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FLIP干扰性小RNA促进大肠癌细胞的凋亡 被引量:5
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作者 孙保存 臧凤琳 +3 位作者 牛瑞芳 魏熙胤 赵秀兰 张诗武 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2005年第13期1519-1523,共5页
目的:研究对应FLIP基因的siRNA片段对大肠癌细胞株HT-29凋亡的影响,明确FLIP在Fas介导的凋亡途径中的作用. 方法:体外培养大肠癌细胞HT-29,通过电穿孔技术将特异性siRNA片段转染入细胞,半定量RT-PCR 法判断干扰前后FLIP mRNA水平的变化... 目的:研究对应FLIP基因的siRNA片段对大肠癌细胞株HT-29凋亡的影响,明确FLIP在Fas介导的凋亡途径中的作用. 方法:体外培养大肠癌细胞HT-29,通过电穿孔技术将特异性siRNA片段转染入细胞,半定量RT-PCR 法判断干扰前后FLIP mRNA水平的变化,分析RNA 干扰的特异性、时效性,并比较对应不同位点的两个siRNA片段对FLIP的干扰效果.经凋亡诱导型抗体激活后,以Annexin V染色法及DNA降解片段检测分析干扰前后HT-29细胞对Fas介导的凋亡敏感性的改变. 结果:特异性siRNA片段能有效降低FLIP mRNA水平,最大干扰效率达65.02%,明显高于作为对照的非相关片段;干扰作用于转染后24 h即可出现,48 h达高峰,72 h稍有降低;对应不同位点的两个siRNA片段对FLIP均可产生干扰作用,彼此间差别不大.在诱导型抗体的刺激下,与未转染细胞相比,转染siRNA 的HT-29细胞中凋亡细胞所占比例明显增加. 结论:特异性siRNA片段可显著降低FLIP基因mRNA 的表达水平,并提高HT-29细胞对Fas介导的凋亡敏感性.以FLIP为靶点的RNA干扰技术可望成为大肠癌基因治疗的新方法. 展开更多
关键词 FLIP 干扰性小rna HT-29 HT-29 RT-PCR rna片段 mrna水平 FAS Annexin DNA rna干扰技术 基因mrna 穿 sirna
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短发卡状PTI-1(PC-3)基因特异性RNA干扰表达载体对PC-3细胞的体外效应 被引量:1
2
作者 宋斌 王禾 +2 位作者 赵晶 秦卫军 杨安钢 《第四军医大学学报》 北大核心 2005年第9期824-827,共4页
目的:通过基因克隆技术构建人前列腺癌PC3细胞系PTI1(PC3)基因[prostatecarcinomatumor inducinggene1(PC3)]的特异性短发卡shRNA(short hairpinRNA)真核表达载体,采用RNA干扰(RNAinterference,RNAi)技术,体外观察对PC3细胞系PTI1(PC3)... 目的:通过基因克隆技术构建人前列腺癌PC3细胞系PTI1(PC3)基因[prostatecarcinomatumor inducinggene1(PC3)]的特异性短发卡shRNA(short hairpinRNA)真核表达载体,采用RNA干扰(RNAinterference,RNAi)技术,体外观察对PC3细胞系PTI1(PC3)基因的沉默作用以及干扰后对PC3细胞的体外效应.方法:采用基因克隆技术,将合成的短发卡样特异性PTI1(PC3)RNA干扰寡核苷酸序列插入真核表达载体pEGFP/U6,构建PTI1(PC3)shRNA的真核表达载体,体外转染人前列腺癌PC3细胞,48h后观察细胞生物学变化;提取转染细胞总RNA及总蛋白,行RT PCR以及West ernblot观测胞内PTI1(PC3)mRNA及蛋白水平.结果:①成功构建短发卡样PTI1(PC3)shRNA真核表达载体pEGFP/U6mPs;②转染(脂质体法)PC3细胞,48h后细胞大部分死亡;③转染48h后细胞内PTI1(PC3)mRNA水平下降;④转染48h后下调胞内PTI1(PC3)蛋白水平.结论:本实验成功构建的shRNA真核表达载体通过RNA干扰,能够干扰人前列腺癌PC3细胞内PTI1(PC3)基因的表达,抑制PTI1(PC3)蛋白的表达,降低了由PTI1蛋白可能发挥的“翻译失真性”作用,促进癌细胞的死亡,进一步揭示了PTI1在前列腺癌发生、发展过程中的显性癌基因作用.由于RNA干扰的特异性从而为临床上前列腺癌的基因治疗提供了新的可能的方法. 展开更多
关键词 PC-3 特异性rna干扰 carcinoma Western PEGFP PTI-1 RT-PCR mrna水平 shrna gene rna blot
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STUB1基因RNA干扰慢病毒载体的构建与鉴定 被引量:3
3
作者 赵虹 张惊宇 +2 位作者 徐万海 杨子超 赵庆杰 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期623-627,共5页
目的:构建人STUB1基因RNA干扰(RNA interference,RNAi)慢病毒表达载体并进行鉴定。方法:针对筛选确定的人STUB1基因RNAi有效靶点序列,合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与经AgeI和EcoRI酶切后的pMagic 4.0载体连接,产生短发卡RNA... 目的:构建人STUB1基因RNA干扰(RNA interference,RNAi)慢病毒表达载体并进行鉴定。方法:针对筛选确定的人STUB1基因RNAi有效靶点序列,合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与经AgeI和EcoRI酶切后的pMagic 4.0载体连接,产生短发卡RNA慢病毒载体。PCR筛选阳性克隆,测序鉴定,并包装成慢病毒颗粒。结果:PCR鉴定与DNA测序证实,合成的含STUB1 shRNA慢病毒载体寡核苷酸链插入正确。STUB1 shRNA慢病毒载体在293T细胞中成功包装成慢病毒颗粒。结论:成功构建人STUB1基因RNAi慢病毒载体以及包装成功慢病毒颗粒,为研究STUB1在胶质瘤发生发展过程中相关信号通路的作用,提供了稳定感染细胞的载体。 展开更多
