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奥奈达希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)MR-1对氟西汀降解过程的转录组及功能基因分析
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作者 万宇 杭小帅 +7 位作者 王志刚 张澜 周莉 尤晓慧 朱冬冬 王燕 肖静 陈翔 《生态与农村环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期532-540,共9页
该文研究了厌氧条件下奥奈达希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)MR-1对氟西汀的降解性能,并从转录组学分析遗传分子代谢机制。结果表明,Shewanella oneidensis MR-1在厌氧条件下可有效降解体系中93.12%的氟西汀,降解速率达0.94 mg·L^... 该文研究了厌氧条件下奥奈达希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)MR-1对氟西汀的降解性能,并从转录组学分析遗传分子代谢机制。结果表明,Shewanella oneidensis MR-1在厌氧条件下可有效降解体系中93.12%的氟西汀,降解速率达0.94 mg·L^(-1)·h^(-1)。采用Illumina高通量测序平台对降解氟西汀后的细菌与对照组细菌进行测序,通过基因本体数据库(GO)和京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)富集分析,结合筛选的高表达高上调的差异表达基因,得到了耐受和降解氟西汀的功能基因,其中包膜应激反应膜蛋白基因、ABC转运蛋白基因、噬菌体休克蛋白PspA基因、氧化应激防御蛋白基因等在Shewanella oneidensis MR-1对环境的耐受中起重要作用;细胞色素C基因、硝基还原酶NfsB基因、乳酸利用蛋白基因等在氟西汀的降解转化中起关键作用。该研究从转录组水平分析了氟西汀的降解机制,可为Shewanella oneidensis MR-1在环境修复中的应用提供参考依据。 展开更多
关键词 shewanella oneidensis MR-1 氟西汀 转录组 差异表达基因 功能基因
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铁矿物协同Shewanella oneidensis MR-1介导的钒(V(Ⅴ))还原及其作用机制
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作者 周雅琪 陈钱砚语 +1 位作者 张杰 司友斌 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第10期5499-5512,共14页
矿物协同微生物可以将高毒性的V(Ⅴ)还原为毒性及流动性较低的V(Ⅳ),从而达到治理钒污染的目的.以希瓦氏菌Shewanella oneidensis MR-1为试验菌株,采用黄铁矿、菱铁矿、马基诺矿3种铁矿物作为受试矿物,考察铁矿物协同微生物对V(Ⅴ)的还... 矿物协同微生物可以将高毒性的V(Ⅴ)还原为毒性及流动性较低的V(Ⅳ),从而达到治理钒污染的目的.以希瓦氏菌Shewanella oneidensis MR-1为试验菌株,采用黄铁矿、菱铁矿、马基诺矿3种铁矿物作为受试矿物,考察铁矿物协同微生物对V(Ⅴ)的还原特性,探讨影响V(Ⅴ)还原的因素,并研究马基诺矿协同S.oneidensis MR-1还原V(Ⅴ)对胞内酶活性、胞外聚合物(EPS)及电子传递的影响,解析铁矿物协同微生物介导的V(Ⅴ)还原机制.结果表明,3种铁矿物均能促进S.oneidensis MR-1对V(Ⅴ)的还原,其中马基诺矿的效果最佳,V(Ⅴ)还原率由对照组的80.84%提高到95.54%.马基诺矿协同S.oneidensis MR-1还原V(Ⅴ)的还原率与初始V(Ⅴ)浓度及pH值成反比,与矿物添加量及接菌量成正比.添加马基诺矿后,胞内的硝酸盐还原酶(NAR)、亚硝酸盐还原酶(NIR)、还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)及ATP水平均有不同程度的提高,EPS中蛋白质、多糖和核酸的含量增加,电子传递能力增强,从而促进V(Ⅴ)生物还原.扫描电镜-能量散射X射线谱(SEM-EDS)和X射线光电子能谱(XPS)显示,马基诺矿促进S.oneidensis MR-1将V(Ⅴ)还原为不溶性V(Ⅳ),形成沉淀聚集在菌体周围. 展开更多
关键词 钒(Ⅴ) shewanella oneidensis MR-1 马基诺矿 亚硝酸还原酶 胞外聚合物 电子传递
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Shewanella oneidensis MR-1对地下水低渗透区中Cr(Ⅵ)和硝酸盐的协同异化还原
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作者 贡玉凤 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第5期2473-2482,共10页
