基于PubMed数据库2017—2022年数据的信息计量分析

文章以PubMed数据库2017—2022年关于删失数据研究领域的科研文献数据为分析对象,从基本描述性统计、发文趋势、期刊载文量、作者发文量、语义地图分析等角度进行了知识计量分析及可视化分析,根据分析结论整理该领域近几年的研究热点和主题演变过程,为该领域科研人员进行研究提供参考。

基于PubMed数据库的临床药学工作切入点的文献计量分析

目的:基于文献可视化分析,探讨临床药学研究的发展趋势。方法:利用BICOMB 2.0和VOSviewer 1.6.16软件,对PubMed数据库自建库起至2023年4月7日发表的临床药学相关文献进行提取统计和可视化分析。结果:最终纳入文献4 609篇,其中我国学者发文量为174篇。我国学者总体发文量呈递增趋势;发文量较多的机构包括中国药科大学、浙江大学医学院附属第一医院、北京大学医学部、上海交通大学医学院附属仁济医院以及首都医科大学附属北京朝阳医院。国内临床药学研究热点问题较单一,涉及医院药学服务、成年人的用药管理和回顾性研究等领域。结论:临床药学在我国起步晚但发展迅速,发展前景广阔。

基于文本挖掘技术的脑卒中文献计量分析:以PubMed数据库为例

目的回溯并勾勒2010年-2020年全球脑卒中领域研究的主题演化历程与时空分布规律。方法从PubMed数据库中获取2010年-2020年脑卒中相关文献,利用R 4.1.2的pubmedR软件包批量抓取文献基本信息,通过quanteda软件包构建语料库,使用结构主体模型进行分析,并运用ggplot2软件包进行国家或地区合作网络分析。结果全球脑卒中研究2010年-2013年为快速增长期,增长率为11.94%~17.60%;2014年-2018年为增长平缓期,增长率为3%~4%左右;2019年-2020年再次快速增长,增长率为12.81%、17.96%。中国内地地区在2012年、2020年增长率分别为102.99%、43.85%,在全球两个阶段的高速增长期中均做出了较大贡献。基于文献摘要文本,共归纳出11个主题类别,其中“临床研究”与“卒中康复”占较大比重,合计热度值为46.66%。我国近年研究热点主要集中在“分子遗传病学”与“动物实验”。结论全球脑卒中研究热度持续增长,主题类别逐渐丰富。我国需进一步加强脑卒中前端预防和后端康复研究,优化防治策略。

基于PubMed数据库对miR与骨代谢相关信号通路的文献研究

目的研究miR通过信号通路对骨代谢的调控机制。方法通过检索Pub Med数据库2000年-2016年期间miR与骨代谢相关信号通路的文献,将相关miR的功能进行分析并予以归类。结果总共检索到相关文献949篇,符合纳入及排除标准的文献有140篇,分析显示miR与骨代谢相关信号通路的文献研究主要以经典的信号通路为主,miR对骨质疏松的作用机制主要表现在对成骨细胞的影响、对破骨细胞的影响、对骨髓间充质干细胞的影响及对钙盐代谢的影响4个方面。结论miR通过信号通路对骨代谢的调控具有重要的意义,其可作为诊断与治疗骨质疏松症的血清潜在标志物。

新版PubMed数据库医学文献检索

今年年初 ,Pub Med推出新版的检索系统软件 ,新版检索软件的界面更清晰、友好 ,使用更简便、实用 。

基于PubMed数据库近十年国外针灸治疗偏头痛文献计量分析

目的明确国外针灸治疗偏头痛文献分布特点和主要研究方向,了解国外针灸治疗偏头痛的研究现状,为进一步的研究提供参考。方法运用文献计量学和共词聚类分析的方法对Pub Med数据库收录的2004-2013年国外针灸治疗偏头痛相关文献进行分析。结果共检出发表的有关偏头痛论文88篇,相关高频主题词共37个,共词聚类分析发现高频主题词聚类为2个类别。结论从文献计量的角度客观反映国外针灸治疗近十年偏头痛的研究情况,研究热点主要集中在预防和治疗领域。

