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马铃薯StNAC6基因克隆及干旱胁迫表达分析
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作者 纪艺红 索梅芹 +2 位作者 邵子莹 张宁 王磊 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第11期51-60,共10页
NAC对植物种子发育、细胞分裂分化、侧根形成等都有直接影响,它与DNA元件相结合发挥作用,能够有效提高植物的抗逆性。通过PCR方法从马铃薯冀张薯8号中克隆获得了1个StNAC6基因,并对StNAC6基因进行生物信息学分析,包含序列比对、理化性... NAC对植物种子发育、细胞分裂分化、侧根形成等都有直接影响,它与DNA元件相结合发挥作用,能够有效提高植物的抗逆性。通过PCR方法从马铃薯冀张薯8号中克隆获得了1个StNAC6基因,并对StNAC6基因进行生物信息学分析,包含序列比对、理化性质预测、进化分析等。使用冀张薯8号组培苗作为试验材料,用浓度为10%、15%和20%的聚乙二醇6000(PEG-6000)处理0、6、12、24 h后,分析干旱胁迫下的表达模式,并在马铃薯开花期,采取不同的组织(花、根、茎、叶、块茎、葡匐茎)进行组织表达分析。结果表明,马铃薯NAC6基因全长为876 bp,共编码291个氨基酸,包含1个NAM结构域;等电点为7.04,相对分子量为33.61915 ku;StNAC6蛋白均含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3种氨基酸磷酸化位点,属于不稳定亲水性蛋白;StNAC6第74、262位氨基酸存在N-糖基化位点;预测StNAC6定位于细胞核。荧光定性PCR结果显示,在不同含量PEG胁迫处理下,马铃薯StNAC6基因的相对表达量不相同,存在明显差异,说明该基因参与干旱应答响应;StNAC6基因在马铃薯茎、花中的相对表达量最高,说明其可能参与马铃薯生长调控。研究结果可为今后深入探究马铃薯NAC6转录因子的功能和调控机制奠定基础。 展开更多
关键词 马铃薯 nac6 基因克隆 干旱胁迫 nac转录因子
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桑树NAC基因家族鉴定与生根粉处理下表达模式分析
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作者 王艺琳 豆浩 +2 位作者 邓鹏 周鑫 权金娥 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期629-640,共12页
【目的】探究桑树NAC基因家族的生物信息学特征,并研究1000 mg·L^(-1)生根粉(ABT)处理对该基因产生的影响,为深入研究桑树NAC转录因子的功能提供依据。【方法】利用生物信息学方法对川桑NAC基因家族进行基因鉴定,并分析其理化性质... 【目的】探究桑树NAC基因家族的生物信息学特征,并研究1000 mg·L^(-1)生根粉(ABT)处理对该基因产生的影响,为深入研究桑树NAC转录因子的功能提供依据。【方法】利用生物信息学方法对川桑NAC基因家族进行基因鉴定,并分析其理化性质、保守基序、顺式作用元件、系统进化树、蛋白三级结构及互作关系,并选用‘果桑大十’作为试验材料,经ABT处理后,分析其4个时期(10、20、30、40 d)NAC基因家族的表达模式。【结果】桑树NAC基因家族共有92个成员,分为22个亚家族,亚家族成员广泛分布于细胞核,且具有相似的保守结构。顺式作用元件分析表明,桑树NAC基因家族对激素具有较强的响应能力。蛋白三级结构显示同一亚家族的蛋白空间结构相似,且功能相同,这可能与其进化同源性有关。ABT处理后,NAC基因家族的表达水平整体呈上升趋势,而MnNAC91、MnNAC67、MnNAC28在对照组(CK)中呈现较高的表达水平。【结论】NAC基因家族功能相对稳定,在整个进化过程中无明显变化;ABT可促进NAC基因家族表达,尤其是MnNAC75、MnNAC104、MnNAC7、MnNAC30、MnNAC101、MnNAC83、MnNAC102具有较高的同源性,并与拟南芥的结构功能相似,推测对抗干旱胁迫有一定作用。 展开更多
关键词 桑树 nac基因家族 鉴定分析 生物信息 元件分析
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养正透邪祛毒法联合NAC方案化疗对三阴性乳腺癌患者疗效、T细胞亚群及癌因性疲乏的影响
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作者 谷晓娟 谢昱伟 +4 位作者 李萌 左晓娜 王佳 刘欣 胡志伟 《中国医院用药评价与分析》 2024年第9期1059-1062,共4页