关键词 rna干扰 rna interference LENTIVIRAL vector rnai shrna DNA
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shRNA干扰Jurkat细胞株MDM2表达对细胞生物特性的影响 被引量:3
4
作者 朱有凯 林汉良 +3 位作者 顾霞 张萌 吴红阳 许湘 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期347-350,共4页
目的研究MDM2基因与白血病细胞生物学特性的关系。方法应用pSilencer4.1CMVneo构建MDM2shRNA表达载体pMDM2shRNA,采用脂质体将载体导入Jurkat细胞,利用G418筛选出稳定表达shRNA细胞后,行RTPCR和Westernblot等技术检测细胞MDM2表达水平... 目的研究MDM2基因与白血病细胞生物学特性的关系。方法应用pSilencer4.1CMVneo构建MDM2shRNA表达载体pMDM2shRNA,采用脂质体将载体导入Jurkat细胞,利用G418筛选出稳定表达shRNA细胞后,行RTPCR和Westernblot等技术检测细胞MDM2表达水平、基础生长曲线、细胞周期变化以及UV照射后细胞生长变化。结果发现转染pMDM2shRNA的细胞MDM2mRNA及蛋白质的表达均下降>50%,细胞的生长减慢,出现一定程度的G1~S期阻滞,DNA损伤后细胞恢复较慢。结论MDM2基因表达下降后,可导致细胞增殖减慢以及降低损伤修复的能力;细胞内表达shRNA可长期敲低靶基因的表达,可作为较理想的基因功能研究细胞模型。 展开更多
关键词 JURKAT rna干扰 MDM2mrna Western MDM2 RT-PCR DNA shrna blot 线 uV
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家族性胆固醇结石患者肝组织HMGCR和SCP_2mRNA的表达 被引量:4
5
作者 崔云峰 崔乃强 +1 位作者 李东华 张琚 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2005年第9期1115-1118,共4页
目的:研究家族遗传性胆囊胆固醇结石患者、非家族遗传性胆囊胆固醇结石患者和非胆固醇结石患者肝组织HMGCoA还原酶(HMGCR)、固醇携带蛋白2(SCP2)基因mRNA的表达情况,进而明确二者在胆石形成中的作用.方法:选取2003-08/2004-08天津市南... 目的:研究家族遗传性胆囊胆固醇结石患者、非家族遗传性胆囊胆固醇结石患者和非胆固醇结石患者肝组织HMGCoA还原酶(HMGCR)、固醇携带蛋白2(SCP2)基因mRNA的表达情况,进而明确二者在胆石形成中的作用.方法:选取2003-08/2004-08天津市南开医院外科住院病例90例,均取得患者及家属知情同意,其中家族遗传性胆囊胆固醇结石患者28例,非家族遗传性胆囊胆固醇结石患者30例,非胆固醇结石患者32例,术中肝活检,行肝组织总RNA提取,逆转录反应合成cDNA,设计引物,进行聚合酶链反应(PCR)扩增HMGCR和SCP2基因的目的片段,检测肝组织mRNA的表达水平的不同.结果:家族遗传性和非家族遗传性胆固醇结石组HMGCR,SCP2mRNA表达水平较非胆固醇结石组升高;其中HMG(:RmRNA表达在家族遗侉}生胆固醇结石组为1.9269±0.2134,非家族遗传性组为1.9791±0.2524,二者均高于非胆固醇结石组0.7730±0.1530,差异有显著性(P<0.05);SCP2mRNA表达在家族遗传性胆固醇结石组为0.8908±0.1649,非家族遗传性组为0.7503±0.1004,二者均高于非胆固醇结石组0.5205±0.1900,差异有显著性(P<0.05);家族遗传性胆固醇结石SCP2mRNA表达水平较非家族遗传性胆固醇结石组升高,差异有显著性(P<0.05),而HMGCRmRNA在家族遗传性和非家族遗传性胆固醇结石组两组间无统计学差别.结论:胆囊胆固醇结石患者肝组织HMGCR,SCP2mRNA表达水平升高是胆囊胆固醇结石形成的重要原因. 展开更多
关键词 (pCR) mrna表达 SCP2 HMGCoA 基因Mrna rna提取 cDNA P2
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RNA复制子疫苗研究进展 被引量:4
6
作者 杨冬 欧阳松应 +1 位作者 王云龙 欧阳红生 《生物技术通讯》 CAS 2005年第3期310-312,共3页
最近兴起的RNA复制子疫苗,利用源自病毒的能够自主复制的RNA,其结构蛋白基因由外源抗原基因取代,保留了非结构蛋白(RNA复制酶)基因。RNA复制酶可使RNA载体在细胞质中高水平复制,并实现外源抗原基因的高水平表达,可同时诱导细胞免疫和体... 最近兴起的RNA复制子疫苗,利用源自病毒的能够自主复制的RNA,其结构蛋白基因由外源抗原基因取代,保留了非结构蛋白(RNA复制酶)基因。RNA复制酶可使RNA载体在细胞质中高水平复制,并实现外源抗原基因的高水平表达,可同时诱导细胞免疫和体液免疫应答。大量双链RNA可诱导被感染细胞凋亡,宿主细胞的凋亡有利于免疫系统识别外源抗原。RNA复制子疫苗克服了传统疫苗和普通DNA疫苗存在的缺点,具有抗原表达效率高、安全性好、应用范围广等优点,因而被视为一种发展前景很好的疫苗形式。目前已对一些疾病模型基于复制子的治疗性和预防性疫苗进行了研究(涉及的对象包括病毒、肿瘤以及细菌毒素等),并对某些不足之处进行了改进。 展开更多
关键词 双链rna DNA 宿
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Non-coding RNAs in acute ischemic stroke:from brain to periphery
