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Angiotensin-converting Enzyme Gene Insertion/Deletion Polymorphism in Children with Henoch-Schonlein Purpua Nephritis 被引量:17
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作者 周建华 田雪飞 徐钦儒 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2004年第2期158-161,共4页
This study investigated the relationship between angiotensin-converting enzyme (ACE) gene insertion/deletion polymorphism and the occurrence, severity, prognosis of HSPN. The polymorphism of ACE gene in 103 HSPN case... This study investigated the relationship between angiotensin-converting enzyme (ACE) gene insertion/deletion polymorphism and the occurrence, severity, prognosis of HSPN. The polymorphism of ACE gene in 103 HSPN cases and 100 healthy children was studied by using the polymerase chain reactions (PCR). Its relation to the clinical manifestation, pathological classification and prognosis of HSPN was analyzed accordingly. The results showed that: (1) there was a significantly higher frequency for DD genotype in HSPN children (P<0.01); (2) DD genotype was more frequently seen in HSPN children with gross hematuria and massive proteinuria (P<0.05), while DI genotype was more common in HSPN children group with renal insufficiency (P<0.05); (3) although mesangial proliferative lesion was most frequently observed in 21 biopsied HSPN children, and DD genotype frequency was still higher in children with severe pathology (Class Ⅲ Ⅳ); (4)II genotype was significantly frequent in HSPN children with complete remission in the follow-up of 32 HSPN children. It was concluded that the deletion allele of ACE gene might play a role, at least to some extent, in the occurrence, deterioration and progression in juvenile HSPN. 展开更多
关键词 angiotensin-converting enzyme gene insertion/deletion polymorphism Henoch-Schonlein purura nephritis children
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Correlation between the Insertion/Deletion Mutations of Prion Protein Gene and BSE Susceptibility and Milk Performance in Dairy Cows 被引量:1
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作者 Shen-rong Hu Yong-tao Huai +3 位作者 Chuan-ying Pan Chu-zhao Lei Hong Chen Xian-yong Lan 《国际感染病学(电子版)》 CAS 2013年第4期153-162,共10页