PubMed数据库检索系统及相关检索方法

PubMed是美国国家医学图书馆（NLM）所属的国家生物技术信息中心（NCBI）开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。该系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的自1950年以来全世界70多个国家4300多种主要生物医学文献的书目索引和摘要，并提供部分免费和付费全文链接服务。

基于PubMed数据库的MEDLINE收录国内期刊论文认定方法研究

分析使用PubMed数据库进行MEDLINE收录国内期刊论文认定工作中出现的情况,并进行期刊及论文收录标识的解读,论文收录信息的对比、分析,确定MEDLINE收录的确切标识和认定标准。

Pubmed数据库计算机检索医学信息

Pubmed是NCBI开发的检索Medline的网上系统。本文介绍了Pubmed的收录范围、检索方法、功能和特点。目的是让医学工作者能够在较短的时间里,掌握网上医学文献的检索,充分开发和利用网上生物医学资源。

对学术论文撤销的思考——基于万方数据库和PubMed数据库

文章收集万方和Pub Med数据库中被撤销论文的撤销时间、第一作者所在国家及地区、撤销原因等,进行统计学分析和排序研究,并提出应对学术论文撤销的措施。在设定检索时段内,在万方和Pub Med数据库中,分别检索到40篇与178篇被撤销论文。两家数据库被撤销论文的年份分布构成比比较,差异无统计学意义(P=0.297)。万方数据库中,被撤销论文前三位的地区分别为北京、广东、湖南。Pub Med数据库中,中国被撤销论文数量最多,超过总撤稿量的三分之一,被撤销论文前三位的地区分别为上海、北京、广东。两家数据库论文被撤销的前三大原因,均分别为损害他人著作权或知识产权,一稿多投及数据/图、表重复发表,差错。然后,就应对我国学术论文撤销的严峻形势,我们提出建议,分别从国家层面、编辑层面、编辑部层面和数据库层面采取措施,遏制论文发表中的学术行为不端。

基于PubMed数据库的胃肿瘤研究现状及热点聚类分析

目的探讨胃肿瘤领域近年的研究热点及研究现状,为该领域科研人员选择研究方向提供参考。方法检索PubMed数据库中2016年1月1日至2021年4月23日的胃肿瘤相关文献,使用BICOMB,gCLUTO等软件对主题词进行聚类分析,结合文献评阅胃肿瘤的研究现状和研究热点。结果共纳入18982篇文献,2016年至2021年每年的发文量依次为4040、3847、4021、4133、2648和293篇。其中发文量最大的期刊是Gastric Cancer,共发表608篇。文献来源于58个国家,其中核心发文国家有15个,共发文10824篇,且以欧美(7874篇,占72.75%)和日本(1515篇,占14.00%)为主。共选取高频主题词79个,聚类分析得到10组聚类效果较好的研究热点。结论胃食管结合部癌诊治、幽门螺杆菌诊治、靶向药物、腹腔镜手术、内镜下切除术等方面为当前胃肿瘤研究的核心热点。欧美国家和日本在该研究领域中具有一定引领作用。

基于PubMed数据库的数字图书馆文献查检系统设计

现有文献查检系统存在准确率低、系统运行能耗高以及耗时长等问题,为此,提出并设计基于PubMed数据库的数字图书馆文献查检系统。采用三层体系结构模式,将系统分为数据层、业务层与应用层。数据层存放从PubMed数据库中选取的数据,通过PCIe接口支持的通信技术与业务层交互;业务层设置SoC芯片HI3510作为处理器,对用户需求输入后形成的查检条件进行查询索引处理,通过输入文献题目、文献号、文献作者等关键词获取文献文本,结合Web Service服务查询本地PubMed数据库;最终通过应用层的用户界面显示文献查检结果,完成系统设计。实验结果表明,该系统的文献查检准确率高达到90%,系统运行能耗少,且查检耗时低。

