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RACE法分离团头鲂生长抑素全长cDNA及其序列测定 被引量:20
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作者 俞菊华 夏德全 +3 位作者 杨弘 贺艳辉 陈勇军 吴婷婷 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期533-539,共7页
生长抑素具有抑制脑垂体GH释放的作用,是调控鱼类生长的主要激素之一。本研究采用RT和RACE(rapid amplification of cDNA ends)法,分离和测定了团头鲂脑中生长抑素PSSI cDNA的全长核苷酸序列,并对该基因进行了结构和系统进化分析。3’R... 生长抑素具有抑制脑垂体GH释放的作用,是调控鱼类生长的主要激素之一。本研究采用RT和RACE(rapid amplification of cDNA ends)法,分离和测定了团头鲂脑中生长抑素PSSI cDNA的全长核苷酸序列,并对该基因进行了结构和系统进化分析。3’RACE扩增得到700bp左右的片段,5’RACE分离得到500bp左右的片段,把3’片段与5’片段拼接得到全长cDNA。cDNA全长735bp[不含poly(A)],5’端非翻译区有100nt,3’端290bP[不包含poly(A)],阅读框(open reading frame,ORF)345bp。该序列与金鱼PSSI cDNA序列同源性为90%,主要差异在5’端非翻译区。团头鲂生长抑素mRNA阅读框编码114个氨基酸,包括一些酶切位点,产生26个氨基酸的大分子态生长抑素,进一步加工成与人等结构相似的14个氨基酸的生长抑素;团头鲂生长抑素前体氨基酸序列与金鱼、虹鳟、鲶鱼、鮟鱇、蛙、牛、鼠、鸡、猴、人等的比较发现,它与金鱼的同源性最高达95%,与鮟鱇最低50%,与人68%。这说明生长抑素基因在长期的进化中相当保守,同时,也因为鱼类生活环境多样导致基因变异较大。 展开更多
关键词 race法 分离鉴定 团头鲂 生长抑素 CDNA 序列测定
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利用3′-RACE法扩增到钙通道基因的3′-端片段 被引量:4
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作者 金晓琳 胡福泉 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 1999年第3期210-212,218,共4页
Ca2+是细胞内的第二信使,涉及到细胞的信号传导、细胞运动、分裂、分化、神经递质的合成与释放,以及细胞凋亡等重要的基本生命过程。电压激活的钙离子通道在调节细胞内钙离子水平中起着至关重要的作用。以往报道表明,钙通道基因具有... Ca2+是细胞内的第二信使,涉及到细胞的信号传导、细胞运动、分裂、分化、神经递质的合成与释放,以及细胞凋亡等重要的基本生命过程。电压激活的钙离子通道在调节细胞内钙离子水平中起着至关重要的作用。以往报道表明,钙通道基因具有高度的多样性。已克隆的6个钙通道α1... 展开更多
关键词 钙通道基因 race法 基因扩增
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利用5′-RACE法扩增到钙通道基因的5′-端片段 被引量:1
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作者 金晓琳 饶贤才 +3 位作者 张克斌 张光明 刘启富 胡福泉 《微生物学杂志》 CAS CSCD 1999年第3期45-46,共2页
关键词 钙通道基因 片段 race法 扩增
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两种检测HBV RNA方法在核苷(酸)类似物经治和初治慢性乙型肝炎患者中的相关性和一致性评价 被引量:3
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作者 王雪刚 张新枝 +5 位作者 杨澍 甘苏琴 刘诗 郝坤艳 周彬 于乐成 《肝脏》 2020年第7期736-742,共7页
目的比较RACE法和Sansure法检测核苷(酸)类似物经治和初治慢性乙型肝炎患者HBV RNA定量值的相关性和一致性。方法纳入南方医科大学南方医院门诊随访的慢性乙型肝炎患者并收集患者血清学、病毒学和生化数据。采集患者血清分别用RACE法和S... 目的比较RACE法和Sansure法检测核苷(酸)类似物经治和初治慢性乙型肝炎患者HBV RNA定量值的相关性和一致性。方法纳入南方医科大学南方医院门诊随访的慢性乙型肝炎患者并收集患者血清学、病毒学和生化数据。采集患者血清分别用RACE法和Sansure法检测HBV RNA水平,分析两者检测值的相关性和一致性。结果共入组101例慢性乙型肝炎患者,其中接受核苷(酸)类似物治疗62例,未曾接受核苷(酸)类似物治疗39例。治疗和未治疗组的HBsAg和HBV DNA水平存在显著差异,HBV RNA水平差异有统计学意义。两种方法相比,RACE法比Sansure法检测到的阳性患者更多(60/101和56/101),平均检测值更高(3.16和2.53 lg拷贝/mL)。HBV DNA水平与HBV RNA水平在治疗组没有相关性(RACE法R^2=0.4406,Sansure法R^2=0.5081),在未治疗组显著相关(RACE法R^2=0.8448,Sansure法R^2=0.8667)。RACE法和Sansure法HBV RNA检测值显著相关(R^2=0.8740);此外,两种HBV RNA检测方法Bland-Altman分析显示,95%一致性界限的范围较窄(在治疗组为-1.789~0.22 lg拷贝/mL,在未治疗组为-2.25~0.53 lg拷贝/mL);以RACE法为基准,Sansure法的偏差在治疗组为-0.78 lg拷贝/mL,在未治疗组为-0.86 lg拷贝/mL。两种方法线性回归后方程:Y(Sansure法)=0.9189X(RACE法)-0.3754。结论两种HBV RNA检测方法的相关性显著,一致性较好,可用线性回归方程互算;两种HBV RNA检测方法均可有效弥补血清HBV DNA检测对指导慢性乙型肝炎临床诊治方面的不足。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 HBV RNA race法 Sansure 相关性 一致性