Cr(Ⅵ)和硝酸盐是地下水中常见的复合污染物,且有可能通过迁移扩散至低渗透区而导致其修复问题被忽视.利用Shewanella oneidensis MR-1作为功能微生物,分别研究了摇瓶和非均质模拟装置中两种污染物的协同异化还原过程.结果表明:摇瓶实验... Cr(Ⅵ)和硝酸盐是地下水中常见的复合污染物,且有可能通过迁移扩散至低渗透区而导致其修复问题被忽视.利用Shewanella oneidensis MR-1作为功能微生物,分别研究了摇瓶和非均质模拟装置中两种污染物的协同异化还原过程.结果表明:摇瓶实验中,Cr (Ⅵ)的去除主要依赖于初始菌浓度,而受硝酸盐浓度、电子供体乳酸盐浓度的影响较小.反之,硝酸盐的还原则明显受到Cr (Ⅵ)的抑制,当Cr(Ⅵ)浓度在0到0.02mmol/L时,其一级动力学还原速率从0.635h^(-1)降至0.164h^(-1).同时,乳酸盐氧化也明显受到Cr(Ⅵ)的抑制,表明Shewanella oneidensis MR-1的代谢过程可能受到了Cr(Ⅵ)的毒性干扰.在非均相装置实验中,Cr(Ⅵ)进水浓度小于等于5mg/L(约0.1mmol/L)时,15d基本可以完全去除,对应硝酸盐去除60%左右;当Cr(Ⅵ)浓度增至10mg/L (约0.2mmol/L)时,Cr(Ⅵ)和硝酸盐的去除率分别降至40%和50%左右.装置内截留的Cr(Ⅵ)还原产物以Cr(OH)_3为主,硝酸盐的还原产物以氨为主. 展开更多
关键词 shewanella oneidensis MR-1 六价铬 硝酸盐
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Aggregation-regulated bioreduction process of graphene oxide by Shewanella bacteria
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作者 Kaixin Han Yibo Zeng +2 位作者 Yinghua Lu Ping Zeng Liang Shen 《Chinese Journal of Chemical Engineering》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第5期56-62,共7页
The bioreduction of graphene oxide(GO)using environmentally functional bacteria such as Shewanella represents a green approach to produce reduced graphene oxide(rGO).This process differs from the chemical reduction th... The bioreduction of graphene oxide(GO)using environmentally functional bacteria such as Shewanella represents a green approach to produce reduced graphene oxide(rGO).This process differs from the chemical reduction that involves instantaneous molecular reactions.In bioreduction,the contact of bacterial cells and GO is considered the rate-limiting step.To reveal how the bacteria-GO integration regulates rGO production,the comparative experiments of GO and three Shewanella strains were carried out.Fourier-transform infrared spectroscopy,X-ray photoelectron spectroscopy,Raman spectroscopy,and atomic force microscopy were used to characterize the reduction degree and the aggregation degree.The results showed that a spontaneous aggregation of GO and Shewanella into the condensed entity occurred within 36 h.A positive linear correlation was established,linking three indexes of the aggregation potential,the bacterial reduction ability,and the reduction degree(ID/IG)comprehensively. 展开更多
关键词 Graphene oxide Reduced graphene oxide BIOREDUCTION AGGREGATION shewanella
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Biological Characteristics and Pathogenicities of Shewanella algae and Shewanella abalone from Babylonia 被引量:3
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作者 李淑芳 张继东 +2 位作者 邱德全 杨世平 黄子通 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2015年第9期1845-1850,1859,共7页
