目的:使用高通量测序法辅助开发RAS相关区域家族1A(Ras-Association Domain Family 1A,RASSF1A)基因甲基化定性检测试剂盒(荧光PCR法)。方法:提取37例肺癌血浆样本DNA进行亚硫酸氢盐修饰转化,使用高通量测序方法检测样本的亚硫酸氢盐转...目的:使用高通量测序法辅助开发RAS相关区域家族1A(Ras-Association Domain Family 1A,RASSF1A)基因甲基化定性检测试剂盒(荧光PCR法)。方法:提取37例肺癌血浆样本DNA进行亚硫酸氢盐修饰转化,使用高通量测序方法检测样本的亚硫酸氢盐转化效率和RASSF1A基因CpG位点的甲基化水平,之后使用荧光PCR法检测样本RASSF1A基因的甲基化状态。结果:高通量测序显示样本DNA的平均转化效率为99.47%;根据CpG位点甲基化水平的双向聚类分析结果,筛选出第26~30号CpG位点作为荧光PCR法的检测位点,以甲基化水平5%作为阈值线,ΔCt Cut-off值为9,得出两种检测方法对37例样本的测定结果一致。结论:本研究借助高通量测序技术成功构建基于荧光PCR法的RASSF1A基因甲基化定性检测方法,操作简便、成本低、效率高,适用于临床RASSF1A基因甲基化状态常规化检测。展开更多
目的探讨肺癌患者痰标本中FH IT、P16、MGMT、RASSF1A和APC等抑癌基因启动子异常甲基化及其联合检测在肺癌筛查及早期诊断中的价值。方法采用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)法,检测47例肺癌组织及对应的痰标本FHIT、P16...目的探讨肺癌患者痰标本中FH IT、P16、MGMT、RASSF1A和APC等抑癌基因启动子异常甲基化及其联合检测在肺癌筛查及早期诊断中的价值。方法采用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)法,检测47例肺癌组织及对应的痰标本FHIT、P16,MGMT、RASSF1A和APC基因启动子区甲基化状态。24例肺良性疾病患者痰标本作为对照。结果 47例肺癌组织标本中FHIT、P16、MGMT、RASSF1A、APC基因启动子区甲基化检出率分别为40.4%(19/47)、53.2%(25/47)、36.2%(17/47)、21.3%(10/47)和38.3%(18/47);对照的痰标本中五者甲基化检出率分别为38.3%(18/47)、48.9%(23/47)、36.2%(17/47)、17.0%(8/47)和29.8%(14/47),两组甲基化检出率存在着一致性[P>0.05;κ(0.8~1.0)]。24例肺良性病变痰标本中未检测到任何异常甲基化,与肺癌组比较差异有统计学意义(P<0.05)。五项指标联合检测可明显提高肺癌检测的灵敏度(80.9%)和特异度(100.0%)。FHIT和P16基因痰标本甲基化检出率与患者吸烟指数有相关性(P<0.05)。结论痰标本中多个肺癌相关基因甲基化联合检测有望成为肺癌筛查、早期诊断简便有效的指标。展开更多
背景与目的肿瘤发生、发展过程中,抑癌基因启动子区域Cp G岛异常甲基化起着重要的作用。已有研究显示RAS相关区域家族1A(Ras association domain family 1A,RASSF1A)基因,作为一个抑癌基因其启动子区域甲基化与非小细胞肺癌(non-small c...背景与目的肿瘤发生、发展过程中,抑癌基因启动子区域Cp G岛异常甲基化起着重要的作用。已有研究显示RAS相关区域家族1A(Ras association domain family 1A,RASSF1A)基因,作为一个抑癌基因其启动子区域甲基化与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的发生发展密切相关。在NSCLC患者癌组织中RASSF1A基因启动子往往表现为异常高甲基化。本研究采用meta分析的方法探讨RASSF1A基因启动子甲基化与NSCLC发生之间的关系。方法通过检索Medline、EMBASE、CNKI和万方数据库,按照已拟定的纳入与剔除标准筛选收集公开发表的关于RASSF1A基因启动子甲基化与NSCLC相关性的研究。以比值比(odds ratio,OR)和95%置信区间(confidence interval,CI)为效应指标,分析RASSF1A基因启动子甲基化与NSCLC的关系。结果共有23篇文献纳入本研究,RASSF1A基因启动子甲基化率在NSCLC患者肺部组织和对照组中分别为41.50%(95%CI:34%-49%)和5.58%(95%CI:2%-9%),meta分析显示肿瘤组织中的甲基化率高于对照组(OR=8.72,95%CI:4.88-15.58,P<0.05);亚组分析显示:肿瘤组织中的甲基化频率高于血浆(OR=10.99,95%CI:2.48-48.68)和正常对照组织(OR=8.74,95%CI:4.39-17.41)。结论 NSCLC患者肺癌组织中RASSF1A基因启动子甲基化率高于对照组,组织中RASSF1A基因启动子甲基化率对肺癌的发生更具影响,RASSSF1A甲基化可能与肺癌的发生存在相关并可作为肺癌诊断的潜在标志物。展开更多
文摘目的:使用高通量测序法辅助开发RAS相关区域家族1A(Ras-Association Domain Family 1A,RASSF1A)基因甲基化定性检测试剂盒(荧光PCR法)。方法:提取37例肺癌血浆样本DNA进行亚硫酸氢盐修饰转化,使用高通量测序方法检测样本的亚硫酸氢盐转化效率和RASSF1A基因CpG位点的甲基化水平,之后使用荧光PCR法检测样本RASSF1A基因的甲基化状态。结果:高通量测序显示样本DNA的平均转化效率为99.47%;根据CpG位点甲基化水平的双向聚类分析结果,筛选出第26~30号CpG位点作为荧光PCR法的检测位点,以甲基化水平5%作为阈值线,ΔCt Cut-off值为9,得出两种检测方法对37例样本的测定结果一致。结论:本研究借助高通量测序技术成功构建基于荧光PCR法的RASSF1A基因甲基化定性检测方法,操作简便、成本低、效率高,适用于临床RASSF1A基因甲基化状态常规化检测。
文摘目的探讨肺癌患者痰标本中FH IT、P16、MGMT、RASSF1A和APC等抑癌基因启动子异常甲基化及其联合检测在肺癌筛查及早期诊断中的价值。方法采用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)法,检测47例肺癌组织及对应的痰标本FHIT、P16,MGMT、RASSF1A和APC基因启动子区甲基化状态。24例肺良性疾病患者痰标本作为对照。结果 47例肺癌组织标本中FHIT、P16、MGMT、RASSF1A、APC基因启动子区甲基化检出率分别为40.4%(19/47)、53.2%(25/47)、36.2%(17/47)、21.3%(10/47)和38.3%(18/47);对照的痰标本中五者甲基化检出率分别为38.3%(18/47)、48.9%(23/47)、36.2%(17/47)、17.0%(8/47)和29.8%(14/47),两组甲基化检出率存在着一致性[P>0.05;κ(0.8~1.0)]。24例肺良性病变痰标本中未检测到任何异常甲基化,与肺癌组比较差异有统计学意义(P<0.05)。五项指标联合检测可明显提高肺癌检测的灵敏度(80.9%)和特异度(100.0%)。FHIT和P16基因痰标本甲基化检出率与患者吸烟指数有相关性(P<0.05)。结论痰标本中多个肺癌相关基因甲基化联合检测有望成为肺癌筛查、早期诊断简便有效的指标。