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辣椒NRT基因家族的系统鉴定、进化与表达分析
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作者 牛佳斌 唐凯 +4 位作者 夏迎萌 刘同坤 孙小川 段伟科 黄志楠 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期653-664,共12页
[目的]本研究旨在鉴定辣椒硝酸盐转运蛋白(NRT)基因家族成员,分析其基本性质、染色体定位、进化关系以及在不同组织、不同果实发育阶段和不同非生物胁迫下的表达特征。[方法]利用生物信息学方法在辣椒‘遵辣1号’基因组中鉴定NRT基因家... [目的]本研究旨在鉴定辣椒硝酸盐转运蛋白(NRT)基因家族成员,分析其基本性质、染色体定位、进化关系以及在不同组织、不同果实发育阶段和不同非生物胁迫下的表达特征。[方法]利用生物信息学方法在辣椒‘遵辣1号’基因组中鉴定NRT基因家族并分析其理化性质、基因结构、染色体定位、共线性、顺式作用元件分布和进化关系等;利用转录组数据分析辣椒NRT(CaNRT)基因在不同组织和不同果实发育阶段中的表达特征,并利用RT-qPCR技术分析在不同非生物胁迫下的表达模式。[结果]辣椒中共包含73个CaNRT基因,不均匀分布在10条染色体上。系统进化分析表明,CaNRT基因可分为3个亚家族,同一亚家族具有相似基因结构和保守基序。顺式作用元件分析结果表明CaNRT可能受光、激素、逆境胁迫等多种因素调控。CaNRT1亚家族成员主要在根、茎、叶中表达量较高,CaNRT2亚家族在任何时期表达量都较低,CaNRT3亚家族存在组织表达差异性,主要在根中高表达。逆境胁迫数据表明,CaNRT1.18、CaNRT3.3、CaNRT3.1、CaNRT2.1、CaNRT1.23在低温、高温、干旱、盐和氧化处理下明显响应,所有CaNRT基因在低温处理时均有不同程度的正向响应。[结论]在辣椒基因组中共鉴定获得73个CaNRT基因,筛选出多个在辣椒生长发育和逆境胁迫中具有重要作用的关键基因。 展开更多
关键词 辣椒 硝酸盐转运蛋白(nrt) 系统进化 表达分析 非生物胁迫
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NRT炉冶炼电子废物及多金属工业固废生产实践
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作者 谢华有 《有色冶金设计与研究》 2024年第2期38-42,共5页
针对国内某企业自主研发的NRT炉协同冶炼电子废物及多金属工业固废工艺,分析了生产工艺运行过程中遇到的问题,并逐一提出了解决措施:根据入炉原料成分复杂的特点,通过原料预处理和定量入炉技术,保证了工艺渣型以及反应过程中的热平衡控... 针对国内某企业自主研发的NRT炉协同冶炼电子废物及多金属工业固废工艺,分析了生产工艺运行过程中遇到的问题,并逐一提出了解决措施:根据入炉原料成分复杂的特点,通过原料预处理和定量入炉技术,保证了工艺渣型以及反应过程中的热平衡控制。通过采用“强化火法冶炼—分层二次燃烧—烟气余热回收—高效烟气处理”的技术路线,实现了尾排烟气达标排放。通过增设二次风调低负压、增加氧浓等措施。解决了烟灰自燃和喷枪寿命短的问题。通过研究磁性铁对渣含铜的影响规律,得到渣含铜随着磁性铁含量增大而增大的结论。将磁性铁质量分数控制在1%及以下时,可获得渣中铜质量分数≤0.8%。 展开更多
关键词 电子废物 nrt 预处理 烟气处理 渣含铜
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大豆盐胁迫响应NRT基因的鉴定及GmNRT1.5A的克隆和表达分析
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作者 王玉斌 张志贤 +4 位作者 张辰淼 刘薇 张彦威 张礼凤 徐冉 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期674-682,共9页
硝酸盐转运蛋白(Nitrate Transporters, NRTs)在植物根系NO-3吸收或转运中发挥重要作用,为探究大豆NRTs基因在盐胁迫响应中的功能,本研究从前期盐胁迫处理的转录组数据中鉴定出8个持续响应盐胁迫的差异表达GmNRTs基因。这些GmNRTs基因... 硝酸盐转运蛋白(Nitrate Transporters, NRTs)在植物根系NO-3吸收或转运中发挥重要作用,为探究大豆NRTs基因在盐胁迫响应中的功能,本研究从前期盐胁迫处理的转录组数据中鉴定出8个持续响应盐胁迫的差异表达GmNRTs基因。这些GmNRTs基因的启动子上均含有多个与逆境胁迫或植物激素应答相关的元件,推测它们可能与大豆非生物胁迫应答或植物激素调控盐胁迫响应相关。同时,从齐黄34根系中克隆了盐胁迫处理上调倍数最大的基因GmNRT1.5A,并对其进行了生物信息学和表达分析。