[Objective] The biological characteristics and pathogenicities of Shewanella algae and Shewanella abalone from Babylonia were studied in this paper. [Method]The hemolytic bacteria were isolated from the hepatopancreas... [Objective] The biological characteristics and pathogenicities of Shewanella algae and Shewanella abalone from Babylonia were studied in this paper. [Method]The hemolytic bacteria were isolated from the hepatopancreas of Babylonia suffered from proboscis edema with blood agar plate. The dominant bacterial community in the ill Babylonia was identified by 16 S r DNA sequence analysis, and the bacterial cultural and biochemical characteristics and pathogenicities were studied. [Result]The Shewanella bacteria, including Shewanella algae and Shewanella abalone, are the dominant bacterial community in Babylonia suffered from proboscis edema.The colony characteristics of Shewanella algae in nutrient agar medium, TCBS agar medium and CHROMagar vibrio colored medium were similar to those of Shewanella abalone. Shewanella algae possessed β-hemolysis and Shewanella abalone possessed α-hemolysis in the blood agar plate. The biochemical reaction of Shewanella algae and Shewanella abalone was all of non-fermentation type. The results of artificial infection test showed that half lethal dose(LD50) of the test strains of Shewanella algae was 10-5.50/0.1 ml. The test strains of Shewanella algae have strong toxicity, and could cause mice and chickens to die of sepsis with mortality of100%. The mortality of Babylonia infected with Shewanella algae was 10%; while the survived Babylonia lost the ability of moving and intaking for a long time, but they were not suffered from proboscis edema. There was no death in mice or chicks infected with Shewanella abalone, but their livers and spleens were slightly hyperemic and swelling. There was also no death in Babylonia infected with Shewanella abalone, but their intaking and moving ability was lost for a short time.[Conclusion] Although Shewanella algae and Shewanella abalone were the dominant bacteria in Babylonia suffered from proboscis edema, they were not the main pathogenic bacteria for proboscis edema. Shewanella algae had strong pathogenicity to mice, chicks and Babylonia, while Shewanella abalone showed no marked pathogenicity to those experimental animals in this study. 展开更多
关键词 shewanella algae shewanella abalone Biological characteristics PATHOGENICITY Babylonia
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U(VI) reduction by Shewanella oneidensis mediated by anthraquinone-2-sulfonate 被引量:3