7
作者 Shuo Li Zhaohan Xu +7 位作者 Shiyao Zhang Huiling Sun Xiaodan Qin Lin Zhu Teng Jiang Junshan Zhou Fuling Yan Qiwen Deng 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第1期116-129,共14页
Acute ischemic stroke is a clinical emergency and a condition with high morbidity,mortality,and disability.Accurate predictive,diagnostic,and prognostic biomarkers and effective therapeutic targets for acute ischemic ... Acute ischemic stroke is a clinical emergency and a condition with high morbidity,mortality,and disability.Accurate predictive,diagnostic,and prognostic biomarkers and effective therapeutic targets for acute ischemic stroke remain undetermined.With innovations in high-throughput gene sequencing analysis,many aberrantly expressed non-coding RNAs(ncRNAs)in the brain and peripheral blood after acute ischemic stroke have been found in clinical samples and experimental models.Differentially expressed ncRNAs in the post-stroke brain were demonstrated to play vital roles in pathological processes,leading to neuroprotection or deterioration,thus ncRNAs can serve as therapeutic targets in acute ischemic stroke.Moreover,distinctly expressed ncRNAs in the peripheral blood can be used as biomarkers for acute ischemic stroke prediction,diagnosis,and prognosis.In particular,ncRNAs in peripheral immune cells were recently shown to be involved in the peripheral and brain immune response after acute ischemic stroke.In this review,we consolidate the latest progress of research into the roles of ncRNAs(microRNAs,long ncRNAs,and circular RNAs)in the pathological processes of acute ischemic stroke–induced brain damage,as well as the potential of these ncRNAs to act as biomarkers for acute ischemic stroke prediction,diagnosis,and prognosis.Findings from this review will provide novel ideas for the clinical application of ncRNAs in acute ischemic stroke. 展开更多
关键词 acute ischemic stroke apoptosis bloodbrain barrier damage circular rnas excitatory toxicity long non-coding rnas MICROrnaS NEUROINFLAMMATION non-coding rnas oxidative stress
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不同强度的耐力运动对糖尿病大鼠骨骼肌GLUT4 mRNA表达的影响 被引量:36
8
作者 刘传道 江钟立 +2 位作者 朱红军 林枫 陈子庆 《中国康复医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期244-247,共4页
目的:探讨不同强度的耐力运动对糖尿病大鼠骨骼肌GLUT4 mRNA表达的影响。方法:雄性SD大鼠,其中36只大鼠经尾静脉注射链脲霉素,建立糖尿病模型。然后随机分为低强度运动组(EL)、高强度运动组(EH)、低强度运动加胰岛素治疗组(LI)、高强度... 目的:探讨不同强度的耐力运动对糖尿病大鼠骨骼肌GLUT4 mRNA表达的影响。方法:雄性SD大鼠,其中36只大鼠经尾静脉注射链脲霉素,建立糖尿病模型。然后随机分为低强度运动组(EL)、高强度运动组(EH)、低强度运动加胰岛素治疗组(LI)、高强度运动加胰岛素治疗组(HI)、胰岛素治疗非运动组(DI)和非胰岛素治疗非运动组(DM)。6只SD大鼠为非运动正常血糖组(CN)。耐力训练采用活动平板,胰岛素采用皮下注射,共8周。运用RT-PCR法测定骨骼肌GLUT4 mRNA。结果:DM组骨骼肌GLUT4 mRNA表达水平显著低于其它各组(P<0.05)。LI组骨骼肌GLUT4 mRNA表达水平明显增高接近CN组,并且显著高于DI组。DI组GLUT4 mRNA含量与EL、EH、HI各组相当,差异无显著性意义。结论:运动可以促进GLUT4m RNA的表达,而运动强度对GLUT4 mRNA表达量无显著影响;低强度运动加胰岛素所具有最佳的GLUT4 mRNA表达水平是其它单独干预措施所无法替代的。 展开更多