目的:探讨养正透邪祛毒法联合NAC方案(多西他赛+表柔比星+环磷酰胺)化疗对三阴性乳腺癌患者疗效、T细胞亚群及癌因性疲乏的影响。方法:选取2022年6月至2023年6月该院诊治的三阴性乳腺癌患者100例,根据随机数字表法分为对照组和观察组,... 目的:探讨养正透邪祛毒法联合NAC方案(多西他赛+表柔比星+环磷酰胺)化疗对三阴性乳腺癌患者疗效、T细胞亚群及癌因性疲乏的影响。方法:选取2022年6月至2023年6月该院诊治的三阴性乳腺癌患者100例,根据随机数字表法分为对照组和观察组,各50例。对照组患者给予NAC方案治疗,观察组患者给予口服自拟养正透邪祛毒方与NAC方案联合治疗。观察两组患者的疗效、T淋巴亚群、炎症因子、癌因性疲乏水平及不良反应发生情况。结果:观察组患者的总有效率为82.00%(41/50),明显高于对照组的58.00%(29/50),差异有统计学意义(P<0.05)。治疗后,两组患者CD3^(+)、CD4^(+)、CD4^(+)/CD8^(+)、白细胞介素(IL)12和IL-2水平均较治疗前升高,且观察组患者较对照组更高;两组患者CD8^(+)、肿瘤坏死因子α和可溶性白细胞介素-2受体水平,躯体、认知和情感疲乏评分均较治疗前降低,且观察组患者较对照组更低,上述差异均有统计学意义(P<0.05)。观察组、对照组患者的不良反应发生率分别为24.00%(12/50)、28.00%(14/50),差异无统计学意义(P>0.05)。结论:养正透邪祛毒法与NAC方案化疗联合治疗三阴性乳腺癌患者,可明显提高疗效,改善T细胞亚群水平,降低炎症反应,改善癌因性疲乏状况,安全性佳。 展开更多
关键词 养正透邪祛毒法 nac方案 三阴性乳腺癌 疗效 T细胞亚群 癌因性疲乏
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紫花苜蓿耐盐性相关NAC转录因子的挖掘及表达分析 被引量:1
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作者 荣梦茹 余如刚 +4 位作者 韦英铭 王国良 杜雪玲 杨改梅 高佳佳 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1055-1067,共13页
NAC(NAM,ATAF1/2,CUC2)是植物特有的一类转录因子家族,可调控植物响应盐胁迫。本研究基于盐胁迫下紫花苜蓿(Medicago sativa L.)耐盐品种GIB和盐敏感品种LS根和叶的转录组数据,通过生物信息学方法筛选出17个差异表达的MsNAC转录因子家... NAC(NAM,ATAF1/2,CUC2)是植物特有的一类转录因子家族,可调控植物响应盐胁迫。本研究基于盐胁迫下紫花苜蓿(Medicago sativa L.)耐盐品种GIB和盐敏感品种LS根和叶的转录组数据,通过生物信息学方法筛选出17个差异表达的MsNAC转录因子家族成员,并对其序列特征、系统进化、顺式作用元件及盐胁迫下的表达模式等进行分析。结果显示,17个MsNACs均具有NAC典型的NAM结构域,且蛋白结构相似。系统进化分析将17个MsNACs分成8个亚族,各亚组成员具有高度相似的保守基序。顺式作用元件分析发现,有15个MsNACs具有ABA响应顺式元件ABRE。转录组数据表达模式分析与RT-qPCR验证结果显示MsNAC1,MsNAC2,MsNAC35,MsJUB1和MsNAC40基因在盐处理下GIB叶中上调表达,在LS叶中下调或者未发生变化,推测这些基因参与调控紫花苜蓿的耐盐反应。本研究为进一步研究紫花苜蓿NAC转录因子响应盐胁迫功能提供参考依据。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 nac 盐胁迫 生物信息学分析 表达模式
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紫花苜蓿NAC基因家族鉴定及在非生物胁迫下的表达模式分析 被引量:1
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作者 邹苇鹏 翟佳兴 +5 位作者 李迪娜 黄洁琼 郭康杰 岑慧芳 朱慧森 许涛 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2440-2458,共19页
NAC是植物特有转录因子,在调控植物生长发育及响应非生物胁迫等方面发挥作用。为挖掘紫花苜蓿(Medicago sativa)响应干旱等非生物胁迫的NAC转录因子,本研究利用生物信息学方法在‘中苜4号’紫花苜蓿基因组中鉴定出143个NAC家族转录因子... NAC是植物特有转录因子,在调控植物生长发育及响应非生物胁迫等方面发挥作用。为挖掘紫花苜蓿(Medicago sativa)响应干旱等非生物胁迫的NAC转录因子,本研究利用生物信息学方法在‘中苜4号’紫花苜蓿基因组中鉴定出143个NAC家族转录因子。研究表明,紫花苜蓿MsNAC基因在染色体上不均匀分布,MsNAC基因存在片段重复,并与大豆(Glycine max(Linn.)Merr.)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)存在共线性关系,基因保守基序及基因结构分析表明MsNAC基因多数含有Motif1,Motif3保守基序及3~6个外显子。大多数MsNAC蛋白定位于细胞核中。系统进化树分析结果表明MsNACs聚类为8个亚家族。顺式作用元件分析表明MsNAC基因含有响应干旱及脱落酸、生长素等顺式作用元件。荧光定量分析结果显示部分MsNAC基因响应干旱、盐胁迫及脱落酸处理,大部分MsNAC候选基因在干旱、盐及ABA处理后上调表达。本研究结果可为紫花苜蓿抗旱、耐盐分子育种提供候选基因。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 nac 转录因子 生物信息学 非生物胁迫 表达模式
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观赏植物NAC转录因子的研究进展 被引量:2