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作者 刘金香 谢水波 +4 位作者 王永华 刘迎九 蔡萍莉 熊芬 王文涛 《Transactions of Nonferrous Metals Society of China》 SCIE EI CAS CSCD 2015年第12期4144-4150,共7页
Anthraquinone-2-sulfonate(AQS) was employed in humus substitutes to evaluate the effects and influencing factors of U(VI) reduction by Shewanella oneidensis MR-1(S. oneidensis MR-1) under anaerobic condition. Th... Anthraquinone-2-sulfonate(AQS) was employed in humus substitutes to evaluate the effects and influencing factors of U(VI) reduction by Shewanella oneidensis MR-1(S. oneidensis MR-1) under anaerobic condition. The removal rate of U(VI) at 30 °C reaches 99.0% afterd 96 h with the p H value of 7.0 and AQS concentration of 1.0 mmol/L. The effective concentrations of AQS as the accelerator for U(VI) bioreduction are approximately 0.5-1.0 mmol/L. The bioreduction of U(VI) is inhibited when the concentration of AQS exceeds 2.0 mmol/L. The coexistence of ions, such as Cu2+, Cr6+, Mn2+, shows a remarkable negative effect on the U(VI) reduction, and Zn2+ shows less influence on the process compared with other tested ions. The U(VI) reduction is remarkably inhibited when the concentration of nitrate ion exceeds 1.0 mmol/L. Otherwise, no difference is found when the nitrate ion concentration is less than 0.5 mmol/L. Sulfate ion(5.0 mmol/L) slightly promotes the U(VI) reduction. Zero-valent iron(ZVI) promotes the U(VI) reduction by S. oneidensis, and the reduction rate improves with increasing the amount of ZVI in the range of 0-2.0 g/L. The XPS result indicates that uranium deposits on the cell surface are in U(VI) and U(IV) forms, and the majority of uranium in the solution is stable UO2. 展开更多
关键词 U(VI) anthraquinone-2-sulfonate(AQS) shewanella oneidensis XPS
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南极Shewanella sp.NJ49低温降解酶的定域及特性研究 被引量:1
7
作者 王以斌 刘晋 +3 位作者 刘芳明 缪锦来 郑洲 单连菊 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2011年第A01期43-48,共6页
石油烃的微生物降解过程与微生物细胞所包含的酶及其酶促反应有关,本文以南极低温降解菌Shewanellasp.NJ49为研究对象,采用2216E和MMC人工海水培养基培养,利用静息细胞技术提取NJ49的胞外酶、膜周酶及膜内酶,研究三种酶对正十六烷... 石油烃的微生物降解过程与微生物细胞所包含的酶及其酶促反应有关,本文以南极低温降解菌Shewanellasp.NJ49为研究对象,采用2216E和MMC人工海水培养基培养,利用静息细胞技术提取NJ49的胞外酶、膜周酶及膜内酶,研究三种酶对正十六烷的低温降解能力、代谢产物分析,测定不同分子量区段酶的活性。结果表明:胞外酶对正十六烷的降解率为63%,膜周酶的降解率小于38%,膜内酶无降解能力,Shewanellasp.NJ49低温降解酶主要定域为胞外酶和膜周酶;酶代谢过程中生成十六醛、十六醇为主的产物,酶以末端氧化方式完成初始降解;烷烃氧化的关键酶(羟化酶)集中在分子量为3万~10万的区段。 展开更多
关键词 shewanella sp.NJ49 正十六烷 定域 胞外酶
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Shewanella燃料电池的原理、组成和性能 被引量:1
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作者 陈慧 郑平 +2 位作者 谢作甫 张吉强 Abbas Ghulam 《环境科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期37-41,61,共6页
