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云南抗白叶枯病稻种的RGA初析 被引量:9
1
作者 姬广海 张世光 +2 位作者 魏兰芳 崔汝强 徐绍忠 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第10期969-974,共6页
根据水稻抗白叶枯病Xa2 1基因的富含亮氨酸重复区域 (LRR)和番茄抗细菌性斑点病 (Pseudomonassyringaepv tomato)的Pto基因编码蛋白质激酶的DNA序列 ,设计 2对引物用于扩增抗水稻白叶枯病品种中的抗病基因同源序列。经聚丙烯酰胺凝胶电... 根据水稻抗白叶枯病Xa2 1基因的富含亮氨酸重复区域 (LRR)和番茄抗细菌性斑点病 (Pseudomonassyringaepv tomato)的Pto基因编码蛋白质激酶的DNA序列 ,设计 2对引物用于扩增抗水稻白叶枯病品种中的抗病基因同源序列。经聚丙烯酰胺凝胶电泳和聚类分析 ,结果表明供试抗病品种间具有丰富的RGA多态性 ,用同一引物测定的属于同一簇的品种显示相似的抗性和抗谱。从XLRRfor/XLRRrev引物的聚类图中可知 ,在遗传距离为 0 2 5时 ,测试的 4 7个抗白叶枯病水稻品种可分为 9个簇。其中 3、4、7组为主要组群 ,第 3组包括 2 3个水稻品种 ,在遗传距离为 0 2时 ,可进一步分为 5个亚群。RGA分析结果为水稻抗病育种选择亲本和利用品种布局进行白叶枯病生态控制提供了依据。 展开更多
关键词 水稻 白叶枯病抗性 抗病基因同源序列 rga指纹
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HPLC测定RGA胶囊中红景天苷的含量 被引量:12
2
作者 罗秀珍 钟忠 +2 位作者 谢忱 徐丽珍 杨世林 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期228-229,共2页
关键词 rga胶囊 红景天苷 含量 测定 高效液相色谱法
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用改进的SSAP方法克隆抗甘薯茎线虫病相关的RGA 被引量:12
3
作者 柳哲胜 刘庆昌 +1 位作者 翟红 玉萍 《分子植物育种》 CAS CSCD 2005年第3期369-374,共6页
甘薯新品系农大603是从感茎线虫病品种徐薯18的辐照后代中获得的一个抗茎线虫病的突变体。根据已报道的植物线虫抗性基因的核苷酸结合位点(NBS)保守氨基酸序列设计兼并引物,用自行改进的SSAP(modified sequence-specific amplification ... 甘薯新品系农大603是从感茎线虫病品种徐薯18的辐照后代中获得的一个抗茎线虫病的突变体。根据已报道的植物线虫抗性基因的核苷酸结合位点(NBS)保守氨基酸序列设计兼并引物,用自行改进的SSAP(modified sequence-specific amplification polymorphisms)方法,对农大603和徐薯18的基因组进行PCR扩增,从农大603中扩增出含有抗性基因NBS保守序列的差异片段2个(片段54和片段72)。在GenBank上序列搜索和比对发现,克隆序列与已报道的植物抗病基因之间同源性较低。根据克隆片段的DNA序列设计引物,以抗、感茎线虫病的甘薯品种的基因组DNA为模板进行PCR扩增,结果显示由片段72设计的引物在抗、感品种上没有扩增出多态性带;由片段54设计的引物在抗病品种和感病品种之间扩增出多态性带,推测片段54是与甘薯抗茎线虫病有关的RGA。 展开更多
关键词 甘薯茎线虫病 rga 克隆 核苷酸结合位点 GenBank PCR扩增 相关 植物抗病基因 基因组DNA 徐薯18 序列设计 抗性基因 植物线虫 保守序列 序列搜索 甘薯品种 感病品种 抗病品种 多态性 片段 引物 突变体 新品系 氨基酸 NBS
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RGA法克隆候选抗病基因的研究进展 被引量:15
4
作者 徐兵强 杜中军 黄俊生 《分子植物育种》 CAS CSCD 2004年第3期421-428,共8页