关键词 GLUT4 尿 RT-PCR mrna表达量 SD 尿 rna含量
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小汤山医院SARS病房内外空气中SARS病毒及其RNA的检测 被引量:10
9
作者 魏巍 李劲松 +3 位作者 肖文君 王明连 王洁 辛英 《中国卫生检验杂志》 CAS 2005年第6期648-651,共4页
目的:了解小汤山医院病区空气中的SARS病毒污染情况。方法:2003年6月4日~8日采用FA-II型空气微生物采样器在病房、内走廊、护士站和病房排气口下风向5m处4个地点连续采样4d。之后进行空气样本的洗脱、Vero-E6细胞培养、RT-PCR及序列测... 目的:了解小汤山医院病区空气中的SARS病毒污染情况。方法:2003年6月4日~8日采用FA-II型空气微生物采样器在病房、内走廊、护士站和病房排气口下风向5m处4个地点连续采样4d。之后进行空气样本的洗脱、Vero-E6细胞培养、RT-PCR及序列测定。结果:小汤山医院每天采集19个空气样品,4d共采集76个空气样品。病房、内走廊、护士站和病房排气口下风向5m处4个地点均有病毒核酸检出,其中以病房排气口下风向5m处的阳性率最高(58.3%),护士站相对较低(25.0%);病房(52.1%)和内走廊(50.0%)的阳性率相当。结论:小汤山医院空气中SARS病毒的污染比较严重,急性后期的病患仍然从呼吸道大量排毒;但在病房室内外的空气中没有检测到活的SARS病毒,初步评估认为,SARS病人病房采取通风和消毒的措施对降低室内污染程度是非常有益的;而空气消毒和环境因素对SARS病毒的存活有较大的影响,故SARS病人病房排出的空气对周边环境造成的危害很小。 展开更多
关键词 SARS SARS rna SARS 20036 Vero-E6 RT-PCR
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短发卡样RNA抑制c-myc癌基因在乳腺癌细胞中的过度表达
10
作者 翟荣林 王国斌 《华中医学杂志》 CAS 2005年第3期187-189,共3页
目的构建人cmyc癌基因特异性短发卡样RNA(shRNA)真核表达载体,抑制靶基因cmyc在乳腺癌细胞中的过度表达。方法设计有小发夹结构的三条寡核苷酸序列,克隆至空载体pEGFPC1/U6中构建重组体并体外转染乳腺癌细胞株MCF7,48h后分别用RTPCR和We... 目的构建人cmyc癌基因特异性短发卡样RNA(shRNA)真核表达载体,抑制靶基因cmyc在乳腺癌细胞中的过度表达。方法设计有小发夹结构的三条寡核苷酸序列,克隆至空载体pEGFPC1/U6中构建重组体并体外转染乳腺癌细胞株MCF7,48h后分别用RTPCR和Westernblot方法检测胞内cmyc癌基因mRNA水平和蛋白水平。结果①成功构建shRNA真核表达载体;②shRNA表达载体转染MCF7细胞48h后,pEGFPC1/U62能明显下调胞内cmycmRNA水平和蛋白水平(P<0.01)。结论构建的shRNA真核表达载体能显著抑制cmyc癌基因在MCF7细胞中的过表达。 展开更多
关键词 C-MYC MCF-7 PEGFP-C1 MCF-7 mrna水平 Western rna真核表达 shrna RT-PCR blot
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博尔纳病病毒持续感染细胞系中病毒RNA的原位PCR检测
11
作者 杨爱英 张凤民 +4 位作者 马培林 林志国 刘玉芳 谷鸿喜 生田和良 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2005年第3期170-171,共2页
目的建立检测博尔纳病病毒(BDV)RNA的原位PCR方法。方法首先设计BDV特异性引物以及检测BDV-RNA的原位PCR扩增系统,然后对BDV持续感染细胞(BDV/OL)和正常细胞(OL细胞)爬片进行原位PCR扩增,进而分别用DNA酶或RNA酶消化处理BDV/OL细胞爬片... 目的建立检测博尔纳病病毒(BDV)RNA的原位PCR方法。方法首先设计BDV特异性引物以及检测BDV-RNA的原位PCR扩增系统,然后对BDV持续感染细胞(BDV/OL)和正常细胞(OL细胞)爬片进行原位PCR扩增,进而分别用DNA酶或RNA酶消化处理BDV/OL细胞爬片后,再进行原位PCR扩增。结果经原位PCR扩增后,约60%~70%的BDV持续感染细胞核中出现了阳性反应信号,但正常细胞无信号出现,并且病毒感染细胞中的阳性信号在RNA酶消化作用下消失,但不受DNA酶作用的影响。结论该研究建立的PCR检测方法具有BDV和RNA特异性,可以应用于检测相关动物或神经精神疾病患者的脑组织中BDV-RNA,为进一步证明BDV的致病性奠定基础。 展开更多
关键词 PCR PCR rna PCR DNA
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一种实用的双链RNA病毒基因组克隆方法 被引量:2
12
作者 章松柏 吴祖建 +2 位作者 段永平 谢联辉 林奇英 《长江大学学报(自然科学版)》 CAS 2005年第2期71-73,108,共3页