微生物燃料电池(MFC)具有治污、产电、研究生物电化学性能等诸多功能,应用前景广阔。Shewanella燃料电池是最早问世的无介体MFC,已有较为全面、深入、系统的研究,可作为探索其他MFC的范例。该文综述了Shewanella燃料电池的生物学原理、... 微生物燃料电池(MFC)具有治污、产电、研究生物电化学性能等诸多功能,应用前景广阔。Shewanella燃料电池是最早问世的无介体MFC,已有较为全面、深入、系统的研究,可作为探索其他MFC的范例。该文综述了Shewanella燃料电池的生物学原理、结构组成以及治污产电性能,并展望了MFC的发展趋势。 展开更多
关键词 shewanella 微生物燃料电池 原理 组成 性能
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Shewanella oneidensis MR-1和Shewanella putrefaciens对V(Ⅴ)的还原及其影响因素 被引量:5
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作者 李劲 杨玉蓉 +2 位作者 朱广森 刘小红 司友斌 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期414-421,共8页
在实验室模拟培养条件下,研究Shewanella oneidensis MR-1和Shewanella putrefaciens在厌氧体系中对Ⅴ(Ⅴ)的耐性试验,探讨在不同的Ⅴ(Ⅴ)浓度、接菌量、pH值和不同蒽醌-2,6-二磺酸(AQDS)浓度下对Ⅴ(Ⅴ)还原的影响,并通过扫描电镜(SEM)... 在实验室模拟培养条件下,研究Shewanella oneidensis MR-1和Shewanella putrefaciens在厌氧体系中对Ⅴ(Ⅴ)的耐性试验,探讨在不同的Ⅴ(Ⅴ)浓度、接菌量、pH值和不同蒽醌-2,6-二磺酸(AQDS)浓度下对Ⅴ(Ⅴ)还原的影响,并通过扫描电镜(SEM)和X射线光电子能谱(XPS)进行表征.结果表明Ⅴ(Ⅴ)浓度低于10mg/L时对S.oneidensis MR-1和S.putrefaciens的生长影响较小,Ⅴ(Ⅴ)浓度超过20mg/L则会抑制其生长和Ⅴ(Ⅴ)的还原;随着接菌量的增加,2种微生物对Ⅴ(Ⅴ)的还原能力逐渐增强;2种微生物最适生长pH值均为7.0左右,弱碱性环境下2种微生物对Ⅴ(Ⅴ)的还原率高于弱酸性环境;添加1mmol/L AQDS会加快2种微生物对Ⅴ(Ⅴ)的还原.菌株培养3d后通过SEM分析,S.oneidensis MR-1和S.putrefaciens进行Ⅴ(Ⅴ)还原的同时也伴有少量的吸附作用.利用XPS能谱分析表明S.oneidensis MR-1和S.putrefaciens将Ⅴ(Ⅴ)还原为Ⅴ(Ⅳ). 展开更多
关键词 Ⅴ(Ⅴ) shewanella oneidensis MR-1 shewanella putrefaciens 生物还原 X射线光电子能谱
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南极低温降解菌Shewanella sp.NJ49羟化酶分离纯化及最适产酶条件研究
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作者 刘芳明 王以斌 +4 位作者 曲长凤 梁强 郑洲 缪锦来 肖天 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1-8,共8页
羟化酶是细菌降解烷烃的关键酶,本文以南极低温降解菌Shewanella sp.NJ49为研究对象,通过硫酸铵沉淀、超滤浓缩及葡聚糖凝胶Sephadex G-75柱层析方法,分离纯化NJ49的羟化酶,获得了单一羟化酶组分,研究了温度、p H、表面活性剂和盐度等... 羟化酶是细菌降解烷烃的关键酶,本文以南极低温降解菌Shewanella sp.NJ49为研究对象,通过硫酸铵沉淀、超滤浓缩及葡聚糖凝胶Sephadex G-75柱层析方法,分离纯化NJ49的羟化酶,获得了单一羟化酶组分,研究了温度、p H、表面活性剂和盐度等环境因素对NJ49羟化酶酶活活性影响。结果表明,羟化酶组分由α、β、γ三个亚基组成,分子质量分别为56,45和36 k D。NJ49最适产酶条件为:温度15℃、p H7.2、盐度55;不同类型表面活性剂对酶的活性影响效应不一,两性离子表面活性剂、阳离子表面活性剂、非离子表面活性剂对酶活没有作用,阴离子表面活性剂+非离子表面活性剂混和剂和阳离子表面活性剂+非离子表面活性剂混和剂能提高羟化酶的活性。 展开更多
关键词 shewanella 羟化酶 分离纯化 环境因素
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产EPA南极嗜冷菌Shewanella frigidimarina NJ136的筛选鉴定及培养条件
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作者 张波涛 麻金海 +1 位作者 方龙 王国栋 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2011年第A01期122-129,共8页
从200余株南极海冰细菌中筛选出1株二十碳五烯酸(EPA)高产南极嗜冷菌株NJ136作为研究对象,对其进行了16SrRNA序列分析;并探讨了在摇瓶培养条件下,生长温度、碳源、氮源3种主要环境因子对该菌株的生长和产EPA的影响。结果发现:该... 从200余株南极海冰细菌中筛选出1株二十碳五烯酸(EPA)高产南极嗜冷菌株NJ136作为研究对象,对其进行了16SrRNA序列分析;并探讨了在摇瓶培养条件下,生长温度、碳源、氮源3种主要环境因子对该菌株的生长和产EPA的影响。结果发现:该菌株系Shewanella菌属,与S.frigidimarina属于同一菌种;该菌株的EPA含量随着温度升高而降低,其最佳碳源和氮源分别为葡萄糖和酵母膏,质量体积浓度分别为10g/L和2g/L。 展开更多