Objective To investigate the 23 bp and 12 bp insertion/deletion(indel)mutations within the bovine prion protein(PRNP)gene in Chinese dairy cows,and to detect the associations of two indel mutations with BSE susceptibi... Objective To investigate the 23 bp and 12 bp insertion/deletion(indel)mutations within the bovine prion protein(PRNP)gene in Chinese dairy cows,and to detect the associations of two indel mutations with BSE susceptibility and milk performance.Methods Based on bovine PRNP gene sequence,two pairs of primers for testing the 23 bp and 12 bp indel mutations were designed.The PCR amplification and agarose electrophoresis were carried out to distinguish the different genotypes within the mutations.Moreover,based on previous data from other cattle breeds and present genotypic and allelic frequencies of two indels mutations in this study,the corrections between the two indel mutations and BSE susceptibility were tested,as well as the relationships between the mutations and milk performance traits were analyzed in this study based on the statistical analyses.Results In the analyzed Chinese Holstein population,the frequencies of two"del"alleles in 23 bp and 12 bp indel muations were more frequent.The frequency of haplotype of 23del-12del was higher than those of 23del-12ins and 23ins-12del.From the estimated r2and D’values,two indel polymorphisms were linked strongly in the Holstein population(D’=57.5%,r2=0.257).Compared with the BSE-affected cattle populations from the reported data,the significant differences of genotypic and allelic frequencies were found among present Holstein and some BSE-affected populations(P<0.05 or P<0.01).Similarly,there were significant frequency distribution differences of genotypes and alleles among Chinese Holstein and several previous reported healthy dairy cattle(P<0.05 or P<0.01).Moreover,association of genotype and combined genotypes of two indel polymorphisms with milk performance and resistant mastitis traits were analyzed in Holstein population,but no significant differences were found(P>0.05).Conclusions These observations revealed that the influence of two indel mutations within the bovine PRNP gene on BSE depended on the breed and they did not affect the milk production traits,which layed the foundation for future selection of resistant animals,and for improving health conditions for dairy breeding against BSE in China. 展开更多
关键词 Dairy cows Prion protein(PRNP) gene Bovine spongiform encephalopathy(BSE) insertion/deletion(indel) mutation Association Milk performance
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Association study between the angiotensin converting enzyme gene insertion/deletion polymorphism and Qinghai Han Chinese with congenital heart disease 被引量:1
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作者 Jing ZHAO Lin LU +2 位作者 Yong-nian LIU Zhan-hai SU Ying-zhong YANG 《中国应用生理学杂志》 CAS CSCD 2016年第6期499-503,共5页