RGA法是克隆植物抗病基因的一条新途径,也是近年来分子生物学领域的一个研究热点并受到植物病理学家广泛地关注。其作用原理是根据已克隆植物抗病基因的保守结构域设计简并引物,扩增获得RGAs,然后分析RGAs与抗病基因的关系,确定候选抗... RGA法是克隆植物抗病基因的一条新途径,也是近年来分子生物学领域的一个研究热点并受到植物病理学家广泛地关注。其作用原理是根据已克隆植物抗病基因的保守结构域设计简并引物,扩增获得RGAs,然后分析RGAs与抗病基因的关系,确定候选抗病基因并从而获得新的抗病基因。研究还发现,已克隆的RGAs与R基因紧密连锁。最近获得的RGAs主要是根据NBS-LRR和STK两种保守结构域而得到的。前者在植物基因组中广泛存在,而后者在植物信号传导中具有重要作用。为此,本文主要对上述两种保守结构域的结构特点和所获得的RGAs特点以及RGA法的应用前景进行了综述,以期让人们对RGA法有更进一步的认识。 展开更多
关键词 rga法克隆 抗病基因 分子生物学 作用原理 植物
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小麦抗病基因同源序列(RGAs)的克隆与分析(英文) 被引量:9
5
作者 刘松青 何莎 +3 位作者 蒋芳 韦先超 周翰林 涂睿 《中国农学通报》 CSCD 2007年第3期83-88,共6页
RGA(抗性基因同源序列)法是克隆植物抗性基因的一种经济有效的方法,成为近年来的研究热点。本实验综合分析了拟南芥,西红柿,水稻,烟草等植物已克隆的抗性基因,并以这些抗性基因的NBS(核酸结合位点),LRR(富含亮氨酸重复),STK(丝氨酸/苏... RGA(抗性基因同源序列)法是克隆植物抗性基因的一种经济有效的方法,成为近年来的研究热点。本实验综合分析了拟南芥,西红柿,水稻,烟草等植物已克隆的抗性基因,并以这些抗性基因的NBS(核酸结合位点),LRR(富含亮氨酸重复),STK(丝氨酸/苏氨酸激酶)保守结构域设计并合成了几十对RGA引物,对小麦抗条锈病材料进行PCR扩增,获得以Xal-NBS为引物的R88RGA片段,经克隆和序列比对分析,发现该片段与逆境条件下植物抗病信号传导相关,与蛋白激酶同源性达到96%。此项研究对抗病机理的研究和基因的发掘有重要的指导意义。 展开更多
关键词 抗病基因同源序列(rgas) 克隆 小麦
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基于PCR的水稻候选RGA标记检验和评估 被引量:3
6
作者 肖天霞 赵向前 +2 位作者 汪旭升 吴为人 朱军 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期51-55,共5页
在生物信息学方法开发的基于e-PCR、共显性的402个水稻候选RGA标记的基础上,随机挑选40对引物,分别以水稻品种Nipponbare和93-11的DNA为模板进行PCR扩增验证.得到清晰条带占所用标记总数的87.5%(35个标记),其中31对引物为共显性标记,4... 在生物信息学方法开发的基于e-PCR、共显性的402个水稻候选RGA标记的基础上,随机挑选40对引物,分别以水稻品种Nipponbare和93-11的DNA为模板进行PCR扩增验证.得到清晰条带占所用标记总数的87.5%(35个标记),其中31对引物为共显性标记,4对引物为显性标记.用这31对RGA引物在24个水稻品种中进行PCR扩增,结果表明标记具有很好的通用性和特异性.RGA引物平均标记多态性指标(PIC)值为0.46,标记具有较好的多态性. 展开更多
关键词 水稻 rga标记 PCR
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基于RGA的铣削加工切削参数智能优化 被引量:5
7
作者 孟令锋 罗红波 +1 位作者 邹云 雷勇 《工具技术》 北大核心 2006年第5期39-41,共3页
采用实数编码遗传算法实现了铣削加工参数的多目标优化,保证了全局寻优与收敛,大大提高了运算效率,在不同生产条件下均能快速找到合理的切削参数。
关键词 rga 铣削加工 切削参数 智能优化
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小麦抗白粉病基因Pm4b的RGA分析 被引量:3
8
作者 胡楠 伊艳杰 +2 位作者 刘红彦 柴春月 刘新涛 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第21期6379-6380,6430,共3页