关键词 EPA 嗜冷 shewanella 南极细菌
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Shewanella haliotis BP-1海藻酸裂解酶基因的克隆表达
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作者 黄桂媛 温顺华 +4 位作者 李锋 卢明倩 王巧贞 廖威 黄庶识 《广西科学》 CAS 2016年第3期228-233,共6页
【目的】了解海洋细菌Shewanella haliotis B P-1中海藻酸裂解酶降解海藻酸钠的生物活性。【方法】应用基因克隆和大肠杆菌异源表达技术,过量表达海藻酸裂解酶,将粗酶液通过 DEAE Sepharose FF柱分离纯化后检测其酶活性。【结果】从S.ha... 【目的】了解海洋细菌Shewanella haliotis B P-1中海藻酸裂解酶降解海藻酸钠的生物活性。【方法】应用基因克隆和大肠杆菌异源表达技术,过量表达海藻酸裂解酶,将粗酶液通过 DEAE Sepharose FF柱分离纯化后检测其酶活性。【结果】从S.haliotis BP-1菌株的基因组DNA中克隆得到一个大小为2157 bp的海藻酸裂解酶基因Alg17S ,该基因编码的海藻酸裂解酶 Alg17S属于PL17家族的蛋白,大小为79726 Da,其中包括N端26个氨基酸的信号肽,与Saccharophagus degradans 2-40菌株产生的海藻酸裂解酶 Alg17C 具有高度同源性,相似性为52%。经纯化后获得的重组酶 Alg17S和△snAlg17S(N端不含26个氨基酸的信号肽)均具有降解海藻酸钠的活性,但△snAlg17S对海藻酸钠的催化活性比 Alg17S高,其酶比活力高达9635 U/mg。【结论】重组海藻酸裂解酶△snAlg17S兼具高表达水平及高酶活性,是进一步研究海藻酸盐糖化和生物燃料生产的潜在的优势酶。 展开更多
关键词 海藻酸裂解酶 克隆表达 酶活性测定 shewanella HALIOTIS BP-1
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利用RAP-PCR检测高盐刺激下Shewanella piezotolerans WP3的基因差异表达
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作者 李升康 李金媛 王玉桥 《长江大学学报(自科版)(中旬)》 CAS 2009年第1期64-67,84,共5页
选取高盐刺激为条件,利用实验室模拟极端环境培养条件下的菌体提取RNA,采用差异显示方法RAP-PCR扫描盐刺激下基因的差异表达。结果表明,在高盐刺激下,WP3下调表达的基因是SS1:hypothetical protein;SS2:ferroxidase。上调的基因是SS3:ga... 选取高盐刺激为条件,利用实验室模拟极端环境培养条件下的菌体提取RNA,采用差异显示方法RAP-PCR扫描盐刺激下基因的差异表达。结果表明,在高盐刺激下,WP3下调表达的基因是SS1:hypothetical protein;SS2:ferroxidase。上调的基因是SS3:gamme-butyrobetaine antiporter;SS4:hypothetical protein。 展开更多
关键词 shewanella piezotolerans WP3 差异显示 高盐刺激 基因表达
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Shewanella oneidensis MR-1对Cr(Ⅵ)的还原及其影响因素 被引量:17
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作者 杜艳影 刘小红 +2 位作者 李劲 李磊明 司友斌 《中国环境科学》 EI CAS CSSCI CSCD 北大核心 2018年第7期2740-2745,共6页
在实验室纯培养条件下,探讨厌氧体系中Shewanella oneidensis MR-1对Cr(Ⅵ)的还原能力,采用扫描电镜(SEM)-能谱(EDS)、X射线光电子能谱(XPS)等方法进行表征.结果表明,S.oneidensis MR-1介导下不同浓度Cr(Ⅵ)的生物转化与微生物对铬的耐... 在实验室纯培养条件下,探讨厌氧体系中Shewanella oneidensis MR-1对Cr(Ⅵ)的还原能力,采用扫描电镜(SEM)-能谱(EDS)、X射线光电子能谱(XPS)等方法进行表征.结果表明,S.oneidensis MR-1介导下不同浓度Cr(Ⅵ)的生物转化与微生物对铬的耐受特性密切相关,低浓度Cr(Ⅵ)对其生长影响不大,高浓度时细菌生长则受到抑制,进而抑制Cr(Ⅵ)的还原率;菌株对Cr(Ⅵ)的还原作用随着接种菌悬液量的增加而增强;菌株最适生长p H值为中性,弱碱性环境比酸性环境更有利于菌株对Cr(Ⅵ)的还原;增加Fe(III)的量会加快Cr(Ⅵ)完全还原的速率.通过SEM-EDS和XPS分析,在对Cr(Ⅵ)进行处理5d后,菌体表面有Cr(Ⅵ)和Cr(III)两种形态存在,证实S.oneidensis MR-1在对Cr(Ⅵ)进行还原的同时也伴有少量的吸附作用.微生物还原为环境中Cr(Ⅵ)的去除以及解毒提供了一种有效的方法. 展开更多
关键词 CR(VI) shewanella oneidensis MR-1 生物还原 X射线光电子能谱
