目的:使用高通量测序法辅助开发RAS相关区域家族1A(Ras-Association Domain Family 1A,RASSF1A)基因甲基化定性检测试剂盒(荧光PCR法)。方法:提取37例肺癌血浆样本DNA进行亚硫酸氢盐修饰转化,使用高通量测序方法检测样本的亚硫酸氢盐转...目的:使用高通量测序法辅助开发RAS相关区域家族1A(Ras-Association Domain Family 1A,RASSF1A)基因甲基化定性检测试剂盒(荧光PCR法)。方法:提取37例肺癌血浆样本DNA进行亚硫酸氢盐修饰转化,使用高通量测序方法检测样本的亚硫酸氢盐转化效率和RASSF1A基因CpG位点的甲基化水平,之后使用荧光PCR法检测样本RASSF1A基因的甲基化状态。结果:高通量测序显示样本DNA的平均转化效率为99.47%;根据CpG位点甲基化水平的双向聚类分析结果,筛选出第26~30号CpG位点作为荧光PCR法的检测位点,以甲基化水平5%作为阈值线,ΔCt Cut-off值为9,得出两种检测方法对37例样本的测定结果一致。结论:本研究借助高通量测序技术成功构建基于荧光PCR法的RASSF1A基因甲基化定性检测方法,操作简便、成本低、效率高,适用于临床RASSF1A基因甲基化状态常规化检测。展开更多
文摘目的:使用高通量测序法辅助开发RAS相关区域家族1A(Ras-Association Domain Family 1A,RASSF1A)基因甲基化定性检测试剂盒(荧光PCR法)。方法:提取37例肺癌血浆样本DNA进行亚硫酸氢盐修饰转化,使用高通量测序方法检测样本的亚硫酸氢盐转化效率和RASSF1A基因CpG位点的甲基化水平,之后使用荧光PCR法检测样本RASSF1A基因的甲基化状态。结果:高通量测序显示样本DNA的平均转化效率为99.47%;根据CpG位点甲基化水平的双向聚类分析结果,筛选出第26~30号CpG位点作为荧光PCR法的检测位点,以甲基化水平5%作为阈值线,ΔCt Cut-off值为9,得出两种检测方法对37例样本的测定结果一致。结论:本研究借助高通量测序技术成功构建基于荧光PCR法的RASSF1A基因甲基化定性检测方法,操作简便、成本低、效率高,适用于临床RASSF1A基因甲基化状态常规化检测。