以克隆水稻矮缩病毒(Rice dwarf virus.RDV)基因组片段 S11、S12为例.报道一种克隆植物dsRNA 病毒基因组的方法。具体过程为:利用 T4 RNA 连接酶将5′-磷酸、3′-氨基修饰的引物 Primer 1连接到 RDV 病毒基因组第11、12片段 dsRNA 的3′... 以克隆水稻矮缩病毒(Rice dwarf virus.RDV)基因组片段 S11、S12为例.报道一种克隆植物dsRNA 病毒基因组的方法。具体过程为:利用 T4 RNA 连接酶将5′-磷酸、3′-氨基修饰的引物 Primer 1连接到 RDV 病毒基因组第11、12片段 dsRNA 的3′-OH 端,经逆转录、退火、补齐形成全长双链 cD-NA,使用单一的互补引物 Primer 2进行 PCR 扩增,扩增产物克隆在 pMD 18-T 载体上.对重组子进行两次限制性内切酶分析,结合序列测定分离鉴定 S11、S12。结果表明,这种方法能同时克隆 RDV 基因片段S11、S12,是一种有效实用的 dsRNA 病毒基因组克隆方法。 展开更多
关键词 双链rna dsrna virus PCR S12 cDNA T
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氟化物对成骨细胞OPGL mRNA和M-CSF mRNA表达的影响 被引量:14
13
作者 华坤 计国义 李广生 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期115-118,共4页
目的 探讨氟对成骨细胞的骨保护蛋白配体 (OPGL)mRNA和巨噬细胞集落刺激因子 (M CSF)mR NA表达的影响。方法 应用酶消化法分离小鼠乳鼠成骨细胞 ,取第 3代成骨细胞 ,加入不同浓度的氟 6h ,提取细胞总RNA ,通过逆转录 聚合酶链式反应 (... 目的 探讨氟对成骨细胞的骨保护蛋白配体 (OPGL)mRNA和巨噬细胞集落刺激因子 (M CSF)mR NA表达的影响。方法 应用酶消化法分离小鼠乳鼠成骨细胞 ,取第 3代成骨细胞 ,加入不同浓度的氟 6h ,提取细胞总RNA ,通过逆转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)方法 ,观察成骨细胞分泌的OPGL和M CSF表达的变化。结果 在氟的作用下 ,成骨细胞的OPGLmRNA和M CSFmRNA的表达呈上升趋势 ,但未达到统计学差异水平。结论 氟有可能通过上调OPGL和M CSF的表达 。 展开更多
关键词 Mrna表达 OPGL M-CSF rna PCR) 3 CFF
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RNase A及其链亲和素融合蛋白在pET系统中的表达
14
作者 刘喜朋 裴冬丽 刘建华 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期52-55,共4页
在大肠杆菌中用pET28a表达载体表达重组RNase A。变性条件下,利用His-Resin亲和纯 化,得到60mg/L电泳纯的RNase A。纯化的RNase A复性后,利用含大量RNA分子的碱法抽提质 粒为底物,测定重组RNase A活性,与商品化的RNase A活性相当。同时... 在大肠杆菌中用pET28a表达载体表达重组RNase A。变性条件下,利用His-Resin亲和纯 化,得到60mg/L电泳纯的RNase A。纯化的RNase A复性后,利用含大量RNA分子的碱法抽提质 粒为底物,测定重组RNase A活性,与商品化的RNase A活性相当。同时在RNase A活性测定体 系中加入4 mol/L尿素会使RNA分子切割效率提高10倍左右。在此基础上,成功表达RNase A 与链亲和素(streptavidjn)的融合蛋白,经纯化复性后,该融合蛋白同时具有核酸酶、biotin结合活 性,在分子生物学中具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 rnaSE pET rna
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BRCA1基因全长mRNA序列分析技术
15
作者 徐红先 周冬仙 +1 位作者 熊文 邵超鹏 《实用医学杂志》 CAS 2005年第12期1340-1341,共2页
目的:建立BRCA1基因全长mRNA序列测定方法。方法:根据文献和GenBank(U14680)报道的BRCA1基本序列设计6对特异性引物,建立6个特异性逆转录PCR(RT-PCR)技术,分段且扩增BRCA1全长mRNA,然后采用毛细管电泳进行cDNA测序,方法建立后用于3名健... 目的:建立BRCA1基因全长mRNA序列测定方法。方法:根据文献和GenBank(U14680)报道的BRCA1基本序列设计6对特异性引物,建立6个特异性逆转录PCR(RT-PCR)技术,分段且扩增BRCA1全长mRNA,然后采用毛细管电泳进行cDNA测序,方法建立后用于3名健康女性样本。结果:6个特异性RT-PCR反应扩增片段相互覆盖,使序列分析结果包括全长BRCA1mRNA,共5000多bp。3名经PCR技术检测确定携带正常BRCA1基因的样本的mRNA分析结果显示,其BRCA1mRNA序列均与过往报道的正常mRNA序列完全一致。结论:所建立的RT-PCR特异性结合BRCA1基因,能用于其mRNA全长序列分析。 展开更多
关键词 BRCA1 rna序列 PCR Mrna RT-PCR DNA PCR PCR)
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AAV-mediated expression of p65shRNA and bone morphogenetic protein 4 synergistically enhances chondrocyte regeneration
16
作者 Yu Yangyi Song Zhuoyue +2 位作者 Lian Qiang Ding Kang Li Guangheng 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第17期3537-3547,共11页