结果显示:GmNRT1.5A的蛋白质编码区全长为1 794 bp,编码597个氨基酸,蛋白分子质量为66.78 kD,理论等电点为5.85。进化树分析结果表明,GmNRT1.5A与AtNRT1.5同源性最高,含有12个跨膜结构域,含有典型的NRT1s保守结构域,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。实时荧光定量PCR分析表明,GmNRT1.5A主要在籽粒和根系中表达,盐胁迫和干旱胁迫显著诱导根系中GmNRT1.5A的表达。此外,GmNRT1.5A的表达受植物激素的调控,ABA和ACC显著诱导其表达,但GA3处理显著抑制GmNRT1.5A表达。本研究表明,GmNRT1.5在响应盐胁迫逆境中发挥重要作用,为探索GmNRTs基因在响应逆境胁迫中的功能提供了新思路,也为深入研究GmNRT1.5基因的功能提供了基础。 展开更多
关键词 大豆 盐胁迫 nrts Gmnrt1.5A 表达分析
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不同氮利用效率小麦品种TaNRT/TaNPF家族基因表达特点 被引量:3
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作者 王露露 仪子博 +4 位作者 王浩哲 能芙蓉 马新明 张志勇 王小纯 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2966-2977,共12页
氮素是小麦生长发育的必需元素之一,NO_(3)^(-)-N是小麦从土壤中获取氮的主要形式。NRT/NPF家族基因编码膜转运蛋白,主要参与植物NO_(3)^(-)-N吸收、运输及分配。为了解小麦NRT/NPF家族基因与氮素利用的关系,选用氮高效小麦品种周麦27(Z... 氮素是小麦生长发育的必需元素之一,NO_(3)^(-)-N是小麦从土壤中获取氮的主要形式。NRT/NPF家族基因编码膜转运蛋白,主要参与植物NO_(3)^(-)-N吸收、运输及分配。为了解小麦NRT/NPF家族基因与氮素利用的关系,选用氮高效小麦品种周麦27(ZM27)和氮低效品种矮抗58(AK58),利用二代测序技术,研究了不同氮水平(N120、N225、N330)开花期TaNRT/TaNPF家族基因在旗叶中的表达特点。结果表明,二代测序鉴定到386个TaNRT/TaNPF家族基因;与AK58相比,ZM27在氮减量(N120)、正常(N225)、过量(N330)条件下差异表达基因分别为27、16和23个,上调表达基因分别为16(59.26%)、12(75%)和19(82.61%)个;减氮条件下ZM27有7个特异下调表达基因,氮过量条件下TaNPF8.1表达量最高,且显著上调1.5倍。可见,TaNRT/TaNPF家族基因表达水平受施氮量及品种调控。利用小麦网络数据库分析发现TaNRT/TaNPF家族基因表达具有组织特异性及染色体偏好性,旗叶表达量最高的TaNPF8.1定位于3A染色体,根系特异表达的TaNRT2.2和TaNRT3.1主要分布于6号染色体,茎秆特异表达的TaNPF4.5主要分布在2号染色体。qRT-PCR分析显示TaNRT/TaNPF基因表达特点与二代转录组及网络数据结果一致。TaNPF8.1、TaNPF4.5和TaNRT3.1蛋白互作分析发现,NO_(3)^(-)-N转运可能还需要转录因子MYB、叶绿素A-B结合蛋白、伴侣蛋白等协同参与,为进一步研究TaNRT/TaNPF家族表达与氮素吸收利用的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 nrt/NPF 氮效率 差异表达 组织特异性
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基于PCR-HRM的水稻氮高效基因NRT1.1B功能标记开发及应用
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作者 房文文 王海凤 +4 位作者 郭涛 薛芳 姜艳芳 张焕霞 张士永 《山东农业科学》 北大核心 2023年第8期21-26,共6页
水稻对氮肥的高效与合理利用是发展绿色农业的重要保障。培育含有氮高效基因的水稻品种,是提高氮肥利用率最经济有效的途径。本研究开发了一个用于HRM(高分辨率熔解曲线)高通量检测硝酸盐转运蛋白基因NRT1.1B的分子功能标记。利用此标记... 水稻对氮肥的高效与合理利用是发展绿色农业的重要保障。培育含有氮高效基因的水稻品种,是提高氮肥利用率最经济有效的途径。本研究开发了一个用于HRM(高分辨率熔解曲线)高通量检测硝酸盐转运蛋白基因NRT1.1B的分子功能标记。利用此标记对78份山东地方水稻品种进行NRT1.1B基因分型,发现有13个水稻品种为含有NRT1.1B的高效单倍型,表明NRT1.1B在山东省水稻品种中分布较少。利用测序分析验证,测序结果与本标记分型结果一致。可见,本研究开发的功能标记能够快速准确鉴定出NRT1.1B基因型,可为筛选和培育氮高效水稻新品种提供有力的技术支撑。 展开更多