基于Pubmed数据库检索的人兽共患病及其病原微生物研究现状与趋势分析

[目的]获得全球范围内人兽共患病及其病原微生物研究现状和热点变化趋势信息,为我国人兽共患病的防控提供参考。[方法]利用COOC 12.6和Citespace 5.8 R1软件对Pubmed数据库中的人兽共患病及其病原微生物相关的关键词进行了频次统计、共现分析、聚类分析、时间线分析和突现词分析。[结果]根据Pubmed数据库中2001—2021年关键词频次统计和共现分析结果,国际关注度较高的人兽共患病及其病原微生物有以下3类:第1类为常见的人兽共患病病原,包括布鲁菌(Brucella)、戊型肝炎病毒(hepatitis E virus)、链球菌(Streptococcus)、大肠杆菌(Escherichia coli)和沙门菌(Salmonella)等,需要持续关注;第2类为近些年在国际上被广泛关注的人兽共患病病原,如新型冠状病毒(SARS-CoV-2)和甲型流感病毒(influenza A virus)等,需要更为深入研究,以尽早控制这些病原的扩散;第3类为在国外特定地区曾大规模出现的人兽共患病,如Q热(Q fever)和中东呼吸综合征(middle east respiratory syndrome,MERS)等,应当重点关注其输入性风险,避免这些疾病在我国暴发。除疾病和病原微生物外,与检测和诊断相关的关键词,如系统发育(phylogeny)和聚合酶链式反应(PCR)等关键词的关注度也较高。聚类分析生成了10个聚类,蜱媒传染病大类提示蜱虫在人兽共患病传播中的作用。时间线和突现词分析结果显示,在病原微生物中,对甲型流感病毒以及新型冠状病毒等的关注度还在逐渐增加。同时,病原微生物检测技术正在从特定序列检测向全基因组学检测技术发展,这些领域极有可能是今后的研究方向和趋势。[结论]结果提示,人们对人兽共患病及其病原微生物研究的关注度越来越高,人兽共患病病原微生物检测技术正在发生更新和迭代。我国应重点关注甲型流感以及新型冠状病毒肺炎等疾病的防控,并适当关注蜱媒传染病。这些信息的获取可为我国的人兽共患病的防控提供参考。

基于PubMed数据库的远程护理文献计量学分析

目的通过分析远程护理相关文献,归纳目前的研究特征及热点,为进一步开展远程护理相关研究提供参考。方法检索PubMed数据库,根据纳入、排除标准检索筛选2019年11月30日前的远程护理相关文献,提取高频主题词并采用聚类分析探讨研究热点主题。结果共纳入930篇文献,其中期刊文献929篇,书籍1本,文献数量呈逐年上升趋势。检索到主要主题词+副主题词共3697个,词频≥20次主题词22个,词频≥41次主题词7个;根据高频主题词得出该领域研究热点共4个:远程家庭照护中信息安全性管理研究、远程照护中患者满意度研究、电话及其他远程护理方法管理研究、心力衰竭患者远程护理的经济学研究。结论远程护理研究正处于发展阶段,今后可以远程护理研究热点为切入点,完善、优化远程护理研究的内容与质量,促进我国远程护理开展。

基于Pubmed数据库国外心搏骤停后综合征研究现状分析

目的从文献计量学的角度反映国外心搏骤停后综合征的研究现状。方法本文筛选了Pubmed数据库2007年1月-2016年11月公开发表的心搏骤停后综合征相关文献，在基于文献计量学的基础上，运用书目共现分析系统Bicomb2．0、统计软件SPSS对数据进行研究分析，提出观点，从而揭示国外心搏骤停后综合征的研究现状与趋势。结果数据分析显示，目前对心搏骤停后综合征的研究主要集中在西方发达国家，研究方向主要集中在心肺功能衰竭、心肺复苏、复苏后并发症、原发病等四个方面。我国的研究在发展中国家中处于前列。结论随着人们对心搏骤停后综合征患者生存质量的逐渐重视，对国外相关研究的数据分析有助于帮助我国相关临床和科研人员解决实际问题。

PubMed数据库中丝光绿蝇相关研究文献分析

本文采用文献计量法对PubMed数据库收录的、1931～2013年间发表的丝光绿蝇研究文献进行分析，结果表明：以Lucilia sericata为关键词共检出341篇丝光绿蝇的文献，共涉及作者1448人，216个研究机构，149种杂志；从2000年起文献发表量提升较快，13年间的发文量是2000年以前总量的2倍多，文章语种以英语为主（299篇，占87.4%），主要刊登在《Med Vet Entomol》和《Forensic Sci Int》杂志上；尽管对于丝光绿蝇的研究领域较广，但主要集中在生理学和分子生物学领域。