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Shewanella oneidensis MR-1还原铁帽过程中的矿物相转变和重金属的释放 被引量:5
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作者 张蕊 陆现彩 +3 位作者 刘欢 李娟 向婉丽 陈笑夜 《矿物岩石地球化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期316-322,共7页
本文以江西武山吴家山铜矿铁帽为研究对象、以合成针铁矿为对照,研究异化铁还原菌Shewanella oneidensis MR-1还原铁帽过程中的矿物物相变化和重金属的释放。使用邻菲啰呤法、ICP-OES、SEM、TEM、XRD和FTIR等分析方法,系统表征了实验体... 本文以江西武山吴家山铜矿铁帽为研究对象、以合成针铁矿为对照,研究异化铁还原菌Shewanella oneidensis MR-1还原铁帽过程中的矿物物相变化和重金属的释放。使用邻菲啰呤法、ICP-OES、SEM、TEM、XRD和FTIR等分析方法,系统表征了实验体系中矿物物相和溶液化学组成的变化。Fe的释放趋势表明MR-1菌株还原了铁帽中的高铁矿物,并导致铁帽中重金属元素的释放。由于菌体和次生矿物的影响,不同重金属元素的活动性存在差异,Mn和As多以次生矿物形式再次沉淀,而菌体对Zn和Cu、Pb的吸附能力较强。同时发现死菌组中亦有高铁矿物被还原的现象,可能与有机质的还原有关。 展开更多
关键词 异化铁还原 重金属迁移 铁帽 shewanella oneidensis MR-1
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产EPA海洋细菌Shewanella baltica 6-42全基因组测序及比较基因组分析 被引量:2
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作者 肖康 彭云峰 +2 位作者 罗玲 彭方 万霞 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期404-413,共10页
新近发现来源于北极的海洋细菌Shewanella baltica 6-42在低温条件下合成超长链多不饱和脂肪酸二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid C20∶5,EPA)。为了进一步探讨EPA合成调控机理,本研究通过第三代高通量测序技术对S.baltica 6-42菌株... 新近发现来源于北极的海洋细菌Shewanella baltica 6-42在低温条件下合成超长链多不饱和脂肪酸二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid C20∶5,EPA)。为了进一步探讨EPA合成调控机理,本研究通过第三代高通量测序技术对S.baltica 6-42菌株进行全基因组测序,得到高质量且无间断的总长度为5.15 Mb的全基因组序列信息。分析表明全基因组的GC含量为46.17%,预测编码基因有4 597个,共有2 577个基因具有明确的生物学功能,其中348个基因参与环境适应性调节,60个基因参与油脂代谢途径。全基因组存在64 053个甲基化修饰位点,且甲基化修饰类型主要是m6A和少量的m4C。根据同源序列比对,解析了该菌株中参与EPA合成的聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)途径5个关键基因及调控因子。同时对脂肪酸合成途径的其他关键基因和次级代谢产物合成基因簇进行了预测。根据已报道的另两株不同亚种S.baltica OS155和S.baltica OS678的基因组信息进行全基因组关联比较分析,结果显示三株细菌都保存有参与合成EPA的PKS基因簇,但其他功能基因的进化差异较大。本研究结果为S.baltica 6-42 EPA合成关键基因以及其他功能基因的挖掘和应用提供数据支持。 展开更多
关键词 shewanella BALTICA 二十碳五烯酸 第三代全基因组测序 聚酮合酶途径
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厌氧下Shewanella marisflavi EP1还原转化二甲戊乐灵 被引量:3
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作者 宁国静 李非里 黄杰勋 《环境科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期19-24,共6页
二甲戊乐灵是农业生产中使用量较大的一种芽前二硝基苯胺除草剂,其在环境中的持久性已经引起广泛关注。为更好地理解其在厌氧条件下的环境归趋,文章研究了Shewanella marisflavi EP1厌氧生物转化二甲戊乐灵的能力以及不同环境因子对该... 二甲戊乐灵是农业生产中使用量较大的一种芽前二硝基苯胺除草剂,其在环境中的持久性已经引起广泛关注。为更好地理解其在厌氧条件下的环境归趋,文章研究了Shewanella marisflavi EP1厌氧生物转化二甲戊乐灵的能力以及不同环境因子对该转化的影响。试验以乳酸钠作为电子供体,二甲戊乐灵为唯一的电子受体,EP1为还原菌,分别考察不同的反应体系和条件下EP1的生长及其对二甲戊乐灵还原的情况。结果表明,S.marisflavi EP1在厌氧条件下能有效还原转化二甲戊乐灵,核黄素的存在加快了还原反应速率,而呼吸抑制剂能够延迟甚至终止还原转化反应,表明二甲戊乐灵的还原转化是与电子传递链相关联的微生物呼吸过程。此外,EP1还原二甲戊乐灵的最优条件分别为p H 8,温度35℃,盐度2%。该研究不仅扩展了希瓦氏菌利用电子受体的潜力,也为处理硝基苯胺类农药的污染修复提供依据。 展开更多