Objective: The aim of this work is to determine whether the angiotensin converting enzyme(ACE) I/D(insertion/deletion) polymorphism is associated with the susceptibility to congenital heart disease(CHD) in the Qinghai... Objective: The aim of this work is to determine whether the angiotensin converting enzyme(ACE) I/D(insertion/deletion) polymorphism is associated with the susceptibility to congenital heart disease(CHD) in the Qinghai Han Chinese. Methods: This study enrolled 59 CHD patients and 193 CHD controls from Qinghai Cardiovascular Diseases Vocational Hospital. Blood samples were collected from each of the patient and control groups. The ACE-I/D polymorphism was detected by polymerase chain reaction(PCR). Results: The genotype frequencies of ACE-I/D for II, ID, DD in patients and controls were 0.475, 0.441, 0.085 and 0.430, 0.446, 0.124, respectively. The allelic frequencies of I and D were 0.650, 0.350 and 0.695, 0.305, respectively. The OR of ID, DD and D alleles relative to II for CHD was 1.116(0.604-2.060), 1.619(0.564-4.648) and 1.211(0.777-1.889). There was no significant difference of the genotypic and the allelic frequencies in ACE-I/D polymorphism between the patient and control groups. Conclusion: There is no relation between ACE-I/D polymorphism and CHD in current Qinghai Han Chinese. 展开更多
关键词 血管紧张素转换酶基因 基因多态性 先天性心脏病 插入/缺失 青海 汉族 等位基因频率 基因型频率
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微课-INSERT AND DELETE的使用的设计与制作
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作者 董雪 王一雄 +1 位作者 王克 王岩 《黑龙江科技信息》 2016年第14期173-173,共1页
随着现代信息科学技术的不断发展,一种新型的教学模式——"微课"开始走进学生的生活,"微课"以其潜在的优势在学生的学习生活中发挥了积极作用。与此同时在数据库中对数据库的录入和删除尤为重要,因此我们结合微课... 随着现代信息科学技术的不断发展,一种新型的教学模式——"微课"开始走进学生的生活,"微课"以其潜在的优势在学生的学习生活中发挥了积极作用。与此同时在数据库中对数据库的录入和删除尤为重要,因此我们结合微课的使用和SQL中的INSERT INTO...VALUES、delete的作用,制作和设计了该微课,本微课主要针对INSERT INTO...VALUES和delete的定义和特点以及微课设计及制作进行了介绍,生动形象的展现了数据的录入和删除的作用。 展开更多
关键词 微课 insert INTO...VALUES deletE
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高血压患者ACE基因Insertion/Deletion多态性中的罕见突变1例
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作者 李娅亨 王倩 +1 位作者 杨杉 李亚峰 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2024年第2期6069-6072,共4页
高血压是最强的心血管危险因素之一,目前我国高血压的患病人数已达约2.45亿[1]。《中国心血管健康与疾病报告2021》数据显示,我国≥18岁成人高血压知晓率41.0%,治疗率34.9%,控制率仅11.0%。在高血压的用药治疗方面,由于用药种类繁多,且... 高血压是最强的心血管危险因素之一,目前我国高血压的患病人数已达约2.45亿[1]。《中国心血管健康与疾病报告2021》数据显示,我国≥18岁成人高血压知晓率41.0%,治疗率34.9%,控制率仅11.0%。在高血压的用药治疗方面,由于用药种类繁多,且存在药物反应的个体差异,通常会导致抗高血压药物的疗效不佳或不良反应[2]。2015年,国家卫生和计划生育委员会发布的《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》[3]。 展开更多
关键词 高血压 血管紧张素转换酶(ACE)基因 PCR溶解曲线法 insertion/deletion多态性 一代测序
原文传递
PLIN1基因InDel位点检测及其与同羊尾脂和生长性状的关联分析
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作者 邱彦博 阮子豪 +3 位作者 易晓华 谢浦航 袁婷婷 孙秀柱 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第15期43-48,118,共7页