为克隆抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。利用10对RGA引物,对小麦抗白粉病基因的一些载体品种(系)进行扩增,将引物对R11F/R11R从Pm4b基因的载体品种VPM中扩增出的稳定多态性条带回收、克隆、测序,获得与小麦Pm4b基因的相关抗... 为克隆抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。利用10对RGA引物,对小麦抗白粉病基因的一些载体品种(系)进行扩增,将引物对R11F/R11R从Pm4b基因的载体品种VPM中扩增出的稳定多态性条带回收、克隆、测序,获得与小麦Pm4b基因的相关抗病基因的同源片段,并对不同的小麦Pm基因载体品系作了检测分析。该稳定多态性条带全长1 321 bp。序列分析表明这个片段属于RGA类序列。用该标记检测小麦不同Pm基因载体品种(系),发现该多态性片段仅出现在Pm4b基因载体品种中。该研究可为分离抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。 展开更多
关键词 小麦 白粉病 抗病基因 rga标记 序列分析
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百合鳞片DNA提取及RGA-PCR体系的优化 被引量:5
9
作者 杨秀梅 瞿素萍 +3 位作者 王丽花 崔光芬 彭绿春 王继华 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第1期266-269,共4页
以百合鳞片为材料,采用改良的CTAB法获得了高质量的基因组DNA。通过影响PCR反应各因子的优化,建立了适合百合的RGA-PCR反应体系:25μl体系中含30 ng模板DNA、2.5 mmol/L MgCl2、0.2 mmol/L dNTPs、0.6μmol/L引物及1.5 UTaq酶。扩增程序... 以百合鳞片为材料,采用改良的CTAB法获得了高质量的基因组DNA。通过影响PCR反应各因子的优化,建立了适合百合的RGA-PCR反应体系:25μl体系中含30 ng模板DNA、2.5 mmol/L MgCl2、0.2 mmol/L dNTPs、0.6μmol/L引物及1.5 UTaq酶。扩增程序为:94℃预变性5 min,94℃变性1 min,44℃退火1 min,72℃延伸2 min,40个循环;最后72℃延伸7 min。利用该体系对35个百合品种进行RGA-PCR,表明该反应体系具有较好的稳定性和可靠性。 展开更多
关键词 百合 DNA提取 rga-PCR
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辣椒疫病抗性相关的共显性RGA-STS标记的开发及应用 被引量:9
10
作者 李永新 巩振辉 +1 位作者 李大伟 陈儒钢 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期123-127,共5页
采用辣椒抗病基因同源序列(Resistance gene analogues)(RGA2)设计1对特异引物,对高抗辣椒疫病品种CM334和极感疫病品种Early Calwonder(EC)进行多态性扩增,开发出共显性的RGA-STS1200标记。利用STS1200标记在具有不同疫霉菌生理小种抗... 采用辣椒抗病基因同源序列(Resistance gene analogues)(RGA2)设计1对特异引物,对高抗辣椒疫病品种CM334和极感疫病品种Early Calwonder(EC)进行多态性扩增,开发出共显性的RGA-STS1200标记。利用STS1200标记在具有不同疫霉菌生理小种抗性的辣椒材料CM334、PBC459、PBC137-1和对辣椒疫霉菌3个生理小种都不具抗性的辣椒材料EC、茄门和B2间进行多态性扩增。结果表明,由3个辣椒疫病抗性材料所扩增出的条带大小一致,而由3个感辣椒疫病品种所扩增出的条带大小一致。说明STS1200标记可用于鉴定辣椒疫病抗、感材料。同时,利用共显性的RGA-STS1200标记在苗期及时剔除CM334和EC正反杂交所得F1代假杂种,进一步构建用于辣椒疫病抗性研究用的F2代分离群体。这是少数报道利用RGA-STS标记对辣椒疫病抗性进行鉴定,也是第一次利用RGA-STS标记对作物种子真伪进行鉴定。 展开更多
