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基于深度学习的SMYD2抑制剂的筛选与活性评价
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作者 刘小倩 朱艳娟 +3 位作者 冯大为 王璐琪 刘钰杭 芦静 《烟台大学学报(自然科学与工程版)》 CAS 2024年第4期430-438,共9页
使用2个深度学习模型(Chemprop和RTMScore)从TopScience商业数据库中筛选潜在的SMYD2抑制剂,再使用CCK-8法测定化合物抑制活性,并分别采用细胞克隆和细胞划痕实验测定化合物抗A549细胞增殖、迁移能力,最终用细胞热转移实验和蛋白质印记... 使用2个深度学习模型(Chemprop和RTMScore)从TopScience商业数据库中筛选潜在的SMYD2抑制剂,再使用CCK-8法测定化合物抑制活性,并分别采用细胞克隆和细胞划痕实验测定化合物抗A549细胞增殖、迁移能力,最终用细胞热转移实验和蛋白质印记实验验证化合物5与蛋白质的结合能力。结果表明,深度学习模型筛选出的化合物5对A549细胞增殖具有明显抑制作用(抑制率≥80%),IC_(50)为10.89μmol/L;给予10μmol/L[JP]的化合物5后,A549细胞的克隆形成数和迁移面积均明显少于对照组(P<0.05)。细胞热转移实验证明化合物5与SMYD2能够结合。 展开更多
关键词 深度学习 smyd2抑制剂 增殖抑制
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