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作者 邓泽宜 罗乐 +2 位作者 于超 张启翔 隋云吉 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期737-750,共14页
NAC转录因子家族在调节植物的生长发育中发挥着重要的作用,在模式植物、作物中已进行了大量研究,但是在观赏植物中的研究还缺乏系统性的梳理和探讨。本综述介绍了NAC转录因子的结构和分类,并梳理了2004-2023年NAC转录因子在观赏植物器... NAC转录因子家族在调节植物的生长发育中发挥着重要的作用,在模式植物、作物中已进行了大量研究,但是在观赏植物中的研究还缺乏系统性的梳理和探讨。本综述介绍了NAC转录因子的结构和分类,并梳理了2004-2023年NAC转录因子在观赏植物器官生长发育和胁迫响应上的生物学功能研究,其中观赏植物器官生长发育主要集中在叶缘形态建成、花器官发育、叶片衰老、花瓣衰老、种球休眠5个方面,胁迫响应则集中在干旱、盐、碱、冷、热等非生物胁迫,在生物胁迫中报道较少。最后,鉴于观赏植物NAC转录因子大部分都还停留在生物信息学分析以及表达模式分析等功能初探阶段,本文在结合观赏植物全基因组测序继续开展NAC转录因子鉴定研究、挖掘观赏植物中与模式植物存在不同作用机制的NAC转录因子、解析观赏植物NAC转录因子与其他转录因子间的调控网络、加快利用推进基因工程或编辑技术开展观赏植物的分子育种工作等4个方面,对未来NAC转录因子在观赏植物中的研究提出了展望。 展开更多
关键词 观赏植物 转录因子 nac基因 生长发育 胁迫响应
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桃基因 PpNAC 的鉴定及其在不同发育时期的表达分析
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作者 王晓菲 高利盈 +7 位作者 刘宁 程钧 王伟 谭彬 郑先波 叶霞 冯建灿 张郎郎 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期412-423,共12页
【目的】鉴定影响桃果实成熟的PpNAC基因,并分析其在桃果实不同发育时期的表达量变化,为解析桃果实成熟的分子机制奠定基础。【方法】通过对桃不同组织部位的转录组分析,从115个PpNAC基因家族成员中筛选在果实中特异表达的PpNAC基因,进... 【目的】鉴定影响桃果实成熟的PpNAC基因,并分析其在桃果实不同发育时期的表达量变化,为解析桃果实成熟的分子机制奠定基础。【方法】通过对桃不同组织部位的转录组分析,从115个PpNAC基因家族成员中筛选在果实中特异表达的PpNAC基因,进一步进行生物信息学分析、蛋白互作分析和表达分析,筛选可能影响桃果实成熟的PpNAC基因。【结果】筛选到16个在桃果实中高表达的PpNAC基因,其在桃的8条染色体上都有分布,蛋白相对分子质量和等电点差异较大。基因编码区均含有NAM保守结构域和motif1~6,含有3~8个外显子,2~7个内含子,启动子中脱落酸响应元件和茉莉酸响应元件相对较多。此外,通过与已报道成熟相关NAC蛋白PpNAC1的互作筛选,得到4个与PpNAC1互作的PpNAC蛋白。进一步的表达分析表明,这4个PpNAC基因在果实成熟起始期和成熟后期表达量达到最高。【结论】PpNAC基因可能参与调控桃果实成熟。 展开更多
关键词 nac基因 果实成熟 表达分析
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3种栗属植物NAC基因家族的鉴定及密码子偏好性分析
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作者 付丽枝 杨涌 +6 位作者 郭江辉 刘静 王萌 王旋 王东升 于立洋 张海娥 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1677-1689,共13页
【目的】鉴定3种栗属植物NAC基因家族,同时分析其密码子偏好性,为进一步探究栗属植物NAC基因家族功能提供重要理论依据。【方法】使用生物信息学方法,对3种栗属植物的染色体位置、系统进化关系、蛋白基序、所受选择压力、密码子偏好性... 【目的】鉴定3种栗属植物NAC基因家族,同时分析其密码子偏好性,为进一步探究栗属植物NAC基因家族功能提供重要理论依据。【方法】使用生物信息学方法,对3种栗属植物的染色体位置、系统进化关系、蛋白基序、所受选择压力、密码子偏好性等方面进行分析。【结果】共鉴定到333个栗属植物NAC基因家族成员,其不均等分布在各个染色体上;进化树分析显示其分为5个小组;蛋白基序分析显示5个小组都包含保守的Motif 1~Motif 7;共线性分析显示其在基因组内与组间包含极强的共线性关系且多数共线性基因对都在经历纯化选择压力;密码子偏好性分析显示其密码子偏好性较弱;中性绘图分析与ENCplot绘图分析显示其密码子偏好性受自然选择压力更大;最优密码子分析显示3种栗属植物的NAC基因家族共同包含11个最优密码子,例如CAU、UAA、GUU等;与模式植物比较密码子使用频率发现拟南芥、烟草、番茄均为3种栗属植物合适的外源受体。【结论】本研究探索栗属植物NAC基因家族成员的进化关系、选择压力、密码子偏好性等,为今后通过分子生物学手段提高栗属植物NAC基因表达效率奠定理论基础。 展开更多