为了探讨同羊PLIN1基因结构及PLIN1基因的插入/缺失(inserted/deletion,InDel)位点对同羊尾脂和体尺性状的影响,试验对PLIN1基因结构进行了生物信息学分析,并测量了166只健康同羊的尾脂和体尺性状;通过测量同羊表型数据、提取基因组DNA... 为了探讨同羊PLIN1基因结构及PLIN1基因的插入/缺失(inserted/deletion,InDel)位点对同羊尾脂和体尺性状的影响,试验对PLIN1基因结构进行了生物信息学分析,并测量了166只健康同羊的尾脂和体尺性状;通过测量同羊表型数据、提取基因组DNA,并采用PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳和Sanger测序等方法检测PLIN1基因的InDel位点和分型情况,然后对PLIN1基因的InDel位点与同羊尾脂和体尺性状进行关联分析。结果表明:PLIN1基因位于绵羊的18号染色体上,有8个外显子和7个内含子。绵羊、山羊、普通牛、欧亚野猪、智人、小鼠的PLIN1蛋白结构高度保守,原鸡和绿头鸭的PLIN1蛋白结构与其他物种存在差异,以上8个物种的PLIN1蛋白有10个共同基序,2个特定的保守结构域,PLIN1基因在物种进化中相对保守。同羊的PLIN1基因存在1个26 bp(CGATCCTCGGTGCCCCAGAAACATTC)的InDel位点,包含DD、II和ID 3种基因型,I和D等位基因频率分别为0.2018和0.7982,II、ID和DD基因型频率分别为0.0663,0.2711,0.6627,该位点处于中间多态性(0.250.05);该位点对公羊的体尺性状无显著影响(P>0.05);但该位点的II基因型母羊背高显著高于ID和DD基因型(P<0.05)。说明PLIN1基因的InDel位点可被作为母羊育种的有用分子标记。 展开更多
关键词 脂滴包被蛋白1(PLIN1) 同羊 尾脂 插入/缺失(indel) 生长性状 关联分析
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新疆维吾尔族群体30个常染色体InDel位点的遗传多态性研究 被引量:8
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作者 百茹峰 贾振军 +3 位作者 姜立喆 吕小娇 袁丽 石美森 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期808-814,共7页
目的调查InvestigatorDIPplex试剂盒中所包含的30个插入/缺失多态性(InDel)位点在新疆维吾尔族人群中的群体遗传学数据,探讨其法医学应用价值。方法应用InvestigatorDIPplex试剂盒对新疆223名维吾尔族无关个体外周血样进行30个InDe... 目的调查InvestigatorDIPplex试剂盒中所包含的30个插入/缺失多态性(InDel)位点在新疆维吾尔族人群中的群体遗传学数据,探讨其法医学应用价值。方法应用InvestigatorDIPplex试剂盒对新疆223名维吾尔族无关个体外周血样进行30个InDel分型检测,统计分析各位点的频率数据、群体遗传学参数,并与其他地区人群已有数据进行比较。结果经Bonferroni校正,30个InDel位点不存在连锁不平衡现象;基因型分布在新疆维吾尔族群体中符合Hardy-Weinberg平衡;各位点平均杂合度(Ho)为0.4686,平均个体识别率(DP)为0.6095,累积个体识别率(TDP)为0.999 999 999 995。30个Indel位点的三联体累积非父排除率(CPEtrio)为0.995 478,二联体累积非父排除率(CPEduo)为0.972 007。维吾尔族群体与哈萨克族的遗传关系较近,与非裔美国人的遗传关系较远。结论 InvestigatorDIPplex试剂盒中包含的30个InDel位点在新疆维吾尔族群体中具有较好的遗传多态性,可作为个体识别等特殊检案有效的补充体系。 展开更多
关键词 插入/缺失多态性 遗传学 群体 维吾尔族
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北京汉族群体30个常染色体InDel位点群体遗传学及法医学研究 被引量:8
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作者 百茹峰 姜立喆 +1 位作者 张中 石美森 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1368-1376,共9页
为了调查30个InDel位点在中国北京汉族人群中的群体遗传学数据,并评估其法医学应用价值,文章采集210名北京汉族无关健康个体外周血样,提取样本DNA,采用Investigator DIPplex体系对HLD77等30个InDel位点进行复合扩增,ABl3130XL遗传... 为了调查30个InDel位点在中国北京汉族人群中的群体遗传学数据,并评估其法医学应用价值,文章采集210名北京汉族无关健康个体外周血样,提取样本DNA,采用Investigator DIPplex体系对HLD77等30个InDel位点进行复合扩增,ABl3130XL遗传分析仪进行基因分型,计算常用法医学参数,分析群体遗传差异。经Bonferroni校正,30个InDel位点不存在连锁不平衡现象,基因型分布符合Hardy—Weinberg平衡;各位点DP值为0.2690-0.6330,累积个体识别力(TDP)为0.999999999985;三联体累积非父排除率(CPEtrio)为0.98771049,二联体累积非父排除率(CPEduo)0.94579456。32例STR基因座发生突变的家系样本调查证实上述InDel位点未发现突变。结果表明,Investigator DIPplex试剂盒中包含的30个InDel位点在北京汉族群体中具有较好的遗传多态性,在STR存在突变及微量DNA检材等特殊检案中可作为有效的补充检测体系。 展开更多