BACKGROUND:Adeno-associated virus(AAV)gene therapy has been proven to be reliable and safe for the treatment of osteoarthritis in recent years.However,given the complexity of osteoarthritis pathogenesis,single gene ma... BACKGROUND:Adeno-associated virus(AAV)gene therapy has been proven to be reliable and safe for the treatment of osteoarthritis in recent years.However,given the complexity of osteoarthritis pathogenesis,single gene manipulation for the treatment of osteoarthritis may not produce satisfactory results.Previous studies have shown that nuclear factorκB could promote the inflammatory pathway in osteoarthritic chondrocytes,and bone morphogenetic protein 4(BMP4)could promote cartilage regeneration.OBJECTIVE:To test whether combined application of AAV-p65shRNA and AAV-BMP4 will yield the synergistic effect on chondrocytes regeneration and osteoarthritis treatment.METHODS:Viral particles containing AAV-p65-shRNA and AAV-BMP4 were prepared.Their efficacy in inhibiting inflammation in chondrocytes and promoting chondrogenesis was assessed in vitro and in vivo by transfecting AAV-p65-shRNA or AAV-BMP4 into cells.The experiments were divided into five groups:PBS group;osteoarthritis group;AAV-BMP4 group;AAV-p65shRNA group;and BMP4-p65shRNA 1:1 group.Samples were collected at 4,12,and 24 weeks postoperatively.Tissue staining,including safranin O and Alcian blue,was applied after collecting articular tissue.Then,the optimal ratio between the two types of transfected viral particles was further investigated to improve the chondrogenic potential of mixed cells in vivo.RESULTS AND CONCLUSION:The combined application of AAV-p65shRNA and AAV-BMP4 together showed a synergistic effect on cartilage regeneration and osteoarthritis treatment.Mixed cells transfected with AAV-p65shRNA and AAV-BMP4 at a 1:1 ratio produced the most extracellular matrix synthesis(P<0.05).In vivo results also revealed that the combination of the two viruses had the highest regenerative potential for osteoarthritic cartilage(P<0.05).In the present study,we also discovered that the combined therapy had the maximum effect when the two viruses were administered in equal proportions.Decreasing either p65shRNA or BMP4 transfected cells resulted in less collagen II synthesis.This implies that inhibiting inflammation by p65shRNA and promoting regeneration by BMP4 are equally important for osteoarthritis treatment.These findings provide a new strategy for the treatment of early osteoarthritis by simultaneously inhibiting cartilage inflammation and promoting cartilage repair. 展开更多
关键词 OSTEOARTHRITIS adeno-associated virus bone morphogenetic protein 4 p65-short hairpin rna gene therapy short hairpin rna transforming growth factor-β1 extracellular matrix articular cartilage chondrocytes.