关键词 水稻 高分辨率熔解曲线(HRM) 氮高效基因nrt1.1B 分子功能标记
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NRT FILES镍钛根管锉预备对弯曲根管应力分布的仿真分析 被引量:1
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作者 蒋谊芳 蔡绮敏 +3 位作者 初政一 秦敏 申煜荣 顾远平 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2023年第7期1038-1042,共5页
背景:在根管治疗中,镍钛合金器械常因应力超过金属塑性变形的弹性极限或在根管弯曲处重复弯曲导致镍钛合金疲劳断裂。目的:探索新型镍钛锉NRT FILES在作为根管预备材料时对根管内壁存在的应力分布,明确应力集中区域。方法:利用Solidwork... 背景:在根管治疗中,镍钛合金器械常因应力超过金属塑性变形的弹性极限或在根管弯曲处重复弯曲导致镍钛合金疲劳断裂。目的:探索新型镍钛锉NRT FILES在作为根管预备材料时对根管内壁存在的应力分布,明确应力集中区域。方法:利用Solidworks软件对NRT FILES进行三维建模,模拟还原器械在真实口腔环境中存在的状态。建立6组根管简化模型:①弯曲角度30°、弯曲半径5 mm、根尖弯曲;②弯曲角度30°、弯曲半径5 mm、根中弯曲;③弯曲角度30°、弯曲半径2 mm、根尖弯曲;④弯曲角度30°、弯曲半径2 mm、根中弯曲;⑤弯曲角度45°、弯曲半径5 mm、根尖弯曲;⑥弯曲角度45°、弯曲半径2 mm、根尖弯曲。将根管简化模型与根管锉模型进行组配,对根管内壁受力点及应力分布情况进行分析。结果与结论:①-⑥组根管锉最大应力分别为1 185,1 354,1 371,1 678,1 335,2 557 MPa,最大应变分别为0.010 36,0.013 54,0.013 79,0.016 48,0.013 45,0.022 03;根管弯曲部位的不同会影响根管锉所承受的应力大小,因此在根管治疗中,根管锉沿着根管越往下,根管锉与根管接触的半径越大、刚性越差,根管锉所承受的应力越大越容易发生断裂;根管弯曲半径越小,根管锉承受的应力越大;根管弯曲角度越小,根管锉所承受的应力越大。在根尖弯曲部位,根管锉在根管弯曲半径小的弯曲根管需要承受更大的应力,根管锉更容易发生断裂;同理,在根中弯曲部位,根管锉在根管弯曲半径小的弯曲根管亦承受更大的应力,因此要格外注意根管的弯曲程度,以此来选择合适的根管锉进行根管治疗。 展开更多
关键词 弯曲根管 nrt FILES镍钛锉 根管预备 应力分布 有限元分析
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水稻硝酸盐转运蛋白基因OsTNrt2.1的编码蛋白特征和表达 被引量:11
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作者 徐海荣 谷俊涛 +3 位作者 路文静 邓若磊 曹云飞 肖凯 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期723-730,共8页
根据Nipponbare的OsNrt2.1cDNA序列,从氮效率较高的水稻品种TP309中克隆了与OsNrt2.1高度同源的硝酸盐转运蛋白(NRT)基因OsTNrt2.1。其开放阅读框为1 602 bp,编码533个氨基酸残基。OsTNrt2.1具有NRT共有的结构特征,与拟南芥、玉米、小... 根据Nipponbare的OsNrt2.1cDNA序列,从氮效率较高的水稻品种TP309中克隆了与OsNrt2.1高度同源的硝酸盐转运蛋白(NRT)基因OsTNrt2.1。其开放阅读框为1 602 bp,编码533个氨基酸残基。OsTNrt2.1具有NRT共有的结构特征,与拟南芥、玉米、小麦、大麦和烟草的NRT基因高度同源。OsTNrt2.1的表达表现器官特异性,在根中高于在叶中。此外,OsTNrt2.1的表达受NH+4的抑制和NO-3的诱导,并具典型的昼夜节律特征。在不同NO-3浓度下,OsTNrt2.1的表达水平相近,表明OsTNrt2.1可能是具有双亲和特征的NRT基因。在不同氮源及不同介质氮浓度条件下,OsTNrt2.1在根中的表达均高于在叶中,表明OsTNrt2.1对于根系吸收NO-3可能具有重要作用。 展开更多
关键词 水稻(Oryza sativa) nrt基因 OsTnrt2.1 基因特征 基因表达
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花生高亲和硝酸盐转运蛋白基因AhNRT2.7a响应低氮胁迫的功能研究 被引量:2
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作者 王娟 陈皓宁 +9 位作者 石大川 于天一 闫彩霞 孙全喜 苑翠玲 赵小波 牟艺菲 王奇 李春娟 单世华 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第22期4356-4372,共17页