关键词 栗属植物 nac基因家族 选择压力 密码子偏好性
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沉默NAC-1基因对人卵巢癌耐药细胞株SKOV3/DDP裸鼠移植瘤化疗敏感的影响 被引量:1
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作者 李冬冬 王莉 +2 位作者 钟洁 凌晨祁 韩英 《现代妇产科进展》 2024年第2期81-86,共6页
目的:探讨核转录因子NAC-1基因沉默对人卵巢癌耐药细胞株SKOV3/DDP裸鼠移植瘤化疗敏感性的影响。方法:采用LV4-LUC-GFP慢病毒转染建立NAC-1基因沉默SKOV3/DDP细胞株,将细胞接种到免疫缺陷小鼠皮下,建立人卵巢癌耐药细胞株SKOV3/DDP裸鼠... 目的:探讨核转录因子NAC-1基因沉默对人卵巢癌耐药细胞株SKOV3/DDP裸鼠移植瘤化疗敏感性的影响。方法:采用LV4-LUC-GFP慢病毒转染建立NAC-1基因沉默SKOV3/DDP细胞株,将细胞接种到免疫缺陷小鼠皮下,建立人卵巢癌耐药细胞株SKOV3/DDP裸鼠移植瘤模型,给予顺铂化疗,比较NAC-1基因沉默对SKOV3/DDP在裸鼠体内增殖的影响。取肿瘤组织进行转录组测序,利用Illumina平台进行转录组mRNA测序,筛选差异表达基因,并进行GO和KEGG功能注释和富集分析,揭示NAC-1基因影响移植瘤化疗敏感的可能分子机制。使用STRING数据库构建DEGs编码蛋白互作网络,筛选MCC算法、Degree算法、Closeness算法3种算法共有基因作为关键基因,使用Metascape网站在线分析这些共同基因的基因功能。结果:与对照组相比,抑制NAC-1基因后裸鼠皮下肿瘤体积变小,重量减轻,差异有统计学意义(P<0.05)。转录组学分析显示,抑制NAC-1基因导致肿瘤组织中460个基因显著下调,568个基因显著上调。差异基因(DEGs)在多项GO富集类别中具有显著差异,如细胞代谢、有丝分裂、坏死、炎症、信号传递等。KEGG功能富集结果显示,NAC-1基因沉默可能影响了细胞因子-细胞因子受体相互作用、白细胞跨内皮迁移、神经活性配体-受体相互作用、细胞黏附分子、坏死、ECM受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、NF-κB信号通路等。筛选获得的关键基因主要富集在白细胞介素的信号传导、粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)通路、炎症反应等通路。结论:抑制NAC-1基因能提高人卵巢癌耐药细胞株SKOV3/DDP化疗敏感性,其可能通过多个信号通路影响肿瘤细胞的代谢、增殖、死亡、炎症反应等。 展开更多
关键词 nac-1 卵巢癌细胞 顺铂耐药 转录组分析
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TaNAC069转基因抗叶锈病小麦种质的创制与分析
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作者 秦臻 崔钟池 +3 位作者 耿怀民 刘长山 王海燕 刘大群 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期10-16,共7页
转录因子是植物中重要的一类抗病相关蛋白,其中NAC(NAM、ATAF1/2和CUC)类转录因子在植物应对生物胁迫和非生物胁迫方面起着重要作用。本研究前期获得了1个小麦(Triticum aestivum L.)NAC类转录因子TaNAC069,并初步证明其参与小麦抗叶锈... 转录因子是植物中重要的一类抗病相关蛋白,其中NAC(NAM、ATAF1/2和CUC)类转录因子在植物应对生物胁迫和非生物胁迫方面起着重要作用。本研究前期获得了1个小麦(Triticum aestivum L.)NAC类转录因子TaNAC069,并初步证明其参与小麦抗叶锈病防御反应。本研究将TaNAC069基因构建到过表达载体pLGY-02中,利用农杆菌(Agrobacterium)介导的遗传转化法将pLGY-02-TaNAC069重组载体导入小麦感叶锈病农家品种‘JW’中,获得11个TaNAC069转基因T0株系。对T_(1)~T_(4)代植株进行PCR检测,明确TaNAC069已转入11个小麦株系中,并能稳定遗传;实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qPCR)检测明确T1代11个转基因株系中TaNAC069基因的表达量显著高于受体材料‘JW’;对TaNAC069转基因小麦进行叶锈病抗性鉴定,TaNAC069转基因小麦叶锈病的发病程度比‘JW’轻,孢子量较少,表明TaNAC069基因过表达提高了转基因小麦对叶锈病的抗性。本研究明确了TaNAC069基因在小麦防御叶锈病过程中起正向调控作用,为解析TaNAC069的抗叶锈病机制奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 叶锈菌 nac转录因子 转基因 抗病性
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植物NAC转录因子的研究进展
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作者 刘惠玲 江炳玉 +2 位作者 张静 王琴 张莉 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期742-753,共12页