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Expression signatures of long non-coding RNA and mRNA in human traumatic brain injury 被引量:8
17
作者 Li-Xiang Yang Li-Kun Yang +3 位作者 Jie Zhu Jun-Hui Chen Yu-Hai Wang Kun Xiong 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期632-641,共10页
Long non-coding RNAs(lncRNAs) play a key role in craniocerebral disease, although their expression profiles in human traumatic brain injury are still unclear. In this regard, in this study, we examined brain injury ti... Long non-coding RNAs(lncRNAs) play a key role in craniocerebral disease, although their expression profiles in human traumatic brain injury are still unclear. In this regard, in this study, we examined brain injury tissue from three patients of the 101 st Hospital of the People's Liberation Army, China(specifically, a 36-year-old male, a 52-year-old female, and a 49-year-old female), who were diagnosed with traumatic brain injury and underwent brain contusion removal surgery. Tissue surrounding the brain contusion in the three patients was used as control tissue to observe expression characteristics of lncRNAs and mRNAs in human traumatic brain injury tissue. Volcano plot filtering identified 99 lncRNAs and 63 mRNAs differentially expressed in frontotemporal tissue of the two groups(P < 0.05, fold change > 1.2). Microarray analysis showed that 43 lncRNAs were up-regulated and 56 lncRNAs were down-regulated. Meanwhile, 59 mRNAs were up-regulated and 4 mRNAs were down-regulated. Gene Ontology(GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG) analyses revealed 27 signaling pathways associated with target genes and, in particular, legionellosis and influenza A signaling pathways. Subsequently, a lncRNA-gene network was generated, which showed an absolute correlation coefficient value > 0.99 for 12 lncRNA-mRNA pairs. Finally, quantitative real-time polymerase chain reaction confirmed different expression of the five most up-regulated mRNAs within the two groups, which was consistent with the microarray results. In summary, our results show that expression profiles of mRNAs and lncRNAs are significantly different between human traumatic brain injury tissue and surrounding tissue, providing novel insight regarding lncRNAs' involvement in human traumatic brain injury. All participants provided informed consent. This research was registered in the Chinese Clinical Trial Registry(registration number: ChiCTR-TCC-13004002) and the protocol version number is 1.0. 展开更多
关键词 nerve REGENERATION HUMAN TRAUMATIC brain injuries long noncoding rna messenger rna GO ANALYSIS real-time quantitative POLYMERASE chain reaction biomarkers microarray ANALYSIS biological processes medical informatics neural REGENERATION