【目的】氮素在作物生产中对生物量和产量起关键作用。高亲和硝酸盐转运蛋白基因NRT2在植物响应低氮胁迫时被激活并具有维持氮吸收和转运的作用。通过筛选花生低氮耐受相关的NRT2基因并解析其生物学功能,为培育高氮素利用率的花生新品... 【目的】氮素在作物生产中对生物量和产量起关键作用。高亲和硝酸盐转运蛋白基因NRT2在植物响应低氮胁迫时被激活并具有维持氮吸收和转运的作用。通过筛选花生低氮耐受相关的NRT2基因并解析其生物学功能,为培育高氮素利用率的花生新品种提供理论参考,最终有助于实现节氮、高效的绿色生产目标。【方法】检测正常氮浓度及1/20正常氮浓度(15 mmol·L^(-1))条件下5个具有典型跨膜结构的花生NRT2基因(AhNRT2.4、AhNRT2.5b、AhNRT2.5c、AhNRT2.7a和AhNRT2.7b)的时空表达情况。以花育6309的cDNA为模板,对AhNRT2.7a进行克隆和生物信息学分析,并通过亚细胞定位确定AhNRT2.7a的表达部位。进一步构建异源过表达AhNRT2.7a的拟南芥株系,分别在正常以及低氮胁迫条件下测定其叶绿素含量、氮积累量以及谷氨酰胺合成酶(GS)、谷氨酸合成酶(GOGAT)、硝酸还原酶(NR)、亚硝酸还原酶(NiR)、谷氨酸脱氢酶(GDH)5个氮代谢关键酶的活性。【结果】5个NRT2基因中有4个NRT2基因在花生响应低氮胁迫条件下大量表达。其中,AhNRT2.7a能够响应低氮胁迫,并在花生茎和叶中高表达。获得AhNRT2.7a的cDNA序列,全长为1380 bp,编码459个氨基酸。蛋白结构分析显示其为具有12个典型跨膜结构域的膜蛋白。该氨基酸序列与栽培种花生(Arachis hypogaea L.)相似性高达99.56%,其次是野生亲本AA和BB基因组花生。亚细胞定位显示其主要定位于细胞质膜上。构建异源过表达AhNRT2.7a的转基因拟南芥植株,在不同供氮条件下,成熟叶和幼叶叶片的叶绿素相对含量均显著高于野生型拟南芥。同时,对上述5个氮代谢相关酶活性以及氮、磷、钾积累量测定显示,转基因植株中2个氮代谢相关酶(GS和NR)的酶活性以及氮积累量均比野生型拟南芥有显著升高。【结论】花生中4个NRT2基因响应低氮胁迫,其中AhNRT2.7a能够提高植物氮代谢过程的氮素利用率。AhNRT2.7a的表达在促进氮代谢过程的同时,促使碳代谢作用的进一步加强。因此,AhNRT2.7a适合作为花生氮素高效利用为目的的候选基因。 展开更多
关键词 花生 nrt2 Ahnrt2.7a 氮素效率 氮代谢相关酶
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节旋藻硝酸盐转运蛋白基因Amnrt P序列分析
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作者 凌娜 茅云翔 +2 位作者 隋正红 邵林 张学成 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第1期97-103,共7页
应用生物信息学软件对获得的节旋藻硝酸盐转运蛋白基因(AmnrtP)全长序列进行了结构特征、同源性比较、多序列比对、系统发育学分析等。结果表明:该基因全长为1515个核苷酸,编码504个氨基酸,平均 GC 含量为43.8%,疏水氨基酸的比例为47.6... 应用生物信息学软件对获得的节旋藻硝酸盐转运蛋白基因(AmnrtP)全长序列进行了结构特征、同源性比较、多序列比对、系统发育学分析等。结果表明:该基因全长为1515个核苷酸,编码504个氨基酸,平均 GC 含量为43.8%,疏水氨基酸的比例为47.6%。该硝酸盐转运蛋白含有12个跨膜结构域(Transmembrane domains,Tm),膜拓扑结构与NRT2家族的类似,并发现了多个 NRT2家族的保守序列。同源性搜索显示与属于 NRT2基因家族的海洋蓝藻的氨基酸序列相似性为75%~89%。采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)构建了分子系统树,结果表明3种树的拓扑结构基本相似,并且在蓝藻中基于硝酸盐转运蛋白基因的系统发育关系与形态学分类结果相一致。所获 Am-nrtP 基因属于 NRT2基因家族,可成为蓝藻系统进化研究的分子标记,并为了解节旋藻中硝酸盐吸收与转运的基因结构和分子机制奠定了一定的基础。 展开更多
关键词 节旋藻 硝酸盐转运蛋白(nrt) 硝酸盐转运蛋白基因(AmnrtP) 序列分析 系统发育
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甘蓝型油菜NRT1.5和NRT1.8家族基因的生物信息学分析及其对氮-镉胁迫的响应 被引量:10
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作者 梁桂红 华营鹏 +3 位作者 周婷 廖琼 宋海星 张振华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期365-380,共16页