关键词 rga-STS 辣椒疫病 分子标记 纯度鉴定
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均匀设计与正交设计优化海岛棉RGA-PCR体系 被引量:1
11
作者 李吉琴 孔庆平 +5 位作者 陈全家 赵其波 孔杰 宁新民 梁亚军 曲延英 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期929-934,共6页
采用均匀设计和正交设计对影响海岛棉RGA体系Mg^(2+)、dNTP、引物以及Taq DNA聚合酶浓度等因素进行了均匀优化和正交优化试验后建立了适合于海岛棉RGA的反应体系:在10μL反应体系中1×Buffer,Mg^(2+)2.5 mmol/L,dNTP 0.25 mmol/L,... 采用均匀设计和正交设计对影响海岛棉RGA体系Mg^(2+)、dNTP、引物以及Taq DNA聚合酶浓度等因素进行了均匀优化和正交优化试验后建立了适合于海岛棉RGA的反应体系:在10μL反应体系中1×Buffer,Mg^(2+)2.5 mmol/L,dNTP 0.25 mmol/L,引物浓度1.0μmmol/L,Taq酶0.375 U/μL,DNA 20 ng。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以Mg^(2+)浓度影响最大,Taq DNA聚合酶的影响最小。运用该体系对海岛棉材料进行验证,证明该体系稳定可靠,并从22对RGA引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的10对引物。这一体系的建立及多态性引物的筛选为今后利用RGA标记技术进行海岛棉枯萎病研究提供了科学依据。 展开更多
关键词 均匀设计 正交设计 海岛棉 rga—PCR 体系优化
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RGA法克隆NBS-LRR类抗病基因同源序列及其在葫芦科作物上应用的研究进展 被引量:2
12
作者 薛莹莹 孙守如 +3 位作者 孙德玺 邓云 朱迎春 刘君璞 《中国瓜菜》 CAS 2014年第3期1-4,9,共5页
RGA克隆法是利用抗病基因产物的保守结构域人工设计简并引物,以植物gDNA或cDNA为模板进行PCR扩增而克隆植物抗病基因同源序列的方法。随着各种植物基因组测序计划的完成及计算机和生物信息学的发展,植物抗病基因的克隆取得了很大进展,... RGA克隆法是利用抗病基因产物的保守结构域人工设计简并引物,以植物gDNA或cDNA为模板进行PCR扩增而克隆植物抗病基因同源序列的方法。随着各种植物基因组测序计划的完成及计算机和生物信息学的发展,植物抗病基因的克隆取得了很大进展,目前人们已经从植物中克隆得到100多个抗病基因。研究表明,大多数抗病基因都存在NBS-LRR、STK、LZ、TIR等功能保守的结构域,其中大部分都为NBS-LRR类型,利用NBS-LRR保守结构域设计PCR引物已经从植物中扩增出大量的RGA。简要综述了已克隆NBS-LRR类抗病基因的结构特点和功能、RGA法克隆NBS-LRR类抗病基因同源序列及其在葫芦科作物上应用的研究进展,并探讨其未来的发展与应用。 展开更多
关键词 rga NBS-LRR 抗病基因 西瓜 甜瓜 黄瓜
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与多花黑麦草抗灰叶斑病相关基因紧密连锁的RGA-CAPS标记筛选 被引量:4
13
作者 丁成龙 沈益新 +1 位作者 顾洪如 三浦優一 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2005年第3期202-206,共5页