关键词 插入缺失多态性 INVESTIGATOR DIPplex 基因多态性 法医学
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GHR基因9-bp InDel与陕北白绒山羊体重和生长性状的关联研究 被引量:12
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作者 闫海龙 白洋洋 +7 位作者 王真 陈晓飞 邓润辉 刘锦旺 董书伟 朱海鲸 蓝贤勇 屈雷 《家畜生态学报》 北大核心 2019年第2期27-31,共5页
生长激素受体(growth hormone receptor,GHR)是生长激素(GH)的特定跨膜受体,对动物正常的生长发育具有重要作用。该试验随机选择532只陕北白绒山羊,通过降落PCR (Touch down PCR)方法鉴定陕北白绒山羊GHR基因第一内含子存在的9bp插入缺... 生长激素受体(growth hormone receptor,GHR)是生长激素(GH)的特定跨膜受体,对动物正常的生长发育具有重要作用。该试验随机选择532只陕北白绒山羊,通过降落PCR (Touch down PCR)方法鉴定陕北白绒山羊GHR基因第一内含子存在的9bp插入缺失(InDel)情况并分析其与体重、生长性状的相关性。研究发现,陕北白绒山羊GHR基因共出现II、ID、DD 3种基因型;相关分析结果表明,在体重、髋宽、体高、荐高和胸深指标上,基因型ID或DD个体相比较II型个体更具显著性优势(P<0.05),说明该位点等位基因D更有利于山羊的生长发育。研究表明GHR基因可作为陕北白绒山羊体重和生长性状的候选基因,为陕北白绒山羊产业快速高效发展提供科学理论依据。 展开更多
关键词 陕北白绒山羊 GHR基因 插入/缺失(indel) 体重 生长性状 相关分析
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GDF9基因12-bp InDel与陕北白绒山羊生长性状关联研究 被引量:3
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作者 朱海鲸 魏宇杰 +6 位作者 康自红 姜雨汝 李陇平 史雷 闫海龙 蓝贤勇 屈雷 《动物医学进展》 北大核心 2019年第6期55-59,共5页
生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)也称FecG基因,是影响家畜繁殖力的常染色体主效候选基因,此基因在性腺轴相关组织及内脏组织器官中均有表达,且shRNA下调GDF9基因的表达可能对动物生长轴的调控造成影响,因此,推测G... 生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)也称FecG基因,是影响家畜繁殖力的常染色体主效候选基因,此基因在性腺轴相关组织及内脏组织器官中均有表达,且shRNA下调GDF9基因的表达可能对动物生长轴的调控造成影响,因此,推测GDF9基因对动物正常的生长发育也具有重要作用。为探讨GDF9基因作为山羊生长性状候选基因的可能性,寻找与山羊生长性状相关的分子标记,本研究以陕北白绒山羊(n=638)为研究对象,并结合已有报道利用DNA池检测GDF9基因的InDel位点,评估InDel位点与生长性状的相关性。本研究发现,在638只陕北白绒山羊GDF9基因3′调控区存在12-bp的插入缺失(InDel),群体共出现3种基因型(II,ID,DD),其中I和D等位基因频率分别为0.461和0.539,优势基因型为杂合型(ID)频率为0.874。关联性分析结果表明,该突变位点与陕北白绒山羊体高显著相关(P<0.01),同时显著影响十字部高性状(P<0.05)。其他性状虽然没有显著的相关性,但是其体重、体长等重要生长性状也表现相同的趋势。因此,GDF9基因可作为陕北白绒山羊生长性状选育的候选基因,为陕北白绒山羊选育工作提供理论依据。 展开更多
关键词 山羊 生长分化因子9 插入缺失(indel) 生长性状 关联分析
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InDel和SNP标记在水稻图位克隆中的应用 被引量:41
11
作者 潘存红 王子斌 +5 位作者 马玉银 殷跃军 张亚芳 左示敏 陈宗祥 潘学彪 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期447-453,共7页
在水稻功能基因的图位克隆中,常需要高密度的分子标记,而目前公布的各种标记的密度还远未达到令人满意的程度。InDel和SNP标记是新型的分子标记类型,基本可以满足精细定位目的基因的需要。InDel和SNP标记可以较容易地通过生物信息学的... 在水稻功能基因的图位克隆中,常需要高密度的分子标记,而目前公布的各种标记的密度还远未达到令人满意的程度。InDel和SNP标记是新型的分子标记类型,基本可以满足精细定位目的基因的需要。InDel和SNP标记可以较容易地通过生物信息学的方法获得,而且经济实用、特异性高、稳定性好。介绍了设计InDel和SNP标记的方法,并以一个水稻卷叶基因的研究为实例,介绍了在基因精细定位研究中利用这两种标记的方法和提高标记设计成功率的注意点。 展开更多
关键词 插入缺失长度多态性 单核苷酸多态性 分子标记 生物信息学 图位克隆 水稻 卷叶基因
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X染色体上18个InDel多重PCR系统的建立 被引量:5
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作者 孙宽 赵书民 +1 位作者 张素华 李成涛 《法医学杂志》 CAS CSCD 2014年第2期101-109,共9页