植物对硝酸盐的吸收和转运需要硝酸盐转运体(nitratetransporters,NRTs)的协助。在拟南芥中,硝酸盐的长途转运及其在根部和地上部的分配,主要受NRT1家族的两个成员NRT1.5和NRT1.8的协同调控,且两者的表达均受到硝酸盐的强烈诱导。本文以... 植物对硝酸盐的吸收和转运需要硝酸盐转运体(nitratetransporters,NRTs)的协助。在拟南芥中,硝酸盐的长途转运及其在根部和地上部的分配,主要受NRT1家族的两个成员NRT1.5和NRT1.8的协同调控,且两者的表达均受到硝酸盐的强烈诱导。本文以AtNRT1.5和AtNRT1.8基因序列为基础序列,采用生物信息学方法鉴定了白菜、甘蓝和甘蓝型油菜中NRT1.5和NRT1.8同源基因,并对基因结构和分子特性、基因拷贝数变异、基因染色体分布、系统进化树、蛋白保守序列比对和跨膜结构域、基因响应低氮和镉胁迫的转录组测序以及基因共表达网络进行了分析。结果表明,白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中NRT1.5和NRT1.8蛋白均含有保守的跨膜结构域和保守基序(F-Y-L-A-L-N-LG-S-L),属于MFS (major facilitator superfamily)超家族的小肽转运体PTR (peptide transporter)家族。转录组测序结果表明,甘蓝型油菜低氮处理72 h,根部NRT1.5基因的表达丰度上调而抑制NRT1.8的表达;镉处理条件下,乙烯/茉莉酸-硝酸盐转运体介导的信号途径能够促进NRT1.8表达上调而抑制NRT1.5的表达,从而使更多的硝酸盐从地上部运输到根部,提高植物抗镉胁迫的能力。本研究为进一步了解甘蓝型油菜NRT1.5和NRT1.8家族基因的生物学功能及其对氮-镉胁迫的响应奠定基础,同时为NRT1.5和NRT1.8家族基因在其他物种中的生物信息学研究提供参考。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 生物信息学 nrt1.5 nrt1.8 硝酸盐
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茶树硝态氮转运蛋白NRT1.1基因的克隆及表达分析 被引量:7
11
作者 杨亦扬 胡雲飞 +3 位作者 万青 李荣林 王枫 阮建云 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期505-512,共8页
以茶树(Camellia sinensis(L.))品种龙井43为试材,采用PCR结合RACE技术,克隆得到硝态氮转运蛋白基因(NRT1.1)的c DNA全长序列,基因序列全长1 880 bp,其中开放阅读框(ORF)1 788 bp,编码595个氨基酸,预测蛋白质分子量为65.9 k D,理论等电... 以茶树(Camellia sinensis(L.))品种龙井43为试材,采用PCR结合RACE技术,克隆得到硝态氮转运蛋白基因(NRT1.1)的c DNA全长序列,基因序列全长1 880 bp,其中开放阅读框(ORF)1 788 bp,编码595个氨基酸,预测蛋白质分子量为65.9 k D,理论等电点为8.99,命名为Cs NRT1.1。序列分析表明,Cs NRT1.1与葡萄NRT1.1氨基酸序列的相似性最高。通过生物信息学分析,对Cs NRT1.1的氨基酸理化性质、亲/疏水性、跨膜区域及亚细胞定位进行了预测。实时定量PCR表达分析表明,茶树根和叶片中Cs NRT1.1在1 mol·L^(-1) NO3-处理5 min内均受到抑制,叶部Cs NRT1.1表达量0.5 h后即达到最大值,24 h内各个时间点均高于根部,根中表达量Cs NRT1.1始终低于对照。本研究结果为研究茶树对NO3-的吸收、转运和调控机理提供了分子生物学基础。 展开更多
关键词 茶树 硝态氮 nrt1.1基因 实时定量PCR
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谷子硝酸盐转运蛋白NRT1家族的鉴定及表达分析 被引量:6
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作者 张瑞娟 屈聪玲 +2 位作者 贺榆婷 杨致荣 王兴春 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第4期37-43,76,共8页