以多花黑麦草抗灰叶斑病品种Sach iaoba、感病品种M inam iaoba及其杂种F1分离群体为材料,采用接种鉴定和分群分析法(BSA)进行抗病基因类似物限制性内切酶酶切多态性(RGA-CAPS)筛选。得到与多花黑麦草抗灰叶斑病相关基因紧密连锁的RGA-C... 以多花黑麦草抗灰叶斑病品种Sach iaoba、感病品种M inam iaoba及其杂种F1分离群体为材料,采用接种鉴定和分群分析法(BSA)进行抗病基因类似物限制性内切酶酶切多态性(RGA-CAPS)筛选。得到与多花黑麦草抗灰叶斑病相关基因紧密连锁的RGA-CAPS标记,该标记与灰叶斑病抗性相关基因紧密连锁,连锁距离为4.94cM。测序和BLASTX查询结果显示,该RGA与水稻的1个NBS-LRR类抗性蛋白(Genbank/NCB I:AAT81729.1)同源性高达67%,序列分析结果显示,对应于抗、感病性的该RGA片段长度均为361 bp,两片段之间存在多个单核苷酸差异(SNPs)。利用SNPs重新设计引物,并应用新设计引物成功地将RGA-CAPS标记转换成共显性STS标记。 展开更多
关键词 多花黑麦草 灰叶斑病 rga-CAPS标记 STS标记
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RGA法标记植物抗病基因的研究进展 被引量:5
14
作者 张荣 陈欧 王振英 《天津农业科学》 CAS 2009年第1期10-12,共3页
简述了植物抗病基因的结构特点,介绍了利用RGA法克隆的抗病基因同源序列及其应用,对RGA法的应用前景进行了展望。
关键词 rga 抗病基因 结构域
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GAI/RGA蛋白家族的研究进展 被引量:3
15
作者 李巍 萧浪涛 《生物技术通报》 CAS CSCD 2007年第5期39-42,共4页
赤霉素(GAs)通过同细胞膜上的受体结合,经过一系列信号分子传递从而调节植物的生长发育。在已发现的植物GA信号传递分子中,有一类重要的组成元件—GAI/RGA家族蛋白,不仅作用于植物的种子萌发、茎的伸长和花的发育等许多方面,而且在GA信... 赤霉素(GAs)通过同细胞膜上的受体结合,经过一系列信号分子传递从而调节植物的生长发育。在已发现的植物GA信号传递分子中,有一类重要的组成元件—GAI/RGA家族蛋白,不仅作用于植物的种子萌发、茎的伸长和花的发育等许多方面,而且在GA信号转导途径与其他植物激素信号转导途径的相互作用中起着非常重要的作用。最近几年,对GAI/RGA家族蛋白的研究取得了惊人的进展。现就GAI/RGA家族蛋白的结构、在GA信号转导中的作用、在植物生长发育中的作用以及在激素相互关系中的作用等方面进行综述。 展开更多
关键词 赤霉素 GAI/rga蛋白家族 保守结构域 信号转导 植物生长发育
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基于RGA软件的稻麦联合收割机的可靠性增长研究 被引量:1
16
作者 王树文 许立佳 +3 位作者 孙勇 李楠 高鹏 王峥峥 《农机化研究》 北大核心 2014年第8期174-176,184,共4页
可靠性增长一般都是通过试验-修复-再试验这样一个反复过程来实现的,如何在试验过程中分析数据,准确地确定可靠性的程度,找出试验与可靠性目标的差距并指导再次试验,作为一个可靠性工程师也是必须要掌握的。应用RGA软件对稻麦联合收割... 可靠性增长一般都是通过试验-修复-再试验这样一个反复过程来实现的,如何在试验过程中分析数据,准确地确定可靠性的程度,找出试验与可靠性目标的差距并指导再次试验,作为一个可靠性工程师也是必须要掌握的。应用RGA软件对稻麦联合收割机可修复系统进行了可靠性增长试验,结果表明:该软件能够精确的定量分析机械产品的可靠性。 展开更多
关键词 稻麦联合收割机 rga 可修复系统 可靠性增长
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辣椒抗疫病相关基因的RGA-STS标记的开发 被引量:3
17
作者 王博 左星 +2 位作者 李永新 巩振辉 李大伟 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期124-127,共4页
利用西北农林科技大学园艺学院辣椒课题组克隆的辣椒抗疫病相关的全长基因RGA1(GenBank登录号:GQ386945)设计一对引物,上游引物为BY32,下游引物为RBQC-R。以对辣椒疫病高抗的品种CM334和感病品种EC为试材,利用PCR技术分析辣椒抗疫病的Se... 利用西北农林科技大学园艺学院辣椒课题组克隆的辣椒抗疫病相关的全长基因RGA1(GenBank登录号:GQ386945)设计一对引物,上游引物为BY32,下游引物为RBQC-R。以对辣椒疫病高抗的品种CM334和感病品种EC为试材,利用PCR技术分析辣椒抗疫病的Sequence Tagged Sites(STS)标记。结果表明,在高抗品种CM334中得到700 bp大小的STS700标记,而在感病品种EC中未扩增出相应大小的片段。在多个不同抗疫病辣椒品种中验证说明,STS700标记鉴定辣椒疫病抗性可靠、稳定。 展开更多