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Study on the Cloning and Isolation of sus scrofa GPX2 Gene by RACE Method 被引量:2
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作者 赵华 周继昌 +2 位作者 李俊刚 赵莹 王康宁 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2008年第1期24-28,共5页
[Objective] Using molecular biotechnology to clone the sus scrofa GPX2 gene. [Method] Using total RNA of sus scrofa duodenum as template, degenerated primer pairs were designed according to the homology alignment anal... [Objective] Using molecular biotechnology to clone the sus scrofa GPX2 gene. [Method] Using total RNA of sus scrofa duodenum as template, degenerated primer pairs were designed according to the homology alignment analysis of GPX2 gene of human, rat, mouse, dog and cattle. A sus scrofa GPX2 gene sequence of 330 bp was obtained by RT-PCR application method. Primes were designed respectively according to the known sequence, sus scrofa GPX2 gene was isolated and cloned by 3-RACE and 5-RACE method and analyzed the gene sequence. [Result] A mRNA sequence of 924 bp was successfully cloned and isolated in this research. This sequence contained complete 3'end and had higher sequence homology with human,mouse,cattle and dog GPX2 gene, and there was codon called TGA which encoding Sec on the position of No. 114-116 gene. [Conclusion] Sequence alignment analysis showed that the cloned gene was sus scrofa GPX2 gene ( NCBI GenBank database, the sequence number was D098982). 展开更多
关键词 Gene clone sus scrofa GPX2 race RT-PCR
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食管癌细胞SHEEC中NGAL基因5'-UTR和3'-UTR的克隆与鉴定 被引量:9
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作者 李恩民 许丽艳 +6 位作者 熊华淇 蔡唯佳 吴炳礼 张灿 张永发 林艳 沈忠英 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第2期143-147,共5页
背景与目的:NGAL(neutrophilgelatinase-associatedlipocalin)基因是lipocalin家族的一个新成员。以往我们曾研究发现NGAL基因在TPA诱导永生化食管上皮细胞SHEE向食管癌细胞SHEEC恶性转化的过程中显著过表达,但表达调控机制不清楚。本... 背景与目的:NGAL(neutrophilgelatinase-associatedlipocalin)基因是lipocalin家族的一个新成员。以往我们曾研究发现NGAL基因在TPA诱导永生化食管上皮细胞SHEE向食管癌细胞SHEEC恶性转化的过程中显著过表达,但表达调控机制不清楚。本研究拟从SHEEC细胞中克隆NGAL基因的5'-UTR和3'-UTR(untranslatedregion)并进一步明确其结构特征。方法:采用RACE方法从SHEEC细胞中克隆NGAL基因的5'-UTR和3'-UTR;在测序基础上进行BLAST分析鉴定。结果:结合以往的实验结果,从SHEEC细胞中克隆了NGAL基因的69bp5'-UTR和147bp3'-UTR,而且序列分析未发现突变。结论:SHEEC细胞中的NGAL基因具备完整的5'-UTR和3'-UTR结构。 展开更多
关键词 食管肿瘤 NGAL基因 基因过表达 转录非翻译区 race法 克隆