[目的]为了揭示谷子硝酸盐高效吸收和利用的分子机制,本文鉴定并分析了谷子硝酸盐转运蛋白NRT1基因家族。[方法]以拟南芥中已知的11个参与硝酸盐吸收和转运的NRT1蛋白为基础,利用Blast的方法在全基因组范围内鉴定谷子参与硝酸盐吸收和... [目的]为了揭示谷子硝酸盐高效吸收和利用的分子机制,本文鉴定并分析了谷子硝酸盐转运蛋白NRT1基因家族。[方法]以拟南芥中已知的11个参与硝酸盐吸收和转运的NRT1蛋白为基础,利用Blast的方法在全基因组范围内鉴定谷子参与硝酸盐吸收和转运的NRT1基因,利用MEGA7.0和MEME构建系统进化树和鉴定保守的基序,并进一步利用PlantCARE预测顺式作用元件,最后通过RT-PCR的方法研究了谷子硝酸盐转运蛋白NRT1家族基因的组织表达情况。[结果]从谷子中鉴定了8个硝酸盐转运蛋白NRT1基因,系统进化分析表明所得8个NRT1基因分别属于NPF1、NPF2、NPF4、NPF6和NPF7亚家族。谷子NRT1蛋白中都含有一个保守的QX4GX8GX3FX5P基序,可能与硝酸盐的吸收和转运相关。谷子NRT1基因的启动子中富含光响应元件,尤其是SP1元件。RT-PCR分析表明谷子8个NRT1基因表达具有组织特异性,暗示了其可能在不同组织和器官的硝酸盐吸收转运中起作用。[结论]本研究鉴定了8个谷子硝酸盐吸收和转运相关的NRT1基因,为后续谷子NRT1基因功能研究及谷子耐低氮分子机制的揭示奠定了基础。 展开更多
关键词 谷子 氮素 硝酸盐转运蛋白 nrt1基因家族 NPF基因家族
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木薯MeNRT2.1基因的克隆及表达分析 被引量:4
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作者 胡春吉 邹良平 彭明 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第1期117-124,共8页
木薯具有产量高、抗贫瘠等特点,为了了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以培养20 d的"华南5号"木薯组培苗为实验材料,采用同源克隆和RT-PCR技术,获得一个高亲和硝态氮转运蛋白(NRT2)基因,命名为Me N... 木薯具有产量高、抗贫瘠等特点,为了了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以培养20 d的"华南5号"木薯组培苗为实验材料,采用同源克隆和RT-PCR技术,获得一个高亲和硝态氮转运蛋白(NRT2)基因,命名为Me NRT2.1,该基因含有1 593 bp的开放阅读框架,编码530个氨基酸。生物信息学分析结果表明,木薯Me NRT2.1与苜蓿、拟南芥、可可、杨树等物种的NRT2.1同源性高,其中与可可树Tc NRT2.1的亲缘关系最近,氨基酸相似性达到90%。实时荧光定量PCR检测结果表明,Me NRT2.1在木薯组培苗的根中表达,并且在NO_3^-浓度为0.2 mmol/L时,其相对表达量较高,NO_3^-浓度为10 mmol/L时其相对表达量较低,NO_3^-浓度为0时几乎不表达;Me NRT2.1在茎、叶中也几乎不表达,即该基因具有诱导型组织特异性表达模式。原生质体瞬时表达发现Me NRT2.1定位在细胞膜上。此研究为进一步通过NRT2基因提高木薯的抗逆性奠定了基础。 展开更多
关键词 木薯 硝态氮 nrt2 实时荧光定量PCR 亚细胞定位
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草地早熟禾NRT1/PTR FAMILY 8.3基因的克隆及表达分析 被引量:2
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作者 金一锋 陈阳 +4 位作者 齐欣 高岩松 金忠民 赵清峰 王琦 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期1397-1405,共9页
植物硝酸盐转运蛋白(Nitrate transporter,NRT)可有效转运NO-3,提升氮素利用效率。为了解析草地早熟禾(Poa pratensis)适应不同浓度及不同形态氮素、干旱胁迫机理,本研究以草地早熟禾为试材,对NRT1/PTR FAMILY 8.3基因进行克隆、生物信... 植物硝酸盐转运蛋白(Nitrate transporter,NRT)可有效转运NO-3,提升氮素利用效率。为了解析草地早熟禾(Poa pratensis)适应不同浓度及不同形态氮素、干旱胁迫机理,本研究以草地早熟禾为试材,对NRT1/PTR FAMILY 8.3基因进行克隆、生物信息学分析,并分析了不同浓度及不同形态氮素以及干旱下该基因表达情况。研究结果:草地早熟禾NRT1/PTR FAMILY 8.3基因包含典型的主要协同转运蛋白超家族(Major facilitator superfamily,MFS)结构域,与二穗短柄草(Brachypodium distachyon)高度同源;荧光定量PCR分析表明,该基因根部、叶部的表达量显著高于茎部;氮浓度为7.5 mM时,不同形态氮素诱导下,NaNO3处理组有利于该基因表达;无氮、高氮组(0,15 mM NaNO3)基因的表达量显著高于适氮组(7.5 mM NaNO3);干旱胁迫可促进其表达。研究结果为探究NRT1/PTR FAMILY 8.3在不同氮素环境中的调节机制,培育氮素利用率高的优质草种提供理论基础。 展开更多
关键词 草地早熟禾 nrt1/PTR FAMILY 8.3 基因克隆 表达分析