NAC转录因子家族是大型植物特异性转录因子家族之一,广泛参与植物侧根生长、次生壁形成、叶片衰老、花器官形成、果实发育等生长发育过程,并响应干旱、寒冷、盐碱以及病原菌入侵等逆境胁迫,极大地帮助了植物在各种环境中更好的生存。综... NAC转录因子家族是大型植物特异性转录因子家族之一,广泛参与植物侧根生长、次生壁形成、叶片衰老、花器官形成、果实发育等生长发育过程,并响应干旱、寒冷、盐碱以及病原菌入侵等逆境胁迫,极大地帮助了植物在各种环境中更好的生存。综述了近年来植物NAC转录因子家族结构和功能的研究进展,以期促进对NAC转录因子调控网络的理解和更深入的研究。 展开更多
关键词 nac转录因子 生长发育 胁迫反应
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NAC6转录因子在芒果果实采后类胡萝卜素代谢过程中的表达及影响
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作者 梁敏华 梁瑞进 +1 位作者 杨震峰 邓鸿铃 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第16期77-87,共11页
NAC转录因子在植物生长发育过程中具有重要调节作用。为了探明NAC6转录因子对芒果果实采后类胡萝卜素代谢的影响作用,选取‘台农’和‘金煌’2个品种芒果商业成熟时期果实作为实验材料,在恒温(20℃)、恒湿(相对湿度85%)、避光环境进行... NAC转录因子在植物生长发育过程中具有重要调节作用。为了探明NAC6转录因子对芒果果实采后类胡萝卜素代谢的影响作用,选取‘台农’和‘金煌’2个品种芒果商业成熟时期果实作为实验材料,在恒温(20℃)、恒湿(相对湿度85%)、避光环境进行贮藏处理,并测定果皮、果肉中类胡萝卜素组分含量变化、NAC6转录因子及类胡萝卜素代谢关键酶基因表达。结果表明:2个品种芒果果实均含有α-胡萝卜素、叶黄素、β-胡萝卜素、β-隐黄素和玉米黄素;在整个贮藏过程中,NAC6转录因子在2个品种芒果果实中的表达均呈持续上升的趋势,在贮藏后期达到极大值,随后略有下降;相关性分析表明,NAC6转录因子可能诱导了芒果果实中1-脱氧-木酮糖-5-磷酸异构酶、法尼基焦磷酸合成酶、牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶、八氢番茄红素合成酶、八氢番茄红素脱氢酶、ζ-胡萝卜素脱氢酶、类胡萝卜素异构酶、β-胡萝卜素羟化酶及紫黄素脱环氧化酶基因的表达,抑制了番茄红素β-环化酶、新黄素合成酶及9-顺式环氧类胡萝卜素双加氧酶基因的表达;NAC6转录因子在‘台农’芒果果皮、果肉中的表达与类胡萝卜素裂解双加氧酶基因(carotenoid cleavage dioxygenase,CCD)的表达呈显著负相关,相关系数分别为-0.8410、-0.8383,NAC6转录因子可能通过抑制CCD的表达,从而延缓果实类胡萝卜素的降解速率。本研究结果能为芒果果实采后贮藏保鲜及品质调控技术提供依据。 展开更多
关键词 芒果 nac6转录因子 类胡萝卜素代谢
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矮牵牛花瓣衰老和逆境胁迫响应相关NAC基因的鉴定与分析
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作者 杨应杰 张付昆 +5 位作者 穆静怡 付鲁峰 陈倬 李华 关夏玉 吕培涛 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期700-710,共11页
【目的】NAC(NAM, ATAF and CUC)参与植物生长发育和多种逆境胁迫响应过程的调控。本文旨在鉴定和研究对矮牵牛生长发育和逆境胁迫响应的关键NAC成员,为优质抗逆矮牵牛育种提供基因资源。【方法】以腋生矮牵牛(Petunia axillaris)基因... 【目的】NAC(NAM, ATAF and CUC)参与植物生长发育和多种逆境胁迫响应过程的调控。本文旨在鉴定和研究对矮牵牛生长发育和逆境胁迫响应的关键NAC成员,为优质抗逆矮牵牛育种提供基因资源。【方法】以腋生矮牵牛(Petunia axillaris)基因组为参考基因组,利用矮牵牛花器官衰老过程、烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)侵染、低磷、低温、NaCl、铜离子和干旱胁迫处理后的转录组数据,分析矮牵牛NAC基因(PaNACs)差异表达情况,并对差异表达PaNACs的启动子顺式作用元件及转录因子结合位点进行分析。利用实时荧光定量PCR验证了部分差异表达PaNACs在矮牵牛花衰老过程中的表达情况,并预测了差异表达PaNACs编码蛋白的潜在靶基因。【结果】鉴定的131个PaNAC基因中,59个(45.04%)被鉴定为花器官衰老和逆境胁迫响应过程中的差异表达基因。PaNAC72、 PaNAC22、 PaNAC29、 PaNAC40、 PaNAC2、 PaNAC90、 PaNAC83、 PaNAC56、 PaNAC36和PaNAC35在至少3个生物学过程响应中差异表达显著,其中拟南芥衰老关键基因AtNAP的直系同源基因PaNAC29在花器官衰老过程和低温、低磷、铜离子胁迫逆境处理中显著上调表达;PaNAC72在除受铜离子胁迫外的所有6种处理中表达差异显著;PaNAC22在花器官衰老过程和低温和低磷胁迫中上调表达,在铜离子和干旱逆境下调表达。启动子分析结果显示这10个PaNAC启动子区域存在多种逆境胁迫响应相关元件,且大量响应衰老和逆境胁迫的差异表达基因的启动子区域存在NAC的结合位点。【结论】PaNACs广泛参与矮牵牛生长发育及逆境胁迫响应,其中PaNAC29可能是花衰老关键的正调控因子,PaNAC72广泛响应多种逆境胁迫。 展开更多