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谢瓦氏曲霉间型变种(Aspergillus chevalieri var.intermedius)esdC基因全长cDNA克隆与序列分析 被引量:8
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作者 刘荣 谭玉梅 +1 位作者 刘永翔 刘作易 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期36-40,共5页
为探究esdC基因在谢瓦氏曲霉问型变种的结构特征,从己构建的抑制性差减文库(ssH)中筛选得到。sdC基因的EST序列,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术扩增该基因片段的5’和3’端,拼接得到全长cDNA1472bp。通过序列分析,该cDNA序列... 为探究esdC基因在谢瓦氏曲霉问型变种的结构特征,从己构建的抑制性差减文库(ssH)中筛选得到。sdC基因的EST序列,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术扩增该基因片段的5’和3’端,拼接得到全长cDNA1472bp。通过序列分析,该cDNA序列含有一个开放阅读框(ORF),长度为819bp,从396~1214bp,含有30个腺嘌呤尾巴。预测编码273个氨基酸,该蛋白质的等电点pI为9.51,分子量为30.26558kD,为不稳定蛋白。序列同源性分析表明:该基因与费希新萨托菌(Neosartorya fischeri NRRL181)有性发育蛋白EsdC相似度最高,为78%,其保守区序列主要集中于蛋白质的N端。本实验为进一步研究esdC基因的分子功能及可能参与的调控途径奠定基础。 展开更多
关键词 谢瓦氏曲霉间型变种 esdC基因 race法
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眼镜王蛇三指毒素新cDNA序列的克隆及结构分析
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作者 李晶 梁成罡 +1 位作者 徐康森 杨化新 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期6-9,共4页
目的:获得眼镜王蛇中多种三指毒素的新的cDNA序列,分析其结构特征,为王蛇三指毒素基因组特征的研究及重组药物的开发奠定基础。方法:采用类似蛇种的毒素信号肽编码序列及简并引物获得部分cDNA序列,再通过3’RACE法获得多种编码成熟三指... 目的:获得眼镜王蛇中多种三指毒素的新的cDNA序列,分析其结构特征,为王蛇三指毒素基因组特征的研究及重组药物的开发奠定基础。方法:采用类似蛇种的毒素信号肽编码序列及简并引物获得部分cDNA序列,再通过3’RACE法获得多种编码成熟三指毒素的完整新cDNA序列。通过BLAST检索,利用功能软件构建系统发生进化树进行分析。结果:获得了眼镜王蛇6类三指毒素共19条新基因的cDNA序列,GenBank的接收号为DQ273567~DQ273585。这些cDNA长度都在480bp左右,彼此之间序列相似度均在70%以上,且每类毒素的cDNA都呈现高度的序列多态性。结论:通过合理的引物设计及3’RACE法成功获得了眼镜王蛇中多种三指毒素的新的编码序列。 展开更多
关键词 眼镜王蛇 三指毒素 简并引物 3’race法 系统发生进化树
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Stat1基因真核表达质粒的构建及其体外转染和表达检测
9
作者 肖红梅 卢光现秀 《中国医学工程》 2007年第8期637-640,645,共5页
目的克隆信号转导与转录活化子1(signal transducer and activators of transcription,STAT)基因片段并构建其真核重组表达质粒。通过研究Stat1 mRNA序列各组成部分与Stat1基因翻译调控的关系,探讨了Stat1蛋白翻译调控机制。方法采用DN... 目的克隆信号转导与转录活化子1(signal transducer and activators of transcription,STAT)基因片段并构建其真核重组表达质粒。通过研究Stat1 mRNA序列各组成部分与Stat1基因翻译调控的关系,探讨了Stat1蛋白翻译调控机制。方法采用DNA重组技术,将用SMART RACE法筛选出的Stat1基因片段克隆到pT-Adv载体,然后将其亚克隆到pFLAG-CMV-2真核表达载体上,构建Stat1 cDNA重组质粒。分别采用磷酸钙转染法、DEAE-葡聚糖转染法和脂质体介导转染法将其转染Hela细胞,并对3种方法的转染效率及各重组Stat1质粒mRNA和蛋白质表达的差异进行比较,以研究Stat1 mRNA结构对Stat1表达的影响。结果构建了CS,C3S,CS/3S,5SFC3S,5SFCS和CL/3L共6个重组Stat1质粒。通过比较发现,磷酸钙转染法、DEAE-葡聚糖转染法的转染效率明显低于脂质体介导转染法,转染的质粒均得到清晰的mRNA和蛋白质表达信号。用INF-α刺激转染5SFC3S重组Stat1质粒的Hela细胞,发现刺激组与空白组Stat1 mRNA转录水平和蛋白质表达量无明显差异,蛋白质合成效率无降低,此结果与野生型Stat1对INF-α刺激不同。结论将重组Stat1质粒转染Hela细胞后,在短暂表达条件下,重组Stat1质粒与野生型Stat1对INF-α刺激反应不同,其原因尚有待进一步研究。 展开更多
关键词 Statl SMART race法 重组质粒 翻译调控 基因表达 干扰素-Α 基因转染
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高山红景天中糖基转移酶家族cDNA全长基因的克隆 被引量:3