关键词 辣椒疫病 分子标记 rga-STS
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RGA10质谱计的改进及在K-Ar、Ar-Ar同位素定年中的应用 被引量:21
18
作者 桑海清 《质谱学报》 EI CAS CSCD 2002年第4期241-247,共7页
对 RGA1 0质谱计离子源、分析室、样品提纯系统及数据处理系统等方面进行了改进 ,并增加了 3 8Ar大小球分取装置 ,使该仪器灵敏度、真空度及仪器的综合指标比过去有了较大改善 ,仪器的稳定性及测试样品的速度有了很大提高。仪器改造后... 对 RGA1 0质谱计离子源、分析室、样品提纯系统及数据处理系统等方面进行了改进 ,并增加了 3 8Ar大小球分取装置 ,使该仪器灵敏度、真空度及仪器的综合指标比过去有了较大改善 ,仪器的稳定性及测试样品的速度有了很大提高。仪器改造后三年来的实验证明 :Ar同位素的分析效率提高了 2至 3倍。 展开更多
关键词 质谱学 rga10质谱计的改进 K-Ar、Ar-Ar法 应用
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小麦NBS类抗病相关基因片段RGA-A的初步研究 被引量:1
19
作者 张立荣 齐爱勇 +1 位作者 杨文香 刘大群 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第9期81-84,共4页
利用同源序列法分离小麦抗病相关基因同源序列。根据已经克隆的抗病基因保守结构NBS区设计引物,采用RT-PCR方法对小麦抗叶锈病近等基因系材料TcLr24进行扩增。获得了一条525bp条带RGA-A,通过BLASTp比较,序列中含有典型的NBS保守结构域,... 利用同源序列法分离小麦抗病相关基因同源序列。根据已经克隆的抗病基因保守结构NBS区设计引物,采用RT-PCR方法对小麦抗叶锈病近等基因系材料TcLr24进行扩增。获得了一条525bp条带RGA-A,通过BLASTp比较,序列中含有典型的NBS保守结构域,与很多已知植物抗病基因的功能相应区域一致,编码的蛋白与大麦中抗性蛋白亲缘关系较近。半定量RT-PCR分析表明,RGA-A受叶锈菌诱导表达,表明该基因在小麦叶片中与抗叶锈性相关。该NBS类抗病基因相关片段的获得为研究小麦抗病基因奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦抗叶锈病基因 抗病基因类似物(rga) 同源基因
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利用Mlo蛋白保守域MrcD2-MJ5区扩增小麦抗白粉病基因RGA 被引量:1
20
作者 张胜利 李东方 许桂芳 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第3期53-54,共2页
培育抗病品种是防治小麦白粉病的最经济、有效的方法。为了探索白粉病抗病基因快速有效筛选及利用的新方法,根据M lo蛋白的跨膜保守结构域设计兼并引物进行了本研究,结果表明:兼并引物在本研究所用的抗、感病材料中扩增效率都不高;在白... 培育抗病品种是防治小麦白粉病的最经济、有效的方法。为了探索白粉病抗病基因快速有效筛选及利用的新方法,根据M lo蛋白的跨膜保守结构域设计兼并引物进行了本研究,结果表明:兼并引物在本研究所用的抗、感病材料中扩增效率都不高;在白粉病高抗品种山农015189及中抗品种郑麦366中均扩增出了较强的500 bp左右的特异条带。本研究所设计的兼并引物扩增效率较低,但在个别抗性材料中有特异性扩增,这为进一步转化、克隆及筛选抗病相关RGA(resistance gene analogs)奠定了良好基础。 展开更多
关键词 小麦 白粉病 rga 抗病基因 兼并引物
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