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NRT基因与氮素利用效率的研究进展 被引量:2
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作者 王波 马行 +1 位作者 刘莹莹 过昱辰 《北方园艺》 CAS 北大核心 2014年第20期198-202,共5页
低氮素利用效率对农田生态系统所造成的污染日益加重,如何提高作物的氮素利用效率已成为目前的一个研究热点。文章分析了植物体内硝酸盐转运体(Nitrate transporters,NRT)的分类、存在部位、生物学功能及调控机制,旨在阐明植物吸收、转... 低氮素利用效率对农田生态系统所造成的污染日益加重,如何提高作物的氮素利用效率已成为目前的一个研究热点。文章分析了植物体内硝酸盐转运体(Nitrate transporters,NRT)的分类、存在部位、生物学功能及调控机制,旨在阐明植物吸收、转运NO3-的生理机制,指出了利用分子生物学的手段是提高作物氮素利用效率的一个重要方向,这为今后通过基因工程的手段来提高氮素利用效率,减少环境污染提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 氮素利用效率 nrt 硝酸盐
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草地早熟禾硝酸盐转运蛋白NRT2.4基因序列的克隆及表达分析 被引量:1
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作者 陈阳 金一锋 +4 位作者 金忠民 王玉书 蔡荣建 邵竹林 王杰 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2021年第2期1-8,共8页
植物硝酸盐转运蛋白(Nitrate transporter,NRT)可有效调节与转运NO-3,提升氮素利用效率。分析草地早熟禾硝酸盐转运蛋白NRT2.4基因在不同氮素浓度下的表达规律,旨在揭示硝酸盐转运蛋白NRT2.4基因在氮素调控中扮演的角色。以草地早熟禾... 植物硝酸盐转运蛋白(Nitrate transporter,NRT)可有效调节与转运NO-3,提升氮素利用效率。分析草地早熟禾硝酸盐转运蛋白NRT2.4基因在不同氮素浓度下的表达规律,旨在揭示硝酸盐转运蛋白NRT2.4基因在氮素调控中扮演的角色。以草地早熟禾为材料,首先设计特异引物,利用RT-PCR技术克隆得到草地早熟禾NRT2.4基因cDNA序列,其长度为1694 bp,包含一个1257 bp的CDS区,编码418个氨基酸序列,属于Nitrate/nitrite transporter NarK超级家族1,与二穗短柄草、节节麦NRT2.4基因高度同源。第6,7个跨膜区之间有一段MFS家族所特有的序列特征:G-X3-D-X2-G-X-R,第4个跨膜区有典型的NO-3/NO-2转运载体特征序列:A-G-W-G/A-N-M-G,第8个跨膜区之后含有保守的蛋白激酶C识别基序(S/T-X-R/K):SKR。利用qRT-PCR方法,测定草地早熟禾NRT2.4基因表达水平存在组织特异性,叶部表达量最多,硝态氮利于NRT2.4基因的表达,氮饥饿和高浓度NaNO3水培液处理均利于NRT2.4基因的表达。上述结果为草地早熟禾硝酸盐转运蛋白NRT2.4在草坪草抗逆基因工程中的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 草坪草 草地早熟禾 nrt2.4 氮素营养胁迫 克隆 表达
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藜麦NRT2基因家族的鉴定及表达分析 被引量:1
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作者 杨利艳 高源 +2 位作者 朱满喜 邓妍 王创云 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第S01期8-18,共11页
硝态氮是植物吸收氮素的2种主要形式之一,硝酸盐转运蛋白2(NRT2)在土壤中硝酸盐缺乏时发挥主导作用。为探究藜麦NRT2基因家族的特征和表达模式,利用生物信息学方法,对藜麦NRT2基因进行全基因组鉴定,并分析了其编码蛋白、染色体定位、基... 硝态氮是植物吸收氮素的2种主要形式之一,硝酸盐转运蛋白2(NRT2)在土壤中硝酸盐缺乏时发挥主导作用。为探究藜麦NRT2基因家族的特征和表达模式,利用生物信息学方法,对藜麦NRT2基因进行全基因组鉴定,并分析了其编码蛋白、染色体定位、基因结构、系统进化、顺式作用元件、组织表达特异性以及不同氮素水平处理后基因的表达模式。结果表明,藜麦中有15个NRT2基因,分布在7条染色体上,每个成员分别含有1~9个内含子及2~10个外显子,蛋白亚细胞定位预测其均定位在质膜上,为疏水性蛋白。同时,系统进化分析显示,藜麦NRT2蛋白家族属于2个亚家族,与拟南芥的亲缘关系更近。顺式作用元件分析显示,藜麦NRT2家族成员启动子区存在大量与生长发育及逆境胁迫等相关的顺式作用元件。藜麦NRT2基因家族成员在不同组织器官中的表达存在差异,在根、茎、叶中表达量较高。在低氮条件下,藜麦NRT2.4、NRT2.7、NRT2.15表达上调;0,25%N处理后藜麦NRT2.7、NRT2.15的表达量急剧增加。研究结果可为后续藜麦NRT2s基因克隆和功能以及氮素胁迫分析提供参考依据。 展开更多