目的对X染色体上的插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)遗传标记进行研究,筛选18个基因座建立可用于中国汉族人群法医DNA鉴定的辅助分型系统。方法采用人类基因组浏览器和dbSNP数据库筛选得到18个X-InDel基因座,用Primer 3软件包设计... 目的对X染色体上的插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)遗传标记进行研究,筛选18个基因座建立可用于中国汉族人群法医DNA鉴定的辅助分型系统。方法采用人类基因组浏览器和dbSNP数据库筛选得到18个X-InDel基因座,用Primer 3软件包设计多重复合扩增PCR引物,依据扩增片段长度分为3组,分别用FAM、HEX和TAMRA三种荧光素标记,建立多重PCR体系。对中国汉族和主要的四大少数民族(回族、维族、蒙古族和藏族)进行群体遗传学调查及对比分析。结果成功研制了一个包含18个X-InDel基因座和Amelogenin性别鉴定基因座的复合荧光多重PCR扩增体系,命名为InDel X-18PLEX系统。多态性调查显示这18个X-InDel基因座在5个主要民族中等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡,但各等位基因的频率分布差异具有统计学意义。在中国汉族人群中,该系统在女性群体和男性群体的累积个人识别率分别为0.999999 4、0.99988,在三联体和二联体的累积平均排除率分别为0.999992和0.99。结论 InDel X-18PLEX系统能够满足成为法医DNA鉴定辅助性试剂盒的要求,可以成为部分疑难案件的补充分析工具。 展开更多
关键词 法医遗传学 多态现象 遗传 X染色体 插入 缺失
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单管直扩38重祖先信息InDels体系的构建及其在微流控芯片系统的应用 被引量:7
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作者 韩俊萍 赵蕾 +7 位作者 王庆国 江丽 谢何鑫 庄斌 赵丽健 李唐松 吴瑾 李彩霞 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2020年第9期968-981,共14页
本文基于插入-缺失多态性(insertion-deletion polymorphism,InDel)遗传标记,从相关文献和dbSNP库中筛选出38个在东亚、欧洲、非洲人群中具有等位基因频率差异的祖先来源InDel位点,同时整合Amelogenin位点和Y染色体STR(DYS439)位点,以... 本文基于插入-缺失多态性(insertion-deletion polymorphism,InDel)遗传标记,从相关文献和dbSNP库中筛选出38个在东亚、欧洲、非洲人群中具有等位基因频率差异的祖先来源InDel位点,同时整合Amelogenin位点和Y染色体STR(DYS439)位点,以辅助未知样本的性别鉴定,采用PCR-CE技术构建了可以区分三大洲际人群的单管直接扩增复合检测体系,该体系可与微流控芯片系统相结合,1.7 h内完成DNA样本自动化扩增和电泳分型,利用公共数据库1000Genomes中16个人群1 607名个体的分型数据对筛选的38个InDel位点进行初步评估;同时对构建的38-plex InDels体系的灵敏度、准确性、直接扩增能力进行验证评估;检测5种不同人群的779份样本和215份唾液卡、血卡的直接扩增样本,采用聚类分析和主成分分析方法,评价体系的推断准确性.结果表明该38-plex InDels复合检测体系分型准确,灵敏度达157 pg,能够对唾液卡和血卡直接扩增,可以区分三大洲际人群及其混合人群,能够准确推断待测样本的族群来源、估算祖先成分,且通过集成细胞裂解步骤将有望2h实现"样本进-结果出"式快速自动化InDel分型. 展开更多
关键词 法医物证学 插入-缺失多态性 祖先信息位点 微流控芯片
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InDel_typer30:用于中国5个主要民族DNA鉴定的多重PCR系统 被引量:14
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作者 赵书民 张素华 李成涛 《法医学杂志》 CAS CSCD 2010年第5期343-348,356,共7页
目的采用插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)多态性遗传标记,建立一种可用于中国汉族、回族、维吾尔族、蒙古族、藏族5个主要民族法医DNA鉴定的多重PCR系统。方法采用人类基因组浏览器和dbSNP数据库筛选具有高度遗传多态性的人类常染... 目的采用插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)多态性遗传标记,建立一种可用于中国汉族、回族、维吾尔族、蒙古族、藏族5个主要民族法医DNA鉴定的多重PCR系统。方法采用人类基因组浏览器和dbSNP数据库筛选具有高度遗传多态性的人类常染色体InDel标记,采用Primer 3软件设计多重PCR引物,通过复合荧光标记系统建立多重PCR扩增体系,采用该体系对汉、回、维、蒙、藏5个民族进行多态性调查。结果成功建立了一个包含30个InDel位点和Amelogenin性别鉴定位点的复合荧光多重PCR扩增体系,命名为InDel_typer30。多态性调查显示这30个InDel位点在上述5个主要民族中均呈高度遗传多态性,平均期望杂合度分别为:0.464、0.460、0.453、0.466和0.469,平均个人识别率分别为:0.595、0.585、0.586、0.589和0.595。该系统在5个民族中的累积个人识别率(CDP)均达到0.999999999996以上。结论 InDel_typer30是一种适用于中国汉、回、维、蒙、藏5个主要民族的法医DNA鉴定系统。 展开更多
关键词 法医遗传学 聚合酶链反应 插入/缺失多态性 亲权鉴定
