鸡KRT14基因编码区SNPs及其与蛋壳品质性状的相关分析

角蛋白14(Keratin 14,KTR14)属于富含半胱氨基酸残基的I型(酸性)角蛋白,具有参与细胞生长,促进细胞分化的作用。为分析KRT14基因对鸡蛋壳品质性状的影响,本研究以43周龄的江汉鸡为实验对象,利用PCR技术结合直接测序法,分析鸡KRT14基因编码区SNPs,并将其与蛋重、蛋壳厚度、蛋壳强度性状进行关联分析。结果显示:在鸡KRT14基因外显子2~5中共发现g.184bp C>T、g.215bp C>T、g.275bp C>A、g.285bp G>A 4个SNPs,均为同义突变;相关性分析结果表明,上述4个SNPs位点的多态性与蛋重、蛋壳厚度、蛋壳强度等具有相关性(P<0.05),其中g.184bp C>T位点的CT基因型、g.215bp C>T位点的CT基因型、g.275bpC>A位点的CC基因型及g.285bpG>A位点的GG基因型具有更高的蛋壳强度和蛋壳厚度;上述突变引起KRT14基因的多态性,共形成9种单倍型、23种单倍型组合,其中单倍型组合H1H9(其序列为CCAG/TTCG)具有最佳的蛋壳品质性状。综上,KRT14基因可作为影响蛋鸡蛋壳品质性状的候选基因,可选择KRT14基因外显子2~5区域的H1H9单倍型作为提高蛋鸡蛋壳品质性状的潜在遗传标记用于江汉鸡的辅助选择中。

KRT14基因新突变导致的单纯型大疱性表皮松解症家系的研究

目的探讨一个包含4代9例患者的单纯型大疱性表皮松解症家系的遗传学病因以及表型特点。方法应用高通量目标区域捕获测序分析先证者大疱性表皮松解症的相关基因。在发现疑似突变后，用Sanger测序对其家系进行分析，同时应用Mutationtaster、Poly Phen-2、Provean、SIFT等软件以及NCBI网站对突变位点的致病性和保守性进行预测，并用100名正常人作为对照。结果先证者KRTj4基因存在一个新的C．1234A〉G（P．Ile412Val）杂合突变。家系分析提示所有患者均携带同样的突变。值得注意的是，3名成员（包括2例患者和1名正常个体）的KRT14基因存在一个人类基因突变数据库收录的c．1237G〉A（P．Ala413 Thr）杂合突变，而在其余7例患者中未发现该突变，提示C．1237G〉A（P．Ala413Thr）并非致病突变。在100名正常对照中均未检测到上述两种突变。NCBI保守性分析提示，两个位点均高度保守，而c．1234A〉G（P．11e412Val）为强致病性，c．1237G〉A（P．Ala413Thr）则可能为多态。结论KRT14基因c．1234A〉G（P．Ile412Val）杂合突变很可能是该家系的遗传学病因。C．1237G〉A（P．Ala413Thr）氨基酸改变可能是一种多态。对于有多个致病基因的遗传病，高通量目标区域捕获测序比传统的Sanger测序更高效、准确、省时和低廉，更适合用于临床检测。

KRT5基因新突变(p.Gly207Asp)导致一家系伴斑状色素沉着的单纯性大疱性表皮松解症

目的:对伴斑状色素沉着的单纯性大疱性表皮松解症一家系进行KRT5和KRT14致病基因突变筛查。方法:提取家系中每一位成员的DNA样本,应用聚合酶链式反应(PCR)扩增KRT5和KRT14基因编码区及外显子-内含子交界区,对PCR产物进行DNA测序。选择100例正常人群作为对照组,将突变结果在The Genome Aggregation Database(gnomAD)和The Exome Aggregation Consortium(ExAC)等多个大样本数据库中查询突变频率。结果:该家系中KRT14基因检测未发现异常;KRT5基因在先证者中检测到1个未报道的错义突变c.620G>A(p.Gly207Asp),患儿父亲及弟弟均检测到该突变。该家系中该突变和表型共分离,该突变c.620G>A(p.Gly207Asp)在GenBank及人类基因突变数据库(HGMD)等国际数据库中尚未见报道。结论:KRT5基因全新点突变c.620G>A(p.Gly207Asp),可能是引起该家系中伴斑状色素沉着的单纯性大疱性表皮松解症患儿发病的原因。