组织血型抗原:轮状病毒可能的潜在受体

轮状病毒(RVs)是引起婴幼儿及动物非细菌性胃肠炎的重要病原体.研究发现,人类组织血型抗原(HBGAs)可能是RVs的结合受体.HBGAs具有丰富的多态性,包含ABO、分泌型及Lewis抗原.研究表明,不同P型的RVs与HBGAs的结合具有型特异性,而且不同人群对各型RVs易感性存在差异.因此,研究RVs与HBGAs的相互作用对于阐明RV感染的致病机理及RV疫苗的设计具有重要意义.

基于虚拟筛选与分子动力学模拟探究轮状病毒抑制剂研发

目的:探究人优势轮状病毒毒株(Rotaviruses,RVs)VP8;是否存在与脂肪酸保守性结合的位点,从中筛选出与VP8;靶点特异性结合的分子。方法:应用分子对接的方法,搜寻VP8;与脂肪酸分子结合的可能位点,并利用虚拟筛选从包含7655个化合物的数据库中针对潜在位点进行对接,然后对得分高的蛋白配体复合物进行分子动力学(MD)模拟。结果:分子对接发现脂肪酸酸结合于VP8表面的似峡谷的口袋,脂肪酸与预测的口袋之间形成了较强的相互作用;虚拟筛选打分与MD模拟的参数证实了Doxorubicin-Semiquinone、 ZINC000004216238VP8结合的稳定性。结论:人优势流行株轮状病毒蛋白VP8;与脂肪酸分子结合具有保守性,Doxorubicin-Semiquinone、ZINC000004216238可以作为人轮状病毒的潜在抑制剂的分子骨架。