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MMP-9反义RNA真核表达载体的构建及鉴定 被引量:1
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作者 唐琳 陈奎生 +2 位作者 张岚 张云汉 高冬玲 《山东医药》 CAS 北大核心 2005年第16期13-14,共2页
目的构建MMP-9反义RNA真核表达载体。方法提取胃癌组织总RNA,按照GenBank中检索的MMP-9基因cDNA序列,设计并合成反义MMP-9基因片段引物,进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),先将扩增产物克隆至pGEM-T载体,再将其反向亚克隆到真核表达质粒pc... 目的构建MMP-9反义RNA真核表达载体。方法提取胃癌组织总RNA,按照GenBank中检索的MMP-9基因cDNA序列,设计并合成反义MMP-9基因片段引物,进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),先将扩增产物克隆至pGEM-T载体,再将其反向亚克隆到真核表达质粒pcDNA3.1中,然后对阳性克隆进行酶切鉴定和测序分析。结果PCR扩增出的反义片段与预期长度相符。构建的MMP-9反义RNA表达质粒pcDNA3.1-MMP-9分别作PCR及双酶切(BamH和Hind)鉴定,证实其中有目的片段完整插入,插入片段测序结果与反义MMP-9序列设计完全一致。结论成功构建了MMP-9反义RNA真核表达载体pcDNA3.1-MMP-9,为进一步研究MMP-9蛋白分子的生物学功能和以MMP-9为靶点的恶性肿瘤的基因治疗研究奠定了基础。 展开更多
关键词 反义rna表达质粒 PCDNA3.1 MMP-9 CDNA PCR BamH rna
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人多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶2基因反义RNA表达质粒的构建及克隆鉴定 被引量:1
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作者 金美芳 刘可人 +3 位作者 周嘉梁 郭向红 潘浩 吴士良 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2005年第2期100-103,106,共5页
目的:研究反义封闭ppGalNAc-T2基因表达对胃癌细胞GC7901细胞增殖以及肿瘤细胞生物学行为的影响,构建反义表达载体并转染胃癌细胞GC7901。方法:在对几种肿瘤细胞的ppGalNAc-T2基因的表达水平分析后,以高表达ppGalNAc-T2的人胃癌细胞GC7... 目的:研究反义封闭ppGalNAc-T2基因表达对胃癌细胞GC7901细胞增殖以及肿瘤细胞生物学行为的影响,构建反义表达载体并转染胃癌细胞GC7901。方法:在对几种肿瘤细胞的ppGalNAc-T2基因的表达水平分析后,以高表达ppGalNAc-T2的人胃癌细胞GC7901的总RNA为模板,利用RTPCR方法扩增两段不同长度ppGalNAc-T2基因片段,构建反义表达载体并转染胃癌细胞GC7901,通过G418筛选,建立一系列旨在封闭胃癌细胞GC7901细胞ppGalNAc-T2基因表达的亚细胞克隆。通过荧光显微镜、RT-PCR技术手段检测封闭反义ppGalNAc-T2基因RNA表达。结果:ppGalNAc-T2反义表达质粒载体pEGFP-FDT2和pEGFPFX-T2经限制性酶切及部分序列分析证明基因已正确插入载体中,荧光显微镜及RTPCR显示转染成功。结论:成功构建了ppGalNAc-T2反义表达质粒载体,反义封闭ppGalNAc-T2基因表达后,胃癌细胞GC7901ppGalNAc-T2的含量明显降低,为进一步研究ppGalNAc-T2奠定了基础。 展开更多
关键词 反义rna表达质粒 ppGalNAc-T2 RT-PCR rna
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百合花瓣总RNA提取方法的研究 被引量:26
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作者 郝福玲 刘雅莉 王跃进 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期1143-1147,共5页
以亚洲百合品种Pollyanna和东方百合品种Sorbonne为试材,在比较异硫氰酸胍法、SDS/酚法与CTAB-L i Cl法提取总RNA效果的基础上,针对百合组织中富含多糖的特点,在Sorbonne提取RNA中加入特殊除多糖步骤,改进了CTAB- L i Cl法.结果表明,改... 以亚洲百合品种Pollyanna和东方百合品种Sorbonne为试材,在比较异硫氰酸胍法、SDS/酚法与CTAB-L i Cl法提取总RNA效果的基础上,针对百合组织中富含多糖的特点,在Sorbonne提取RNA中加入特殊除多糖步骤,改进了CTAB- L i Cl法.结果表明,改进CTAB- L i Cl法能有效去除多糖,提取到的RNA2 8S r RNA亮度约为18S r RNA的2倍,A2 6 0 / 2 80介于1.8~2 .0之间,A2 6 0 / 2 30为2 .0 ,Pollyanna RNA产率为36 .3μL·g- 1 ,Sor-bonne RNA产率为10 .2 μL·g- 1 ,经RT- PCR获得了特异性条带,说明用改进CTAB- L i Cl法从百合花瓣中提取到的RNA质量好、产率高、完整性强,完全适合于进一步的分子生物学研究. 展开更多
关键词 rna提取方法 LiCl CTAB RT-PCR rrna rna SDS 28S 18S
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