关键词 藜麦 硝酸盐 nrt2 基因家族 氮胁迫
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人工耳蜗电极在耳蜗内不同部位的NRT阈值 被引量:1
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作者 王海英 胡宝华 张道行 《浙江临床医学》 2007年第4期461-462,共2页
目的通过对人工耳蜗电极在耳蜗内不同深度NRT阈值的检测,探讨耳蜗不同部位螺旋神经节对NRT反应阈值的差异。方法选择接受NucleusCI24M型人工耳蜗植入的15例患者,选择位蜗内最浅5个电极和最深5个电极区间,分别在蜗内3.20~7.05mm深(A组)... 目的通过对人工耳蜗电极在耳蜗内不同深度NRT阈值的检测,探讨耳蜗不同部位螺旋神经节对NRT反应阈值的差异。方法选择接受NucleusCI24M型人工耳蜗植入的15例患者,选择位蜗内最浅5个电极和最深5个电极区间,分别在蜗内3.20~7.05mm深(A组)和20.20~23.28mm深(B组)两个组,进行NRT阈值的检测。结果:A组NRT阈值为195.667±10.506,B组NRT阈值为182.200±14.339,两组比较,差异有显著性(P<0.05)。结论位于蜗顶的NRT阈值比蜗底部低。 展开更多
关键词 神经反应遥测技术 人工耳蜗植入 阈值 nrt
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植物NRT1.1的研究进展及其在苎麻研究中的展望 被引量:2
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作者 侯美 喻春明 《中国麻业科学》 2017年第4期207-214,共8页
在自然条件下,硝酸盐是非固氮植物生长过程中从外界环境吸收的主要氮源。植物通过一系列硝酸盐转运蛋白实现对硝态氮的吸收与利用。NRT1.1(硝酸盐转运蛋白nitrate transporter1.1,NRT1.1)是植物根系吸收硝酸盐后第一个发挥作用的蛋白,... 在自然条件下,硝酸盐是非固氮植物生长过程中从外界环境吸收的主要氮源。植物通过一系列硝酸盐转运蛋白实现对硝态氮的吸收与利用。NRT1.1(硝酸盐转运蛋白nitrate transporter1.1,NRT1.1)是植物根系吸收硝酸盐后第一个发挥作用的蛋白,其通过氨基酸序列中第101位苏氨酸是否发生磷酸化修饰而表现双亲和性转运功能;NRT1.1可作为一种信号分子,调控侧根的生长与发育;NRT1.1除了参与硝酸盐响应和转运过程,还参与植物对重金属的吸收。文章结合最新的研究报道,综述了植物硝酸盐转运蛋白NRT1.1的研究进展,并对其在苎麻研究中的作用进行展望,以期为提高苎麻氮同化效率与逆境抗性能力研究提供参考,并为苎麻育种提供理论依据与方向。 展开更多
关键词 硝酸盐 nrt1.1 转运蛋白 信号分子 苎麻
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果蝇Nrt基因的一个人同源异型基因NLGN-4的研究初报
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作者 曾伟奇 朱传炳 +3 位作者 李永青 罗开梅 叫玮 吴秀山 《湖南师范大学自然科学学报》 EI CAS 北大核心 2002年第1期59-63,共5页
运用计算机克隆的方法获得了一个新的人同源基因 ,经国际人类基因命名委员会批准命名为NL GN 4(Neuroligin 4) .该基因位于X染色体 ,有一个含有TATA框的典型启动子序列 ,mRNA全长约 5 .6kb ,3’末端含有ATAAA的加尾信号 ,编码一段长 81... 运用计算机克隆的方法获得了一个新的人同源基因 ,经国际人类基因命名委员会批准命名为NL GN 4(Neuroligin 4) .该基因位于X染色体 ,有一个含有TATA框的典型启动子序列 ,mRNA全长约 5 .6kb ,3’末端含有ATAAA的加尾信号 ,编码一段长 816个氨基酸的蛋白质 ,相似于其家族成员人的NLGN 3基因产物 ,其神经系统 (主要是大脑 )的EST数目占正常组织EST总数的 45 % ,表明它在大脑和其他神经组织中有高度表达 ,可能与大脑的功能有关 ,这与其家族成员的功能相一致 .而它在胎儿心脏中也有较多表达 (占正常组织的 2 0 % ) 。 展开更多
关键词 同源异型基因 计算机克隆 人类NLGN-4基因 果蝇 nrt基因 基因克隆
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