

为研究禽类干扰素诱导跨膜转运蛋白(interferon-induced transmembrane proteins,IFITMs)基因抗流感病毒的功能和分子机制,用PCR扩增了三黄鸡IFITM3基因并进行序列测定及其编码蛋白的结构分析。在此基础上,构建了pIRES2-EGFP-IFITM3真核表达载体并转染至DF-1细胞。分析结果显示,该基因随物种发育进化地位的不同而表现出种属间差异性,编码蛋白由113个氨基酸构成,存在2个潜在跨膜区,不含信号肽。转染结果显示,pIRES2-EGFP-IFITM3真核表达载体在DF-1细胞中成功表达。研究结果为构建IFITM3专性表达细胞系及三黄鸡IFITM3蛋白抗病毒分子机制的研究奠定了基础。

IFITM3单核苷酸多态性与急性白血病的患病风险评估

分别探讨IFITM3基因3个位点(rs3888188、rs7478728、rs7479267)单核苷酸多态性与急性髓系白血病、急性淋巴细胞白血病、男性急性白血病、女性急性白血病的患病风险。方法 共收集437例研究对象,使用SNaPshot测序并对结果进行统计分析。结果 rs7478728和rs7479267的CT基因型、C等位基因、(CT+CC)联合基因均表明是急性髓系白血病的保护性因子。结论 IFITM3基因位点rs7478728和rs7479267的部分基因变异可能与急性髓系白血病的患病风险呈负相关。

IFITM3基因单核苷酸多态性与急性淋巴细胞白血病关系

目的探讨急性淋巴细胞白血病(ALL)患者干扰素(IFN)诱导跨膜蛋白3(IFITM3)的单核苷酸多态性(SNP)与其发病的相关性,为ALL临床预防和诊断提供依据。方法选取2018-01-06-2019-02-06本院收治的60例ALL患者为病例组,另选取同期本院健康体检者50名作为对照组,比较2组IFITM3基因的SNP,分析其与抗ALL的DNA抗体、C3和C4补体的相关性。结果病例组IFITM3表达量为6.77±2.03,高于对照组的3.02±0.59,t=12.617,P<0.001。病例组抗ALL的DNA抗体水平为(1.01±0.24)mg/L,低于对照组的(3.24±1.29)mg/L,t=13.132,P<0.001;C3补体水平为(2.68±1.27)g/L,高于对照组的(1.03±0.54)g/L,t=8.560,P<0.001;C4补体水平为(1.58±0.35)g/L,高于对照组的(0.77±0.04)g/L,t=16.264,P<0.001。病例组GA和GG例数多于对照组,AA例数少于对照组,差异有统计学意义,χ^(2)=54.797,P<0.001。病例组G等位基因频率为70.00%,大于对照组的36.00%,χ^(2)=10.897,P<0.001。结论IFITM3基因多态性与ALL有关,携带GA和GG基因型者发病风险增大。