关键词 矮牵牛 nac 转录组 衰老 胁迫 生物信息学
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茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9鉴定及其对非生物胁迫的响应 被引量:1
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作者 孔洁玙 杨妮 +3 位作者 罗微 胡志航 王雅慧 庄静 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期572-581,共10页
【目的】鉴定茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9,并分析它们在干旱、盐、高温、低温、外施ABA和外施GA3胁迫下的表达模式,为进一步解析CsNAC79和CsNAC9转录因子的生物学功能提供参考。【方法】以茶树‘龙井43’为材料,用RT-PCR扩增NA... 【目的】鉴定茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9,并分析它们在干旱、盐、高温、低温、外施ABA和外施GA3胁迫下的表达模式,为进一步解析CsNAC79和CsNAC9转录因子的生物学功能提供参考。【方法】以茶树‘龙井43’为材料,用RT-PCR扩增NAC转录因子家族基因CsNAC79和CsNAC9,并进行生物信息学分析;用qRT-PCR检测CsNAC79和CsNAC9在茶树6种非生物胁迫下的相对表达量。【结果】(1)CsNAC79和CsNAC9分别编码409个和282个氨基酸,且分别在15—150氨基酸位点、11—134氨基酸位点含有NAC家族成员典型的NAM保守结构域。(2)CsNAC79蛋白与中华猕猴桃、柿、洋蓟亲缘关系较近,CsNAC9蛋白与桃、荔枝、榴莲亲缘关系较近;2个NAC转录因子均是亲水性蛋白,皆不含信号肽和跨膜结构;CsNAC79和CsNAC9的启动子区域都含有非生物胁迫响应元件;蛋白质空间结构分析显示,CsNAC79和CsNAC9蛋白主要是由不规则卷曲和α-螺旋组成。(3)表达分析表明:CsNAC79和CsNAC9基因在6种不同非生物胁迫下均上调表达。【结论】茶树CsNAC79和CsNAC9基因响应多种非生物胁迫。 展开更多
关键词 茶树 nac转录因子 ABA GA_(3) 非生物胁迫 表达分析
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NAC转录因子在水稻遗传改良中的研究进展
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作者 彭波 邱静 +7 位作者 彭静 张志国 刘岩 黄雅琴 汪全秀 赵金会 周伟 孙艳芳 《信阳师范学院学报(自然科学版)》 CAS 2024年第4期540-550,共11页
NAC转录因子是植物最大的特异性转录因子,具有特殊的NAC结构域和C端结构域,它们在调节水稻生长发育过程中发挥着重要的作用。目前在水稻中已鉴定到多种NAC转录因子,发现它们广泛参与调控水稻的产量及其品质性状,在水稻的遗传改良中具有... NAC转录因子是植物最大的特异性转录因子,具有特殊的NAC结构域和C端结构域,它们在调节水稻生长发育过程中发挥着重要的作用。目前在水稻中已鉴定到多种NAC转录因子,发现它们广泛参与调控水稻的产量及其品质性状,在水稻的遗传改良中具有重要功能。综述了NAC转录因子的分类与定位、调控水稻产量和稻米品质以及参与水稻非生物胁迫应答反应等新进展,以期为优质高产多抗水稻新品种的分子设计育种提供新的基因资源。 展开更多
关键词 水稻 nac转录因子 产量 品质 非生物胁迫
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香樟NAC基因家族的全基因组鉴定及盐胁迫下的表达分析
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作者 曾伟伟 李一凡 +3 位作者 朱渊铭 林宇清 陈丝雨 邹双全 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第7期1393-1408,共16页