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作者 于寒松 张继星 +2 位作者 李彦舫 马兰青 胡耀辉 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第21期244-247,共4页
为了获得高山红景天中红景天苷生物合成关键酶——UDP-糖基转移酶家族基因的全长cDNA序列,采用在线简并引物设计软件结合3′-RACE技术获得两个糖基转移酶基因的3′端部分序列,进一步采用不同的5′-RACE试剂盒扩增两个基因的5′端序列,... 为了获得高山红景天中红景天苷生物合成关键酶——UDP-糖基转移酶家族基因的全长cDNA序列,采用在线简并引物设计软件结合3′-RACE技术获得两个糖基转移酶基因的3′端部分序列,进一步采用不同的5′-RACE试剂盒扩增两个基因的5′端序列,结果显示利用Takara公司的试剂盒扩增可以得到cDNA全长序列(GenBank登录号为EF508689和EU567325),而采用Invitrogen公司的试剂盒得到的序列不包括全部开放读码框。实验证明,利用Takara公司的SMARTerTM RACE cDNA Amplification Kit克隆获得基因全长序列的比率更高。 展开更多
关键词 糖基转移酶 基因克隆 cDNA末端快速克隆(race) 高山红景天
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左侧视网膜剥夺鸽左前脑差异表达基因全长cDNA的克隆
11
作者 金珠 匡晶 +4 位作者 徐磊 吕立夏 许蕾 李学礼 王尧 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期457-462,共6页
利用cDNA末端快速扩增 (RACE)技术克隆了一条由左侧视网膜剥夺造成左前脑差异表达EST片段的全长cDNA序列 ,同源性比较后认定 ,其为鸽e(r)基因 .该基因与人类及斑马鱼等脊椎动物e(r)基因的同源性非常高 ,但C端有明显差异 .RNA斑点杂交、... 利用cDNA末端快速扩增 (RACE)技术克隆了一条由左侧视网膜剥夺造成左前脑差异表达EST片段的全长cDNA序列 ,同源性比较后认定 ,其为鸽e(r)基因 .该基因与人类及斑马鱼等脊椎动物e(r)基因的同源性非常高 ,但C端有明显差异 .RNA斑点杂交、逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)及Northern印迹等方法检测 ,该基因在不同组织中表达量有差异 .结果表明 ,鸽e(r)基因在左眼视网膜剥夺鸽的左前脑及肝、肾中的表达量较高 ,该基因的表达具有一定的组织表达特异性 . 展开更多
关键词 eDNA末端快速扩增(race) 组织表达特异性 e(r)基因
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水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析
12
作者 王步勇 王峰 +3 位作者 李丹蕾 马玲 陈俏丽 王博文 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期305-311,共7页
根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820)。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF)。... 根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820)。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF)。预测蛋白编码653个氨基酸,相对分子质量为72 009,理论等电点为4.82,不稳定指数为41.5,属于不稳定性蛋白。保守区预测分析结果表明,该蛋白含有B302_SPRY和CTLH 2个保守结构域,属于SPRY超家族。多序列比对分析结果表明,该基因编码蛋白与马来丝虫的SPRY(XP_001891979.1)蛋白的相似度为43%。蛋白结构分析结果表明,β–折叠与无规则卷曲是Ab–SPRYSEC蛋白的主要结构元件。表达定位分析结果表明,Ab–SPRYSEC基因的表达位置在水稻干尖线虫食道腺附近。Ab–SPRYSEC基因作为水稻干尖线虫效应因子,在水稻干尖线虫侵染宿主中发挥了重要作用。 展开更多
关键词 水稻干尖线虫 SPRYSEC基因 原位杂交 c DNA末端快速扩增技术(race法)
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龙眼己糖激酶基因的克隆及原核表达
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《中国园艺文摘》 2016年第6期235-235,共1页
目的:克隆龙眼Dimocarpus longan己糖激酶(Hexokinase,HXK)基因,并对其进行生物信息学分析及原核表达分析。方法:以龙眼总RNA为模板,采用RT-PCR结合RACE法获得基因全长CDNA序列,构建pET-32a—DIHXK原核表达载体,转化到大肠埃希... 目的:克隆龙眼Dimocarpus longan己糖激酶(Hexokinase,HXK)基因,并对其进行生物信息学分析及原核表达分析。方法:以龙眼总RNA为模板,采用RT-PCR结合RACE法获得基因全长CDNA序列,构建pET-32a—DIHXK原核表达载体,转化到大肠埃希菌Escherichia coli Rosetta(DE3)中诱导表达。 展开更多
关键词 原核表达载体 己糖激酶 酶基因 龙眼 克隆 全长CDNA序列 RT-PCR race法
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