基于PubMed数据库的非霍奇金淋巴瘤治疗现状和研究热点聚类分析

目的:了解近年来非霍奇金淋巴瘤的治疗现状和研究热点。方法:对PubMed数据库中2016年1月1日-2019年8月21日收录的治疗非霍奇金淋巴瘤相关文献,用书目共现分析系统2.0软件和gCLUTO 1.0软件进行文献计量学与双向聚类分析。结果:共获得4534篇文献,可以看出2016-2019年发文量呈逐年下降趋势,发文期刊以《Leukemia&lymphoma》,《Annals of hematology》,《British journal of haematology》,《Blood》等血液科学的顶级期刊为主,第一作者意大利的Zinzani PL(11篇)发文最多,其次是西班牙的Sorigue M(10篇)和美国的Martin P(10篇)。聚类分析显示研究热点集中在淋巴瘤、白血病、皮肤肿瘤或肿瘤复发患者的传统治疗,分子靶向药物利妥昔单抗及其他免疫治疗药物的用途、不良反应、治疗方案、给药方法和剂量等方向。结论:欧洲学者在治疗非霍奇金淋巴瘤的研究中发文量处于领先地位,美国学者在该领域的研究成果也比较突出。针对传统治疗、靶向治疗药物的用途、不良反应、治疗方案、给药方法及剂量的研究对提高治愈率和改善预后具有重要意义。

我国中文医学期刊在PubMed数据库中的收录及数据展示分析

【目的】对我国中文医学期刊在PubMed数据库中的收录及数据展示现状进行分析,为进一步提高期刊国际影响力提供参考。【方法】检索PubMed数据库中收录的中文医学期刊,对其基本信息、PubMed收录时间及在PubMed上的展示现状(数据更新时间、摘要语种、DOI和全文链接)进行分析,并探讨中文医学期刊与国际高影响力期刊(CA-A Cancer Journal for Clinicians)在数据展示方面的差异。【结果】PubMed收录的中文医学期刊以月刊居多,收录高峰期为1997年,2008年后逐渐减少;其中,35种PubMed收录期刊对文献数据进行了及时更新,25种采用中英双语摘要,32种标注了DOI,27种提供了全文链接。与中文医学期刊相比,CA-A Cancer Journal for Clinicians的文献均采用了提前在线出版方式。【结论】我国中文医学期刊被PubMed数据库收录的数量较少,而且已被收录的期刊在文献更新速度和内容方面尚需进一步改进。提前在线出版是我国中文医学期刊与国际高影响力期刊在数据展示方面的主要差距。

PubMed数据库中我国论文撤销原因及学术影响力分析

【目的】分析PubMed数据库中因不同原因撤销的我国论文的文献计量学特征以及净化效果。【方法】收集2005—2014年PubMed因不同原因而撤销的我国学术论文的地区、期刊分布情况;分析撤销论文数量随时间的变化趋势以及撤销论文的撤销时滞和净化效果。【结果】共检索到撤销的中国论文370篇,撤销原因中,剽窃类型最多,错误次之,其次为重复发表、学术道德问题。因错误和学术不端撤销的论文数量逐年增长。湖北、上海、北京、山东、江苏、浙江、广东、台湾、黑龙江、陕西、重庆显示度比较高。期刊的分布比较分散,表现规律不明显。各种类型净化时间成本均衡。除其他类型外,各种类型论文撤销后学术净化效果显著。【结论】揭示了我国生物医学类论文撤销的主要原因及不同原因撤销论文的净化效果。建议编辑、期刊、数据库出版商应当规范和完善撤销声明和撤销原因的标注,避免引用撤销后的论文,共同净化学术环境。

利用PubMed数据库查对参考文献题名时需要注意核定的问题

Pub Med是当今世界上重要、权威的生物医学和生命科学领域的专业数据库,是生物医学和生命科学领域文章重要的参考文献文库,也是该领域科技期刊编辑在查对参考文献时经常使用的数据库。Pub Med数据库在收录文献信息时,在著录文献题目方面会对一些特定内容使用替代性处理,从而导致其录入并呈现的信息内容与真实正确的内容存在偏差。本文对工作实践中发现、收集的Pub Med数据库文献题名方面容易出现的偏差及其表现情况进行了总结,以供编辑同人参考。