关键词 shewanella marisflavi 二甲戊乐灵 生物转化 厌氧还原
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Shewanella oneidensis MR-1/还原氧化石墨烯复合材料的制备及其光催化性能 被引量:2
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作者 陶文雨 谢韦 邓国志 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期720-725,共6页
利用异化金属还原菌Shewanella oneidensis MR-1还原氧化石墨烯,合成S.oneidensis MR-1/还原氧化石墨烯复合材料,通过透射电子显微镜(TEM)、X射线衍射(XRD)、X射线光电子能谱分析(XPS)对复合材料进行表征分析,同时研究该复合材料光催化... 利用异化金属还原菌Shewanella oneidensis MR-1还原氧化石墨烯,合成S.oneidensis MR-1/还原氧化石墨烯复合材料,通过透射电子显微镜(TEM)、X射线衍射(XRD)、X射线光电子能谱分析(XPS)对复合材料进行表征分析,同时研究该复合材料光催化降解结晶紫的催化效果.结果表明,棒状微生物的表面包裹着还原氧化石墨烯薄膜,从而形成复合材料.在厌氧条件下,可见光可以促进该复合材料对结晶紫的脱色效率;同时,在结晶紫降解过程中,提出了耦合还原氧化石墨烯的光催化作用和S.oneidensis MR-1生物降解作用的机理,为生物光催化降解体系的降解机理提供了新的见解. 展开更多
关键词 shewanella oneidensis MR-1 石墨烯 光催化 耦合光催化 生物降解
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脱色希瓦氏菌(Shewanella decolorationis)S12^T的脱色特性 被引量:23
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作者 许玫英 钟小燕 +3 位作者 曹渭 郭俊 岑英华 孙国萍 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期5-9,共5页
从印染废水活性污泥中分离到一株高效染料脱色菌,经鉴定该菌株为希瓦氏菌属的一个新种,命名为脱色希瓦氏菌(Shewanelladecolorationis)S12T。该菌株在偶氮染料浓度为50mg/L的培养基中培养4h后,染料去除率达到96%,对偶氮染料的最高脱色... 从印染废水活性污泥中分离到一株高效染料脱色菌,经鉴定该菌株为希瓦氏菌属的一个新种,命名为脱色希瓦氏菌(Shewanelladecolorationis)S12T。该菌株在偶氮染料浓度为50mg/L的培养基中培养4h后,染料去除率达到96%,对偶氮染料的最高脱色浓度达到2000mg/L。在浓度为500mg/L的偶氮染料平板上生长4d后,可观察到明显的脱色圈。全波长光谱扫描的结果表明希瓦氏菌S12T以生物降解的方式对偶氮染料进行脱色。希瓦氏菌S12T的脱色酶为组成型的胞内酶。 展开更多
关键词 脱色希瓦氏菌S12^T 偶氮染料 脱色
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深海嗜冷希瓦氏菌Shewanella psychrophila WP2的基因组学分析 被引量:1
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作者 聂唱 侯佳林 +1 位作者 王寅炤 蹇华哗 《应用海洋学学报》 CSCD 北大核心 2020年第3期319-328,共10页
嗜冷希瓦氏菌Shewanella psychrophila WP2分离自深海沉积物,其拥有目前希瓦氏菌属(Shewanella)中最大的基因组,为6.4 Mb。通过对S.psychrophila WP2的完整基因组进行系统发育和代谢潜能分析,并与相近菌株进行比较,探究WP2拥有较大基因... 嗜冷希瓦氏菌Shewanella psychrophila WP2分离自深海沉积物,其拥有目前希瓦氏菌属(Shewanella)中最大的基因组,为6.4 Mb。通过对S.psychrophila WP2的完整基因组进行系统发育和代谢潜能分析,并与相近菌株进行比较,探究WP2拥有较大基因组的生理和生态意义,深化对Shewanella菌在环境适应性方面的认识。基于串联保守蛋白对WP2基因组进行系统发育分析,根据注释结果对WP2进行代谢通路重建。系统发育进化树显示,WP2属于Group 1分支,和其它嗜冷嗜压Shewanella菌相同,非嗜冷嗜压Shewanella菌株都属于Group 2分支。WP2基因组中与DNA修复、次级代谢产物合成、转运分泌相关的基因数明显多于Shewanella piezotolerans WP3。WP2拥有较多水平转移来源的基因组岛(17个),岛内包含了与嘌呤代谢、氨基糖代谢、运动趋化、群体感应等功能相关的基因。结果表明,通过潜在的水平基因转移,WP2获得了大量的辅助功能基因,增强了它的氮源利用能力、运动和趋化能力,以及应对复杂环境的群体感应能力和抗生素合成功能,从而更加适应生活在寡营养和复杂极端的深海环境。本研究针对S.psychrophila WP2的代谢潜力进行了深入的探索和研究,为将来关于Shewanella菌和微生物的环境适应机制的研究提供了更多数据参考和理论基础。 展开更多
关键词 海洋生物学 深海 shewanella WP2 基因组分析 环境适应
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