[目的]探究NAC基因在香樟(Cinnamomum camphora)生长发育及其在盐胁迫下发挥的重要作用,为进一步阐明香樟在盐胁迫下的响应机理奠定基础。[方法]对香樟全基因组NAC基因进行鉴定和生物信息学分析,探究香樟非生物胁迫的响应模式。通过对香... [目的]探究NAC基因在香樟(Cinnamomum camphora)生长发育及其在盐胁迫下发挥的重要作用,为进一步阐明香樟在盐胁迫下的响应机理奠定基础。[方法]对香樟全基因组NAC基因进行鉴定和生物信息学分析,探究香樟非生物胁迫的响应模式。通过对香樟NAC家族成员进行鉴定,并从理化性质、系统进化分析、保守基序、基因结构、染色体定位、物种间共线性、顺式作用元件预测和表达模式等方面进行系统分析。[结果]共鉴定出103个香樟NAC基因,氨基酸数量介于137~1136个,等电点在4.54~10.00,相对分子质量在15644.40~129859.29 u,平均疏水性全部为负值,均为亲水蛋白,亚细胞定位预测定位在细胞核和细胞质中;通过与拟南芥(Arabidopsis thaliana)NAC基因序列构建系统发育进化树发现,香樟NAC基因被划分为16个亚家族,其中NAM亚家族成员最多,有17个香樟NAC基因,还有25个香樟NAC基因未参与分组;保守基序和基因结构分析发现,香樟NAC基因包含有2~8个内含子和10个motif,其中motif3在香樟基因遗传进化中趋于稳定,motif9和motif10多数分布在NAM亚家族中;染色体定位和复制事件分析发现,103个NAC基因分布在12条染色体中,基因分布最多的是Chr02号染色体(13个CcNAC基因),最少的是Chr10和Chr11(各2个基因),片段复制为香樟NAC家族的主要扩增方式;多物种共线分析发现,香樟与牛樟(Cinnamomum kanehirae)NAC基因形成162对共线基因,多于其它物种,说明香樟NAC基因与牛樟之间的同源进化关系比其他物种更密切;香樟NAC基因启动子中含有多个非生物胁迫、生长发育和激素类响应元件;qRT-PCR结果表明,在叶中,CcNAC058和CcNAC092基因的表达水平在低盐胁迫下达到最大。在根中,CcNAC007、CcNAC033、CcNAC058和CcNAC092基因的表达随着盐浓度的增加而增加。[结论]NAC基因家族在香樟的生长发育进程中可能参与盐胁迫响应过程,在盐胁迫下CcNAC092、CcNAC058基因在叶片、根部均具有明显的响应,推测CcNAC058、CcNAC092是促使香樟在盐胁迫下能产生自我防御行为的关键基因。 展开更多
关键词 香樟 nac基因家族 盐胁迫 全基因组分析
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蓖麻RcNAC91基因的克隆及表达特性研究
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作者 朱贵爽 李艳肖 +1 位作者 李志刚 向殿军 《种子》 北大核心 2024年第8期27-35,共9页
为探明NAC家族基因在蓖麻中抗非生物胁迫应答过程的作用,本研究通过RT-PCR技术从蓖麻的盐胁迫转录组数据中克隆了1个上调表达的RcNAC91基因(GenBank No.OR756194),并对其进行生物信息学分析,运用RT-qPCR技术检测其组织表达特性及对逆境... 为探明NAC家族基因在蓖麻中抗非生物胁迫应答过程的作用,本研究通过RT-PCR技术从蓖麻的盐胁迫转录组数据中克隆了1个上调表达的RcNAC91基因(GenBank No.OR756194),并对其进行生物信息学分析,运用RT-qPCR技术检测其组织表达特性及对逆境胁迫的响应情况。结果表明,RcNAC91基因位于1号染色体,该基因cDNA序列全长1911 bp,包含编码区1755 bp,共推导284个氨基酸,有1个跨膜域的亲水性蛋白质。亚细胞定位显示RcNAC91蛋白质定位在细胞核中。进化树结果显示,RcNAC91与水银草NAC蛋白亲缘关系最近。RcNAC91启动子区域中有多个逆境响应和激素诱导类元件。RT-qPCR结果显示,RcNAC91基因在子叶中的表达值最高,且该基因的表达受到干旱、盐、低温和脱落酸胁迫的激活,说明RcNAC91基因可积极参与蓖麻的非生物胁迫响应。 展开更多
关键词 nac基因家族 蓖麻 基因克隆 非生物胁迫
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NAC转录因子:参与植物诸多生命过程的调控因子
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作者 张兆冉 王利娜 +1 位作者 朱博艺 李朝炜 《安徽农业科学》 CAS 2024年第15期22-29,共8页
NAC(NAM、ATAF1/2、CUC2)转录因子家族是植物中最大的蛋白家族之一,在多种植物中均发现其家族成员。NAC转录因子(NAC transcription factors,NAC TFs)一般由保守的N端特殊的DNA结合域以及多样的C端调控结构域组成,其数量十分庞大且功能... NAC(NAM、ATAF1/2、CUC2)转录因子家族是植物中最大的蛋白家族之一,在多种植物中均发现其家族成员。NAC转录因子(NAC transcription factors,NAC TFs)一般由保守的N端特殊的DNA结合域以及多样的C端调控结构域组成,其数量十分庞大且功能多种多样,主要通过调控靶基因的表达水平参与调控诸多生命过程,进而调控植物的次生代谢产物合成、生长发育和应激反应,探究其生物学功能及分子调控机制,对改良植物农艺性状具有重要意义。系统综述了NAC TFs的研究现状、结构特点、作用模式和进化历程,及其对植物生命活动的调控包括次生生长、生物合成、生物/非生物胁迫响应、器官衰老等,旨在为改良植物农艺性状提供理论基础。 展开更多
关键词 nac 功能 生长 胁迫 激素响应
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The NAC transcription factor LuNAC61 negatively regulates fiber development in flax (Linum usitatissimum L.)