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用于中国人群个体识别的InDel多重PCR系统的构建 被引量:4
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作者 王玮 赵蕾 +7 位作者 江丽 刘京 黄美莎 李冉冉 刘佳佳 马泉 王英元 李彩霞 《刑事技术》 2017年第1期1-8,共8页
目的利用插入-缺失多态性(insertion-deletion,InDel)遗传标记,建立一套可用于鉴定中国人群的法医DNA复合扩增体系。方法利用db SNP数据库,筛选出30个在中国人群中有高度遗传多态性的InDel位点,建立复合多重PCR扩增体系,并对汉族、哈萨... 目的利用插入-缺失多态性(insertion-deletion,InDel)遗传标记,建立一套可用于鉴定中国人群的法医DNA复合扩增体系。方法利用db SNP数据库,筛选出30个在中国人群中有高度遗传多态性的InDel位点,建立复合多重PCR扩增体系,并对汉族、哈萨克族、傣族、苗族与瑶族进行遗传多态性调查。结果成功建立了一套包含30个InDel位点与1个性别鉴定基因座、共31个遗传标记的复合多重PCR扩增体系。在5个民族的遗传多态性调查中,累积个体识别率分别为0.999999999957、0.999999999990、0.999999999974、0.999999999875及0.999999999966,具有较高的遗传多态性;群体间FST值均小于0.0448,在群体间差异很小。结论本体系可用于中国人群的法医DNA个体识别。 展开更多
关键词 法医遗传学 插入-缺失多态性 个体识别
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鸡Visfatin基因9 bp indel杂合突变异源双链DNA的鉴定 被引量:1
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作者 韩瑞丽 康相涛 +3 位作者 魏杨 李国喜 蓝贤勇 陈宏 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期756-761,共6页
内脂素(Visfatin)是脂肪细胞因子家族的新成员,主要由内脏脂肪组织产生.研究表明内脂素具有类胰岛素样作用.在检测固始鸡-安卡鸡资源群体3代(亲本,F1,F2)964只鸡Visfatin基因9bp插入/缺失(9 bp 'TAACCTGTG' insertion-deletion... 内脂素(Visfatin)是脂肪细胞因子家族的新成员,主要由内脏脂肪组织产生.研究表明内脂素具有类胰岛素样作用.在检测固始鸡-安卡鸡资源群体3代(亲本,F1,F2)964只鸡Visfatin基因9bp插入/缺失(9 bp 'TAACCTGTG' insertion-deletion)多态的过程中,发现其杂合子的变性和非变性聚丙烯酰胺胶上除2条同源双链DNA(282bp和273bp)外有2条未知条带(命名为A和B).A,B条带经回收、二次PCR、再次聚丙烯酰胺凝胶电泳及DNA测序表明:Visfatin基因第10内含子中9bp insertion-deletion突变杂合子的PCR产物中,本身包含2种同源双链DNA片段和2种异源双链DNA片段,不需要经过额外的变性、退火处理,其PCR产物可以直接进行突变检测,在229个杂合突变中异源双链DNA的检出率为100%.因此,通过异源双链DNA这一标示物作为基因分型时的依照或者参考,建立适当的异源双链DNA分析法可进行基因中几个核苷酸插入/缺失多态的检测. 展开更多
关键词 Visfatin基因 9bp插入/缺失 杂合子突变 异源双链DNA
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InDel遗传标记在法医学领域的研究进展 被引量:5
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作者 盛翔 包云 +5 位作者 张家硕 李敏 李亚男 徐倩男 张素华 李成涛 《法医学杂志》 CAS CSCD 2018年第4期420-427,共8页
法医DNA分型的遗传标记经历了可变数目串联重复(variable number of tandem repeat,VNTR)序列和短串联重复(short tandem repeat,STR)序列。随着测序技术的产生,出现了第三代遗传标记,因其基因座通常只有两个等位基因,故又被称为二等位... 法医DNA分型的遗传标记经历了可变数目串联重复(variable number of tandem repeat,VNTR)序列和短串联重复(short tandem repeat,STR)序列。随着测序技术的产生,出现了第三代遗传标记,因其基因座通常只有两个等位基因,故又被称为二等位基因遗传标记,主要包括单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和插入/缺失(insertion/deletion,In Del)。由DNA片段插入或缺失形成的DNA长度多态性In Del遗传标记分布于整个基因组中,数目众多,兼具STR和SNP遗传标记的优势,现已应用于遗传学、人类学等领域。本文主要对In Del遗传标记在法医学领域的研究进展进行综述,旨在回顾和总结近年来的主要研究成果并为后续研究提供参考。 展开更多
关键词 法医遗传学 遗传标记 综述 插入/缺失
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Lack of association between ADRA2B-4825 gene insertion/deletion poly- morphism and migraine in Chinese Han population
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作者 倪健强 贾莎莎 +4 位作者 刘民 陈守恭 姜玉婷 董万利 高玉振 《Neuroscience Bulletin》 SCIE CAS CSCD 2010年第4期322-326,共5页
