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CT抗原KM-HN-1 HLA-A*0201限制性表位预测及其与HLA-A*0201结合强度分析
被引量:
2
1
作者
王昊亮
付晓岚
+3 位作者
姜曼
黎万玲
唐艳
吴玉章
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期593-596,共4页
目的通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础。方法利用基于蛋白酶体剪切位点特异性...
目的通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础。方法利用基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法PAProc及基于肽MHC-I结合的算法BIMAS和SYFPEITHI对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测.合成KM-HN-1相关候选表位肽KM-HN-I321-329(KLLPFRETV),KM-HN-I303-211,(FLPTAPPNV),KM-HN-I629-637。(TLLQIIETV),KM-HN-I87-95(ILNKSIIEV),KM-HN-I538-596。(QMMEALDQL)及阳性对照肽HBVcAg18-27(FLPSDFFPSV);对这些合成肽与HIA-A*0201分子结合亲和力及其复合物稳定性根据文献报道的方法进行分析。结果KM-HN-I321-329(KLLPERETV)结合亲和力最低,KM-HN—I203-211(FLPTAPPNV)结合亲和力最高,其余3条肽结合亲和力介于2者之间;稳定性实验(DC50)结果显示:KM-HN-I538—546(QMMEALDQL)DC50小于2h,KM—HN-I321-329(KLLPERETV)的DC50介于2~4h之间,KM-HN-I87-95。(ILNKSIIEV)的DC50介于6~8h之间,KM-HN-I233-211(HLPTAPPNV)及KM-HN-I629—633(TLLQIIETV)的DC50均大于8h。结论基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法及基于肽MHC-I结合的算法对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,结合候选表位肽与HLA-A*0201分子结合的亲和力与复合物稳定性实验分析,为该抗原HLA-A*0201限制性表位的鉴定奠定了基础。
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关键词
CT抗原
km-hn-1
表位预测
HLA-A*020
1
限制性
结合亲和力及稳定性
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职称材料
题名
CT抗原KM-HN-1 HLA-A*0201限制性表位预测及其与HLA-A*0201结合强度分析
被引量:
2
1
作者
王昊亮
付晓岚
姜曼
黎万玲
唐艳
吴玉章
机构
第三军医大学基础医学部全部免疫学研究所
出处
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期593-596,共4页
基金
国家重点基础研究发展规划"973"项目(2003CB514108)
国家自然科学基金面上项目(30300315)资助
文摘
目的通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础。方法利用基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法PAProc及基于肽MHC-I结合的算法BIMAS和SYFPEITHI对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测.合成KM-HN-1相关候选表位肽KM-HN-I321-329(KLLPFRETV),KM-HN-I303-211,(FLPTAPPNV),KM-HN-I629-637。(TLLQIIETV),KM-HN-I87-95(ILNKSIIEV),KM-HN-I538-596。(QMMEALDQL)及阳性对照肽HBVcAg18-27(FLPSDFFPSV);对这些合成肽与HIA-A*0201分子结合亲和力及其复合物稳定性根据文献报道的方法进行分析。结果KM-HN-I321-329(KLLPERETV)结合亲和力最低,KM-HN—I203-211(FLPTAPPNV)结合亲和力最高,其余3条肽结合亲和力介于2者之间;稳定性实验(DC50)结果显示:KM-HN-I538—546(QMMEALDQL)DC50小于2h,KM—HN-I321-329(KLLPERETV)的DC50介于2~4h之间,KM-HN-I87-95。(ILNKSIIEV)的DC50介于6~8h之间,KM-HN-I233-211(HLPTAPPNV)及KM-HN-I629—633(TLLQIIETV)的DC50均大于8h。结论基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法及基于肽MHC-I结合的算法对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,结合候选表位肽与HLA-A*0201分子结合的亲和力与复合物稳定性实验分析,为该抗原HLA-A*0201限制性表位的鉴定奠定了基础。
关键词
CT抗原
km-hn-1
表位预测
HLA-A*020
1
限制性
结合亲和力及稳定性
Keywords
Cancer-testis antigen
km-hn-1
Epitope prediction
HLA-A * 020
1
restriction
Binding aifinity & complex stability
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CT抗原KM-HN-1 HLA-A*0201限制性表位预测及其与HLA-A*0201结合强度分析
王昊亮
付晓岚
姜曼
黎万玲
唐艳
吴玉章
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006
2
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职称材料
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