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作者 Dongwei Xie Jing Li +5 位作者 Wan Li Lijun Sun Zhigang Dai Wenzhi Zhou Jianguang Su Jian Sun 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2024年第3期795-805,共11页
Flax is a crucial fiber crop that exhibits excellent textile properties and serves as a model plant for investigating phloem fiber development. The regulation of multiple genes significantly influences fiber developme... Flax is a crucial fiber crop that exhibits excellent textile properties and serves as a model plant for investigating phloem fiber development. The regulation of multiple genes significantly influences fiber development, notably involving NAC(NAM, ATAF1/2, CUC2) transcription factors in forming the fiber secondary cell wall(SCW).Overexpression of LuNAC61 in flax resulted in sparse top meristematic zone leaves and significantly reduced stem cellulose content. Scanning electron microscopy and staining observations revealed a significant reduction in fiber bundles. β-Glucuronidase(GUS) staining analysis demonstrated high activity of the LuNAC61 promoter in the bast fibers of the flax stem. Additionally, several members of the LuPLATZ and LuCesA families exhibited significant coexpression with LuNAC61. Subcellular localization indicated the presence of LuPLATZ24 protein in the nucleus and cytoplasm, LuNAC61 protein exclusively in the nucleus, and LuCesA10 in the nucleus and endoplasmic reticulum. LuPLATZ24 positively regulates LuNAC61, whereas LuNAC61 negatively affects LuCesA10, suggesting the involvement of a metabolic network in regulating flax fiber development. In conclusion, this study provides a critical opportunity for a comprehensive and in-depth analysis of the mechanisms governing flax fiber development and the potential use of biotechnology to enhance flax fiber yield. 展开更多
关键词 FLAX fiber development Lu nac61 gene function gene interaction
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A novel semi-dominant allele of the transmembrane NAC transcription factor ZmNTL2 reduces the size of multiple maize organs
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作者 Chuan Li Yun Bai +9 位作者 Yuwei Hou Siyu Wang Yue Xin Tao Yu Jing Wang Xiaowei Liu Hongyang Yi Chao Xia Hai Lan Moju Cao 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2024年第3期676-687,共12页
Maize plant architecture influences planting density and,in turn,grain yield.Most of the plant architecture-related traits can be described as organ size.We describe a miniature maize mutant,Tiny plant 4(Tip4),which e... Maize plant architecture influences planting density and,in turn,grain yield.Most of the plant architecture-related traits can be described as organ size.We describe a miniature maize mutant,Tiny plant 4(Tip4),which exhibits reduced size of multiple organs and exhibits a semi-dominant monofactorial inheritance characteristic.Positional cloning confirmed that a 4-bp deletion in the NAC TF with transmembrane motif 1-Like(NTL)gene ZmNTL2,denoted as ZmNTL2^(Δ),confers the Tip4 mutation.qRT-PCR showed that ZmNTL2 was expressed in all tested tissues.ZmNTL2 functions as a transcriptional activator and is located in both the nucleus and biomembranes.The mutation does not affect the mRNA abundance of ZmNTL2 locus,but it does result in the loss of transmembrane domain and confines the ZmNTL2^(Δ)protein to the nucleus.Knocking out ZmNTL2 has no effect on maize organ size development,indicating that the 4-bp deletion might be a gain-of-function mutation in organ size regulation.Combining transcriptome sequencing with cytokinin and auxin content determination suggests that the decreased organ size may be possibly mediated by changes in hormone homeostasis. 展开更多
关键词 Organ size c-ray mutagenesis Membrane-bound nac TF Hormone homeostasis MAIZE
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