Objective The present study aimed to estimate the association between susceptibility to migraine and the 12nucleotide insertion/deletion (indel) polymorphism in promoter region ofα 2B -adrenergic receptor gene (AD... Objective The present study aimed to estimate the association between susceptibility to migraine and the 12nucleotide insertion/deletion (indel) polymorphism in promoter region ofα 2B -adrenergic receptor gene (ADRA2B).Methods A case-control study was carried out in Chinese Han population,including 368 cases of migraine and 517 controls.Genomic DNA was extracted from blood samples,and DNA fragments containing the site of polymorphism were amplified by PCR.Data were adjusted for sex,age,migraine history and family history,and analyzed using a logistic regression model.Results There was no association between indel polymorphism and migraine,at either the allele or the genotype level.Conclusion These findings do not support a functional significance of ADRA2B indel polymorphism at position-4825 relative to the start codon in the far upstream region of the promoter in the present migraine subjects. 展开更多
关键词 MIGRAINE promoter ofα 2B -adrenergic receptor gene insertion/deletion polymorphism genetic association
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利用比较基因组学开发山羊草属InDel分子标记 被引量:13
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作者 吴磊 王丹 +2 位作者 苏文悦 郭长虹 束永俊 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1334-1338,共5页
为开发和利用小麦野生近缘种的优异基因,采用比较基因组学方法,通过拟斯卑尔脱山羊草EST(expressed sequencetag)与小麦UniGene序列的比对分析,发现山羊草插入/缺失(InDel)位点137个,在这些位点两端序列设计引物24对,通过在15个小麦野... 为开发和利用小麦野生近缘种的优异基因,采用比较基因组学方法,通过拟斯卑尔脱山羊草EST(expressed sequencetag)与小麦UniGene序列的比对分析,发现山羊草插入/缺失(InDel)位点137个,在这些位点两端序列设计引物24对,通过在15个小麦野生近缘属种基因组DNA的扩增分析,发现11对引物具多态性,可以作为InDel标记。这些包含突变位点的基因涉及亚细胞定位、蛋白质结合与催化以及代谢等过程。 展开更多
关键词 比较基因组学 插入/缺失突变 小麦 拟斯卑尔脱山羊草 功能分子标记
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贵州地方水稻种质资源籼-粳遗传分化的InDel分子标记研究 被引量:7
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作者 冼俊龙 曾晓芳 赵德刚 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期486-496,共11页
本研究利用36对InDel分子标记引物对贵州地方水稻种质的籼-粳遗传分化和亲缘关系进行分析,结果表明,82份贵州地方栽培稻中49份为粳稻,33份为籼稻,贵州地方栽培稻"禾"品种主要属于粳稻,而"谷"品种主要为籼稻。基于Ne... 本研究利用36对InDel分子标记引物对贵州地方水稻种质的籼-粳遗传分化和亲缘关系进行分析,结果表明,82份贵州地方栽培稻中49份为粳稻,33份为籼稻,贵州地方栽培稻"禾"品种主要属于粳稻,而"谷"品种主要为籼稻。基于Nei氏遗传距离的亲缘关系分析表明在粳稻群体和籼稻群体中均存在与野生稻亲缘关系近的品种,其中的粳稻品种与野生稻的遗传关系比之籼稻品种近。而基于MCMC算法的遗传结构分析揭示了贵州地方籼稻品种中存在较为复杂的遗传结构。分子变异分析显示,粳稻和籼稻品种的遗传变异主要来自亚种内,遗传多样性分析表明其亚种内籼稻品种的遗传多样性略高于粳稻品种。研究结果揭示了贵州省黔东南地区栽培稻种质资源的籼-粳分化程度、遗传关系及其遗传多样性。 展开更多
关键词 水稻 籼-粳分化 插入/缺失 遗传结构
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